李 麗,張辛銘,尹雙輝,張濤濤,楊順利,薛慧文
(1.甘肅農業(yè)大學動物醫(yī)學院,甘肅蘭州 730070;2.中國農業(yè)科學院蘭州獸醫(yī)研究所/家畜疫病病原生物學國家重點實驗室,甘肅蘭州 730046;3.石家莊市獸用生物制品供應站,河北石家莊 050027)
豬流行性腹瀉病毒(Porcine epidemic diarrhea virus,PEDV) 屬于尼多病毒目(Nidovirales)、冠狀病毒科(Coronaviridae)、冠狀病毒屬(Coronavirus)成員,是引起豬流行性腹瀉(Poreine epidemic diarrhea,PED)的病原。PED是一種急性接觸性傳染病,病豬的主要特征為腹瀉、嘔吐和脫水,對哺乳仔豬具有較高致死率。流行病學調查表明,PEDV已經(jīng)遍及全球,給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大損失[1-2]。膜蛋白(M)在PEDV結構蛋白中含量最多,在補體共同作用下能夠誘導機體產生中和抗體。M蛋白編碼基因與其它冠狀病毒的M基因有較低的相似性,但是在不同PEDV毒株間具有較高的相似性。因此,M蛋白是PEDV檢測以及病原成像等研究的理想靶標蛋白。
駝科和軟骨魚等動物體內存在著一種天然缺失輕鏈、僅有重鏈的抗體,稱之為重鏈抗體(heavy chain antibodies,HCAbs)[3]。這類抗體僅通過重鏈可變區(qū)形成的結構來特異性識別和結合抗原,故稱此可變區(qū)結構片段為單域抗體(single domain antibody,sdAb)。sdAb是目前可以得到的具有完整功能的最小抗體分子,分子質量僅15 ku,是單克隆抗體分子質量的1/3,又稱為納米抗體(nanobody)。sdAb具有結構簡單易于基因工程改造,容易重組表達、高水溶性、耐高溫和極端pH等獨特性質[4-5]。此外,sdAb具有較強的組織滲透性,甚至能通過血腦屏障[6-7],在腫瘤成像、腫瘤治療和小分子抗體治療藥物研發(fā)等領域具有廣闊應用前景[8-11]。本實驗室前期篩選到了M蛋白特異性sdAb,并證實其具有較好的PEDV結合活性,在PEDV檢測和分離方面具有較好的應用價值。然而,由于sdAb不具有自主進入動物細胞的特性,限制了其在治療性抗體研發(fā)以及PEDV成像示蹤方面的應用。
細胞穿膜肽(cell penetrating peptides,CPPs)也稱為蛋白質轉導結構域,是一類含有約5~30個氨基酸的短肽,自身具有跨膜轉運功能,能夠攜帶核酸、蛋白質等生物大分子進入細胞發(fā)揮功能,且沒有細胞毒性。TAT短肽(transactivator)是人類免疫缺陷病毒1型(HIV-1)的反式激活因子,是最早被報道的CPPs[12]。目前,TAT短肽已經(jīng)被用作向細胞內遞送包括小分子核酸(DNA、RNA和siRNA)、多肽、蛋白質、病毒、成像劑、藥物以及各種納米顆粒等的有效工具。
本研究將TAT穿膜肽與抗PEDV膜蛋白M的特異性sdAb進行融合表達,獲得帶有TAT短肽的重組sdAb(TAT-sdAb)。用ELISA方法檢測TAT-sdAb與M蛋白的結合活性,通過免疫熒光技術分析TAT-sdAb進入Vero細胞的特性,并對TAT-sdAb與細胞內的PEDV進行共定位。本研究獲得的具有穿膜活性和抗原結合活性的重組TAT-sdAb,為PEDV感染的活細胞檢測和示蹤提供了材料基礎,為治療性sdAb的研發(fā)提供了參考。
1.1.1 主要試劑 限制性內切酶BamHⅠ和XholⅠ,英國NEB公司產品;膠回收試劑盒、質粒提取試劑盒和大腸埃希氏菌感受態(tài)細胞,中國全式金生物公司產品;0.45 μm濾膜,美國Millipore公司產品;異丙基-β-d-硫代半乳糖苷(IPTG),上海生工生物工程有限公司產品;His-tag純化樹脂,德國Qiagen公司產品;多聚甲醛固定液,中國索萊寶生物公司產品;HRP和FITC標記抗His-tag抗體,TRITC標記抗鼠抗體,美國Abcam公司產品;DMEM培養(yǎng)基,美國Hyclone公司產品;胎牛血清,中國四季青公司產品;細胞培養(yǎng)瓶、激光共聚焦顯微鏡觀察實驗用培養(yǎng)皿(24 mm),美國Corning公司產品;pET-32a表達載體、PEDV核蛋白單克隆抗體、膜蛋白特異性sdAb和重組表達的PEDV M蛋白,中國農業(yè)科學院蘭州獸醫(yī)研究所豬禽消化道感染和黏膜免疫研究創(chuàng)新團隊實驗室保存;其他常規(guī)試劑為國產分析純。
