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Drp1 異構(gòu)體在線粒體分裂和細(xì)胞死亡中的作用

2022-12-16 13:02:56劉喆豪李京睿謝樹(shù)春于明明黃家誠(chéng)丁冶春范小娜
關(guān)鍵詞:肌動(dòng)蛋白異構(gòu)體外顯子

劉喆豪,李京睿,謝樹(shù)春,于明明,黃家誠(chéng),丁冶春,范小娜?

(1.贛南醫(yī)學(xué)院公共衛(wèi)生與健康管理學(xué)院;2.贛南醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院;3.贛南醫(yī)學(xué)院 藥學(xué)院,江西 贛州 341000)

線粒體在能量代謝和鈣穩(wěn)態(tài)調(diào)控的細(xì)胞功能中發(fā)揮重要作用[1]。 線粒體細(xì)胞器的形態(tài)因細(xì)胞種類和不同條件而具有很大的差異[2],它主要通過(guò)融合和分裂等形成動(dòng)態(tài)變化。 動(dòng)力相關(guān)蛋白是GTP 酶家族蛋白,包括具有融合活性的Mfn1、Mfn2和Opa1 以及具有分裂活性的Drp1,他們共同調(diào)控線粒體的動(dòng)力學(xué)[3]。 在這些 GTP 酶家族蛋白中,Drp1 常與各種病理性變化和細(xì)胞死亡具有高度相關(guān)性。 Drp1 是 Shin 等人(1997)首次在人肝癌HepG2 細(xì)胞中發(fā)現(xiàn)的[4]。 Drp1 在人類細(xì)胞中具有廣泛表達(dá),是線粒體分裂的主要調(diào)節(jié)因子。 因此,Drp1 在調(diào)控細(xì)胞分化、代謝、增殖及死亡等各種級(jí)聯(lián)信號(hào)中發(fā)揮重要作用[5]。

在酵母、秀麗隱桿線蟲(chóng)、果蠅和嚙齒動(dòng)物中均發(fā)現(xiàn)有Drp1 同源物,它們具有高度的序列相似性。人類Drp1 基因的選擇性剪接已有報(bào)道,但其病理生理學(xué)意義研究較少。 大多數(shù)基因剪接后異構(gòu)體具有與蛋白質(zhì)相互作用的特異性,這可能意味著不同的異構(gòu)體在不同組織具有特殊的功能,特別是如果它們表達(dá)豐富時(shí),其產(chǎn)生的生理學(xué)作用就更為顯著[6]。 有研究表明,Drp1 異構(gòu)體可能在細(xì)胞死亡中具有重要作用[7]。 在此,本文將對(duì)Drp1各種異構(gòu)體在線粒體分裂和細(xì)胞死亡中的作用進(jìn)行簡(jiǎn)要綜述。

一、人類Drp1 異構(gòu)體

人類Drp1 蛋白由DNM1L 基因編碼,該基因包含21 個(gè)外顯子,位于12 號(hào)染色體上。 在其轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物上,通常存在三個(gè)位點(diǎn)可進(jìn)行選擇性剪接。 一個(gè)位于 GTPase 結(jié)構(gòu)域,另外兩個(gè)具有可變結(jié)構(gòu)域[8]494,總共可產(chǎn)生九種異構(gòu)體,本文對(duì)該因子命名系統(tǒng)進(jìn)行重新整理。 除非有特別說(shuō)明,將使用異構(gòu)體1 的氨基酸編號(hào)以及異構(gòu)體6 的外顯子編號(hào)。

絕大多數(shù)研究對(duì)Drp1 的四個(gè)結(jié)構(gòu)域均使用經(jīng)典的命名系統(tǒng),即GTPase 結(jié)構(gòu)域、中間結(jié)構(gòu)域、可變結(jié)構(gòu)域和 GTPase 效應(yīng)器結(jié)構(gòu)域[9](圖 1A)。Drp1 蛋白結(jié)構(gòu)研究發(fā)現(xiàn),它們均具有原型的動(dòng)力蛋白折疊,具有三個(gè)不同的(非連續(xù)的)結(jié)構(gòu)域,即GTPase 結(jié)構(gòu)域,束信號(hào)元件(BSE)以及莖部區(qū)域[10]。 而第四個(gè)結(jié)構(gòu)域?yàn)榭勺兘Y(jié)構(gòu)域。 中間結(jié)構(gòu)域和GTPase 效應(yīng)結(jié)構(gòu)域的部分區(qū)域形成莖部區(qū)域。 另外,部分 GTPase 結(jié)構(gòu)域和部分 GTPase 效應(yīng)器結(jié)構(gòu)域可構(gòu)成三個(gè) BSE 基序[10]。 在一些異構(gòu)體中,GTPase 結(jié)構(gòu)域包含13 個(gè)氨基酸插入,稱之為A?插入子。 而可變結(jié)構(gòu)域包含37 個(gè)氨基酸的插入,則稱為B?插入子(圖1A)。

