張露凡,宋普文,毋柳柳,胡海燕,李成偉
(河南科技學(xué)院生命科技學(xué)院/河南省植物遺傳改良與土壤修復(fù)國際聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室,河南新鄉(xiāng) 453000)
小麥(TriticumaestivumL.)是世界最重要的糧食之一,也是我國重要的糧食作物,目前我國耕地面積逐漸減少,保證糧食作物高產(chǎn)穩(wěn)產(chǎn)和高質(zhì)量發(fā)展就顯得尤為重要。同時(shí)我國也是小麥的生產(chǎn)大國和消費(fèi)大國,小麥赤霉病的流行已經(jīng)嚴(yán)重威脅到我國的糧食和食品生產(chǎn)安全[1]。
小麥赤霉病是由鐮刀菌屬真菌引起的一種世界性病害,流行年份會導(dǎo)致小麥產(chǎn)量下降,甚至導(dǎo)致絕收[2]。同時(shí)鐮刀菌還會在小麥體內(nèi)產(chǎn)生多種真菌毒素,如脫氧雪腐鐮刀菌烯醇(DON)、玉米赤霉烯酮(ZEN)等,人畜誤食會造成嚴(yán)重危害[3]。
減輕小麥赤霉病危害最經(jīng)濟(jì)、環(huán)保的手段就是培育抗病品種[4]。但是國內(nèi)外抗源較少,農(nóng)藝性狀較差和抗性機(jī)理不清楚阻礙了抗病品種的培育[5]。因此,挖掘小麥赤霉病抗性基因資源、創(chuàng)制抗赤霉病新種質(zhì)以及研究小麥抗赤霉病抗性機(jī)理仍是目前小麥赤霉病的研究方向。Fhb1是在蘇麥3號中發(fā)現(xiàn)的抗赤霉病效應(yīng)和穩(wěn)定性最好的位點(diǎn),隨后在望水白、黃方柱和日本品種Nyubai中均發(fā)現(xiàn)了該位點(diǎn)[6]。Rawat等[7]通過對蘇麥3號3BS染色體上主效位點(diǎn)Fhb1的精細(xì)定位和圖位克隆,獲得了抗赤霉病擴(kuò)展的基因PFT(pore-forming toxin-like)。2019年Su等[8]在Fhb1位點(diǎn)鑒定到一個(gè)編碼組氨酸富集的鈣離子結(jié)合蛋白基因TaHRC,被認(rèn)為是Fhb1位點(diǎn)的主要抗性基因,并發(fā)現(xiàn)TaHRC基因沉默后小麥抗性增強(qiáng),而Li等[9]將TaHRC基因過表達(dá)后發(fā)現(xiàn)小麥抗性增強(qiáng),所以,其作用機(jī)制目前也存在分歧,同時(shí)也說明了小麥赤霉病抗性機(jī)制可能不是由一個(gè)基因控制的,可能存在其他基因的干預(yù)。He等[10]通過以PFT為誘餌篩選小麥酵母雙雜文庫,得到23種與PFT互作的蛋白,并通過實(shí)時(shí)定量PCR分析這些互作蛋白基因的表達(dá)模式,發(fā)現(xiàn)5種蛋白在植物生長和發(fā)育的各個(gè)過程中以及在抵抗生物和非生物脅迫方面發(fā)揮關(guān)鍵作用。
本研究先以PFT為誘餌蛋白篩選小麥酵母雙雜文庫,得到一個(gè)新的基因,然后通過酵母雙雜交試驗(yàn)、雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)和實(shí)時(shí)熒光定量分析,對其表達(dá)模式以及與小麥TaPFT的相互作用進(jìn)行分析,以期為解析小麥赤霉病抗性機(jī)制奠定基礎(chǔ)。
抗赤霉病小麥蘇麥3號和本氏煙草均由河南科技學(xué)院河南省糧食作物基因組編輯工程技術(shù)研究中心提供。大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞、根癌農(nóng)桿菌GV3101感受態(tài)細(xì)胞、酵母Y2HGold菌株均由本實(shí)驗(yàn)室保存。
1.2.1 小麥RNA的提取與cDNA的合成
在小麥生長至兩葉一心時(shí),取一整株小麥用ddH2O沖洗干凈后迅速放入液氮冷凍,-80 ℃保存。采用Trizol法提取小麥RNA,使用RNase-Free DNase I試劑盒去除混雜的基因組DNA,用超微量分光光度計(jì)測量RNA樣品的純度和濃度。cDNA的合成按照PrimeScriptTMII 1st Strand cDNA Synthesis Kit試劑盒(寶生物,大連)說明書進(jìn)行,反轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物于-20 ℃保存。
