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RUNX3調(diào)控胃癌細(xì)胞對(duì)曲妥珠單抗耐藥的機(jī)制:基于超效高液相色譜-四極桿/靜電場(chǎng)軌道阱質(zhì)譜的代謝組學(xué)分析

2022-05-06 07:19:40劉文虎湯建才常晉霞
關(guān)鍵詞:谷氨酰胺代謝物耐藥

人表皮生長(zhǎng)因子受體2(HER2)是由原癌基因ErbB2編碼的跨膜蛋白,通過(guò)受體二聚體或激酶區(qū)磷酸化激活PIK/AKT/mTOR等信號(hào)途徑,參與調(diào)控腫瘤的發(fā)生、發(fā)展及耐藥。HER2不僅是胃癌化療的重要靶標(biāo),也是選擇化療方式的參考指標(biāo),同時(shí)也是監(jiān)測(cè)化療效果的預(yù)后分子。曲妥珠單抗是靶向HER2的人源單克隆抗體,作為HER2陽(yáng)性胃癌化療的靶向藥物,其通過(guò)拮抗HER2信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)及抗體依賴細(xì)胞介導(dǎo)的細(xì)胞毒作用發(fā)揮抗腫瘤作用。盡管曲妥珠能夠延長(zhǎng)晚期胃癌患者的總生存期,然而伴隨化療出現(xiàn)的腫瘤獲得性耐藥已不可避免。因此,研究胃癌曲妥珠耐藥機(jī)制、闡明逆轉(zhuǎn)耐藥策略對(duì)提高化療有效性具有現(xiàn)實(shí)意義。

③建設(shè)單位要進(jìn)一步加強(qiáng)對(duì)施工單位水土保持措施施工的管理,特別是在簽訂施工合同時(shí)就應(yīng)該注明各水土保持措施的工程量等;施工單位則應(yīng)該合理安排各工序的施工順序,注意施工順序的合理性。

Runt相關(guān)轉(zhuǎn)錄因子3(RUNX3)屬于Runt結(jié)構(gòu)域家族成員,在腫瘤增殖、分化及腫瘤微環(huán)境中具有重要生物學(xué)功能。近年來(lái),有關(guān)RUNX3突變與腫瘤耐藥的研究備受關(guān)注,然而RUNX3與胃癌曲妥珠耐藥的關(guān)系尚未闡明。我們的前期研究顯示,曲妥珠耐藥胃癌細(xì)胞RUNX3與DNA 的結(jié)合活性顯著增加,敲除RUNX3可逆轉(zhuǎn)其耐藥,然而代謝水平RUNX3是通過(guò)何種途徑調(diào)控胃癌細(xì)胞對(duì)曲妥珠耐藥,尚不明確。因此,本實(shí)驗(yàn)以胃癌曲妥珠耐藥細(xì)胞(NCI N87R)及RUNX3敲除細(xì)胞(NCI N87R/RUNX3)為研究對(duì)象,基于超高液相色譜-四極桿/靜電場(chǎng)軌道阱質(zhì)譜的代謝組學(xué)研究NCI N87R/RUNX3細(xì)胞的代謝特征變化,結(jié)合生物信息學(xué)及功能驗(yàn)證闡釋RUNX3在胃癌曲妥珠耐藥細(xì)胞中的代謝調(diào)節(jié)作用。

1 材料和方法

1.1 主要儀器與試劑

1290型超高效液相色譜系統(tǒng)(Agilent),Q Exactive Focus四極桿/靜電場(chǎng)軌道阱質(zhì)譜儀和Heraeus Freco17型離心機(jī)(Thermo Fisher);BSA124S-CW型電子天平(Sartorius);JXFSPRP-24型研磨儀(上海凈信);Milli-Q 超純水系統(tǒng)(Millipore);PS-60AL超聲儀(雷邦電子);ACQUITY UPLC HSS T3(Waters)。甲醇、乙腈、乙酸銨、甲酸為HPLC級(jí)(CNW Technologies),L-2-氯苯丙氨酸(上海恒柏),曲妥珠抗體(羅氏制藥),谷胱甘肽及輔酶Ⅱ檢測(cè)試劑盒(碧云天),其它試劑均為分析純。

