国产日韩欧美一区二区三区三州_亚洲少妇熟女av_久久久久亚洲av国产精品_波多野结衣网站一区二区_亚洲欧美色片在线91_国产亚洲精品精品国产优播av_日本一区二区三区波多野结衣 _久久国产av不卡

?

MiR-671-5p通過負(fù)向調(diào)控SMAD抑制骨肉瘤細(xì)胞的遷移和侵襲

2021-11-10 16:24胡雅瓊陳新璐李洪利尹崇高
關(guān)鍵詞:質(zhì)粒通路數(shù)據(jù)庫(kù)

胡雅瓊,梁 答,陳新璐,陳 琳,白 俊,李洪利,尹崇高,鐘 偉

濰坊醫(yī)學(xué)院1病理學(xué)教研室,2附屬醫(yī)院關(guān)節(jié)外一科//矯形骨科,3醫(yī)學(xué)研究實(shí)驗(yàn)中心,4護(hù)理學(xué)院,山東 濰坊261053

骨肉瘤是最常見于兒童和青少年患者的骨腫瘤,其特征是治療后轉(zhuǎn)移進(jìn)展和復(fù)發(fā)的高風(fēng)險(xiǎn)[1]。由于患者的生存率較低,這種疾病有效的治療管理仍然是難以捉摸的[2]。為了實(shí)現(xiàn)更有效的治療管理方案,從而提高患者的生存率,在臨床環(huán)境中為骨肉瘤的治療確定更有針對(duì)性的治療方法至關(guān)重要[3]。

miRNA是小的內(nèi)源RNA,可在轉(zhuǎn)錄后調(diào)控基因表達(dá),在各種細(xì)胞和生理過程(例如細(xì)胞增殖和分化)中發(fā)揮重要作用[4-6]。據(jù)報(bào)道它們的異常表達(dá)與各種人類腫瘤的進(jìn)展和轉(zhuǎn)移密切相關(guān),有關(guān)的功能研究已被證實(shí)[7,8],miRNA充當(dāng)腫瘤抑制物或癌基因,并且針對(duì)miRNA的miRNA模擬物和分子已在臨床前開發(fā)中顯示出希望[9]。前期已有研究證明miR-671-5p能夠結(jié)合相關(guān)靶蛋白從而影響腫瘤的發(fā)生發(fā)展,能夠通過抑制成纖維生長(zhǎng)因子受體2阻斷人食道鱗狀細(xì)胞癌的進(jìn)展[10]。MiR-671-5p的過表達(dá)能夠影響結(jié)腸癌的預(yù)后,并會(huì)加速結(jié)腸癌細(xì)胞的增殖,遷移和侵襲[11]。另外,MiR-671-5p也能夠通過結(jié)合釉叢蛋白1在抑制骨肉瘤細(xì)胞生長(zhǎng)、遷移和侵襲中發(fā)揮關(guān)鍵作用[12]。但是,miR-671-5p影響骨肉瘤發(fā)展進(jìn)程的其他分子機(jī)制尚不明確。

在本研究中,我們研究了miR-671-5p在骨肉瘤中的作用,并探討了miR-671-5p與其下游靶基因SMAD3在體外的相互作用,結(jié)果表明,miR-671-5p通過結(jié)合其下游靶基因SMAD3影響骨肉瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力。

1 材料和方法

1.1 主要儀器和試劑

Lipofectamine 2000(Invitrogen),miR-671-5p上下游引物(上海生工生物工程有限公司),β-actin(ab8226)、SMAD3(ab40854)、Vimentin(ab92547)、N-cadherin(ab76001)抗體(Abcam)。

1.2 網(wǎng)上在線數(shù)據(jù)庫(kù)

