王曉英,羅 明,張匯征, 易利華
結(jié)核病是由結(jié)核分枝桿菌(MycobacteriumTuberculosis, MTB)感染引起的慢性傳染病,是由單一致病菌引起的死亡人數(shù)最多的疾病[1]。據(jù)世界衛(wèi)生組織(World Health Organization, WHO)估算,2019年耐多藥結(jié)核病(Multi-drug Resistant Tuberculosis, MDR-TB)及利福平耐藥結(jié)核病(Rifampicin Resistant Tuberculosis, RR-TB)患者數(shù)為46.5萬(wàn)。2019年,我國(guó)約有6.5萬(wàn)MDR/RR-TB患者,占全球MDR/RR-TB病例的14%,僅次于印度(27%)。然而,RR-/MDR-TB的治療非常困難,成功率僅為57%[2]。2019年,WHO在耐藥結(jié)核病治療整合指南中,將貝達(dá)喹啉和氯法齊明分別列為MDR-TB治療的A組及B組藥物[3]。2020年,WHO進(jìn)一步修改了廣泛耐藥結(jié)核病(Extensively drug-resistant tuberculosis, XDR-TB)的定義,即符合MDR/RR-TB的定義,同時(shí)對(duì)氟喹諾酮類以及至少一種其他的A組藥物耐藥[4]。雖然貝達(dá)喹啉和氯法齊明在我國(guó)尚未作為抗結(jié)核藥物進(jìn)行大規(guī)模的使用,但已存在對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明耐藥的MTB菌株。本文將系統(tǒng)闡述貝達(dá)喹啉和氯法齊明的作用機(jī)理以及耐藥相關(guān)基因突變等情況,為2種藥物耐藥快速檢測(cè)工具的開(kāi)發(fā)提供依據(jù)。
1.1 貝達(dá)喹啉的作用機(jī)理 相比于其他抗結(jié)核藥物,貝達(dá)喹啉的作用機(jī)制獨(dú)特、抗MTB活性強(qiáng)、療效好,是近50年來(lái)第一個(gè)上市的抗結(jié)核新藥[5-6]。貝達(dá)喹啉是一種二芳基喹啉類化合物,通過(guò)與MTB的ATP合成酶低聚物亞基C相結(jié)合,影響ATP合成酶質(zhì)子泵的活性,導(dǎo)致ATP合成受阻。最終通過(guò)阻止MTB中的ATP能量供應(yīng)而發(fā)揮抑菌和殺菌的作用[7-8]。
1.2 氯法齊明的作用機(jī)理 目前,氯法齊明抗MTB的作用機(jī)制研究還不是很清楚,多數(shù)研究認(rèn)為其作用機(jī)理主要有以下3個(gè)方面:1)MTB呼吸過(guò)程中需要煙酰胺腺嘌呤二核苷酸(NADH)產(chǎn)生的電子。氯法齊明通過(guò)與重組Ⅱ型煙酰胺腺嘌呤二核苷酸脫氫酶底物甲基萘醌競(jìng)爭(zhēng)NADH貢獻(xiàn)的電子而變?yōu)檫€原型氯法齊明,隨后被氧化形成超氧化物,最終通過(guò)釋放活性氧而實(shí)現(xiàn)治療結(jié)核病的作用[9-12];2)氯法齊明可能通過(guò)溶血磷脂介導(dǎo)的膜功能障礙而抑制K+的吸收,從而通過(guò)干擾MTB膜電位而導(dǎo)致ATP含量的下降,發(fā)揮抗MTB功效[9,11,13];3)氯法齊明可通過(guò)改變MTB衍生因子的抑制作用而增強(qiáng)吞噬細(xì)胞的內(nèi)殺傷能力,即增強(qiáng)吞噬細(xì)胞對(duì)MTB的吞噬能力,而且氯法齊明的半衰期較長(zhǎng)、藥代動(dòng)力學(xué)較好[14-15]。
貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥情況的出現(xiàn)主要和Rv0678(mmpR)基因和Rv2535c(pepQ)基因的突變有關(guān)。
