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嗜水氣單胞菌感染暗紋東方鲀脾臟的蛋白質(zhì)組學(xué)分析

2020-10-30 01:06付勝利劉海粟廖紹安
關(guān)鍵詞:水氣脾臟單胞菌

付勝利, 劉海粟, 廖紹安*, 郭 政*

(1. 天津市水產(chǎn)生態(tài)及養(yǎng)殖重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室, 天津 300384; 2. 華南師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院∥廣東省水產(chǎn)優(yōu)質(zhì)環(huán)保養(yǎng)殖工程技術(shù)研究中心, 廣州 510631)

暗紋東方鲀(Takifuguobscurus)屬硬骨魚綱,輻鰭亞綱,鱸形總目,鲀形目(Letrodontiforms),鲀科(Terradontidae),東方鲀屬(Takifugu),在我國主要分布在東海、渤海、黃海以及長江中上游[1],其味道鮮美,脂肪含量低,蛋白質(zhì)含量高,是享譽(yù)國內(nèi)外的“長江三鮮”之一[2]. 2016年9月我國出臺(tái)了新的河豚產(chǎn)品購銷政策,取消了對暗紋東方鲀和紅鰭東方鲀的限制性養(yǎng)殖,中國河豚市場初步開放,其人工養(yǎng)殖產(chǎn)量亦逐年增長,具有廣闊的開發(fā)和利用前景[3]. 隨著河豚養(yǎng)殖業(yè)的快速發(fā)展,養(yǎng)殖面積不斷擴(kuò)大,集約化程度不斷提高,養(yǎng)殖水質(zhì)易惡化,在養(yǎng)殖過程中,魚病害頻發(fā),對河豚養(yǎng)殖業(yè)造成巨大損失. 嗜水氣單胞菌作為一種廣泛存在于淡水、污水以及土壤中的病原菌,是我國危害養(yǎng)殖魚種類最多、影響區(qū)域最廣、流行季節(jié)最長、發(fā)病率和死亡率高、造成經(jīng)濟(jì)損傷最嚴(yán)重的細(xì)菌性病原之一,對我國水產(chǎn)養(yǎng)殖業(yè)造成了嚴(yán)重的威脅[4-6].

在硬骨魚中,脾臟作為主要的免疫器官之一,也是紅細(xì)胞和各種粒細(xì)胞等產(chǎn)生、儲(chǔ)存和成熟的主要場所,可為魚體提供充足的血液和大量的免疫細(xì)胞[7-8],其功能主要包括:清除大分子物質(zhì),降解和呈遞抗原以及抗體生成等[9]. 當(dāng)硬骨魚受到外源刺激時(shí),脾臟可以產(chǎn)生大量的黑色素巨噬細(xì)胞,它可以通過結(jié)合抗體和淋巴細(xì)胞來調(diào)節(jié)免疫功能[10]. 目前,對于暗紋東方鲀抵抗病原菌的研究較少,主要集中在基因表達(dá)層面上的探究[11-13],而相對于基因組學(xué),蛋白質(zhì)組學(xué)對生命現(xiàn)象的詮釋更直接、更準(zhǔn)確. 本研究采用TMT標(biāo)記、高效液相色譜(HPLC)分級技術(shù)以及基于質(zhì)譜的定量蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),檢測病原菌感染暗紋東方鲀后脾臟蛋白的表達(dá)變化,分析其抵抗病原菌的關(guān)鍵蛋白和富集通路,為進(jìn)一步探究病原菌感染暗紋東方鲀的致病機(jī)理提供了一定的理論基礎(chǔ).

1 材料與方法

1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物

健康暗紋東方鲀購于廣州市金洋水產(chǎn)有限公司,平均體質(zhì)量為45.4 ± 2.2 g,體長為9.2 ± 1.3 cm. 購買回來的暗紋東方鲀暫養(yǎng)2周,使其適應(yīng)養(yǎng)殖環(huán)境,暫養(yǎng)期間飼養(yǎng)于300 L/桶循環(huán)養(yǎng)殖系統(tǒng)中,養(yǎng)殖循環(huán)水溫度為23~25 ℃,pH為7.5~7.7,氨氮的質(zhì)量濃度≤0.05 mg/L,溶解氧的質(zhì)量濃度≥6.0 mg/L,期間個(gè)體死亡率極低(≤0.5%).