NCBI在線數(shù)據(jù)庫(kù)(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/)中GSE28423 數(shù)據(jù)集篩選骨肉瘤細(xì)胞中差異表達(dá)的miRNAs,GSE70414數(shù)據(jù)集對(duì)骨肉瘤細(xì)胞中l(wèi)og2FC>1,P<0.05 的mRNA 進(jìn)行篩選;starbase 數(shù)據(jù)庫(kù)(http://starbase.sysu.edu.cn/)、miRDB數(shù)據(jù)庫(kù)(http://mirdb.org/)、TargetScan數(shù)據(jù)庫(kù)(http://www.targetscan.org/vert_72/)預(yù)測(cè)可能與miR-671-5p結(jié)合的hub基因。

1.3 細(xì)胞培養(yǎng)和轉(zhuǎn)染

人成骨細(xì)胞hFOB1.19,骨肉瘤細(xì)胞MG63、U2OS、Saos-2,人胚胎腎細(xì)胞HEK293T均購(gòu)自美國(guó)模式培養(yǎng)物保藏所(ATCC),并按照其培養(yǎng)條件進(jìn)行培養(yǎng)。培養(yǎng)24 h,并在細(xì)胞達(dá)到0.70時(shí)通過Lipofectamine 2000將質(zhì)粒轉(zhuǎn)入細(xì)胞中。細(xì)胞分組為:con(轉(zhuǎn)染過表達(dá)miR-671-5p對(duì)照質(zhì)粒的骨肉瘤細(xì)胞);miR-671-5p(轉(zhuǎn)染過表達(dá)miR-671-5p質(zhì)粒的骨肉瘤細(xì)胞);NC(轉(zhuǎn)染過表達(dá)SMAD3對(duì)照質(zhì)粒的骨肉瘤細(xì)胞);SMAD3(轉(zhuǎn)染過表達(dá)SMAD3質(zhì)粒的骨肉瘤細(xì)胞);SMAD3+miR-671-5p(共轉(zhuǎn)染過表達(dá)SMAD3和過表達(dá)miR-671-5p質(zhì)粒的骨肉瘤細(xì)胞)。

1.4 qRT-PCR

TRIzol 提取各組細(xì)胞的總RNA,ReverTra AceRQpcr RT Kit試劑盒逆轉(zhuǎn)錄獲得cDNA,以cDNA為模板,U6為內(nèi)參,運(yùn)行條件為95 ℃30 s、95 ℃5 s、65 ℃30 s、72 ℃30 s、循環(huán)數(shù)為35,PCR 檢測(cè)細(xì)胞中miR-671-5p的表達(dá)情況。2-△△CT計(jì)算結(jié)果。miR-671-5p上游引物為:GCGCGCATAAAGTAGAAAGC;下游引物為:AGTGCAGGGTCCGAGGTATT;莖環(huán)結(jié)構(gòu):GTCGTATCCAGTGCAGGGTCCGAGGTATTCGCA CTGGATACGACAGTAGT

1.5 Transwell實(shí)驗(yàn)

將4×104具有不同miR-671-5p或SMAD3表達(dá)水平的骨肉瘤細(xì)胞分別接種在無(wú)FBS的MEM培養(yǎng)基中,并置于小室或鋪有Matrigel小室的上腔室中。然后,下腔注入10% FBS的MEM培養(yǎng)基。24 h后甲醇固定15 min,輕拭上室的細(xì)胞,Giemsa染色1 h,PBS清洗,吸棄PBS晾干后進(jìn)行拍照。鏡下隨機(jī)選擇5個(gè)視野拍照,取其平均值作為最終結(jié)果。

1.6 Western blot

提取各組細(xì)胞的總蛋白,測(cè)量蛋白質(zhì)濃度,在10%SDS-PAGE凝膠上分離并轉(zhuǎn)移到PVDF膜上,封閉,一抗4 ℃過夜,洗膜,二抗常溫孵育1 h,洗膜,顯影,曝光,分析灰度值,計(jì)算結(jié)果??贵w配制如下:SMAD3(1∶500),Vimentin(1∶1000),N-cadherin(1∶500),β-actin(1∶1000)作為內(nèi)參。

