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SOTOS綜合征NSD1基因新發(fā)錯義突變1例并文獻(xiàn)復(fù)習(xí)

2021-03-18 06:08
精準(zhǔn)醫(yī)學(xué)雜志 2021年1期
關(guān)鍵詞:錯義基因突變綜合征

(青島大學(xué)附屬醫(yī)院新生兒科,山東 青島 266003)

SOTOS綜合征為一種先天的過度生長性疾病,以常染色體顯性遺傳,主要表現(xiàn)為特殊面容、學(xué)習(xí)障礙以及生長過度,發(fā)病率約為1/14 000[1]。超過90%的患者存在NSD1基因異常,臨床上癥狀與SOTOS綜合征高度相似的非NSD1基因突變患者,已被證明攜帶APC2和NFIX基因突變[2]。本文報(bào)道1例NSD1基因新發(fā)錯義突變患兒,并結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)進(jìn)行復(fù)習(xí),探討基因型與表型的關(guān)系,為提高臨床醫(yī)師診斷該病提供經(jīng)驗(yàn)。

1 臨床資料

對1例5月齡SOTOS綜合征男嬰的臨床資料進(jìn)行回顧性分析,并對患兒及父母進(jìn)行全外顯子組基因檢測。獲父母知情同意和醫(yī)院倫理委員會批準(zhǔn)后,采集患兒及父母外周靜脈血各2 mL,EDTA抗凝,以QIAampDNA Blood Mini試劑盒(德國Qiagen GmbH公司)按廠家說明提取基因組DNA。將提取的基因組DNA片段化和擴(kuò)增純化以后與適配器相連接,由IDT XGen外顯子研究小組(IDT,Lowa,美國)的探針捕獲約19 396個靶向基因,構(gòu)建DNA文庫。DNA文庫再經(jīng)擴(kuò)增和純化以后,在NovaSeq 6000測序儀(Illumina,San Diego,美國)上采用Burrows-Wheeler Aligner(v.0.5.9-r16)軟件進(jìn)行測序,測序結(jié)果與UCSChg19人類參考基因組序列進(jìn)行比對,使用PriVar Toolkit工具進(jìn)行數(shù)據(jù)注釋后,確定有臨床意義的變異體,再用PCR方法驗(yàn)證檢測到的變異,并在3500XL遺傳分析儀上對獲得產(chǎn)物進(jìn)行直接測序。通過SIFT、PROVEAN PREDICTION、Mutation Taster、Polyphen2等生物信息學(xué)軟件預(yù)測致病性。

2 結(jié) 果

2.1 臨床表現(xiàn)及體征

患兒,男,5月齡,因“發(fā)育遲滯”就診。系第2胎第2產(chǎn),胎齡40+4周,順產(chǎn)出生,出生時體質(zhì)量為3 990 g,Apgar評分10分,無窒息史。母親孕期體健。自出生以來,喂養(yǎng)困難,吮吸差,哭聲直,現(xiàn)仍不能逗笑,不會咿呀作語,不能追視。出生后10 d因“新生兒高膽紅素血癥、新生兒肺炎”就診當(dāng)?shù)蒯t(yī)院,最高時總膽紅素為389.9 μmol/L,住院10 d好轉(zhuǎn)出院。家族史:父母體健,否認(rèn)為近親結(jié)婚,否認(rèn)有家族遺傳病史,患兒有1個3歲姐姐,體健。查體:頭圍49.2 cm,身高71 cm,體質(zhì)量7 kg。前囟未閉,約2 cm×2 cm大小,平軟。巨顱,顱骨重疊,前額突出,下頜尖長,高腭弓,下牙齦凹凸不平(圖1A、B),萌牙2顆?;純弘p耳廓外形基本正常,雙耳(長約6 cm)、雙手(長約8 cm)、雙腳(長約11 cm)較同齡兒明顯偏大,雙側(cè)指掌紋無異常,心、肺、腹查體未見異常。雙手拇指內(nèi)收,四肢肌張力高,病理征及腦膜刺激征陰性。抬頭差,豎抱頭不穩(wěn),視聽追視無反應(yīng),不會逗笑,不能與人互動,哭聲直,發(fā)音單一,不會咿呀作語,無主動抓握意識,不可獨(dú)坐。精細(xì)運(yùn)動、大運(yùn)動及語言發(fā)育均落后同齡兒。

2.2 實(shí)驗(yàn)室檢查結(jié)果

血常規(guī)、生化、心臟以及泌尿系統(tǒng)超聲檢查均未見有明顯異常;顱腦MRI檢查顯示前后徑增大,腦溝深,腦回增寬,雙側(cè)基底節(jié)區(qū)T1WI稍高信號,雙側(cè)內(nèi)囊后肢T1高信號,雙側(cè)腦室體部異常信號(圖1C~E)。