2.1Rv0678基因(mmpR)Rv0678基因?qū)儆贛arR調(diào)控基因之一,其編碼產(chǎn)物為調(diào)控蛋白。Rv0678基因具有多種生物學(xué)效應(yīng),如對(duì)抗菌藥物的耐藥性,毒力因子的調(diào)控以及對(duì)氧化應(yīng)激的敏感性等[16]。Rv0678基因編碼的調(diào)控蛋白被認(rèn)為是MmpS2/MmpL2,MmpS4/MmpL4和MmpS5/MmpL5轉(zhuǎn)運(yùn)體系統(tǒng)的抑制因子[16]。MmpS/MmpL蛋白被認(rèn)為是MTB細(xì)胞壁脂類、毒性因子以及一些藥物的轉(zhuǎn)運(yùn)體。MmpS5/MmpL5尤其參與了貝達(dá)喹啉、氯法齊明以及唑類藥物(如益康唑等)的外排[17]。Rv0678突變導(dǎo)致了MmpS5/MmpL5抑制因子的滅活,上調(diào)了外排泵系統(tǒng)MmpS5/MmpL5的表達(dá),增加了貝達(dá)喹啉和氯法齊明的外排,從而導(dǎo)致細(xì)胞內(nèi)藥物濃度下降,出現(xiàn)MTB對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明耐藥的現(xiàn)象[10,18]。
2.1.1Rv0678突變與貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥的相關(guān)性 Pang等[19]的研究顯示,在未使用過(guò)貝達(dá)喹啉和氯法齊明的Pre-XDR-TB和XDR-TB患者中,以最低抑菌濃度(minimum inhibitory concentration,MIC)>1 μg/mL為氯法齊明耐藥的判斷標(biāo)準(zhǔn),有5株XDR-TB對(duì)氯法齊明耐藥,其中4株發(fā)現(xiàn)了Rv0678突變(Ser53Pro(2株),Ser53Leu(1株),Tyr157Asp(1株))。同時(shí),Rv0678突變(Ser53Pro(2株))也與貝達(dá)喹啉耐藥相關(guān)。此研究表明貝達(dá)喹啉和氯法齊明的交叉耐藥是由Rv0678基因第53位密碼子突變導(dǎo)致的(Ser53Pro)[19]。對(duì)于復(fù)治的Pre-XDR-TB和XDR-TB患者,以MIC≥1.2 μg/mL為氯法齊明耐藥的判斷標(biāo)準(zhǔn),5株耐氯法齊明MTB菌株中有4株同時(shí)對(duì)貝達(dá)喹啉耐藥,而且均存在Rv0678突變,突變位點(diǎn)以及導(dǎo)致的氨基酸改變分別為:T437C(M146T),G5T(S2I),C158T (S53L)以及T350G (L117R)[20]。這種因Rv0678突變導(dǎo)致的貝達(dá)喹啉和氯法齊明原發(fā)性耐藥可能是使用了其他抗結(jié)核藥物進(jìn)行治療的結(jié)果。而且Villellas等的研究發(fā)現(xiàn),相比于對(duì)抗結(jié)核藥物敏感的MTB患者,Rv0678的突變頻率在MDR-TB患者中更高[21]。He等對(duì)未使用貝達(dá)喹啉的TB患者菌株進(jìn)行研究,結(jié)果表明,在6株耐貝達(dá)喹啉的MTB菌株中有4株同時(shí)對(duì)氯法齊明耐藥。全基因組測(cè)試結(jié)果顯示,這4株交叉耐藥菌株均存在Rv0678突變(Ser63Arg,Ser68Gly以及在核苷酸192位置的G堿基插入突變)[22]。Zheng等的研究發(fā)現(xiàn)在339株MTB菌株中,有2株為貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥菌株,且該交叉耐藥是由Rv0678突變引起,由此導(dǎo)致的氨基酸改變?yōu)镚ln31Arg和Ser53Pr[23]。
另外,研究表明MTB對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明存在獲得性耐藥的情況。2014年,Somoskovi等報(bào)道了1例MDR-TB患者對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明產(chǎn)生了獲得性耐藥[24]。這例耐藥菌株(貝達(dá)喹啉:MIC=3.2 μg/mL;氯法齊明:MIC≥4 μg/mL)出現(xiàn)了Rv0678突變(GTG-GCG, 導(dǎo)致了M1A置換)[25]。隨后,Liu等研究也報(bào)道了MTB對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明產(chǎn)生獲得性耐藥的情況,在采用含貝達(dá)喹啉的治療方案后,1.8%(5/277)的MDR-TB患者出現(xiàn)了對(duì)2種藥物的交叉耐藥,且均為Rv0678突變[26]。