姚 妹 馮藝杰 夏 雨 周棟明 金佳寧 魏 佳 崔易沁 毛姍姍
浙江大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬兒童醫(yī)院神經(jīng)內(nèi)科 國(guó)家兒童健康與疾病臨床醫(yī)學(xué)研究中心(浙江杭州 310052)
脊髓性肌萎縮癥[spinal muscular atrophy,SMA,OMIM:#253300(SMA 1)、#253550(SMA 2)、#253400(SMA3)、#271150(SMA4)]是一種以進(jìn)行性、對(duì)稱性肌萎縮和肌無(wú)力為主要特征的常染色體隱性遺傳神經(jīng)肌肉疾病,發(fā)病率為1/10000~1/6000,人群攜帶率約1/50。其致病機(jī)制為運(yùn)動(dòng)神經(jīng)元存活(spinal muscular neuron gene 1,SMN1)基因純合缺失或變異[1-2],95%患者為SMN1第7外顯子純合缺失,另5%則為SMN 1第7 外顯子缺失合并雜合性點(diǎn)突變或其他變異類型。SMN2作為SMN1高度同源基因,與之僅有5 個(gè)堿基的差異,其中1 個(gè)堿基位于編碼區(qū),即SMN2第7號(hào)外顯子第6位氨基酸c.840T,而SMN 1為c.840 C,兩者的高度同源性增加了變異位點(diǎn)的區(qū)分難度[3-6]?,F(xiàn)階段,SMA常規(guī)基因檢測(cè)方法多重連接探針擴(kuò)增技術(shù)(multiplex ligation-dependent probe amplification,MLPA)僅可檢出SMN1純合缺失即0 拷貝,疑似復(fù)合雜合變異患者則需經(jīng)長(zhǎng)片段PCR擴(kuò)增技術(shù)或TA克隆確診點(diǎn)突變,但以上方法無(wú)法有效識(shí)別出SMN1 2拷貝位于同一條染色體,另一條染色體SMN1丟失的“2+0”型隱性遺傳病攜帶者,極易造成診斷延誤,增加家系再發(fā)風(fēng)險(xiǎn)[7]。本研究報(bào)告1例罕見(jiàn)的復(fù)合雜合變異SMA-Ia型患兒的臨床及家系遺傳學(xué)資料,探討排查隱性遺傳病攜帶者重要性,提高疾病認(rèn)知,力爭(zhēng)早期識(shí)別并評(píng)估其子代患病風(fēng)險(xiǎn),指導(dǎo)遺傳咨詢,保證健康生育。
患兒,男,2月齡,漢族,因出生后哭聲低弱、四肢無(wú)力就診于浙江大學(xué)兒童醫(yī)院(具體時(shí)間軸見(jiàn)圖1)?;純合礕 1 P 1,足月順產(chǎn),出生體質(zhì)量3 400 g,生后即哭,哭聲弱,無(wú)窒息史,Apgar 評(píng)分均10 分。父母體健,非近親婚配,否認(rèn)遺傳病家族史,母孕期無(wú)異常。體格檢查:神清,精神可,哭聲低弱,前囟平軟,頸軟,心肺腹無(wú)異常;四肢自發(fā)活動(dòng)少,四肢肌力Ⅱ級(jí),肌張力低下,雙跟膝腱反射未引出,雙側(cè)巴氏征陰性。輔助檢查:血常規(guī)、血?dú)怆娊赓|(zhì)、生化、血氨均正常。頭顱MRI 未見(jiàn)明顯異常,肌電圖示脊髓前角細(xì)胞病變。綜合患兒典型臨床表現(xiàn)及輔助檢查,高度疑診SMA。
圖1 先證者及其家系診斷、隨訪時(shí)間軸
為明確病因,經(jīng)醫(yī)院醫(yī)學(xué)倫理會(huì)審查批準(zhǔn)(No.2019-IRB-171)及家屬簽署知情同意書(shū)后,采集患兒及其父母外周血行MLPA 檢測(cè)。結(jié)果顯示先證者SMN1為1拷貝,SMN2為2拷貝,其父母SMN1均為2拷貝(圖2)。推測(cè)患兒屬SMA復(fù)合雜合變異,依據(jù)《脊髓性肌萎縮癥遺傳學(xué)診斷專家共識(shí)》診斷流程,應(yīng)用SMN1特異性長(zhǎng)片段PCR結(jié)合巢式PCR探查點(diǎn)突變,結(jié)果發(fā)現(xiàn)患兒SMN 1存在c.22_23 insA變異(圖3)。進(jìn)一步通過(guò)Sanger 測(cè)序?qū)純弘p親進(jìn)行驗(yàn)證,患兒母親存在c.22_23insA變異(圖4),父親未檢出該位點(diǎn)致病變異,確證點(diǎn)突變遺傳自母親。