李醒,黃俊星
南通大學(xué)第五附屬醫(yī)院(泰州市人民醫(yī)院)腫瘤科,江蘇 泰州225300
食管癌是世界上最常見(jiàn)的消化道惡性腫瘤,也是全世界最具侵襲性和致死性的消化道腫瘤之一[1],亞洲國(guó)家食管癌的病理類型主要為食管鱗狀細(xì)胞癌(esophageal squamous cell carcinoma,ESCC)。盡管食管癌化療和放療方案、手術(shù)技術(shù)以及圍手術(shù)期管理取得了一些進(jìn)展,但由于早期無(wú)特殊癥狀,大多數(shù)食管癌患者確診時(shí)已進(jìn)展至晚期并伴有廣泛的局部浸潤(rùn)和淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移,故其5年生存率僅有19%[2],其中晚期食管癌患者的中位生存期小于1年[3]。因此,進(jìn)一步研究食管癌的發(fā)病機(jī)制并尋找早期診斷標(biāo)志物,是目前食管癌研究的關(guān)鍵之一。長(zhǎng)鏈非編碼RNA(long non‐coding RNA,ln‐cRNA)是一類進(jìn)化保守的RNA分子,其長(zhǎng)度大于200個(gè)堿基,沒(méi)有或具有有限的蛋白質(zhì)編碼功能[4],早期并不被人們重視。隨后的研究發(fā)現(xiàn),lncRNA在基因調(diào)控的幾乎所有階段(表達(dá)、轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)錄后和翻譯水平)都發(fā)揮作用,且作為細(xì)胞周期、自噬和凋亡的重要調(diào)節(jié)因子,具有癌基因或抑癌基因的作用[5‐7]。與正常細(xì)胞相比,lncRNA在食管癌細(xì)胞中經(jīng)常表達(dá)失調(diào),提示其可能成為惡性腫瘤的生物標(biāo)志物。此外,隨著對(duì)lncRNA在食管癌發(fā)病機(jī)制中作用的進(jìn)一步研究,其有望作為抗腫瘤治療的新靶點(diǎn)[8]。多項(xiàng)研究表明,lncRNA可作為競(jìng)爭(zhēng)性內(nèi)源 RNA(competing endogenous RNA,ceR‐NA),通過(guò)與微小RNA(microRNA,miRNA)相互作用,調(diào)控其靶基因的表達(dá),從而參與食管癌的發(fā)生發(fā)展過(guò)程[9‐11]。本文就lncRNA作為ceRNA在食管癌中的研究進(jìn)展作一綜述。
Salmena等[12]于2011年提出了ceRNA假說(shuō),該假說(shuō)對(duì)傳統(tǒng)基因調(diào)控模式進(jìn)行了補(bǔ)充,將miR‐NA→RNA的概念轉(zhuǎn)變?yōu)镽NA→miRNA→RNA。該假說(shuō)認(rèn)為,信使RNA(messenger RNA,mRNA)、lncRNA、環(huán)狀RNA(circular RNA,circRNA)等作為ceRNA,通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)一個(gè)或多個(gè)miRNA反應(yīng)元件(miRNA response element,MRE)調(diào)節(jié)其他RNA的功能,形成了跨轉(zhuǎn)錄組的大規(guī)模調(diào)控網(wǎng)絡(luò)。隨后的大規(guī)模交聯(lián)免疫沉淀(cross‐linking immunopre‐cipitation,CLIP)實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)了成千上萬(wàn)的 miRNA‐lncRNA相互作用,這意味著miRNA介導(dǎo)的mRNA與lncRNA之間的相互作用廣泛存在于不同的生物學(xué)過(guò)程中,例如腫瘤的發(fā)生、發(fā)展[13]。因此,ceR‐NA假說(shuō)為探索食管癌中l(wèi)ncRNA的功能提供了一個(gè)新的視角。