1.2.2 PFT互作蛋白基因的酵母篩庫
將TaPFT基因連接至酵母表達(dá)載體pGBKT7上,通過酵母轉(zhuǎn)化的方法導(dǎo)入酵母菌株Y2HGold中,涂布于SD-Trp平板培養(yǎng)基上, 30 ℃培養(yǎng)長出單克隆后,挑取單克隆接種至50 mL SD-Trp液體培養(yǎng)基中培養(yǎng)12~16 h,作為原代培菌液。利用酵母轉(zhuǎn)化試劑盒(TaKaRa,大連)制備酵母感受態(tài)細(xì)胞,將前期制備好的小麥酵母雙雜cDNA文庫轉(zhuǎn)化至酵母感受態(tài)中,并涂布于SD/-His-Leu-Trp-Ade平板培養(yǎng)基上,于 30 ℃培養(yǎng)3~7 d后,挑取單克隆進(jìn)行擴(kuò)繁培養(yǎng),使用酵母質(zhì)粒提取試劑盒(天根,北京)提取酵母質(zhì)粒,并以酵母質(zhì)粒為模板進(jìn)行PCR擴(kuò)增,擴(kuò)增產(chǎn)物用膠回收試劑盒(天根,北京)進(jìn)行回收后,送至武漢金開瑞生物工程有限公司進(jìn)行測序。用ORF Finder分析表明,其中一個(gè)文庫插入序列具有771 bp的完整編碼框,進(jìn)一步BlAST分析表明,其序列與已知小麥cDNA文庫克隆Triticum aestivum clone wyr1c.pk002.o12(BT008921.2)序列具有99.48%的相似性,其編碼蛋白與野生二粒小麥(Triticumdicoccoides)果糖激酶Fructokinase-2蛋白序列具有99.48%的相似性,因此推測該基因編碼蛋白為Fructokinase,命名為TaFRK。
1.2.3 基因克隆
使用Primer 6.0軟件設(shè)計(jì)引物TaFRK-F/R和 TaPFT-F/R(表1),擴(kuò)增TaFRK和TaPFT基因的全長序列。以TaFRK和TaPFT的cDNA為模板擴(kuò)增TaFRK(771 bp)和TaPFT(1 434 bp)的編碼區(qū)序列。PCR反應(yīng)體系為25 μL,包括模板cDNA 1 μL,上下游引物(10 μmol·L-1)各1 μL,Taq酶12.5 μL,ddH2O 9.5 μL。PCR反應(yīng)程序:預(yù)變性94 ℃ 5 min,變性94 ℃ 30 s,退火55 ℃(TaFRK:45 s;TaPFT:90 s),延伸72 ℃ 30 s,35個(gè)循環(huán);延伸72 ℃ 7 mim,4 ℃保存。用1%瓊脂糖凝膠電泳檢測PCR產(chǎn)物。
PCR產(chǎn)物膠回收后分別與pMD19-T載體于16 ℃連接過夜,連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞后,涂抹于含有Amp+抗性的培養(yǎng)基上,隨機(jī)選取5個(gè)單克隆菌落,菌落PCR鑒定為陽性后,送至武漢金開瑞生物工程有限公司進(jìn)行測序。
1.2.4 酵母雙雜交分析
使用Primer 6.0軟件設(shè)計(jì)的引物pGADT7-TaFRK-F/R和pGBKT7-TaPFT-F/R(表1)分別擴(kuò)增TaFRK和TaPFT基因,對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳并進(jìn)行回收后,將回收產(chǎn)物TaFRK連接至經(jīng)過EcoR I和XhoI雙酶切的pGADT7載體上,構(gòu)建pGADT7-TaFRK重組載體;將回收產(chǎn)物TaPFT連接至經(jīng)BamH I和EcoR I酶切的pGBKT7載體上,構(gòu)建pGBKT7-TaPFT重組載體,然后將這兩個(gè)重組載體分別轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。對單克隆進(jìn)行PCR驗(yàn)證,將陽性克隆送至武漢金開瑞生物工程有限公司進(jìn)行測序。用通用引物T7和3AD對pGADT7-TaFRK進(jìn)行測序,用通用引物T7和3BD對pGBKT7-TaPFT進(jìn)行測序,用DNAMAN軟件對測序結(jié)果進(jìn)行對比分析。
表1 本試驗(yàn)使用的引物Table 1 Primers used in the study
