鄭華亮,賈小峰,馬魯南,劉 忠,張貴民
(山東新時(shí)代藥業(yè)有限公司 山東省蛋白類藥物工程實(shí)驗(yàn)室,山東 臨沂 273400)
2017年國際糖尿病聯(lián)盟發(fā)布的第8版糖尿病概覽數(shù)據(jù)顯示,我國糖尿病(20~79歲)患病人數(shù)達(dá)到了1.14億[1],糖尿病已成為繼心血管疾病和癌癥之后,嚴(yán)重危害我國人民健康的三大疾病之一[2]。人胰島素分短效、中效和長效三類,目前市場上應(yīng)用于臨床的長效胰島素有甘精胰島素、地特胰島素等。地特胰島素由丹麥諾和諾德公司研制,于2004年在歐洲上市。地特胰島素是第一個(gè)采用化學(xué)修飾方法獲得的胰島素類似物,即將天然人胰島素分子B鏈上的第30位蘇氨酸去掉,通過?;磻?yīng)在第29位賴氨酸上結(jié)合一個(gè)C14游離脂肪酸[3],C14游離脂肪酸可以與血液中的白蛋白結(jié)合,形成蛋白結(jié)合體,從而延長作用時(shí)間[4-5]。目前,國際市場僅有原研藥諾和諾德上市,2019年銷售收入15.4億美元,國內(nèi)地特胰島素只有幾家藥企處于申報(bào)階段,且普遍存在表達(dá)量低、表達(dá)的胰島素前體容易形成包涵體等問題。
近年來,以低等真核生物酵母作為表達(dá)系統(tǒng)表達(dá)外源蛋白越來越被廣泛研究和應(yīng)用。與大腸桿菌相比,酵母表達(dá)的蛋白質(zhì)可以進(jìn)行翻譯后加工、修飾以及合理的空間折疊,能有效克服大腸桿菌系統(tǒng)缺乏蛋白相關(guān)修飾的不足[6]。1983年,Wegner[7]為克服釀酒酵母的局限,開發(fā)了以畢赤酵母甲醇營養(yǎng)型酵母為代表的第二代酵母表達(dá)系統(tǒng)。畢赤酵母由于醇氧化酶(AoXl)基因的強(qiáng)啟動(dòng)子,特別適合于外源基因的調(diào)控表達(dá)[8],采用這個(gè)系統(tǒng)成功表達(dá)了200種以上蛋白,包括病毒、細(xì)菌、真菌、動(dòng)植物和某些人源蛋白[9]。在甲醇畢赤酵母表達(dá)系統(tǒng)中,受不同蛋白氨基酸組成以及空間結(jié)構(gòu)差異等因素影響,其最優(yōu)表達(dá)條件不同,在發(fā)酵過程中,pH、溫度、溶氧、甲醇誘導(dǎo)量和誘導(dǎo)前菌體濃度都可能對蛋白表達(dá)有很大影響[10-13]。
因此,本文中,筆者嘗試采用酵母表達(dá)系統(tǒng)分泌表達(dá)胰島素前體,以帶有編碼地特胰島素前體DesB30基因的甲醇營養(yǎng)型重組畢赤酵母為實(shí)驗(yàn)菌株,使用5 L玻璃發(fā)酵罐進(jìn)行培養(yǎng)條件的優(yōu)化,考察pH、溫度、誘導(dǎo)前菌體濃度和甲醇流加速度對地特胰島素前體DesB30蛋白表達(dá)的影響,擬通過優(yōu)化發(fā)酵條件得到高表達(dá)可溶性的目的蛋白。
畢氏酵母(Pichiapastoris)GS115菌株,載體為pPIC9K(分泌性表達(dá)載體),信號(hào)肽來自釀酒酵母的α-雜交因子。重組人胰島素源類似物HMPIDesB30基因根據(jù)酵母密碼子的偏好性人工合成。按照Multi-copyPichiaexpression Ki(Version B)經(jīng)SalⅠ酶切,用電轉(zhuǎn)化方法將重組質(zhì)粒HMPIDesB30/pPIC9K轉(zhuǎn)入畢赤酵母GS115中,隨后通過組氨酸缺陷培養(yǎng)基以及G418抗性培養(yǎng)基篩選具有外源基因高拷貝數(shù)的菌株,整個(gè)實(shí)驗(yàn)操作參考畢赤酵母表達(dá)實(shí)驗(yàn)手冊。構(gòu)建的菌株保存于山東新時(shí)代藥業(yè)有限公司。