1.7 熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)

HEK293T細(xì)胞接種到24孔板中,并在細(xì)胞數(shù)量達(dá)到0.70時(shí)利用Lipofectamine 2000將miR-671-5p過表達(dá)質(zhì)粒及對(duì)照質(zhì)粒、SMAD3野生型SMAD3-3’UTRWt及突變型SMAD3-3’UTR-Mut質(zhì)粒共轉(zhuǎn)染。培養(yǎng)24 h后,檢測(cè)各組細(xì)胞的熒光素酶活性,分析相對(duì)熒光強(qiáng)度,計(jì)算結(jié)果。

1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

實(shí)驗(yàn)重復(fù)3次,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)表示為均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差,使用SPSS 17.0軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,兩組之間差異分析采用獨(dú)立樣本t檢驗(yàn),多樣本均數(shù)之間的比較采用方差分析,P<0.05被認(rèn)為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 MiR-671-5p在骨肉瘤組織和細(xì)胞中表達(dá)下調(diào)

通過NCBI在線數(shù)據(jù)庫(kù)獲得數(shù)據(jù)集GSE28423,篩選出|log2FC|>4 的miRNAs 并制作熱圖(圖1A),GSE28423數(shù)據(jù)集發(fā)現(xiàn)miR-671-5p的log2FC=-4.80、P<0.05,在骨肉瘤細(xì)胞中可能發(fā)揮抑癌基因的作用。通過qRT-PCR發(fā)現(xiàn)在10例骨肉瘤組織中,與癌旁正常骨組織相比,骨肉瘤組織中miR-671-5p的表達(dá)明顯降低(圖1B)。因此,我們選擇miR-671-5p作為研究對(duì)象。qRTPCR結(jié)果顯示與人成骨細(xì)胞hFOB1.19相比,在骨肉瘤細(xì)胞中miR-671-5p 的表達(dá)明顯下調(diào)(圖1C)。MiR-671-5p主要參與的前10位KEGG通路,包括Wnt信號(hào)通路、癌癥通路、細(xì)胞周期等,這些通路在癌癥中都發(fā)揮著至關(guān)重要的作用,因此我們可以推測(cè)miR-671-5p也許參與相關(guān)通路的調(diào)控從而影響骨肉瘤的發(fā)展進(jìn)程(圖1D)。

圖1 MiR-671-5p在骨肉瘤組織和細(xì)胞中表達(dá)下調(diào)Fig.1 MiR-671-5p expression is down-regulated in osteosarcoma tissues and cells.A:Heatmap of the differentially expressed miRNAs with |log2FC| >4 in the GSE28423;B:Expression of miR-671-5p in 10 patients with osteosarcoma (*P<0.05).C:Expression of miR-671-5p in osteosarcoma cells (*P<0.05 vs hFOB1.19 group).D:KEGG analyses of miR-671-5p.

2.2 MiR-671-5p抑制骨肉瘤細(xì)胞的遷移和侵襲

將miR-671-5p過表達(dá)質(zhì)粒和對(duì)照質(zhì)粒轉(zhuǎn)染入骨肉瘤細(xì)胞,qRT-PCR結(jié)果顯示與對(duì)照組相比,過表達(dá)miR-671-5p組中miR-671-5p表達(dá)(MG63:P<0.0001;Saos-2:P=0.0002)明顯上調(diào)(圖2A)。Transwell遷移實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),與對(duì)照組相比,過表達(dá)miR-671-5p組穿膜細(xì)胞數(shù)(MG63:P=0.0017;Saos-2:P=0.0014)明顯減少(圖2B)。而Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,過表達(dá)miR-671-5p 組穿膜細(xì)胞數(shù)(MG63:P=0.0124;Saos-2:P<0.0001)明顯降低(圖2C)。

圖2 MiR-671-5p對(duì)骨肉瘤細(xì)胞遷移和侵襲能力的影響Fig.2 Effect of miR-671-5p overexpression on migration and invasion of osteosarcoma cells.A:Expression of miR-671-5p in different groups after transfection.B,C:Transwell assay for examining cell invasion and migration abilities in each group(scale bar=100 μm).*P<0.05.

