黃彥菱, 姜雅淇, 李小意, 李高明, 楊 毅
(1.四川大學生命科學學院 生物資源與環(huán)境教育部重點實驗室, 成都 610065;2.四川大學文學與新聞學院, 成都 610065)
植物不能像動物那樣通過遷移來尋找適宜的生存環(huán)境,因此,為了能夠在不斷變化的環(huán)境中生存,植物通常會被不同的環(huán)境馴化出一系列的調控機制[1].在遭遇干旱、冷凍、鹽堿等逆境脅迫時,植物的各種內源激素便單獨或協(xié)同地發(fā)揮重要作用以應對這些非生物脅迫[2].植物在干旱時,體內ABA含量迅速增加,進而激活ABA信號通路,合成干旱相關基因的表達,或通過抑制氣孔開放以降低植物的蒸騰作用,從而使其更好地應對干旱脅迫.此外,ABA參與調節(jié)植物生長發(fā)育的諸多過程,能夠遲滯種子的萌發(fā),抑制植物的生長[3-4].
ABA通路中三大核心元件包括:ABA受體(Regulatory Components Of ABA Receptors/Pyrabactin Resistance/ PYR Like, RCAR/PYR/PYL)、SNF1相關聯(lián)的蛋白激酶(SNF1-Related Protein Kinases, SnRK2s)和下游的轉錄因子.ABA存在時,在ABA受體與ABA結合后,抑制蛋白磷酸酶2C(protein phosphatase 2Cs, PP2Cs)的活性,從而釋放了對SnRK2s的抑制[5-6].SnRK2s自我磷酸化后,激活其磷酸激酶活性,磷酸化離子通道蛋白,控制對滲透脅迫的適應性反應[7].ABA受體除了響應ABA應答外,也會參與到植物對其它非生物脅迫的應答.近期研究表明,在擬南芥中過表達RCAR12或RCAR13 后,經過高溫或者冷凍處理,與野生型的擬南芥相比,其存活率明顯較高,揭示了RCAR12和RCAR13可能在擬南芥對極端溫度的響應方面發(fā)揮了積極作用[8].在小麥中,TaOPR1(12-Oxo-Phytodienoic Acid Reductase 1)通過ABA信號通路調控逆境因子MYC2(Myelocytomatosis 2), 從而提高了小麥對鹽的耐受性[9].因此,研究植物對ABA的響應有利于提升農作物對非生物脅迫的適應性,對指導農業(yè)生產具有重要意義.
本實驗先前以擬南芥中的ABA受體RCAR3/PYL8為誘餌篩選到CARK1,熒光雙分子互補實驗和酵母雙雜交實驗證明:該激酶分別與RCAR3、RCAR11、RCAR12、RCAR13、RCAR14在體內外均有較強的相互作用,并且能夠磷酸化它們[10].根據(jù)蛋白質同源性分析,除CARK1外,該家族還擁有10個同源蛋白,分別命名為CARK2-11,同時將該家族分為三個亞家族,其中CARK4為Ⅲ亞家族,CARK5-9為Ⅱ亞家族,剩下的均為Ⅰ亞家族.前期的研究證明了CARK1通過磷酸化ABA受體從而正調控ABA信號的傳遞.因此,通過對CARK家族單突變體和雙重突變體的分析,探究CARKs是否全部參與ABA信號的調控,且在ABA信號途徑.
cark1,cark2,cark4,cark5,cark6,cark7,cark11七種T-DNA插入突變體從擬南芥生物資源中心(ArabidopsisBiological Resource Center, ABRC)購買,背景為哥倫比亞野生型(Col-0),詳細信息見表1.鑒定引物根據(jù)突變體種子編號在http://signal.salk.edu/index.html中查找,引物由北京擎科公司合成.
表1 carks突變體信息
2.2.1 擬南芥基因組的提取和PCR擴增 本實驗用Plant Genomic DNA Extraction Kit試劑盒(Biovision).取1 cm2左右的擬南芥嫩葉片,加液氮磨碎,然后加buffer A 400 μL;65 ℃加熱10 min,離心10 min,轉移上清,加400 μL buffer B混勻;離心10 min,加400 μL buffer C洗滌后離心去廢液,加適量buffer D溶解.以提取的基因組DNA為模板,加入引物和2×T5 Super PCR Mix(北京擎科),PCR擴增檢測條帶.
2.2.2 擬南芥的雜交 為了獲取雙重突變體,當單基因突變體擬南芥開花期時,選擇剛冒白的花朵,除去多余部分,只留柱頭.將父本的花粉抖到柱頭上,用套子覆蓋,第二天重復此授粉過程.由此獲得的雜交種子用于雙重突變體的PCR篩選和鑒定.