YPD種子培養(yǎng)基(g/L):葡萄糖20.0,蛋白胨20.0,酵母粉10.0。
發(fā)酵罐培養(yǎng)基(BSM)(1 L):85%H3PO426.7 mL,CaSO40.93 g,K2SO418.2 g,MgSO4·7H2O 14.9 g,KOH 4.13 g,甘油40 g,PTM1微量元素溶液12 mL[14]。
補(bǔ)料培養(yǎng)基:質(zhì)量分?jǐn)?shù)50%甘油,每1 000 mL含有12 mL PTM1微量元素溶液。
PTM1(1 L):CuSO4·5H2O 6.0 g,KI 0.08 g,MnSO4·H2O 3.0 g,Na2MoO40.2 g,H3BO30.02 g,CoCl20.5 g,ZnSO420.0 g,F(xiàn)eSO4·7H2O 65.0 g,VH(生物素)0.2 g,H2SO45.0 mL。
1.3.1 搖瓶種子培養(yǎng)
從平板上挑取單菌落接種至100 mL YPD培養(yǎng)基的搖瓶中,30 ℃、200 r/min培養(yǎng)過夜至OD600為5.0左右。
1.3.2 發(fā)酵罐培養(yǎng)
將搖瓶種子液按照體積分?jǐn)?shù)4%接種量接入到裝有2 L發(fā)酵罐培養(yǎng)基的五聯(lián)裝5 L玻璃發(fā)酵罐中,每升培養(yǎng)基添加4.35 mL PTM1微量元素溶液,用氨水調(diào)初始pH至5.0。當(dāng)甘油耗盡,溶氧快速回升到80%以上后,開始補(bǔ)加質(zhì)量分?jǐn)?shù)50%甘油,流加速度為18.15 mL/(h·L)(以初始發(fā)酵體積計(jì))。甘油補(bǔ)料結(jié)束后,待溶氧快速回升后調(diào)到合適的pH和誘導(dǎo)溫度。隨后補(bǔ)加甲醇進(jìn)行誘導(dǎo)。開始保持低速流加甲醇,之后緩慢提高甲醇補(bǔ)加速度,根據(jù)Invitrogen公司提供的方法,補(bǔ)加速度最終提升至10.9 mL/(h·L),并保持至發(fā)酵結(jié)束,發(fā)酵時(shí)間為128 h左右。通過調(diào)節(jié)轉(zhuǎn)速、罐壓、空氣流量使溶氧大于10%。甲醇誘導(dǎo)期間取樣檢測,測定菌體濃度(以菌體濕質(zhì)量表示),離心收集上清液并進(jìn)行蛋白濃度測定。在此基礎(chǔ)上分別對誘導(dǎo)pH、誘導(dǎo)溫度、誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度和甲醇補(bǔ)速進(jìn)行單因素實(shí)驗(yàn)優(yōu)化。
1.3.3 細(xì)胞濕質(zhì)量
取40 mL發(fā)酵液,12 000 r/min 離心10 min,去上清液,稱菌體質(zhì)量。
1.3.4 目的蛋白DesB30濃度測定
發(fā)酵液12 000 r/min離心,上清液用鹽酸調(diào)pH至4.0,經(jīng)0.45 μm膜過濾后進(jìn)行HPLC(島津公司)分析,色譜柱為C18。流動(dòng)相A(5%乙睛,0.1%三氟乙酸),流動(dòng)相B(95%乙睛,0.1%三氟乙酸)。洗脫條件:先用流動(dòng)相A平衡柱子,洗脫條件為30 min流動(dòng)相B從0~100%,流速1 mL/min,柱溫40 ℃[15]。蛋白含量計(jì)算見式(1)。
發(fā)酵液蛋白濃度=發(fā)酵液上清液峰面積/標(biāo)準(zhǔn)品峰面積×標(biāo)準(zhǔn)品蛋白濃度
(1)
