馮清敏,王子豪,唐家璇,林軍章,譚曉明,汪衛(wèi)東,黃婷婷,田泊凝,肖 盟*
(1.青島科技大學(xué)化工學(xué)院,山東 青島 266042;2.中國石化勝利油田分公司石油工程技術(shù)研究院,山東 東營 257000)
多環(huán)芳烴(polycyclic aromatic hydrocarbons,PAHs)是由兩個及兩個以上苯環(huán)稠合而成的持久性有機污染物[1-2],主要來源于石油、煤炭、木材等有機高分子化合物的不完全燃燒過程以及原油的開采過程[3]。多環(huán)芳烴具有很強的疏水性和生物毒性[4],其在環(huán)境中的積聚嚴(yán)重危害人類的身體健康。目前,環(huán)境中的多環(huán)芳烴主要通過吸附、光降解、化學(xué)氧化、生物法等方法降解[5],其中,生物法,尤其是微生物的礦化作用,具有成本低、綠色環(huán)保、降解效果顯著、不會殘留有毒有害中間代謝產(chǎn)物等優(yōu)點,是降解多環(huán)芳烴的主要手段。多環(huán)芳烴高效降解菌的篩選是降解多環(huán)芳烴的關(guān)鍵。目前,對于降解菌的報道大多針對低分子量多環(huán)芳烴[6],降解機理比較清晰;而高分子量多環(huán)芳烴因其水溶性差、生物利用率低、降解難度大[7],相關(guān)生物降解途徑不夠清晰。因此,篩選高分子量多環(huán)芳烴降解菌,并探究其降解機理及強化措施,對有效降解環(huán)境中的多環(huán)芳烴具有一定的指導(dǎo)意義。
共代謝作用是微生物降解多環(huán)芳烴的重要手段[8]。共代謝基質(zhì)主要有葡萄糖、乙酸、蛋白胨等簡單碳源以及水楊酸、鄰苯二酚等中間代謝產(chǎn)物。添加共代謝基質(zhì)后,可以顯著提高微生物的代謝性能,進而強化其對多環(huán)芳烴的降解。然而,隨著共代謝基質(zhì)被微生物吸收殆盡,微生物對多環(huán)芳烴的共代謝作用也隨之降低,最終導(dǎo)致多環(huán)芳烴的殘留或不完全降解,產(chǎn)生有毒有害的中間代謝產(chǎn)物。對于受原油污染的環(huán)境,共代謝基質(zhì)的選擇最好是“就地取材”,從而避免因共代謝基質(zhì)消耗而影響微生物對多環(huán)芳烴的降解,即將原油中的易降解烴類(如飽和烴和芳烴)作為共代謝基質(zhì),原位強化微生物對多環(huán)芳烴的共代謝作用。
芘作為高分子量多環(huán)芳烴模式化合物,普遍存在于石油污染土壤及油田廢水中。然而,有關(guān)微生物以石油烴為共代謝基質(zhì)降解芘的研究相對較少。因此,作者從勝利油田沾三區(qū)塊石油污染土壤中篩選一株以芘為唯一碳源和能源的降解菌,考察菌株的生長特性及其對芘的降解性能,采用氣相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀(GC-MS)和高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀(HPLC-MS)分析中間代謝產(chǎn)物,推測菌株的代謝途徑;分別以飽和烴、芳烴和原油為共代謝基質(zhì),結(jié)合降解酶活性分析,探討不同共代謝基質(zhì)對菌株共代謝性能的影響,為高分子量多環(huán)芳烴的降解提供一定的理論支持。
原油,由中國石化勝利油田分公司石油工程技術(shù)研究院提供,其飽和烴、芳烴、非烴和瀝青質(zhì)的含量分別為48.13%、22.15%、10.04%和19.83%,四組分測定方法參照SY/T 5119-2016 《巖石中可溶有機物及原油族組分分析》。
芘(質(zhì)量分數(shù)98%)、雙(三甲基硅基)三氟乙酰胺(BSTFA),Aldrich公司;酵母浸粉、蛋白胨,北京奧博星生物技術(shù)有限公司;乙酸乙酯、丙酮、無水硫酸鈉、氯化鈉等均為分析純,國藥集團化學(xué)試劑有限公司。
Agilent 6890/5975型氣質(zhì)聯(lián)用儀、Agilent 1200型高效液相色譜儀、Agilent 6460C型高效液相色譜-質(zhì)譜聯(lián)用儀,美國安捷倫科技有限公司;752型紫外可見分光光度計,上海菁華科技儀器有限公司。