1.2 主要試劑和儀器

碘代乙酰胺(Iodoacetamide)、二硫蘇糖醇(Dithiothreitol)、尿素(Urea)、三氯乙酸(Trichloroacetic Acid)、四乙基溴化銨(TEAB)購買于美國Sigma公司;1×磷酸緩沖鹽溶液(1×PBS)、RPMI-1640培養(yǎng)液購買于美國Gibco公司;Annexin V-FITC細(xì)胞凋亡檢測試劑盒、Fluo-3 AM、BCA試劑盒購買于中國碧云天生物技術(shù)公司;TMT標(biāo)記試劑盒購買于德國Thermo公司; Easy nLc色譜系統(tǒng)、Q ExactiveTM質(zhì)譜儀、Multiskcan FC酶標(biāo)儀購買于德國Thermo公司;低溫高速離心機(jī)、真空離心濃縮儀購買于德國Eppendorf公司;勻漿儀購買于中國杭州米歐有限公司;AKTA Purifier 100純化儀購買于美國GE Healthcare公司;流式細(xì)胞儀購買于美國BD公司.

1.3 暗紋東方鲀感染及取樣

暗紋東方鲀致病菌嗜水氣單胞菌(BYK00810)(購買于水產(chǎn)種質(zhì)資源發(fā)掘與利用教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,上海海洋大學(xué))經(jīng)活化計(jì)數(shù). 暗紋東方鲀分為實(shí)驗(yàn)組和對照組,各50尾,實(shí)驗(yàn)組每尾注射100 μL菌液,菌液濃度為1×108CFU/mL[1],對照組注射等體積無菌磷酸緩沖鹽溶液(PBS). 在注射后0、3、6、12、24、48、72 h各采集實(shí)驗(yàn)組和對照組脾臟,每個(gè)時(shí)間點(diǎn)各3尾,脾臟細(xì)胞用于流式細(xì)胞儀檢測. 另外,感染12 h時(shí),采集實(shí)驗(yàn)組和對照組脾臟各5尾,-80 ℃凍存. 感染嗜水氣單胞菌后的暗紋東方鲀相對于健康暗紋東方鲀,游動(dòng)緩慢,肝臟充血.

1.4 脾臟細(xì)胞凋亡率

將取好的脾臟組織用2.5 mL注射器搗碎后通過75 μm一次性篩網(wǎng)過濾組織,細(xì)胞提取步驟參照本實(shí)驗(yàn)室潘訓(xùn)彬等[14]的實(shí)驗(yàn)方法,利用Annexin V-FITC細(xì)胞凋亡檢測試劑盒通過流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞凋亡. 將脾臟細(xì)胞稀釋后計(jì)數(shù),用無菌PBS稀釋至1×106個(gè)/mL,取200 μL細(xì)胞懸液,加入2.5 μL Annexin V-FITC和5 μL PI工作液避光染色15 min,再加入50 μL 5×Annexin V 結(jié)合緩沖液后上機(jī)檢測.

1.5 胞內(nèi)游離Ca2+含量

以Fluo-3AM為熒光探針,利用流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞內(nèi)游離的鈣離子含量. 根據(jù)本實(shí)驗(yàn)室XIAN等[15]的實(shí)驗(yàn)步驟. 取上述脾臟細(xì)胞懸液200 μL,加入10 μmol/L Fluo-3AM避光孵育30 min,1×PBS洗滌3次,每次500×g、4 ℃離心3 min,洗滌結(jié)束后用1×PBS懸浮細(xì)胞,上機(jī)檢測.

1.6 蛋白質(zhì)提取及酶解

取適量組織樣品,于研缽中充分研磨至粉末,期間不斷添加液氮制冷. 將粉末轉(zhuǎn)移至含有4倍體積裂解緩沖液(8 mol/L尿素,1%蛋白酶抑制劑)離心管中,超聲裂解后離心,離心條件:4 ℃,12 000 r/min,10 min,去除細(xì)胞碎片,上清液轉(zhuǎn)移至新的離心管,利用BCA試劑盒進(jìn)行蛋白濃度測定.