在食管癌相關(guān)的ceRNA研究中,lncRNA占據(jù)著重要的位置,多數(shù)lncRNA在食管癌中表達(dá)失調(diào),表明lncRNA可作為食管癌早期診斷標(biāo)志物和新的治療靶點(diǎn)。
2.1.1 核富集轉(zhuǎn)錄體 1核富集轉(zhuǎn)錄體1(nuclear enriched abundant transcript 1,NEAT1)是細(xì)胞核旁斑的核心結(jié)構(gòu)成分,已被報(bào)道在多種惡性腫瘤,如乳腺癌[14]、宮頸癌[15]、卵巢癌[16]中可作為 ceRNA 發(fā)揮致癌作用。Li等[17]研究發(fā)現(xiàn),在ESCC細(xì)胞中NEAT1可作為ceRNA,通過(guò)與miRNA‐129競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合,下調(diào)miRNA‐129的表達(dá),從而導(dǎo)致miRNA‐129的靶基因 C‐末端結(jié)合蛋白 2(C‐terminal bind‐ing protein 2,CTBP2)去阻遏,ESCC細(xì)胞的侵襲能力增強(qiáng);NEAT1基因敲除或miRNA‐129過(guò)表達(dá)可抑制CTBP2對(duì)ESCC細(xì)胞活力和侵襲能力的增強(qiáng)作用。
2.1.2 同源盒基因轉(zhuǎn)錄反義RNA 在食管癌中,同源盒基因轉(zhuǎn)錄反義RNA(homeobox transcript anti‐sense intergenic RNA,HOTAIR)的高表達(dá)與ESCC患者的生存率下降有關(guān)[18]。研究證實(shí),HOTAIR可以促進(jìn)食管癌細(xì)胞增殖、侵襲和遷移。Xu和Zhang[10]的研究發(fā)現(xiàn),HOTAIR可作為 miRNA‐148a的海綿,正調(diào)節(jié)snail家族轉(zhuǎn)錄抑制因子2(snail family transcriptional repressor 2,SNAIL2)的表達(dá),從而促進(jìn)上皮‐間充質(zhì)轉(zhuǎn)化(epithelial‐mesenchymal transition,EMT)的發(fā)生。同樣,Wang等[19]研究表明,HOTAIR可能充當(dāng)ceRNA,成為miRNA‐130a‐5p的海綿,從而抑制鋅指E盒結(jié)合同源盒蛋白1(zinc finger E‐box binding homeobox 1,ZEB1)的表達(dá),并促進(jìn)ESCC中EMT的發(fā)生。
2.1.3 漿細(xì)胞瘤變體易位 1研究表明,漿細(xì)胞瘤變體易位 1(plasmacytoma variant translocation 1,PVT1)在ESCC組織中的表達(dá)水平明顯高于正常對(duì)照組織,且能夠預(yù)測(cè)ESCC患者的總體預(yù)后。PVT1敲除后可導(dǎo)致miRNA‐203表達(dá)上調(diào),同樣miRNA‐203的敲除可使PVT1的表達(dá)上調(diào);雙熒光素酶實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步證實(shí),PVT1通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miR‐NA‐203 調(diào)節(jié)人重組 LIM 和 SH3 蛋白 1(LIM and SH3 protein 1,LASP1)的表達(dá),從而促進(jìn)ESCC的進(jìn)展[20]。Shen等[21]研究發(fā)現(xiàn),miRNA‐145過(guò)表達(dá)或PVT1沉默可抑制ESCC細(xì)胞的活力、遷移和侵襲能力,同時(shí)還能促進(jìn)細(xì)胞凋亡;PVT1可以與miR‐NA‐145結(jié)合并調(diào)節(jié)其表達(dá),而肌動(dòng)蛋白結(jié)合蛋白1(fascin actin‐bundling protein 1,F(xiàn)SCN1)是 miR‐NA‐145的靶基因,提示下調(diào)PVT1的表達(dá)可抑制食管癌細(xì)胞遷移和侵襲,并可能通過(guò)miRNA‐145介導(dǎo)的對(duì)FSCN1的抑制作用促進(jìn)細(xì)胞凋亡。
