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基于網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)探討腦出血方治療腦出血的作用機制

2021-03-27 11:24:41楊子奇趙德喜
吉林中醫(yī)藥 2021年3期
關(guān)鍵詞:龜板蒲黃水蛭

楊子奇,趙德喜

(1.長春中醫(yī)藥大學(xué)中醫(yī)學(xué)院,長春 130117;2.長春中醫(yī)藥大學(xué)附屬醫(yī)院腦病科,長春 130021)

腦出血(ICH)占全部腦卒中的10%~15%[1-2],具有發(fā)病急,病情重,病死率和致殘率較高的特點,預(yù)后不良。現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對腦出血的治療一直沒有明確的藥物支持,2015年AHA/ASA發(fā)布的《自發(fā)性腦出血診療指南》中,對腦出血內(nèi)科治療未推薦針對性藥物,亦不推薦外科治療[3]。中醫(yī)治療ICH 具有豐富的臨證經(jīng)驗,可以提高患者的存活率,降低致殘率、病死率,值得深入挖掘。

腦出血屬于中醫(yī)中風病的范疇,其病位在肝,病機屬“肝風內(nèi)動”,多因痰火、飲食、情志因素致病。近代以來,醫(yī)家對腦髓的認知逐漸清晰,對于中風的病位傾向于腦,其病機為內(nèi)外因素刺激下導(dǎo)致的腦竅病變,如唐容川提出以下法治療腦部及目系疾病,以“離經(jīng)之血即為瘀血”及“瘀血不去新血不生”[4];張錫純提出“腦充血”的概念,以大量活血藥治療腦出血,其論述已接近于現(xiàn)代醫(yī)學(xué)對腦出血的病位診斷。國醫(yī)大師任繼學(xué)教授總結(jié)前人經(jīng)驗,經(jīng)過廣泛深入的研究和觀察,原創(chuàng)性地提出了“破血化瘀,泄熱醒神,豁痰開竅”的治療大法,并創(chuàng)立了腦出血方。動物實驗表明,腦出血方可能通過抑制MMP-2/MMP-9 蛋白表達,能效降低ICH 后腦水含量,拮抗腦水腫的發(fā)生[5];研究[6]表明,腦出血方可能通過上調(diào)腦出血血腫周圍損傷組織中BDNF 及受體TrkB 蛋白表達,顯著改善腦出血大鼠神經(jīng)功能缺損。此外,臨床證實該方可以促進腦出血急性期血腫吸收,明顯改善患者神經(jīng)功能缺損,提高生活質(zhì)量[7]。然而,目前腦出血方治療ICH 的關(guān)鍵作用靶點、信號通路仍未完全明晰,有待進一步的研究。網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)以生物系統(tǒng)與藥理學(xué)為知識框架,能結(jié)合多個靶點、生物過程、信號通路等系統(tǒng)分析藥物間協(xié)同作用[8],為運用中醫(yī)整體觀念指導(dǎo)下的中藥配對應(yīng)用研究提供參考。本研究利用網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)挖掘腦出血方對ICH 干預(yù)與影響的相關(guān)成分與靶點,從整體探討藥物對ICH 的調(diào)控作用,探索中醫(yī)藥治療ICH 的新靶點與信號通路,為后續(xù)研究提供新的依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 化學(xué)成分的收集與篩選 借助中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(TCMSP)、中醫(yī)藥綜合數(shù)據(jù)庫(TCMID 和Batman-TCM(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)數(shù)據(jù)庫收集腦出血方各單味藥(水蛭、虻蟲、生大黃、蒲黃、三七、石菖蒲、瓜蔞、龜板)主要化學(xué)成分,并使用PubChem 數(shù)據(jù)庫(https://pubchem.ncbi.nlm.nih.gov/)對其化合物名稱和分子結(jié)構(gòu)進行核對。以口服利用度(oral bioavailability,OB)≥30%、類藥性(drug-likeness,DL)≥0.18 為篩選條件,對化合物進行篩選。

