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鏈霉菌中3個新脂肪酰胺類化合物

2023-02-04 03:18:34何江波康大偉牛燕芬王紀(jì)愛畢曉旭曹艷茹
關(guān)鍵詞:酰胺霉菌甲基

何江波,王 瑩,康大偉,牛燕芬,王紀(jì)愛,陳 秀,畢曉旭,欒 杰,曹艷茹**

(1.昆明學(xué)院 醫(yī)學(xué)院,云南 昆明 650214;2.云南省疾病預(yù)防控制中心 理化檢測中心,云南 昆明 650022)

特殊生境的微生物具有較高的創(chuàng)造能力,可以產(chǎn)生多種多樣結(jié)構(gòu)新穎的活性成分,這些活性化學(xué)物質(zhì)可以成為研究藥物的先導(dǎo)化合物,有的甚至可以成為生物農(nóng)藥[1].在特殊生境微生物的研究中,鏈霉菌研究受到廣大學(xué)者的較高關(guān)注.鏈霉菌屬于好氧革蘭氏陽性菌,廣泛分布于土壤、海洋、極端環(huán)境和一些生物體內(nèi)[2-5].鏈霉菌基因組特有的生物合成基因簇,可以產(chǎn)生具有生物活性的次生代謝產(chǎn)物,這些代謝產(chǎn)物被應(yīng)用于抗病毒、抗真菌、抗腫瘤藥物開發(fā)等[6].李惠玲等[7]從海洋鏈霉菌Streptomycessp.S598的次生代謝產(chǎn)物中分離得到抗菌活性物質(zhì)纈氨霉素,對白色念珠菌和金黃色葡萄球菌均有較好的抑制活性.在現(xiàn)代農(nóng)用抗生素開發(fā)方面,鏈霉菌也具有較大的優(yōu)勢,李萍等[8]從黃抗霉素鏈霉菌的次生代謝產(chǎn)物中分離得到一種殺線蟲活性化合物TDD,該化合物對線蟲48 h的致死率為40%.國產(chǎn)的殺稻瘟菌素就是從有色產(chǎn)色鏈霉菌(Streptomyces griseochromogenes)的代謝產(chǎn)物中分離得到[9].因此鏈霉菌是一類應(yīng)用前景廣闊的微生物資源,研究鏈霉菌的次生代謝產(chǎn)物,對挖掘藥物資源具有重要的意義.

本課題組一直從事微生物資源開發(fā),Streptomyces plumbidurans[10]是我們從昆明東川銅礦中分離得到,并經(jīng)16S rRNA基因鑒定為鏈霉菌(GenBank號:MW526995).為深入研究該菌,尋找可利用的天然產(chǎn)物,我們采用PDB培養(yǎng)基發(fā)酵該菌,對發(fā)酵液進(jìn)行濃縮,然后采用乙酸乙酯萃取,并對乙酸乙酯部分進(jìn)行系統(tǒng)分離與化學(xué)成分鑒定.從中分離得到3個新脂肪酰胺類化合物,分別命名為kcacylamide A~C (1~3) (圖1).我們對化合物1~3進(jìn)行體外抗腫瘤活性和體外抑菌活性評價,3個化合物在50 μmol/L濃度下均無明顯的抑制人結(jié)腸癌細(xì)胞 (HCT116)、人宮頸癌細(xì)胞 (Hela)、肝癌細(xì)胞 (LM-3)腫瘤細(xì)胞生長活性和抑制大腸桿菌(ATCC25922)、金黃色葡萄球菌(ATCC25923)以及枯草芽孢桿菌(ATCC6051)活性.本文主要報道Streptomyces plumbidurans代謝產(chǎn)物中的3個脂肪酰胺類化合物分離鑒定及初步活性篩選結(jié)果.