1.2 樣本制備及代謝物提取

人源胃癌細(xì)胞NCI N87由國(guó)家蛋白質(zhì)科學(xué)中心惠贈(zèng),NCI N87R及NCI N87R/RUNX3為自建細(xì)胞系,細(xì)胞培養(yǎng)于含10%胎牛血清的DMEM 培養(yǎng)液,NCI N87R和NCI N87R/RUNX3培養(yǎng)時(shí)加入80 μg/mL的曲妥珠。將細(xì)胞均分為2組,一組用于細(xì)胞計(jì)數(shù),另一組用于實(shí)驗(yàn)。計(jì)數(shù)細(xì)胞用PBS洗2次,胰酶消化,充分混勻后計(jì)數(shù)。同法收集實(shí)驗(yàn)組細(xì)胞,PBS 洗2 次,加入1 mL PBS,用細(xì)胞刮刮取細(xì)胞,收集細(xì)胞懸液,按計(jì)數(shù)細(xì)胞對(duì)實(shí)驗(yàn)細(xì)胞數(shù)折算,確保各樣本含有相同的細(xì)胞數(shù)且不少于1×10/mL。取等量細(xì)胞懸液,離心,細(xì)胞沉淀經(jīng)液氮速凍后轉(zhuǎn)移至-80 ℃保存。按文獻(xiàn)方法提取代謝物,簡(jiǎn)單來(lái)說(shuō),細(xì)胞沉淀加入1 mL預(yù)冷甲醇-乙腈-水(2∶2∶1,)混合提取液(含內(nèi)標(biāo)L-2氯苯丙氨酸為1 μg/mL),震蕩30 s;加鋼珠2粒,45 Hz研磨2 min,冰水浴超聲3 min,-20 ℃靜置1 h,4 ℃、12 000離心10 min,上清經(jīng)0.22 μm微孔濾膜過(guò)濾,質(zhì)譜檢測(cè)。取等體積待檢樣本(30 μL),充分混合作為質(zhì)控(QC)樣本。

1.3 色譜及質(zhì)譜條件

采用SPSS21.0 軟件進(jìn)行數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)量資料以均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差表示,組間比較采用獨(dú)立樣本檢驗(yàn),<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

質(zhì)譜條件:ESI離子源,正負(fù)離子電壓分別為4.0 kV和-3.6 kV;毛細(xì)管溫度400 ℃;掃描范圍70~1000 m/z;鞘氣流速45 Arb;輔助氣流速15 Arb;全掃分辨率70 000;二級(jí)分辨率17 500;多級(jí)模式循環(huán)碰撞能為30±15 V。

目前,國(guó)內(nèi)外對(duì)湖泊沉積物污染狀況的評(píng)價(jià)尚缺乏統(tǒng)一的評(píng)價(jià)方法和標(biāo)準(zhǔn),本研究采用綜合污染指數(shù)法和有機(jī)污染指數(shù)法評(píng)價(jià)洞庭湖表層沉積物的污染狀況,這兩種方法常被用于湖泊沉積物污染評(píng)價(jià)研究。

1.4 數(shù)據(jù)預(yù)處理、統(tǒng)計(jì)分析及差異代謝物辨識(shí)

依據(jù)試劑盒檢測(cè)NCI N87R與NCI N87R/RUNX3細(xì)胞GSH/GSSG水平。每組設(shè)定6個(gè)復(fù)孔,利用酶標(biāo)儀檢測(cè)412 nm 處吸光值,測(cè)定含量并計(jì)算GSH/GSSG。

