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葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變永生化淋巴細(xì)胞系的建立

2020-05-24 07:34賈崢張艷艷孫楠張文新高飛孫晶黃杰曲守方
分子診斷與治療雜志 2020年4期
關(guān)鍵詞:雜合脫氫酶磷酸

賈崢 張艷艷 孫楠 張文新 高飛 孫晶 黃杰★ 曲守方★

葡萄糖-6-磷酸脫氫酶(glucose-6-phosphate dehydrogenase,G6PD)缺乏癥是由位于X 染色體長臂2 區(qū)8 帶(Xq28)的G6PD基因突變導(dǎo)致G6PD 酶合成缺陷引起,是一種以溶血性貧血為主要臨床特征的遺傳病,常見臨床表現(xiàn)有新生兒黃疸、新生兒高膽紅素血癥、蠶豆病、藥物性溶血、某些感染性溶血等[1-2]。本病在我國主要分布在長江流域以南地區(qū),尤以廣東、海南、廣西、云南、貴州、四川等地為高發(fā)區(qū)。G6PD 缺乏癥患者多數(shù)平時無臨床癥狀,早期診斷和干預(yù)非常重要。在G6PD 缺乏癥的高發(fā)地區(qū),應(yīng)開展G6PD 缺乏癥篩查。作為一種X-連鎖不完全顯性遺傳病,男性攜帶突變(男性半合子)表現(xiàn)為明顯的酶活性缺乏,女性攜帶純合突變或雜合突變時(稱為女性雜合子),發(fā)病情況因人而異。部分女性雜合子的酶活性可能接近正常不表現(xiàn)缺乏,因此不易通過酶活性檢測發(fā)現(xiàn),可以通過細(xì)胞化學(xué)染色體法和基因檢測等方法明確突變狀態(tài)[3]。G6PD 缺乏癥的分子檢測方法,包括熒光探針PCR熔解曲線法、基因芯片、反向點雜交、測序和飛行時間質(zhì)譜等,提高了女性雜合子的檢出率[4-7]。

目前尚無葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變的國家參考品,亟需建立相應(yīng)的國家參考品,用于評價葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變試劑盒的質(zhì)量。葡萄糖-6-磷酸脫氫酶缺乏癥作為一種單基因病,該類參考品的制瓶頸是難以保證持續(xù)獲得臨床樣本,解決的思路是建立永生化淋巴細(xì)胞系或者構(gòu)建基因編輯細(xì)胞系。本院通過建立葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變的永生化淋巴細(xì)胞系,可以提供長期穩(wěn)定的遺傳資源,并采用二代測序法進行驗證。

1 材料方法

1.1 材料

1.1.1 樣本來源及處理

經(jīng)倫理委員會批準(zhǔn),聯(lián)系珠海市婦幼保健院,招募自愿參與項目的樣品捐獻者33 人,簽署知情同意書。每人抽取10 mL 外周血,血液樣本采集到枸櫞酸鹽或檸檬酸鹽抗凝的真空采集管。采集外周血后進行永生化淋巴細(xì)胞系建系。

1.1.2 試劑和儀器

RPMI 1640 培養(yǎng)基、胎牛血清(FBS)和青霉素鏈霉素雙抗購自美國GIBCO 公司;人外周血淋巴細(xì)胞分離液、環(huán)孢霉素A 和二甲基亞砜(DMSO)購自北京索萊寶科技有限公司;葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變檢測試劑盒(熒光PCR 熔解曲線法)由廈門致善生物科技有限公司提供;基因組DNA提取試劑盒(磁珠法)由深圳華大智造科技有限公司提供;新生兒基因檢測試劑盒由華大基因股份有限公司提供。

上海宏石SLAN-96S 全自動醫(yī)用PCR 分析系統(tǒng),廈門致善生物科技有限公司提供;MGISEQ-2000 基因測序儀,深圳華大智造科技有限公司提供。

1.2 方法

1.2.1 樣本的篩查

使用葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變檢測試劑盒(熒光PCR 熔解曲線法),按照說明書的操作方法,對樣本進行檢測。

1.2.2 永生化淋巴細(xì)胞系的建立

1.2.2.1 EBV 病毒液的制備 復(fù)蘇B95-8 細(xì)胞株,采用RPMI 1640 培養(yǎng)基加胎牛血清(FBS)進行培養(yǎng),每隔2~3 天補液一次,逐漸增加培養(yǎng)基的用量。饑餓培養(yǎng)10 天后,收集細(xì)胞在液氮及37℃條件下反復(fù)凍融3 次,2 000 rpm 離心10 min。收集上清液,使用0.2 μm 濾膜的細(xì)胞濾器進行過濾后,備用。