使用PEG/LiAc法轉(zhuǎn)化酵母菌株Y2HGold,以pGBKT7-TaPFT和pGADT7-TaFRK共轉(zhuǎn)化作為試驗(yàn)組,以pGBKT7和pGADT7空載體共轉(zhuǎn)化作為對照組,pGBKT7-TaPFT和pGADT7、pGADT7-TaFRK和pGBKT7共轉(zhuǎn)化作為陰性對照。轉(zhuǎn)化后的酵母涂抹在含有X-α-Gal和AbA的 SD/-Leu/-Trp/-His/-Ade平板培養(yǎng)基上,于30 ℃靜置培養(yǎng)3~ 5 d,拍照并記錄。
1.2.5 雙分子熒光互補(bǔ)分析
使用Primer 6.0軟件設(shè)計(jì)的引物BiFC-TaFRK-F/R和BiFC-TaPFT-F/R(表1)分別擴(kuò)增TaFRK和TaPFT基因的開放閱讀框。對擴(kuò)增產(chǎn)物進(jìn)行電泳并回收。使用Gateway體系構(gòu)建雙分子熒光互補(bǔ)載體,經(jīng)BP反應(yīng)將回收產(chǎn)物TaFRK和TaPFT分別連接至pDNOR221中間載體,構(gòu)建pDNOR221-TaFRK和pDNOR221-TaPFT重組載體,然后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞。對PCR鑒定為陽性的單克隆送至武漢金開瑞生物工程有限公司進(jìn)行測序。將測序正確且含有pDNOR221-TaFRK和pDNOR221-TaPFT的單克隆分別進(jìn)行搖菌提質(zhì)粒后,經(jīng)過MluI快切酶酶切,用回收試劑盒(天根,北京)進(jìn)行回收,將目的基因經(jīng)LR反應(yīng)連接至YC和YN載體中,構(gòu)建YC-TaFRK和YN-TaPFT載體,然后轉(zhuǎn)化至大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,對PCR鑒定為陽性的單克隆送至武漢金開瑞生物工程有限公司進(jìn)行測序。用DNAMAN軟件對測序結(jié)果進(jìn)行對比分析。
將YC-TaFRK和YN-TaPFT載體分別轉(zhuǎn)入農(nóng)桿菌GV3101中進(jìn)行搖培,待OD600約為0.6~0.8時(shí),5 000 g離心1 min富集菌體,用無菌水洗滌菌體,再用煙草侵染緩沖液(D-glucose 250 mg,0.5 mol·L-1的MES 5 mL, 1 mol·L-1的乙酰丁香酮5 μL,0.02 mol·L-1的Na3PO4·12H2O 5 mL,加無菌水至50 mL)重懸菌體后將兩種菌液等比例混合,黑暗靜置2 h,然后使用注射器將菌液注射至6~8周齡的煙草葉片;同時(shí)設(shè)置對照將空載體YC和YN注射至煙草,用記號筆標(biāo)記注射區(qū)域,25 ℃培養(yǎng)48 h后,在激光共聚焦顯微鏡下觀察結(jié)果,并拍照。
1.2.6 接種禾谷鐮刀菌后TaFRK基因的表達(dá)模式分析
按照Bai等[11]的方法用綠豆湯培養(yǎng)基培養(yǎng)禾谷鐮刀菌,產(chǎn)生孢子后于7 000 g 離心15 min收集孢子,用無菌水沖洗2~3遍。于小麥開花期,使用移液器將15 μL禾谷鐮刀菌孢子懸浮液(200個(gè)孢子·μL-1)注入穗狀花序的中央小花中,接種過的穗包裹在夾層袋中,夾層袋內(nèi)部用水霧化,分別在小麥接種禾谷鐮刀菌0、 3、6、12、24、36、48和72 h時(shí)取樣,對照組用無菌水接種小麥小穗。每個(gè)時(shí)間點(diǎn)收集2個(gè)小穗,取下后置于液氮中冷凍, -80 ℃保存。
為了標(biāo)準(zhǔn)化每個(gè)反應(yīng)中的cDNA總量,并消除樣品之間的差異,以小麥微管蛋白基因Tubulin作為內(nèi)部參照。每個(gè)樣品重復(fù)3次,使用2-ΔΔCT方法計(jì)算TaFRK基因的相對表達(dá)量,進(jìn)行3次生物學(xué)重復(fù)。
用引物TaPFT-F/R和TaFRK-F/R擴(kuò)增TaPFT和TaFRK基因的全長片段,擴(kuò)增結(jié)果如圖1A和圖1B所示。對擴(kuò)增片段進(jìn)行回收,與pMD19-T載體16 ℃連接過夜后轉(zhuǎn)化大腸桿菌DH5α感受態(tài)細(xì)胞,挑5個(gè)單克隆搖菌,菌液PCR驗(yàn)證為陽性后進(jìn)行測序。將測序正確的菌液提取質(zhì)粒后分別連接在pGBKT7(BamH I和EcoR I雙酶切)和pGADT7(EcoR I和XhoI雙酶切)載體上。經(jīng)PCR檢測后送測序,分別得到約1 434和771 bp的片段(圖1C和圖1D),與TaPFT和TaFRK的片段大小一致,表明表達(dá)載體構(gòu)建 成功。
