馮云奎,王健,馬金亮,張柳明,李擁軍
揚(yáng)州大學(xué)動物科學(xué)與技術(shù)學(xué)院,江蘇揚(yáng)州 225009
【研究意義】長江三角洲白山羊,是國內(nèi)外唯一能生產(chǎn)優(yōu)質(zhì)筆料毛的山羊品種,其頸脊部產(chǎn)出的毛發(fā)具有“毛色潔白、挺直有峰、彈性好”等優(yōu)良性狀,為制作高檔毛筆的獨(dú)特原料[1-2]?!厩叭搜芯窟M(jìn)展】毛發(fā)生長與毛囊發(fā)育之間存在著密切聯(lián)系,毛囊生長發(fā)育不僅僅影響著絨毛的生長,而且也影響著絨毛的質(zhì)量[3]。毛囊發(fā)育為一個循環(huán)的生物系統(tǒng),包括生長期,退行期和休止期三個階段,并涉及基因調(diào)控的動態(tài)變化[4]。課題組前期轉(zhuǎn)錄組測序篩選出促分裂原活化蛋白激酶的激酶 1(mitogen-activated protein kinase kinase kinase 1, MAP3K1),它是與優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀相關(guān)的候選基因之一,在優(yōu)質(zhì)筆料毛中RPKM(reads per kilobase per million reads)值為8.7731,在非優(yōu)質(zhì)筆料毛個體中RPKM值僅為0.0345,log2Fold Change值為7.49[5]。MAP3K1,又稱MEKK1,是MAPK信號通路中的重要調(diào)控因子。已有的研究發(fā)現(xiàn),MAP3K1除了參與免疫機(jī)制,損傷修復(fù),腫瘤進(jìn)展和骨骼肌生長發(fā)育的調(diào)控外,還在毛發(fā)形成方面起著至關(guān)重要的作用[6]。microRNA 是一種短鏈(20—24 nt)非編碼 RNA,通過與靶基因的mRNA 3′UTR結(jié)合[7-8]進(jìn)而降解或抑制靶基因表達(dá)[9]。miRNAs參與多種生理進(jìn)程,包括組織發(fā)育、器官形成、細(xì)胞生長和凋亡等過程[10-12]。迄今為止,在毛囊發(fā)育過程中鑒定出許多 miRNAs,如 miR-203[13]、miR-let-7a[14]和 miR-196a[15]等對于調(diào)節(jié)毛囊的發(fā)育和再生至關(guān)重要。已有的研究指出,miR-31-5p是與腫瘤相關(guān)的miRNA,miR-31-5p在大腸癌、口腔癌、結(jié)腸腺癌中通過抑制靶基因的轉(zhuǎn)錄或翻譯,促進(jìn)癌細(xì)胞的生長、遷移和侵襲等過程[7,16-17],也有相關(guān)文獻(xiàn)證實(shí) miR-31參與皮膚組織修復(fù),如系統(tǒng)性紅斑狼瘡、傷口愈合等[18]。最近研究表明,miR-31-5p可與RAS p21蛋白激活劑1(RAS p21 protein activator 1, RASA1)的3′UTR結(jié)合,RASA1是RAS / MAPK信號通路的負(fù)調(diào)節(jié)因子,然后激活RAS / MAPK(小鼠皮膚組織中的ERK1 / 2)通路,促進(jìn)細(xì)胞存活[19]?!颈狙芯壳腥朦c(diǎn)】關(guān)于miR-31-5p在長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛形成過程中的作用和調(diào)控機(jī)制以及在毛囊干細(xì)胞中的功能知之甚少?!緮M解決的關(guān)鍵問題】本研究通過驗(yàn)證 miR-31-5p是否直接靶向 RASA1影響MAP3K1,進(jìn)而激活MAPK信號通路,然后調(diào)節(jié)長江三角白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛的形成,為長江三角洲白山羊的分子選育提供理論依據(jù)。
本研究于2019年6月至2020年9月在江蘇省揚(yáng)州大學(xué)動物遺傳繁育與分子設(shè)計重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室完成。