由于畢赤酵母可耐受較寬的pH(pH 3.0~7.0),因此可以通過優(yōu)化 pH 條件來提高目的蛋白的表達(dá)量。為了確定DesB30表達(dá)最適的pH條件,在誘導(dǎo)溫度為25 ℃、誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度280 g/L培養(yǎng)條件下,選擇pH 5.5、6.0、6.5和7.0不同梯度進(jìn)行優(yōu)化,結(jié)果如圖1所示。由圖1(a)發(fā)酵結(jié)果可知:在不同pH條件下,誘導(dǎo)前期和誘導(dǎo)后期的生物量相差不大,生長趨勢幾乎無差別,說明pH對菌體的生長影響較小,發(fā)酵后期濕菌體質(zhì)量濃度均能達(dá)到500 g/L左右。
圖1 不同pH對菌體濕質(zhì)量和DesB30表達(dá)的影響Fig.1 Effects of pH on wet weight of bacteria and DesB30
在不同pH誘導(dǎo)條件下,誘導(dǎo)24 h后,經(jīng)HPLC檢測,DesB30已有少量表達(dá)。在pH 6.0和pH 6.5條件下,DesB30表達(dá)相差不大,具有較高的表達(dá)量。與pH 6.0和pH 6.5條件下的表達(dá)量相比,pH 5.5和pH 7.0條件下的表達(dá)量在誘導(dǎo)24 h后至發(fā)酵結(jié)束這一階段明顯降低(圖1(b))。中性條件pH 7.0并不是蛋白表達(dá)的最適條件,因此,DesB30在中性條件下表達(dá)量很低,DesB30的等電點(diǎn)pI為5.5,在pH 5.5的條件下,DesB30的表達(dá)量偏低,可能是由于DesB30在等電點(diǎn)附近時(shí)目的蛋白溶解度較低,一部分蛋白分泌到上清液后沉淀出來造成單位偏低。綜上,DesB30最適的表達(dá)pH為6.0~6.5,偏中性或者偏酸性都不利于目的蛋白的表達(dá)。
通過pH單因素實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)DesB30最適表達(dá)條件為pH 6.0~6.5。選取誘導(dǎo)表達(dá)pH為6.0、誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度280 g/L條件下,分別設(shè)置22、24、26、28和30 ℃這5個(gè)溫度梯度,以考察溫度對酵母工程菌的生長狀況和DesB30表達(dá)量的影響,結(jié)果如圖2所示。由圖2可知:在22、24和26 ℃這3個(gè)溫度條件下,菌體生長狀態(tài)相似,生物量相差不大;在誘導(dǎo)48 h前,28和30 ℃這2個(gè)溫度條件下的菌體生長狀態(tài)與22、24和26 ℃這3個(gè)溫度條件下的生長狀態(tài)相似,但是在48 h以后,28和30 ℃這2個(gè)溫度條件下的菌體生長明顯變慢,并且96 h以后上清液變混濁,推測是在較高的溫度條件下菌體生長過快,在誘導(dǎo)過程中由于受到甲醇補(bǔ)速的限制,碳源供應(yīng)不足,影響了工程菌的生長,造成菌體部分自溶。
在誘導(dǎo)60 h前,在22、24、26和28 ℃條件下,DesB30表達(dá)量相差不大。誘導(dǎo)60 h后,22、24和26 ℃條件下的DesB30表達(dá)量明顯更高,到發(fā)酵后期,3個(gè)溫度條件下表達(dá)量相差不大。在22 ℃條件下,誘導(dǎo)表達(dá)104 h后表達(dá)量達(dá)到最大,而在24和26 ℃條件下,誘導(dǎo)表達(dá)128 h后表達(dá)量還有繼續(xù)增長的趨勢??紤]到發(fā)酵過程中較低的溫度不易控制,選取26 ℃作為最合適的誘導(dǎo)溫度。
DesB30為分泌性表達(dá),在28和30 ℃條件下誘導(dǎo)時(shí),由于菌體部分自溶,蛋白酶釋放到上清液中,造成蛋白降解。因此,過高的溫度不利于蛋白的積累,而過低的溫度又影響了菌體的生長,隨著發(fā)酵過程的進(jìn)行,甲醇容易積累,毒害菌體,后期培養(yǎng)條件不再適合菌體發(fā)酵,也不利于蛋白的積累,因此在實(shí)際發(fā)酵中盡量控制合適的溫度。