故綜合應(yīng)用MLPA、Sanger 測(cè)序及長(zhǎng)片段PCR 結(jié)合巢式PCR 確診該患兒屬SMN 1“1d+0”型復(fù)合雜合變異(1d:c.22_23insA,ACMG變異分類屬致病性變異),其母親為“1+1d”型隱性遺傳病攜帶者,一代驗(yàn)證明確點(diǎn)突變遺傳于母親。同時(shí),患兒SMN 1另一條等位基因的缺失原因有待明確,由于患兒父親SMN 1亦為2 拷貝,根據(jù)基因遺傳規(guī)律,考慮父親SMN 1為“1+1”或“2+0”基因型可能。因此采集家系三代其他成員外周血行MLPA 技術(shù),結(jié)果顯示患兒祖父SMN1拷貝數(shù)為1,祖母及姑姑SMN1均為3拷貝(圖2),進(jìn)一步通過(guò)短串聯(lián)重復(fù)序列(short tandem repeat,STR)的家系連鎖分析法確證患兒父親為SMN 1“2+0”型的特殊隱性遺傳病攜帶者(圖5)。
圖2 先證者及其家系MLPA 結(jié)果
圖3 先證者長(zhǎng)片段PCR 結(jié)合巢式PCR 結(jié)果
圖4 先證者母系家系成員Sanger 測(cè)序驗(yàn)證c.22_23insA 變異結(jié)果
圖5 先證者三代家系10 位成員STR 連鎖分析圖
根據(jù)本例患兒起病年齡及SMN 2拷貝數(shù),確診其屬型SMA。雖因家庭經(jīng)濟(jì)條件限制,患兒未能接受疾病修正藥物諾西那生鈉注射治療,但我院立即予其多學(xué)科管理與個(gè)體化指導(dǎo),包括呼吸、消化營(yíng)養(yǎng)及康復(fù)訓(xùn)練等各系統(tǒng)照護(hù),并對(duì)該家系進(jìn)行隨訪、疾病健康教育及遺傳咨詢。對(duì)該家系隨訪2年,期間患兒發(fā)生肺部感染4次,最終因呼吸道感染、呼吸衰竭于6月齡死亡。先證者去世1個(gè)月后其母親再次妊娠,并于孕8周時(shí)經(jīng)絨毛穿刺行產(chǎn)前診斷,結(jié)果提示胎兒未攜帶變異位點(diǎn),排除SMA患者可能,于2021年1月生育1名健康女?huà)耄壳耙?1月齡,運(yùn)動(dòng)發(fā)育正常。
SMA位居2歲以下嬰幼兒致死致殘性疾病首位,2018年列入我國(guó)《第一批罕見(jiàn)病目錄》。根據(jù)起病年齡和可達(dá)到的最大運(yùn)動(dòng)能力,臨床分為0 型、Ⅰ型、Ⅱ型、Ⅲ型和Ⅳ型,兒童期常見(jiàn)Ⅰ、Ⅱ型與Ⅲ型,其中以生后3個(gè)月內(nèi)起病的Ⅰa型病情最為嚴(yán)重,多伴有嚴(yán)重肌無(wú)力、肌張力低下、頭控弱等表現(xiàn),無(wú)法獨(dú)坐,常因肋間肌薄弱、吞咽吸吮困難、胃食管反流等問(wèn)題并發(fā)吸入性肺炎甚至呼吸衰竭,無(wú)藥物治療及多學(xué)科管理支持下其生存期常低于2年[8-9]。國(guó)內(nèi)外SMA 診斷專家共識(shí)明確指出基因檢測(cè)可確診該疾病,并以MLPA技術(shù)為其診斷金標(biāo)準(zhǔn)。然而MLPA技術(shù)僅可明確診斷SMN 1純合缺失患者,當(dāng)SMN 1拷貝數(shù)≥1 時(shí),需進(jìn)一步行長(zhǎng)片段PCR 結(jié)合巢式PCR或RT-克隆測(cè)序驗(yàn)證其是否為復(fù)合雜合變異患者[10]。此外,MLPA技術(shù)無(wú)法區(qū)分SMN1均為2拷貝的“1+1”型正常人與“2+0”型隱性遺傳病攜帶者,這亦將增加遺傳咨詢的假陰性,致使SMA 患兒出生,給家庭及社會(huì)帶來(lái)沉重負(fù)擔(dān)。因此及早識(shí)別復(fù)合雜合變異,排查隱性遺傳病攜帶者有利于SMA 精準(zhǔn)診治,基于家系框架圖開(kāi)展高質(zhì)量的遺傳咨詢,促進(jìn)健康生育。
本例患兒以生后哭聲低弱、四肢無(wú)力典型臨床特征起病,肌電圖提示脊髓前角細(xì)胞病變,臨床高度疑診SMA。MLPA結(jié)果顯示患兒SMN1拷貝數(shù)為1,進(jìn)一步經(jīng)長(zhǎng)片段PCR結(jié)合巢式PCR確證患兒SMN1存在致病變異位點(diǎn)c.22_23insA(p.Ser8LysfsX23),診斷該患兒為復(fù)合雜合變異(1d+0)。本例患兒屬型,起病后6 個(gè)月去世,生存時(shí)間短,符合疾病自然病史特點(diǎn)。國(guó)外研究報(bào)道諾西那生鈉可顯著降低型患兒病死率、提高運(yùn)動(dòng)里程碑[11-12],我國(guó)仍缺乏藥物治療SMA 的真實(shí)世界數(shù)據(jù),隨著藥物納入國(guó)家醫(yī)保,未來(lái)有望使更多型患兒獲得疾病修正治療機(jī)會(huì)。
