顧順心,姜 琴,施鵬飛
(江蘇海洋大學(xué) 環(huán)境與化學(xué)工程學(xué)院,江蘇 連云港 222005)
藥物治療是目前臨床治療腫瘤的重要手段之一,開發(fā)具有獨特療效的抗腫瘤藥物一直是藥物研發(fā)領(lǐng)域的熱點。順鉑(CDDP)是最早臨床應(yīng)用的金屬抗腫瘤藥物[1],該藥物因具有廣譜抗腫瘤活性和高治愈率而在多種癌癥治療中表現(xiàn)不俗[2-4],特別是針對睪丸癌的治療,它使睪丸癌患者的死亡率從100%降到10%以下[5]。但順鉑類藥物也存在嚴重的毒副作用[6],且容易產(chǎn)生耐藥性、水溶性小、在體內(nèi)不易代謝,因此迫切需要開發(fā)新型金屬抗腫瘤替代藥物,以減少鉑類藥物毒副作用和交叉耐藥性帶來的問題。
很多銥(Ⅲ)配合物因具有較強的細胞滲透能力以及獨特的抗腫瘤活性,而引起生物醫(yī)藥領(lǐng)域研究人員的廣泛關(guān)注[7-9]。不僅如此,銥(Ⅲ)配合物還表現(xiàn)出優(yōu)異的發(fā)光性能,包括激發(fā)/發(fā)射波長易于調(diào)節(jié)、量子產(chǎn)率高、斯托克斯位移值大、發(fā)光壽命長、光穩(wěn)定性好等特點,使其在發(fā)光材料研究領(lǐng)域也備受青睞[10-11]。鑒于發(fā)光銥(Ⅲ)配合物所具有的光學(xué)特性,可采用激光共聚焦顯微鏡來追蹤其在腫瘤組織內(nèi)的攝入、分布與代謝狀態(tài),這將有助于研究者明確銥(Ⅲ)配合物抗腫瘤的靶分子與作用機理。另外,部分配合物在光激發(fā)下還可在腫瘤細胞內(nèi)誘導(dǎo)生成具有強氧化性能的活性氧(ROS)物種,導(dǎo)致細胞壞死或凋亡。目前發(fā)光銥(Ⅲ)配合物已經(jīng)作為一類非常有潛力的腫瘤光動力學(xué)治療的光敏劑[12]而被廣泛研究。
Ye等[13]的研究表明,Ir(Ⅲ)配合物對多種癌細胞表現(xiàn)出強抗增殖活性(強于順鉑類藥物),甚至對順鉑耐藥細胞株也有很好的藥效;該配合物具有強磷光發(fā)射性能,利用激光共聚焦顯微成像技術(shù)發(fā)現(xiàn)配合物能夠有效地滲透到Hela細胞中;對線粒體的形態(tài)進行實時監(jiān)控發(fā)現(xiàn),配合物能誘導(dǎo)線粒體損傷從而殺死癌細胞。Yang等[14]研究表明,半三明治型Ir(Ⅲ)配合物對A549細胞表現(xiàn)出良好的抗癌活性(IC50=4.7 μmol/L),該配合物能靶向并破壞A549細胞的溶酶體,從而導(dǎo)致細胞死亡。Liu等[15]研究表明環(huán)金屬化銥配合物具有雙重(轉(zhuǎn)移抑制和溶酶體損傷)抗癌機制:配合物通過血清白蛋白及靜電力猝滅機制進行運輸,且能有效地阻止癌細胞的轉(zhuǎn)移,擾亂細胞周期G0/G1期,從而誘導(dǎo)細胞凋亡;配合物通過能量依賴性細胞攝取機制,有效積累在溶酶體中,誘導(dǎo)溶酶體損傷,最終導(dǎo)致細胞死亡。Liu等[16]將四苯乙烯基團引入Ir(Ⅲ)配位單元,得到的系列配合物對癌細胞和正常細胞具有一定的選擇性;不同結(jié)構(gòu)的配合物其抗腫瘤機制有所不同:部分配合物不僅可以催化NADH轉(zhuǎn)變?yōu)镹AD+,還可以誘導(dǎo)ROS富集。Lu等[17]報道了末端含芘基團的雙核三聯(lián)吡啶銥配合物,該配合物表現(xiàn)出強光毒性和相對較弱的暗毒性;配合物能在細胞內(nèi)生成ROS,導(dǎo)致肺癌細胞A549和人皮膚癌細胞A431的線粒體和溶酶體功能損傷,以細胞凋亡的方式促使細胞壞死。Kuang等[18]報道了一種以蒽醌三聯(lián)吡啶衍生物作為主配體的Ir(Ⅲ)配合物,該配合物在雙光子PDT治療厭氧腫瘤方面具有非常良好的應(yīng)用前景。