圖1 Drp1 異構(gòu)體的結(jié)構(gòu)及編碼區(qū)域圖

DNM1L 轉(zhuǎn)錄體的選擇性剪接主要涉及外顯子3(編碼GTPase 結(jié)構(gòu)域中的A?插入子)和外顯子16 和17(編碼可變結(jié)構(gòu)域中的 B?插入子)(圖1B)。 含有外顯子3 的Drp1 異構(gòu)體主要表達(dá)于神經(jīng)細(xì)胞類型,包括皮層,海馬和小腦神經(jīng)元。 這些結(jié)果表明,包含外顯子3 的Drp1 異構(gòu)體,如異構(gòu)體6、8 和9,可能在神經(jīng)元中具有偏好性表達(dá)。 對(duì)于外顯子16 和17,只存在于異構(gòu)體1、6 和7,具有完整的B?插入(圖1B)。 目前已有報(bào)道,異構(gòu)體1 和6 在神經(jīng)元中高度表達(dá)[11]。

值得注意的是,在異構(gòu)體7 中,5’非翻譯區(qū)同時(shí)存在于外顯子1 和2 中,并在外顯子2 而非外顯子1 中的交替起始密碼子處啟動(dòng)翻譯,同時(shí)缺少4個(gè)連續(xù)的外顯子(外顯子 5?8)(圖 1B)。 此外,三個(gè)保守的 GTP 結(jié)合基序(GTQSSGK 由外顯子1?2編碼,DLPG 由外顯子 6 編碼,TKLD 由外顯子 8 編碼)和一個(gè)Dynamin 特異性的G 帽基序(由外顯子8?9 編碼的 GVVNRSQ)不存在于異構(gòu)體 7 中。 然而,這些基序?qū)TP 的結(jié)合是必不可少的。

(一)A?插入子和 B?插入子

A?插入子是Drp1 的GTPase 結(jié)構(gòu)域中插入的13 個(gè)氨基酸,主要存在于異構(gòu)體 6、8 和 9。 B?插入則是可變結(jié)構(gòu)域中的一個(gè)37 個(gè)氨基酸區(qū)域,常見(jiàn)于異構(gòu)體 1、6 和 7(圖 1B)。 在異構(gòu)體 3 和 9 并沒(méi)有這些氨基酸插入。 Macdonald 等人(2016)對(duì)只有A 插入子(相當(dāng)于異構(gòu)體9)或B 插入子(相當(dāng)于異構(gòu)體1)、大鼠 Drp1 異構(gòu)體 1 同時(shí)含有 A?和B?插入子(相當(dāng)于人類Drp1 異構(gòu)體6)、人類Drp1異構(gòu)體3 同時(shí)缺少A?和B?插入子等進(jìn)行研究。 在結(jié)構(gòu)上,相比于那些含有B?插入子的脂質(zhì)體,缺少B?插入子的脂質(zhì)體可形成直徑較大的螺旋狀聚合物(>100nm)。 在功能上,當(dāng)兩種插入子均不存在時(shí),GTPase 基礎(chǔ)表達(dá)活性和心磷脂刺激的GTPase表達(dá)活性均為最高,而兩個(gè)插入子都存在時(shí)則最低。 在 Drp1 基因敲除小鼠胚胎成纖維細(xì)胞(MEFs)和線粒體分裂因子(Mff)敲除 MEFs 的細(xì)胞中,外源性表達(dá)異構(gòu)體3(同時(shí)缺乏A?和B?插入子)可顯著逆轉(zhuǎn)線粒體分裂活性。 然而,當(dāng)存在A?或B?插入子時(shí),外源性表達(dá)異構(gòu)體3 對(duì)Mff 敲除的MEF 中的線粒體分裂中沒(méi)有產(chǎn)生影響,而在Drp1敲除 MEF 中也只有輕微的逆轉(zhuǎn)作用[8]496?505。