1.1.1 細(xì)胞 本實(shí)驗(yàn)所用毛囊干細(xì)胞分離自江蘇海門種羊場120日胎齡的胎羊頸脊部皮膚組織樣,經(jīng)生理鹽水沖洗3次,75%酒精沖洗3次后,置于DMEM培養(yǎng)液中帶回實(shí)驗(yàn)室進(jìn)行下一步分離操作。
分離試驗(yàn)操作簡要如下:
1)用手術(shù)刀片將組織分割成2×2 mm2的組織塊,加入0.25%胰酶沒過組織塊,37℃ 5% CO2培養(yǎng)箱90 min。加入含 10%胎牛血清培養(yǎng)液替換胰酶消化液,在體視顯微鏡下使用外科神經(jīng)鑷從組織塊中挑出毛囊,并置于培養(yǎng)液中。
2)當(dāng)收集到肉眼可見的米粒大小時,1 200 r/min離心5 min棄上清,加入0.25%胰酶,37℃消化30 min,1 200 r/min 離心5 min棄上清,加入含10%胎牛血清的DMEM培養(yǎng)液,勻漿器勻漿后,過200目細(xì)胞篩,置于37℃ CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),3天后換液并觀察[20]。
1.1.2 主要儀器與試劑 主要儀器:CO2培養(yǎng)箱(美國Thermo Scientific公司);實(shí)時熒光定量PCR儀(美國 ABI 7500/7500 FAST);倒置熒光顯微鏡(德國Leica公司);凝膠成像系統(tǒng)(美國BIO-RAD 公司);臺式高速離心機(jī)(德國 Eppendorf公司);微量紫外可見光度計(美國Thermo Scientific公司)多模式微孔板檢測系統(tǒng)(美國Perkinelmer公司);流式細(xì)胞儀(中國貝克曼公司,細(xì)胞凋亡用);FACSAria SORP流式細(xì)胞儀(美國BD公司,細(xì)胞周期用)。
主要試劑:Cell counting Kit-8(CCK-8)細(xì)胞增殖-毒性檢測試劑盒(日本同仁公司);EdU細(xì)胞增殖檢測試劑盒(廣東銳博生物科技有限公司);Trizol試劑盒、DNA限制性內(nèi)切酶(Hind Ⅲ、XbaⅠ、XhoⅠ和NotⅠ)、DNA連接酶(日本TaKaRa公司);反轉(zhuǎn)錄和PCR熒光定量試劑盒、BCA蛋白濃度測定試劑盒、ECL發(fā)光液(南京諾唯贊生物科技股份有限公司);Opti-MEM 培養(yǎng)液(美國 Gibco公司);Lipofectamine 3000(美國Invitrogen公司);Annexin V-FITC細(xì)胞凋亡檢測試劑盒,細(xì)胞周期與細(xì)胞凋亡檢測試劑盒(上海碧云天生物技術(shù)有限公司);試驗(yàn)所用抗體如下,英國Abcam公司:PCNA(29 kDa,稀釋比例 1∶1000),CDK1(34 kDa,稀釋比例 1∶1000),CCND2(33 kDa,稀釋比例 1∶1000), Bax(21 kDa,稀釋比例1∶5000),β-actin(42 kDa,稀釋比例1∶500);Bcl-2(26 kDa,稀釋比例 1∶1000,美國Proteintech公司);MAP3K1(164 kDa,稀釋比例1∶1000,北京Bioss公司);RASA1(110 kDa,稀釋比例 1∶2000,美國 Affbiotech公司);二抗兔抗羊與羊抗兔抗體(稀釋比例1∶5000,南京Bioworld公司);脫脂奶粉(上海生工生物工程公司);蛋白Maker(美國Thermo Fisher Scientific公司);1×TBST緩沖液的配制:取50 mL 20×TBS(北京索萊寶公司),1 mL Tween-20(美國Diamond公司)加入1 L容量瓶中,超純水定容至1 L;8%分離膠配制(5 mL體系):2.3 mL超純水,1.3 mL 30% Arc-Bis,1.3 mL 1.5 mol·L-1Tris-HCl,50 μL 10% SDS,50 μL 10% APS,3 μL 四甲基乙二胺;5%濃縮膠配制(5 mL體系):3.4 mL超純水,0.83 mL 30%Arc-Bis,0.63 mL 1.0 mol·L-1Tris-HCl,50 μL 10% SDS,50 μL 10% APS,5 μL 四甲基乙二胺。
