王 偉, 張 宸, 王 志, 張衛(wèi)軍, 王偉偉, 于 亮, 鈕力亞, 王奉芝, 張景儉
(1.滄州市農(nóng)林科學(xué)院/河北省農(nóng)作物耐鹽堿評價與遺傳改良重點實驗室, 河北 滄州 061001;2.滄縣鑫翰種植專業(yè)合作社, 河北 滄縣 061731;3.滄州渤海新區(qū)中捷產(chǎn)業(yè)園區(qū)農(nóng)務(wù)局, 河北 滄州 061108)
小麥?zhǔn)侵匾募Z食作物之一,其產(chǎn)量關(guān)系著國家糧食安全[1]。小麥的銹病和赤霉病嚴(yán)重影響著小麥的豐產(chǎn)性和穩(wěn)產(chǎn)性,導(dǎo)致小麥品質(zhì)下降[2-3]。穗發(fā)芽對小麥的產(chǎn)量和品質(zhì)等方面均有影響,而且小麥穗發(fā)芽抗性易受基因型與環(huán)境因素的共同影響[4-5]。干旱是限制小麥生產(chǎn)主要的非生物逆境脅迫因素之一,對小麥產(chǎn)量要素和品質(zhì)性狀的形成有著嚴(yán)重影響[6-7]。選育和推廣抗病、抗逆的小麥品種是保障國家糧食安全,促進小麥生產(chǎn)可持續(xù)發(fā)展的有效途徑之一。河北省鹽堿地總面積約71.61萬hm2,是我國鹽堿地的主要類型之一[8],旱堿麥?zhǔn)菫I海鹽堿地產(chǎn)出的特色小麥產(chǎn)品[9]。明確河北省旱堿麥優(yōu)質(zhì)、抗病、抗旱和抗穗發(fā)芽等性狀相關(guān)功能基因的組成分布,對于河北省小麥優(yōu)質(zhì)專用旱堿麥的生產(chǎn)以及鹽堿地資源的開發(fā)利用具有重要意義。
小麥籽粒高分子量麥谷蛋白亞基只占小麥貯藏蛋白的10%左右,分別由位于第一同源群染色體長臂上的Glu-A 1、Glu-B 1和Glu-D 1位點的基因編碼[10-11],是決定面粉烘烤品質(zhì)最主要的因素[3]。小麥葉銹病是小麥的重要病害之一,主要通過侵害小麥葉片從而影響光合作用來降低小麥的產(chǎn)量和品質(zhì)[12]。Lr34和Lr68屬于慢銹病基因,抗病效果持久[13]。小麥赤霉病是一種危害性很強的真菌病害,而Fhb1是抗小麥抗赤霉病的主效基因[14]。小麥的穗發(fā)芽抗性主要受種子休眠性、種皮顏色和穎殼抑制物等因素的影響,休眠特性與穗發(fā)芽抗性能力顯著相關(guān)[15]。Tasdr-B1基因?qū)π←溗氚l(fā)芽抗性有重要調(diào)控作用,基因型Tasdr-B1a的發(fā)芽指數(shù)顯著低于Tasdr-B1b,為Tasdr-B1基因的抗穗發(fā)芽單倍型[16-17]。TaPHS1基因?qū)π←溗氚l(fā)芽抗性起正向調(diào)節(jié)作用,可以調(diào)控小麥成熟期的種子休眠性[18]。干旱缺水是影響小麥產(chǎn)量的重要因素,小麥的抗旱性是多個基因共同作用的數(shù)量性狀。Dreb-B1是應(yīng)答干旱脅迫的一個小麥轉(zhuǎn)錄因子[19-20]??购祷騎aSST-A1是一種小麥莖稈水溶性碳水化合物合成基因,可提高小麥粒重和產(chǎn)量[21]。
KASP(Kompetitive Allele Specific PCR)是一項靈活、經(jīng)濟、準(zhǔn)確的SNP檢測方法[22]。目前已利用KASP技術(shù)標(biāo)記了小麥重要性狀如株高,抗病性、抗旱性等相關(guān)功能基因的KASP標(biāo)記,可用于相應(yīng)功能基因的快速分型檢測[23-26]。本試驗利用小麥品質(zhì)基因高分子量谷蛋白亞基、抗病和抗逆性相關(guān)基因的KASP標(biāo)記,對54份河北省旱堿麥品種,進行優(yōu)質(zhì)、抗病和抗逆性狀相關(guān)基因進行單倍型檢測,旨在了解河北省旱堿麥優(yōu)質(zhì)、抗病和抗逆性狀相關(guān)基因的分布情況,篩選含有目標(biāo)基因的優(yōu)異種質(zhì)資源,為河北省鹽堿地上旱堿麥的優(yōu)質(zhì)、抗病、抗逆育種提供試驗材料。