雙分子熒光互補(bǔ)載體的構(gòu)建使用Gateway體系,分別使用引物BiFC-TaPFT-F/R和BiFC-TaFRK-F/R分別擴(kuò)增TaPFT和TaFRK基因的開放閱讀框,經(jīng)BP反應(yīng)將TaPFT和TaFRK基因連接至中間載體pDNOR221,菌落PCR驗(yàn)證為陽性后送測序。將測序正確的載體用MluI酶切后回收,然后經(jīng)LR反應(yīng)將TaPFT和TaFRK分別與YN和YC載體連接,并進(jìn)行測序,分別得到大小分別為1 434和771 bp的片段(圖1E和1F),與TaPFT和TaFRK的片段大小一致,表明表達(dá)載體構(gòu)建成功。
M:Marker DL2000;M1:Marker DL5000.圖1 TaPFT和 TaFRK基因的克隆及酵母雙雜交載體和雙分子熒光互補(bǔ)載體的構(gòu)建Fig.1 Cloning of TaPFT and TaFRK genes and construction of yeast two hybrid vector and bimolecular fluorescence complementary vector of TaPFT and TaFRK
酵母雙雜交是鑒定蛋白相互作用最常用的手段。將共轉(zhuǎn)pGBKT7-TaPFT和pGADT7-TaFRK、pGBKT7-TaPFT和pGADT7、pGBKT7和pGADT7-TaFRK、pGBKT7和pGADT7的酵母菌菌株Y2HCold在含有X-α-Gal和AbA的SD/-His-Leu-Trp-Ade的平板培養(yǎng)基上進(jìn)行劃線培養(yǎng),發(fā)現(xiàn)只有共轉(zhuǎn)pGBKT7-TaPFT和pGADT7-TaFRK的酵母變藍(lán)(圖2)。表明TaPFT和TaFRK基因可以在酵母中發(fā)生相互作用。
a:pGBKT7-TaPFT載體與pGADT7-TaFRK載體共轉(zhuǎn)酵母涂板;b:pGBKT7-TaPFT載體與pGADT7載體共轉(zhuǎn)酵母涂板;c:pGBKT7載體與pGADT7-TaFRK載體共轉(zhuǎn)酵母涂板;d:pGBKT7載體與pGADT7載體共轉(zhuǎn)酵母涂板。a: pGBKT7-TaPFT vector and pGADT7-TaFRK vector were co-transferred into yeast; b: pGBKT7-TaPFT vector and pGADT7 vector were co-transferred into yeast; c: pGBKT7 vector and pGADT7-TaFRK vector were co-transferred into yeast; d: pGBKT7 vector and pGADT7 vector were co-transferred into yeast.圖2 酵母雙雜交檢測 TaFRK和 TaPFT的相互作用Fig.2 Interaction between TaPFT and TaFRK detected by yeast two-hybrid system
為了進(jìn)一步驗(yàn)證TaFRK和TaPFT是否可以在植物體內(nèi)發(fā)生相互作用,利用雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)探討TaFRK和TaPFT在煙草細(xì)胞中的相互作用情況。結(jié)果(圖3)發(fā)現(xiàn),攜帶YC-TaFRK和YN-TaPFT農(nóng)桿菌組合的煙草表皮細(xì)胞中可以觀察到黃色熒光,且熒光主要分布在細(xì)胞質(zhì)中,表明TaFRK和TaPFT在細(xì)胞質(zhì)中發(fā)生了相互作用,而只攜帶YC和YN農(nóng)桿菌組合的煙草表皮細(xì)胞中未觀察到黃色熒光。
圖3 雙分子熒光互補(bǔ)實(shí)驗(yàn)檢測 TaPFT和 TaFRK相互作用Fig.3 Interaction between TaPFT and TaFRK detected by Bi-Fluorescent Complementation