2.1.4 尿路上皮癌相關(guān)基因 1尿路上皮癌相關(guān)基因 1(urothelial cancer associated 1,UCA1)位于染色體19p13上。據(jù)報(bào)道,UCA1在肝細(xì)胞癌、乳腺癌、結(jié)直腸癌和胃癌等多種惡性腫瘤中的表達(dá)水平均明顯上調(diào),并通過(guò)調(diào)節(jié)雷帕霉素靶蛋白(mechanis‐tic target of rapamycin kinase,MTOR)、Wnt或蛋白激酶B(protein kinase B,PKB,也稱AKT)信號(hào)通路促進(jìn)腫瘤進(jìn)展[22‐24]。Jiao 等[25]研究發(fā)現(xiàn),UCA1可與miRNA‐204相互作用,降低miRNA‐204與性別決定區(qū)相關(guān)高遷移率族盒蛋白4(sex‐dertermining re‐gion of Y chromosome related high mobility group box 4,SOX4)的3'‐非翻譯區(qū)(3'‐untranslated region,3'‐UTR)的結(jié)合能力,抑制 miRNA‐204 對(duì)SOX4mRNA的降解,促進(jìn)食管癌細(xì)胞的增殖。UCA1可作為ceRNA抑制miRNA‐498的表達(dá),從而使miR‐NA‐498對(duì)鋅指E盒結(jié)合同源盒蛋白2(zinc finger E‐box binding homeobox 2,ZEB2)的作用減弱;在UCA1下調(diào)和miRNA‐498上調(diào)的裸鼠體內(nèi),ZEB2的表達(dá)水平明顯降低,腫瘤細(xì)胞的增殖、侵襲、遷移和集落形成能力以及EMT、腫瘤生長(zhǎng)速度和重量均明顯降低[26]。
2.1.5 X染色體失活特異轉(zhuǎn)錄本X染色體失活特異轉(zhuǎn)錄本(X‐inactive specific transcript,XIST)與雌性哺乳動(dòng)物X染色體失活相關(guān),在食管癌組織和細(xì)胞系中高表達(dá),且與食管癌細(xì)胞的增殖、凋亡、遷移和侵襲密切相關(guān)。Chen等[9]研究發(fā)現(xiàn),XIST在食管癌中的表達(dá)上調(diào),可靶向miRNA‐494/周期蛋白依賴性激酶 6(cyclin‐dependent kinase 6,CDK6)軸,并通過(guò)Janus激酶2(Janus kinase 2,JAK2)/信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及轉(zhuǎn)錄激活蛋白3(signal transducer and activa‐tor of transcription 3,STAT3)信號(hào)通路,在食管癌的發(fā)生發(fā)展中發(fā)揮致癌作用。敲除XIST可抑制ES‐CC細(xì)胞的增殖、遷移和侵襲,導(dǎo)致miRNA‐101的表達(dá)水平升高和zeste基因增強(qiáng)子同源物2(enhanc‐er of zeste homolog 2,EZH2)的表達(dá)水平下降;增強(qiáng)EZH2的表達(dá)可顯著降低XIST基因敲除后的抗增殖活性,這些都提示XIST可能作為miRNA‐101的ceRNA調(diào)節(jié)EZH2的表達(dá)[27]。