A:患兒的前額突起,下頜尖長;B:患兒下牙齦凹凸不平,牙列不齊;C~E分別為T1軸位、T2軸位、T1矢狀位顱腦MRI圖像

2.3 基因檢測結(jié)果

基因檢測結(jié)果顯示,該患兒5號染色體5q35區(qū)出現(xiàn)NSD1基因區(qū)域錯義突變c.5791T>C,使該位點(diǎn)的半胱甘酸轉(zhuǎn)變?yōu)榫彼?p.Cys1931Arg)。在HGMD數(shù)據(jù)庫中并未見相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道;dbSNP147數(shù)據(jù)庫、ESP6500siv2_ALL數(shù)據(jù)庫和千人基因(1000g2015aug_ALL)數(shù)據(jù)庫均未見收錄。其父母樣本中未檢測到該變異,因此推測其為新發(fā)突變?;純?、患兒父親、患兒母親的基因檢測結(jié)果見圖2。

A、B、C分別為患兒、患兒父親、患兒母親

3 討 論

3.1 SOTOS綜合征患者的臨床表現(xiàn)

超過90%的SOTOS綜合征患者具有以下臨床特征[3]:①特殊面容,如前額凸出、鼻梁低平、輕度斜視、高腭弓、眼距增寬、眼裂下斜、小下頜、尖下巴及額頂區(qū)毛發(fā)稀疏等;②學(xué)習(xí)障礙,如早期發(fā)育遲緩,輕度至重度智力障礙;③過度生長,如在青春期前,尤其1~6歲,頭圍或身高大于正常同齡兒第97百分位,或平均值的2個標(biāo)準(zhǔn)差;在青春期后,身高增長趨于正常,但大頭畸形非常典型;④骨齡超前。其他臨床表現(xiàn)還有腦室擴(kuò)大、早期喂養(yǎng)困難、新生兒高膽紅素血癥、肌張力減退、新生兒低血糖、皮膚錯構(gòu)瘤、脊柱側(cè)彎、關(guān)節(jié)過度松弛、扁平足、癲癇、便秘、腫瘤、淋巴水腫、先天性心臟病(動脈導(dǎo)管未閉、室間隔缺損及房間隔缺損等)及泌尿生殖系統(tǒng)異常(膀胱輸尿管反流、隱睪、多囊腎)等[4-9]。成年SOTOS綜合征患者有一個獨(dú)特的面部特征,呈方形且突出的下頜。一般成年患者都很健康,僅少數(shù)患者會出現(xiàn)淋巴水腫、牙列不全、聽力喪失、肢體攣縮和震顫等臨床癥狀[10]。此外,SOTOS綜合征患兒易合并孤獨(dú)癥、注意力缺陷與多動障礙、焦慮行為以及語言障礙等[11-15]。

本研究報(bào)道的該例5月齡的患兒,存在典型的SOTOS綜合征臨床表現(xiàn),且顱腦MRI信號異常,可能存在神經(jīng)系統(tǒng)異常。因家屬拒絕骨齡檢查,尚不能明確是否存在骨齡超前。該患兒經(jīng)基因檢測,發(fā)現(xiàn)5號染色體q35.3區(qū)出現(xiàn)NSD1基因區(qū)域錯義突變c.5791 T>C,使該位點(diǎn)的半胱甘酸轉(zhuǎn)變?yōu)榫彼?p.Cys1931Arg),生物信息學(xué)軟件預(yù)測其致病性很高,此突變點(diǎn)既往未有文獻(xiàn)報(bào)道。結(jié)合基因檢測結(jié)果,患兒符合SOTOS綜合征診斷。

