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耐重金屬腸桿菌GL-2 鑒定及對(duì)小麥促生作用的研究

2022-01-08 11:43蔡高磊趙昌松彭宣和趙建寧
湖北農(nóng)業(yè)科學(xué) 2021年23期
關(guān)鍵詞:無菌重金屬小麥

蔡高磊,周 煬,趙昌松,彭宣和,張 振,趙建寧

(1.農(nóng)業(yè)農(nóng)村部農(nóng)產(chǎn)品質(zhì)量安全環(huán)境因子控制重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,天津 300191;2.丹江口庫區(qū)十堰生態(tài)農(nóng)業(yè)研究院,湖北 十堰 442000;3.農(nóng)業(yè)農(nóng)村部環(huán)境保護(hù)科研監(jiān)測所,天津 300191)

近年來,土壤重金屬污染對(duì)生態(tài)系統(tǒng)和人類健康都構(gòu)成嚴(yán)重威脅,日益成為嚴(yán)重的全球性環(huán)境問題。工業(yè)生產(chǎn)、采礦活動(dòng)、農(nóng)業(yè)生產(chǎn)中肥料和農(nóng)藥的使用、廢水灌溉和廢棄物的不當(dāng)處理等人類活動(dòng)都與土壤中的重金屬污染有關(guān)[1-4]。重金屬是土壤中的常見污染物,也是植物和動(dòng)物代謝過程中的非必需元素,特別是土壤污染中的鎘(Cd)被認(rèn)為是重金屬中最具毒性的污染物之一,因此它具有高遷移率和低允許暴露限值[5,6]。傳統(tǒng)的重金屬處理方法如土壤沖刷、穩(wěn)定劑、酸淋洗、離子交換或電化學(xué)處理對(duì)土壤修復(fù)來說既昂貴效率又低,并且往往對(duì)土壤生態(tài)系統(tǒng)造成負(fù)面影響[7,8]。除了重金屬毒性外,植物的生長還可能受到干旱、鹽堿化和養(yǎng)分缺乏等不良環(huán)境脅迫,克服環(huán)境壓力并促進(jìn)植物生長對(duì)植物發(fā)揮自身性能必不可少。植物根系周圍存在大量植物根際促生菌(Plant growth-promoting rhizobacteria,PGPR),它們是一群可以產(chǎn)生與植物生長相關(guān)物質(zhì),例如嗜鐵素、吲哚3-乙酸(IAA)和1-氨基環(huán)丙烷-1-羧酸合成酶(1-aminocyclopropane-1-carboxylate,ACC)等來提高植物對(duì)重金屬毒性的耐受性和促進(jìn)植物生物量的有益根際細(xì)菌[9-11]。研究報(bào)道,與植物相關(guān)的PGPR 通過降低土壤中的重金屬生物利用度來幫助植物生長和提高植物對(duì)重金屬的耐受性,并減少重金屬的吸收或轉(zhuǎn)移到植物的上半部分[12-15]。Madhaiyan 等[16]報(bào)道,接種內(nèi)生細(xì)菌Magnaporthe oryzae和Burkholderiaspp.可以增加植株生長,減少番茄根和芽中Ni 和Cd的積累,同樣也減少了土壤中Ni 和Cd的有效性,是PGPR 菌株對(duì)重金屬的吸附和生物積累的結(jié)果。此外,細(xì)菌還可以直接與重金屬等污染物相互作用,以降低其毒性或調(diào)節(jié)其生物利用率[17]。因此,PGPR的應(yīng)用是減少土壤中重金屬積累和植物生長效率的有效途徑。

本研究通過從土壤中分離一種PGPR 菌株,離體條件下篩選出具有耐重金屬和嗜鐵素活性,測定了該菌株對(duì)重金屬的最低抑制濃度,并研究了其對(duì)小麥幼苗生長性狀的影響,為該菌株在土壤中保護(hù)作物生長及應(yīng)用提供理論基礎(chǔ)。

1 材料與方法

1.1 試驗(yàn)材料

試驗(yàn)土壤取自湖北省十堰市一處小麥種植地,取樣時(shí)小心將小麥拔出并收集小麥根際的土壤置于無菌袋中,注明采樣時(shí)間和地點(diǎn),置于冰箱4 ℃保存?zhèn)溆谩?/p>

