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ADCY9基因與兒童支氣管哮喘的易感性及環(huán)境交互作用分析

2022-09-08 03:34賈京晶魏兵李令雪任夢(mèng)洋張世楠劉俊張宇璇
中國(guó)當(dāng)代兒科雜志 2022年9期
關(guān)鍵詞:兒童哮喘等位基因基因型

賈京晶 魏兵 李令雪 任夢(mèng)洋, 張世楠 劉俊 張宇璇,

(1.錦州醫(yī)科大學(xué)北部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院研究生培養(yǎng)基地,遼寧沈陽(yáng) 110016;2.中國(guó)人民解放軍北部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院,遼寧沈陽(yáng) 110016)

支氣管哮喘(簡(jiǎn)稱(chēng)哮喘)是兒童時(shí)期最常見(jiàn)的慢性呼吸道疾病之一,以慢性氣道炎癥、氣道高反應(yīng)性和氣道重塑為特征的異質(zhì)性疾病[1]。近年來(lái),兒童哮喘呈起病年齡逐漸變小,患病率逐漸上升的趨勢(shì)。我國(guó)兒童哮喘患病率已經(jīng)從1990年的0.91%,上升為2010 的3.02%[2-3]。哮喘已經(jīng)成為全球范圍內(nèi)嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問(wèn)題之一,然而哮喘的發(fā)病機(jī)制尚未明確,目前認(rèn)為其是由多種遺傳因素和環(huán)境因素間復(fù)雜的相互作用引起的[4-5]。腺苷酸環(huán)化酶9 (adenylyl cyclase Ⅸ,ADCY9)基因位于染色體16p13.3 區(qū),該基因編碼一種膜結(jié)合酶,分布比較分散,在肺和其他組織中均廣泛表達(dá)。研究表明ADCY9基因可能與哮喘、瘧疾和鐮狀細(xì)胞病等具有相關(guān)性[6]。目前國(guó)外關(guān)于ADCY9基因多態(tài)性與兒童哮喘的關(guān)系僅有1 篇研 究,結(jié)果顯示ADCY9基 因rs2601814 和rs2601796 位點(diǎn)與巴西兒童哮喘易感性有關(guān)[7],國(guó)內(nèi)暫無(wú)相關(guān)研究報(bào)道。本研究為國(guó)內(nèi)外首次探討ADCY9基因rs1967309、 rs2230739、 rs2601814、rs2601825、rs2601796 和rs2283497 位點(diǎn)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)與中國(guó)兒童哮喘易感性及基因-環(huán)境交互作用的關(guān)系,以探索兒童哮喘的發(fā)病機(jī)制。

1 資料與方法

1.1 研究對(duì)象

本研究為病例-對(duì)照研究,選取2019年3月至2021年9月就診于中國(guó)人民解放軍北部戰(zhàn)區(qū)總醫(yī)院的哮喘患兒123例為哮喘組,均符合《兒童支氣管哮喘診斷與防治指南(2016 年版)》的診斷標(biāo)準(zhǔn)[1]。根據(jù)哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度分為輕中度84例(68.3%),重度39 例(31.7%)。對(duì)照組兒童選取同期于我院健康體檢的兒童124例。所有入組兒童均為東北地區(qū)漢族兒童,三代內(nèi)無(wú)血緣關(guān)系,無(wú)自身免疫疾病和其他病史。哮喘組和對(duì)照組兒童性別、入組年齡及體重指數(shù)(body mass index,BMI)差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)表1。本研究經(jīng)我院倫理委員會(huì)批準(zhǔn)[倫理Y(2020)054號(hào)],所有患兒家屬均簽署知情同意書(shū)。

表1 研究對(duì)象基本情況

1.2 ADCY9基因SNPs的測(cè)定

分別采集2 組研究對(duì)象外周血3 mL 于真空靜脈采血管中,采用DNA 提取試劑盒(上海天昊科技生物有限公司)提取DNA,應(yīng)用Primer 3軟件設(shè)計(jì)聚合酶鏈反應(yīng)(polymerase chain reaction,PCR)引物(生工生物工程上海股份有限公司),利用引物對(duì)ADCY9基因6 個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行擴(kuò)增,引物信息見(jiàn)表2。PCR 反應(yīng)體系包含10 倍PCR 反應(yīng)緩沖液,3.0 mmol/L Mg2+,0.3 mmol/L dNTP 混合液,1 U Tap酶,1 μL樣本DNA和1 μL多重PCR引物;反應(yīng)條件: 95℃2 min, 94℃20 s, 65℃40 s, 72℃1.5 min,共35 個(gè)循環(huán)。PCR 產(chǎn)物純化后采用ABI3730XL測(cè)序儀進(jìn)行基因測(cè)序,ADCY9基因6個(gè)位點(diǎn)電泳峰型見(jiàn)圖1~6。