試驗材料為河北省內(nèi)相關(guān)育種單位選育的常規(guī)旱堿麥品種(25份)和收集的農(nóng)家種(29份),共54份,品種信息見表3。
每份材料取10粒種子置于培養(yǎng)皿內(nèi),室內(nèi)超純水培養(yǎng),萌發(fā)后第8天取幼苗葉片放入加有鋼珠的2.0 mL的Eppendorf管中,每個材料3次重復(fù)。將樣品液氮速凍后,在研磨機上研磨成粉狀。利用天根植物基因組DNA提取試劑盒進行DNA提取。
根據(jù)文獻[23],由中玉金標(biāo)記生物技術(shù)股份有限公司合成抗葉銹病、抗赤霉病、抗穗發(fā)芽和品質(zhì)相關(guān)基因等的KASP標(biāo)記引物(表1)。利用KASP 5000 V 4.0 2×MasterMix (LGC公司,英國)進行PCR擴增。PCR反應(yīng)體系為10 μL,包括4.78 μL DNA (5~50 ng/μL),5 μL KASP 5 000 V 4.0 2×MasterMix,0.14 μL KASP Assay Mix,0.08 μL Mg+。KASP Assay Mix是由3條引物的稀釋獲得:先將引物稀釋成100 μmol/L,再按FAM-primer∶HEX-primer∶Common primer∶ddH2O=12∶12∶30∶46的比例混合[17]。PCR反應(yīng)在Bio-Rad CFX 96 PCR儀上進行。每次反應(yīng)設(shè)置4個空白對照組(NTC)。PCR反應(yīng)為降落PCR,反應(yīng)程序為:94 ℃熱處理15 min;94 ℃變性20 s,61~55 ℃退火和延伸60 s 10個循環(huán)(每個循環(huán)下降0.6 ℃);94 ℃變性20 s,55 ℃退火和延伸60 s,26個循環(huán);4 ℃避光保存[25]。待PCR反應(yīng)程序結(jié)束后進行熒光掃描,然后進行基因型分析。
表1 試驗所用的KASP標(biāo)記引物
本研究共檢測了2個品質(zhì)相關(guān)基因Glu-D1和Glu-A1。有15份材料含有Glu-D1基因的高分子量麥谷蛋白亞基5+10,占全部供試材料的68.52%;有32份材料是Glu-A1基因的Ax1orAx2*強筋單倍型,占全部供試材料的59.26%(表2)。
表2 河北省54份旱堿麥品質(zhì)和抗性相關(guān)基因的KASP標(biāo)記檢測
本研究共檢測了3個抗病基因,包括抗葉銹病基因(Lr34和Lr68)和抗赤霉病基因Fhb1。結(jié)果顯示,52份旱堿麥材料中含有抗葉銹病基因Lr34的材料占比為46.20%,在29份農(nóng)家種中的占比高達(dá)86.21%;52份旱堿麥材料中有3份含有抗葉銹病基因Lr68,分別為滄麥12,滄麥14和衡4399;52份旱堿麥材料中有27份含有抗赤霉病基因Fhb1,占比50.00%,而在29份農(nóng)家種中占比高達(dá)86.21%。說明絕大部分小麥農(nóng)家種具有葉銹病和赤霉病抗性。
在抗穗發(fā)芽基因方面,本研究共檢測了4個抗穗發(fā)芽的基因,分別為TaSdr-B1、TaPHS1、TaMoc-A1和TaMFT-A1。有24份材料含TaSdr-B1基因的TaSdr-B1a抗穗發(fā)芽單倍型,占全部供試材料的44.44%;有47份材料含有TaPHS1基因的RioBlancotype抗穗發(fā)芽單倍型,占全部供試材料的87.03%;僅有9份材料含有TaMoc-A1基因的Hap-H抗穗發(fā)芽單倍型,占全部供試材料的16.67%;在所有供試材料中含TaMFT-A1基因的Jagger-type和Zen/2174-type抗穗發(fā)芽單倍型的材料數(shù)分別為10份和28份,分別占全部供試材料的18.52%和51.85%(表2)。