該配合物在缺氧條件下經(jīng)還原酶還原后,發(fā)光性能顯著增強,且在近紅外雙光子光激發(fā)下具有很高的穩(wěn)定性;輻照后,配合物可以誘導(dǎo)產(chǎn)生碳自由基,促進線粒體膜電位降低與細胞死亡(光激發(fā)下IC50=2.1 μmol/L, 黑暗中IC50=58.2 μmol/L,PI=27.7);體內(nèi)有A549癌細胞的雄性小鼠注射給藥后,經(jīng)雙光子激發(fā)照射(730 nm, 50 mW, 1 kHz, 脈沖寬35 fs, 5 s/mm),2 d后小鼠體重沒有明顯變化,14 d后小鼠體內(nèi)的腫瘤組織顯著減小。Pracharova等[19]報道的配合物對順鉑耐藥的腫瘤細胞表現(xiàn)出一定的生長抑制活性;研究發(fā)現(xiàn),抗腫瘤活性并非基于DNA損傷,而是通過優(yōu)先靶向內(nèi)質(zhì)網(wǎng)并抑制蛋白翻譯過程從而殺死腫瘤細胞;配合物表現(xiàn)出良好的PDT活性,可見光照可使IC50值降低兩個數(shù)量級。
本文中未特別指明的化學(xué)品都來源于商業(yè)采購并直接使用,小牛胸腺DNA(ct-DNA)和牛血清蛋白(BSA)從Sigma-Aldrich公司購買。所有合成的化合物均在真空干燥器(CaSO4)中干燥后再進行結(jié)構(gòu)表征。核磁數(shù)據(jù)(1H NMR)采用500 MHz Bruker DMX采集,利用四甲基硅烷(TMS)做內(nèi)標(biāo)。質(zhì)譜數(shù)據(jù)用Agilent 1290-6545 LC/MS質(zhì)譜儀采集。紫外-可見吸收光譜用UV-3100記錄,熒光光譜用Hitachi F-7000記錄。ct-DNA的濃度用紫外光譜標(biāo)定(ε260 nm=6 600 L/(mol·cm))。在Tris-HCl的緩沖溶液中(pH=7.42),260 nm和280 nm處紫外吸光度的比值為1.87,表明DNA中已完全去除了蛋白質(zhì)雜質(zhì)。稱取一定量牛血清蛋白BSA,用Tris-HCl緩沖液溶解,配制濃度為2×10-4mol/L的儲備液,置于4 ℃保存。
NNC配體及其Ir(Ⅲ)配合物合成路線見圖1。
圖1 NNC配體及其Ir(Ⅲ)配合物的合成路線
1.2.1N,N-二羥乙基苯甲醛的合成與表征 將52 gN,N-二(2-羥乙基)苯胺溶于70 g吡啶中,加入90 g乙酸酐后在90 ℃下攪拌24 h,冷卻至室溫,用400 mL水洗滌后用200 mL乙酸乙脂萃取。乙酸乙酯溶液用無水硫酸鎂干燥,減壓蒸除溶劑,得油狀物N,N-二乙酸乙酯基苯胺(化合物a)。1H NMR(CDCl3,500 MHz),δ:7.2(2H),6.8(3H),4.3(4H),3.6(4H),2.1(6H)。
將40 g POCl3在0 ℃攪拌滴入50 mL DMF中,溶液變?yōu)榈t色油狀物。0 ℃繼續(xù)攪拌15 min后,將50 gN,N-二乙酸乙酯基苯胺溶于30 mL 1,2-二氯乙烷并滴入淡紅色油狀物中,滴完后升溫至90 ℃,攪拌3 h得墨綠色混合溶液。冷至室溫后,倒入碎冰中攪拌,用質(zhì)量分數(shù)30%的K2CO3溶液將溶液pH調(diào)節(jié)至6~8,得到黃色固體N,N-二乙酸乙酯基苯甲醛(化合物b)。1H NMR(CDCl3,500 MHz),δ:9.6(1H),7.7(2H),6.8(2H),4.2(4H),3.6(4H),2.0(6H)。
取15 gN,N-二乙酸乙酯基苯甲醛溶解于含有12.5 g氫氧化鈉的250 mL乙醇水溶液(乙醇與水體積比為175∶75)中,攪拌7 h后用稀鹽酸(4 mol/L)調(diào)節(jié)pH至8~9。將溶液蒸干后用乙酸乙酯洗滌3遍,蒸除乙酸乙酯,得黃色油狀固體。柱層析(硅膠柱,展開劑為體積比1∶1的乙酸乙酯和石油醚)后得到黃色粉末N,N-二羥乙基苯甲醛(化合物c),產(chǎn)率90%。1H NMR(CDCl3,500 MHz),δ:9.65(1H),7.71(2H),6.71(2H),3.91(5H)。
