農(nóng)春仕,孟國忠,尹佟明,汪貴斌,張遠(yuǎn)蘭
(1.南京林業(yè)大學(xué) 實(shí)驗(yàn)室與基地建設(shè)管理處,江蘇 南京 210037;2.南京林業(yè)大學(xué) 現(xiàn)代分析測(cè)試中心,江蘇 南京 210037;3.南京林業(yè)大學(xué) 林學(xué)院,江蘇 南京 210037;4.南京林業(yè)大學(xué) 生物與環(huán)境學(xué)院,江蘇 南京 210037)
2018 年6 月,教育部陳寶生部長(zhǎng)在新時(shí)代全國高等學(xué)校本科教育工作會(huì)上提出了“金課”概念。如何抓好虛擬仿真實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目的“金課”建設(shè),開辟“智能+教育”新途徑是新時(shí)代本科實(shí)驗(yàn)教學(xué)的重要任務(wù)。虛擬仿真技術(shù)是用虛擬系統(tǒng)模仿真實(shí)系統(tǒng)的技術(shù),也是仿真技術(shù)與虛擬現(xiàn)實(shí)技術(shù)相結(jié)合的產(chǎn)物[1]。隨著計(jì)算機(jī)仿真技術(shù)和信息技術(shù)的快速發(fā)展,虛擬仿真技術(shù)具有逼真、交互、虛擬等特點(diǎn),能夠真實(shí)模擬實(shí)驗(yàn)教學(xué)中的各種場(chǎng)景,使學(xué)校實(shí)驗(yàn)、實(shí)踐教學(xué)的手段發(fā)生顯著的變化[2-5]。虛擬仿真實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目是學(xué)科專業(yè)與信息技術(shù)深度融合的產(chǎn)物,更加適合新時(shí)代大學(xué)生的學(xué)習(xí)習(xí)慣,在教育教學(xué)中發(fā)揮著越來越重要的作用。植物組織培養(yǎng)是高等院校農(nóng)學(xué)、林學(xué)、植物學(xué)、生物科學(xué)、園林植物以及生物技術(shù)等本科專業(yè)必修的實(shí)驗(yàn)科目之一,也是對(duì)楊樹進(jìn)行基因工程操作的基礎(chǔ)性平臺(tái)。結(jié)合當(dāng)前虛擬仿真技術(shù)的快速發(fā)展,我校依托林木遺傳育種實(shí)驗(yàn)室建立的“南林895 楊”高效組培再生體系,按照“能實(shí)不虛、虛實(shí)互補(bǔ)”的原則,構(gòu)建了楊樹良種組培再生虛擬仿真實(shí)驗(yàn)平臺(tái),為“互聯(lián)網(wǎng)+”背景下建立與教學(xué)內(nèi)容相符的人性化實(shí)驗(yàn)教學(xué)運(yùn)行模式提供了支撐與保障[6-8]。
植物組織培養(yǎng)是一種對(duì)植物的器官、組織、細(xì)胞或原生質(zhì)體等進(jìn)行體外培養(yǎng)的技術(shù)?!澳狭?95 楊”是我校林木遺傳育種學(xué)科選育的優(yōu)良美洲黑楊品種,其良種組培快繁技術(shù)具有較強(qiáng)的技術(shù)優(yōu)勢(shì),對(duì)于植物組織培養(yǎng)相關(guān)課程的實(shí)踐教學(xué)具有積極示范作用。由于受課時(shí)和實(shí)驗(yàn)條件的限制,學(xué)生在傳統(tǒng)的植物組織培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)中主要進(jìn)行培養(yǎng)基配制、外植體選擇和接種等接觸性的實(shí)驗(yàn)操作,缺乏對(duì)植物組織培養(yǎng)完整動(dòng)態(tài)過程的感官認(rèn)知。同時(shí),在傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中,學(xué)生主要按照指導(dǎo)教師的實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),被動(dòng)地進(jìn)行培養(yǎng)基配制、外植體加工、接種等固定環(huán)節(jié)的操作,缺乏實(shí)驗(yàn)的自主性,此外,由于實(shí)驗(yàn)結(jié)果無法追蹤、重復(fù)性差,導(dǎo)致實(shí)驗(yàn)效果不理想。