圖1 化合物1~3的化學(xué)結(jié)構(gòu)Fig.1 Chemical structures of compounds 1~3

1 材料與方法

1.1 材料菌株鑒定:自云南昆明東川銅礦中分離,16S rRNA基因序列分析結(jié)果表明KC 17012為鏈霉菌屬(Streptomyces)菌株, GenBank號:MW526995.菌種目前保存于昆明學(xué)院農(nóng)學(xué)與生命科學(xué)學(xué)院菌種庫(編號為KC 17012).

Streptomyces plumbidurans活化培養(yǎng)基:PDA培養(yǎng)基,土豆 200 g,葡萄糖20 g,瓊脂20 g,自來水1 000 mL,微量鹽 1 mL,121 ℃,滅菌30 min.

Streptomyces plumbidurans發(fā)酵培養(yǎng)基:PDB培養(yǎng)基,土豆200 g,葡萄糖20 g,自來水1 000 mL,微量鹽1 mL,121 ℃,滅菌 30 min.

指示菌培養(yǎng)基:LB 固體培養(yǎng)基,胰蛋白胨 10 g,酵母提取物 5 g,氯化鈉10 g,瓊脂20 g,自來水1 000 mL.

1.2 菌株活化與種子液的培養(yǎng)將保存于4 ℃的菌株Streptomyces plumbidurans接種于PDA平板,28 ℃培養(yǎng)7 d以進(jìn)行活化.然后將單菌落接種至改良ISP 2培養(yǎng)基 (1 L):恒溫?fù)u床28 ℃,180 r/min,培養(yǎng) 3 d,作為種子液.

1.3 菌株發(fā)酵將種子液接種至PDB培養(yǎng)基25 L,培養(yǎng)8 d,28 ℃,180 r/min,發(fā)酵液采用紗布過濾,收集濾液,得發(fā)酵液25 L,然后將發(fā)酵液減壓濃縮至2 L.

1.4 儀器與試劑質(zhì)譜儀(美國Agilent 6500系列Q-TOF LC/MS);核 磁 共 振 儀(Avance 600 MHz,TMS作為內(nèi)標(biāo));萬分之一電子天平(上海越平科學(xué)儀器有限公司);搖床(上海智城分析儀器制造有限公司,ZWY-2102);柱色譜用硅膠、薄層色譜用硅膠GF254(青島海洋化工廠有限公司);Sephadex LH-20(美國GE公司); D101大孔樹脂(滄州寶恩吸附材料科技有限公司);色譜試劑(上海星可高純度試劑公司);石油醚、二氯甲烷、丙酮、乙酸乙酯、甲醇等有機溶劑均為工業(yè)純,經(jīng)重蒸后使用.顯色劑為H2SO4(10%)的乙醇溶液.

1.5 發(fā)酵代謝產(chǎn)物的提取與分離發(fā)酵液濃縮液采用等體積的乙酸乙酯萃取3次,濃縮萃取液,得乙酸乙酯浸膏43 g.將乙酸乙酯浸膏用甲醇溶解,過濾,除去不溶物,然后采用D101大孔樹脂柱(φ80 mm×500 mm)初步分離,洗脫劑為10%~100%乙醇水梯度洗脫;根據(jù)薄層色譜(TLC),10%濃硫酸乙醇溶液顯色合并相似成分,得6個組分Fr A~F.

Fr A組分(1.3 g),經(jīng)Sephadex LH-20柱(MeOH)純化,根據(jù)TLC合并相似組分,得到Fr A 1~3.Fr A-2(132 mg)部分,采用硅膠柱色譜分離,洗脫劑為石油醚-丙酮(體積比20∶1~3∶1),得到化合物1(11 mg)和化合物2(6 mg).FrA-3(78 mg) 部分結(jié)晶后的母液,通過硅膠柱色譜分離,洗脫劑為石油醚-丙酮(體積比15∶1~3∶1),得到化合物3(2.8 mg).