在南非,貝達(dá)喹啉和氯法齊明已經(jīng)被普遍應(yīng)用在TB患者的治療中。Nimmo等研究發(fā)現(xiàn),南非也存在對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥的MTB菌株,而且主要是由Rv0678突變引起的,并導(dǎo)致了23個(gè)不同的氨基酸改變[27]。Rv0678突變將導(dǎo)致外排泵系統(tǒng)MmpS5/MmpL5表達(dá)上調(diào),細(xì)胞內(nèi)藥物濃度降低,導(dǎo)致貝達(dá)喹啉的MIC增加了2~8倍,同時(shí)也使氯法齊明的MIC增加了2~4倍[10,28]。
2.1.2Rv0678突變與氯法齊明耐藥的相關(guān)性Rv0678突變是導(dǎo)致MTB對(duì)氯法齊明耐藥的主要機(jī)制。2015年,Zhang等研究表明,97%(93/96)的耐氯法齊明MTB菌株存在Rv0678突變,其中2個(gè)突變熱點(diǎn)分別為G193(突變頻率為43.8%,42/96)和C466T(突變頻率為11.5%,11/96)[29]。Islam的研究也表明,在存在Rv0678突變的MTB菌株中,以G193和C466T突變最為常見(jiàn)[9]。Pang等研究表明,5.6%(5/90)的XDR-TB菌株對(duì)氯法齊明耐藥,且該耐藥均是由Rv0678突變導(dǎo)致的[19]。由此可見(jiàn),Rv0678突變是導(dǎo)致MTB對(duì)氯法齊明耐藥的主要原因,同時(shí)也是導(dǎo)致MTB對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥的重要機(jī)制。
2.2Rv2535c基因(pepQ)Rv2535c基因編碼的372位氨基酸蛋白有2個(gè)結(jié)構(gòu)域:即100-aa N-末端α/β結(jié)構(gòu)域和250-aa C-末端肽酶結(jié)構(gòu)域,其編碼產(chǎn)物可能為細(xì)胞質(zhì)肽酶,但目前其具體的作用機(jī)制還不是很清楚。Almeida等研究發(fā)現(xiàn),Rv2535c突變導(dǎo)致貝達(dá)喹啉和氯法齊明的MIC增加了4倍,并伴隨著貝達(dá)喹啉和氯法齊明藥效的降低,但并沒(méi)有導(dǎo)致MTB對(duì)這2種藥物完全耐藥[30]。Rv2535c突變導(dǎo)致的貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥表現(xiàn)在:14位密碼子(Ala)中插入C 堿基導(dǎo)致的移碼突變以及催化結(jié)構(gòu)域271位密碼子(Arg)中C堿基刪除導(dǎo)致的移碼突變。同時(shí)該研究表明,因Rv2535c突變導(dǎo)致的貝達(dá)喹啉和氯法齊明低水平交叉耐藥并沒(méi)有涉及MmpS5/MmpL5表達(dá)的上調(diào),可能與通過(guò)其他機(jī)制增加藥物的外排有關(guān)(如抑制MmpL5的降解等)[30]。而在Pang[19]以及Xu等[20]研究中,并未檢測(cè)到貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥菌株中存在Rv2535c突變。Zhang等的研究表明,在96株耐氯法齊明MTB菌株中,有1株(1%)存在Rv2535c突變,突變位點(diǎn)為G265T[29]。由此可見(jiàn),因Rv2535c突變導(dǎo)致的氯法齊明耐藥較少見(jiàn)。因此,Rv2535c突變?cè)谀吐确R明MTB菌株中的作用以及突變頻率仍需進(jìn)一步的研究。
除了因Rv0678和Rv2535c突變導(dǎo)致的貝達(dá)喹啉和氯法齊明低濃度交叉耐藥外,atpE突變(靶點(diǎn)突變)也是導(dǎo)致MTB對(duì)貝達(dá)喹啉耐藥的原因之一。atpE基因編碼ATP合成酶的跨膜蛋白,而此跨膜蛋白是貝達(dá)喹啉的作用靶點(diǎn)。atpE突變將導(dǎo)致貝達(dá)喹啉與亞基C的結(jié)合力減弱,從而維持了H+轉(zhuǎn)移和ATP的產(chǎn)生,導(dǎo)致MTB對(duì)貝達(dá)喹啉耐藥。2005年,Andries等第一次發(fā)現(xiàn)atpE突變(氨基酸改變?yōu)锳la63Pro)導(dǎo)致了MTB對(duì)貝達(dá)喹啉耐藥[31]。