1.2.2 配體PhbpyOH的合成與表征 將2.9 g(14 mmol)N,N-二羥乙基苯甲醛、1.68 g(14 mmol)苯乙酮和2.24 g(56 mmol)質(zhì)量分數(shù)10%的NaOH水溶液在常溫下攪拌12 h后,用二氯甲烷萃取,無水硫酸鎂干燥后,旋蒸去除溶劑,得到2.2 g紅色油狀物(化合物d),產(chǎn)率為50.57%。
將11.8 g(50 mmol)I2溶于72 mL吡啶中,加熱到60 ℃至完全溶解,再加入7.1 g(58.7 mmol)2-乙?;拎?,升溫至95 ℃,反應(yīng)3 h,靜置冷卻后析出固體。將固體濾出后用CH2Cl2洗滌,得到7.28 g灰色固體吡啶嗡鹽(化合物e),產(chǎn)率44.7%。
將2.2 g(7 mmol)化合物d和2.3 g(7 mmol)化合物e溶于100 mL甲醇,回流反應(yīng)30 min后分3批加入3.27 g NH4Ac,繼續(xù)回流24 h后靜置冷卻,用乙酸乙酯萃取后干燥,旋蒸除去溶劑得棕色油狀物。柱層析(硅膠柱,展開劑為體積比4∶1的乙酸乙酯和石油醚)后得到黃色粉末(化合物PhbpyOH),產(chǎn)率為14%。1H NMR(CDCl3,500 MHz),δ:8.70(t,1H),8.67(d,1H),8.57(d,1H),8.20(d,2H),7.93(d,1H),7.88(td,1H),7.74(d,2H),7.47(t,1H),7.38~7.31(m,1H),6.77(d,2H),4.17~3.96(m,2H),3.88(t,4H),3.64(t,4H)。
1.2.3 配合物Ir-NNC的合成與表征 將397 mg(2.56 mmol)的2-苯基吡啶、764 mg(1.28 mmol)的三氯化銥水合物和20 mL乙二醇水溶液(V(乙二醇)∶V(水)=3∶1)的混合溶液置于Schlenk管中,N2保護下120 ℃加熱回流24 h。反應(yīng)結(jié)束后冷卻至室溫析出沉淀,離心過濾得到黃色粉末,依次用水(3×20 mL)、乙醇(3×10 mL)和乙醚(3×10 mL)分別洗滌,真空干燥后得到543.8 mg[Ir(bpy)2Cl]2(化合物f)。
將100 mg(0.093 mmol)化合物f和76.57 mg(0.186 mmol)PhbpyOH溶于30 mL二氯甲烷與甲醇的混合溶液(V(二氯甲烷)∶V(甲醇)=1∶1)中,65 ℃下回流反應(yīng)24 h,全程N2保護且避光處理。反應(yīng)結(jié)束后減壓蒸除溶劑,得到橙色固體。將橙色固體溶于30 mL水中,加入150 mg NH4PF6固體后繼續(xù)攪拌30 min,過濾收集橙色沉淀物,依次用水(3×20 mL)、乙醇(3×10 mL)和乙醚(10 mL)洗滌,真空干燥后得到橙色粉末(化合物Ir-NNC)72.4 mg,產(chǎn)率為37.2%。表征結(jié)果為1H NMR(d6-丙酮,500 MHz),δ:9.07(d,1H),9.03(d,1H),8.28(td,J=8.1 Hz,1H),8.11(dd,J=8.5 Hz,2H),8.01(ddd,5H),7.93(td,J=7.9 Hz,1H),7.76(d,1H),7.70(dd,1H),7.65~7.59(m,1H),7.41~7.36(m,1H),7.27(ddd,1H),7.23~7.17(m,1H),7.01~6.94(m,3H),6.92(td,1H),6.86~6.60(m,5H),6.58~6.53(m,1H),6.35(td,1H),6.02(dd,1H),5.65(dd,1H),4.23(t,2H),3.89~3.73(m,4H),3.70(t,4H)。ESI-MS(+p),m/z=912.289 1,可指認為[Ir(ppy)2PhbpyOH]+的分子離子峰。