1.2.1 與MAP3K1相作用的microRNAs的預(yù)測 利用生物信息學(xué)軟件 StrBase(http://starbase.sysu.edu.cn/index.php)、miRDB(http://mirdb.org/index.html)、TargetScan(http://www.targetscan.org/vert_72)和miR-Walk[21](http://mirwalk.umm. uni-heidelberg.de/)、DAVID(https://david.ncifcrf.gov/home.jsp)、KEGG(https://www.genome.jp/kegg/pathway.html)、RNA hybrid(https://bibiserv.cebitec.uni- bielefeld.de/rnahybrid/)預(yù)測與MAP3K1具有靶向關(guān)系的miRNAs,利用在線網(wǎng)站Venny 2.1繪制韋恩圖(https://bioinfogp.cnb.csic.es/tools/venny/index.html),進(jìn)一步篩選與MAP3K1相關(guān)的miRNA。
1.2.2 引物設(shè)計與合成 根據(jù) NCBI核酸數(shù)據(jù)庫(https://www.ncbi.nlm.nih.gov/nuccore/)中公布的山羊MAP3K1(登錄號:XM_018065623.1)和RASA1(登錄號:XM_013965775.2)的mRNA序列,通過Primer 5.0 設(shè)計山羊MAP3K1-CDS區(qū)、RASA1- CDS區(qū)定量引物和MAP3K1-3′UTR、RASA1-3′UTR 引物。miR-31-5p引物采用莖環(huán)法設(shè)計,以 18S rRNA為miRNA內(nèi)參基因,GAPDH為基因內(nèi)參。引物及Mut-MAP3K1由上海生物工程股份有限公司合成。定量引物序列見表1。
表1 熒光定量PCR引物序列Table 1 Primer sequence for qPCR
1.2.3 質(zhì)粒構(gòu)建及轉(zhuǎn)染 按照DNA提取試劑盒說明書提取毛囊干細(xì)胞DNA,通過微量紫外可見光度計測定DNA的質(zhì)量和濃度。以DNA為模板,對miR-31-5p前體、MAP3K1-3′UTR和RASA1-3′UTR序列進(jìn)行擴(kuò)增,構(gòu)建載體引物序列見表2。MAP3K13′UTR突變型位點(diǎn)序列由TCTTGCCA 突變?yōu)?AGAACGGT,RASA1 3′UTR 突變型位點(diǎn)序列由 TCTTGCCA 突變?yōu)镚AGGTATA。將擴(kuò)增后的PCR產(chǎn)物分別通過Hind Ⅲ和Xba I、Xho I和Not I進(jìn)行雙酶切,之后通過T4連接酶連接到pcDNA 3.1(+)或psiCHECK2.0載體上,形成重組質(zhì)粒,將成功連接的重組質(zhì)粒轉(zhuǎn)至Trans 5ɑ感受態(tài)細(xì)胞中,均勻涂布在含氨芐的LB固體培養(yǎng)基上,37℃恒溫培養(yǎng)箱12—16 h。挑選酶連成功菌液,送往生工生物工程(上海)股份有限公司測序。測序鑒定成功的重組質(zhì)粒分別命名為 Wild-MAP3K1、Wild-RASA1、Mut-RASA1、pre-miR-31-5p,其中Mut-MAP3K1由生工生物工程合成。
表2 構(gòu)建載體的引物序列Table 2 Primer sequences used in plasmid construction
將毛囊干細(xì)胞接種于6孔培養(yǎng)板中,待細(xì)胞生長密度達(dá)到 60%—70%時,更換 Opti-MEM 培養(yǎng)液,使用Lipofectamine 3000進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染試驗(yàn),每次試驗(yàn)至少設(shè)置3個重復(fù)。轉(zhuǎn)染48 h后收集細(xì)胞總RNA或蛋白。