1.2 腦出血方靶點、腦出血靶點和腦出血方治療靶點研究 通過中藥系統(tǒng)藥理學(xué)技術(shù)平臺(TCMSP)中醫(yī)藥綜合數(shù)(TCMI)及Batman-TCM(http://bionet.ncpsb.org/batman-tcm/)數(shù)據(jù)庫,檢索水蛭、虻蟲、大黃、蒲黃、三七、石菖蒲、瓜蔞和龜板的主要化學(xué)成分可能作用靶點并整合。以“cerebral hemorrhage”為關(guān)鍵詞在OMIM 數(shù)據(jù)庫和Genecards 數(shù)據(jù)庫進行檢索,獲取全部的腦出血靶點。使用“Venny”將腦出血方靶點與腦出血作用靶點取交集得到重腦出血方治療靶點,用于后續(xù)研究。

1.3 網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 將“1.2”中獲取的腦出血方治療靶點上傳至String 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/)對腦出血方治療靶點蛋白間的相互關(guān)系進行分析。物種選擇為“Homo sapiens”,并設(shè)置條件“minimum required interaction score=0.9”和“hide disconnected nodes in the network”,隨后導(dǎo)入輸出文件和蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用(PPI)網(wǎng)絡(luò)圖。此外,利用Cytoscape 3.6.2 軟件構(gòu)建藥物-化合物-靶點網(wǎng)絡(luò),并利用Network Analyzer 進行拓撲分析,根據(jù)中介中心度和節(jié)點度來度量節(jié)點在網(wǎng)絡(luò)中的重要性。通過藥物與化合物及化合物與靶點連接情況,篩選出腦出血方治療靶點作用于腦出血的關(guān)鍵化合物和靶點,同時結(jié)合現(xiàn)有報道文獻進行分析。

1.4 基因本體(gene ontology,GO)功能與KEGG 通路富集分析 為進一步闡述腦出血方在生物學(xué)角度不同的科學(xué)內(nèi)涵,本研究擬采用DAVID v6.8 數(shù)據(jù)庫(https://david.ncifcrf.gov/)對腦出血方治療靶點進行GO 功能富集分析和KEGG 通路富集分析。隨后分析結(jié)果,進行可視化分析。

2 結(jié)果

2.1 腦出血方候選化合物的篩選 運用TCMSP、TCMID 和Batman-TCM 數(shù)據(jù)庫檢索水蛭、虻蟲、大黃、蒲黃、三七、石菖蒲、瓜蔞和龜板,得到化合物成分,設(shè)置篩選條件為OB ≥30%,DL ≥0.18,并去掉不同數(shù)據(jù)中的相同部分,僅保留唯一。經(jīng)整合后共得到48個活性化合物(不包括重復(fù)的化合物),其中水蛭13個、虻蟲2個、大黃7個、蒲黃5個、三七7個、石菖蒲3個、瓜蔞9 個和龜板6 個。

2.2 腦出血方靶點、腦出血靶點和腦出血方治療靶點收集 對篩選出的48 個化合物,通過TCMSP、TCMID 和Batman-TCM 分析平臺,檢索水蛭、虻蟲、大黃、蒲黃、三七、石菖蒲、瓜蔞和龜板的主要化學(xué)成分可能作用靶點并整合,共得到705 個靶點。通過對OMIM 和Genecards 數(shù)據(jù)庫,使用“cerebral hemorrhage”作為關(guān)鍵詞,整合得到腦出血基因靶點3 605 個。將腦出血相關(guān)靶點和腦出血方活性成分靶點分別導(dǎo)入在線工具Venny 2.1(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/)進行分析,得到341 個靶點,此即為腦出血方與腦出血的共同靶點。