1.2.2.2 單核B 淋巴細(xì)胞的分離和轉(zhuǎn)化 取采集的外周血5 mL,加入等體積的含有青霉素鏈霉素雙抗的RPMI 1640 培養(yǎng)基稀釋血液。將稀釋后的血液緩緩加入已分裝在離心管內(nèi)的淋巴細(xì)胞分層液中,2 000 rpm 離心20 min。小心吸取白膜層,轉(zhuǎn)移至新的離心管中,加入含有雙抗的RPM1640 培養(yǎng)基8 mL 洗滌2 次,1 500 rpm 離心10 min 后,去上清。然后加入分裝好的EBV 病毒液1.5 mL、環(huán)孢霉素A 0.4 mL 以及完全培養(yǎng)基重懸細(xì)胞沉淀,然后將細(xì)胞懸液接種至T25 培養(yǎng)瓶中,將細(xì)胞培養(yǎng)瓶置于37℃的5%CO2培養(yǎng)箱進行培養(yǎng)。

1.2.2.3 永生化淋巴細(xì)胞系凍存 接種培養(yǎng)24~48 h 后,使用倒置顯微鏡觀察細(xì)胞轉(zhuǎn)化情況并拍照。觀察細(xì)胞狀態(tài)及聚團大小,適當(dāng)加入少量完全培養(yǎng)基繼續(xù)培養(yǎng)。一周后觀察細(xì)胞聚團數(shù)量及細(xì)胞狀態(tài),進行半換液。待培養(yǎng)液顏色變淺黃,細(xì)胞聚團多且密集時,1 300 rpm 離心5 分鐘,傳代。待細(xì)胞培養(yǎng)至足夠數(shù)量時(3~6×106個/mL),1 300 rpm 離心5 分鐘,收集細(xì)胞。根據(jù)細(xì)胞的數(shù)量加入含10%DMSO 凍存液,調(diào)整細(xì)胞凍存濃度,按所需要求將細(xì)胞分裝至凍存管。然后按照標(biāo)準(zhǔn)凍存操作程序進行梯度降溫存儲,最終轉(zhuǎn)移至液氮進行長期存儲。

1.2.3 永生化淋巴細(xì)胞系的驗證

將永生化淋巴細(xì)胞系取出復(fù)蘇后進行基因組DNA 提取,使用瓊脂糖凝膠電泳檢測DNA 的完整性。采用新生兒基因檢測試劑盒進行驗證。采用酶切的方法將基因組DNA 打斷為100~200 bp 左右的DNA 片段,通過末端修復(fù),加A 和接頭連接后,進行第一輪PCR 擴增。擴增的PCR 產(chǎn)物采用DNA 探針進行目標(biāo)區(qū)域富集后,使用MGISEQ-2000 基因測序儀進行高通量測序。

2 結(jié)果

2.1 樣本篩查

采用葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變檢測試劑盒(熒光PCR 熔解曲線法),根據(jù)與探針雜交產(chǎn)物熔點的差異來檢測G6PD基因突變。通過比較檢測樣本在反應(yīng)液A 和反應(yīng)液B 體系中FAM、HEX、ROX 和CY5 共8 個檢測通道的熔解峰與野生型對照對應(yīng)通道的熔解峰之間熔點(Tm 值)的差異判斷樣本是否發(fā)生突變。當(dāng)樣本熔解峰與野生型對照對應(yīng)熔解峰差異(ΔTm 值)在±1℃以內(nèi)的即為野生型峰,差異超過±2℃的即為突變型峰,最后篩查出不同突變類型的樣本。33例樣本的篩查結(jié)果可見表1。CNGB030108 樣本在反應(yīng)液A 體系CY5 檢測通道出現(xiàn)野生峰和突變峰的融合峰,而其它7 個通道的熔解峰均為野生峰,且突變峰與野生型對照的熔解峰差異在(-4.8℃)~(-3℃)范圍內(nèi),表明是1376(G>T)雜合型突變;在反應(yīng)液B 體系ROX 檢測通道出現(xiàn)野生峰和突變峰的融合峰,而其它7 個通道的熔解峰均為野生峰,且突變峰與野生型對照的熔解峰差異在5.19℃~6.41℃范圍內(nèi),表明是519(C>T)雜合型,見圖1。

2.2 永生化淋巴細(xì)胞系的建立

采用EBV 轉(zhuǎn)化加環(huán)孢霉素A 法,共完成33例樣本建系,其中27例樣本建系成功,6例因細(xì)菌污染導(dǎo)致失敗,建系成功率為81%,復(fù)蘇成功率為100%,可以傳代用于實驗研究。在倒置顯微鏡下可觀察到細(xì)胞轉(zhuǎn)化后96 h 內(nèi),細(xì)胞體積明顯增大,聚團生長的細(xì)胞團增多;轉(zhuǎn)化2 周后,肉眼可見細(xì)胞聚團物,顯微鏡下觀察大量細(xì)胞聚團;轉(zhuǎn)化培養(yǎng)3~4 周后,顯微鏡下觀察細(xì)胞外壁呈不規(guī)則毛刺狀突起,增殖旺盛,表明建系成功,見圖2A~圖2C。