本研究對(duì)先證者家系三代共10 位成員進(jìn)行基因檢測(cè)。通過(guò)STR 連鎖分析和Sanger 測(cè)序明確診斷患兒雙親均為隱性遺傳病攜帶者,其母親SMN 1為“1d+1”型1 d:c.22_23 insA(p.Ser 8 LysfsX 23),父親為罕見(jiàn)的“2+0”型,患兒SMN 1基因第7 號(hào)外顯子缺失遺傳自父親,另一條SMN 1基因突變位點(diǎn)遺傳自母親。根據(jù)文獻(xiàn)報(bào)道,c.22_23 insA(p.Ser 8 LysfsX 23)位點(diǎn)致病性明確,為中國(guó)人群最常見(jiàn)的變異位點(diǎn)之一,占比37.5%,該變異為編碼肽鏈22 號(hào)及23 號(hào)堿基之間插入1 個(gè)腺嘌呤,進(jìn)而導(dǎo)致絲氨酸轉(zhuǎn)變?yōu)橘嚢彼?,并在新閱讀框的第23位產(chǎn)生終止密碼子,通過(guò)蛋白質(zhì)截短或無(wú)義介導(dǎo)的mRNA 衰變導(dǎo)致SMN 蛋白功能喪失[13]。而“2+0”基因型屬SMA特殊類別的攜帶者,其人群攜帶率僅為5%~8%[14],但現(xiàn)階段金標(biāo)準(zhǔn)MLPA 技術(shù)并不能區(qū)分“2+0”基因型與“1+1”基因型。本研究聯(lián)合應(yīng)用MLPA 技術(shù)、長(zhǎng)片段PCR 結(jié)合巢式PCR、Sanger測(cè)序與STR連鎖分析多種檢測(cè)技術(shù),最終明確先證者及其家系SMN1基因型,確證先證者為SMA復(fù)合雜合變異患者,并發(fā)現(xiàn)其父母雙方均為特殊類型的隱性遺傳病攜帶者,該種家系遺傳物質(zhì)的傳遞組合方式尚未見(jiàn)報(bào)道。Alías等[15]在一項(xiàng)涉及1 562例的SMN1“2+0”基因型攜帶者篩查隊(duì)列中發(fā)現(xiàn),僅3個(gè)家系雙親中存在“2+0”型,其中2 個(gè)家系父母雙方SMN1基因型均為“2+0”型。Ar Rochmah等[16]檢測(cè)33 例SMA 患者及其家系的SMN1拷貝數(shù),發(fā)現(xiàn)僅2例父母攜帶2個(gè)SMN1拷貝,其中1例純合缺失SMA患者母親基因型為“2+0”型,父親為“1+0”型;另1例則為復(fù)合雜合變異者“0+1d”型,其父親為“1+1d”型,母親為“1+0”型。我國(guó)學(xué)者在一項(xiàng)中國(guó)SMA患者家系SMN 1“2+0”基因型攜帶者研究中共確定了9個(gè)家系中的 10 例個(gè)體為“2+0”基因型攜帶者[17]??偨Y(jié)國(guó)內(nèi)外有關(guān)隱性遺傳病攜帶者的研究報(bào)告發(fā)現(xiàn),其報(bào)道的所有“2+0”基因型攜帶者家系內(nèi)均為純合缺失SMA患者。本例患兒的父母雙親為特殊類型隱性遺傳病攜帶者,該家系遺傳特點(diǎn)在常規(guī)SMA攜帶者篩查中極易漏診,明確特殊家系基因遺傳方式,可避免家系再發(fā)SMA患者?;诰珳?zhǔn)的家系遺傳學(xué)診斷與詳盡的遺傳咨詢,先證者母親再次妊娠并行產(chǎn)前診斷未發(fā)現(xiàn)胎兒攜帶相同致病位點(diǎn),排除胎兒為SMA 患者可能,最終順利孕育1 名健康女?huà)搿?/p>
對(duì)于復(fù)合雜合變異患者,合理應(yīng)用MLPA 聯(lián)合長(zhǎng)片段PCR結(jié)合巢式PCR可實(shí)現(xiàn)疾病早期診斷,縮短患者治療的時(shí)間窗。針對(duì)隱性遺傳病攜帶者,尤其是雙親SMN 1均為2 拷貝而患兒為復(fù)合雜合變異者,更應(yīng)高度警惕特殊家系遺傳可能,為降低SMA隱性遺傳病攜帶者殘留風(fēng)險(xiǎn),建議應(yīng)用多態(tài)標(biāo)記以提高“2+0”基因型的特殊隱性遺傳病攜帶者檢出率,以真正實(shí)現(xiàn)SMA 三級(jí)預(yù)防,減少出生缺陷,提高人口素質(zhì)。