配體PhbpyOH的單晶通過其在溶劑(V(乙酸乙酯)∶V(石油醚)=1∶1)中緩慢揮發(fā)得到。選取表面光滑、無裂紋、大小合適的單晶,置于帶有石墨單色器的Bruker APEX CCD X-ray衍射儀上,于296 K下使用MoKα(k=0.071 073 nm)射線收集衍射數(shù)據(jù),使用Bruker APEX2[20]和Bruker SAINT[21]程序進行衍射數(shù)據(jù)的收集和還原。使用Olex2[22]軟件進行晶體解析。Olex2.Solve程序?qū)ε潴wPhbpyOH晶體結(jié)構(gòu)進行初解, 并使用SHELXTL-2018[23]程序?qū)w結(jié)構(gòu)進行精修獲得非氫原子坐標(biāo)和各向異性參數(shù),氫原子由理論計算方法得到。CCDC:2125620。
配體和配合物的DFT計算采用Gaussian 09程序包進行,利用B3LYP密度泛函理論對分子結(jié)構(gòu)進行了優(yōu)化。在基態(tài)和激發(fā)態(tài)優(yōu)化的基礎(chǔ)上,運用TDDFT方法研究了激發(fā)態(tài)的電子性質(zhì)。在計算過程中,配體的所有原子采用 6-31g(d)基組,配合物采用了6-31g(d)(H,O,N,C)/LANL2DZ(Ir)混合基組。
在體外使用9,10-蒽二基-二(亞甲基)二丙二酸ABDA作為1O2指示劑,用功率為6 W的紫外燈在365 nm處激發(fā)配合物Ir-NNC(初始濃度為10 μmol/L)的乙腈溶液,每間隔10 s記錄一次ABDA的吸光度(418 nm處)。采用不含配合物的ABDA的乙腈溶液作為對照試驗,采用Ru(bpy)3Cl2(ΦΔ=0.56)敏化ABDA為參考,計算Ir-NNC敏化ABDA的量子產(chǎn)率。量子產(chǎn)率計算公式為
其中:sam表示配合物Ir-NNC;std表示Ru(bpy)3Cl2;S表示ABDA吸光度圖的斜率;F表示吸收校正因子,F(xiàn)=1-10-OD(OD為Ru(bpy)3Cl2和配合物的光密度)。
雙光子激發(fā)熒光光譜使用鎖模鈦寶石激光器(Coherent Mira900F)作為激發(fā)光源,脈沖持續(xù)時間200 fs,重復(fù)頻率76 MHz,采用單掃描條紋相機(Hamamastu C5680-01)及單色儀記錄雙光子熒光信號。樣品溶于DMSO,濃度1.0×10-3mol/L。
采用Autodock程序?qū)ε浜衔锱cDNA(或BSA)之間的相互結(jié)合進行模擬。Ir-NNC的結(jié)構(gòu)通過DFT(B3LYP)方法優(yōu)化得到,DNA(PDB ID 1BNA)和BSA(PDB ID 4f5sBSA)的分子結(jié)構(gòu)從蛋白質(zhì)數(shù)據(jù)庫中獲得(http://www.rcsb.org/pdb)。在建模時,DNA-Ir-NNC的網(wǎng)格盒大小為6.8 nm×7.6 nm×12.6 nm,網(wǎng)格間距為0.037 5 nm。BSA-Ir-NNC的網(wǎng)格盒大小為15.0 nm×6.6 nm×10.4 nm,網(wǎng)格間距為0.1 nm。運用拉馬克遺傳算法(LGA)計算結(jié)合在DNA/BSA上的Ir-NNC可能出現(xiàn)的構(gòu)象,進行100次GA運算,其他參數(shù)使用默認值。利用Pymol軟件分析結(jié)合自由能最低的構(gòu)象的對接結(jié)果。
配體分子的X-ray單晶衍射結(jié)構(gòu)如圖2a所示,配合物經(jīng)DFT優(yōu)化的結(jié)構(gòu)如圖2b所示。