1.1.2 主要儀器 CO2細胞培養(yǎng)箱(HERAcell vios 160i),Thermo Fisher Scientific公司產品;蛋白電泳儀(PowerPac)和酶標儀(iMark),Bio-Rad公司產品;超聲波破碎儀(SCIENTZ-950E),寧波新芝生物科技股份有限公司產品;激光共聚焦顯微鏡(TCS SP8X),Leica公司產品。
1.2.1 PEDV特異性單域抗體與穿膜肽的融合表達及與M蛋白結合活性分析 將TAT穿膜肽基因與實驗室保存的抗PEDV M蛋白的特異性單域抗體sdAb-Mc30(MH550666)[13]基因,通過引物延伸方法融合,并利用BamHⅠ和XholⅠ酶切位點克隆到pET-32a表達載體,連接產物轉化到大腸埃希氏菌(DH5α)感受態(tài)細胞,挑選陽性克隆并進行測序分析,陽性質粒命名為32a-TAT-sdAb,轉化到大腸埃希氏菌BL21(DE3)感受態(tài)細胞中,過夜培養(yǎng)后,挑取單菌落接種到新鮮Lysogeny broth(LB)培養(yǎng)基(含100 μg/mL ampicillin),37℃振蕩培養(yǎng)過夜,次日按照體積比1%接種量,將菌轉接至新鮮LB培養(yǎng)基(含100 μg/mL ampicillin)中,振搖至OD 600 nm值約為0.6~0.8,加入終濃度分別為0.001 moL/L、0.002 moL/L、 0.005 moL/L和0.01 moL/L的IPTG,25℃誘導12 h后,8 000 r/min離心收集菌體。用120 g/L聚丙烯酰胺凝膠電泳(SDS-PAGE)分析。
確定目的蛋白表達以及最佳的IPTG誘導濃度后,大量誘導重組表達菌,收集菌體。用Tris-HCl緩沖液(pH8.0)重懸重組菌,置冰上用超聲儀進行細胞裂解,然后12 000 r/min、4℃離心10 min,收集上清。上清液用0.45 μm濾膜過濾并加入到裝有His蛋白純化樹脂(Ni-NTA agarose resin)的親和層析柱,按操作說明進行目的蛋白純化。獲得的蛋白樣品進行SDS-PAGE電泳分析,然后用透析袋更換溶解緩沖液為磷酸鹽緩沖液(PBS,pH 8.0),用Nanodrop 2000超微量分光光度計測濃度后,分裝,-80℃保存。
參照已報道的ELISA方法[13],稀釋重組TAT-sdAb和sdAb至終濃度分別為10 μg/mL、5 μg/mL、2.5 μg/mL、1.25 μg/mL、0.63 μg/mL、0.32 μg/mL、0.16 μg/mL和0 μg/mL,檢測不同濃度TAT-sdAb與M蛋白的結合活性。
1.2.2 TAT-sdAb穿膜活性分析 利用間接免疫熒光方法(IFA)分析TAT介導sdAb穿膜進入細胞的過程。Vero細胞用DMEM培養(yǎng)基傳代培養(yǎng)(含10%胎牛血清、100 IU/mL青霉素和100 μg/mL鏈霉素),在37℃、5% CO2條件下培養(yǎng)。將細胞傳代至激光共聚焦顯微鏡觀察用培養(yǎng)皿(24 mm),培養(yǎng)至70%~80%細胞匯合,用無血清DMEM培養(yǎng)基洗3次,加入1 mL的DMEM,同時加入TAT-sdAb至終濃度為50 μg/mL,在37℃、5% CO2共孵育3 h;棄掉培養(yǎng)液,PBS洗5次,40 g/L多聚甲醛室溫固定10 min,1 mL/L Triton X100的PBS透膜10 min。固定后的細胞與FITC標記的抗His-tag抗體(1∶3 000稀釋)室溫孵育1 h,DAPI染核5 min,最后用PBS洗5次,激光共聚焦顯微鏡下觀察。
