雷宇平,圖門巴雅爾,張仲萍,王 錦,寧 艷,雷 沖,胡明明,孫 杰,王治維,趙 凱,張 昱,王仲兵
(山西省動物疫病預(yù)防控制中心,山西太原 030027)
流感(influenza)是由流感病毒(influenza virus,IV)引起的人獸共患病,禽類和哺乳類動物均易感。2013 年,上海市發(fā)現(xiàn)首例人感染H7N9亞型IV(IV-H7N9)病例。IV-H7N9 在之后4 年內(nèi)引起的感染人數(shù)與H5N1 亞型20 年內(nèi)引起的感染人數(shù)相似,提示其對人類健康的威脅性較高[1]。根據(jù)農(nóng)業(yè)農(nóng)村部官網(wǎng)信息,2013 年至2017 年,我國已經(jīng)發(fā)生了5 次家禽IV-H7N9 疫情,流行范圍幾乎遍及全國[2]。
通常來說,H5 和H7 亞型IV 屬于高致病性病毒,可引起雞群中度或重度呼吸系統(tǒng)疾病,死亡率較高[3]。值得注意的是,與H5N1 亞型相比,H7N9 亞型在禽類中流行較隱蔽,引起的癥狀缺乏不易被發(fā)覺,從而導(dǎo)致養(yǎng)殖場遭受經(jīng)濟(jì)損失,并威脅公眾身體健康[1,4]。IV-H7N9 流行通常遵循季節(jié)規(guī)律,無患病人群年齡和性別分布差異[5]。
IV 致病性強(qiáng)弱受多種因素影響,對易感雞群來說,病毒毒力和雞群免疫水平都能影響其發(fā)病情況[6]。通常人感染IV-H7N9 是通過與患病禽類密切接觸引起的。感染者可發(fā)生嚴(yán)重呼吸系統(tǒng)疾病,主要表現(xiàn)為發(fā)熱、咳嗽、呼吸困難,同時伴有天門冬氨酸轉(zhuǎn)移酶、肌酸激酶和乳酸脫氫酶升高,患者也會出現(xiàn)嚴(yán)重并發(fā)癥,包括急性呼吸系統(tǒng)衰竭、休克、急性腎損傷、淤血性心衰等。
目前,人類針對IV-H7N9 的群體免疫尚未建立,且該病毒還可在禽類以外的小鼠、貂及靈長類等動物體內(nèi)高度復(fù)制,因此其具有大流行的可能性[7]。盡管IV-H7N9 可在活禽中被檢出,然而其在雞群中的致病性和傳播機(jī)制尚未完全明確[8]。2017年國家衛(wèi)健委組成聯(lián)合督導(dǎo)組,對流感疫情重點省份防控工作進(jìn)行督查,指出我國IV-H7N9 疫情表現(xiàn)出病例增多、分布地區(qū)廣、散發(fā)程度高等特點,但疫情總體特點未發(fā)生改變,接觸被感染禽類或暴露于活禽經(jīng)營市場是人感染的重要危險因素[9]。
IV-H7N9 的免疫學(xué)檢測技術(shù)主要有免疫膠體金檢測和酶聯(lián)免疫吸附試驗(ELISA)。這兩種技術(shù)操作簡單,適用于病毒現(xiàn)場檢測。IV-H7N9 的分子生物學(xué)檢測方法包括RT-PCR、多重RT-PCR、基因芯片、液相芯片等。其中:多重RT-PCR 可同時檢測不同亞型病毒;基因芯片和液相芯片特異性高、檢測時間短,但對硬件要求高,成本相對較高;RT-PCR 具有快速、靈敏度高、特異性強(qiáng)的優(yōu)點,且可以對樣品進(jìn)行定量分析,是目前在監(jiān)測網(wǎng)絡(luò)中使用最廣泛的方法。
加強(qiáng)源頭管控,早期檢出IV-H7N9,是減少農(nóng)場經(jīng)濟(jì)損失,降低公眾生命健康威脅的必要手段。本研究旨在構(gòu)建一種高效、準(zhǔn)確的熒光定量RT-PCR 方法,以快速檢出雞群中的IV-H7N9,為控制病毒擴(kuò)散提供技術(shù)手段。
第二代人感染IV-H7N9 核酸檢測試劑國家參考品,購自國家藥品標(biāo)準(zhǔn)物質(zhì)網(wǎng)站,貨號 370050;H1、H3、H5、H9 亞型禽流感(AIV)核酸樣品,購自北京世紀(jì)元亨動物防疫技術(shù)有限公司,貨號分別為AIV-H1 20200617P、AIV-H3 20200617P、AIV-H5 20200212P、AIV-H9 20200210P。