從圖2a可以看出,純配體PhbpyOH中的兩個吡啶環(huán)與苯環(huán)具有一定的共平面性,最大偏差為24.63°。而在配合物Ir-NNC中,由于配位中心的位阻效應(yīng),PhbpyOH中的苯環(huán)平面與聯(lián)吡啶平面的夾角增大,達到74.75°。從Ir-NNC的DFT優(yōu)化的結(jié)構(gòu)(圖2b)可以看出,PhbpyOH中的苯環(huán)沒有參與配位,這與質(zhì)譜結(jié)果是一致的。Ir(Ⅲ)配位中心采取畸變的正八面體結(jié)構(gòu),其中的Ir—N鍵長與文獻[24]報道的結(jié)果接近。
a 配體的單晶衍射結(jié)構(gòu)
配體和配合物的紫外-可見吸收光譜見圖3。配體PhbpyOH在250~400 nm范圍內(nèi)呈現(xiàn)出3個吸收帶,分別是不同共軛體系之間的π→π*躍遷所致。配合物中n→π躍遷的吸收帶的強度明顯增加且發(fā)生了一定的紅移。與Ir(Ⅲ)配位后,配體PhbpyOH中的π→π*躍遷強度顯著降低,且配合物在415 nm處新出現(xiàn)一個強吸收峰,可歸屬為金屬到配體的荷移躍遷(MLCT)。
圖3 配體和配合物的紫外-可見吸收光譜
為了進一步明確配體和配合物中激發(fā)態(tài)的能級與結(jié)構(gòu),采用TDDFT進行了結(jié)構(gòu)優(yōu)化和分子軌道能量計算,結(jié)果如圖4所示。PhbpyOH的HOMO軌道電子云主要集中在N,N-(2羥乙基)氨基、苯基、多聯(lián)吡啶基團的中心吡啶環(huán)區(qū)域內(nèi),LUMO軌道電子云主要集中在聯(lián)吡啶部位,分子中的N,N-(2羥乙基)氨基是強給電子基團,而聯(lián)吡啶基團起到吸電子的作用,這種D-π-A結(jié)構(gòu)有利于分子內(nèi)的電荷轉(zhuǎn)移。結(jié)合上述紫外-可見吸收光譜圖可知,261 nm處的吸收帶可歸屬于多吡啶基團的π→π*的躍遷吸收(HOMO-1→LUMO),而345 nm處的吸收帶則歸屬于配體整個分子的π→π*躍遷吸收(HOMO→LUMO)。在配合物Ir-NNC中,HOMO軌道電子云主要集中在PhbpyOH的聯(lián)吡啶區(qū)域上,HOMO-2軌道電子云主要集中在PhbpyOH的N,N-(2羥乙基)氨基、苯基基團上,而LUMO軌道電子云主要集中在苯基吡啶Ir(Ⅲ)配位單元上,HOMO→LUMO表現(xiàn)出明顯的MLCT特性。
圖4 配體和銥配合物的分子軌道
配體PhbpyOH和配合物Ir-NNC在多種溶劑中都呈現(xiàn)出較強的熒光發(fā)射,如圖5所示。對比化合物在不同極性的溶劑中的熒光發(fā)射峰,發(fā)現(xiàn)它們都呈現(xiàn)明顯的溶致變色現(xiàn)象,表明配體和配合物的激發(fā)態(tài)都具有一定的極性且都呈現(xiàn)出電荷轉(zhuǎn)移發(fā)光。溶劑極性的增加促使溶劑分子與溶質(zhì)分子的偶極—偶極相互作用增強,使激發(fā)態(tài)的能量降低,造成熒光光譜發(fā)生紅移。與配體PhbpyOH(λem=518 nm,DMSO)比較,在同一溶劑中配合物Ir-NNC(λem=621 nm,DMSO)的最大熒光發(fā)射波長發(fā)生了明顯的紅移,而且熒光發(fā)射強度降低約1/2。表明Ir(Ⅲ)的配位對配體的電子云結(jié)構(gòu)產(chǎn)生了巨大的影響。
a 配體
不僅如此,配體和配合物在760 nm的飛秒激光激發(fā)下,還表現(xiàn)出雙光子激發(fā)熒光效應(yīng)(TPEF),如圖6所示。相同的測試條件下,配合物Ir-NNC在DMSO溶液中的雙光子激發(fā)熒光相較配體PhbpyOH的峰值紅移約40 nm,但發(fā)光強度要明顯弱于PhbpyOH。配體PhbpyOH在DMSO中的最大TPEF發(fā)射波長位于528 nm,與其在DMSO中的單光子激發(fā)熒光(OPEF)相比,紅移了約10 nm,這主要是由于在TPEF測量時樣品濃度遠大于OPEF的(約為150倍),造成了熒光的再吸收作用所致[25]。配合物Ir-NNC的TPEF峰位于567 nm處,其相對于OPEF譜帶的峰藍移了50 nm,說明單光子激發(fā)與雙光子激發(fā)具有不同的激發(fā)態(tài)能級和結(jié)構(gòu)。TPEF來源于能級更高的單線態(tài)激發(fā)態(tài)1MLCT,而OPEF則源自低能級的三線態(tài)激發(fā)態(tài)3MLCT。