向蛋白溶液中添加終濃度為5 mmol/L的二硫蘇糖醇,56 ℃孵育30 min. 之后加入終濃度為11 mmol/L的碘代乙酰胺,室溫避光孵育15 min. 將樣品的尿素濃度稀釋至2 mol/L以下. 加入胰酶適量(m(胰酶)∶m(蛋白)=1∶50),酶解過夜. 再加入胰酶適量(m(胰酶)∶m(蛋白)=1∶50),酶解4 h.

1.7 TMT標(biāo)記和HPLC分級

將上述酶解蛋白用Strata X C18 (Phenomenex)除鹽后真空冷凍干燥. 然后用0.5 mol/L 四乙基溴化銨溶解,操作參照陳敏氡等[16]步驟.

將每組標(biāo)記后的肽段采用高pH反向HPLC分級,在Agilent 300 Extend C18 (5 μm粒徑,4.6 mm內(nèi)徑,250 mm長)中進(jìn)行分離. 操作如下:分級梯度為8%~32%乙腈,調(diào)整pH 9,60 min分離60個(gè)組分,然后肽段合并為18個(gè)組分,真空冷凍干燥后進(jìn)行后續(xù)操作.

1.8 液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用分析

肽段用液相色譜流動(dòng)相A相(體積分?jǐn)?shù)為0.1%的甲酸水溶液)溶解后. 使用EASY-nLC 1000超高效液相系統(tǒng)進(jìn)行分離. 液相梯度設(shè)置:0~24 min 7%~25%;24~32 min 25%~40%;32~36 min 35%~80%;36~40 min 80%,流速維持在350 nL/min. 肽段用液相色譜流動(dòng)相A相(0.1%甲酸和2%乙腈的水溶液)溶解后進(jìn)行分離. 分離后的肽段注入NSI離子源中進(jìn)行電解,然后用Q ExactiveTM質(zhì)譜儀進(jìn)行分析. 具體分析步驟參照陳敏氡等[16]步驟.

1.9 數(shù)據(jù)庫搜索

用Maxquant(v1.5.2.8)檢索二次質(zhì)譜分析數(shù)據(jù). 檢索參數(shù)設(shè)置:數(shù)據(jù)庫為本實(shí)驗(yàn)室轉(zhuǎn)錄組(57 208條序列),添加了反庫以計(jì)算隨機(jī)匹配造成的假陽性率(FDR),并且在數(shù)據(jù)庫中加入了常見的污染庫,用于消除鑒定結(jié)果中的污染蛋白的影響,具體分析步驟參照陳敏氡等[16]步驟. 定量方法設(shè)置為TMT-6plex,蛋白鑒定、PSM鑒定的FDR都設(shè)置為1%. 依據(jù)蛋白質(zhì)豐度水平,以注射PBS組暗紋東方鲀脾臟為參考,將注射嗜水氣單胞菌12 h的暗紋東方鲀脾臟樣品與之比較,當(dāng)差異倍數(shù)≥1.3(上調(diào))或≤0.77(下調(diào)),且經(jīng)統(tǒng)計(jì)檢驗(yàn)其P<0.05時(shí),視為差異表達(dá)蛋白質(zhì).

1.10 生物信息學(xué)分析

Gene Ontology (GO)對蛋白組學(xué)層面的注釋來源于UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫(www.http://www.ebi.ac.uk/GOA/). 首先,系統(tǒng)會(huì)將蛋白ID轉(zhuǎn)化為UniProt ID,之后用UniProt ID去匹配GO ID,并依據(jù)GO ID從UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫中調(diào)取相應(yīng)的信息. 如果UniProt-GOA數(shù)據(jù)庫中沒有所查詢的蛋白信息,那么會(huì)使用InterProScan,去預(yù)測該蛋白的GO功能,通過KEGG(Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes)數(shù)據(jù)庫(http://www.kegg.jp/kegg/pathway.html)分析差異表達(dá)蛋白主要參與的生化代謝途徑和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)途徑.