計算機(jī)信息化教育已經(jīng)在我國初步發(fā)展起來,但仍遠(yuǎn)遠(yuǎn)不夠。要想深化計算機(jī)信息化教育,我們的政府應(yīng)該詳細(xì)制定相關(guān)的政策并加強(qiáng)引導(dǎo),支持建立專業(yè)計算機(jī)信息化教育機(jī)構(gòu);學(xué)校與企業(yè)之間應(yīng)該加強(qiáng)合作;教師更應(yīng)該轉(zhuǎn)變現(xiàn)有的觀念,加強(qiáng)計算機(jī)信息化學(xué)習(xí),改變教學(xué)方式。相信在不遠(yuǎn)的將來,計算機(jī)信息化教育必將成為我國教育的主流模式,提供更多的專業(yè)人才,使中國在世界科技之林中立于不敗的位置。
1.2.4 qPCR 與Western blot檢測相關(guān)基因表達(dá)水平將 1 μg總 RNA 反轉(zhuǎn)錄成 cDNA,反應(yīng)體系為:2×ChamQ Universal SYBR qPCR Master Mix 10 μL,上、下游引物各 0.6 μL,ddH2O 3.2 μL ,cDNA 0.6 μL。反應(yīng)程序?yàn)椋旱谝徊筋A(yù)變性95℃ 30 s;第二步循環(huán)反應(yīng)95℃ 10 s,60℃ 30 s,共40個循環(huán);第三步融解曲線 95℃ 15 s,60℃ 1 min,95℃ 15 s。利用 2-ΔΔCt方法[22]計算相關(guān)基因的表達(dá)水平。
毛囊干細(xì)胞轉(zhuǎn)染24 h后更換細(xì)胞生長液,培養(yǎng)48 h后參照高效RIPA組織/細(xì)胞裂解液(索萊寶)說明書提取細(xì)胞總蛋白,BCA蛋白濃度測定試劑盒測定不同組間蛋白濃度,將上述蛋白樣品與 6×loading Buffer以5∶1比例混合,98℃變性10 min,每孔上樣量20 μg,經(jīng)割膠,轉(zhuǎn)膜(電流設(shè)置為300 mA,PCNA、CDK1、CCND2、Bax、Bcl-2、β-actin,轉(zhuǎn)膜時40 min;MAP3K1轉(zhuǎn)膜時長180 min;RASA1轉(zhuǎn)膜時長120 min)等步驟后,用含5%的脫脂奶粉的1×TBST封閉1 h,隨后一抗孵育過夜,1×TBST緩沖液潤洗3次,每次10 min;二抗孵育1 h,1×TBST緩沖液潤洗3次,每次10 min。用BIO-RAD顯影,Image Lab 分析蛋白灰度值。
1.2.5 CCK-8 與 EdU法檢測山羊毛囊干細(xì)胞增殖水平 將1×104個細(xì)胞接種于96孔培養(yǎng)板中,每孔添加100 μL培養(yǎng)基,每組9個重復(fù)。37℃ 5% CO2培養(yǎng),24 h后轉(zhuǎn)染,48 h后更換細(xì)胞培養(yǎng)液,每孔添加10 μL CCK-8試劑,繼續(xù)培養(yǎng)4 h用多模式微孔板檢測系統(tǒng)檢測450 nm處OD值。
取1×105個對數(shù)生長期細(xì)胞接種于24孔培養(yǎng)板中,每組3個獨(dú)立重復(fù)。根據(jù)EdU細(xì)胞增殖檢測試劑盒說明書,轉(zhuǎn)染6 h后,換成含有10 μmol·L-1EdU細(xì)胞完全培養(yǎng)基繼續(xù)在37℃ 5% CO2培養(yǎng)箱中培養(yǎng),24 h后換細(xì)胞生長液,48 h之后進(jìn)行細(xì)胞固定、Apollo染色和 DNA染色。染色完成后立即使用熒光顯微鏡進(jìn)行觀測,Image J軟件分析熒光圖片。