2.2.3 ABA抑制的種子萌發(fā) 用MS固體培養(yǎng)基培養(yǎng)種子,ABA處理的濃度為0.3、0.5和1 μmol/L,分別統(tǒng)計萌發(fā)的種子數(shù)和總數(shù),間隔12 h統(tǒng)計一次,并計算萌發(fā)率,生物學重復三次.
2.2.4 ABA抑制的綠芽率 用MS固體培養(yǎng)基培養(yǎng)種子,ABA處理的濃度為0.3、 0.5和1 μmol/L.待種子萌發(fā)后,每隔24 h統(tǒng)計種子子葉變綠的個數(shù)和種子總數(shù),并計算百分率,生物學重復三次.
PCR鑒定結果表明成功構建了十種雙重突變體,如圖1所示,左上角第一個株系是雙重突變體cark1cark4,記為cark1/4.同理,其余九種雙重突變體分別記為cark1/7、cark1/11、cark4/5、cark4/7、cark4/11、cark5/7、cark5/11.提取構建的雙重突變體擬南芥的基因組為模板,進行PCR擴增.其中引物LP和RP分別位于T-DNA插入位點的兩端,LP為正向引物,RP為反向引物,LB1.3為插入到擬南芥基因組上的T-DNA載體片段的末尾端,且為正向引物.用LP+RP這對引物能擴出條帶時,表明沒有T-DNA插入;用LB1.3+RP這對引物能擴出條帶時,表明有T-DNA插入.所以,用這兩對引物同時擴增一個模板時,如果只出現(xiàn)LP+RP的條帶,表明是野生型;若只出現(xiàn)LB1.3+RP的條帶,表明是突變體;若兩者皆有條帶,則是雜合植株.由此觀之,上述雙重突變體的純合植株已全部構建成功.
圖1 carks雙重突變體基因組的PCR鑒定Fig.1 PCR identification of carks double mutant plants
在種子萌發(fā)和子葉變綠階段,cark1、cark4、cark5、cark6單基因突變體相較于野生型對ABA不敏感,如圖2所示.在MS固體培養(yǎng)基上,cark1、cark4、cark5、cark6突變體和野生型的萌發(fā)趨勢基本一致(圖2a),而用ABA處理后(圖2b~d),雖然所有株系的萌發(fā)都被抑制,但cark1、cark4、cark5、cark6突變體的萌發(fā)率均較野生型高.用0.3 μmol/L的ABA處理所有株系7 d后,野生型的綠芽率只有22%左右(圖2e、f),而cark1為76%,cark4為62%,cark5為39%,cark6為46%左右.以上結果表明,CARK1、CARK4、CARK5、CARK6在ABA介導的抑制種子萌發(fā)和子葉變綠中起著正調控作用.
圖2 carks單基因突變體在種子萌發(fā)和子葉變綠時對ABA的敏感分析(Ⅰ) ** P<0.01.Fig.2 carks single gene mutant plants were insensitive to ABA in ABA-mediated seed germination and green shoots (Ⅰ) ** P<0.01.
圖3 carks單基因突變體在種子萌發(fā)和子葉變綠時對ABA的敏感分析(Ⅱ) **P<0.01.Fig.3 carks single gene mutant plants were insensitive to ABA in ABA-mediated seed germination and green shoots (Ⅱ) ** P<0.01.
相似地,在種子萌發(fā)和子葉變綠時期,cark7、cark11單基因突變體相較于野生型對ABA不敏感,如圖3所示.在MS固體培養(yǎng)基上,cark7、cark11突變體和野生型的萌發(fā)基本一致(圖3a).用0.3 μmol/L ABA處理后(圖3.3b-d),cark7、cark11突變體的萌發(fā)率均比野生型高,差異均較大.用0.3 μmol/L的ABA處理8 d后,野生型的綠芽率為35%左右(圖3e、f),而cark7為92%,cark11為78%.以上結果表明CARK7和CARK11功能缺失的株系在ABA介導的抑制種子萌發(fā)和子葉變綠時對ABA不敏感.
