李 靜 李艷紅 陸雪瑩 張志強(qiáng) 吳思雅
(1.新疆輕工職業(yè)技術(shù)學(xué)院食品與生物技術(shù)分院 新疆烏魯木齊 830021;2.新疆師范大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院 新疆烏魯木齊830054;3.中國科學(xué)院新疆理化技術(shù)研究所干旱區(qū)植物資源化學(xué)重點實驗室 新疆烏魯木齊 830011)
優(yōu)良品種是現(xiàn)代農(nóng)業(yè)生產(chǎn)的重要基礎(chǔ),小麥(Triticum aestivum L)作為世界上第一大糧食作物,是人類最主要的食物來源。轉(zhuǎn)基因大穗小麥?zhǔn)潜緦嶒炇也捎没ǚ酃芡ǖ婪▽⒋筚嚥菘侱NA導(dǎo)入受體春麥761后獲得的轉(zhuǎn)基因小麥新株系,其具有大穗、多粒、大粒、高蛋白、抗黃萎病等優(yōu)良變異[1]??娷?、王子霞等對大賴草、轉(zhuǎn)基因大穗小麥及春麥761進(jìn)行了RFLP、RAPD及SSR等一系列分析工作,從分子的角度證實了轉(zhuǎn)基因大穗小麥中確實引入了供體大賴草的基因[2-3]。由于轉(zhuǎn)基因大穗小麥?zhǔn)峭ㄟ^導(dǎo)入大賴草總DNA獲得的,其在獲得優(yōu)良變異性狀的同時,也引入了生長期延長、冬性化、分蘗數(shù)增加、株型分散等不利變異。為了去除不利變異基因,進(jìn)一步獲取優(yōu)良性狀基因片段,本文對轉(zhuǎn)基因大穗小麥中導(dǎo)入的外源性DNA片段進(jìn)行化學(xué)發(fā)光生物素探針標(biāo)記Southern雜交檢測分析,以期為后續(xù)小麥的遺傳育種提供參考。
轉(zhuǎn)基因大穗小麥和春麥761幼苗葉片(將其同條件種植后幼苗長至5 cm~8 cm時,剪取幼嫩葉片作為實驗材料);大賴草基因組總DNA為本實驗室保存。
1.2.1 基因組DNA的提取純化
(1)提取。將植物幼嫩葉片樣品分別加液氮依次磨碎,分別用CTAB法[4]抽提,經(jīng)兩次離心后,使用無水乙醇洗滌,真空抽干,在得到的DNA中加入2 mLl0 mmol/L的Tris·HCl(pH=8.0)充分溶解,于4 ℃保存。
(2)純化。第一次純化:向DNA溶液中加入RNA酶(RNase)(10 mg/mL),37 ℃保溫30 min,加蛋白酶K使終濃度為100 μg/mL,37 ℃保溫1 h,苯酚抽提兩次,氯仿抽提一次;上清液分別過Sepharose 2B柱(柱長22 cm,直徑2.4 cm),洗脫液為0.2 M NaCl、10 mmol/L Tris·HCl(pH=8.0),洗脫速度3 滴/min~4 滴/min,走紙6 cm/min,靈敏度2A;收集第一峰,乙醇沉淀,-20 ℃放置4 h以上,離心,真空抽干,10 mmol/L Tris·HCl溶解沉淀。第二次純化:由于第一次過柱后,RNA峰和DNA峰分界不明顯,認(rèn)為仍然混有RNA,故又加入RNase,再過柱。
1.2.2 基因組總DNA電泳檢測及紫外分光光度法定量測定
將提取的兩種樣品總DNA于1.2%Agarose、40 V電泳2 h[5],紫外燈下看條帶是否清晰。分別取30 μL兩種樣品總DNA稀釋至3 mL,蒸餾水對照,紫外分光光度計分別測OD260和OD280值。
1.2.3 化學(xué)發(fā)光生物素標(biāo)記Southern雜交檢測
(1)植物材料基因組總DNA的限制性雙酶切。
取滅菌0.5 mL離心管,按照表1中所列配制反應(yīng)液進(jìn)行酶切反應(yīng),總體積為30 μL。37 ℃水浴鍋中保育5 h,同時對作為對照的λDNA進(jìn)行37 ℃保育2 h,BamHⅠ和HindⅢ雙酶切。
表1 不同植物材料基因組總DNA限制性雙酶切反應(yīng)液配制量表
(2)酶切DNA的電泳分離及硝酸纖維素膜轉(zhuǎn)印。
酶切DNA的電泳分離:酶切后的DNA樣品與Marker一起進(jìn)行1.2%瓊脂糖凝膠電泳,紫外燈下觀察結(jié)果。
酶切片段的原位變性及硝酸纖維素膜轉(zhuǎn)?。鹤冃裕瑢⒛z上的雙鏈DNA片段經(jīng)過原位變性處理,使之成為單鏈;凝膠上的單鏈DNA片段經(jīng)毛細(xì)管的虹吸作用,轉(zhuǎn)移到硝酸纖維膜上,硝酸纖維膜真空80 ℃烘烤處理2 h固定,室溫保存。
(3)生物素標(biāo)記探針的制備。
對大賴草基因組DNA進(jìn)行BamHⅠ和HindⅢ的限制性雙酶切后,-20 ℃保存。探針的制備方法按照碧云天生物公司的《生物素隨機(jī)引物DNA標(biāo)記試劑盒操作說明書》,生物素標(biāo)記好的DNA探針于-20 ℃保存。