1.6 體外抗腫瘤和抑菌活性評價

1.6.1 體外抗腫瘤細(xì)胞毒活性 實驗采用MTT法檢測人結(jié)腸癌細(xì)胞(HCT116)、人宮頸癌細(xì)胞(Hela)、肝癌細(xì)胞(LM-3)存活率,按照使用說明書用MTT [3-(4,5-二甲基噻唑-2)-2,5-二苯基四氮唑溴鹽]法檢測細(xì)胞存活率.全自動酶標(biāo)儀(波長570 nm)測定各孔OD值(A);空白對照加等體積DMSO處理,以紫杉醇為陽性對照藥(4 μmol/L),每組重復(fù)3個復(fù)孔.將A值作為反映細(xì)胞活性及代謝狀況的參數(shù),各實驗重復(fù)3次,抑制率按公式進(jìn)行計算.

1.6.2 體外抑菌實驗 采用微量稀釋法檢測化合物的體外抑菌活性.分別將大腸桿菌、金黃色葡萄球菌以及枯草芽孢桿菌接種于LB固體培養(yǎng)基,37 ℃培養(yǎng)24 h后,挑取單菌落2~3個于20 mL LB液體培養(yǎng)基中,37 ℃,180 r/min搖床培養(yǎng)6 h,用LB液體培養(yǎng)基稀釋成1×105CFU/mL菌懸液.稱取適量的化合物1~3,用DMSO配制成100 μmol/L的儲存液,并用0.22 μm微孔濾膜過濾.取無菌的96孔板,外周36孔分別加入100 μL無菌水,其余每孔加入100 μL 1×105CFU/mL菌懸液.同時,選取環(huán)丙沙星作為陽性對照,DMSO作空白對照,且每個梯度設(shè)3個復(fù)孔,微板觀察法檢測其最小抑菌濃度(Minimum Inhibitory Concentration, MIC)值.

2 結(jié)果與分析

2.1 化合物1的結(jié)構(gòu)鑒定無色油狀物,易溶于甲醇、氯仿.HR-ESI-MS顯示分子式為C10H15NO3(m/z198.112 0 [M+H]+,計算值為 C10H15NO3[M+H]+198.112 5),不飽和度為4.化合物1的1H NMR譜(表1)顯示含有2個含氧的次甲基氫[δH4.07(t,J=5.4 Hz,H-6),3.95(t,J=6.0 Hz,H-7)],6個烯氫[δH6.02(d,J=14.4 Hz,H-2),7.17(dd,J=15.0,11.4 Hz,H-3),6.41(dd,J=15.6,11.4 Hz,H-4),6.16(dd,J=15.6,6.0 Hz,H-5),5.52(ddd,J=15.6,7.2,1.8 Hz,H-8),5.72 (1H,dq,J=15.0,6.6 Hz,H-9)],根據(jù)耦合常數(shù)確定3個雙鍵為E式,1個甲基信號[δH1.71,d,J=6.6 Hz,H-10],共10個 氫 信 號.13C NMR和DEPT譜顯示該化合物有10個碳信號(表1),包括1個酮羰基[δc171.2],2個次甲基的碳信號[δc76.7,76.0],1個甲基信號[δc18.0],其余為雙鍵碳信號,因此由3個雙鍵和1個羰基構(gòu)成該化合物的4個不飽和度,推測該化合物為鏈狀不飽和脂肪酰胺.根據(jù)1H-1H COSY相關(guān),我們可以得到H-2/H-3/H-4/H-5/H-6/H-7/H-8/H-9/H-10相關(guān)(圖2).二維HMBC圖譜給出H-10與C-9,C-8相關(guān),H-8與C-7,C-9相關(guān),H-5與C-6,C-4相關(guān),H-2與C-1,C-3相關(guān).由此確定化合物1的平面結(jié)構(gòu),因該類成分為長鏈化合物,故未鑒定其絕對構(gòu)型,因此本文報道其平面結(jié)構(gòu)為(2E,4E,8E)6,7-二羥基-癸酸酰胺,并命名為kcacylamide A.