圖4 carks雙重突變體在種子萌發(fā)和子葉變綠時對ABA的敏感性分析(Ⅰ) **P<0.01.Fig.4 carks double mutant plants were insensitive to ABA in ABA-mediated seed germination and green shoots (Ⅰ) ** P<0.01.
cark1/4、cark1/7、cark1/11雙重突變體在種子萌發(fā)和子葉變綠階段相較于野生型對ABA極不敏感,如圖4所示.cark1/4、cark1/7、cark1/11雙重突變體和野生型的萌發(fā)在不處理時幾乎一致(圖4a).用ABA處理時(圖4b~d),cark1/4、cark1/7、cark1/11雙重突變體的萌發(fā)率均比野生型高,且差異均較大.用0.5 μmol/L的ABA處理全部株系,10 d后,野生型的綠芽率只有13%左右(圖4e、f),而cark1/4為88%,cark1/7為91%,cark1/11為78%.其余的雙重突變體cark4/5、cark4/7、cark4/11、cark5/7、cark5/11在萌發(fā)和子葉變綠時同樣對ABA不敏感,如圖5所示.無處理時,上述雙重突變體和野生型的萌發(fā)率保持一致(圖5a).用ABA處理時(圖5b~d),cark4/5、cark4/7、cark4/11、cark5/7、cark5/11雙重突變體的萌發(fā)率均比野生型高,且差異均很大.用0.5 μmol/L的ABA處理10 d,野生型的綠芽率為20%左右(圖5e、f),而cark4/5、cark4/7、cark4/11、cark5/7、cark5/11則分別為81%、89%、76%、79%、85%.以上結果表明,carks雙重突變體在種子萌發(fā)和子葉變綠階段對ABA的不敏感性強于carks單突變體.
圖5 carks雙重突變體在種子萌發(fā)和子葉變綠時對ABA的敏感性分析(Ⅱ) **P<0.01.Fig.5 carks double mutant plants were insensitive to ABA in ABA-mediated seed germination and green shoots (Ⅱ) ** P<0.01.
截至目前,已經發(fā)現(xiàn)了四個激酶能磷酸化ABA受體.但是它們的功能以及對ABA信號通路的影響是不同的.在正常情況下,TOR(Target of Rapamycin)磷酸化RCAR12的S119位點, 抑制ABA信號通路;在脅迫下,SnRK2s磷酸化TOR的一個亞基Raptor, 從而抑制TOR的激酶活性[11].隨后研究者又發(fā)現(xiàn),激酶AEL(ArabidopsisEL1-like)分別磷酸化RCAR11的S109和S156,RCAR12的S136和S182的位點,促進泛素化修飾,從而加劇降解,因此AEL在ABA信號通路中起負調控作用[12].質膜磷酸激酶CEPR2(C-terminally encoded peptide receptor 2)磷酸化被募集到質膜上的RCAR10的S54, 促進RSL1泛素連接酶對RCAR10的泛素化,進而促進26S蛋白酶對其降解[13].本研究的蛋白質磷酸激酶CARK1磷酸化RCAR3的T77位點和RCAR11的T78位點.由此可見,ABA受體不同位點被磷酸化導致其對ABA信號途徑的影響不同,從而形成了復雜的調控網(wǎng)絡,以應對多變的生態(tài)環(huán)境.
carks單基因突變體cark1、cark4、cark5、cark6、cark7和cark11在種子萌發(fā)和子葉變綠階段相對于野生型對ABA不敏感(圖2和圖3),carks雙重突變體cark1/4、cark1/7、cark1/11、cark4/5、cark4/7、cark4/11、cark5/7和cark5/11同樣也在萌發(fā)和子葉變綠階段相較于野生型對ABA不敏感,且這種不敏感性強于單基因突變體(圖4和圖5),這說明CARKs家族成員在ABA信號途徑中的功能是冗余的.實驗室前期的工作表明CARK1能夠磷酸化ABA受體[6-7],所以以CARKs基因功能缺失的突變體為材料,探究這些突變體在ABA處理下的表型,從而探討CARKs在ABA信號通路中的作用.在預實驗中,由于cark2株系在萌發(fā)時對ABA的耐受性與野生型差異較小,因此在構建雙重突變體時未將其作為重點.
結果表明,CARKS存在功能冗余性,接下來可以通過體內外蛋白質互作的方法分析不同的CARK是否會與相同的ABA受體存在相互作用,進而用體外磷酸化實驗分析這些CARKs激酶是否磷酸化相同的ABA受體,或者分析這些CARKs激酶在體內對相同的ABA受體穩(wěn)定性的影響.如果實驗結果表明不同的CARKs激酶會磷酸化相同的ABA受體,并且會影響其體內的蛋白水平,那么就找到了其存在功能冗余性的原因.研究CARKs在ABA信號通路中的功能有助于為研究植物應對逆境時的調節(jié)機制提供新思路,提升農作物對逆境的適應性,并最終提高農作物的產量.