仇鑫,李子孝,3,4
“表觀遺傳學(xué)”的概念于1942年首次被提出,指基于非基因序列改變所致基因表達(dá)水平的變化或表型改變,其形式包括DNA甲基化、組蛋白修飾、染色體重塑和非編碼RNA調(diào)控等,主要通過對基因轉(zhuǎn)錄或翻譯過程的調(diào)控,影響基因的功能和特性[1]。表觀遺傳學(xué)調(diào)控是一種只影響基因修飾加工和表達(dá)的調(diào)控機(jī)制,其發(fā)生不會(huì)引起DNA序列的改變,是連接環(huán)境、遺傳、臨床表型的重要橋梁。隨著生物檢測技術(shù)的不斷發(fā)展,越來越多的證據(jù)支持表觀遺傳過程在細(xì)胞生物學(xué)和組織生理學(xué)中具有重要作用的觀點(diǎn),其與人類疾病的關(guān)聯(lián)性也逐漸顯現(xiàn)。目前,表觀遺傳學(xué)生物標(biāo)志物在臨床中的應(yīng)用主要有兩種:①預(yù)測藥物反應(yīng)或預(yù)后的個(gè)體差異,篩選適合患者個(gè)體的藥物、劑量和方式,指導(dǎo)治療;②作為分子靶標(biāo),通過逆轉(zhuǎn)異常的表觀修飾,開創(chuàng)治療新途徑[2]。
DNA甲基化是目前研究最廣泛的表觀調(diào)控形式之一,其通過改變DNA和蛋白質(zhì)之間的相互作用來調(diào)節(jié)染色質(zhì)“開放”和“封閉”形式之間的平衡,也被稱為是一種“表觀遺傳開關(guān)”。所謂DNA甲基化是指在DNA甲基轉(zhuǎn)移酶(DNA methyltransferase,DNMT)的催化作用下,在基因組CpG二核苷酸的胞嘧啶5’碳位共價(jià)鍵結(jié)合一個(gè)甲基基團(tuán),使胞嘧啶被修飾為5-甲基胞嘧啶(5-methylcytosine,5-mC)的過程[1]。DNA甲基化的改變可在全基因組范圍內(nèi)影響各類疾病的發(fā)生與發(fā)展。在大多數(shù)情況下,甲基化修飾會(huì)引起基因轉(zhuǎn)錄水平降低,但有時(shí)也會(huì)因不同組織微環(huán)境等因素而促進(jìn)基因表達(dá)。因此,DNA甲基化在未來疾病診斷、預(yù)后預(yù)測和治療方面都具有較大的臨床應(yīng)用前景[3]。
腦血管病是因顱內(nèi)血液循環(huán)障礙而造成腦組織損傷的一組疾病,也是導(dǎo)致我國成人致殘的首要疾病,具有高發(fā)病率、高致殘率和高死亡率的特點(diǎn),嚴(yán)重威脅國民健康。其中,急性缺血性卒中(acute ischemic stroke,AIS)是最常見的腦血管病,占我國卒中的70%左右[4]。2020年發(fā)表的《中國卒中報(bào)告2019》顯示,年齡標(biāo)準(zhǔn)化后,我國卒中的發(fā)病率約為246.8/10萬人年(首次發(fā)生在記錄時(shí)間前1年內(nèi)的卒中),死亡率更是達(dá)到了149.49/10萬,占我國居民總死亡率的22.3%,卒中現(xiàn)患已多達(dá)1300萬[5]。
近年研究表明,腦血管病是由遺傳因素和外界環(huán)境共同作用導(dǎo)致的一種復(fù)雜綜合性疾病[6]。近年來,基因組學(xué)不斷發(fā)展,目前腦血管病領(lǐng)域的基因組學(xué)研究主要針對遺傳風(fēng)險(xiǎn),對單基因遺傳性腦動(dòng)脈病有明確的診斷價(jià)值,但在多基因遺傳腦血管病人群中的應(yīng)用價(jià)值仍有一定的局限性。表觀遺傳學(xué)主要研究外界環(huán)境因素對疾病發(fā)生、發(fā)展和轉(zhuǎn)歸的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)機(jī)制,可用于心腦血管疾病等由多基因遺傳背景和外界環(huán)境作用共同驅(qū)動(dòng)的復(fù)雜疾病的研究,從而不斷豐富臨床對復(fù)雜疾病發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)和預(yù)后轉(zhuǎn)歸的生物學(xué)的理解。