LB培養(yǎng)基(g·L-1):酵母粉5.0,蛋白胨10.0,氯化鈉10.0,pH值7.0。
無機鹽培養(yǎng)基(g·L-1):KH2PO41.0,CaCl20.01,K2HPO41.0,F(xiàn)eSO4·7H2O 0.1,MgSO40.5,NH4NO31.0,pH值7.0,加入2%瓊脂粉可作為固體培養(yǎng)基,121 ℃高壓滅菌20 min。
芘-無機鹽培養(yǎng)基:以丙酮為溶劑,配制4 g·L-1芘儲備液;取適量儲備液于錐形瓶中,置于暗處,待丙酮完全揮發(fā)后加入適量無機鹽培養(yǎng)基,121 ℃高壓滅菌20 min。
取10 g石油污染土壤加入到含有100 mg·L-1芘的芘-無機鹽培養(yǎng)基中,在35 ℃、150 r·min-1條件下,于空氣浴恒溫振蕩器中培養(yǎng)7 d;培養(yǎng)結(jié)束后,取上層培養(yǎng)液轉(zhuǎn)接于含有300 mg·L-1芘的芘-無機鹽培養(yǎng)基中繼續(xù)培養(yǎng)7 d;重復(fù)以上操作,依次以芘濃度500 mg·L-1和700 mg·L-1的芘-無機鹽培養(yǎng)基轉(zhuǎn)接富集;富集結(jié)束后,取0.1 mL培養(yǎng)液,梯度稀釋后涂布于芘-無機鹽固體培養(yǎng)基上,置于恒溫培養(yǎng)箱中;待長出菌落,挑取菌落大小及形態(tài)不同的單菌落并劃線分離,即得到以芘為唯一碳源的降解菌。
菌株形態(tài)觀察:將篩選菌株于LB培養(yǎng)基中活化至對數(shù)期,取適量菌細胞用磷酸鹽緩沖液沖洗后,用透射電鏡觀察菌株大小及形態(tài)。
菌株種屬鑒定:提取篩選菌株的DNA,用通用引物擴增菌株的16S rDNA序列,引物序列為27F (5′-AGTTTGATCMTGGCTCAG-3′)和1492R(5′-GGTTACCTTGTTACGACTT-3′);然后將擴增產(chǎn)物送至生工(上海)生物工程有限公司測序;將測序所得序列提交至NCBI的Genbank數(shù)據(jù)庫進行序列同源性比對,用MEGA 7.0進行序列同源性分析,依據(jù)鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,確定芘降解菌的種屬。
最適生長溫度的測定:將活化后的菌液按5%接種量接種至含有100 mg·L-1芘的芘-無機鹽培養(yǎng)基中,分別在25 ℃、30 ℃、35 ℃、40 ℃條件下,于空氣浴振蕩器中150 r·min-1培養(yǎng)7 d,測定不同溫度下的OD600值和培養(yǎng)液中芘的含量。以上試樣均做3個平行。
最適pH值的測定:調(diào)整芘-無機鹽培養(yǎng)基的pH值分別為5、6、7、8、9,將活化后的菌液按5%接種量接種至含有100 mg·L-1芘的芘-無機鹽培養(yǎng)基中,在35 ℃、150 r·min-1條件下培養(yǎng)7 d,測定不同pH值下的OD600值和培養(yǎng)液中芘的含量。以上試樣均做3個平行。
用等體積乙酸乙酯超聲萃取培養(yǎng)液30 min,靜置2 h后收集萃取液,重復(fù)萃取3次,合并有機相;加入無水硫酸鈉,4 ℃靜置過夜,旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)萃取液并定容至1 mL;用0.22 μm有機濾膜過濾后,采用HPLC測定芘的含量,并計算降解率。以上試樣均做3個平行。HPLC測試條件:Water C18色譜柱,紫外檢測器,柱溫35 ℃,流動相為甲醇,流速0.8 mL·min-1,進樣量10 μL,檢測波長254 nm。
取降解7 d后的菌液,用等體積乙酸乙酯超聲萃取3次后,合并有機相;然后用6 mol·L-1鹽酸調(diào)整萃余液pH值為2.0,重復(fù)萃取3次,合并中性和酸性萃取液并旋轉(zhuǎn)蒸發(fā)至2 mL;有機濾膜過濾后,分別用GC-MS和HPLC-MS測定中間代謝產(chǎn)物組成。