1.2.6 流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期與凋亡 細(xì)胞周期檢測:取1×106個對數(shù)生長期細(xì)胞接種于6孔培養(yǎng)板中,24 h進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染,48 h后去除細(xì)胞培養(yǎng)液,經(jīng)胰酶消化后收集到離心管中,室溫1 500 r/min,離心5 min,去上清,加入1 mL提前4℃預(yù)冷的PBS重懸細(xì)胞,再次離心去上清;在樣品管中加入1 mL預(yù)冷的70%乙醇,輕吹混勻,4℃固定24 h;4℃ 1 500 r/min 離心5 min去上清,加入1 mL預(yù)冷的PBS重懸細(xì)胞,再次離心去上清;根據(jù)樣品數(shù)量配制碘化丙啶染色液,每管細(xì)胞樣品加入500 μL碘化丙啶染色液,緩慢并充分重懸細(xì)胞,37℃避光孵育 30 min,隨后使用流式細(xì)胞儀檢測,結(jié)果使用Flowjo軟件分析。
細(xì)胞凋亡檢測:取1×106個對數(shù)生長期細(xì)胞接種于6孔培養(yǎng)板中,同期培養(yǎng)3個中皿用做流式細(xì)胞儀調(diào)節(jié)電壓(空白組,單染FITC,單染PI),24 h后進(jìn)行細(xì)胞轉(zhuǎn)染,待細(xì)胞生長至48 h,把細(xì)胞培養(yǎng)液吸出至一合適離心管中,使用37℃預(yù)熱的PBS潤洗細(xì)胞一次,加入適量胰酶消化細(xì)胞 3 min,加入上步吸出的細(xì)胞培養(yǎng)液,將細(xì)胞輕輕吹打下來,轉(zhuǎn)移至離心管內(nèi),1 500 r/min 離心5 min棄上清,用PBS重懸細(xì)胞并計數(shù);取5—10萬重懸細(xì)胞,1 500 r/min離心5 min棄上清,加入195 μL Annexin V-FITC 結(jié)合液重懸細(xì)胞;加入 5 μL Annexin V-FITC,輕吹混勻;加入 10 μL碘化丙啶染色液,輕吹混勻;室溫避光孵育 10—20 min,隨后使用流式細(xì)胞儀檢測,結(jié)果使用CytExpert軟件分析。
1.2.7 雙熒光素酶報告試驗(yàn) 將HEK293T細(xì)胞接種在24孔板中,待細(xì)胞生長密度至60%—70%時,對細(xì)胞進(jìn)行轉(zhuǎn)染。試驗(yàn)分為2組,每組3個重復(fù)。共轉(zhuǎn)染W(wǎng)ild-MAP3K1 3′UTR載體與pre-miR-31-5p,Wild-RASA1 3′UTR載體與pre-miR-31-5p為過表達(dá)組;共轉(zhuǎn)染W(wǎng)ild-MAP3K1 3′UTR載體與pcDNA 3.1 (+) ,Wild-RASA1 3′UTR 載體與 pcDNA 3.1 (+)為 Control組。轉(zhuǎn)染48 h后,使用試劑盒檢測熒光素酶的相對活性。
使用 StrBase、miRDB、TargetScan和 miRWalk分別預(yù)測出與MAP3K1具有靶向關(guān)系的miRNAs,經(jīng)在線網(wǎng)站對4個數(shù)據(jù)庫中預(yù)測得到的miRNAs進(jìn)行交互繪制韋恩圖[23],如圖1所示。4個數(shù)據(jù)庫中,StrBase中共預(yù)測到 33個 miRNAs,其中只有1個在StrBase被預(yù)測到,1個與TargetScan共同被預(yù)測到,9個與 miRDB共同被預(yù)測到。miRDB中共預(yù)測到262個miRNAs與MAP3K1具有靶向關(guān)系,其中有 89個在 miRDB中單獨(dú)被預(yù)測到,4個與TargetScan共同被預(yù)測到,137個與miRWalk共同被預(yù)測到。TargetScan中共預(yù)測到79個miRNAs,其中有 67個在 TargetScan被預(yù)測到,1個與miRWalk共同被預(yù)測到。miRWalk中共預(yù)測到1 641個miRNAs,其中有1 482個在miRWalk中單獨(dú)被預(yù)測到。3個miRNAs在4個數(shù)據(jù)庫中同時被預(yù)測到,分別是miR-31-5p、miR-21-5p和miR-9-5p。從數(shù)據(jù)庫中的評分以及結(jié)合現(xiàn)有miRNAs在皮膚和毛囊上的研究,最終確定并選用 miR-31-5p作為本試驗(yàn)的研究對象。