正負(fù)離子所有QC 樣本的變異偏差在±2 std(圖1A、B),QC 樣本呈正相關(guān)且相關(guān)系數(shù)r≥0.98(圖1C、D)。PCA顯示,正負(fù)離子所有QC處于95%置信區(qū)間,且代表各樣本的點(diǎn)緊密聚集(圖2A、D)。正負(fù)離子下QC內(nèi)標(biāo)的RSD分別為4.47%和3.68%。

數(shù)據(jù)導(dǎo)入MetaboAnalyst 5.0進(jìn)行多變量分析,所有變量經(jīng)均值中心化和pareto scaling標(biāo)度化處理。用非監(jiān)督的主成分分析(PCA)建立分類模型,觀察樣本組間聚類趨勢(shì)及離群樣本,采用有監(jiān)督的偏最小二乘法判別分析(PLS-DA)建立模型,并對(duì)模型進(jìn)行7次循環(huán)交互驗(yàn)證及200次置換檢驗(yàn),R2表示模型穩(wěn)定性,Q2表示模型預(yù)測(cè)能力,并依據(jù)PLS-DA模型中變量投影重要性(VIP)篩選對(duì)模型分組貢獻(xiàn)較大的變量;進(jìn)而使用獨(dú)立樣本檢驗(yàn)和倍數(shù)變化(FC)篩選差異變量,選擇VIP>1、FC≥1.2或FC≤0.83且<0.05的變量作為差異變量。使用OSI-SMMS(達(dá)碩信息技術(shù))數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行差異代謝物辨識(shí),根據(jù)分子質(zhì)荷比、保留時(shí)間及二級(jí)質(zhì)譜裂解信息對(duì)碎片離子匹配度打分,分值大于0.7的代謝物視為定性準(zhǔn)確,依據(jù)HMDB數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)外源性、藥源性物質(zhì)剔除。

將差異代謝物導(dǎo)入MetaboAnalyst 5.0數(shù)據(jù)庫(kù)作通路分析,剔除>0.05及通路影響值PIV<0.1的通路,顯示8條通路在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞顯著變化,其中谷氨酰胺代謝變化最顯著(=2.1×10),其次為煙酸-煙酰胺及甘油磷脂代謝(=3.7×10,=9.0×10),谷胱甘肽、精氨酸-脯氨酸代謝顯示較小的值(=0.001,=0.002);而丙氨酸-天冬氨酸-谷氨酸代謝具有最高的通路影響值(PIV=0.621),其次為谷氨酰胺(PIV=0.510);煙酸-煙酰胺和谷胱甘肽代謝的PIV 分別為0.429 和0.368(圖4,表2)。

廣西與東盟國(guó)家的跨境人民幣結(jié)算量增長(zhǎng)趨勢(shì)順應(yīng)雙邊進(jìn)出口貿(mào)易持續(xù)上漲趨勢(shì),且在2016年進(jìn)出口貿(mào)易增速下降的趨勢(shì)下仍能保持總量增加的態(tài)勢(shì)。但從增速看,2015年和2016年速度明顯放緩,后勁不足。

1.5 通路富集分析與聚類分析

基于MetaboAnalyst 5.0數(shù)據(jù)庫(kù)對(duì)差異代謝物進(jìn)行通路富集分析,富集方法為Fisher's Exact Test;拓?fù)鋵W(xué)方法為Relative-betweeness Centrality;富集數(shù)據(jù)庫(kù)為KEGG。聚類算法為Pearson correlation 和Average linkage clustering。

1.6 還原型/氧化型谷胱甘肽(GSH/GSSG)測(cè)定

數(shù)據(jù)經(jīng)ProteoWizard 轉(zhuǎn)為mzML 格式,利用XCMS(參數(shù)設(shè)置如下:profmethos:binlin;method:centWave;ppm:60;peakwidth:8~30 scans;prefilter:9(3,100);noise threshold:20;mzdiff:0.05 amu)進(jìn)行保留時(shí)間校準(zhǔn)、峰識(shí)別、峰匹配、峰積分,刪除缺失值超過(guò)50%的變量,生成包括質(zhì)荷比(m/z)、保留時(shí)間(RT)及峰面積的數(shù)據(jù)矩陣,采用最小值法填充缺失值,樣本總面積法歸一化。數(shù)據(jù)采集前連續(xù)檢測(cè)QC樣本3次,并在每組樣本檢測(cè)結(jié)束后插入QC 1次,檢測(cè)過(guò)程每7個(gè)樣本插入QC 1次,將QC數(shù)據(jù)中相對(duì)標(biāo)準(zhǔn)偏差(RSD)>30%的變量剔除。