2 結(jié)果與分析

2.1 脾臟細(xì)胞凋亡率和胞內(nèi)游離鈣離子含量

利用流式細(xì)胞儀檢測感染嗜水氣單胞菌后的暗紋東方鲀脾臟細(xì)胞凋亡水平和細(xì)胞質(zhì)游離鈣離子含量變化,PBS組為對照. 實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明(圖1):感染3 h后脾臟細(xì)胞凋亡率升高,相對于對照組,差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.01),在12 h達(dá)到最高值,為對照組的5.4倍,之后逐步下降(圖1A),但仍極顯著高于對照組(P<0.01). 病原菌介導(dǎo)脊椎動(dòng)物細(xì)胞凋亡主要有2條途徑:一條是外在或死亡受體途徑,另一條是內(nèi)在或線粒體途徑,兩者相互關(guān)聯(lián),最終通過含半胱氨酸的天冬氨酸蛋白水解酶(Caspase)家族基因,介導(dǎo)細(xì)胞凋亡[1]. 暗紋東方鲀的Caspase家族基因的結(jié)構(gòu)和功能有待進(jìn)一步分析.

感染6 h后,脾臟細(xì)胞的細(xì)胞質(zhì)中游離鈣離子含量顯著上調(diào),差異極顯著(P<0.01),在12、24 h達(dá)到最大值,分別為對照組的3.74、3.71倍,之后逐步下調(diào)(圖1B),72 h后仍極顯著高于對照組(P<0.01). 胞內(nèi)鈣離子來源主要包括胞外的鈣離子內(nèi)流和鈣庫的鈣離子外流[17],硬骨魚的鈣離子信號通路與病原菌感染之間的關(guān)系有待進(jìn)一步探究.

圖1 感染嗜水氣單胞菌后暗紋東方鲀的脾臟細(xì)胞凋亡水平和細(xì)胞質(zhì)游離鈣離子含量變化Figure 1 The apoptosis level of spleen cells and the concentration of free Ca2+ in the cytoplasm of T. obscurus after infection with A. hydrophila

2.2 差異表達(dá)蛋白的統(tǒng)計(jì)及分析

2.2.1 差異表達(dá)蛋白統(tǒng)計(jì) 本實(shí)驗(yàn)通過光譜儀獲得的光譜數(shù)188 618,與對比蛋白匹配的光譜數(shù)32 913,獲得肽段21 588個(gè),鑒定到蛋白4 133個(gè),包括定量蛋白3 672個(gè). 以差異倍數(shù)值變化超過1.3倍作為顯著上調(diào)、小于1/1.3作為顯著下調(diào)的變化標(biāo)準(zhǔn),獲得差異表達(dá)蛋白306個(gè),其中120個(gè)蛋白表達(dá)上調(diào),186個(gè)蛋白表達(dá)下調(diào),其中和免疫相關(guān)的差異蛋白有整合素β1(ITGB1)、血漿血管性血友病因子(VWF)、Ⅰ型膠原α1(COL1A)、CD44、免疫球蛋白重鏈(IGH)、1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶(InsP3)、CD38、經(jīng)典蛋白激酶Cβ型(PRKCB)、一氧化氮合成酶(NOS1)、磷脂酰肌醇磷脂酶C(PLCD).

2.2.2 差異表達(dá)蛋白的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)定位分析 使用Wolfpsort軟件對差異表達(dá)蛋白進(jìn)行了亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)的預(yù)測和分類統(tǒng)計(jì),從結(jié)果(表1)中可以看出:上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白定位在細(xì)胞質(zhì)中的比例最高,分別占22%和27%,上調(diào)蛋白定位在細(xì)胞膜和線粒體中也較多,而下調(diào)蛋白則定位在細(xì)胞核和胞外的較多.