GC-MS樣品須氮吹揮干,加入150 μL正己烷,再加入300 μL BSTFA-三甲基氯硅烷(TMCS)(99∶1),60 ℃反應(yīng)45 min,最后添加正己烷定容至1 mL。GC-MS條件:HP-5毛細管色譜柱(30 m×0.25 mm,0.25 μm),電子轟擊(EI)離子源;電離能量70 eV;離子源溫度230 ℃;進樣口溫度250 ℃;四級桿溫度150 ℃;全掃描模式,掃描范圍:50~550 amu;氮氣流速1 mL·min-1。程序升溫條件:初始溫度120 ℃,保持2 min;以2 ℃·min-1升溫至280 ℃,保持2 min。不分流進樣,進樣量1 μL。
HPLC-MS條件:C8色譜柱(2.1 mm×50 mm,1.7 μm)和XEVO G2-XS Q-TOF高分辨質(zhì)譜儀,采用軟電離,正負離子模式檢測;進樣量2 μL;檢測時間6 min;流動相水-乙腈(90∶10),梯度洗脫:10%乙腈保持0.2 min,1 min后升至99%,保持2.8 min后回到初始比例直到6 min;質(zhì)譜儀離子源溫度120 ℃,脫溶劑氣溫度350 ℃。
為了探究不同共代謝基質(zhì)對降解菌共代謝性能的影響,分別以100 mg·L-1的飽和烴、芳烴、原油為共代謝基質(zhì),以只含有100 mg·L-1芘的芘-無機鹽培養(yǎng)基為對照,接種后于35 ℃、150 r·min-1培養(yǎng)30 d,并分別于7 d和30 d測定芘的降解率。
按1.8方法培養(yǎng)菌液。待降解至第7 d,分別測定水楊酸羥化酶、原兒茶酸-3,4-雙加氧酶、鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶和鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶的活性。粗酶液的制備參照Bradford[9]的方法;水楊酸羥化酶、原兒茶酸-3,4-雙加氧酶、鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶和鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶活性的測定分別參照Zhou等[10]、Bubinas等[11]、Xu等[12]和劉娜等[13]的方法。以上試樣均做3個平行。
以芘為唯一碳源進行芘降解菌的篩選,得到了一株能以芘為唯一碳源和能源的降解菌M4。M4的菌落在芘-無機鹽固體培養(yǎng)基上呈淺黃色,邊緣清晰(圖1a);透射電鏡照片顯示菌株呈短棒狀,長度約1~2 μm,且有鞭毛(圖1b)。
圖1 菌株M4的菌落形態(tài)(a)及透射電鏡照片(b)
根據(jù)鄰接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹(圖2)。經(jīng)16S rDNA測序并與Genbank數(shù)據(jù)庫比對分析,發(fā)現(xiàn)菌株M4與假單胞菌(Pseudomonas)HL22-2的同源性最高,序列相似度為99.41%,推斷菌株M4為施氏假單胞菌(Pseudomonasstutzeri),命名為Pseudomonassp.M4。
圖2 基于菌株M4 16S rDNA序列構(gòu)建的系統(tǒng)發(fā)育樹
在不同溫度和不同pH值下,菌株M4的芘降解率和OD600值如圖3所示。
圖3 不同溫度(a)和不同pH值(b)下,菌株M4的芘降解率及OD600值
由圖3可知,隨著溫度的升高和pH值的增大,芘降解率及菌體濃度(OD600值)均先升高后降低。當(dāng)溫度為35 ℃時,芘降解率及菌體濃度均達到最高,表明菌株M4的最適生長溫度為35 ℃;當(dāng)pH值為7時,芘降解率最高,且具有最高的菌體濃度,表明菌株M4的最適pH值為7。
通過GC-MS和HPLC-MS分析菌株M4降解芘的中間代謝產(chǎn)物。根據(jù)中間代謝產(chǎn)物的GC-MS總離子流圖(圖4),共檢測到6種中間代謝產(chǎn)物,各代謝產(chǎn)物的碎片離子質(zhì)荷比(m/z)及結(jié)構(gòu)式如圖4所示。