RNA 提取試劑盒,購自廣州維伯鑫生物科技股份有限公司;ddH2O,為美國Sigma 公司產(chǎn)品;dNTPs、5×buffer,購自上海生工生物工程有限公司;Hot-startTaq聚合酶、MMLV 反轉(zhuǎn)錄酶,購自菲鵬生物股份有限公司;高速低溫離心機(jī),購自珠海黑馬醫(yī)學(xué)儀器有限公司;LightCycler480 熒光PCR 儀,為瑞士羅氏公司產(chǎn)品;小型瞬時離心機(jī),為美國精騏公司產(chǎn)品;渦旋振蕩器、超微量紫外分析儀,為Quawell Technology 公司產(chǎn)品。
從GenBank 上下載序列(H7 序列登記號:MT498676.1、MG925503.1、MN170546.2、MN686727.1;N9 序列登記號:MG266066、MN700040、MH553128、KP416232),序列比對后,分別針對H7 和N9 片段使用Primer 5.0 軟件設(shè)計1對特異性引物和TaqMan 探針。引物和探針?biāo)蜕ど锕こ蹋ㄉ虾#┕煞萦邢薰竞铣伞?/p>
按照總RNA 提取試劑盒(柱提法)說明書要求提取第二代人感染IV-H7N9 核酸檢測試劑國家參考品中病毒總RNA,再使用超微量紫外分析儀,通過檢測樣本在260 nm 波長的吸光度來確定所提取RNA 濃度。以RNA 為模板,使用熒光PCR 儀進(jìn)行熒光定量RT-PCR 擴(kuò)增。反應(yīng)體系為25.0 μL:RNA 模板4.0 μL、引物及探針(F1、R1、P1、F2、R2、P2,均為10 μmol/L)各0.5 μL、dNTPs
表1 引物和探針
(10 mmol/L)1.4 μL、5×buffer 5.0 μL、Hot-startTaqpolymerase(2 U/μL)1.0 μL、MMLV Reverse Transcriptase(25 U/μL)1.0 μL、ddH2O 9.6 μL。反應(yīng)程序為:42 ℃,20 min;95 ℃,10 min;94 ℃,15 s,55 ℃,30 s(收集熒光),共40 個循環(huán)。
對第二代人感染IV-H7N9 核酸檢測試劑國家參考品中最低檢出限參考品按照產(chǎn)品說明書操作,加入0.5 mL 無RNA 酶去離子水復(fù)溶后(濃度為1.7×106copies/mL),分別用無RNA 酶去離子水進(jìn)行10-1~10-4(濃度為1.7×105~1.7×102copies/mL)4 個濃度梯度稀釋。用熒光RT-PCR 方法對待測樣品進(jìn)行檢測從而確定最低檢測限。
對第二代人感染IV-H7N9 核酸檢測試劑國家參考品中重復(fù)性參考品按照產(chǎn)品說明書操作,加入無RNA 酶去離子水稀釋100 倍后,利用建立的熒光RT-PCR 反應(yīng)體系重復(fù)檢測H7 和N9 核酸參考品10 次,記錄每次反應(yīng)結(jié)果并分析。
以第二代人感染IV-H7N9 核酸檢測試劑國家參考品作為陰性和陽性對照,參考品恢復(fù)至室溫后,按照產(chǎn)品說明書操作,將陰性、陽性參考品分別加入0.5 mL 無RNA 酶去離子水復(fù)溶,待液體完全澄清后作為待測樣品使用。陽性參考品用于敏感性檢測,陰性參考品用于特異性檢測;H1、H3、H5、H9 等核酸樣品,同樣用于特異性檢測。
采用IBM SPSS Statistics 21.0 軟件對重復(fù)性試驗中的變異系數(shù)(coefficient of variance,CV)進(jìn)行計算,CV ≤5%,表示差異具有統(tǒng)計學(xué)意義。
對4 個濃度梯度的最低檢出限參考品,以本試驗建立的熒光定量RT-PCR 方法分別對H7 和N9片段進(jìn)行檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)H7 和N9 核酸片段最低檢測限均為1.7×103copies/mL(圖1~2)。
圖1 H7 核酸片段最低檢測限結(jié)果
圖2 N9 核酸片段最低檢測限結(jié)果
為確認(rèn)所建立的熒光RT-PCR 方法能否穩(wěn)定檢出IV-H7N9,使用該方法分別重復(fù)檢測H7 和N9核酸參考品各10 次,檢測結(jié)果見圖3。經(jīng)計算,得出H7 和N9 核酸參考品CV 分別為0.25%和0.30%,二者均<1%(表2),提示該方法重復(fù)性良好。
