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基于磁化率成像Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜定量分析腦鐵的可行性

2020-08-06 09:20:40李棟學(xué)熊真亮曾憲春王榮品
關(guān)鍵詞:磁化率勾畫腦區(qū)

李棟學(xué),代 斌,熊真亮,曾憲春,王榮品

(貴州省人民醫(yī)院放射科 貴州省智能醫(yī)學(xué)影像分析與精準(zhǔn)診斷重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 精準(zhǔn)影像診療示范型國際科技合作基地,貴州 貴陽 550002)

鐵為人體必須且含量最高的微量元素,參與纖維束生長、髓鞘形成、氧運(yùn)輸、電子轉(zhuǎn)運(yùn)及神經(jīng)轉(zhuǎn)運(yùn)體生成等過程,與神經(jīng)退行性疾病的發(fā)生發(fā)展相關(guān)[1]。早發(fā)現(xiàn)、早診斷鐵代謝異常相關(guān)神經(jīng)系統(tǒng)疾病具有重要臨床意義。認(rèn)識(shí)正常人腦鐵分布及變化規(guī)律,探尋準(zhǔn)確且無創(chuàng)的腦鐵定量方法,對(duì)研究鐵代謝異常疾病具有重要價(jià)值。作為一種量化生物組織內(nèi)磁化率空間分布MRI技術(shù),定量磁化率成像(quantitative susceptibility mapping, QSM)已越來越多地用于定量研究腦鐵,是目前臨床定量測(cè)量活體組織內(nèi)鐵含量的主要方法[2]。本研究探討采用基于QSM的Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜定量分析腦鐵的可行性。

1 資料與方法

1.1 一般資料 2018年7月—2019年5月招募43名右利手、健康的成年志愿者,其中男20名,女23名,年齡22~58歲,平均(35.3±10.0)歲。納入標(biāo)準(zhǔn):自愿、知情并填寫MR檢查同意書;無MR檢查禁忌證;無腦器質(zhì)性疾病史;無神經(jīng)精神疾?。粺o酒精及藥物依賴。排除標(biāo)準(zhǔn):檢查未完成而終止;圖像質(zhì)量不佳影響后處理。

1.2 儀器與方法 采用GE 3.0T MR掃描儀(Discovery MR 750, Milwaukee, WI),行常規(guī)序列、3D T1W及QSM掃描。主要掃描參數(shù):3D T1W,TR/TE 8.5/3.2 ms,TI 450 ms,翻轉(zhuǎn)角15°,視野256 mm×256 mm,矩陣256×256,層厚1 mm,帶寬31.25 kHz;QSM,TR/TE 41.8/3.3 ms,回波數(shù)16,間隔時(shí)間2.3 ms,翻轉(zhuǎn)角20°,視野256 mm×256 mm,矩陣256×256,層厚1 mm,帶寬62.50 kHz。

將原始數(shù)據(jù)傳至GE后處理工作站,利用Functool軟件行后處理,得到磁敏感圖像。以DICOM格式輸出磁化率(susceptibility, SUS)圖像、原始圖像(RAW)及3D T1WI(T1)圖像,進(jìn)行線下處理。利用dcm2niigui軟件將SUS和T1圖像轉(zhuǎn)換為NIFTI格式(.nii),采用Matlab(MathWorks, Natick, MA, USA)軟件自編代碼完成RAW圖像的NIFTI格式轉(zhuǎn)換。基于Matlab利用SPM12軟件包(http://www.fil.ion.ucl.ac.uk/spm/)對(duì)圖像進(jìn)行標(biāo)準(zhǔn)化處理,以T1圖像為金標(biāo)準(zhǔn),RAW圖像為配準(zhǔn)參考,將此配準(zhǔn)參數(shù)套用到SUS圖像進(jìn)行配準(zhǔn);而后將T1圖像對(duì)應(yīng)到東亞人腦模板上進(jìn)行正規(guī)化;最后進(jìn)行平滑處理,得到標(biāo)準(zhǔn)化SUS圖像。在SPM12 Check Reg中,以SUS圖像及SPM標(biāo)準(zhǔn)腦模板對(duì)應(yīng)檢查配準(zhǔn)情況,手動(dòng)微調(diào)配準(zhǔn)欠佳圖像。

在Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜上找到雙側(cè)海馬(hippocampus, HP)、蒼白球(globus pallidus,GP)、尾狀核(caudate, CA)、殼核(putamen, PU)、丘腦(thalamus, TH)、額葉皮質(zhì)(frontal cortex, FC)、頂葉皮質(zhì)(parietal cortex,PC)及枕葉皮質(zhì)(occipital cortex, OC)共計(jì)16個(gè)腦區(qū),設(shè)置ROI,利用Matlab R2013a軟件,使用自定義代碼提取各ROI的磁化率值,以Excel表格輸出數(shù)據(jù)。同時(shí)利用Functool軟件在SUS圖像上于HP、GP、CA、PU、TH最大層面手工勾畫ROI,在FC、PC、OC皮層最厚處手工勾畫ROI(≤10 mm2),測(cè)量磁化率值。由2名神經(jīng)影像學(xué)主任醫(yī)師共同完成數(shù)據(jù)處理、ROI勾畫及磁化率測(cè)量,排除質(zhì)量不佳及配準(zhǔn)不滿意圖像。處理過程示意圖見圖1。

圖1 基于Brainnetome Atlas腦磁化率值測(cè)量后處理過程示意圖 A、B.于GE工作站進(jìn)一步計(jì)算QSM相位圖和幅度圖,得到SUS圖像; C.以Matlab軟件依次將QSM相位圖和SUS圖像匹配到T1圖像; D.將配準(zhǔn)好的SUS圖像對(duì)應(yīng)到標(biāo)準(zhǔn)腦模板上并進(jìn)行校對(duì); E.以自定義Matlab代碼從標(biāo)準(zhǔn)化ROI中提取磁化率值,在腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜Brainnetome Atlas選取ROI

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析 采用SPSS 19.0統(tǒng)計(jì)分析軟件。計(jì)量資料以±s表示。將Matlab法和手工所測(cè)磁化率值與尸檢腦組織染色所得鐵濃度數(shù)據(jù)[3]進(jìn)行Pearson相關(guān)分析;以Spearman相關(guān)分析觀察磁化率值與年齡的相關(guān)性。繪制磁化率值分布箱式圖;采用非參數(shù)Wilcoxon檢驗(yàn)比較不同性別、側(cè)別間磁化率值。P<0.05為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 磁化率值與組織病理結(jié)果的一致性 Matlab法及手工勾畫法所測(cè)磁化率值呈正相關(guān)(r=0.959,P<0.001),且均與尸檢化學(xué)染色測(cè)量鐵濃度結(jié)果[3]呈正相關(guān)(r=0.920、0.856,P=0.003、0.014),見表1。

表1 Matlab法及手工勾畫法所測(cè)各腦區(qū)磁化率值(ppb)與病理鐵濃度值(mg iron/100 g)

2.2 磁化率值分布及與年齡的相關(guān)性 箱式圖(圖2)示手工法測(cè)量磁化率值整體高于Matlab法,其上限和大部分下限均高于Matlab法;2種方法測(cè)量GP、PU、FC均存在少數(shù)異常值。2種方法所測(cè)磁化率值均以GP最高,PU次之,HP最低。Matlab法及手工法測(cè)量ROI磁化率值整體與年齡均呈正相關(guān)(rs=0.535、0.340,P=0.001、0.026,圖3A);其中Matlab法所測(cè)GP磁化率值與年齡相關(guān)性最高(r=0.737,P<0.001,圖3B)。