(二)GTPase 結(jié)構(gòu)域

GTPase 結(jié)構(gòu)域不僅對(duì)GTP 的結(jié)合起重要作用,而且對(duì)Drp1 高階自組裝也起重要作用,且該組裝系統(tǒng)受“80?環(huán)” 調(diào)控[12]。 80?環(huán)可與 GTPase 結(jié)構(gòu)域進(jìn)行分子間連接,用于高階組裝[12]。 Drp1 二聚體化是線粒體招募和最終在線粒體外膜處進(jìn)行聚合所必需的[13]. 此外,80?環(huán)的突變可導(dǎo)致 Drp1以單體狀態(tài)存在而無(wú)法二聚化[12]。 在異構(gòu)體6、8和9 中,由于 A?插入子的存在,在 80?環(huán)的 Asp83和Gly84 之間延伸了13 個(gè)氨基酸殘基。 從結(jié)構(gòu)上看,A?插入子不影響 GTP?Drp1 的結(jié)合親和力。 另外,這個(gè)80?環(huán)所延伸的區(qū)域是可被溶酶體、晚期內(nèi)體及漿膜等的識(shí)別的一個(gè)基序[14]。

(三)可變結(jié)構(gòu)域

Drp1 的可變結(jié)構(gòu)域在導(dǎo)向更高一級(jí)螺旋組裝過(guò)程中具有非常重要的作用[15]。 可變結(jié)構(gòu)域的靈活性在Drp1 寡聚過(guò)程中幾何結(jié)構(gòu)優(yōu)化中是必要的,對(duì)環(huán)繞線粒體外膜的Drp1 環(huán)的直徑進(jìn)行精細(xì)調(diào)控[16]。 可變結(jié)構(gòu)域的變異包括不完整的 B?插入子(異構(gòu)體 2、4、5 和 8)和完整 B?插入子的缺失(異構(gòu)體 3 和 9)或存在(異構(gòu)體 1、6、7)。 因此,可變結(jié)構(gòu)域中的結(jié)構(gòu)變化會(huì)影響Drp1 異構(gòu)體在線粒體中分裂活性。

可變結(jié)構(gòu)域的改變也可能干擾Drp1 的Mff 結(jié)合位點(diǎn)[17]。 當(dāng)人 Drp1 異構(gòu)體 1 中的可變結(jié)構(gòu)域被敲除時(shí),構(gòu)建體則在Mff 存在下不能形成長(zhǎng)鏈聚合物,但在溶液中表現(xiàn)出較高的GTPase 活性[18]??勺兘Y(jié)構(gòu)域?qū)τ贒rp1 與線粒體外膜上心磷脂的結(jié)合具有重要作用,而在線粒體分裂時(shí),線粒體外膜上缺乏完整的可變結(jié)構(gòu)域的Drp1 異構(gòu)體則無(wú)法結(jié)合心磷脂[18,19]。 在線粒體外膜,Mff 可以減輕分子間GTPase 結(jié)構(gòu)體二聚時(shí)的空間位阻作用,導(dǎo)致更有效的Drp1 自組裝和聚合以促進(jìn)線粒體分裂。

二、Drp1 異構(gòu)體在線粒體中的作用

線粒體分裂?融合的協(xié)調(diào)和動(dòng)態(tài)平衡是產(chǎn)生適當(dāng)線粒體群體的必要條件,以適應(yīng)各種生理過(guò)程和維持細(xì)胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)。 高表達(dá)水平的Drp1 使這種平衡向裂變轉(zhuǎn)移。 在生理?xiàng)l件上,裂變產(chǎn)生更小的線粒體,促進(jìn)在細(xì)胞不同區(qū)域進(jìn)行線粒體運(yùn)輸和鈣緩沖作用。 這將提高各種生理過(guò)程,如有絲分裂,軸突運(yùn)輸,突觸形成和 T 細(xì)胞活化[20]。

Drp1 是線粒體分裂的主要調(diào)節(jié)因子。 Drp1 在線粒體分裂時(shí)轉(zhuǎn)位到線粒體外膜,進(jìn)而聚合成環(huán)狀結(jié)構(gòu)以誘導(dǎo)分裂。 線粒體分裂由 Drp1 的GTPase活性介導(dǎo)。 與dynamin 類似,在自組裝成聚合物的過(guò)程中,Drp1 分子間的合作互動(dòng)增強(qiáng)了GTPase 酶活性,從而對(duì)環(huán)狀結(jié)構(gòu)直徑進(jìn)行精細(xì)調(diào)控,進(jìn)而促進(jìn)膜限制[21]。 不同的 Drp1 異構(gòu)體可能會(huì)影響這個(gè)過(guò)程中。