LB 培養(yǎng)基:胰蛋白胨10 g,酵母提取物5 g,NaCl 10 g,瓊脂15 g,定容至1 000 mL,pH 為7.0,121 ℃滅菌20 min。

嗜鐵素培養(yǎng)基[18]:CAS(鉻天青)60.5 g,10 mL 三價(jià)鐵溶液(1 mmol/L FeCl3·6H2O),HDTMA(十六烷基三甲基溴化胺)72.9 g,瓊脂18 g,定容至1 000 mL,121 ℃滅菌20 min。

PDA 培養(yǎng)基:馬鈴薯200 g,葡萄糖20 g,瓊脂15 g,定容至1 000 mL,pH為7.0,121 ℃滅菌20 min。

Murashige 和Skoog(MS)培養(yǎng)基[19]。

小麥品種:鄂麥DH16,為本實(shí)驗(yàn)室保存品種。

1.2 試驗(yàn)方法

1.2.1 耐CdCl2的PGPR 菌株的篩選 為了獲得耐重金屬細(xì)菌,稱量10 g 根際土壤放入90 mL 無菌水中,搖床于28 ℃下180 r/min 振蕩30 min,用稀釋平板法連續(xù)將土壤混懸液稀釋成10-1~10-3g/mL,并加入含有20 mg/L CdCl2的LB 培養(yǎng)基中涂抹均勻,放置在恒溫培養(yǎng)箱中25 ℃下培養(yǎng)5 d。將生長出來的菌落接入LB 液體培養(yǎng)基中,25 ℃振蕩培養(yǎng)48 h,用離心機(jī)5 000 r/min 離心10 min,收集菌體,再用無菌水稀釋菌液濃度至1×107cfu/mL 接入嗜鐵素培養(yǎng)基中,28 ℃下恒溫培養(yǎng)5 d。觀察菌落周圍是否產(chǎn)生黃色暈圈,有黃色暈圈的是產(chǎn)生嗜鐵素的PGPR 菌株。根據(jù)下列公式計(jì)算嗜鐵素PGPR 菌株活性。

菌株活性=[(暈圈直徑-菌落直徑)/暈圈直徑]×100%

1.2.2 重金屬最低抑制濃度測定 為了檢測分離菌株對(duì)重金屬的抗性水平,選取生長最快、抗重金屬最強(qiáng)、嗜鐵素活性最高的PGPR 菌株,測定了PGPR 菌株對(duì)硫酸銅、硫酸鋅、硝酸鉛和氯化鎘的最低抑制濃度(Minimal inhibitory concentration,MIC)。采用平板稀釋法在LB 培養(yǎng)基上添加Cu、Zn、Pb 和Cd 不同濃度的重金屬,以菌株不能生長的最低重金屬濃度為試驗(yàn)統(tǒng)計(jì)的生長臨界值,每個(gè)處理3 次重復(fù)。

1.2.3 PGPR 菌株的分子鑒定和生理生化特征 對(duì)篩選出的PGPR 菌株送北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公 司進(jìn)行16S rDNA 和gyrB 分 子鑒定,16S rDNA 引物 為5′-AGAGTTTGATCCTGGCTCAG-3′,5′-GGTTA CCTTGTTACGACTT-3′。16S rDNA PCR 擴(kuò)增條件為:94 ℃3 min;94 ℃45 s,55 ℃30 s,72 ℃2 min,35 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸5 min,4 ℃停止。gyrB 引物為5′-GAAGTCATCATGACCGTTCTGCAYGCNGGNGGNAARTTYGA-3′,5′-AGCAGGGTACGGATGTGCGAGCCRTCNACRTCNGCRTCNGTCAT-3′,gyrB PCR擴(kuò)增條件為:96 ℃5 min,96 ℃1 min,62 ℃1 min,72 ℃ 2 min,35 個(gè)循環(huán);72 ℃延伸7 min,4 ℃停止。利用BLASTN 將獲得的序列與GenBank 數(shù)據(jù)庫中的16S rDNA 和gyrB 核苷酸序列進(jìn)行比較。使用MEGA5.0 軟件進(jìn)行多序列比對(duì)并構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹。