圖2 MATLAB法、手工勾畫法測(cè)量的磁化率值分布的箱式圖

圖3 磁化率值與年齡相關(guān)性散點(diǎn)圖 A.Matlab法(藍(lán))和手工勾畫法(紅); B.MATLAB法測(cè)量GP

2.3 不同性別、側(cè)別磁化率值差異 Matlab法所測(cè)FC磁化率值男性高于女性(P<0.05),不同性別間其余腦區(qū)磁化率值差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P均>0.05)。2種方法所測(cè)磁化率值不同側(cè)別間差異均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P均>0.05),見表2、3。

表2 2種方法所測(cè)不同性別各腦區(qū)磁化率值比較(ppb, ±s)

表2 2種方法所測(cè)不同性別各腦區(qū)磁化率值比較(ppb, ±s)

性別HPMATLAB法手工勾畫法GPMATLAB法手工勾畫法CAMATLAB法手工勾畫法PUMATLAB法手工勾畫法男-24.40±8.26-33.55±13.1043.40±7.55103.68±19.5927.48±7.0259.61±12.3441.31±12.6882.02±17.48女-24.58±7.66-31.36±13.6941.38±8.4296.82±20.8225.18±7.3949.15±20.1936.24±12.9875.88±16.86Z值-0.195-0.463-0.122-0.438-1.144-1.583-1.6560.368P值0.8460.6440.9030.6610.2520.1130.0980.368性別THMATLAB法手工勾畫法FCMATLAB法手工勾畫法PCMATLAB法手工勾畫法OCMATLAB法手工勾畫法男-6.44±8.69-5.62±11.582.95±2.9439.59±15.882.38±1.4338.15±28.94-2.66±5.4-1.21±14.06女-1.62±11.040.00±11.450.90±3.2740.93±10.772.01±0.9327.71±23.9-2.62±4.24-1.00±13.49Z值-1.437-1.631-2.167-0.341-1.291-1.364-0.146-0.134P值0.1510.1030.0300.7330.1970.1730.8840.893

3 討論

3.1 QSM成像及Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜 腦內(nèi)不同形式的鐵具有不同磁化效能。非血紅素鐵為順磁性物質(zhì),能引起局部磁場(chǎng)不均勻,縮短組織橫向弛豫時(shí)間,并反映于MRI上。非血紅素鐵中,鐵蛋白及含鐵血黃素占大部分,是引起MRI信號(hào)改變的主要鐵存在形式[4],故可通過MRI評(píng)估正常氧合狀態(tài)下腦組織鐵含量。QSM基于梯度回波序列成像,首先采集多個(gè)不同回波時(shí)間的幅度圖和相位圖,再對(duì)相位圖解卷繞并消除寬大背景場(chǎng),得到大腦組織局部場(chǎng)圖,代表不同組織間鐵的差異;最后結(jié)合幅度圖利用正則化約束求解,獲得大腦組織SUS圖像,通過勾畫ROI可得到組織中的鐵含量[2,5-6]。QSM能較好識(shí)別高分辨率MRI難以辨認(rèn)的TH核團(tuán)[7],高場(chǎng)下QSM可顯示腦白質(zhì)和腦灰質(zhì)邊界細(xì)節(jié)[8-9],是具有高對(duì)比度、高分辨力、可完全定量鐵含量的新興MRI技術(shù)。Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜由中科院自動(dòng)化所蔣田仔團(tuán)隊(duì)于2016年繪制,利用腦結(jié)構(gòu)和功能連接信息將腦區(qū)精細(xì)劃分為246個(gè)腦亞區(qū),具有客觀精準(zhǔn)的邊界定位[10]。本研究基于Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜于雙側(cè)HP、GP、CA、PU、TH、FC、PC、OC共16個(gè)腦區(qū)選取ROI。

表3 2種方法所測(cè)不同側(cè)別各腦區(qū)磁化率值比較(ppb,±s)

表3 2種方法所測(cè)不同側(cè)別各腦區(qū)磁化率值比較(ppb,±s)