1.7 還原性/氧化性輔酶II(NADPH/NADP)測(cè)定

細(xì)胞計(jì)數(shù)后加入200 μL NADPH/NADP提取液,吹打促使細(xì)胞完全裂解,4 ℃、12 000離心10 min,收集上清,依據(jù)試劑盒檢測(cè)450 nm處NADPH/NADP。

1.8 統(tǒng)計(jì)學(xué)方法

色譜條件:1290型超高液相色譜儀搭載HSS T3色譜柱(2.1 mm×100 mm,1.8 μm),正離子模式:流動(dòng)相A為0.1%甲酸-水;流動(dòng)相B為乙腈;負(fù)離子模式:流動(dòng)相A為5 mmol/L乙酸銨-水;流動(dòng)相B為乙腈。洗脫條件:0~1 min,1%B;1~8 min,99%B;8~10 min,99%B;10~10.1 min,1%B;10.1~12.0 min,1%B;流速0.5 mL/min;柱溫35 ℃,自動(dòng)進(jìn)樣器溫度4 ℃;進(jìn)樣量為5 μL。

2 結(jié)果

2.1 質(zhì)控分析

根據(jù)工程投資估算和運(yùn)行收益分析,1臺(tái)1000 MW機(jī)組汽輪機(jī)回?zé)嵯到y(tǒng)優(yōu)化投資費(fèi)用總計(jì)1075萬(wàn)元,機(jī)組運(yùn)行綜合收益306.7萬(wàn)元/a,靜態(tài)投資回收期約為3.5 a,具有較高的經(jīng)濟(jì)性。

2.2 代謝輪廓分析

公司一切進(jìn)入正軌,許多事情都不用周橋親力親為,他只需最后拍板,按理說(shuō)他應(yīng)該開(kāi)心才對(duì),但事實(shí)恰好相反,他什么事情都要操心,員工們給的意見(jiàn)他也不愛(ài)聽(tīng),總覺(jué)得屬下不聽(tīng)他的話。

2.3 差異代謝物篩選及鑒定

根據(jù)火山圖結(jié)合VIP值鑒定差異代謝物81個(gè)(圖3A,B),其中正離子42個(gè),負(fù)離子39個(gè)(表1)。采用熱圖顯示差異代謝物的變化水平,其中43 個(gè)代謝物在NCI N87R/RUNX3中顯著增加,38個(gè)代謝物顯著降低(圖3C);代表性化合物的質(zhì)譜鑒定(圖3D,E)。

2.4 代謝通路富集分析

企業(yè)在國(guó)外的海外施工項(xiàng)目涉及的領(lǐng)域范圍比較廣,同時(shí)也要求管理人員具有扎實(shí)的物資管理方面的經(jīng)驗(yàn),還需要具備一定的語(yǔ)言溝通能力,了解到國(guó)際市場(chǎng)和國(guó)際貿(mào)易過(guò)程中的相關(guān)的政策以及相關(guān)的法規(guī)方面的基本常識(shí)。同時(shí),也有效的應(yīng)對(duì)海外項(xiàng)目施工現(xiàn)場(chǎng)管理過(guò)程中出突發(fā)情況,及時(shí)有效的處理相關(guān)的情況,可以推動(dòng)項(xiàng)目施工工程的順利發(fā)展,也是現(xiàn)代國(guó)外項(xiàng)目進(jìn)行的一大趨勢(shì),施工現(xiàn)場(chǎng)的管理人員需要全面加強(qiáng)相關(guān)方面的學(xué)習(xí),比如語(yǔ)言、市場(chǎng)營(yíng)銷、法律法規(guī)等方面知識(shí)的學(xué)習(xí)可以提高相關(guān)的管理人員的專業(yè)發(fā)水平。