表1 上調(diào)和下調(diào)差異表達(dá)蛋白的亞細(xì)胞結(jié)構(gòu)定位分布情況Table 1 The location of subcellular structures of up- and down-regulated expression proteins

2.2.3 差異表達(dá)蛋白的GO注釋 對差異表達(dá)蛋白的生物進(jìn)程、細(xì)胞組成和分子功能進(jìn)行分析(表2、表3),結(jié)果表明:差異表達(dá)蛋白參與的主要生物進(jìn)程有8個(gè),上調(diào)蛋白參與最多的生物進(jìn)程是代謝過程,下調(diào)蛋白參與最多的是細(xì)胞進(jìn)程;從差異蛋白所屬細(xì)胞組分(5個(gè))來看,上調(diào)蛋白以細(xì)胞膜上蛋白居多,下調(diào)蛋白以細(xì)胞中蛋白居多;在主要分子功能(4個(gè))方面,上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白均以結(jié)合功能和催化活性為最多.

表2 上調(diào)蛋白在GO二級注釋中的分布情況Table 2 The distribution of up-regulated expression proteins in GO annotation

表3 下調(diào)蛋白在GO二級注釋中的分布情況Table 3 The distribution of down-regulated expression proteins in GO annotation

2.2.4 差異表達(dá)蛋白的功能富集分析 將GO注釋中除了一級三大類之外的條目進(jìn)行了富集分析(圖2). 細(xì)胞組分上,上調(diào)蛋白主要富集到6個(gè),其中胞外區(qū)富集最多,而下調(diào)蛋白主要富集到8個(gè),其中核糖核蛋白復(fù)合體富集最多;分子功能上,上調(diào)蛋白和下調(diào)蛋白各富集到8個(gè)類別,其中上調(diào)蛋白主要富集到鈣離子結(jié)合、羧酸酯水解酶活性、果糖二磷酸醛糖酶活性、醛裂合酶活性、脂結(jié)合蛋白、氧化還原酶活性、血紅素結(jié)合、四吡咯結(jié)合等功能,下調(diào)蛋白主要富集到結(jié)構(gòu)分子活動(dòng)、核糖體的結(jié)構(gòu)組成、細(xì)胞外基質(zhì)結(jié)構(gòu)組成、三價(jià)鐵離子結(jié)合、黃素單核苷酸結(jié)合、水解酶活性、鐵離子結(jié)合、肌動(dòng)蛋白結(jié)合等功能;生物進(jìn)程上,上調(diào)蛋白富集到12條生物進(jìn)程,包括碳水化合物代謝過程、脂質(zhì)轉(zhuǎn)運(yùn)、多元醇代謝過程等進(jìn)程,下調(diào)蛋白富集到14條生物進(jìn)程,包括翻譯、細(xì)胞酰胺代謝過程、肽生物合成過程等進(jìn)程.

圖2 差異表達(dá)蛋白的GO富集結(jié)果Figure 2 The GO enrichment results of DEPs

差異表達(dá)蛋白KEGG通路富集結(jié)果顯示(圖3):上調(diào)蛋白主要富集到和代謝相關(guān)通路上,如葉酸合成、精氨酸和脯氨酸代謝、組氨酸代謝、煙酸和煙酰胺代謝、藥物代謝;而下調(diào)蛋白主要富集到核糖體、視黃醇代謝、鈣離子信號通路、ECM受體相互作用、糖尿病并發(fā)癥中的AGE-RAGE信號通路. 其中和免疫相關(guān)通路主要是鈣離子信號通路和ECM受體相互作用,注釋到這2條通路上的差異蛋白具體見表4和表5.

圖3 差異表達(dá)蛋白的KEGG通路富集結(jié)果Figure 3 The KEGG pathway enrichment of DEPs

表4 嗜水氣單胞菌感染暗紋東方鲀后脾臟和免疫相關(guān)表達(dá)上調(diào)的差異蛋白Table 4 The immune-related up-regulated DEPs in spleen of pufferfish after A. hydrophila infection

表5 嗜水氣單胞菌感染暗紋東方鲀后脾臟和免疫相關(guān)表達(dá)下調(diào)的差異蛋白Table 5 The immune-related down-regulated DEPs in spleen of pufferfish after A. hydrophila infection

2.3 差異蛋白的PRM驗(yàn)證

選取4個(gè)差異表達(dá)蛋白進(jìn)行PRM驗(yàn)證,其中包括1個(gè)上調(diào)表達(dá)蛋白ITGB1和3個(gè)下調(diào)表達(dá)蛋白IGH、CD38、COL1A(表6). 結(jié)果顯示:蛋白質(zhì)組測序和PRM結(jié)果一致,說明本次測序具有一定可靠性.