表2 重復(fù)性試驗結(jié)果
圖3 H7 和N9 核酸參考品重復(fù)性試驗結(jié)果
利用第二代人感染IV-H7N9 核酸檢測試劑國家參考品作為陽性和陰性對照,檢測熒光定量RTPCR 方法的靈敏度。結(jié)果(圖4)顯示,與陽性對照相比,該方法檢測的10 個IV-H7N9 樣本全部為陽性,敏感性為100%(10/10)。
圖4 敏感性試驗結(jié)果
利用陰性參考品檢測該方法特異性的結(jié)果(圖5)顯示:與陽性對照相比,該方法檢測的20 個陰性參考品樣本全部為陰性,特異性為100%(20/20)。同時使用H1、H3、H5、H9 等核酸樣品進(jìn)行擴(kuò)增檢測的結(jié)果也均為陰性(圖6)。綜上,該方法具有良好的特異性。
圖5 陰性標(biāo)準(zhǔn)品特異性檢測結(jié)果
圖6 H1、H3、H5、H9 等亞型AIV 檢測結(jié)果
甲型IV 屬于正黏病毒科,是單股負(fù)鏈RNA病毒,含有8 個基因片段,其自然宿主主要是禽類。除蝙蝠流感病毒以外,水生禽類體內(nèi)都可檢測到血凝集素(hemagglutinin,HA)H1~16 和神經(jīng)酰胺酶(neuraminidase,NA)N1~9 亞型病毒。IV 從禽類傳染給哺乳類的情況時有發(fā)生,部分病毒能夠通過突變和重排在人群中形成傳播[8]。
2013 年首次報道人感染IV-H7N9,并引起了社會、學(xué)術(shù)界廣泛關(guān)注。測序分析[9]顯示,該病毒來源于野生鳥類,基因組發(fā)生了重排,其HA 片段來源于歐亞分支。盡管目前并沒有足夠流行病學(xué)證據(jù)表明IV-H7N9 可持續(xù)在人類中傳播,也不能完全排除局部發(fā)生人傳人現(xiàn)象[7]。據(jù)中國疾病預(yù)防控制中心官方網(wǎng)站相關(guān)信息,2017 年發(fā)現(xiàn)H7N9病毒變異株,其HA 片段存在插入性突變,具有高致病性,值得引起高度警惕[10]。因此,早期診斷、快速檢測IV-H7N9,及時更新病毒檢測方法對于該病源頭防控具有重要意義。
熒光定量RT-PCR 是在反應(yīng)體系中加入熒光基團(tuán)和熒光淬滅基團(tuán),隨著反應(yīng)進(jìn)行,擴(kuò)增產(chǎn)物不斷積累,熒光信號逐漸增強(qiáng),從而能夠利用較少樣本檢測出準(zhǔn)確量化結(jié)果,是對原有PCR 技術(shù)的一大變革[11-12]。多重實時熒光PCR,是在一個PCR 管中用多個熒光探針來區(qū)分多個擴(kuò)增子,具有檢測效率高、內(nèi)控效果好的技術(shù)優(yōu)點。本試驗使用這一技術(shù),設(shè)計針對H7 和N9 片段的特異性引物與探針,建立了能夠快速、高效檢測IV-H7N9 的熒光定量RT-PCR 方法。該方法特異性強(qiáng)、操作便捷,能夠為控制流感疫情爭取時間。在實際操作過程中,熒光RT-PCR 方法中TaqMan 探針對于整個反應(yīng)體系至關(guān)重要。探針的雜交效率較高,但熒光淬滅難以徹底,探針?biāo)庖蕾囉赥aq酶的外切活性,定量時易受酶活性和試劑質(zhì)量影響[13-15]。本研究通過使用國家第二代人感染IV-H7N9 核酸檢測試劑國家參考品以及H1、H3、H5、H9 等核酸樣品檢測,證實該檢測方法的敏感性、特異性均為100%。
另外,禽類養(yǎng)殖場環(huán)境復(fù)雜以及取樣過程不能保證標(biāo)準(zhǔn)化操作等原因都可能造成結(jié)果偏差。同時,檢測過程中混入雜質(zhì)、其他病毒基因片段以及操作過程不穩(wěn)定等,也可能造成結(jié)果誤讀。本研究重復(fù)10 次檢測,發(fā)現(xiàn)H7 和N9 核酸參考品CV 均小于1%,提示本方法重復(fù)性和穩(wěn)定性均較好。
綜上所述,本研究建立了一種熒光定量RTPCR 方法,能夠快速準(zhǔn)確、穩(wěn)定檢測IV-H7N9,具有高度的靈敏性和特異性。