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潛在抑癌基因eIF4E3野生型和突變體質(zhì)粒的構(gòu)建*

2020-05-19 09:02姚運(yùn)紅熊敏涵胡新榮
黑龍江醫(yī)藥 2020年4期
關(guān)鍵詞:凝膠電泳瓊脂糖突變體

姚運(yùn)紅,袁 煒,熊敏涵,張 葉,胡新榮

廣東醫(yī)科大學(xué)病理學(xué)系、腫瘤研究所,廣東 東莞 523808

真核翻譯起始因子4E(Eukaryotic translation initiation factor 4E,eIF4E),是真核細(xì)胞翻譯起始和調(diào)控的核心成分,能夠選擇性地控制腫瘤基因的翻譯和表達(dá)。目前已經(jīng)明確在哺乳動物中eIF4E有三種不同的家族成員,包括eIF4E1、eIF4E2、eIF4E3,其在結(jié)構(gòu)標(biāo)記、功能特征及表達(dá)形式上各有不同[1]。eIF4E3是抑癌基因,eIF4E在眾多腫瘤中過量表達(dá)[2]。過量表達(dá)的eIF4E選擇性地起始c-Myc等眾多經(jīng)典癌基因的翻譯表達(dá),從而促進(jìn)癌細(xì)胞轉(zhuǎn)化、增殖、抗凋亡、侵襲及腫瘤血管生成等[3]。本研究擬構(gòu)建并鑒定eIF4E3野生型、eIF4E3突變體C69a、w86a真核過表達(dá)質(zhì)粒,為進(jìn)一步對eIF4E3研究及為腫瘤治療尋找新的靶點(diǎn)提供思路。

1 材料與方法

1.1 材料

菌株及表達(dá)載體: 大腸桿菌(Escherichia coli)菌株DH5a、PIRES2-EGFP載體(本實(shí)驗(yàn)保存),eIF4E3野生型插入片段序列,eIF4E3C69a突變體是eIF4E3野生型在69位點(diǎn)C變?yōu)锳突變而來;eIF4E3W86a突變體是eIF4E3野生型在86位點(diǎn)W變?yōu)锳突變而來。主要試劑:EcoRI、BamHI、NheI限制性內(nèi)切酶(美國NEB公司)PCR產(chǎn)物回收試劑盒、DNA凝膠回收試劑盒(日本TAKARA公司)T4 DNAligase(美國Thermo公司)Gold View I型核酸染色劑(北京Solarbio公司)高純度質(zhì)粒小提中量試劑盒(北京天根公司)。

1.2 方法

1.2.1 eIF4E3基因片段、RT-PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物純化:eIF4E3、eIF4E3C69a、eIF4E3W86a質(zhì)粒載體構(gòu)建,參照公司質(zhì)粒構(gòu)建說明書。實(shí)驗(yàn)步驟如下:逆轉(zhuǎn)錄反應(yīng)(RT-PCR)擴(kuò)增獲得 cDNA樣本。RT-PCR擴(kuò)增條件:37℃ 15 min,85℃ 5 s,4℃保存。以cDNA樣本為模板,用構(gòu)建的上下游引物進(jìn)行PCR擴(kuò)增獲得eIF4E3野生型及其突變體序列片段。eIF4E3 PCR引物上游引物序列為:primer 5'-GGCGAATTCATGGCGCTGCCCCCG-3',下游引物序列為:primer 5'-GCGGATCCTTAGTGTTTTCCACGTC?CACCTTCA-3',PCR反應(yīng)體系為:2×power Taq PCR Mas?ter Mix 10 μl,F(xiàn)orward Primer P1(10 μM)1 μl,Reverse Primer P1(10 μM)1 μl,cDNA Template100ng ddH2O 總量加到20 μl,反應(yīng)條件94℃預(yù)變性5 min,94℃變性45S,55℃退火1 min,72℃延伸5 min 40個(gè)循環(huán),取適量產(chǎn)物,用1%瓊脂糖凝膠電泳實(shí)驗(yàn)鑒定產(chǎn)物,鑒定結(jié)果正確,PCR產(chǎn)物剩余部分用PCR產(chǎn)物回收試劑盒回收并純化(試劑盒說明書),回收產(chǎn)物于-20℃保存。

1.2.2 目的片段eIF4E3及空載質(zhì)粒PIRES2-EGFP雙酶切與純化、回收:用限制性內(nèi)切酶EcoRI、BamHI雙酶切eIF4E3基因片段及空載質(zhì)粒PIRES2-EGFP。用限制性內(nèi)切酶NheI、BamHI分別雙酶切eIF4E3C69a、eIF4E3W86a基因片段及空載質(zhì)粒PIRES2-EGFP。將eIF4E3酶切產(chǎn)物進(jìn)行回收;提取的質(zhì)粒經(jīng)瓊脂糖凝膠電泳,找到相應(yīng)的目的條帶切膠并回收。