表6 PRM實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證差異表達(dá)蛋白Table 6 The confirmation of DEPs detected in PRM analysis

3 討論

本實(shí)驗(yàn)利用TMT蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),探究了暗紋東方鲀感染嗜水氣單胞菌前后脾臟組織蛋白質(zhì)表達(dá)變化. 實(shí)驗(yàn)共篩選到306個(gè)差異表達(dá)蛋白,其中120個(gè)差異蛋白上調(diào),186個(gè)差異蛋白下調(diào);從中篩選4個(gè)和免疫相關(guān)的差異表達(dá)蛋白(1個(gè)上調(diào),3個(gè)下調(diào)),利用PRM試驗(yàn)進(jìn)行驗(yàn)證,表達(dá)結(jié)果一致. 對免疫相關(guān)的差異蛋白進(jìn)行分析發(fā)現(xiàn):上調(diào)蛋白有整合素β1、血漿血管性血友病因子,下調(diào)蛋白有Ⅰ型膠原α1、CD44、免疫球蛋白重鏈、1,3,4-三磷酸肌醇5/6激酶、CD38、經(jīng)典蛋白激酶Cβ型、一氧化氮合成酶、磷脂酰肌醇磷脂酶C.

整合素β1(ITGB1)是整合素家族的跨膜蛋白,作為主要的細(xì)胞黏附分子和細(xì)胞外基質(zhì)(ECM)相關(guān)分子,其激活的下游通路參與了多種細(xì)胞功能的調(diào)控,包括增值、存活、遷移和分化[18]. 對小菜蛾(Plutellaxylostella)ITGB1基因進(jìn)行克隆表達(dá),發(fā)現(xiàn)其在昆蟲免疫的包囊作用中起到重要作用,表明ITGB1蛋白在小菜蛾血細(xì)胞免疫過程中發(fā)揮重要作用[19]. 在稀有鮈鯽(Gobiocyprisrarus)的研究表明:ITGB1的缺失對凋亡相關(guān)基因的表達(dá)有一定影響,同時(shí)降低了草魚腸孤病毒(GCRV)的進(jìn)入效率[20]. 暗紋東方鲀受到嗜水氣單胞菌感染后脾臟ITGB1蛋白表達(dá)量上調(diào),說明其可能參與了暗紋東方鲀抵抗病原菌感染過程,其具體機(jī)制還有待進(jìn)一步探究.

血漿血管性血友病因子(VWF)是一種重要的血漿成分,參與血小板的黏附和聚集過程[21]. 斑馬魚中的研究表明,斑馬魚血小板聚集過程中VWF表達(dá)上調(diào)[22]. 暗紋東方鲀受到嗜水氣單胞菌感染后脾臟VWF蛋白表達(dá)量上調(diào),說明嗜水氣單胞菌感染后可能造成暗紋東方鲀血小板聚集進(jìn)而導(dǎo)致血管堵塞.

CD44是一種細(xì)胞表面糖蛋白,存在于許多正常細(xì)胞,主要是淋巴細(xì)胞和上皮細(xì)胞[23]. 通過多種途徑廣泛參與細(xì)胞-細(xì)胞/基質(zhì)間黏附、細(xì)胞內(nèi)外信號傳導(dǎo)及淋巴細(xì)胞歸巢等重要功能[24],其多種生理活性表現(xiàn)在多種疾病的病理中,暴露癌癥、關(guān)節(jié)炎、細(xì)菌和病毒感染等[25]. 目前,硬骨魚中CD44相關(guān)研究未見報(bào)道. 在哺乳動(dòng)物中,有研究表明,CD44可以通過促進(jìn)巨噬細(xì)胞中的CCL2的表達(dá)來調(diào)節(jié)細(xì)胞的遷移,TNF-α可以顯著提高細(xì)胞中CD44的表達(dá)[26];CD44與糖胺聚糖透明質(zhì)酸(HA)相互作用可介導(dǎo)白細(xì)胞遷移和活化[27];利用CD44缺失小鼠,確定了CD44在炎癥部位白細(xì)胞募集中的作用,同時(shí)揭示了CD44在限制炎癥反應(yīng)和解決炎癥方面的作用[28]. 暗紋東方鲀受到嗜水氣單胞菌感染12 h后脾臟CD44蛋白表達(dá)量下調(diào),其基因和蛋白水平動(dòng)力學(xué)變化有待進(jìn)一步確定,其功能有待進(jìn)一步探究.