2.3 MiR-671-5p抑制骨肉瘤細(xì)胞的EMT的發(fā)生

Western blot 結(jié)果顯示,與對(duì)照組相比,過表達(dá)miR-671-5p 組中Vimentin(MG63:P=0.0054;Saos-2:P=0.003)和N-cadherin(MG63:P=0.0138;Saos-2:P=0.0244)的表達(dá)明顯降低(圖3)。

圖3 Western blot檢測(cè)miR-671-5p對(duì)骨肉瘤細(xì)胞EMT的影響Fig.3 Western blotting for detecting expressions of EMT-related proteins in osteosarcoma cells overexpressing miR-671-5p.

2.4 SMAD3為miR-671-5p的關(guān)鍵基因

網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫(kù)starbase、miRDB、TargetScan預(yù)測(cè)可能與miR-671-5p結(jié)合的靶蛋白取其交集并獲取hub基因,構(gòu)建degree 得分前10 位的蛋白互作網(wǎng)絡(luò)關(guān)系圖(圖4A),將網(wǎng)上數(shù)據(jù)庫(kù)預(yù)測(cè)的hub 基因與骨肉瘤數(shù)據(jù)集GSE70414 中l(wèi)og2FC>1,P<0.05 的mRNA 取交集(圖4B),發(fā)現(xiàn)SMAD3既在骨肉瘤中表達(dá)上調(diào),又與miR-671-5p 結(jié)合。Western blot 檢測(cè)在骨肉瘤細(xì)胞中SMAD3的表達(dá)情況,發(fā)現(xiàn)與人成骨細(xì)胞hFOB1.19相比,SMAD3在骨肉瘤細(xì)胞中表達(dá)明顯上調(diào)(圖4C)。熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)結(jié)果顯示,與con/Wt-SMAD3-3’UTR組相比,miR-671-5p/Wt-SMAD3-3’UTR組的相對(duì)熒光活性明顯降低,而con/Mut-SMAD3-3’UTR組與miR-671-5p/Mut-SMAD3-3’UTR 組則無(wú)明顯差異(圖4D)。

圖4 SMAD3為miR-671-5p的關(guān)鍵基因Fig.4 SMAD3 is a key gene for miR-671-5p.A:Protein interaction network of the top10 target genes associated with miR-671-5p;B:Venn diagram of the hub genes and GSE70414.C:Expression of SMAD3 in osteosarcoma cells (*P<0.05 vs hFOB1.19 group).D:Relative luciferase activity in different groups measured by luciferase report experiment.*P<0.05.

2.5 MiR-671-5p調(diào)控SMAD3抑制骨肉瘤細(xì)胞的遷移和侵襲

通過Western blot發(fā)現(xiàn),與NC組相比,SMAD3組SMAD3 的表達(dá)(MG63:P=0.0006;Saos-2:P=0.0009)明顯升高,而SMAD3+miR-671-5p組SMAD3的表達(dá)(MG63:P=0.0008;Saos-2:P=0.0018)則少于SMAD3組(圖5A)。Transwell 遷移實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),與NC 組相比,SMAD3 組穿膜細(xì)胞數(shù)(MG63:P=0.0006;Saos-2:P=0.0003)明顯升高,而SMAD3+miR-671-5p組的穿膜細(xì)胞 數(shù)(MG63:P=0.0018;Saos-2:P=0.0014)則少于SMAD3組(圖5B)。Transwell侵襲實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn),與NC組相比,SMAD3組穿膜細(xì)胞數(shù)(MG63:P=0.0003;Saos-2:P=0.0003)明顯升高,而SMAD3+miR-671-5p組的穿膜細(xì)胞數(shù)(MG63:P=0.0003;Saos-2:P=0.0034)則少于SMAD3組。

圖5 MiR-671-5p調(diào)控SMAD3抑制骨肉瘤細(xì)胞的遷移和侵襲Fig.5 MiR-671-5p targets SMAD3 to inhibit the invasion and metastasis of osteosarcoma cells.A:Expression of SMAD3 in osteosarcoma cells in different groups.B:Transwell assay for examining migration and invasion abilities of cells transfected with the plasmids for overexpression of SMAD3,miR-671-5p,or both.scale bar=100 μm,*P<0.05.