(4)印跡雜交并放射自顯影。
轉(zhuǎn)印完畢且固定好的硝酸纖維素膜與制備好的生物素標(biāo)記大賴草DNA探針進(jìn)行雜交,清洗干凈的雜交膜進(jìn)行化學(xué)發(fā)光自顯影檢測,雜交檢測生物素標(biāo)記核酸探針的方法參照碧云天生物公司的《化學(xué)發(fā)光法生物素標(biāo)記核酸檢測試劑盒操作說明書》進(jìn)行。
提取植物材料總DNA的目的是要進(jìn)行后續(xù)實驗,做限制性雙酶切、Southern雜交等,要求DNA純度較高,將雜蛋白、多糖、RNA有效去除。殘余的雜蛋白和多糖通過酚-氯仿進(jìn)行多次抽提,然后用乙醚除去酚,之后再加入蛋白酶K來去除。而RNA的去除,起初認(rèn)為過柱可以順利將其除去,但過柱后,如圖1所示,RNA峰和DNA峰分界不明顯,認(rèn)為溶液中仍然混有RNA,故又加入RNase,再次過柱后,如圖2所示,RNA去除得較干凈。
圖1 總DNA Sepharose2B柱層析洗脫曲線圖
圖2 RNA酶解后總DNA Sepharose2B柱層析洗脫曲線圖
總DNA電泳圖(如圖3)和紫外分光光度計定量測定結(jié)果(如表2)顯示,利用CTAB法提取再過柱純化得到的植物材料基因組總DNA的純度較高,濃度達(dá)到了預(yù)期的值,滿足限制性雙酶切及Southern雜交等后續(xù)實驗要求。
圖3 總DNA電泳圖
表2 總DNA的OD260和OD280值
對轉(zhuǎn)基因大穗小麥和春麥761進(jìn)行BamHⅠ和HindⅢ雙酶切,將酶切的總DNA進(jìn)行1.2%瓊脂糖凝膠電泳,電泳的目的是將酶切后得到的不同長度的片段在凝膠上依次分開,然后把凝膠上分開的DNA片段原位轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上。實驗對高純度的植物材料基因組總DNA和作為對照的λDNA進(jìn)行BamHⅠ和HindⅢ雙酶切后,電泳結(jié)果如圖4所示,得到了長度合適的在凝膠上依次分開的DNA片段,為后續(xù)成功地將雙酶切的DNA片段轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上打下良好的基礎(chǔ)。
對轉(zhuǎn)基因大穗小麥和春麥761進(jìn)行BamHⅠ和HindⅢ雙酶切,將酶切的總DNA進(jìn)行1.2%瓊脂糖凝膠電泳,電泳的目的是將酶切后得到的不同長度的片段在凝膠上依次分開,然后把凝膠上分開的DNA片段原位轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上。實驗對高純度的植物材料基因組總DNA和作為對照的λDNA進(jìn)行BamHⅠ和HindⅢ雙酶切后,電泳結(jié)果如圖4所示,得到了長度合適的在凝膠上依次分開的DNA片段,為后續(xù)成功地將雙酶切的DNA片段轉(zhuǎn)移到硝酸纖維素膜上打下良好的基礎(chǔ)。
圖4 總DNA雙酶切電泳圖
化學(xué)發(fā)光Southern雜交檢測自顯影后的X光膠片如圖5所示,由圖可知,雜交條帶位于第四條泳道上,即轉(zhuǎn)基因大穗小麥所在的泳道上,且只有唯一一條,而春麥761泳道上沒有,經(jīng)過和轉(zhuǎn)膜前瓊脂糖凝膠上的條帶位置及Marker比對,條帶大小約在750 bp~1 000 bp。
圖5 Southern雜交化學(xué)發(fā)光自顯影圖
20世紀(jì)90年代,花粉管通道法被廣泛應(yīng)用于轉(zhuǎn)基因小麥的研究中[6]。本實驗室采用與小麥同亞族的且具有多種小麥不具有的優(yōu)良性狀的大賴草總DNA對春麥761進(jìn)行轉(zhuǎn)化,獲得了一系列的轉(zhuǎn)基因新品系。分析研究轉(zhuǎn)基因大穗小麥中大穗相關(guān)的功能基因?qū)π←溒焚|(zhì)育種具有重要意義[7]。本研究利用化學(xué)發(fā)光生物素標(biāo)記大賴草總DNA探針對轉(zhuǎn)基因大穗小麥和受體春麥761基因組DNA進(jìn)行了Southern印跡雜交,產(chǎn)生了轉(zhuǎn)基因大穗小麥和大賴草共有的而春麥761中沒有的特異性DNA條帶,實驗結(jié)果顯示該DNA片段長度約在750 bp~1 000 bp,推測它是大賴草總DNA導(dǎo)入受體春麥761之后在轉(zhuǎn)基因大穗小麥中留下的DNA片段,即此片段來自大賴草基因組,為后續(xù)獲取并研究該特異性外源DNA片段奠定了基礎(chǔ)。