隨后,Petrella等在耐貝達(dá)喹啉MTB菌株中發(fā)現(xiàn)了atpE新的突變位點(diǎn)(I66M)[32]。atpE靶基因突變導(dǎo)致的貝達(dá)喹啉耐藥,可使貝達(dá)喹啉的MIC增加8~133倍[33-34]。2010年, Huitric等一項(xiàng)研究表明約有30%(15/53)的耐貝達(dá)喹啉MTB菌株存在atpE突變,5個(gè)點(diǎn)突變分別為A28V、A63P、I66M、A28P以及G61A[33]。而在Pang等[19]以及Xu等[20]研究中,未檢測(cè)到耐貝達(dá)喹啉MTB菌株中存在atpE突變,可能與測(cè)試菌株的數(shù)量和來(lái)源有關(guān)。因此,atpE突變?cè)谪愡_(dá)喹啉耐藥中的作用仍需進(jìn)行更深入的研究。
2018年,Ismail等研究表明,耐貝達(dá)喹啉的MTB菌株很可能全部對(duì)氯法齊明耐藥,然而耐氯法齊明MTB菌株中僅1/3表現(xiàn)出對(duì)貝達(dá)喹啉的交叉耐藥[35],此研究表明,MTB對(duì)氯法齊明的耐藥還存在著其他的耐藥機(jī)制,如Rv1979c突變。
Rv1979c基因可能編碼參與氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)的通透酶。Rv1979c突變導(dǎo)致氯法齊明耐藥的機(jī)制目前還不是很清楚。2015年,Zhang等第一次在耐氯法齊明MTB菌株中發(fā)現(xiàn)了Rv1979c突變,并推測(cè)其可能與氨基酸轉(zhuǎn)運(yùn)有關(guān)。Rv1979c基因有可能通過(guò)直接或間接的方式影響氯法齊明的轉(zhuǎn)運(yùn)和吸收,從而改變MTB的生理功能,進(jìn)而導(dǎo)致MTB對(duì)氯法齊明的敏感性降低[29]。該研究發(fā)現(xiàn),在耐氯法齊明的MTB菌株(96株)中,有3株存在Rv1979c突變:其中一株僅有Rv1979c突變(突變位點(diǎn):T1052C;氨基酸改變:V351A);其余2株同時(shí)存在Rv0678c和Rv1979c突變。與僅有Rv1979c突變的MTB菌株相比,同時(shí)存在Rv0678c和Rv1979c突變的MTB菌株氯法齊明的MIC升高(1 mg/L),因此在存在其他基因突變的基礎(chǔ)上附加的Rv1979c突變可能導(dǎo)致高水平氯法齊明耐藥[29]。在Xu等研究中,以MIC≥1.2μg/mL為氯法齊明耐藥的判斷標(biāo)準(zhǔn),在1株氯法齊明耐藥菌株(1/5,20%)中檢測(cè)到了Rv1979c突變,突變位點(diǎn)為A155C,導(dǎo)致的氨基酸改變?yōu)閂52G[20]。而在Ismail等研究中,并未檢測(cè)到耐氯法齊明MTB菌株中存在Rv1979c突變[36]。Phelan等研究還表明,Rv1979c基因突變與異煙肼耐藥相關(guān)[37]。因此,Rv1979c突變?cè)谀吐确R明MTB菌株中的作用還需進(jìn)行更深入的研究。
綜上所述,目前已知的導(dǎo)致貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥的基因突變均為非靶點(diǎn)基因突變,包括Rv0678(mmpR)基因和Rv2535c(pepQ)基因,其中Rv0678(mmpR)突變頻率較高,是導(dǎo)致MTB對(duì)貝達(dá)喹啉和氯法齊明交叉耐藥以及MTB對(duì)氯法齊明耐藥的重要原因。雖然貝達(dá)喹啉和氯法齊明存在低濃度交叉耐藥的情況,但已有研究表明,增加貝達(dá)喹啉用量同時(shí)聯(lián)合氯法齊明具有更好的抗結(jié)核效果[26]。目前貝達(dá)喹啉和氯法齊明耐藥性及其耐藥機(jī)制仍有許多未闡明之處,還需進(jìn)行更深入的研究,為今后兩種藥物的合理應(yīng)用提供參考。
利益沖突:無(wú)
引用本文格式:王曉英,羅明,張匯征,等. 結(jié)核分枝桿菌貝達(dá)喹啉和氯法齊明耐藥及其交叉耐藥機(jī)制研究進(jìn)展[J]. 中國(guó)人獸共患病學(xué)報(bào),2022,38(2):165-169. DOI:10.3969/j.issn.1002-2694.2021.00.031