a 配體
研究發(fā)現(xiàn),大多數(shù)銥配合物的抗腫瘤作用都是通過光誘導(dǎo)產(chǎn)生具有細胞毒性的1O2,從而殺死腫瘤細胞[17]。使用ABDA作為1O2指示劑并以Ru(bpy)3Cl2為參照,測試了配合物Ir-NNC的相對1O2量子產(chǎn)率。隨著光照時間的增加,含有Ir-NNC的ABDA溶液的吸光度呈現(xiàn)出一定的下降趨勢,這表明在體外銥配合物Ir-NNC可在光照下誘導(dǎo)生成1O2,其量子產(chǎn)率約為0.1。
臨床使用的許多抗癌藥物都以DNA為作用靶點,它們與DNA的相互結(jié)合可引起DNA復(fù)制障礙,從而抑制癌細胞的分裂[26]。研究銥配合物與DNA分子的相互作用,對于明確其抗腫瘤的生物靶分子具有重要意義。由圖7a可以看出,隨著ct-DNA濃度逐漸增加,Ir-NNC的紫外-可見吸收光譜表現(xiàn)出明顯的減色效應(yīng),但并無明顯的紅移效應(yīng),說明配合物不是通過嵌入作用與DNA結(jié)合[27]。而當(dāng)配合物結(jié)合到DNA的溝區(qū)時,僅出現(xiàn)減色效應(yīng),可能是配合物的發(fā)色團被DNA的堿基覆蓋所導(dǎo)致[28]。
血清白蛋白是血漿中含量最為豐富的載體蛋白,能與進入血液中的大多數(shù)內(nèi)源性和外源性化合物結(jié)合,從而在體內(nèi)起到存儲和轉(zhuǎn)運的作用。研究銥配合物與血清蛋白之間的相互作用[29],有助于了解配合物在體內(nèi)的運輸和分布情況,對于闡明銥配合物抗腫瘤的作用機制具有重要意義。由圖7b可知,隨著BSA濃度逐漸增加,275 nm處的吸收峰出現(xiàn)增色效應(yīng),這是BSA分子中色氨酸和酪氨酸的特征吸收峰所致。在300 nm和425 nm處配合物的紫外-可見光譜吸收峰均表現(xiàn)出明顯的減色和紅移現(xiàn)象,并在297 nm出現(xiàn)等吸收點,表明配合物Ir-NNC可結(jié)合到BSA上并形成Ir-NNC-BSA復(fù)合物。
a DNA
Dock分子建模法是用于探索小分子與生物大分子的結(jié)合位點和結(jié)合能的一項重要技術(shù)[30-31]。為了進一步明確Ir-NNC與DNA和BSA的結(jié)合位點,本文利用Autodock模擬了配合物與DNA和BSA之間的相互作用。對接結(jié)果表明,銥(Ⅲ)配合物Ir-NNC進入DNA的小溝區(qū)而不是插入DNA堿基對之間(這與紫外滴定的結(jié)果一致),結(jié)合自由能為-20.75 J/mol。如圖8a所示,Ir-NNC的2個羥乙基與DNA行成4個氫鍵,分別是H92與DNA的DC-15(0.21 nm),H97與DT-8(0.24 nm),DG-16(0.20 nm),O56與DC-9(0.24 nm)。由圖8b可以看出,Ir-NNC在BSA中的結(jié)合位置為ⅠB亞結(jié)構(gòu)域,該結(jié)合自由能為-14.98 J/mol。圖8c可知,Ir-NNC的H97和H92分別與氨基酸殘基ASP-118(0.25 nm)和GLU-125(0.19 nm,0.27 nm)形成了3個氫鍵。氫鍵的存在可以穩(wěn)定復(fù)合物Ir-NNC-BSA的結(jié)構(gòu)。
a 與雙螺旋DNA的對接(單位:?)