利用現(xiàn)代虛擬仿真技術(shù),可以再現(xiàn)植物組織培養(yǎng)所必需的實(shí)驗(yàn)環(huán)境(包括準(zhǔn)備間、高壓滅菌室、無菌接種間和光照培養(yǎng)間等)、儀器設(shè)備(包括電子天平、PH 計(jì)、微波爐、高壓滅菌鍋和超凈工作臺(tái)等)以及組培的完整動(dòng)態(tài)過程。通過虛擬仿真實(shí)驗(yàn),學(xué)生可以自己設(shè)計(jì)培養(yǎng)基的配方,實(shí)時(shí)追蹤該誘導(dǎo)條件下的不定芽、莖伸長(zhǎng)生長(zhǎng)和不定根發(fā)育的動(dòng)態(tài)變化及其與最佳激素組合誘導(dǎo)結(jié)果的差異性,從中不僅可以深刻認(rèn)識(shí)到激素配比對(duì)組培再生效率的重要影響,而且根據(jù)反饋結(jié)果,可以通過反復(fù)實(shí)驗(yàn)優(yōu)化設(shè)計(jì)和操作,篩選出適合不同組培誘導(dǎo)階段的最佳激素組合,作為真實(shí)實(shí)驗(yàn)中的培養(yǎng)條件,達(dá)到虛擬與真實(shí)實(shí)驗(yàn)教學(xué)的有機(jī)融合。
傳統(tǒng)植物組織培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)周期長(zhǎng)、操作繁瑣、技術(shù)要求高[9-11],從葉片開始到大量再生植株移栽需要6個(gè)月以上的時(shí)間。而實(shí)驗(yàn)課時(shí)少,學(xué)生無法在規(guī)定的學(xué)時(shí)內(nèi)認(rèn)知組織培養(yǎng)的動(dòng)態(tài)過程和關(guān)鍵的影響環(huán)節(jié)。然而,通過虛擬仿真,學(xué)生可以在4 個(gè)學(xué)時(shí)內(nèi)完成整個(gè)實(shí)驗(yàn)操作流程,節(jié)約了時(shí)間和成本,提高了感官認(rèn)識(shí)。此外,學(xué)生可通過開放端口,隨時(shí)登錄系統(tǒng),進(jìn)行在線實(shí)驗(yàn)操作和自主學(xué)習(xí),不受預(yù)定實(shí)驗(yàn)課程安排的限制。
由于植物需要在滿足一定的環(huán)境條件下才能正常生長(zhǎng),因此植株組織培養(yǎng)從培育基配制、外植體選擇、不定芽誘導(dǎo)、不定芽伸長(zhǎng)、生根都需要在維持一定溫度、濕度、光照和潔凈度的組培室中進(jìn)行,整個(gè)實(shí)驗(yàn)過程需要投入大量人力和物力來維持。而通過虛擬仿真,有效克服了植物組織培養(yǎng)的空間限制。此外,植物虛擬仿真實(shí)驗(yàn)可以基于PC 端和移動(dòng)端而設(shè)計(jì),學(xué)生不受實(shí)驗(yàn)地點(diǎn)的限制進(jìn)行實(shí)踐操作,突破了空間的限制。從理論上來講,虛擬仿真實(shí)驗(yàn)可以無限次重復(fù)進(jìn)行,有效節(jié)約實(shí)驗(yàn)成本。
楊樹良種組培再生虛擬仿真實(shí)驗(yàn)基于“以學(xué)生為中心”的教學(xué)理念開發(fā)設(shè)計(jì),體現(xiàn)了良好的交互性。在線實(shí)驗(yàn)操作過程中,學(xué)生可以根據(jù)系統(tǒng)的提示和自己對(duì)植物組織培養(yǎng)基本知識(shí)點(diǎn)的理解和把握情況,自主設(shè)計(jì)誘導(dǎo)培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)素和細(xì)胞分裂素使用濃度、選擇外植體和接種方向等關(guān)鍵參數(shù)。通過自主設(shè)計(jì)的實(shí)驗(yàn)結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)進(jìn)行對(duì)比,在線分析其中的原因和改進(jìn)措施,可以有效解決傳統(tǒng)實(shí)驗(yàn)教學(xué)中學(xué)生因無法參與實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì),只能被動(dòng)地進(jìn)行實(shí)驗(yàn)操作的問題,提高學(xué)生在實(shí)驗(yàn)中的主觀能動(dòng)性和積極性。此外,學(xué)生也可以通過系統(tǒng)中的交互窗口,及時(shí)對(duì)實(shí)驗(yàn)中存在的問題與指導(dǎo)教師進(jìn)行交流互動(dòng)。