表1 樣本的篩查結(jié)果Table1 The screening results of samples

圖1 CNGB030108 樣本篩查結(jié)果Figure1 The screening result of CNGB030108

2.3 永生化淋巴細(xì)胞系的驗證

用基因組DNA 提取試劑盒提取的永生化淋巴細(xì)胞系樣本基因組DNA,使用0.8%瓊脂糖凝膠電泳,結(jié)果顯示DNA 條帶完整,沒有拖帶或彌散帶,表明基因組DNA 具有很好的完整性。

圖2 永生化淋巴細(xì)胞系轉(zhuǎn)化第0、15 天和30 天結(jié)果(×50)Figure2 The result of immortalized lymphocyte cell line transformation on day 0,day15 and day 30(×50)

采用高通量測序法進行驗證,樣本的結(jié)果均與采用熒光PCR 熔解曲線法篩查的結(jié)果一致,見圖3和表2。CNGB030108 樣本的測序結(jié)果顯示在X 染色體153 762 678 bp(人類基因組hg19)位置處檢測到94 條reads 支持C 堿基(正向是G 堿基)和108 條reads 支持T 堿基(正向是A 堿基),表明是c.519 C>T 雜合突變;在X 染色體153 760 484 bp 位置處檢測到60 條reads 支持G 堿基(正向是C 堿基)和68 條reads 支持T 堿基(正向是A 堿基),表明是c.1 376 G>T 雜合突變。

圖3 CNGB030108 樣本測序結(jié)果Figure3 The sequencing results of CNGB030108

3 討論

永生化指體外培養(yǎng)的細(xì)胞經(jīng)過自發(fā)的或受外界因素的影響從增殖衰老危機中逃離,從而具有無限增殖能力的過程。目前應(yīng)用最多的方式是使用EB 病毒(EBV)轉(zhuǎn)化人外周血淋巴細(xì)胞從而獲得的一種能夠連續(xù)分裂、永久生存的B 淋巴細(xì)胞株,每株細(xì)胞含有正常的二倍體組型并且含有供者完整的遺傳信息。在B 淋巴細(xì)胞轉(zhuǎn)化過程中加入環(huán)孢霉素A,可以抑制T 淋巴細(xì)胞的免疫殺傷活性,有效阻止T 淋巴細(xì)胞對已轉(zhuǎn)化的B 淋巴細(xì)胞的攻擊,從而提高轉(zhuǎn)化效率。獲得的永生化細(xì)胞系在連續(xù)培養(yǎng)傳代過程中染色體穩(wěn)定,可獲取足量的細(xì)胞遺傳資源用于研究。世界上基因細(xì)胞遺傳資源存儲機構(gòu)包括英國生物樣本庫(UK Biobank)、美國國立衛(wèi)生研究院(National Institutes of Health,NIH)、美國國家人類基因細(xì)胞庫(The NIGMS Human Genetic Cell Repository),均將其作為最主要的技術(shù)法方法保存細(xì)胞遺傳資源[8-9]。

表2 永生化淋巴細(xì)胞系樣本驗證結(jié)果Table2 The verification results of immortalized lymphocyte cell lines

我國常見的致病性G6PD基因變異類型包括c.95A>G、c.392G>T、c.487G>A、c.493A>G、c.592C>T、c.1024C>T、c.1360C>T、c.1376G>T、c.1388G>A,這9 種變異占總變異的90%以上[10]。本研究采用葡萄糖-6-磷酸脫氫酶突變類型的外周全血樣本,經(jīng)過EB 病毒誘導(dǎo)分化,最終成功建立了葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變的永生化淋巴細(xì)胞系,包括葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因c.392G>T 純合和雜合突變、c.871G>A 純合和雜合突變、c.95A>G 純合和雜合突變、c.1388G>A 純合和雜合突變、c.1376G>T純合和雜合突變、c.1360C>T 雜合突變、c.1024C>T純合和雜合突變、c.519 C>T 雜合突變,涵蓋了我國常見的突變類型。同時對建系成功的永生化淋巴細(xì)胞株進行高通量測序方法的驗證,結(jié)果表明葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變的永生化淋巴細(xì)胞系基因組DNA 的結(jié)果與臨床樣本的標(biāo)示結(jié)果一致。該永生化淋巴細(xì)胞系的遺傳信息穩(wěn)定,可作為國家參考品的遺傳資源,用于評價葡萄糖-6-磷酸脫氫酶基因突變檢測試劑盒的質(zhì)量。

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