1.2.3 TAT-sdAb的最適使用劑量分析 將Vero細胞傳代至激光共聚焦顯微鏡觀察用培養(yǎng)皿培養(yǎng)至70%~80%細胞匯合,用無血清DMEM培養(yǎng)基洗3次,然后加入1 mL的DMEM,并分別加入TAT-sdAb至終濃度為0 μg/mL、1 μg/mL、10 μg/mL、50 μg/mL和100 μg/mL,設置相同濃度的sdAb為試驗對照,在37℃、5% CO2條件下培養(yǎng)3 h。細胞洗滌并固定,與FITC標記的抗His-tag抗體以及DAPI染料孵育,PBS洗滌,激光共聚焦顯微鏡下觀察。
1.2.4 TAT-sdAb的最適作用時間分析 將Vero細胞傳代至共聚焦顯微鏡觀察實驗用培養(yǎng)皿,培養(yǎng)至70%~80%細胞匯合,分別加入TAT-sdAb至終濃度為50 μg/mL,在37℃、5% CO2,分別培養(yǎng)0 h、0.5 h、1 h、3 h和5 h;設置不加TAT-sdAb的空白細胞對照。細胞洗滌并固定,與FITC標記的抗His-tag抗體以及DAPI染料孵育,PBS洗滌,激光共聚焦顯微鏡下觀察。
1.2.5 TAT-sdAb與PEDV胞內共定位 將Vero細胞傳代至激光共聚焦顯微鏡觀察用培養(yǎng)皿接種0.5 MOI的PEDV疫苗株(CV777),培養(yǎng)12 h,用無血清DMEM培養(yǎng)基洗3次,加入1 mL的DMEM,同時加入TAT-sdAb至終濃度為50 μg/mL,繼續(xù)培養(yǎng)3 h。隨后洗滌并固定細胞,分別與FITC標記的抗His-tag抗體、抗PEDV核蛋白單克隆抗體、TRITC標記抗鼠二抗以及DAPI染料孵育,PBS洗滌,激光共聚焦顯微鏡下觀察。
將PEDV特異性sdAb與TAT融合,構建表達載體32a-TAT-sdAb,并轉化到大腸埃希氏菌感受態(tài)細胞(DE3)。加入不同終濃度IPTG誘導,SDS-PAGE鑒定發(fā)現(xiàn),誘導組均能觀察到大小約為35 ku的特異性條帶,與預測目標蛋白大小相符;利用His-tag蛋白純化樹脂進行純化,可獲得特異性的蛋白條帶(圖1);ELISA試驗證實不同稀釋度的TAT-sdAb與sdAb具有相似的M蛋白結合活性,表明融合TAT并未影響sdAb的抗原結合活性(圖2)。
M.蛋白分子質量標準;1~4.空白質粒對照;5~8.0.001 moL/L、0.002 moL/L、0.005 moL/L和0.01 moL/L IPTG誘導條件下表達菌,白色箭頭所指為目的條帶;9 .目的蛋白純化。
圖2 ELISA方法分析TAT-sdAb的抗原結合活性分析
為了驗證TAT能否有效介導sdAb進入細胞,分別向Vero細胞中加入TAT-sdAb和sdAb共孵育,利用IFA方法通過激光共聚焦顯微鏡觀察細胞內TAT-sdAb和sdAb的分布特征。結果觀察到在TAT-sdAb共孵育Vero細胞的胞質中有明顯的熒光,而與sdAb共孵育的對照細胞內未觀察到明顯的熒光。結果表明融合TAT短肽,使TAT-sdAb具備了穿透細胞膜進入Vero細胞的活性(圖3)。
A.白光觀察的細胞;B.360 nm觀察的細胞;C.488 nm觀察的細胞;D.合并觀察的細胞; T.TAT-sdAb處理組; S.sdAb處理組
為了確定TAT-sdAb穿膜的最佳使用劑量,將不同量的TAT-sdAb與Vero細胞共孵育,IFA方法檢測細胞內TAT-sdAb的變化(圖4)。結果發(fā)現(xiàn),隨著TAT-sdAb蛋白量的增加,Vero細胞內的熒光分布范圍逐漸變大,熒光強度也隨之增加,在使用濃度為50 μg/mL和100 μg/mL時熒光較為明顯,而sdAb對照組則未見明顯熒光。結果說明TAT-sdAb穿膜進入Vero細胞的活性和效率與使用劑量成正相關,要達到理想的穿膜效果,使用濃度應大于50 μg/mL。
A.0 μg TAT-sdAb;B.1 μg TAT-sdAb;C.10 μg TAT-sdAb;
為了確定TAT-sdAb穿膜的最適孵育時間,將其與Vero細胞共孵育,IFA檢測TAT-sdAb在細胞內的變化(圖5)。結果發(fā)現(xiàn),隨著TAT-sdAb與細胞共孵育時間的延長,細胞內熒光點的分布范圍逐漸變大,熒光強度增加;當?shù)? h時,熒光強度尤為明顯。結果說明TAT-sdAb穿膜進入Vero細胞的活性和效率與作用時間成正相關,要達到理想的穿膜效果,作用時間應大于3 h。