2.2.1 母系表達(dá)基因 3Dong等[28]研究發(fā)現(xiàn),母系表達(dá)基因 3(maternally expressed gene 3,MEG3)在ESCC組織和細(xì)胞中的表達(dá)顯著下調(diào),采用甲基轉(zhuǎn)移酶抑制劑處理后,MEG3在ESCC細(xì)胞中的表達(dá)水平顯著升高,提示MEG3是一種抑癌基因,且異常啟動(dòng)子高甲基化是ESCC中MEG3基因沉默的關(guān)鍵。此外,MEG3作為ceRNA可通過(guò)競(jìng)爭(zhēng)性結(jié)合miRNA‐9調(diào)節(jié)上皮鈣黏素(E‐cadherin)和叉頭框轉(zhuǎn)錄因子O1(forkhead box O1,F(xiàn)OXO1)的表達(dá),可作為預(yù)測(cè)ESCC進(jìn)展和預(yù)后的潛在生物標(biāo)志物。Ma等[29]研究發(fā)現(xiàn),ESCC細(xì)胞中MEG3能夠與miRNA‐4261相互作用,抑制重組人Dickkopf相關(guān)蛋白2(recombinant human Dickkopf‐related protein 2,DKK2)并阻斷Wnt/β‐聯(lián)蛋白(β‐catenin)信號(hào)傳導(dǎo),從而抑制ESCC的發(fā)生和發(fā)展。
2.2.2 癌癥易感性候選基因 2癌癥易感性候選基因 2(cancer susceptibility candidate 2,CASC2)位于染色體10q26上。Zhu等[30]研究發(fā)現(xiàn),CASC2在食管癌組織和細(xì)胞系中的表達(dá)水平明顯下降,過(guò)表達(dá)CASC2可誘導(dǎo)ESCC細(xì)胞的DNA損傷,CASC2通過(guò)負(fù)調(diào)節(jié)ESCC細(xì)胞中miRNA‐181a的表達(dá),抑制AKT信號(hào)通路,從而促進(jìn)順鉑的抗腫瘤活性。
2.2.3 生長(zhǎng)抑制特異性基因 5Wang等[31]研究表明,生長(zhǎng)抑制特異性基因 5(growth arrest‐specific 5,GAS5)在ESCC組織和細(xì)胞系中表達(dá)下調(diào),且與miRNA‐196a的高表達(dá)有關(guān),雙熒光素酶報(bào)告分析結(jié)果表明miRNA‐196a可與GAS5的第7外顯子結(jié)合。
ceRNA假說(shuō)的吸引力在于其可能具有解釋成千上萬(wàn)個(gè)尚未被識(shí)別的lncRNA功能的潛力,但是目前對(duì)ceRNA假說(shuō)仍存在疑慮[32]。這些反對(duì)論點(diǎn)的核心是,單個(gè)miRNA靶基因表達(dá)的任何變化都可能只構(gòu)成靶區(qū)豐度的一小部分[33]。使用全轉(zhuǎn)錄組方法進(jìn)行的一些分析認(rèn)為,生理狀態(tài)下個(gè)體ln‐cRNA表達(dá)的變化不足以抑制miRNA的活性[34‐36]。另外,ceRNA調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的有效性可能受多個(gè)因素的影響,如miRNA豐度和ceRNA豐度的相對(duì)水平,以及單個(gè)分子的亞細(xì)胞定位。因此,雖然有關(guān)ceRNA的研究已經(jīng)取得了一定進(jìn)展,但仍處于假說(shuō)驗(yàn)證階段,仍需要大量的證據(jù)證明。
基于ceRNA的基因調(diào)控是一個(gè)正在興起的研究領(lǐng)域,它將顯著提高人們對(duì)腫瘤相關(guān)分子機(jī)制的理解。研究lncRNA作為ceRNA在食管癌中的作用有利于其診斷和治療,對(duì)全面了解食管癌的發(fā)生機(jī)制具有很大幫助。另有研究發(fā)現(xiàn),ceRNA也存在于其他疾病中,如糖尿病腎病及心血管相關(guān)疾病[37‐38]。但是,有關(guān)lncRNA作為ceRNA在食管癌中作用的研究尚處于初級(jí)階段,未來(lái)的探索可能會(huì)為食管癌的診斷和治療提供更多的潛在生物標(biāo)志物。