圖1 rs1967309位點(diǎn)電泳峰型圖

表2 引物信息

1.3 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

應(yīng)用SPSS 23.0 軟件進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)分析。符合正態(tài)分布的計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差(±s)表示,不符合正態(tài)分布的計(jì)量資料采用中位數(shù)(四分位數(shù)間距)[M(Q1,Q3)]表示,2組間比較采用兩樣本t檢驗(yàn)或Mann-WhitneyU檢驗(yàn)。計(jì)數(shù)資料用例數(shù)和構(gòu)成比(%)表示,組間比較采用χ2檢驗(yàn)。應(yīng)用logistic 回歸分析對(duì)ADCY9基因與兒童哮喘易感性進(jìn)行分析,以比值比(odds ratio,OR)及95%置信區(qū)間(confidence interval,CI)評(píng)估相對(duì)風(fēng)險(xiǎn)度。應(yīng)用廣義多因子降維法(generalized multifactor dimensionality reduction,GMDR) 分 析ADCY9基因與環(huán)境因素的交互作用,得出最優(yōu)模型后,應(yīng)用二元logistic 回歸分析進(jìn)行驗(yàn)證。連鎖不平衡及單倍型分析采用Haploview 軟件,當(dāng)連鎖不平衡系數(shù)(D')>0.8 時(shí)存在強(qiáng)連鎖不平衡。P<0.05為差異具有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

圖2 rs2230739位點(diǎn)電泳峰型圖

圖3 rs2601814位點(diǎn)電泳峰型圖

圖4 rs2601825位點(diǎn)電泳峰型圖

圖5 rs2601796位點(diǎn)電泳峰型圖

圖6 rs2283497位點(diǎn)電泳峰型圖

2 結(jié)果

2.1 ADCY9基因6個(gè)位點(diǎn)基因型及等位基因在哮喘組和對(duì)照組的分布

應(yīng)用Hardy-Weinberg平衡檢驗(yàn)ADCY9基因6個(gè)位點(diǎn)分布情況,結(jié)果顯示哮喘組及對(duì)照組符合遺傳平衡定律(均P>0.05),說(shuō)明研究對(duì)象具有良好的代表性。rs1967039 位點(diǎn)基因型和等位基因在哮喘組和對(duì)照組的分布差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05)。經(jīng)logistic 回歸分析顯示rs1967039 位點(diǎn)中GA 和AA基因型兒童哮喘患病風(fēng)險(xiǎn)分別為GG基因型兒童的0.493、0.395 倍,攜帶A 等位基因兒童患哮喘的風(fēng)險(xiǎn)是攜帶G 等位基因兒童的1.755 倍(P<0.05)。rs2230739、rs2601814、rs2601825、rs2601796 和rs2283497 位點(diǎn)基因型及等位基因在哮喘組和對(duì)照組的分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05)。見(jiàn)表3。

表3 哮喘組和對(duì)照組的ADCY9基因6個(gè)位點(diǎn)基因型及等位基因比較 [n(%)]

2.2 ADCY9基因6個(gè)位點(diǎn)基因型及等位基因與兒童哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度的關(guān)系

ADCY9基因6 個(gè)位點(diǎn)基因型及等位基因在輕中度兒童和重度兒童的分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05),見(jiàn)表4。

表4 ADCY9基因SNPs與不同哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度的關(guān)系 [n(%)]

2.3 ADCY9 基因6 個(gè)位點(diǎn)連鎖不平衡及單倍型分析

ADCY9基 因rs2601796 和rs2601814 位 點(diǎn)D'為0.98,表明2 位點(diǎn)間存在強(qiáng)連鎖不平衡,構(gòu)成TA和GG 2 種單倍型。單倍型TA 和GG 在哮喘組和對(duì)照組的分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。單倍型TA和GG在不同哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度中的分布差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P>0.05)。見(jiàn)表5~6。

表5 哮喘組和對(duì)照組單倍型TA和GG分布頻率比較[n(%)]