A.空白對照;B.0 h;C.0.5 h;D.1 h;E.3 h;F.5 h
為了驗證TAT-sdAb進入細胞后能否識別和結合PEDV,將TAT-sdAb與PEDV感染的Vero細胞孵育,用IFA方法進行共定位分析。結果發(fā)現(xiàn)TAT-sdAb(綠色熒光)進入細胞后,與胞內的PEDV(紅色熒光)分布基本一致,在細胞膜和細胞質發(fā)生熒光重疊(圖6)。結果表明TAT-sdAb進入細胞后能識別胞內的PEDV。
A.360 nm觀察的細胞;B.488 nm觀察的細胞;D.549 nm觀察的細胞;E.合并觀察的細胞; T.TAT-sdAb處理組; C.對照組
PEDV是威脅養(yǎng)豬業(yè)的重大病原,其傳播的廣泛性和對新生仔豬近100%的致死率,給我國養(yǎng)豬業(yè)造成了巨大的損失。本研究小組已經(jīng)利用篩選到的PEDV膜蛋白特異性單域抗體(sdAb-Mcs),建立了PEDV檢測和分離的方法[13]。為了進一步提高sdAb的研究適用性,本研究嘗試構建帶有穿膜肽的sdAb,旨在獲得具有自主進入細胞活性的sdAb,從而拓寬sdAb的潛在應用。
sdAb是具備抗原結合能力的最小抗體,與傳統(tǒng)抗體相比,sdAb還具有可溶性高、穩(wěn)定性好、親和力高、組織穿透力強以及容易大量生產等優(yōu)點。在生物成像、胞內特定抗原示蹤與檢測、藥物投遞以及作為治療性抗體等方面具有巨大應用潛力[14-16]。然而,在活細胞內特定抗原示蹤成像、藥物投遞以及胞內病原治療性抗體等應用中,通常需要sdAb具備較高的組織和細胞穿透活性。細胞穿膜肽(CPPs)是能夠自主穿過細胞膜進入細胞的一類短肽,有介導sdAb進入細胞的巨大潛力。已有研究證實CPPs可通過內吞和直接穿透等機制運載蛋白質和核酸等生物大分子、成像劑、藥物以及各種納米顆粒進入細胞內發(fā)揮其效應功能[17-19]。CPPs具有生物相容性佳、對細胞造成的毒性小以及能與生物活性蛋白直接融合重組表達等優(yōu)點,因此成為以胞內分子為靶標的藥物遞送技術發(fā)展的重要工具。TAT短肽是一類已經(jīng)被廣泛應用的富含堿性氨基酸的CPPs,具有強烈的穿透細胞膜能力[12]。鑒于此,本研究結合sdAb分子質量小、易于基因工程改造特性以及TAT短肽能穿過哺乳動物細胞膜特性,將sdAb基因與TAT短肽融合表達,成功獲得能在大腸埃希氏菌中(E.coli)可溶性表達的重組TAT-sdAb蛋白。對TAT-sdAb的M蛋白結合活性分析表明,融合TAT并未影響sdAb的抗原結合活性。此外,每升LB培養(yǎng)液可獲得超過5 mg的重組TAT-sdAb抗體(結果未展示),成本低廉,易于制備,能滿足后續(xù)的各種應用需求。
研究發(fā)現(xiàn),將蛋白質(如乙二醛酶蛋白和Smar蛋白等)與細胞穿膜肽TAT融合表達后,TAT能夠以時間和劑量依賴的方式將這些蛋白質遞送進入細胞中[20-21]。也有研究證實,將治療性抗體與TAT融合,成功將治療性抗體遞送到細胞內[22]。本研究將TAT-sdAb與Vero細胞共孵育后,發(fā)現(xiàn)TAT-sdAb能夠進入到Vero細胞內,其入胞效率與使用劑量和作用時間成正相關,這也與以前的研究報道相一致。對細胞內PEDV與TAT-sdAb共定位分析發(fā)現(xiàn),進入細胞的TAT-sdAb與PEDV呈共定位分布,表明重組TAT-sdAb進入細胞后能識別胞內的PEDV病原。因此,TAT-sdAb有望成為PEDV感染細胞動態(tài)示蹤研究中的有力工具。同時,TAT穿膜肽成功介導有病原結合活性的sdAb有效進入細胞,為具有特定活性小分子蛋白的細胞內傳遞提供更多數(shù)據(jù)參考。
總之,本研究將TAT穿膜肽與PEDV特異性sdAb進行了融合表達,獲得了具有抗原結合活性的重組TAT-sdAb;進一步分析證實TAT-sdAb能夠自主進入Vero細胞,并能識別細胞內的PEDV,為PEDV感染動態(tài)過程可視化研究提供了有力工具,同時也為治療性單域抗體的細胞內遞藥提供更多參考。