學(xué)生通過網(wǎng)頁瀏覽器登錄虛擬仿真實(shí)驗(yàn)平臺(tái),自主選擇實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目,系統(tǒng)通過模塊調(diào)用、數(shù)據(jù)交互,實(shí)現(xiàn)學(xué)生對(duì)實(shí)驗(yàn)工況及相關(guān)條件參數(shù)的選擇,并進(jìn)行過程演示,最終得到運(yùn)行結(jié)果,并對(duì)實(shí)驗(yàn)結(jié)果進(jìn)行對(duì)比分析,完成實(shí)驗(yàn)報(bào)告生成。
虛擬仿真實(shí)驗(yàn)通過3D 仿真、動(dòng)畫技術(shù)、WebGL技術(shù),應(yīng)用Flash、3d Max、Adobe After Effects、Adobe Photoshop 等開發(fā)工具,再現(xiàn)植物組培的全過程。在項(xiàng)目品質(zhì)方面,單場(chǎng)景模型總面數(shù)可達(dá)6 萬左右,貼圖分辨率為1920×1080,每幀渲染次數(shù)為24 次,動(dòng)作反饋時(shí)間為0.1 s,實(shí)時(shí)顯示刷新率,分辨率為1920×1080。
我校虛擬仿真實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目平臺(tái)的功能模塊框架如圖1 所示。根據(jù)功能需要和角色不同,將實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目平臺(tái)的基本架構(gòu)設(shè)計(jì)為三個(gè)權(quán)限不等的功能區(qū),即學(xué)生功能區(qū)、教師功能區(qū)和管理功能區(qū)。在每個(gè)功能區(qū)下設(shè)計(jì)若干執(zhí)行某一特定任務(wù)的工作模塊,并在工作模塊中加載相關(guān)的虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)資源數(shù)據(jù)。在學(xué)生功能區(qū),學(xué)生可以實(shí)現(xiàn)從實(shí)驗(yàn)前預(yù)習(xí)和測(cè)試、實(shí)驗(yàn)中操作練習(xí)、實(shí)驗(yàn)后完成實(shí)驗(yàn)報(bào)告和課后測(cè)試等不同環(huán)節(jié),幫助全面掌握植物組織培養(yǎng)相關(guān)知識(shí)。在教師功能區(qū),任課教師可以通過關(guān)注學(xué)生在網(wǎng)絡(luò)上實(shí)驗(yàn)全程記錄,全面客觀地評(píng)價(jià)學(xué)生對(duì)植物組織培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)的掌握情況,并對(duì)學(xué)生進(jìn)行綜合成績(jī)?cè)u(píng)定,可以有效地克服傳統(tǒng)教學(xué)中僅憑學(xué)生在實(shí)驗(yàn)中的表現(xiàn)和實(shí)驗(yàn)報(bào)告進(jìn)行成績(jī)?cè)u(píng)定的不足。在管理員功能區(qū),管理人員可以對(duì)平臺(tái)用戶的權(quán)限、數(shù)據(jù)、安全等提供基本管理服務(wù),保證平臺(tái)的安全、有序運(yùn)行。
圖1 實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目平臺(tái)的功能模塊框架
1902 年,德國著名植物學(xué)家哈勃蘭特提出植物細(xì)胞全能性的概念。他認(rèn)為由于植物的每個(gè)體細(xì)胞都含有該物種全部的遺傳信息,因此均具備發(fā)育成完整植株的潛在能力[12]。目前,該理論已經(jīng)被越來越多的植物組織培養(yǎng)的成功案例所證實(shí),使之成為指導(dǎo)植物組織培養(yǎng)的基本理論基礎(chǔ)。楊樹良種組培再生虛擬仿真實(shí)驗(yàn)主要涉及基本培養(yǎng)基、激素濃度配比、外植體選擇、外植體接種方式以及外在培養(yǎng)條件等5 個(gè)知識(shí)點(diǎn)。其中,基本培養(yǎng)基為離體器官或組織的生長(zhǎng)和發(fā)育提供基本的營(yíng)養(yǎng),主要由無機(jī)營(yíng)養(yǎng)物、碳源、維生素、有機(jī)附加物等組成[13];離體植物材料的細(xì)胞分裂和分化活動(dòng)主要依賴于培養(yǎng)基中的生長(zhǎng)調(diào)節(jié)物質(zhì)及其濃度配比。