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從德爾塔到拉姆達(dá),揭開病毒變種的面紗

2021-09-21 02:59陳一竹
人人健康 2021年17期
關(guān)鍵詞:三角瓶德爾塔變種

曾經(jīng),如果讓研究人員預(yù)測哪一種新冠變異毒株會(huì)造成嚴(yán)峻后果,他們的首個(gè)猜測對象決不會(huì)是德爾塔(Delta)變異株。但該變種自2020年12月首次在印度出現(xiàn)以來,這種高傳染性的變異株已成為新冠病毒的主要流行毒株。要知道,近期美國新冠肺炎病例中的90%以上均是感染了這種毒株。相較于早期的毒株,德爾塔具有更加強(qiáng)大的進(jìn)化優(yōu)勢。

美國匹茲堡大學(xué)(University of Pittsburgh)的進(jìn)化生物學(xué)家沃恩·庫珀(Vaughn Cooper)對此表示:“德爾塔的增長速度在這次的新冠大流行中是絕無僅有的。”

當(dāng)?shù)聽査局瓿掷m(xù)在全球不斷造成感染的時(shí)候,又一種新興的拉姆達(dá)毒株走向臺前。許多人不經(jīng)發(fā)出感慨:這樣的日子何時(shí)是個(gè)頭?病毒是否會(huì)無休止地突變?下面,就讓我們來揭開病毒變種的神秘面紗,為何病毒會(huì)產(chǎn)生突變?它們又會(huì)帶來什么樣的影響呢?

理查德的三角瓶——認(rèn)識微生物突變能力

1988年,為了理解進(jìn)化的機(jī)制,31歲的生物學(xué)家理查德·倫斯基(Richard Lenski)在美國加州做了一項(xiàng)著名的實(shí)驗(yàn)。他想知道,為了提高自身的屬性,微生物的進(jìn)化能有多快?又會(huì)多有效?

他將常見的大腸桿菌分裝到12個(gè)不同的三角瓶里,每個(gè)三角瓶里都有同樣的培養(yǎng)液,并且都置于37度的環(huán)境下進(jìn)行培養(yǎng)。每日,理查德都會(huì)從三角瓶里提取一些經(jīng)過復(fù)制的細(xì)菌,放到新的三角瓶里。此外,他還不斷儲(chǔ)存細(xì)菌樣本,以便用于后續(xù)研究。

每天,三角瓶里的大腸桿菌都會(huì)產(chǎn)生六代全新的大腸桿菌。如果清晨的大腸桿菌還是剛出生的嬰兒,那么在一天將盡時(shí),它們已然成為了曾曾曾祖輩。理查德和他的團(tuán)隊(duì)一研究就是33年,收獲了7萬多代不同的大腸桿菌。與最初放入三角瓶的大腸桿菌相比,最新生成的大腸桿菌復(fù)制速度增長了70%。但即便不同的大腸桿菌群體學(xué)會(huì)使用不同的生物學(xué)通路來提升自己的屬性,但在七萬代后,它們看似達(dá)到了極限,大部分新生成的大腸桿菌群體之間,復(fù)制速度只差幾個(gè)百分點(diǎn),非常接近。

理查德因?yàn)檫@項(xiàng)研究榮獲“麥克阿瑟天才獎(jiǎng)”,他的發(fā)現(xiàn)也徹底改變了人們對微生物突變能力的認(rèn)知。該研究的3個(gè)重要發(fā)現(xiàn),對于今日的我們依舊有重要的啟發(fā)。

首先,隨著時(shí)間的不斷推進(jìn),突變產(chǎn)生的效益會(huì)逐漸減少——大部分會(huì)給細(xì)菌帶來生存優(yōu)勢的突變,都在較早期發(fā)生。

第二,細(xì)菌將永遠(yuǎn)不會(huì)停下進(jìn)化的腳步。即便是在七萬代后,它們也在發(fā)生突變,追求更加完美的自己。盡管,這一進(jìn)化的速度在后期可能已經(jīng)大幅變緩?!拔以脒^它們會(huì)停止進(jìn)化,”理查德說道,“但看起來,對自身的修補(bǔ)存在無限種可能。如果真的有進(jìn)化的極限的話,在實(shí)驗(yàn)周期里,我們是不可能看到的。即便是在地質(zhì)學(xué)上的時(shí)間尺度,我們可能也看不到?!?/p>

