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結直腸癌RAS、BRAF 基因狀態(tài)與臨床病理特征的關系

2021-04-21 03:52:26黃莎楊建偉高煒師怡張和軍林錦源吳光峰林鷺萍
中國衛(wèi)生標準管理 2021年6期
關鍵詞:突變率密碼子外顯子

黃莎 楊建偉 高煒 師怡 張和軍 林錦源 吳光峰 林鷺萍

李惠

結直腸癌(colorectal cancer,CRC)是我國常見惡性腫瘤之一,其發(fā)病機制尚未完全明確,目前認為與多條信號傳導通路有關[1]。研究發(fā)現(xiàn),絲裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinases,MAPK)信號通路的異常激活在CRC 發(fā)生發(fā)展過程中起重要作用[2]。目前在中國人群,針對MAPK 信號傳導通路上KRAS、NRAS 及BRAF 基因狀態(tài)與CRC 臨床病理特征之間的關系認識并不充分。本研究通過檢測分析370 例CRC 患者中KRAS、NRAS 及BRAF 基因常見位點突變情況,探索上述基因與臨床病理特征之間的關系,為CRC 患者的綜合治療提供理論依據(jù)。

1 資料與方法

1.1 研究對象

收集2018 年1 月—2020 年11 月在福建省腫瘤醫(yī)院接受治療的370 例CRC 患者。所有患者組織標本及臨床病理資料完整。本研究已獲得福建省腫瘤醫(yī)學倫理委員會批準。

1.2 KRAS、NRAS 及BRAF 基因突變檢測

用試劑盒DNA FFPE Tissue Kit 提取結直腸癌組織DNA,采用PCR 擴增,用直接測序法檢測KRAS、NRAS 及BRAF 基因突變。

1.3 錯配修復(MMR)蛋白表達檢測

使用BenchMark ULTRA 全自動免疫組化儀進行MMR 蛋白(MLH1、MSH2、MSH6、PMS2)檢測,所用試劑均為福州邁新生物技術開發(fā)有限公司生產。MLH1、MSH2、MSH6、PMS2 均表達為(+)判為pMMR,而MLH1、MSH2、MSH6、PMS2 中任意一種表達為(-)則判為dMMR。

1.4 統(tǒng)計學分析

采用SPSS 25.0 版軟件處理數(shù)據(jù)。采用χ2檢驗或Fish 精確概率法分析基因狀態(tài)與臨床病理特征的關系。P<0.05 差異具有統(tǒng)計學意義。

2 結果

2.1 臨床病例資料

370 例CRC 患者中,男性236 例,女性134 例,年齡25 ~83 歲;右半結腸癌103 例,左半結腸癌及直腸癌267 例。

2.2 KRAS、NRAS 及BRAF 基因突變頻率及類型

370 例CRC 患者中,KRAS 基因突變率最高,突變患者155例(41.9%),其中第2、3、4 外顯子突變例數(shù)分別為138 例(89.0%)、8 例(5.2%)、9 例(5.8%)。其中KRAS 基因第2 外顯子第12 密碼子突變107 例,第13 密碼子突變31 例;第3 外顯子第59 密碼子突變2 例,第61 密碼子突變6 例;第4外顯子第117 密碼子突變0 例,第146 密碼子突變9 例。NRAS基因突變患者19 例(5.1%),其中第2、3、4 外顯子突變例數(shù)分別為10 例(52.6%)、9 例(47.4%)、0 例。其中NRAS基因第2 外顯子第12 密碼子突變6 例,第13 密碼子突變4 例;第3 外顯子第59 密碼子突變0 例,第61 密碼子突變9 例。BRAF 基因突變患者40 例(10.8%),其中1 例患者突變類型為G469V,其他39 例均為V600E 突變。

2.3 KRAS、NRAS 及BRAF 基因突變與CRC 臨床病理特征之間的關系

KRAS 基因在女性、高中分化患者中突變率高(P=0.009,P=0.007),但與患者年齡、腫瘤部位、大體類型、腫瘤浸潤深度、淋巴結轉移、遠處轉移、MMR 蛋白表達無關。NRAS 基因在低分化、浸潤型患者中突變率高(P=0.003),但與其他臨床病理因素無關。BRAF V600E 突變在右半結腸癌、年齡小于50 歲患者中的突變率高(P=0.007、P=0.004),在低分化、浸潤型患者中的突變率高(P=0.000),多發(fā)生區(qū)域淋巴結轉移及遠處轉移(P=0.047、P=0.001),但與性別、腫瘤浸潤深度、MMR 蛋白表達無關。見表1。

