董 劍,席家莊,王 杉,何建春,趙峻英*
(重慶市大足區(qū)人民醫(yī)院,重慶 402360)
耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)是金黃色葡萄球菌的一個獨特菌株,能抵抗所有青霉素及其他β內(nèi)酰胺酶類抗菌藥物。至今MRSA感染幾乎遍及全球,成為重要的院內(nèi)感染病原菌之一[1]。MRSA的早期篩查,對臨床治療和院感防控至關重要。然而,傳統(tǒng)病原菌培養(yǎng)鑒定耗時較長、靈敏度有限、操作繁瑣,難于實現(xiàn)MRSA的早期檢測[2]。因此,急需構建具有高效、靈敏、便捷的MRSA檢測方法。本研究以mecA基因為目標基因,構建超支化等溫擴增PCR檢測方法,現(xiàn)將研究結果報道如下。
菌株為隨機抽取的我院2015年1月~2019年1月保存的經(jīng)VITEK2 Compact全自動細菌鑒定儀鑒定的MRSA 83株,甲氧西林敏感的金黃色葡萄球菌(MSSA)62株。
細菌核酸提取試劑盒、dNTPs 、Champagne Taq DNA polymerase由北京天根生物科技股份有限公司生產(chǎn)、PCR引物由上海捷瑞生物公司合成。
根據(jù)GenBank 中發(fā)布的mecA耐藥基因序列,采用Primer 6.0設計,遵循核酸設計的原則,在保守區(qū)設計超支化等溫擴增PCR技術發(fā)卡結構H1、H2、SH1、SH2,采用Oligo 6.0進行評價。
按試劑盒說明書操作步驟進行細菌核酸提取
采用50 μL的反應體系,模板1~5 μL,H1、H2、SH1、SH2 1M共5 μL,dNTPs 4 μL,Buffer緩沖液5 μL,Taq酶0.25 μL,無菌雙蒸水補齊。反應條件:62℃水浴恒溫 52 min,80℃5 min10 min。
取擴增產(chǎn)物10 μL與2 μL上樣緩沖液混合,加入到PAGE電泳孔,
恒流100 mA電泳,在凝膠像分析儀下觀察并記錄結果。
應用SPSS 19.0統(tǒng)計軟件進行統(tǒng)計分析,P<0.05為差異有統(tǒng)計學意義。
(1)在電泳圖上含mecA基因的金黃色葡萄球菌(MRSA)被檢出,有梯狀條帶出現(xiàn),
不含mecA基因的金黃色葡萄球菌(MSSA)不出現(xiàn)條帶,呈陰性。
(2)145株金黃色葡萄球菌兩種方法的檢測結果
145株金黃色葡萄球菌中,VITEK2 Compact全自動細菌鑒定共檢出MRSA83株,檢出率57.24%,超支化等溫擴增PCR在以上83株MRSA中全部找到mecA基因,在62株MSSA中找到3株含mecA基因,MRSA檢出率59.31%。兩種檢測方法結果比較差異無統(tǒng)計學意義(P>0.05)。
本研究所構建的超支化等溫鏈擴增PCR技術[3-5],采用臨床分離的菌株進行檢測具有較好的特異性,含mecA基因的金黃色葡萄球菌可出現(xiàn)有梯狀條帶出現(xiàn),不含mecA基因的金黃色葡萄球菌則呈陰性。對145株金黃色葡萄球菌的檢測結果來看[6-8]:超支化等溫鏈擴增PCR技術與VITEK2 Compact全自動細菌鑒定和藥敏分析儀,二者對MRSA檢出率相比差異無統(tǒng)計學意義[9-11](P>0.05)。兩種方法結果不一致的3株,符合率97.93%。在本研究超支化等溫鏈擴增PCR反應體系過程中僅需一個普通的恒溫水浴箱,不需昂貴的PCR儀。只需1 h左右就可得到檢測結果,相較于常規(guī)的細菌培養(yǎng)和鑒定流程時間大大縮短[12-14],可在基層的實驗室開展。