第三個(gè)重要發(fā)現(xiàn)更是關(guān)鍵。2003年,理查德來到實(shí)驗(yàn)室,發(fā)現(xiàn)一個(gè)三角瓶里的培養(yǎng)液變得十分渾濁,這表明細(xì)菌出現(xiàn)了爆發(fā)式增長。在通常情況下,細(xì)菌絕不應(yīng)該增長得如此之快。

經(jīng)過研究,理查德發(fā)現(xiàn)這批大腸桿菌進(jìn)化出了一種特殊的能力——普通大腸桿菌只能消化葡萄糖,而這批大腸桿菌卻習(xí)得了如何將檸檬酸鹽作為額外的能量來源。這種突變極其罕見,在30多年的研究期間,從未有另一種大腸桿菌能重復(fù)這種突變。

“為什么這樣罕見的突變可以發(fā)生,而再也沒有重現(xiàn)?”理查德說道,“一種可能性是這種突變本身很罕見,僅在整個(gè)實(shí)驗(yàn)周期里出現(xiàn)一次。但另一種可能是,也許大腸桿菌先需要一系列其它變化,建立一個(gè)特殊的遺傳背景,然后一個(gè)普通的突變就能帶來全新的功能?!崩聿榈抡J(rèn)為他觀察到的也許是兩者的結(jié)合,大腸桿菌先需要積累特定的突變,再出現(xiàn)一個(gè)罕見而關(guān)鍵的新突變,讓整個(gè)種群的能力產(chǎn)生飛躍。

羅伯托的預(yù)言

阿爾法變種、貝塔變種、伽馬變種、德爾塔變種、拉姆達(dá)變種……每隔一段時(shí)間,新冠病毒就會(huì)積累出關(guān)鍵的突變,產(chǎn)生新的變種。新冠病毒的進(jìn)化極限在哪里?它們未來又會(huì)出現(xiàn)哪些變化?

羅伯托·博里奧尼(Roberto Burioni)是世界知名病毒學(xué)家。他曾設(shè)想過新冠病毒的終極版本——一種具有最大化的傳播力,在全球占據(jù)統(tǒng)治地位,其它變種在它面前不值一提,僅在局部地區(qū)存在有限的影響力的毒株。

這種具有統(tǒng)治性的新冠變種,存在3種不同的可能性。第一種可能性對人類來說最為樂觀——病毒再如何進(jìn)化,也無法讓疫苗徹底失效。就如現(xiàn)存的許多可控傳染性疾病一樣,類似麻疹、脊髓灰質(zhì)炎、天花等病毒,就在疫苗的控制范圍內(nèi)。

在羅伯特提出的第二種可能性里,新冠變種會(huì)對疫苗帶來的免疫力產(chǎn)生“部分逃逸”。但這種免疫逃逸需要病毒付出一定的代價(jià)。比如貝塔與伽馬變種病毒,都具有一定程度的免疫逃逸,但它們的傳播力都不如阿爾法或是德爾塔變種。

在20世紀(jì)90年代,HIV病毒曾面臨著相同的命運(yùn)。當(dāng)時(shí),一種叫作M184V的突變使其對抗病毒藥物拉米夫定(lamivudine)產(chǎn)生了耐受性。表面上看,這是抗艾戰(zhàn)場上的一項(xiàng)倒退。然而醫(yī)生們卻發(fā)現(xiàn),帶有M184V突變的感染者,體內(nèi)的病毒載量更低,表明這一突變“殺敵一千,自損八百”,自身的復(fù)制效率也有所降低。因此在耐藥病毒株出現(xiàn)后,患者們依舊會(huì)服用拉米夫定。在某種意義上,人們選擇了M184V變種,以降低病毒的復(fù)制率。

最令人擔(dān)憂的就是羅伯特預(yù)言的第三種可能——病毒積累的突變最終突破了免疫屏障,且自身的傳染性或毒性沒有受到明顯影響。不過,這也意味著新冠病毒還需要經(jīng)歷一次進(jìn)化飛躍,我們都知道這種飛躍發(fā)生的可能性非常低。