2.2 化合物2的結(jié)構(gòu)鑒定無色油狀物,易溶于甲醇、氯仿.HR-ESI-MS顯示分子式為C10H15NO3(m/z198.112 2 [M+H]+,計算值為 C10H15NO3[M+H]+198.112 5),不飽和度為4.化合物2的1H NMR譜(表1)顯示含有2個含氧的次甲基氫[δH4.67(t,J=6.0 Hz,H-6),4.25(t,J=5.1 Hz,H-9)],6個烯氫[δH6.04(d,J=15.0 Hz,H-2),7.16(dd,J=15.0,10.8 Hz,H-3),6.38(dd,J=15.0,11.4 Hz,H-4),6.09(dd,J=15.6,6.0 Hz,H-5),5.65(dd,J=15.6,6.0 Hz,H-7),5.74(dd,J=15.6,6.0 Hz,H-8)],根據(jù)耦合常數(shù)確定3個雙鍵為E式,1個甲基信號[δH1.22,d,J=6.6 Hz,H-10],共10個氫信號.13C NMR和DEPT譜顯示該化合物有10個碳信號(表1),包括1個酮羰基[δc171.2],2個次甲基的碳信號[δc76.7,76.0],1個甲基信號[δc18.0],其余為雙鍵碳信號,因此由3個雙鍵和1個羰基構(gòu)成該化合物的4個不飽和度,推測該化合物為化合物1的類似物.根據(jù)1H-1H COSY和HMBC圖譜推測該化合物的平面結(jié)構(gòu)(圖2),為(2E,4E,7E)6,9-二 羥 基-癸 酸 酰 胺,并 命 名 為kcacylamide B.

表1 化合物1~3的1H NMR(600 MHz)和13C NMR(150 MHz) 數(shù)據(jù)Tab.1 1H NMR (600 MHz) and 13C NMR (150 MHz) data of compounds 1-3

圖2 化合物1~3的重要1H-1H COSY和HMBC相關(guān)Fig.2 The key 1H-1H COSY and HMBC of compounds 1-3

2.3 化合物3的結(jié)構(gòu)鑒定無色油狀物,易溶于甲醇、氯仿.HR-ESI-MS顯示分子式為C10H17NO3(m/z200.127 8 [M+H]+,計算值為 C10H17NO3[M+H]+200.128 1),不飽和度為3.化合物3的1H NMR譜(表1)顯示含有2個含氧的次甲基氫[δH4.02(t,J=6.0 Hz,H-6),3.51(m,H-7)],4個烯氫[δH6.02(d,J=15.6 Hz,H-2),7.20(dd,J=15.0,10.8 Hz,H-3),6.43(dd,J=15.6,11.4 Hz,H-4),6.24(dd,J=15.6,6.6 Hz,H-5)],根據(jù)耦合常數(shù)確定3個雙鍵為E式,1個甲基信號[δH1.71,d,J=6.6 Hz,H-10],共10個氫信號.13C NMR 和DEPT 譜顯示該化合物有10個碳信號(表1),包括1個酮羰基[δc171.2],2個次甲基的碳信號[δc76.7,76.0],1個甲基信號[δc18.0],其余為雙鍵碳信號,因此由3個雙鍵和1個羰基構(gòu)成該化合物的4個不飽和度,推測該化合物為鏈狀不飽和脂肪酰胺.根據(jù)1H-1H COSY相關(guān),我們可以得到H-2/H-3/H-4/H-5/H-6/H-7/H-8/H-9/H-10相關(guān)(圖2).二維HMBC圖譜給出H-10與C-9,C-8相關(guān),H-8與C-7,C-9相關(guān),H-5與C-6,C-4相關(guān),H-2與C-1,C-3相關(guān).由此確定化合物3的平面結(jié)構(gòu),為(2E,4E,8E)6,7-二羥基-癸酸酰胺,并命名為kcacylamide C.