圖2 不同溫度對菌體濕質(zhì)量和DesB30 表達(dá)的影響Fig.2 Effects of temperature on wet weight of bacteria and DesB30
為了考察誘導(dǎo)前菌體濃度對DesB30表達(dá)的影響,在誘導(dǎo)pH為6.0、誘導(dǎo)溫度26 ℃條件下,筆者選取了誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度分別為120、200和280 g/L 3個(gè)條件,結(jié)果如圖3所示。由圖3可知:誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度為120 g/L時(shí),誘導(dǎo)后菌體質(zhì)量濃度相比于誘導(dǎo)前200和280 g/L的菌體質(zhì)量濃度一直偏小。這表明誘導(dǎo)前菌體濃度太低的情況下,在相同甲醇補(bǔ)速條件下,甲醇濃度偏高,對菌體的毒害作用影響了菌體生長,進(jìn)而影響了DesB30的表達(dá)。當(dāng)誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度200 g/L時(shí),誘導(dǎo)之后生長比280 g/L時(shí)的更快,這可能是誘導(dǎo)前太高的菌體濃度,而甲醇補(bǔ)料不足導(dǎo)致碳源不足,使菌體生長受限,蛋白表達(dá)受影響;到后期菌體進(jìn)入平臺(tái)期,兩者菌體濃度相差不大。在誘導(dǎo)表達(dá)50 h前,3個(gè)誘導(dǎo)條件下,DesB30的表達(dá)區(qū)別不大;但在誘導(dǎo)表達(dá)60 h后,誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度200 g/L時(shí)的DesB30表達(dá)量比另外兩個(gè)條件下的表達(dá)量更大,這表明合適的誘導(dǎo)前菌體濃度對蛋白表達(dá)具有很大影響。由此確定200 g/L為最適的誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度。
圖3 不同初始菌體濃度對菌體濕質(zhì)量和DesB30 表達(dá)的影響Fig.3 Effects of initial concentration on wet weight of bacteria and DesB30
在誘導(dǎo)pH為6.0、誘導(dǎo)溫度26℃、誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度200 g/L條件下,繼續(xù)考察甲醇流加補(bǔ)速對DesB30表達(dá)的影響。根據(jù)Invitrogen公司提供的方法,選取甲醇終誘導(dǎo)補(bǔ)速分別為10.9、16.3和21.8 mL/(h·L)3個(gè)條件,結(jié)果如圖4所示。由圖4可知:甲醇流加速度越大,菌體濃度越高,生長越旺盛,培養(yǎng)后期受各種條件影響,菌體生長進(jìn)入平臺(tái)期。在誘導(dǎo)前期,由于甲醇補(bǔ)速是逐漸增加的,在誘導(dǎo)40 h前,DesB30表達(dá)量相差不大;而在誘導(dǎo)40 h后,甲醇補(bǔ)速越大,DesB30表達(dá)量越大。由此可見,提高甲醇流加速率使發(fā)酵液中的甲醇濃度維持在較高水平,有利于DesB30的表達(dá)。但在誘導(dǎo)100 h后,較高的甲醇流加速率已造成細(xì)胞損傷,菌體濃度開始降低,逐漸進(jìn)入衰亡期。