一些科學(xué)家們認(rèn)為,如果又要保持免疫逃逸功能,又要維持傳染力,新冠病毒會(huì)受到生物學(xué)上的諸多限制。比如為了降低中和抗體的結(jié)合能力,新冠病毒的刺突蛋白結(jié)構(gòu)會(huì)發(fā)生改變,而這可能會(huì)影響病毒結(jié)合人類細(xì)胞受體的能力。

“這當(dāng)然會(huì)有限制,”美國加州斯克里普斯研究所的傳染病專家克里斯汀·安德森(Kristian Andersen)博士說道:“但我們不知道具體的限制在哪里。根本性的問題在于,病毒對這些突變的耐受性有多高。如果刺突蛋白出現(xiàn)了大量突變,這些刺突蛋白是否還能行使功能,協(xié)助病毒進(jìn)入細(xì)胞?”

從某些方面看,結(jié)論也許并不樂觀。冠狀病毒一直以來就可以結(jié)合許多不同動(dòng)物的ACE-2受體。一項(xiàng)近期的研究也支持了這樣的擔(dān)憂。

為了了解刺突蛋白的突變會(huì)如何影響其與ACE-2受體的結(jié)合能力,一支團(tuán)隊(duì)對刺突蛋白的受體結(jié)合域的每一個(gè)氨基酸進(jìn)行了突變,觀察其對刺突蛋白功能的影響。

結(jié)果表明新冠病毒的刺突蛋白上,有大把可以耐受的位點(diǎn),使其出現(xiàn)免疫逃逸的同時(shí),維持對細(xì)胞的入侵能力。

精密復(fù)雜的免疫系統(tǒng),抵御微生物入侵

雖然文章前面提到了許多病毒發(fā)展的可能性,但未來或許并沒有想象中的那么悲觀。要知道,人類的免疫系統(tǒng)是相當(dāng)復(fù)雜而又精密的,在數(shù)千年間成功抵御過無數(shù)微生物的入侵。

2009年,H1N1流感大流行仿若眼前。當(dāng)時(shí),研究人員觀察到了一個(gè)奇怪的現(xiàn)象:相比老年人,它對于年輕人來說,危害好像更大。全球范圍內(nèi),每5名因?yàn)镠1N1去世的感染者中,就有4名的年齡在65周歲以下。相比之下,通常的流感死亡病例中,70%到90%都是老年人。

部分人認(rèn)為,這些在H1N1流感中不大受影響的老年人,在幾十年前可能曾遇到過類似的病毒株,這意味著,他們的免疫系統(tǒng)經(jīng)受過“提前訓(xùn)練”。在遇到H1N1時(shí),免疫系統(tǒng)還記得幾十年前的戰(zhàn)斗經(jīng)驗(yàn),因此可以抗擊該類毒株。

不管新冠病毒發(fā)生何種突變,它們本質(zhì)上還是新冠病毒。目前的研究發(fā)現(xiàn),無論是曾感染新冠的個(gè)體還是接種疫苗的個(gè)體,體內(nèi)的抗體都能對多種冠狀病毒產(chǎn)生抵抗力,這甚至包括了2003年出現(xiàn)的SARS冠狀病毒。

“這兩種病毒在進(jìn)化上的距離很遠(yuǎn),”進(jìn)化生物學(xué)家泰勒·斯塔(Tyler Starr)博士說道:“同一種病毒能結(jié)合新冠病毒和SARS病毒,能給我們帶來一定的信心?!彼顾┦肯氡磉_(dá)的是,如果連不那么相像的SARS病毒都能抑制,更何況是長相非常接近的新冠變種呢?