(一)與微管和肌動(dòng)蛋白的相互作用

微管和肌動(dòng)蛋白在線粒體運(yùn)動(dòng)和胞內(nèi)再分配中具有重要作用。 微管和肌動(dòng)蛋白相互作用通過(guò)影響微管生長(zhǎng)和肌動(dòng)蛋白成核。 反過(guò)來(lái),它們調(diào)節(jié)各種細(xì)胞事件,如神經(jīng)元發(fā)育,細(xì)胞分裂,細(xì)胞遷移和細(xì)胞極性。 同時(shí),它們也調(diào)控了線粒體的重新分布和重組,而后者涉及線粒體形態(tài)的動(dòng)態(tài)調(diào)節(jié)。 在胞漿中,大約有一半Drp1 不參與線粒體分裂,而作為Drp1 二聚體和多聚體的異質(zhì)混合物定位于其他細(xì)胞室,如微管和肌動(dòng)蛋白絲等[22]。這些異寡聚體可穩(wěn)定存在于動(dòng)態(tài)平衡的細(xì)胞溶質(zhì)、細(xì)胞骨架和線粒體中。 α?和 β?微管蛋白 C?末端殘基與 Drp1 Arg566、Drp1 的 Arg566 和 Arg567產(chǎn)生靜電作用[23]。 這樣的 Drp1 結(jié)構(gòu)體具有較低的線粒體分裂活性,相比于僅包含外顯子16 的結(jié)構(gòu)體[23]。 其可能的機(jī)制是這種結(jié)構(gòu)體(等同于異構(gòu)體2)可優(yōu)先結(jié)合到微管,從而干擾Drp1 在線粒體的招募和分裂。

肌動(dòng)蛋白束也是Drp1 寡聚物的貯存器。 Drp1異構(gòu)體3 可直接與肌動(dòng)蛋白結(jié)合。 低濃度的肌動(dòng)蛋白可增強(qiáng)人Drp1 異構(gòu)體3 的GTPase 活性,而高肌動(dòng)蛋白濃度則使GTPase 活動(dòng)恢復(fù)到基線水平。這種雙相活性可能與肌動(dòng)蛋白聚合在線粒體分裂中的作用有關(guān),包括 Drp1 的招募和寡聚[24]。 然而,不同的Drp1 異構(gòu)體是否對(duì)肌動(dòng)蛋白有不同的傾向,目前仍不清楚。 有研究表明機(jī)械傳導(dǎo)和Drp1 之間存在間接相關(guān)性。 例如,單調(diào)拉伸動(dòng)作可以增加基質(zhì)金屬蛋白酶活性,進(jìn)而激活ERK1/2表達(dá)和刺激大鼠膀胱平滑肌細(xì)胞增殖。 對(duì)于周期性拉伸反應(yīng),ERK 依賴的 NF?κB 信號(hào)通路活化可促進(jìn)一氧化氮誘導(dǎo)的大鼠肺泡上皮細(xì)胞層的通透性[25]。 ERK1/2 可對(duì) Drp1 的 Ser616 進(jìn)行磷酸化,從而誘導(dǎo)線粒體分裂并促進(jìn)血管平滑肌細(xì)胞增殖[26]537。 缺血?再灌注對(duì)人臍靜脈內(nèi)皮細(xì)胞產(chǎn)生的流體剪切應(yīng)力也可誘導(dǎo)活性氧的產(chǎn)生和線粒體的分裂。

(二)翻譯后修飾

Drp1 的翻譯后修飾是應(yīng)答于線粒體募集。 可變結(jié)構(gòu)域?qū)⒊蔀镈rp1 的主要調(diào)控區(qū)域。 Drp1 可進(jìn)行泛素化、SUMO 化修飾和磷酸化。 可變結(jié)構(gòu)域中 Ser616 的磷酸化會(huì)導(dǎo)致 Drp1 的激活。Drp1Ser616 可被多種激酶磷酸化,包括 ERK1/2、PKC 及細(xì)胞周期蛋白?依賴性激酶 1(CDK1)等[26]538。 CDK1 介導(dǎo)的 Drp1 的絲氨酸殘基磷酸化,可促進(jìn)有絲分裂細(xì)胞的線粒體分裂。 CDK5 調(diào)控的Drp1 的Ser616 磷酸化可誘導(dǎo)胚胎神經(jīng)元成熟過(guò)程中的線粒體融合,但在成年有絲分裂后神經(jīng)元中則促進(jìn)線粒體分裂[27]。