本研究共檢測了3個與小麥抗旱性相關(guān)的基因,分別為COMT-3B、Dreb-B1和TaSST-4A。有44份材料含有COMT-3B基因的3Ba單倍型,占全部供試材料的81.48%;僅有12份材料含有Dreb-B1基因的TaDREB-B1a抗旱單倍型,占全部供試材料的22.22%;有49份材料含有TaSST-4A基因的A2a抗旱單倍型,占全部供試材料的90.74%(表3)。其中,石優(yōu)20、石優(yōu)17、石15鑒21、邯優(yōu)361和衡0628均聚合了這3個小麥抗旱性基因的抗旱單倍型。
表3 河北省54份旱堿麥品質(zhì)和抗性相關(guān)基因KASP標(biāo)記的基因分型
河北省是我國重要的農(nóng)業(yè)生產(chǎn)大省,土壤鹽堿化嚴(yán)重且面積較大,已成為影響河北省農(nóng)業(yè)發(fā)展的主要限制因素之一。培育耐鹽堿農(nóng)作物新品種,利用生物途徑提高作物耐鹽堿能力是有效利用鹽堿耕地的重要途徑。而KASP標(biāo)記技術(shù)穩(wěn)定性好,準(zhǔn)確性高,成本低廉,采用KASP標(biāo)記輔助選擇能顯著提高育種效率。目前,國內(nèi)外研究者利用不同性狀的相關(guān)基因?qū)Σ煌愋偷男←溒贩N進行KASP標(biāo)記分型[23,25]。本研究利用KASP標(biāo)記技術(shù),鑒定出河北省旱堿地小麥的品質(zhì)、抗病性、抗旱性和抗穗發(fā)芽等相關(guān)基因的單倍型,為河北省旱堿麥優(yōu)質(zhì)抗病抗逆育種提供理論依據(jù)。
蛋白質(zhì)作為小麥籽粒的重要貯藏物質(zhì),占籽粒重量的10%~15%,小麥高分子量麥谷蛋白亞基約占小麥貯藏蛋白的10%[27]?;騁luD1和GluA1是其中兩個編碼高分子麥谷蛋白亞基的基因[10],與GluB1基因相互作用,對面筋的彈性起著決定性作用[28]。其中,5+10亞基具有較好的和面特性[29],5+10基因型具有較好的蘭州拉面品質(zhì)[30]。本研究表明,5+10亞基多出現(xiàn)在常規(guī)小麥品種中,29個小麥農(nóng)家種均是2+12 or other單倍型;在Glu-A1基因KASP標(biāo)記檢測結(jié)果中,農(nóng)家種多為Ax1orAx2*強筋單倍型;優(yōu)質(zhì)旱堿麥滄麥119、藁優(yōu)8901和石麥22同時聚合了這2種強筋單倍型。這些研究結(jié)果為河北省優(yōu)質(zhì)旱堿麥育種提供遺傳信息和親本選擇依據(jù)。
河北省旱堿麥農(nóng)家種多攜帶抗赤霉病基因Fhb1[14],而且農(nóng)家種中攜帶抗葉銹基因Lr34的頻率亦較高,說明Fhb1基因和Lr34在旱堿麥農(nóng)家種中分布較高,一定程度上解釋了小麥抗病育種常識中農(nóng)家種抗病性好的原因。這些農(nóng)家種可為河北省旱堿麥抗病育種提供親本材料,是培育小麥抗赤霉病和葉銹病品種的基礎(chǔ)條件。
小麥的抗旱性和穗發(fā)芽抗性是小麥抗逆育種的重要目標(biāo)。河北省的濱海鹽堿地分布廣泛,土地鹽堿化程度高,冬春兩季干旱少雨,獨特的環(huán)境條件使得旱堿麥抗逆性較好。在穗發(fā)芽抗性的KASP標(biāo)記檢測中,在29份農(nóng)家種中,有23份材料含有TaSdr-B1基因的TaSdr-B1a抗穗發(fā)芽單倍型;有27份材料含有TaPHS1基因的RioBlancotype抗穗發(fā)芽單倍型;僅有2份材料含有TaMoc-A1基因的Hap-H抗穗發(fā)芽單倍型;有24份材料含有TaMFT-A1基因的Zen/2174-type抗穗發(fā)芽單倍型;白葫蘆頭和大紅芒均含有這4種抗穗發(fā)芽的單倍型(表3)。對于小麥抗旱性KASP標(biāo)記的檢測中,大部分材料含有COMT-3B基因的3Ba抗旱單倍型和TaSST-4A基因的A2a抗旱單倍型(表3)。其中,石優(yōu)20、石優(yōu)17、石15鑒21、邯優(yōu)361和衡0628均聚合了本文中3個小麥抗旱性基因的抗旱單倍型。這可能是河北省旱堿麥尤其是農(nóng)家種多具有抗旱性和穗發(fā)芽抗性的原因,或許也與旱堿麥長期適應(yīng)外界環(huán)境條件有關(guān)。這些檢測結(jié)果,可為小麥抗逆性育種提供種質(zhì)資源。