1.2.4 PGPR 對(duì)重金屬處理下植物生長的影響 挑取PGPR 菌株單菌落放入LB 液體培養(yǎng)基中,28 ℃振蕩培養(yǎng)72 h,用離心機(jī)5 000 r/min 離心10 min,收集菌體,再用無菌水稀釋菌液濃度至1×108cfu/mL 備用。將鄂麥DH16 種子用75%乙醇消毒8 min,再用無菌水清洗3 遍,然后用無菌濾紙吸干種子表面水分,分別放入MS、MS+PGPR、MS+PGPR+Pb、MS+Pb、MS+PGPR+Cd 和MS+Cd 培養(yǎng)基內(nèi),Pb 和Cd的終濃度均為50 mg/L,用0.22 μm 過濾器過濾滅菌后加入MS 培養(yǎng)基中混勻,每瓶5 粒種子,每個(gè)處理3 次重復(fù),5 d 后調(diào)查各處理下小麥生長情況。

1.2.5 PGPR 對(duì)植物的促生長作用 選取健康的小麥種子,先用1.2% NaOCl 溶液消毒5 min,然后用75%乙醇消毒5 min,再用無菌水清洗3 次,最后將小麥種子放入無菌濾紙的培養(yǎng)皿中,加入適量無菌水,25 ℃恒溫培養(yǎng)5 d 進(jìn)行催芽,選取發(fā)芽一致的幼苗備用。每個(gè)花盆(直徑15 cm)裝有1.5 kg 土壤。試驗(yàn)設(shè)計(jì),處理1:未添加PGPR 菌株的對(duì)照土;處理2:PGPR 活菌(1×108cfu/mL)接種土壤;處理3:PGPR活菌(1×105cfu/mL)接種土壤。每盆播種3 株幼苗,每個(gè)處理重復(fù)3 次,于分蘗期調(diào)查各處理下小麥的生長狀況。

2 結(jié)果與分析

2.1 PGPR 菌株耐重金屬和嗜鐵素活性

5 株P(guān)GPR 在培養(yǎng)基上出現(xiàn)時(shí)間和嗜鐵素活性不同(表1),GL-1 到GL-5 出現(xiàn)時(shí)間分別為25、20、29、49、46 h,說明在LB 培養(yǎng)基上加了重金屬對(duì)PGPR 菌株生長有一定的抑制作用,5 株P(guān)GPR 嗜鐵素活性從31.55%到65.88%,其中GL-2 活性最高,為65.88%。因此,GL-2是篩選的最合適PGPR菌株。

表1 耐CdCl2的PGPR 菌株的生長時(shí)間和嗜鐵素活性

2.2 GL-2菌株對(duì)4種重金屬的最低抑制濃度(MIC)

平板試驗(yàn)中(圖1),重金屬硫酸銅、硫酸鋅、硝酸鉛和氯化鎘對(duì)GL-2 菌株表現(xiàn)出不同程度的抑制作用,GL-2 對(duì)添加Cu、Zn、Pb 和Cd的LB 培養(yǎng)基上的最低抑制濃度(MIC)分別為200、150、650 和200 mg/L,說明GL-2 菌株對(duì)重金屬離子具有很強(qiáng)的耐受性,特別是對(duì)Pb的MIC 達(dá)650 mg/L。

圖1 GL-2 對(duì)重金屬的最低抑制濃度

2.3 GL-2 鑒定結(jié)果

利用16S rDNA 和gyrB 基因片段進(jìn)行測序,分別得到長為1 426 bp 和742 bp的核苷酸序列。系統(tǒng)進(jìn)化樹表明(圖2 和圖3),GL-2 菌株和Enterobacterludwigii聚為一枝,與其他腸桿菌序列的相似性均低于Enterobacter ludwigii。此外,根據(jù)第九版Bergeys細(xì)菌鑒定手冊(cè),GL-2 菌株的生理生化鑒定結(jié)果(表2)與Enterobacter ludwigii基本一致。因此,GL-2菌株為Enterobacter ludwigii,命名為Enterobacter ludwigiiGL-2。