圖4 菌株M4降解芘的中間代謝產(chǎn)物的GC-MS總離子流圖及GC-MS檢測到的中間代謝產(chǎn)物
微生物對芘的降解通常存在兩種代謝途徑:水楊酸途徑和鄰苯二甲酸途徑[14]。由圖4可知,降解過程中產(chǎn)生了下游代謝產(chǎn)物苯甲酸、鄰苯二酚、鄰苯二甲酸單烯丙酯[15],推測菌株M4對芘的降解過程存在鄰苯二甲酸途徑。然而,鄰苯二甲酸和水楊酸在GC-MS中均未被檢出。為了確定是否存在鄰苯二甲酸和水楊酸,配制水楊酸、鄰苯二甲酸、鄰苯二酚和1-羥基-2-萘甲酸的標(biāo)準(zhǔn)樣品,采用HPLC-MS在負離子模式下對標(biāo)準(zhǔn)樣品和降解樣品作進一步檢測,結(jié)果見表1。
表1 HPLC-MS檢測到的中間代謝產(chǎn)物
由表1可知,在降解樣品中檢測到了4種中間代謝產(chǎn)物,保留時間分別為0.510 min、0.621 min、2.250 min和3.701 min,[M-H]的質(zhì)荷比分別為165.019 7、137.024 9、208.052 5和232.052 5,分別對應(yīng)標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)鄰苯二甲酸、水楊酸、3,4-二羥基菲和4,5-二羥基芘。
綜合GC-MS和HPLC-MS的分析結(jié)果,菌株M4降解芘的中間代謝產(chǎn)物包括上游代謝產(chǎn)物1-羥基芘、4,5-二羥基芘、3,4-二羥基菲和1,2-二羥基萘,以及苯甲酸、鄰苯二酚、鄰苯二甲酸單烯丙酯、鄰苯二甲酸、水楊酸等下游代謝產(chǎn)物。
芘的生物降解過程中,遵循從高環(huán)數(shù)向低環(huán)數(shù)轉(zhuǎn)化的規(guī)律[16],首先在雙加氧酶的作用下發(fā)生羥基化反應(yīng),生成4,5-二羥基芘,再通過加氧酶、脫氫酶等轉(zhuǎn)化為3,4-二羥基菲,從而進入菲的代謝途徑[17]。在菲的降解過程中,會產(chǎn)生標(biāo)志性代謝產(chǎn)物1-羥基-2-萘甲酸。但本實驗并未檢測到1-羥基-2-萘甲酸,可能該物質(zhì)含量很低,產(chǎn)生后被快速消耗。許多芳烴雙加氧酶基因的研究可以支持這一推測[18-19]。1-羥基-2-萘甲酸的降解存在兩種代謝途徑[20],分別為水楊酸途徑和鄰苯二甲酸途徑[21]。1-羥基-2-萘甲酸在還原酶的作用下生成1,2-二羥基萘,本實驗代謝產(chǎn)物中存在水楊酸、1,2-二羥基萘和鄰苯二酚,表明菌株M4對芘的降解存在水楊酸途徑。此外,1-羥基-2-萘甲酸可在雙加氧酶、脫氫酶和脫氫異構(gòu)酶的作用下,轉(zhuǎn)化為順式-2′-羧基苯丙酮酸鹽,進一步生成鄰苯二甲酸。根據(jù)GC-MS的分析結(jié)果,存在鄰苯二甲酸單烯丙酯,該物質(zhì)為鄰苯二甲酸的衍生物,而HPLC-MS分析中檢測到了鄰苯二甲酸,表明在芘降解過程中,也存在鄰苯二甲酸途徑。因此,根據(jù)文獻報道的代謝途徑,結(jié)合GC-MS和HPLC-MS分析結(jié)果,推斷菌株M4對芘的降解同時存在水楊酸途徑和鄰苯二甲酸途徑,如圖5所示。
圖5 菌株M4對芘的代謝途徑(括號內(nèi)的物質(zhì)為已檢測到的中間代謝產(chǎn)物)
分別以飽和烴、芳烴和原油為共代謝基質(zhì),以只含有芘的芘-無機鹽培養(yǎng)基作為對照,分別測定7 d和30 d的芘降解率,結(jié)果如圖6所示。
圖6 不同共代謝基質(zhì)對芘降解率的影響
由圖6可知,添加共代謝基質(zhì)均能夠促進芘的降解,其中添加原油的效果最為明顯;7 d芘降解率由高到低依次為原油組、飽和烴組、芳烴組和對照組,降解率分別為26.56%、21.50%、18.20%和17.01%,而30 d芘降解率普遍高于7 d降解率,由高到低依次為原油組、飽和烴組、芳烴組和對照組,降解率分別為61.23%、55.76%、44.71%和42.05%。表明,隨著時間的延長,芘降解率逐漸升高。相較于芳烴,飽和烴更容易被微生物降解利用[22],以飽和烴為共代謝基質(zhì)能夠顯著提高微生物的代謝活性[23],使得芘降解率顯著高于對照組和芳烴組。