將毛囊干細(xì)胞接種于6孔培養(yǎng)板中,分別轉(zhuǎn)染空白組(Control組)、 pcDNA 3.1 (+)、pre-miR-31-5p,48 h后提取細(xì)胞總RNA,qPCR檢測過表達(dá)效率。由圖2-A可知,與Control組相比,轉(zhuǎn)染pcDNA-3.1(+)組無差異(P>0.05),轉(zhuǎn)染pre-miR-31-5p組顯著提高miR-31-5p表達(dá)量(P<0.01),因此后續(xù)試驗(yàn)選用Control組和pre-miR-31-5p組進(jìn)一步研究。
由雙熒光素酶報告基因結(jié)果(圖 2-B)可知,過表達(dá)miR-31-5p后MAP3K1的熒光活性高于Control組(P<0.01)。為了進(jìn)一步驗(yàn)證miR-31-5p與MAP3K1之間的聯(lián)系,結(jié)合生物信息學(xué)分析(TargetScan,DAVID, KEGG),發(fā)現(xiàn)在MAPK信號通路的上游存在一個與 miR-31-5p具有靶向關(guān)系的抑制因子RASA1,在山羊RASA1 mRNA的 3′UTR區(qū)也有一個保守的 miR-31-5p結(jié)合位點(diǎn)。與 Wild-RASA1 3′UTR載體與pcDNA 3.1 (+)組相比,RASA1 3′UTR載體與pre-miR-31-5p共轉(zhuǎn)染組的雙熒光素酶活性極顯著降低(P<0.01,圖2-C)。
這些初步結(jié)果表明,miR-31-5p可以直接靶向RASA1的3′UTR,而不是MAP3K1的 3′UTR。在毛囊干細(xì)胞中進(jìn)一步探究發(fā)現(xiàn)過表達(dá) miR-31-5p抑制了RASA1 mRNA和蛋白的表達(dá),升高了MAP3K1 mRNA和蛋白的表達(dá)(P<0.01,圖2-D,E,F(xiàn))。這些試驗(yàn)結(jié)果證實(shí) RASA1是 miR-31-5p的直接靶基因,抑制RASA1可上調(diào)MAP3K1的表達(dá)水平。
通過CCK-8、EdU、細(xì)胞周期等試驗(yàn)來進(jìn)一步探討過表達(dá)miR-31-5p對毛囊干細(xì)胞增殖功能的影響,結(jié)果如圖 3所示。CCK-8試驗(yàn)結(jié)果顯示,過表達(dá)miR-31-5p后,細(xì)胞活力達(dá)到 1.1,顯著高于對照組(0.8);另外通過 EdU法檢測細(xì)胞增殖能力,發(fā)現(xiàn)過表達(dá) miR-31-5p后,細(xì)胞增殖能力顯著提高(P<0.05)(圖3-A, B, C)。利用流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞周期,結(jié)果發(fā)現(xiàn)Control組G1/G0、S、G2/M期細(xì)胞率分別為 56.81%、12.29% 和 23.88%(圖 3-D);pre-miR-31-5p組G1/G0、S、G2/M期細(xì)胞數(shù)量分別為52.23%、14.38%和24.87%(圖3-E)。與Control組相比,G1/G0期細(xì)胞數(shù)量極顯著下降(P<0.01),S和 G2/M 期細(xì)胞數(shù)量上升,但不存在顯著差異(P>0.05,圖3-F),表明過表達(dá)miR-31-5p減緩毛囊干細(xì)胞在G1期的阻滯。以上結(jié)果表明,過表達(dá)miR-31-5p能促進(jìn)毛囊干細(xì)胞增殖。
利用流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞凋亡率,pre-miR-31-5p組活細(xì)胞數(shù)量(93.8%,圖4-B)相比于Control組(90.1%,圖4-A)顯著上升,而細(xì)胞總凋亡率pre-miR-31-5p組(4.9%)相較于對照組(8.41%)差異極顯著降低(P<0.01,圖4-C),表明過表達(dá)miR-31-5p能顯著抑制毛囊干細(xì)胞凋亡。