Ser637 位于可變結(jié)構(gòu)域和莖的交界處。 PKA對(duì)Ser637 進(jìn)行磷酸化,可抑制 Drp1 的 GTPase 活性,從而抑制線粒體分裂[28]。 Drp1 的 Ser40/44(異構(gòu)體7 不存在這兩個(gè)位點(diǎn))位于N 末端GT?Pase 結(jié)構(gòu)域內(nèi),可被糖原合成酶激酶3β(GSK3β)磷酸化而促進(jìn)線粒體分裂,誘導(dǎo)促進(jìn)帕金森病模型中的神經(jīng)元對(duì)凋亡的敏感性[29]。 相反,GSK3β也可以磷酸化 Ser693,增加其對(duì) H2O2誘導(dǎo)HeLa線粒體斷裂和凋亡的抗性[30]。

Drp1 轉(zhuǎn)位到線粒體誘導(dǎo)分裂并引發(fā)凋亡,可受 SUMO 蛋白(SUMO?1、?2 或?3)和 SUMO 化修飾程度調(diào)控。 因此可通過(guò)這種修飾以促進(jìn)或阻止Drp1 的活性[31]。 Drp1 的關(guān)鍵 SUMO 受體殘基是位于可變結(jié)構(gòu)域的拼接區(qū)域,即Lys532、Lys535、Lys558 和 Lys568。 只有異構(gòu)體 1、6 和 7 含有所有四種賴氨酸殘基。 因此,可以根據(jù)不同的Drp1 異構(gòu)體,預(yù)測(cè)不同類型的SUMO 化修飾產(chǎn)物。

三、Drp1 介導(dǎo)的細(xì)胞死亡與異構(gòu)體特異性有關(guān)

近年來(lái),Drp1 介導(dǎo)的線粒體裂變常表現(xiàn)為細(xì)胞死亡,而也有許多研究表明抑制Drp1 可提高細(xì)胞存活率。 這種差異可能與調(diào)節(jié)Drp1 的表達(dá)和功能的物種、疾病模型及方法學(xué)不同有關(guān)。 單靠Drp1 誘導(dǎo)的線粒體裂變不足以誘導(dǎo)凋亡。 因此,Drp1 在凋亡中的作用也可能不限于線粒體裂變。另外,Drp1 可直接與Bax 結(jié)合,促進(jìn)其轉(zhuǎn)移到線粒體,再通過(guò) Bax/Bak 對(duì) Drp1 進(jìn)行 SUMO 化修飾以誘導(dǎo)細(xì)胞凋亡[32]。 不同Drp1 異構(gòu)體可能參與決定不同的細(xì)胞命運(yùn)。 例如,只有外顯子16 和17 的結(jié)構(gòu)體能夠與抗凋亡因子Bcl?xL 結(jié)合而抑制凋亡[33]。此外,轉(zhuǎn)錄后修飾如磷酸化等,可影響Drp1 向線粒體轉(zhuǎn)位,誘導(dǎo)線粒體分裂和凋亡。 這些修飾作用對(duì)不同的Drp1 異構(gòu)體可能產(chǎn)生不同的影響。

四、結(jié)語(yǔ)

人類Drp1 通過(guò)三個(gè)位點(diǎn)進(jìn)行剪切形成九種異構(gòu)體。 根據(jù) Drp1 的四個(gè)結(jié)構(gòu)域,即 GTPase 結(jié)構(gòu)域、中間結(jié)構(gòu)域、可變結(jié)構(gòu)域和GTPase 效應(yīng)器結(jié)構(gòu)域,各種不同異構(gòu)體由于剪切而存在結(jié)構(gòu)差異,最終導(dǎo)致其在調(diào)控線粒體功能方面出現(xiàn)不同的效果。 不同的Drp1 異構(gòu)體GTPase 的活性存在差異。在不同的細(xì)胞中,Drp1 的異構(gòu)體及其病理生理學(xué)活性也會(huì)出現(xiàn)特異性。 因此,有必要深入探索Drp1 不同異構(gòu)體在不同組織細(xì)胞中調(diào)控機(jī)制,為其進(jìn)一步作為靶標(biāo)分子開(kāi)發(fā)奠定基礎(chǔ)。

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