3 討論

骨肉瘤的診療現(xiàn)在大多基于標(biāo)準(zhǔn)的選擇診療法,包括積極的手術(shù)切除、全身化療和靶向放療[13]。本文致力于找到新的腫瘤標(biāo)志物和靶點(diǎn)治療,從而降低骨肉瘤的發(fā)展。目前有報(bào)道闡明,miRNA與骨肉瘤的化療敏感性和耐藥性有著密切相關(guān)性[14,15]。也有報(bào)道稱miRNA可能參與骨肉瘤的抗輻射并能夠降低放療的敏感性從而對(duì)其今后的治療起著非常重要的作用[16]。因此,探索miRNA的分子機(jī)制,找到新的腫瘤標(biāo)志物和靶點(diǎn)治療對(duì)降低骨肉瘤的耐化學(xué)性,提高其對(duì)化療和放療的敏感性尤為重要。本文正是以此為切入點(diǎn),通過NCBI在線數(shù)據(jù)庫(kù)篩選出在骨肉瘤中相對(duì)表達(dá)下調(diào)的miR-671-5p作為研究對(duì)象。我們通過質(zhì)粒轉(zhuǎn)染,過表達(dá)miR-671-5p后,發(fā)現(xiàn)骨肉瘤細(xì)胞的遷移和侵襲能力降低,證實(shí)miR-671-5p可以作為一種抑癌基因在骨肉瘤的發(fā)展進(jìn)程中發(fā)揮相應(yīng)的作用。前期研究表明多種miRNA的異常表達(dá)對(duì)骨肉瘤今后的發(fā)展起著至關(guān)重要的作用[17-19]。MiR-627-3p可以通過靶向PTN降低骨肉瘤細(xì)胞的增殖和轉(zhuǎn)移能力[20]。這為我們探索miR-671-5p在骨肉瘤的發(fā)展進(jìn)程中如何發(fā)揮作用提供了思路。

EMT是一種可逆的細(xì)胞生物學(xué)程序,參與侵襲、血管生成和轉(zhuǎn)移相關(guān)的化療耐藥[21]。本文通過Western blot實(shí)驗(yàn)檢測(cè)在骨肉瘤中miR-671-5p對(duì)EMT的影響。在生理EMT過程中,上皮細(xì)胞通過特定程序轉(zhuǎn)化為具有間質(zhì)表型細(xì)胞的生物學(xué)過程并且失去了與基底膜的連接等上皮表型使細(xì)胞獲得了較高的遷移與侵襲能力。在腫瘤細(xì)胞中,EMT受到來(lái)自腫瘤及其微環(huán)境的刺激,如生長(zhǎng)因子和細(xì)胞因子的異常調(diào)節(jié),導(dǎo)致遷移和侵襲表型[22-24]。本文已經(jīng)證明過表達(dá)miR-671-5p能夠抑制EMT的發(fā)生,而通過transwell遷移和侵襲實(shí)驗(yàn)也證明miR-671-5p能夠抑制骨肉瘤的遷移和侵襲能力,這正與我們的預(yù)期結(jié)果相符合。在EMT期間,細(xì)胞間以及細(xì)胞與細(xì)胞外基質(zhì)間的相互黏連作用被重塑,從而導(dǎo)致上皮細(xì)胞彼此之間以及下層基底膜之間的分離,并激活了一個(gè)新的轉(zhuǎn)錄程序來(lái)促進(jìn)間充質(zhì)的命運(yùn)[25,26]。本研究通過western blot實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)過表達(dá)miR-671-5p質(zhì)粒后,骨肉瘤細(xì)胞中EMT的相關(guān)標(biāo)志物Vimentin、Ncadherin的表達(dá)明顯降低,過表達(dá)miR-671-5p能抑制EMT的發(fā)生。