3.2 SOTOS綜合征患者基因型與表型的關(guān)系

SOTOS綜合征主要是由于NSD1基因單倍劑量不足所致,包括NSD1基因內(nèi)突變(錯義突變、無義突變、移碼突變等)和5q35微缺失[1,16]。SOTOS綜合征基因型在種族之間存在差異,于歐美國家中,NSD1基因突變型占80%~85%,5q35微缺失型占10%~15%;而在日本患者中,5q35微缺失型占50%以上[1]。本研究中的患兒NSD1基因存在未見報(bào)道的雜合突變(c.5791 T>C),臨床表現(xiàn)與文獻(xiàn)報(bào)道相似。中國內(nèi)地共報(bào)道了17例SOTOS綜合征患兒,有15例經(jīng)基因檢測確診,其中NSD1基因突變型8例(4例錯義突變,3例移碼突變,1例無義突變),占47%(8/17);5q35微缺失型7例,占41%(7/17),均為散發(fā)病例,未見有家族性報(bào)道[17-25]。中國香港地區(qū)報(bào)道了36例SOTOS綜合征,26例患兒NSD1基因異常,其中NSD1基因內(nèi)突變型23例,占64%(23/36),5q35微缺失型只有3例,僅僅占8%(3/36)[26]。按照我國人口數(shù)量,報(bào)道的樣本量過小,不能明確我國患者的基因型,說明我國對此類罕見病的臨床認(rèn)識不足。有研究報(bào)道5q35微缺失型與NSD1基因突變型之間存在表型差異,與基因突變型相比,5q35微缺失型患者更容易出現(xiàn)學(xué)習(xí)困難及心臟、腎臟異常等問題,而過度生長現(xiàn)象不明顯[27]。在我國報(bào)道的17例患兒中,大部分存在特殊面容、過度生長及智力障礙等臨床表現(xiàn),幾乎所有的患兒顱腦MRI顯示腦室擴(kuò)大、腦發(fā)育不良,部分患兒合并骨齡超前、低糖血癥、腭裂、新生兒喂養(yǎng)困難、新生兒黃疸等。本研究報(bào)道的基因內(nèi)突變型患兒臨床表現(xiàn)與國內(nèi)報(bào)道的相符,早期合并喂養(yǎng)困難及新生兒黃疸,無心臟及腎臟異常。在國內(nèi)報(bào)道的17例患兒中,有4例患兒合并先天性心臟病或腎臟異常,皆為5q35微缺失型,與既往文獻(xiàn)報(bào)道相符,可能微缺失型患兒更易合并心臟及腎臟異常??德仿返萚17]報(bào)道了3例NSD1基因突變型患兒中,有1例患兒無特殊面容及過度生長。趙敏[20]報(bào)道了3例SOTOS綜合征患兒,2例NSD1基因突變型無過度生長。孫碧君等[25]報(bào)道了2例微缺失型SOTOS綜合征新生兒,1例出生時即表現(xiàn)為過度生長,另1例在隨訪至45個月時出現(xiàn)過度生長,與國外研究有差異,可能與我國樣本量較小有關(guān)系。BOU-ASSI等[28]研究報(bào)道了1例以新生兒皮膚松弛癥作為首發(fā)癥狀的SOTOS患兒。SIO等[29]報(bào)道了首例SOTOS綜合征合并先天性巨結(jié)腸患兒。SOTOS綜合征新生兒期的癥狀更加不典型,合并罕見臨床癥狀時,可考慮存在基因異常。相關(guān)研究表明,高胰島素血癥是新生兒期SOTOS綜合征患兒的特征性癥狀[30-31]。GRAND等[32]報(bào)道了7例合并高胰島素血癥的SOTOS綜合征患兒。在高胰島素血癥或低血糖的背景下,即使無過度生長表現(xiàn),也可以考慮此病[33],并應(yīng)進(jìn)行早期的基因診斷,以改善患兒預(yù)后。LACCETTA等[34]報(bào)道了1個家系的SOTOS綜合征,該家族3代成員攜帶相同突變位點(diǎn),先證者具有典型SOTOS綜合征表現(xiàn),母親與外祖父僅身高大于正常同齡人第97百分位,無其他異常。韓國報(bào)道了1對同卵雙生子患兒,2名患兒均為NSD1基因無義突變,先證者存在癲癇發(fā)作、脊柱側(cè)凸、腦室擴(kuò)大、注意力缺陷、多動障礙等異常的臨床表現(xiàn),而其胞弟并無上述表現(xiàn),僅有SOTOS綜合征的典型臨床表現(xiàn)[35]。因此,突變位置與臨床表型之間沒有絕對的相關(guān)性,同一突變位點(diǎn)也可以表現(xiàn)出不同的臨床特征。SOTOS綜合征相關(guān)的臨床特征,可能與基因型無關(guān),具體機(jī)制尚不清楚,有待進(jìn)一步研究。

3.3 SOTOS綜合征的產(chǎn)前診斷及隨訪

如果產(chǎn)前超聲顯示胎兒生長過度、頭顱畸形、羊水過多且合并其他異常,如泌尿系統(tǒng)異常、中樞神經(jīng)系統(tǒng)異常、頸部透明帶增厚和異常的母體血清篩查結(jié)果,應(yīng)考慮此病,并應(yīng)早期進(jìn)行基因檢測,有助于遺傳診斷和咨詢[36-37]。目前此病尚無特殊治療方法,兒科定期隨訪很重要,以便早期處理并發(fā)癥,提高患兒預(yù)后。

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