圖2 GL-2 基于16S rDNA 序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹

圖3 GL-2 基于gyrB 序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹

表2 GL-2 菌株的生理生化特征

2.4 GL-2 對(duì)重金屬處理下小麥生長的影響

小麥生長情況(圖4)表明,MS+PGPR 處理與MS+PGPR+Pb 處理的根長差異不顯著;但與添加Cd處理相比,株高、根長及鮮重差異均達(dá)顯著水平,說明重金屬影響了小麥的生長,加入Enterobacter ludwigiiGL-2 對(duì)小麥生長具有一定的促進(jìn)作用,可以減輕重金屬對(duì)小麥生長的影響,特別是促進(jìn)了小麥根長和增加了生物量。

圖4 小麥生長情況

2.5 GL-2 對(duì)盆栽小麥生長的作用

盆栽試驗(yàn)結(jié)果(表3)表明,3種不同處理下,小麥的株高、根長和主根數(shù)沒有明顯差異。然而PGPR活菌(1×108cfu/mL 和1×105cfu/mL)接種小麥后,小麥根鮮重、分蘗數(shù)和根干重與對(duì)照相比具有顯著差異。處理2 小麥根鮮重、分蘗數(shù)和根干重分別比對(duì)照增加了102.80%、93.17%和216.67%。處理3小麥根鮮重、分蘗數(shù)和根干重分別比對(duì)照增加了27.97%、55.28%和53.33%。PGPR 活菌在1×108cfu/mL 濃度下對(duì)小麥生長具有較強(qiáng)的促生效果。

表3 GL-2 對(duì)小麥的生長作用

3 討論

腸桿菌在自然界中廣泛存在,PGPR 對(duì)土壤修復(fù)已被證明是促進(jìn)植物生長和保護(hù)植物免受重金屬毒性的一種經(jīng)濟(jì)有效的方法[20,21]。此外,與植物相關(guān)的PGPR 細(xì)菌可能會(huì)使土壤中的重金屬產(chǎn)生生物球或沉淀,并通過與陰離子官能團(tuán)結(jié)合而降低重金屬對(duì)生物利用率的毒性,還可以利用細(xì)胞外聚合物(多糖、蛋白質(zhì)、腐殖質(zhì)等)或細(xì)菌產(chǎn)生的鐵載體、有機(jī)酸螯合金屬離子以及熒光假單胞菌Pseudomonas fluorescensACC9、P.fluorescensACC 23、Enterobactersp.NBRI K28 SD1 和Enterobacter ludwigiiNCR3的生理機(jī)制來促進(jìn)植物生長和對(duì)重金屬的吸附[1,3,22]。

本研究中,GL-2 屬于Enterobacter ludwigii,具有生長速度快、嗜鐵素活性強(qiáng)的特性,在重金屬M(fèi)IC 試驗(yàn)中,GL-2 對(duì)4 種不同重金屬具有一定的耐受性,尤其是在含有Pb的培養(yǎng)基中MIC 高達(dá)650 mg/L,在含有50 mg/L 重金屬Pb的MS 培養(yǎng)基中接種GL-2 菌株,小麥的根長和鮮重的生物量與對(duì)照無顯著性差異,說明GL-2 菌株改善了重金屬下小麥的生長環(huán)境,提高了小麥的生物量,減少了重金屬對(duì)小麥生長的影響。盆栽小麥生長研究表明,Enterobacter ludwigiiGL-2 在1×108cfu/mL 濃度下,小麥根鮮重、分蘗數(shù)和根干重與對(duì)照相比具有顯著差異,分別比對(duì)照增加了102.80%、93.17%和216.67%,對(duì)小麥的生長發(fā)育起到促生作用,這種明顯的促生作用還有可能與其篩自小麥根際土壤有關(guān)。

綜上,本試驗(yàn)對(duì)篩選、鑒定的PGPR 菌株、抗重金屬能力及其對(duì)小麥?zhǔn)┯眯Ч难芯拷Y(jié)果表明,PGPR 菌 株Enterobacter ludwigiiGL-2對(duì)減輕重金屬影響和小麥生長具有積極的促進(jìn)作用,對(duì)于制作微生物菌肥具有潛在的應(yīng)用價(jià)值。另外,植物生長也受菌株、植物特性和土壤環(huán)境等因素影響,這些都需要進(jìn)一步的研究來證實(shí)。

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