據(jù)文獻報道,在Acinetobacterjohnsonii同步降解萘和芘的過程中,萘可被優(yōu)先降解,同時降解菌的生物量和降解酶活性均顯著提高,進而促進芘的降解[24]。由此推斷,以芳烴為共代謝基質(zhì)時,低分子量的芳烴也能夠提高相關(guān)降解酶的活性,進而促進芘的降解。但芳烴與芘的降解可能存在競爭性抑制[25],因而其降解率低于飽和烴組。當(dāng)以原油為共代謝基質(zhì)時,由于飽和烴和芳烴共存,因此,既能提高微生物的代謝性能,又能提高降解酶的活性,因此,以原油為共代謝基質(zhì)時的芘降解率最高。在實際環(huán)境中,飽和烴和芳烴并不可能單獨存在,以原油作為共代謝基質(zhì)能有效模擬實際環(huán)境,且不需要添加其它外源營養(yǎng)物質(zhì),實現(xiàn)了共代謝基質(zhì)的“就地取材”,避免了因外源營養(yǎng)物質(zhì)的耗盡而引起降解菌降解性能的下降。
為了探究菌株M4利用石油烴的共代謝機理,明確菌株M4降解芘的主要途徑,對降解過程中水楊酸羥化酶、原兒茶酸-3,4-雙加氧酶、鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶和鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶的活性進行測定,結(jié)果如圖7所示。
a.水楊酸羥化酶 b.原兒茶酸-3,4-雙加氧酶 c.鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶 d.鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶
由圖7可知,不同共代謝基質(zhì)可以強化不同種類的降解酶活性。以原油為共代謝基質(zhì)時,水楊酸羥化酶的活性顯著升高(圖7a),僅添加飽和烴對水楊酸羥化酶無明顯誘導(dǎo)作用,因此,推斷原油能夠顯著提高水楊酸羥化酶的活性。然而,飽和烴顯著提高了原兒茶酸-3,4-雙加氧酶的活性(圖7b),添加芳烴次之,而后是原油組和對照組,表明以原油為共代謝基質(zhì)不能強化原兒茶酸-3,4-雙加氧酶的活性。鄰苯二酚是水楊酸的下游代謝產(chǎn)物,鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶和鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶是鄰苯二酚降解的關(guān)鍵酶,經(jīng)鄰苯二酚雙加氧酶催化后便可進入TCA循環(huán)。添加原油后鄰苯二酚-1,2-雙加氧酶的活性偏低(圖7c),鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶的活性較高(圖7d),可見當(dāng)以原油為共代謝基質(zhì)時,鄰苯二酚的降解主要依賴于鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶。綜合降解酶活性分析,以原油為共代謝基質(zhì)會顯著提高水楊酸羥化酶和鄰苯二酚-2,3-雙加氧酶的活性,即主要通過提高水楊酸途徑中降解酶的活性強化菌株M4對芘的共代謝作用。
從石油污染土壤中篩選到一株能以芘為唯一碳源和能源的降解菌,命名為Pseudomonassp.M4。菌株M4降解芘的最適生長溫度為35 ℃、最適pH值為7。通過GC-MS和HPLC-MS分析,推斷菌株M4對芘的降解存在水楊酸途徑和鄰苯二甲酸途徑。共代謝實驗結(jié)果表明,相較于飽和烴和芳烴,以原油為共代謝基質(zhì)時芘的降解率最高,30 d降解率達61.23%。降解酶活性分析表明,不同的共代謝基質(zhì)會強化不同代謝途徑中的酶活性。以原油為共代謝基質(zhì)時,菌株M4主要通過強化水楊酸途徑中降解酶的活性實現(xiàn)對芘的共代謝作用。因此,綜合生長條件及共代謝性能,菌株M4對原油污染的環(huán)境有較好的適應(yīng)性,不需要添加外源營養(yǎng)物,能夠有效利用原油強化高分子量多環(huán)芳烴的降解,具有較好的應(yīng)用前景。