有文獻(xiàn)報(bào)道稱miR-139可以通過負(fù)向調(diào)控ROCK1的表達(dá)影響骨肉瘤細(xì)胞的增殖和侵襲能力[27]。本研究通過相應(yīng)的生物信息學(xué)和實(shí)驗(yàn)證明miR-671-5p對(duì)骨肉瘤的遷移運(yùn)動(dòng)和侵襲能力具有一定的抑制作用,也進(jìn)一步為miRNA對(duì)骨肉瘤今后的發(fā)展提供有力依據(jù)。在本研究中,我們通過生物信息學(xué)發(fā)現(xiàn)SMAD3是miR-671-5p的關(guān)鍵基因,在骨肉瘤中表達(dá)上調(diào)。因此,我們把SMAD3作為后期研究對(duì)象。SMAD蛋白能夠介導(dǎo)細(xì)胞內(nèi)轉(zhuǎn)化生長(zhǎng)因子-β(TGF-β)信號(hào)傳導(dǎo),通過多種機(jī)制對(duì)TGF-β超家族信號(hào)通路產(chǎn)生抑制作用,并在腫瘤的生長(zhǎng),侵襲和轉(zhuǎn)移中扮演著至關(guān)重要的角色[28-31]。在本研究中,熒光素酶報(bào)告基因檢測(cè)證實(shí)miR-671-5p 與SMAD3之間存在結(jié)合位點(diǎn)。通過Transwell實(shí)驗(yàn)進(jìn)一步探究miR-671-5p與SMAD3相互作用對(duì)骨肉瘤發(fā)展進(jìn)程的影響,發(fā)現(xiàn)SMAD3可以促進(jìn)骨肉瘤細(xì)胞的遷移運(yùn)動(dòng)和侵襲能力,而miR-671-5p則能夠抑制這種作用。

綜上所述,我們研究發(fā)現(xiàn)在骨肉瘤中miR-671-5p表達(dá)下調(diào),抑制骨肉瘤EMT的發(fā)生,并且能夠通過負(fù)向調(diào)控SMAD3抑制骨肉瘤的遷移和侵襲能力,了解miR-671-5p 在骨肉瘤發(fā)展進(jìn)程中的作用,將為后期miR-671-5p作為骨肉瘤潛在的治療靶點(diǎn)提供基礎(chǔ),為未來(lái)骨肉瘤的治療提供新的理論依據(jù)。

猜你喜歡
質(zhì)粒通路數(shù)據(jù)庫(kù)
農(nóng)桿菌轉(zhuǎn)化法中的“Ti質(zhì)粒轉(zhuǎn)化載體系統(tǒng)”的簡(jiǎn)介
——一道江蘇高考題的奧秘解讀和拓展
全基因組測(cè)序后質(zhì)粒的組裝與鑒定研究進(jìn)展*
小檗堿治療非酒精性脂肪肝病相關(guān)通路的研究進(jìn)展
Wnt/β-catenin信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路在瘢痕疙瘩形成中的作用機(jī)制研究
mcr-1陽(yáng)性類噬菌體質(zhì)粒與F33∶A-∶B-質(zhì)粒共整合形成的融合質(zhì)粒的生物學(xué)特性分析
白芍總苷調(diào)控Sirt1/Foxo1通路對(duì)慢性心力衰竭大鼠的保護(hù)作用研究
開發(fā)新方法追蹤植物病害的全球傳播(2020.6.7 iPlants)
數(shù)據(jù)庫(kù)
數(shù)據(jù)庫(kù)
數(shù)據(jù)庫(kù)