以GAPDH為內(nèi)參,運(yùn)用qPCR技術(shù)研究過表達(dá)miR-31-5p對毛囊干細(xì)胞增殖和凋亡相關(guān)基因mRNA表達(dá)量的影響。由圖5-A可知,與Control組相比,pre-miR-31-5p組的增殖相關(guān)基因 PCNA、CDK1、CCND2的mRNA表達(dá)量極顯著升高(P<0.01),促凋亡基因(Bax)的表達(dá)量差異不顯著(P>0.05),抗凋亡基因(Bcl-2)的表達(dá)量極顯著升高(P<0.01)。
結(jié)合Western blot試驗(yàn),以β-actin為內(nèi)參探究過表達(dá)miR-31-5p對增殖和凋亡相關(guān)基因蛋白表達(dá)量的影響。由圖5-B可知,與Control組相比,pre-miR-31-5p組的增殖相關(guān)基因(PCNA、CDK1、CCND2)的蛋白相對表達(dá)量顯著升高(P<0.05),促凋亡基因(Bax)的相對表達(dá)量極顯著降低(P<0.01),抗凋亡基因(Bcl-2)的相對表達(dá)量極顯著升高(P<0.01)。由此可推測,過表達(dá)miR-31-5p能促進(jìn)毛囊干細(xì)胞增殖,抑制毛囊干細(xì)胞凋亡。
已有研究表明毛發(fā)的生長、脫落及修復(fù)依賴于毛囊干細(xì)胞增殖、分化和遷移,且皮膚組織的結(jié)構(gòu)狀態(tài)和毛囊性狀對羊毛品質(zhì)與產(chǎn)量有較大的影響[24]。因此,關(guān)于毛囊干細(xì)胞的生物學(xué)研究逐年增多。
MAP3K1是MAPK信號通路中的核心調(diào)控因子,在細(xì)胞生理過程中(如細(xì)胞增殖、分化,遷移和凋亡)起著重要作用[25]。MAP3K1可編碼磷酸化或激活絲氨酸/蘇氨酸激酶表達(dá)的MAPK激酶,活化的MAPK激酶刺激MAPK信號通路中下游因子,如ERK,MEK,JNK等促進(jìn)細(xì)胞存活[26]。此外,MAP3K1可用作潛在的乳腺癌易感基因座,并參與乳腺癌的發(fā)展進(jìn)程[27]。在課題組前期研究中發(fā)現(xiàn)MAP3K1在優(yōu)質(zhì)筆料毛的形成中起著重要作用,并且在優(yōu)質(zhì)筆料毛山羊個體頸脊部皮膚組織中表達(dá)水平更高[28]。因此,本研究深入研究了與MAP3K1相關(guān)的miRNA分子作用機(jī)制,首先通過生物信息學(xué)預(yù)測和有關(guān)皮膚及毛囊文獻(xiàn)分析,發(fā)現(xiàn)miR-31-5p可能通過靶向MAP3K1參與優(yōu)質(zhì)筆料毛的形成。雙熒光素酶報告基因試驗(yàn),qPCR和Western Blot結(jié)果顯示,與miRNA 靶向mRNA調(diào)節(jié)機(jī)制相比[29],過表達(dá)miR-31-5p后MAP3K1熒光素酶活性和MAP3K1表達(dá)量都顯著增加。綜合上述結(jié)果初步考慮MAP3K1并不是miR-31-5p的直接靶基因。miRNA在機(jī)體內(nèi)的表達(dá)在時間和空間上會有差別,其原因可能是種屬不一,或是環(huán)境影響。為了精確識別miR-31-5p的靶基因及其與MAP3K1之間的關(guān)系,使用在線數(shù)據(jù)庫(TargetScan, KEGG, RNA hybrid),發(fā)現(xiàn)miR-31-5p可以直接靶向RASA1 mRNA的3′UTR區(qū),該基因參與MAPK信號傳導(dǎo)通路,且位于MAP3K1的上游[30]?;谶@些發(fā)現(xiàn),推測miR-31-5p可能會靶向RASA1,然后在優(yōu)質(zhì)筆料毛形成過程中上調(diào)MAP3K1的表達(dá)。qPCR和Western blot結(jié)果表明,過表達(dá)miR-31-5p后RASA1的 mRNA和蛋白表達(dá)水平降低,而MAP3K1表達(dá)水平顯著升高。此外,過表達(dá)miR-31-5p時,RASA1的熒光素酶活性明顯下降,而MAP3K1的熒光素酶活性則顯著高于對照組。這些結(jié)果表明,miR-31-5p可能通過靶向抑制RASA1然后上調(diào)MAP3K1表達(dá)來調(diào)節(jié)優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀的形成。