2.5 敲除RUNX3導(dǎo)致NCI N87R細(xì)胞代謝失調(diào)

富集結(jié)果顯示,NCI N87R/RUNX3細(xì)胞中谷氨酰胺通路代謝物,包括谷氨酰胺、谷氨酸、ADP、AMP、GMP、腺嘌呤、次黃嘌呤、鳥(niǎo)嘌呤核苷及鳥(niǎo)嘌呤的水平降低(<0.001);從代謝物水平看,谷氨酰胺、鳥(niǎo)嘌呤水平回調(diào)至親本細(xì)胞相應(yīng)代謝物水平;而ADP、AMP、次黃嘌呤和鳥(niǎo)嘌呤核苷低于親本細(xì)胞相應(yīng)代謝物水平(圖5A)。NCI N87R/RUNX3細(xì)胞糖酵解代謝物磷酸二羥丙酮(DHAP)、三磷酸甘油酸(G3P)和磷酸烯醇丙酮酸(PEP)顯著降低(<0.001),且與親本細(xì)胞相應(yīng)代謝物水平相當(dāng)(圖5B);嘧啶代謝物UMP、尿嘧啶及UDP顯著增加(<0.001),且向敏感細(xì)胞相應(yīng)代謝物水平轉(zhuǎn)歸,而乳清酸鹽與敏感細(xì)胞變化相反(圖5C);脯氨酸-精氨酸通路中SMA、脯氨酸、肌酸和瓜氨酸水平均升高(<0.001,圖5D)。

2.6 NCI N87R/RUNX3 細(xì) 胞GSH/GSSG 及NADPH/NADP降低

試劑盒檢測(cè)結(jié)果顯示,NCI N87R細(xì)胞GSH/GSSG及NADPH/NADP 比值較親本細(xì)胞顯著增加(圖6A,B),而NCI N87R/RUNX3細(xì)胞GSH/GSSG比值較耐藥組顯著降低(<0.05,圖6A),NADPH/NADP的比值趨于降低(=0.07,圖6B)。

結(jié)果顯示,組間PCA分離明顯,組內(nèi)樣本聚集良好(圖2A、D)。PLS-DA模型顯示,正離子模式44.4%的變量(R2X)可解釋NCI N87R與NCI N87R/RUNX3組間99.7%的差異(R2Y),交叉有效性驗(yàn)證預(yù)測(cè)能力為95.1%[Q2(cum)](圖2B);負(fù)離子模式45.1%的變量(R2X)可解釋NCI N87R 與NCI N87R/RUNX3 組間99.8%的差異(R2Y),交叉有效性驗(yàn)證預(yù)測(cè)能力為95.8%[Q2(cum)](圖2E),兩種模式下R2(Y)與Q2(cum)的差值小于0.3,Q2(cum)大于50%。置換檢驗(yàn)顯示,正負(fù)離子R2Y建模值與真實(shí)值(綠色圖)組成的回歸線截距分別為0.735和0.752;Q2建模值與真實(shí)值(藍(lán)色圖)組成的回歸線截距分別為-0.526和-0.591(圖2C、F)。