2.3 靶蛋白互作網(wǎng)絡(luò) 將腦出血方治療靶點基因?qū)隨tring 數(shù)據(jù)庫(https://string-db.org/)數(shù)據(jù)庫,設(shè)置篩選條件為智人,設(shè)置條件“minimum required interaction score=0.9”和“hide disconnected nodes in the network”,保存得到的相應(yīng)結(jié)果文件,得出292 個PPI 網(wǎng)絡(luò)的基因,篩選排名前10 位的靶點分別是:MAPK1、AKT1、JUN、TNF、RELA、CXCL8、IL6、MAPK8、BDKRB2、PRKCA,提示這些靶點在腦出血方對腦出血的治療中可能具有重要作用。

2.4 腦出血方藥物-化合物-治療靶點網(wǎng)絡(luò)構(gòu)建 通過Cytoscape 來獲得腦出血方單味藥-化合物-治療靶點交集,根據(jù)中介中心度和節(jié)點度來度量節(jié)點在網(wǎng)絡(luò)中的重要性。藥物-化合物-靶點網(wǎng)絡(luò)總共包括397個節(jié)點(48 個化合物節(jié)點、341 個靶點節(jié)點,其中8個單味藥節(jié)點),依照交集結(jié)果,各單位藥度值排名為(從大到小):蒲黃(51)、生大黃(27)、水蛭(13)、瓜蔞(9)、三七(7)、龜板(6)、石菖蒲(3)、虻蟲(2)。排名前3 位的化合物為槲皮素(quercetin)、熊果酸(ursolic acid)、苯丙氨酸(phenylalanine);度值排名前5 位的靶點為PTGS1、PGR、PTGS2、PPARG、AR。預(yù)測這些關(guān)鍵化合物和靶點在腦出血方對腦出血的治療調(diào)控網(wǎng)絡(luò)中起著至關(guān)重要的作用。

2.5 GO 富集與KEGG 通路富集分析 將341 個腦出血方治療靶點導(dǎo)入DAVID 6.8 在線數(shù)據(jù)庫進行GO 富集分析,選擇人類作為研究物種,篩選條件設(shè)置為細胞的組成(cellular component),分子的功能(molecular function),生物的過程(biological process),可獲取分析結(jié)果??煞治龀錾镞^程主要涉及藥物反應(yīng)、乙醇反應(yīng)、RNA 聚合酶II 啟動子轉(zhuǎn)錄正調(diào)控、脂多糖反應(yīng)、缺氧反應(yīng)等。細胞組成主要涉及細胞外間隙、線粒體、膜筏、胞漿、質(zhì)膜等方面。分子功能主要涉及酶結(jié)合、蛋白質(zhì)結(jié)合、蛋白質(zhì)異二聚活性、藥物結(jié)合等。KEGG 富集結(jié)果顯示主要涉及HIF-1 信號通路、cAMP信號通路、MAPK 信號通路。由此可知腦出血方可能作用于這些通路來達到治療作用。