性別HPMATLAB法手工勾畫法GPMATLAB法手工勾畫法CAMATLAB法手工勾畫法PUMATLAB法手工勾畫法左側(cè)-24.48±9.18-32.56±14.8342.93±8.44103.06±20.8625.86±6.9153.21±17.2838.67±13.877.33±18.41右側(cè)-24.51±8.03-32.2±13.8241.71±7.9996.96±23.5726.64±8.0654.82±18.3538.52±14.3080.14±20.53Z值-0.004-0.363-0.751-1.118-0.734-0.54-0.255-1.075P值0.9970.7170.4520.2630.4630.5890.7990.282性別THMATLAB法手工勾畫法FCMATLAB法手工勾畫法PCMATLAB法手工勾畫法OCMATLAB法手工勾畫法左側(cè)-4.33±10.90-2.53±12.121.76±3.2940.69±15.362.03±1.332.75±28.69-2.75±5.30-0.91±14.15右側(cè)-3.39±10.01-2.69±12.451.95±3.4739.93±14.522.33±1.3032.38±33.15-2.52±4.96-1.29±13.25Z值-0.466-0.177-0.397-0.367-0.92-0.35-0.272-0.134P值0.6410.8590.6910.7140.3580.7260.7860.894

3.2 Matlab腦鐵定量方法可行性 本研究發(fā)現(xiàn)Matlab和手工勾畫2種方法所測(cè)磁化率值均與病理鐵濃度呈顯著正相關(guān),表明QSM定量磁化率值可間接反映腦鐵含量[11-12];且2種方法所測(cè)磁化率值呈顯著正相關(guān),而Matlab法測(cè)值與病理鐵濃度相關(guān)性更高,提示Matlab法可準(zhǔn)確測(cè)量腦鐵含量。

腦鐵分布具有時(shí)間、空間異質(zhì)性[13-14]。本研究中2種方法所測(cè)磁化率值均與年齡呈正相關(guān),提示腦鐵含量隨年齡增加而呈逐漸緩升趨勢(shì),與既往研究[3,15]結(jié)果相符;2種方法所測(cè)磁化率值均以GP最高,PU次之,HP最低,與夏爽等[16]的研究結(jié)果一致,提示鐵在椎體外系功能運(yùn)作中具有重要作用。

本研究Matlab法所測(cè)FC磁化率值存在顯著性別差異,2種方法所測(cè)磁化率值均無側(cè)別差異,與XU等[17]研究結(jié)果一致;但也存在不同研究結(jié)果,如夏爽等[16]認(rèn)為GP磁化率存在性別差異、CA磁化率存在側(cè)別差異,洪居陸等[18]報(bào)道CA磁化率存在性別差異。磁化率分布存在異質(zhì)性,性別及側(cè)別間可能有所差別,有待加大樣本量深入分析。

本研究中Matlab法所測(cè)磁化率值整體低于手工勾畫法測(cè)值,可能與前者計(jì)算的是整個(gè)三維結(jié)構(gòu)的平均磁化率,而后者僅針對(duì)結(jié)構(gòu)最大層面勾畫ROI測(cè)得磁化率有關(guān);2種方法測(cè)量GP、PU、FC均存在少數(shù)異常值,提示測(cè)量過程中難免均存在誤差。

本研究的主要不足:受試者均為貴州本地人,可能存在地域偏倚;Matlab數(shù)據(jù)標(biāo)準(zhǔn)化過程采用東亞人標(biāo)準(zhǔn)腦模板,可能存在匹配及對(duì)應(yīng)偏差;在Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜中只選取部分腦亞區(qū)作為ROI,可能存在樣本量偏少等問題。

綜上所述,QSM是定量腦鐵含量的較準(zhǔn)確可靠的MRI技術(shù),可較好顯示腦鐵分布特點(diǎn)及隨年齡變化規(guī)律。因腦鐵含量可能存在性別差異,今后研究中需考慮性別影響。基于Brainnetome Atlas腦網(wǎng)絡(luò)組圖譜的Matlab定量測(cè)量腦鐵具有較高準(zhǔn)確性和可行性,能減少工作量、節(jié)省時(shí)間,但需注意警惕計(jì)算機(jī)配準(zhǔn)、校正、標(biāo)準(zhǔn)化過程可能造成的誤差。

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