有文獻(xiàn)指出 miR-31參與細(xì)胞的增殖、凋亡、分化、遷移等多種生理過程,具體如促進(jìn)胚胎著床;在成年脊椎動物中維持骨穩(wěn)態(tài),并調(diào)節(jié)無脊椎動物胚胎的骨骼發(fā)育;在結(jié)腸癌、卵巢癌、肝癌、肺癌等一些癌癥中促進(jìn)癌癥進(jìn)程;還促進(jìn)經(jīng)輻射誘導(dǎo)的細(xì)胞凋亡[31]。研究還發(fā)現(xiàn) miR-31在表皮干細(xì)胞存在的基底層有一定水平的表達(dá)[18],在細(xì)胞損傷狀態(tài)下miR-31的表達(dá)量明顯提高,通過靶向抑制RASA1表達(dá),激活RAS/MAPK信號通路,促進(jìn)非小細(xì)胞肺癌[32]、肝內(nèi)膽管癌細(xì)胞[33]的癌變,炎癥反應(yīng)的發(fā)生[34]及皮膚組織的修復(fù)[18]。在本試驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)在長江三角洲白山羊毛囊干細(xì)胞中過表達(dá)miR-31-5p后,CCK-8與EdU結(jié)果顯示在過表達(dá)miR-31-5p組提升了細(xì)胞活力,促進(jìn)了細(xì)胞增殖。細(xì)胞周期結(jié)果發(fā)現(xiàn)過表達(dá)miR-31-5p后,減少了G1期細(xì)胞數(shù)量,明顯減緩了細(xì)胞G1期阻滯,S期和G2/M期雖無統(tǒng)計學(xué)差異,但仍有高于對照組的趨勢。通過細(xì)胞凋亡試驗(yàn)結(jié)果發(fā)現(xiàn)過表達(dá)miR-31-5p后,活細(xì)胞數(shù)量顯著高于對照組,總凋亡細(xì)胞數(shù)明顯低于對照組。另外本試驗(yàn)還通過驗(yàn)證過表達(dá)miR-31-5p后增殖與凋亡基因相關(guān)表達(dá)量,發(fā)現(xiàn)在轉(zhuǎn)染 miR-31-5p后促進(jìn)了增殖相關(guān)基因、抗凋亡基因的mRNA和蛋白表達(dá),抑制了凋亡基因的mRNA和蛋白表達(dá)。這與現(xiàn)有研究結(jié)果一致,馬金亮等發(fā)現(xiàn)在毛囊干細(xì)胞中干擾MAP3K1后,促進(jìn)了細(xì)胞凋亡[35]。近期也有文獻(xiàn)證實(shí)了在毛囊干細(xì)胞中干擾miR-31-5p后,促進(jìn)了細(xì)胞凋亡,抑制細(xì)胞增殖[36]。另有相關(guān)文獻(xiàn)指出在卵泡生長的過程中,miR-31的過表達(dá)通過靶向卵泡刺激素受體促進(jìn)顆粒細(xì)胞凋亡[37],說明相同的miRNA在不同細(xì)胞中可能發(fā)揮不一樣的調(diào)節(jié)作用。
在本研究中過表達(dá)miR-31-5p通過靶向RASA1影響MAP3K1表達(dá),提高增殖相關(guān)基因(PCNA,CDK1,CCND2)和抗凋亡基因(Bcl-2),降低促凋亡基因(Bax)的表達(dá)來促進(jìn)毛囊干細(xì)胞增殖。CCK-8,EdU、細(xì)胞周期和凋亡分析等結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了過表達(dá)miR-31-5p可提高毛囊干細(xì)胞增殖能力并抑制其凋亡。結(jié)合上述結(jié)果繪制miR-31-5p在毛囊干細(xì)胞中的分子作用機(jī)制圖(圖6)。
研究發(fā)現(xiàn) miR-31-5p直接靶向 RASA1,上調(diào)MAPK信號通路中MAP3K1的表達(dá),進(jìn)而促進(jìn)長江三角洲白山羊毛囊干細(xì)胞增殖,并抑制其凋亡。研究闡明了miR-31-5p參與山羊毛囊干細(xì)胞的增殖和凋亡,為探索調(diào)控長江三角洲白山羊優(yōu)質(zhì)筆料毛性狀的分子形成機(jī)制提供新的見解。