3 討論

腦出血方以《傷寒論》記載的抵擋湯為基礎(chǔ)方,以水蛭、大黃為君藥,水蛭味苦,咸,平,有小毒,歸肝經(jīng),有破血逐瘀,通經(jīng)活絡(luò)之用,腦出血時形成血腫,水蛭以蟲類之軀而入血分,通達腦竅;大黃味苦寒,歸肝、脾、胃、大腸、心包經(jīng),泄下攻積,泄火解毒,主通行六腑,二藥為君,使在上之瘀血下成下行之勢,緩腦府之急。蒲黃、虻蟲、瓜蔞為臣藥,蒲黃味甘平,歸肝、心包經(jīng),有化瘀、止血、通淋之功效,蒲黃生于水中,引熱以下行,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)研究[9]證實,其有較強的凝血作用。虻蟲味苦,微咸,歸肝經(jīng),破血通經(jīng)、逐瘀消癥,與水蛭相比,其作用迅猛,常與水蛭同用,故為臣藥。瓜蔞味甘,苦,歸肺、胃、大腸經(jīng),有清熱滌痰,寬胸散結(jié)之功效,很多腦出血的患者都有高血壓、高脂血癥等病史,或平素嗜好肥甘厚味及嗜酒,均為腦出血發(fā)生的危險因素,其人多煩亂而熱,符合中醫(yī)論述的“痰火”為病,瓜蔞清熱化痰,補活血藥之不逮。三七、龜板、菖蒲為佐使藥,三七味甘,苦,歸肝、胃經(jīng),散瘀止血,可以通神。菖蒲味辛、苦,溫,歸心、胃經(jīng),又名九空子,二藥可以開竅醒神。龜板味甘、咸,歸心、肝、腎經(jīng),滋陰潛陽,益腎強骨,養(yǎng)血補心,因腦出血時,人體氣血奔沖,有升無降,龜板鎮(zhèn)靜、潛斂,又為血肉有情之品,可以補精氣以充腦髓。

本研究中,Degree 排名前3 位的單位藥為蒲黃、生大黃、水蛭,該結(jié)果與現(xiàn)代中醫(yī)學(xué)君臣佐使的配伍原則大致相符,而蒲黃擁有最高的Degree,可能跟研究過程中使用不同的數(shù)據(jù)庫有關(guān)。以上結(jié)果表明,在藥物的配伍過程中應(yīng)該更加注重生大黃和水蛭的地位,同時蒲黃也予以考慮。

本研究結(jié)果顯示,腦出血方單味藥-化合物-治療靶點網(wǎng)絡(luò)中,PTGS1、PGR、PTGS2、PPARG、AR均為重要靶點。目前,環(huán)氧化酶抑制劑是針對腦出血后炎癥反應(yīng)的治療措施之一,Park HK等[10]研究發(fā)現(xiàn),腦出血患者于48 h 內(nèi)服用抗炎藥物塞來昔布具有減輕腦水腫的作用?;诖送茰y,腦出血方可能通過靶向抑制PTGS1 和PTGS2 發(fā)揮治療腦出血作用,減輕腦水腫。PPI 網(wǎng)絡(luò)結(jié)果表明,MAPK1、AKT1、JUN、TNF、RELA、CXCL8、IL6、MAPK8、BDKRB2、PRKCA 等靶點蛋白Degree 值大于平均值8.6,表明其可能是腦出血方治療腦出血的重要靶點群。分裂原活化蛋白激酶1(MAPK1)又稱細胞外信號調(diào)節(jié)激酶2(ERK2),是ERK 信號通路中的重要調(diào)節(jié)因子,也是MAPK 信號通路的重要成員,具有調(diào)控細胞的生長與分化和調(diào)節(jié)炎癥與細胞凋亡等應(yīng)激反應(yīng)作用[11]。腦出血模型大鼠血腫周圍磷酸化ERK1/2 蛋白表達顯著增加[12]。此外,郭孝龍[13]研究發(fā)現(xiàn),ERK 可介導(dǎo)AQP4 的不同表達,對實驗性腦出血大鼠腦水腫產(chǎn)生影響。以上結(jié)果表明腦出血方可能靶向ERK2 并降低其表達,達到減輕腦出血患者腦水腫的目的。綜上所述,腦出血方可以靶向多個靶點群,通過多途徑、多機制發(fā)揮治療腦出血藥理作用。然而,腦出血方單味藥-化合物-治療靶點網(wǎng)絡(luò)與PPI 網(wǎng)絡(luò)中的關(guān)鍵靶點并不一致,其不一樣的結(jié)果可能是由于不同數(shù)據(jù)庫的局限性所造成的,有待進一步研究。