另外,在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),在較高的甲醇補(bǔ)速條件下,細(xì)胞代謝甲醇需要更多氧氣,受發(fā)酵罐條件限制,無法維持合適的溶氧水平,因此在誘導(dǎo)過程中合適的甲醇補(bǔ)速對細(xì)胞生長和蛋白表達(dá)至關(guān)重要。在誘導(dǎo)過程中,較高的甲醇補(bǔ)速致使菌體生長越旺盛,產(chǎn)熱嚴(yán)重,耗氧增加,對發(fā)酵罐的要求較高,而且甲醇終補(bǔ)速為16.3和21.8 mL/(h·L)條件下,誘導(dǎo)后期DesB30表達(dá)量相差不大。因此,綜合各種條件及考慮成本因素,確定甲醇終流加補(bǔ)速16.3 mL/(h·L)為最適條件。
圖4 不同甲醇補(bǔ)速下對菌體濕質(zhì)量和DesB30 表達(dá)的影響Fig.4 Effects of different methanol flow rate on wet weight of bacteria and DesB30
在上述優(yōu)化的發(fā)酵條件下,使用5 L玻璃發(fā)酵罐進(jìn)行發(fā)酵實(shí)驗(yàn)。在30 ℃、pH 5.0培養(yǎng)條件下消耗基礎(chǔ)培養(yǎng)基,待培養(yǎng)基中甘油消耗完畢后補(bǔ)料50%甘油,補(bǔ)料結(jié)束后調(diào)溫度至26 ℃,pH至6.5,0.5 h后甲醇誘導(dǎo),15 h內(nèi)將甲醇補(bǔ)速提至16.3 mL/(h·L),發(fā)酵過程中將溶氧控制在15%以上,直至發(fā)酵結(jié)束。發(fā)酵結(jié)束時(shí),下罐D(zhuǎn)esB30表達(dá)量能夠達(dá)到2.5 g/L左右。彭強(qiáng)強(qiáng)等[16]利用一株重組畢赤酵母,通過優(yōu)化的培養(yǎng)工藝,在5 L反應(yīng)器水平發(fā)酵生產(chǎn)人胰島素前體,108 h后產(chǎn)量達(dá)到1.85 g/L。與彭強(qiáng)強(qiáng)等[16]研究結(jié)果相比,本研究的DesB30表達(dá)量高出35%左右,具有明顯的提升,說明本研究優(yōu)化的條件更能利于DesB30的表達(dá)。
畢赤酵母具有能夠高效表達(dá)并有效分泌胞外蛋白、生產(chǎn)成本低等優(yōu)點(diǎn),普遍用于重組蛋白商業(yè)生產(chǎn)。在本研究中,筆者通過畢赤酵母成功地表達(dá)了地特胰島素前體DesB30,并通過單因素實(shí)驗(yàn),初步確定了DesB30蛋白的最優(yōu)表達(dá)條件:誘導(dǎo)pH為6.0~6.5,誘導(dǎo)溫度26 ℃,誘導(dǎo)前菌體質(zhì)量濃度200 g/L,甲醇終補(bǔ)速16.3 mL/(h·L)。在優(yōu)化的發(fā)酵條件下,5 L玻璃發(fā)酵罐中DesB30表達(dá)量能夠達(dá)到2.5 g/L左右。
單因素試驗(yàn)?zāi)艽_定DesB30各種發(fā)酵因素的最佳發(fā)酵條件,但各因素之間可能存在交互作用,后續(xù)還需通過中心復(fù)合實(shí)驗(yàn)確定各因素之間最優(yōu)的比例。另外在實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn),這種固定的甲醇誘導(dǎo)補(bǔ)料方式在發(fā)酵后期存在甲醇補(bǔ)料不足的問題,影響菌體正常生長,需要根據(jù)生長狀況和蛋白表達(dá)情況及時(shí)調(diào)整甲醇流加速率。本結(jié)果對下一步利用大型發(fā)酵罐進(jìn)行重組畢赤酵母發(fā)酵有借鑒作用,從而為DesB30大規(guī)模工業(yè)生產(chǎn)提供實(shí)驗(yàn)基礎(chǔ)。