外植體是指用于離體培養(yǎng)的植物組織、器官或細(xì)胞,其狀態(tài)的好壞直接決定著細(xì)胞的分裂和分化能力。在外植體的選擇過程中,需要綜合考慮基因型、外植體的來源、取材季節(jié)、外植體的生理狀態(tài)和發(fā)育年齡以及外植體的大小等因素;就外植體接種方式而言,植物不同部位的組織和器官由于行使的功能不同,在結(jié)構(gòu)上也存在很大的差異。例如,葉片近軸面和遠(yuǎn)軸面在組織結(jié)構(gòu)上的差異決定了兩者對(duì)培養(yǎng)基中營(yíng)養(yǎng)和生理調(diào)節(jié)物質(zhì)的吸收能力是不同的;環(huán)境條件也會(huì)影響到離體植物組織或器官的生長(zhǎng)發(fā)育過程,主要包括溫度、溫度和光照等因素。
在虛擬仿真實(shí)驗(yàn)中,學(xué)生是學(xué)習(xí)的主體。因此,學(xué)生能否利用好虛擬資源是完成虛擬仿真實(shí)驗(yàn)的關(guān)鍵。對(duì)本項(xiàng)目而言,學(xué)生可以通過智能手機(jī)或PC 登錄實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目平臺(tái),熟悉實(shí)驗(yàn)背景、目的,完成課前測(cè)試,并按照?qǐng)D2 所示流程開展植物組織培養(yǎng)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)。
圖2 植物組織培養(yǎng)虛擬仿真實(shí)驗(yàn)流程
(1)實(shí)驗(yàn)前準(zhǔn)備。學(xué)生在系統(tǒng)登錄界面,輸入姓名和學(xué)號(hào)后,點(diǎn)擊“確定”,直接進(jìn)入到實(shí)驗(yàn)操作界面。通過實(shí)驗(yàn)簡(jiǎn)介和幫助等模塊,了解項(xiàng)目背景、實(shí)驗(yàn)原理、目的、基本操作以及操作系統(tǒng)使用方法。
(2)虛擬實(shí)驗(yàn)操作。依次點(diǎn)擊實(shí)驗(yàn)操作界面左側(cè)培養(yǎng)基配制(見圖3)、接種材料選擇和葉盤制作、不定芽誘導(dǎo)、莖伸長(zhǎng)培養(yǎng)、不定根誘導(dǎo)和煉苗移栽等模塊,根據(jù)系統(tǒng)提示,進(jìn)行相關(guān)參數(shù)設(shè)置和實(shí)驗(yàn)操作。
(3)撰寫實(shí)驗(yàn)報(bào)告。實(shí)驗(yàn)操作完成以后,學(xué)生點(diǎn)擊操作界面上方的“實(shí)驗(yàn)報(bào)告”模塊,系統(tǒng)記錄學(xué)生的操作過程,生成實(shí)驗(yàn)結(jié)果統(tǒng)計(jì)表。學(xué)生在統(tǒng)計(jì)表格中如實(shí)填寫不定芽和不定根數(shù)量,并計(jì)算不定芽/不定根的誘導(dǎo)率、平均不定芽/不定根數(shù),最后學(xué)生對(duì)比分析自主實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)結(jié)果與標(biāo)準(zhǔn)實(shí)驗(yàn)結(jié)果,完成數(shù)據(jù)分析后,在線撰寫并提交實(shí)驗(yàn)報(bào)告,如圖4 所示。
圖3 培養(yǎng)基配制頁面
(4)實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目評(píng)價(jià)。實(shí)驗(yàn)報(bào)告在線提交以后,點(diǎn)擊界面上方的“課后習(xí)題測(cè)試”模塊,系統(tǒng)隨機(jī)從數(shù)據(jù)庫中抽取由5~10 道題組成的試卷,學(xué)生在線作答并提交,系統(tǒng)自動(dòng)打分,并給出正確答案。整個(gè)實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目考核包括課前預(yù)習(xí)及在線測(cè)試、真實(shí)和虛擬實(shí)驗(yàn)中的操作能力、實(shí)驗(yàn)報(bào)告和綜合能力測(cè)試4 個(gè)部分,并根據(jù)每項(xiàng)考核指標(biāo)的重要性,分別給予一定的權(quán)重,最后由此計(jì)算出學(xué)生的綜合評(píng)定成績(jī)。