表1 KRAS、NRAS 及BRAFV600E 突變與CRC 臨床病理特征的關系[例(%)]

3 討論

CRC 是我國常見的惡性腫瘤之一,其發(fā)生發(fā)展,是由一系列復雜的遺傳和表觀遺傳事件逐漸累積所致。近年來,結直腸癌分型聯(lián)盟將CRC 的分子分型分為CMS 1-4 型,每種亞型具有各自的分子學及臨床特征[3]。但CMS 分型屬于群體分型,無法指導臨床治療。因此,我們需要對每一位患者進行治療靶點的分型,通過檢測微衛(wèi)星狀態(tài)、MMR 蛋白、KRAS、NRAS、BRAF 等基因選擇治療策略。

臨床研究表明,全RAS 野生型患者在標準化療基礎上聯(lián)合表皮生長因子受體(epidermal growth factor receptor,EGFR)單抗可延長生存期[4]。KRAS 或NRAS 基因突變是EGFR 單抗原發(fā)性耐藥的主要發(fā)生機制。在CRC 患者中,KRAS 突變率為40%,其中主要是第2 外顯子第12、13 密碼子突變[5]。本研究對KRAS 及NRAS 基因進行檢測,KRAS 基因突變率為41.9%,第2 外顯子突變率為37.3%,與文獻報道相似。文獻報道在CRC 患者中KRAS 第3 外顯子突變率僅為2.1%[5],本研究中第3 外顯子突變率為2.2%。國內對于KRAS 第4 外顯子突變的報道很少,本研究檢測到第4 外顯子突變率為2.4%,均為第146 密碼子突變。有報道顯示,KRAS 基因突變與年齡、性別、原發(fā)腫瘤部位、TNM 分期等臨床病理特征無關[6]。本研究顯示,KRAS 基因在女性患者、高中分化患者中突變率高,但與患者年齡、腫瘤部位、大體類型、腫瘤浸潤深度、淋巴結轉移、遠處轉移、MMR 蛋白表達無關。

研究結果顯示,NRAS 基因突變率為2.6%[7]。本研究檢測到NRAS 突變率為5.1%,其中第2、3 外顯子突變率分別為2.7%、2.4%,未檢測到第4 外顯子突變。本研究顯示,NRAS 基因在低分化、浸潤型患者中突變率高,但NRAS 基因突變與患者性別、年齡、腫瘤部位、腫瘤浸潤深度、淋巴結轉移、遠處轉移、MMR 蛋白表達無關。

BRAF 基因編碼的絲氨酸蘇氨酸蛋白激酶是MAPK 信號通路中重要的轉導因子。在CRC 中,BRAF 基因突變率為5% ~10%[8-9],最常見突變位點是V600E[10]。BRAF 基因V600E 突變患者有其獨特的臨床病理特征,常發(fā)生在右半結腸,分化差,與高度微衛(wèi)星不穩(wěn)定和鋸齒狀腺瘤癌變途徑相關[11]。同時,BRAF 基因V600E 突變是晚期結直腸癌的獨立不良預后因素[12]。本研究檢測BRAF 基因突變率為10.8%,其中1 例為G469V 突變,其他均為V600E 突變。BRAF 基因V600E突變與KRAS、NRAS 基因突變不同時存在,但1 例BRAF 基因G469V 突變患者同時存在NRAS G12D 突變。本研究顯示,BRAF V600E 突變多發(fā)生于右半結腸癌、年齡小于50 歲、低分化、浸潤型、區(qū)域淋巴結轉移及遠處轉移的患者中。文獻報道,dMMR CRC 中原發(fā)灶和轉移灶分別有50%和25%的患者可檢測出BRAF 基因V600E 突變[1]。但本研究顯示BRAF 基因V600E突變與患者MMR 蛋白表達無關,可能與樣本量較小有關。

本研究對370 例中國CRC 患者的KRAS、NRAS、BRAF 及MMR 蛋白進行了檢測,收集整理了所有患者的臨床資料,通過統(tǒng)計學分析,對基因突變狀態(tài)和臨床病理特征之間的關系進行研究,為了解中國CRC 患者熱點基因突變分布情況和臨床精準診療提供理論依據(jù)和重要參考。

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