目前已有多項(xiàng)研究證實(shí)DNA甲基化在冠心病等心血管疾病的發(fā)生、發(fā)展中發(fā)揮重要作用,但腦血管病相關(guān)的甲基化研究尚處于起步階段。有動(dòng)物研究顯示,腦組織缺血損傷后,DNA甲基化模式會(huì)發(fā)生顯著的動(dòng)態(tài)改變。由于缺血部位組織損傷,DNMT在短時(shí)間內(nèi)表達(dá)上調(diào),可引起級聯(lián)反應(yīng),導(dǎo)致局部組織甲基基團(tuán)增多,CpG島呈現(xiàn)高甲基化狀態(tài)。在大腦中動(dòng)脈閉塞的小鼠模型中,缺血30 min后,小鼠缺血側(cè)大腦皮質(zhì)和紋狀體等部位的DNA甲基化水平明顯升高,而在缺血2 h后缺血部位的DNA甲基化水平回歸正常水平。使用去甲基化藥物(如地西他濱等)可特異性抑制另一種表觀遺傳修飾——組蛋白去乙酰化的水平,增加組織對缺血的抵抗性,明顯減輕小鼠的缺血性腦損傷[7]。
臨床研究中也有一些小樣本研究報(bào)道了DNA甲基化水平與腦血管病發(fā)病、預(yù)后、治療效果之間的作用。例如,在一項(xiàng)小型的前瞻性隊(duì)列中,研究者發(fā)現(xiàn)缺血性卒中患者的DNA轉(zhuǎn)座子長散在核元件-1(long interspersed nuclear element-1,LINE-1)基因呈現(xiàn)低甲基化狀態(tài),且其在無癥狀個(gè)體臨床前階段就發(fā)生了改變[8]。同時(shí),有研究發(fā)現(xiàn)LINE-1低甲基化可能會(huì)改變脂質(zhì)和碳水化合物的代謝,并導(dǎo)致異常的脂質(zhì)分布和糖代謝受損,進(jìn)一步導(dǎo)致動(dòng)脈粥樣硬化斑塊的形成,同樣提示了LINE-1甲基化改變可能是缺血性卒中的早期致病因素[9]。Gallego-Fabrega等[10]發(fā)現(xiàn),在使用阿司匹林治療的患者中,編碼蛋白磷酸酶1A(protein phosphatase magnesium depend ent1A,PPM1A)的PPM1A基因中差異甲基化模式與血管事件復(fù)發(fā)具有較強(qiáng)的相關(guān)性,對這些位點(diǎn)的甲基化干預(yù)可能會(huì)增強(qiáng)阿司匹林的療效,這也提示DNA甲基化在腦血管病的藥物治療方面也扮演了重要角色。但是,目前在腦血管病領(lǐng)域尚缺乏大規(guī)模的隊(duì)列研究對DNA甲基化與疾病的病因機(jī)制、臨床特征、預(yù)后及治療進(jìn)行全面評價(jià),亟待更多深入研究發(fā)掘具有臨床應(yīng)用價(jià)值的DNA甲基化標(biāo)志物。
將DNA甲基化為主的表觀遺傳學(xué)研究技術(shù)引入腦血管病領(lǐng)域,將成為闡明疾病發(fā)病機(jī)制、篩選疾病新治療靶點(diǎn)、設(shè)計(jì)新一代治療方案的重要途徑。未來,我們可以通過研究甲基化這種“表觀遺傳開關(guān)”在缺血性腦血管病發(fā)生、發(fā)展過程中的特征性變化,尋找與臨床表型和治療結(jié)局密切相關(guān)的分子標(biāo)志物,建立有效的風(fēng)險(xiǎn)預(yù)測模型,對不同風(fēng)險(xiǎn)等級的患者施以不同的二級預(yù)防策略,推進(jìn)腦血管病精準(zhǔn)醫(yī)療的發(fā)展,也將有助于緩解我國腦血管病疾病負(fù)擔(dān)。