由表2可以看出,隨著時(shí)間的延長,接種禾谷鐮刀菌孢子處理組TaFRK基因的相對表達(dá)量總體上呈上升趨勢(除接種12 h時(shí)有所下降);而對照組TaFRK基因的相對表達(dá)量呈先上升后下降的趨勢。在接種6~72 h(除接種12 h),處理組TaFRK基因的相對表達(dá)量均顯著高于對照組。表明禾谷鐮刀菌孢子侵染后誘導(dǎo)了TaFRK基因的上調(diào)表達(dá)。說明TaFRK基因可能參與小麥赤霉病抗性反應(yīng)。
表2 接種禾谷鐮刀菌后小麥小穗中TaFRK的相對表達(dá)量Table 2 Relative expression of TaFRK gene in wheat spikelets after anoculation with Fusarium graminearum spores
果糖激酶(Frlctokinase,F(xiàn)RK)是己糖激酶的一種,不僅參與糖的代謝,還可作為糖感受器和信號分子來調(diào)控植物的生長發(fā)育[12-14],激活或阻遏植物體內(nèi)相關(guān)基因的表達(dá)來影響細(xì)胞周期、光合作用、碳?xì)浯x、逆境響應(yīng)、萌發(fā)、營養(yǎng)生長、生殖發(fā)育、衰老等過程[15]。Granot等[16]通過嫁接試驗(yàn)表明,反義抑制番茄LeFRK2可引起葉片枯萎以及莖組織中活性木質(zhì)部面積明顯變小。說明LeFRK2參與木質(zhì)部的發(fā)育過程,且木質(zhì)部發(fā)育可能與果糖有關(guān)。果糖是蔗糖的水解產(chǎn)物,蔗糖合成酶(SUSY)可將蔗糖裂解成UDP葡萄糖和果糖,其中UDP葡萄糖已經(jīng)證明參與番茄的維管系統(tǒng)表達(dá)[17-18],這說明SUSY也可能與木質(zhì)素發(fā)育有關(guān)。
Roach等[19]研究表明,在楊木發(fā)育過程中RNA干擾FRK2基因的表達(dá),可增加可溶性糖的含量以及降低己糖磷酸和UDP-葡萄糖的含量,表明FRK2基因與胞壁多糖前體的碳流有關(guān)。
FRK2蛋白的活性降低也導(dǎo)致纖維細(xì)胞壁變薄,纖維素比例降低[19]。這一結(jié)果確立了FRK2在木材纖維素碳通量中的中心作用。
Tomassini等[20]研究表明,禾谷鐮刀菌在入侵小麥時(shí)在體外產(chǎn)生纖維素酶、木聚糖酶等降解宿主細(xì)胞壁的酶來降解細(xì)胞壁,從而穿透和定殖宿主組織。而木質(zhì)素在禾本科植物細(xì)胞壁占比20%,是一種重要的結(jié)構(gòu)成分,可防御病原體的入侵,使細(xì)胞壁對細(xì)胞壁降解酶更具抵抗力,同時(shí)阻止病原體產(chǎn)生的毒素?cái)U(kuò)散。Lionetti等[21]研究表明,較高的S型木質(zhì)素含量可能是一種與抗病性有關(guān)的細(xì)胞壁生化特性,同時(shí)也表明有利于S型木質(zhì)素積累的基因可能參與了對病原菌的抗性。
Yang等[22]研究發(fā)現(xiàn),蘋果MdFRK2的轉(zhuǎn)錄受到褪黑素(N-乙?;?5-甲氧基色胺)的抑制,較高的褪黑素濃度會抑制MdFRK2的表達(dá)和降低FRK蛋白的活性。褪黑素是植物中廣泛存在的具有高度保守性的多功能小分子,當(dāng)由于生物脅迫導(dǎo)致細(xì)胞滲漏時(shí),可通過激活防御相關(guān)基因的表達(dá)參與植物的光周期反應(yīng)、清除活性氧以及保護(hù)植物免受細(xì)菌病原體的侵害[23-24]。說明MdFRK2受褪黑素的調(diào)控,進(jìn)而參與植物的抗病 過程。
本研究使用酵母雙雜交和雙分子熒光互補(bǔ)試驗(yàn)證明,TaFRK和抗病基因PFT能夠發(fā)生互作反應(yīng),實(shí)時(shí)熒光定量研究表明,TaFRK基因表達(dá)受赤霉病侵染誘導(dǎo)。而FRK基因在植物細(xì)胞壁和木質(zhì)素合成中起重要作用[20-21],我們推測TaPFT可能通過與TaFRK互作影響細(xì)胞壁或木質(zhì)素的積累來提高植物細(xì)胞壁的抗病特性。本研究為解讀小麥抗赤霉病抗性機(jī)理具有一定的參考意義,為解析TaPFT抗性機(jī)制提供新途徑。