表6 不同哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度單倍型TA和GG分布頻率比較 [n(%)]

2.4 ADCY9基因6個(gè)點(diǎn)位間的交互作用分析

應(yīng) 用 GMDR 分 析 rs1967309、 rs2230739、rs2601814、rs2601825、rs2601796 和rs2283497 位點(diǎn)之間的交互作用, 結(jié)果顯示rs1967309、rs2230739、rs2601814、rs2601825、rs2601796 和rs2283497 位點(diǎn)交叉一致性為100%,為最佳模型,但6個(gè)位點(diǎn)間顯著性檢驗(yàn)差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05)。見(jiàn)表7。

表7 ADCY9基因各位點(diǎn)間的交互作用GMDR分析結(jié)果

2.5 ADCY9基因與環(huán)境交互作用分析

采用GMDR 分析母乳喂養(yǎng)、變應(yīng)原接觸、環(huán)境煙草煙霧(environmental tobacco smoke,ETS)接觸、寵物接觸及城市居住地與rs1967309 位點(diǎn)的交互作用。由表8可以看出,二階模型及六階模型交叉一致性均為10/10,但二階模型檢驗(yàn)樣本準(zhǔn)確性(0.661)高于六階模型(0.600),故選擇二階模型為最佳模型(圖7)。二階模型交互作用顯著性檢驗(yàn)差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P<0.05),即rs1967309位點(diǎn)與變應(yīng)原接觸的交互作用有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。對(duì)ADCY9基因各位點(diǎn)間及其與環(huán)境交互作用交叉一致性為100%的模型進(jìn)行l(wèi)ogistic回歸分析驗(yàn)證,結(jié)果顯示rs1967309 位點(diǎn)與變應(yīng)原接觸的交互作用使哮喘的患病風(fēng)險(xiǎn)增加(OR=1.585,P<0.05)。見(jiàn)表9。

表9 交叉一致性為100%的模型logistic回歸分析

圖7 ADCY9基因rs1967309位點(diǎn)與環(huán)境交互作用的GMDR分析結(jié)果最佳模型

表8 ADCY9基因rs1967309位點(diǎn)與環(huán)境交互作用GMDR分析結(jié)果

3 討論

近二三十年來(lái),在全球范圍內(nèi)兒童哮喘的發(fā)生率迅速升高,尤其是經(jīng)濟(jì)發(fā)達(dá)的國(guó)家和地區(qū)[8],嚴(yán)重影響了人們的身心健康。早期哮喘風(fēng)險(xiǎn)的評(píng)估對(duì)高風(fēng)險(xiǎn)兒童至關(guān)重要,若能進(jìn)行有效的早期評(píng)估,采取早期預(yù)防能很大程度降低高風(fēng)險(xiǎn)兒童哮喘的發(fā)病率。哮喘是多基因控制的呼吸系統(tǒng)慢性疾病,其發(fā)病受遺傳、環(huán)境等因素影響。ADCY9基因受G 蛋白耦合受體、蛋白激酶和鈣家族的調(diào)節(jié), 催化三磷酸腺苷(adenosine triphosphate,ATP)轉(zhuǎn)化為第二信使環(huán)磷酸腺苷(cyclic adenosine monophosphate,cAMP),ADCY9基因表達(dá)的減少導(dǎo)致cAMP生成減少,進(jìn)而引起免疫調(diào)節(jié)失衡[9]。此外,β2腎上腺素能受體在ADCY9基因的介導(dǎo)下可被激活,該通道對(duì)平滑肌及肺功能調(diào)節(jié)起著重要作用[10-11]。