事實(shí)上,我們的身體在疫苗接種后,產(chǎn)生的是多克隆抗體。它不是一種,而是一大群不同的抗體。當(dāng)其中一些抗體在新冠變種面前失效,我們總可以期望另外一些抗體能夠發(fā)揮功效。想要徹底對免疫系統(tǒng)發(fā)生逃逸,是一件不大可能發(fā)生的事情。

而且,中和抗體并不是抵抗力的全部。一些科學(xué)家指出,目前許多研究都提到中和抗體,只是因?yàn)槿魏我婚g實(shí)驗(yàn)室都能做相關(guān)的實(shí)驗(yàn)。

在疫苗的作用下,我們的身體還會(huì)產(chǎn)生記憶B細(xì)胞,記住先前遇到過的病原體,在再次遇見時(shí)會(huì)作出快速反應(yīng)。

而T細(xì)胞則會(huì)追蹤和清除那些被感染的細(xì)胞——即便新冠變種會(huì)發(fā)生免疫逃逸,感染細(xì)胞,這些感染的細(xì)胞也很難逃脫T細(xì)胞的清理。在這一點(diǎn)上,新冠病毒再怎么突變也幾乎無濟(jì)于事。

這也就解釋了為何接種疫苗的人還是可能會(huì)感染新冠病毒,但他們出現(xiàn)重癥或死亡的概率很低。斯塔博士提到,隨著時(shí)間推移,感染最終只會(huì)造成輕癥,或是無癥狀。盡管他不清楚這會(huì)需要多久。

疫苗會(huì)失效嗎?

此外,我們還必須考慮免疫力能持續(xù)多久。針對新冠病毒,免疫力能持續(xù)5年以上嗎?對于爆發(fā)只有一年多的全新病毒,沒有人知道答案。我們只知道感染SARS病毒的一些個(gè)體,在近20年后,體內(nèi)的T細(xì)胞還能識別SARS病毒。

許多人都在關(guān)心,新的新冠變種是否使得疫苗失效了。美國紐約大學(xué)朗格尼醫(yī)學(xué)中心(New York University's Langone Medical Center)的微生物學(xué)家納撒尼爾·蘭道(Nathaniel Landau)認(rèn)為,我們有著相對簡單的對抗德爾塔的方法,即對疫苗稍加改進(jìn),以使其更有效地對抗這種變體?!叭绻_實(shí)出現(xiàn)了一種具有比當(dāng)前更易逃脫抗體的變異毒株,那就真的需要針對該毒株注射疫苗加強(qiáng)針了?!?/p>

不過在此期間,現(xiàn)有的疫苗仍然是防止出現(xiàn)新變異的最佳方法。美國埃默里大學(xué)(Emory University)的病毒學(xué)家梅胡爾·蘇塔爾(Mehul Suthar)表示:“顯而易見,在這些病毒存在的情況下,并不是說我們戰(zhàn)勝了德爾塔,就戰(zhàn)勝了新冠大流行,還將有其他的變異毒株不斷涌現(xiàn)。”

蘇塔爾還補(bǔ)充道,如果接種疫苗的人數(shù)過少、病毒的傳播無法加以控制,“那就將會(huì)出現(xiàn)感染、變異和傳播的無限循環(huán)。”

關(guān)于未來

與理查德的實(shí)驗(yàn)不同,疫苗是三角瓶與新冠疫情之間的根本性區(qū)別。在理查德的三角瓶里,條件是一成不變的。但在真實(shí)世界中,我們正用盡全力來改變疫情。而疫苗在全球的生產(chǎn)與分配不均,則讓問題變得相當(dāng)復(fù)雜——時(shí)至今日,世界上只有約四分之一的人口完整接種了疫苗。

因此,未來新冠變種究竟會(huì)造成怎樣的影響,很大程度上取決于身在何時(shí),又身處何地。對于已經(jīng)接種了疫苗的個(gè)體,所需擔(dān)心的或許是變種的免疫逃逸能力。但要知道,世界上還有數(shù)十億人沒有接種過疫苗,他們更需要擔(dān)心傳染性增強(qiáng)的問題??梢韵胂?,在未來的一段時(shí)間里,全世界的不同地區(qū),會(huì)有不同的新冠變種,代表著不同的預(yù)言場景。

在理查德的三角瓶里,大腸桿菌在足夠長的時(shí)間里、穩(wěn)定的環(huán)境下出現(xiàn)了進(jìn)化飛躍。與理查德的實(shí)驗(yàn)不同的是,新冠病毒培養(yǎng)的條件并不是在三角瓶中,而是在數(shù)千萬,乃至數(shù)億的人類群體中。因此,人類不會(huì)給它這樣的機(jī)會(huì)。

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