GO 富集結(jié)果表明,腦出血方治療靶點主要涉及藥物反應(yīng)、乙醇反應(yīng)、細胞外間隙、線粒體、酶結(jié)合、蛋白質(zhì)結(jié)合等,表明其治病靶點分布于不同分子組成,結(jié)構(gòu)功能各異。KEGG 通路結(jié)果表明,341 個腦出血方治療靶點主要參于HIF-1信號通路、cAMP信號通路、MAPK 信號通路等。

HIF-1 是一種異源二聚體,主要由HIF-1α 和HIF-1β 兩個亞單位組成。其中HIF-1β 為結(jié)構(gòu)亞單位,HIF-1α 是活性亞基,發(fā)揮主要功能。動物實驗表明,腦出血模型大鼠血清HIF-1α 較對照組表達上升[14]。此外,臨床研究[15]證實,HIF-1α 在急性腦出血患者中表達升高,且其升高水平可反應(yīng)腦出血病情進展及預(yù)后[16]。上述結(jié)果表明,腦出血方可能通過干預(yù)HIF-1 活性亞基發(fā)揮治療作用。

cAMP 是細胞內(nèi)重要的第二信使,廣泛分布于各種體液和生物細胞中,其主要通過激活下游的PKA 而發(fā)揮相應(yīng)的生物效應(yīng)[17]。研究[18-19]表明,腦出血模型大鼠或腦出血患者cAMP 水平升高,其可能于血腦屏障破壞有關(guān)。腦出血方可能通過抑制cAMP表達水平,修復(fù)血腦屏障,發(fā)揮治療作用。

MAPK 通路一種典型的三級激酶模式,其可調(diào)節(jié)細胞的生長、分化、對環(huán)境的應(yīng)激適應(yīng)、炎癥反應(yīng)等多種重要的細胞病理生理過程。MAPK 主要包括3 個亞族:ERK、JUN 和p38MAPK,其分別對應(yīng)ERK 信號通路、JUN 信號通路和p38MAPK 信號通路?,F(xiàn)代研究表明,ICH 大鼠模型MAPK 相關(guān)蛋白(ERK、JUN 和p38MAPK)在病灶周圍腦組織表達增加[20],崔振文[21]發(fā)現(xiàn)MAPK 通路可調(diào)節(jié)腦出血后神經(jīng)凋亡。MAPK 可通過胞外信號使ERK、JUN 和p38MAPK 發(fā)生磷酸化促進表達炎癥因子(IL-1β 和TNF-α)的產(chǎn)生,介導(dǎo)腦出血相關(guān)病理生理過程[22-23]。研究證實,通過直接減少體內(nèi)炎性介質(zhì)(IL-1β 和TNF-α)的表達,可減輕神經(jīng)功能損傷[24-26],減輕腦血管疾病后的氧化反應(yīng),從而起到腦保護作用[27]。本研究中,IL-1β和TNF-α 均是腦出血方治療靶點,且均在MAPK 信號通路中富集?;诖?,我們推測腦出血方可能通過介導(dǎo)MAPK 信號通路的關(guān)鍵蛋白(ERK、JUN 和p38MAPK)調(diào)節(jié)IL-1β、TNF-α 的表達水平,進而調(diào)節(jié)ICH 神經(jīng)凋亡發(fā)揮對腦出血治療效果。

綜上所述,本研究借助網(wǎng)絡(luò)藥理學(xué)方法,對腦出血方治療腦出血的作用機制進行初步理論探討,研究結(jié)果表明腦出血方48 個活性成分對應(yīng)341 個治療靶點中,其中MAPK1、AKT1、JUN、TNF 可能為腦出血方治療腦出血得關(guān)鍵靶點,其可能通過調(diào)節(jié)HIF-1活性亞基;抑制cAMP 水平,修復(fù)血腦屏障;調(diào)控MAPK 信號通路參與腦水腫的發(fā)生、減輕神經(jīng)凋亡,抑制ICH 病理過程,為進一步深入探討腦出血方治療腦出血提供了理論基礎(chǔ)。

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