鈣離子是細(xì)胞內(nèi)最古老、作用最廣泛的信號物質(zhì),鈣離子參與細(xì)胞增殖、分化、生長、衰老等生命活動(dòng)的信息傳遞與調(diào)控,并在各種生理活動(dòng)中起著十分重要的作用[29-30]. 細(xì)胞質(zhì)鈣離子來源主要有2個(gè):一個(gè)是胞外鈣離子內(nèi)流,另一個(gè)是細(xì)胞器鈣離子外流[31]. 胞外鈣離子內(nèi)流存在3種機(jī)制:(1)配體結(jié)合觸發(fā)的鈣離子跨膜流動(dòng),即受體門控性鈣通道(ROCs);(2)細(xì)胞膜去極化激活電壓門控性鈣通道(VOCs)導(dǎo)致的鈣內(nèi)流;(3)當(dāng)細(xì)胞內(nèi)鈣離子耗竭,為了補(bǔ)充鈣離子不足,儲(chǔ)存開啟性鈣通道(SOCs)開放,促使鈣離子大量內(nèi)流. 胞內(nèi)鈣離子外流是指鈣庫(內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或肌質(zhì)網(wǎng))中鈣離子通過鈣離子釋放通道1,4,5-三磷酸肌醇(InsP3)受體和Ryanodine受體(RyR)進(jìn)入細(xì)胞質(zhì)[30]. 鈣庫中鈣儲(chǔ)量下降時(shí),鈣離子可以從細(xì)胞外進(jìn)入細(xì)胞,這一過程在基因表達(dá)調(diào)控以及免疫反應(yīng)中都發(fā)揮著重要作用[29]. 鈣離子外排主要有Na+/Ca2+交換體可協(xié)助鈣離子從細(xì)胞中排出和內(nèi)質(zhì)網(wǎng)上的Ca2+-ATP酶(SERCA)、線粒體上的MCU將細(xì)胞質(zhì)鈣離子攝入內(nèi)質(zhì)網(wǎng)或線粒體中[32-33]. 暗紋東方鲀脾臟感染病原菌后,鈣離子信號通路相關(guān)蛋白如免疫球蛋白重鏈(IGH)、CD38、ITPK、PRKCB、NOS1和PLCD均發(fā)生下調(diào),而流式細(xì)胞術(shù)結(jié)果顯示細(xì)胞內(nèi)鈣離子含量在6 h開始出現(xiàn)顯著上調(diào)(圖1B),可能是由于病原菌進(jìn)入后與細(xì)胞表面BCR結(jié)合后激活了初始鈣離子信號通路[34]. CD38催化環(huán)腺苷二磷酸核糖(cADPR)合成,通過作用于魚尼丁受體(RyR)參與細(xì)胞內(nèi)鈣庫的鈣動(dòng)員[35],其表達(dá)量的下調(diào)說明病原菌感染后暗紋東方鲀胞內(nèi)鈣離子濃度的上調(diào)可能主要是胞外鈣離子內(nèi)流導(dǎo)致的. 鈣離子信號通路相關(guān)蛋白在抵抗病原菌中的功能有待進(jìn)一步研究.

綜上所述,本研究應(yīng)用TMT蛋白質(zhì)組學(xué)技術(shù),定量分析了暗紋東方鲀感染嗜水氣單胞菌后脾臟蛋白質(zhì)組的表達(dá)變化,并對差異表達(dá)蛋白在參與的生物學(xué)過程、分子功能、亞細(xì)胞定位以及富集通路等進(jìn)行了歸納整理,并深入分析了免疫相關(guān)蛋白功能,為揭示嗜水氣單胞菌的分子致病機(jī)制奠定了理論基礎(chǔ).

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