2.7 差異代謝物-調(diào)控基因網(wǎng)絡(luò)分析

基于OmicsNet數(shù)據(jù)庫(kù)構(gòu)建差異代謝物-調(diào)控基因的關(guān)系,結(jié)果顯示,整個(gè)網(wǎng)絡(luò)由65個(gè)節(jié)點(diǎn)分子(Nodes)和127條邊界線(Edges)構(gòu)成,其中節(jié)點(diǎn)包括23種代謝物和42個(gè)調(diào)控基因,其中谷氨酸、AMP及ADP組成網(wǎng)絡(luò)的中心(圖7A)。在此基礎(chǔ)上,構(gòu)建谷氨酰胺代謝通路子網(wǎng)絡(luò),發(fā)現(xiàn)谷氨酰胺的3 個(gè)調(diào)控基因GLS、NADSYN1和GNPNAT1在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞中的表達(dá)均降低(圖7B)。而谷氨酸被13個(gè)基因所調(diào)控,其中表達(dá)上調(diào)基因3個(gè)(PLCB3、NFKB1和TSTD1),下調(diào)基因10 個(gè)(GLS、NADSYN1、GNPNAT1、GLA、CALB2、GCA、BIRC5、BCL2、GGH 和ASS1),其中GLS、NADSYN1和GNPNAT1為谷氨酸和谷氨酰胺共同調(diào)控基因。SRC 為AMP、ADP、GMP、鳥(niǎo)嘌呤核苷和鳥(niǎo)嘌呤的共調(diào)節(jié)基因。此外,還發(fā)現(xiàn)了鳥(niǎo)嘌呤核苷、鳥(niǎo)嘌呤、GMP、AMP 的調(diào)控基因,其中多數(shù)基因在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞中表達(dá)下調(diào)(圖7B)。甘油磷脂、煙酸-煙酰胺及丙氨酸-天冬氨酸-谷氨酰胺代謝紊亂,這些通路均與能量代謝中心三羧酸(TCA)循環(huán)密切相關(guān)(圖8)。

3 討論

腫瘤耐藥極具復(fù)雜性和異質(zhì)性,而代謝失調(diào)是導(dǎo)致其耐藥的重要特征和直接體現(xiàn)。因此,探究耐藥細(xì)胞失調(diào)的代謝特征,不僅有助于深入了解腫瘤細(xì)胞增殖的原因,而且能夠?yàn)槟孓D(zhuǎn)腫瘤耐藥提供依據(jù)。本研究顯示,敲除RUNX3可導(dǎo)致耐藥細(xì)胞代謝途徑改變,其中谷氨酰胺代謝及糖酵解途徑抑制;而嘧啶、精氨酸-脯氨酸代謝激活;甘油磷脂、煙酸-煙酰胺及丙氨酸-天冬氨酸-谷氨酰胺代謝紊亂,這些通路均與能量代謝中心三羧酸(TCA)循環(huán)密切相關(guān)。此外,與細(xì)胞氧化還原穩(wěn)態(tài)相關(guān)的谷胱甘肽代謝抑制,包括GSH/GSSG 和NADPH/NADP比值降低,提示能量代謝紊亂及氧化還原穩(wěn)態(tài)改變可能是RUNX3逆轉(zhuǎn)NCI N87R細(xì)胞對(duì)曲妥珠單抗耐藥的潛在機(jī)制。

谷氨酰胺代謝為腫瘤細(xì)胞糖酵解及氧化磷酸化提供了原料,也可通過(guò)調(diào)控糖、脂質(zhì)、蛋白質(zhì)代謝穩(wěn)態(tài)誘導(dǎo)腫瘤耐藥。谷氨酰胺經(jīng)轉(zhuǎn)運(yùn)體轉(zhuǎn)入細(xì)胞,并在谷氨酰胺酶(GLS)、谷氨酸脫氫酶(GDH)及天冬氨酸轉(zhuǎn)氨酶催化下轉(zhuǎn)化為α-酮戊二酸,后者不僅為其它代謝提供了中間產(chǎn)物,而且為TCA循環(huán)提供能量。另一方面,α-KG催化逆向生成乙酰輔酶A,可作為脂質(zhì)合成原料,從而影響脂質(zhì)代謝。作為線粒體催化酶,GLS在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞的表達(dá)下降,且谷氨酸和谷氨酰胺水平降低,說(shuō)明谷氨酰胺代謝受到抑制,這不僅對(duì)耐藥細(xì)胞能量代謝產(chǎn)生影響,而且影響其它通路發(fā)生改變,提示抑制谷氨酰胺代謝是RUNX3逆轉(zhuǎn)胃癌曲妥珠耐藥的潛在機(jī)制。