本研究對(duì)ADCY9基因6 個(gè)位點(diǎn)的SNPs 與兒童哮喘易感性進(jìn)行分析,結(jié)果顯示rs1967309 位點(diǎn)檢測(cè)出GG、GA和AA 3種基因型,與Kim等[12]分析韓國(guó)輕中度哮喘患者ADCY9基因多態(tài)性相同,基因型及等位基因在哮喘組和對(duì)照組的分布差異存在統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,表明該位點(diǎn)是兒童哮喘的易感位點(diǎn),其中AA基因型在哮喘組中的分布頻率低于對(duì)照組,次等位基因A降低了兒童患哮喘的風(fēng)險(xiǎn),提示其是兒童哮喘的保護(hù)因素。我們推測(cè)可能次等位基因A 參與了蛋白激酶A 的正向調(diào)控,cAMP 生成增多,使ADCY9活性增加。Teixeira等[7]研究了ADCY9基因多態(tài)性與1 309例巴西兒童哮喘和過(guò)敏的相關(guān)性,發(fā)現(xiàn)rs2601814 和rs2601796 位點(diǎn)的SNPs 增加了哮喘兒童的患病風(fēng)險(xiǎn),rs2283497 位點(diǎn)與兒童過(guò)敏有關(guān)。本研究未發(fā)現(xiàn)rs2601814、rs2601796和rs2283497位點(diǎn)與兒童哮喘患病風(fēng)險(xiǎn)增加存在關(guān)聯(lián),考慮可能受到地域、種族和樣本量的影響。此前有研究證實(shí)rs2230739 位點(diǎn)與瘧疾的患病有關(guān)[13-14],目前暫無(wú)該位點(diǎn)與兒童哮喘的相關(guān)性研究,我們發(fā)現(xiàn)rs2230739 位點(diǎn)與兒童哮喘易感性無(wú)關(guān)。本研究中rs2601825位點(diǎn)檢測(cè)出TT、TC和CC基因型,經(jīng)分析發(fā)現(xiàn)該位點(diǎn)不是兒童哮喘的易感位點(diǎn)。ADCY9基因位于β2腎上腺素能受體下游[9],β2腎上腺素能受體與哮喘急性發(fā)作密切相關(guān)[15],因此我們對(duì)ADCY9基因與哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度進(jìn)行研究,結(jié)果顯示ADCY9基因6 個(gè)位點(diǎn)的SNPs與哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度無(wú)關(guān)。

連鎖不平衡指的是不同遺傳標(biāo)記間存在著的非隨機(jī)組合[16],單倍型是共同出現(xiàn)在單條染色體上的遺傳變異位點(diǎn)的組合[17]。目前越來(lái)越多的學(xué)者致力于單倍型與復(fù)雜性疾病的研究[18-19]。我們是國(guó)內(nèi)外首次對(duì)ADCY9基因單倍型與兒童哮喘的關(guān)系進(jìn)行研究,結(jié)果顯示rs2601796和rs2601814位點(diǎn)共構(gòu)成TA和GG 2種單倍型,TA和GG單倍型在哮喘組和對(duì)照組中及在不同哮喘急性發(fā)作嚴(yán)重程度中的分布差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,提示這2種單倍型與兒童哮喘的發(fā)病及急性發(fā)作嚴(yán)重程度無(wú)關(guān)。

哮喘是由基因-基因、基因-環(huán)境交互作用引起復(fù)雜性疾?。?0],了解其交互作用,篩選出哮喘易感人群,避免環(huán)境觸發(fā)因素,能夠?qū)和M(jìn)行早期診斷及有效干預(yù)。有研究表明變應(yīng)原接觸、寵物接觸、ETS接觸、城區(qū)居住地及非母乳喂養(yǎng)均是兒童哮喘發(fā)生的危險(xiǎn)因素[21-24]。本研究首次探討ADCY9基因與環(huán)境交互作用的關(guān)系,結(jié)果提示rs1967309、rs2230739、rs2601814、rs2601825、rs2601796 和rs2283497 位點(diǎn)不存在交互作用。對(duì)ADCY9基因易感位點(diǎn)rs1967309與環(huán)境因素進(jìn)行交互作用分析,結(jié)果提示rs1967309 位點(diǎn)與變應(yīng)原接觸間存在交互作用,經(jīng)logistic 回歸分析顯示該交互作用增加了哮喘發(fā)生的風(fēng)險(xiǎn),提示rs1967309 位點(diǎn)與變應(yīng)原接觸產(chǎn)生了協(xié)同作用。

綜上,ADCY9基因rs1967309是兒童哮喘的易感位點(diǎn),該位點(diǎn)和變應(yīng)原接觸的交互具有協(xié)同致哮喘的作用。rs2230739、rs2601814、rs2601825、rs2601796和rs2283497位點(diǎn)并非兒童哮喘的易感位點(diǎn)。由于不同地區(qū)、種族差異和樣本量大小問(wèn)題導(dǎo)致同一疾病的發(fā)病的易感基因不同,并不能完全闡述ADCY9基因多態(tài)性與兒童哮喘的關(guān)系,需進(jìn)一步深入研究。

利益沖突聲明:所有作者聲明無(wú)利益沖突。

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