傳統(tǒng)植物組織培養(yǎng)實(shí)驗(yàn)所利用的植物材料體積小,抗逆性差,對(duì)環(huán)境條件要求嚴(yán)格,需投入大量人力、物力,成本較高。通過虛擬仿真實(shí)驗(yàn)平臺(tái),學(xué)生能夠在線進(jìn)行培養(yǎng)基配方設(shè)計(jì)、配制、分裝、高壓滅菌、外植體選擇、加工和接種不定芽誘導(dǎo)、壯苗、不定根誘導(dǎo)和煉苗移栽等實(shí)驗(yàn)操作,并實(shí)時(shí)追蹤特定誘導(dǎo)條件下的不定芽、莖生長(zhǎng)和不定根的發(fā)育變化,有效地解決了因植物組織培養(yǎng)周期過長(zhǎng)及課時(shí)和空間有限而導(dǎo)致的實(shí)驗(yàn)操作有限和實(shí)驗(yàn)結(jié)果難以跟蹤的難題,為“植物細(xì)胞工程”“植物基因工程”等實(shí)驗(yàn)的開展提供了有益的在線輔助工作。
在虛擬仿真實(shí)驗(yàn)平臺(tái),學(xué)生可以自己設(shè)計(jì)不同階段誘導(dǎo)培養(yǎng)基中的激素濃度配比,并實(shí)時(shí)追蹤與比較該誘導(dǎo)條件下的不定芽、莖伸長(zhǎng)生長(zhǎng)和不定根發(fā)育與實(shí)驗(yàn)參照之間的差異性。同時(shí),虛擬仿真實(shí)驗(yàn)可以無限次重復(fù)進(jìn)行,使學(xué)生能夠在反復(fù)實(shí)驗(yàn)過程中發(fā)現(xiàn)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)存在的問題,可以通過重新設(shè)計(jì)實(shí)驗(yàn)參數(shù)和反復(fù)操作,深入理解激素配比對(duì)植物組織培養(yǎng)階段性發(fā)育過程的重要性和差異性,提升學(xué)生參與實(shí)驗(yàn)的主觀能動(dòng)性與創(chuàng)造性。
通過網(wǎng)絡(luò)平臺(tái),學(xué)生可以隨時(shí)隨地進(jìn)行在線實(shí)驗(yàn)操作。如在實(shí)驗(yàn)前,學(xué)生可以通過系統(tǒng)中的相關(guān)模塊,事先了解實(shí)驗(yàn)?zāi)康?、原理等相關(guān)基本知識(shí)。實(shí)驗(yàn)課后,可以通過重復(fù)實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)和操作,鞏固課堂所學(xué)內(nèi)容。通過這種由“實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)—結(jié)果反饋—發(fā)現(xiàn)問題”的過程,培養(yǎng)學(xué)生科學(xué)的實(shí)驗(yàn)方法,拓展其知識(shí)視野,激發(fā)個(gè)人的主觀能動(dòng)性和創(chuàng)造性。同時(shí),學(xué)生還可以通過在線交流的形式,與教師進(jìn)行一定的互動(dòng)交流,提升學(xué)習(xí)的針對(duì)性和實(shí)效性。通過實(shí)驗(yàn)平臺(tái),任課教師可以清晰地了解學(xué)生對(duì)相關(guān)知識(shí)的掌握情況,為今后有針對(duì)性地開展課堂教學(xué)提供參考信息。
楊樹良種組培再生虛擬仿真實(shí)驗(yàn)項(xiàng)目秉承“虛實(shí)結(jié)合、綠色共享”的理念開發(fā)設(shè)計(jì),虛擬條件下的植物生長(zhǎng)過程是對(duì)實(shí)際實(shí)驗(yàn)結(jié)果的動(dòng)態(tài)模擬,虛擬結(jié)果是基于長(zhǎng)期研究過程中積累的大量實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)。目前,該項(xiàng)目已獲得2018 年度國家虛擬仿真實(shí)驗(yàn)教學(xué)項(xiàng)目認(rèn)定,截至2019 年10 月,已有14 540 人次使用該平臺(tái)。通過虛擬仿真實(shí)驗(yàn)平臺(tái),為其他生物基礎(chǔ)理論的深入研究提供了必要的方法和手段,拓展了相關(guān)專業(yè)學(xué)生學(xué)習(xí)知識(shí)的深度和廣度,可以有效激勵(lì)學(xué)生投入理論知識(shí)學(xué)習(xí)和實(shí)踐訓(xùn)練的積極性和想象力,有效解決教學(xué)過程中的沖突、壓力和倦怠等問題,為創(chuàng)新型人才的培養(yǎng)創(chuàng)造了條件,取得了良好效果。