1.2.3 目的片段和載體質(zhì)粒的連接和轉(zhuǎn)化、提取、鑒定:使用T4 DNA Ligase產(chǎn)品將目的片段與線性載體進(jìn)行連接,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化感受態(tài)大腸桿菌DH5α。挑選長出的克隆并搖菌擴(kuò)增,提取質(zhì)粒進(jìn)行后續(xù)PCR及測序。PCR引物和擴(kuò)增的反應(yīng)體系和反應(yīng)條件同上。擴(kuò)增出的目的片段為675bp。重組質(zhì)粒雙酶切鑒定真核表達(dá)載體PIRES2-EGFP具有卡那霉素抗性,本實(shí)驗(yàn)中選取酶切位點(diǎn)分別為Eco?RI、BamHI,NheI、BamHI。根據(jù)內(nèi)切酶說明書,對重組質(zhì)粒進(jìn)行雙酶切鑒定。將酶切產(chǎn)物進(jìn)行1%瓊脂糖凝膠電泳,成像儀下曝光并拍照。重組DNA測序?qū)⑻崛〉馁|(zhì)粒DNA送往華大基因生物技術(shù)有限公司測序并分析結(jié)果。

2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果

2.1 目的基因eIF4E3擴(kuò)增結(jié)果

PCR擴(kuò)增產(chǎn)物經(jīng)1%瓊脂糖凝膠電泳后,從擴(kuò)增圖可以看到3條大小約為675bp的條帶,與預(yù)期的野生型(eIF4E3)和突變型(C69a、W86a)基因大小一致(圖1)。

圖1 eIF4E3野生型和突變體基因PCR擴(kuò)增電泳圖

2.2 重組質(zhì)粒PIRES2-EGFP-eIF4E3、PIRES2-EGFP-C69a、PIRES2-EGFP-W86a雙酶切及鑒定結(jié)果

經(jīng)過瓊脂糖凝膠電泳分析以后回收得到的PCR產(chǎn)物與PIRES2-EGFP空載體進(jìn)行雙酶切后,用連接酶進(jìn)行連接用含有卡那霉素的LB培養(yǎng)基進(jìn)行鋪板長菌,挑取2~3個(gè)單克隆進(jìn)行擴(kuò)增并提取質(zhì)粒最后進(jìn)行雙酶切及PCR鑒定。雙酶切后可以得到大約675bp的片段(圖2),進(jìn)一步進(jìn)行菌液及其質(zhì)粒的PCR鑒定,同樣可以看出大約675bp的片段(圖3),說明eIF4E3野生型及其突變體成功插入到PIRES2-EGFP載體上。

圖2 eIF4E3野生型和突變體重組質(zhì)粒雙酶切鑒定圖

圖3 eIF4E3野生型和突變體菌液及質(zhì)粒PCR電泳圖

2.3 重組質(zhì)粒測序結(jié)果

將重組質(zhì)粒PIRES2-EGFP-eIF4E3、PIRES2-EGFP-eIF4E3C69a、PIRES2-EGFP-eIF4E3C69W86a上插入的目的基因eIF4E3、C69a、W86a片段進(jìn)行DNA測序,經(jīng)過Blast比對和分析,結(jié)果顯示eIF4E3、C69a、W86a基因正確插入到真核表達(dá)載體PIRES2-EGFP中,其與目的序列一致,測序結(jié)果(圖4)。

3 討論

圖4 eIF4E3野生型和突變體質(zhì)粒測序圖

eIF4E3是最近年新發(fā)現(xiàn)的一種潛在的抑癌基因。本實(shí)驗(yàn)中我們成功的將eIF4E3、eIF4E3C69a、eIF4E3W86a基因鏈接到真核表達(dá)載體pIRES2-EGFP中。我們選用的pIRES2-EGFP真核表達(dá)載體容易進(jìn)入細(xì)胞,容量比較大,易于檢測,在臨床實(shí)驗(yàn)中應(yīng)用比較廣泛。eIF4E3僅存在脊索動物中,而且研究發(fā)現(xiàn)只存在于脊索動物的睪丸、骨骼肌、心肌、脾臟和肺臟等組織中,尤其在睪丸中表達(dá)水平最高[3]。2013年Borden[4]等人的研究發(fā)現(xiàn)過表達(dá)eIF4E3能夠競爭結(jié)合eIF4E的靶mRNA,并且能夠阻止VEGF等因子的翻譯表達(dá),這提示eIF4E3是對抗eIF4E的潛在抑癌基因。過表達(dá)eIF4E3可與eIF4E競爭結(jié)合eIF4E的靶mRNA,例如CyclinD1、c-Myc、VEGF等并阻止其翻譯表達(dá)。Gartenhaus[5]等人進(jìn)一步發(fā)現(xiàn)eIF4E3除了抑制eIF4E1的功能外,還可以自己起始n-Myc、HMGA、CDX2、Twist等的翻譯,而這些基因通常都不是eIF4E1的靶基因,這表明eIF4E3可以起始不同于eIF4E1的靶基因的翻譯。此外,在藥物、放射、缺氧、缺營養(yǎng)等條件下,eIF4E表達(dá)下降[6-8],因此eIF4E已成為研究腫瘤靶向治療的最熱門靶點(diǎn)之一[9]。

本實(shí)驗(yàn)成功構(gòu)建了PIRES2-EGFP-eIF4E3野生型,PIRES2-EGFP-eIF4E3 C69a、PIRES2-EGFP-eIF4E3 w86a突變體質(zhì)粒,經(jīng)測序檢測,序列與預(yù)期相符。eIF4E3野生型,突變體 C69a、w86a的構(gòu)建為進(jìn)一步研究其在腫瘤的作用及機(jī)理,為腫瘤治療尋找新的靶點(diǎn)奠定了基礎(chǔ)。

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