谷子:① 草本植物,是我國(guó)北方的糧食作物;② 谷子的沒(méi)有去殼的籽實(shí),也叫粟,有的地區(qū)叫粟子。(注:②中的“谷子”應(yīng)該改為“這種植物”)

作為維持機(jī)體氧化還原系統(tǒng)穩(wěn)態(tài)的關(guān)鍵小分子活性肽,GSH通過(guò)調(diào)節(jié)代謝酶的活性維持GSH與GSSG的水平以達(dá)到胞內(nèi)氧化還原平衡,然而,持續(xù)高水平的GSH導(dǎo)致腫瘤細(xì)胞DNA修復(fù)能力增強(qiáng),進(jìn)而促進(jìn)其耐藥。因此,降低GSH或者靶向GSH系統(tǒng)代謝酶可有效逆轉(zhuǎn)腫瘤耐藥。相比NCI N87R細(xì)胞,盡管GSH、GSSG在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞中的水平增加,然而GSH/GSSG降低,提示GSH系統(tǒng)在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞具有復(fù)雜的調(diào)節(jié)機(jī)制。GSH系統(tǒng)還可通過(guò)調(diào)節(jié)NADPH/NADP水平維系胞內(nèi)氧化還原平衡,而GSH/GSSG及NADPH/NADP降低提示NCI N87R/RUNX3細(xì)胞氧化應(yīng)激增加,還原勢(shì)下降。

能量代謝重編程是腫瘤耐藥的顯著特征之一,盡管糖酵解產(chǎn)生的ATP凈值不及氧化磷酸化多,然而腫瘤細(xì)胞仍以高速率的糖酵解為主要方式,以獲得增殖所需的ATP,且糖酵解代謝中間體在代謝調(diào)控及抵抗氧化應(yīng)激方面具有重要作用。雖然本實(shí)驗(yàn)構(gòu)建的網(wǎng)絡(luò)關(guān)系中沒(méi)有發(fā)現(xiàn)調(diào)控糖酵解的相關(guān)基因,然而糖酵解關(guān)鍵分子DHAP、G3P及PEP在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞顯著降低,提示敲除RUNX3導(dǎo)致耐藥細(xì)胞糖酵解抑制。

核苷酸代謝失衡不僅與腫瘤發(fā)生及轉(zhuǎn)移有關(guān),而且可通過(guò)影響代謝酶的表達(dá)促進(jìn)腫瘤耐藥。作為核苷酸代謝的重要組成部分,嘧啶代謝為腫瘤細(xì)胞DNA、RNA的合成提供了原料,其產(chǎn)生的β-丙胺酸及β-氨基異丁酸是腫瘤代謝所需的營(yíng)養(yǎng)物質(zhì);精氨酸-脯氨酸代謝與腫瘤免疫及轉(zhuǎn)移能力關(guān)系密切。相比耐藥細(xì)胞,NCI N87R/RUNX3細(xì)胞嘧啶、精氨酸-脯氨酸通路分子的水平顯著增加,推測(cè)這些代謝物可能對(duì)NCI N87R/RUNX3細(xì)胞起到能量代償作用。此外,胞磷膽堿、磷酸二羥丙酮、膽堿、乙酰膽堿和磷酸甘油酸在NCI N87R/RUNX3細(xì)胞中顯著增加,而溶血性磷脂酰膽堿水平降低,說(shuō)明NCI N87R/RUNX3細(xì)胞甘油磷脂代謝發(fā)生了紊亂。綜上所述,本研究表明,敲除RUNX3對(duì)胃癌曲妥珠耐藥細(xì)胞代謝產(chǎn)生重要影響,而了解這些代謝特征有助于進(jìn)一步認(rèn)識(shí)RUNX3在胃癌曲妥珠耐藥中的作用。

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