2.4 活 性 鑒 定 結(jié) 果通 過MTT法 檢 測 化 合 物1~3的體外抗腫瘤活性,檢測人結(jié)腸癌細(xì)胞(HCT116)、人宮頸癌細(xì)胞(Hela)、肝癌細(xì)胞(LM-3)存活率;采用微板觀察法檢測枯草桿菌(Bacillus subtilis)、大腸桿菌(Escherichia coli)、金黃色葡萄球菌(Staphylococcus aureus)MIC值(陽性對照環(huán)丙沙星MIC為2 μmol/L),結(jié)果顯示3個化合物在50 μmol/L濃度下均無顯著的抗腫瘤細(xì)胞毒活性及抑菌活性.

3 討論與結(jié)論

在普通微生物研究達(dá)到一定程度后,越來越多的研究者們將研究目標(biāo)鎖定在特殊環(huán)境微生物,例如:海洋微生物、高溫溫泉微生物、內(nèi)生菌等.這些特殊環(huán)境微生物具有產(chǎn)生豐富代謝產(chǎn)物的潛力,可以利用其次級代謝產(chǎn)物開發(fā)創(chuàng)新型殺菌劑、新藥等.鏈霉菌本身就是一個具有較高代謝能力的菌株,國內(nèi)外較多學(xué)者均在不遺余力地深入挖掘該類菌株.Streptomyces plumbidurans自云南昆明東川銅礦中分離,采用PDB培養(yǎng)基發(fā)酵得到次生代謝產(chǎn)物.采用高效液相檢測發(fā)現(xiàn),該菌的代謝產(chǎn)物較為豐富,而且較為復(fù)雜.于是我們在沒有優(yōu)化培養(yǎng)基的條件下進(jìn)行該菌株的大規(guī)模發(fā)酵,采用經(jīng)典的植物化學(xué)分離鑒定方法,對其發(fā)酵液進(jìn)行研究,獲得3個新的脂肪酰胺類成分.關(guān)于該類成分的研究報道較少,我們利用目前實驗室現(xiàn)有的活性篩選平臺,對其進(jìn)行抗腫瘤細(xì)胞毒和抑菌活性篩選,目前暫時沒有發(fā)現(xiàn)以上3個新成分具有顯著的生理活性,因此我們將繼續(xù)開發(fā)其他方面的生理活性.脂肪酰胺類成分在鏈霉菌的次生代謝產(chǎn)物中被報道較少,2019年Hou等[11]從海洋鏈霉菌Strptomyces youssoufiensis的基因突變體的分離得到一個新的脂肪酰胺類化合物.土壤來源的鏈霉菌Strptomyces maoxianensis中曾報道分離得到2個新的脂肪酰胺類成分,通過細(xì)胞毒測試發(fā)現(xiàn)化合物1和2存在較弱的抗人肺癌細(xì)胞A549、人肝癌細(xì)胞HepG2和白血病K562細(xì)胞的活性[12].關(guān)于這類成分的活性研究報道,C20長鏈脂肪酰胺具有類似大麻素的生理活性,具有開發(fā)成抗抑郁和抗焦慮藥物的潛力[13].同時還認(rèn)為脂肪酰胺雖然結(jié)構(gòu)較為簡單,但是卻是一類重要的信號分子,影響我們的痛覺、炎癥、睡眠等重要的生理功能[14].由此可見,對于該菌的開發(fā),還可以進(jìn)一步深入研究,通過優(yōu)化培養(yǎng)基以提高代謝產(chǎn)物的多樣性,為先導(dǎo)化合物的開發(fā)提供資源.

本文從東川銅礦中分離得到一株Streptomyces plumbidurans,采用PDB培養(yǎng)基發(fā)酵該菌,并研究其次生代謝產(chǎn)物,從中分離得到3個全新的脂肪酰胺類化合物,并利用核磁、質(zhì)譜、紅外光譜等確定其平面結(jié)構(gòu).對3個新化合物進(jìn)行了初步的抗腫瘤細(xì)胞毒活性測試和抗菌活性測試,為深入研究該菌的次生代謝產(chǎn)物奠定了基礎(chǔ).

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