任冰鈺,王 玨,胡明欣,高曉凡,丁相福*
(1.吉林大學(xué)第二醫(yī)院 甲狀腺外科,吉林 長春130041;2.吉林大學(xué)白求恩口腔醫(yī)院 修復(fù)科,吉林 長春130021)
根據(jù)癌癥統(tǒng)計報告,甲狀腺癌(thyroid cancer,TC)是第九大最常被診斷出的癌癥[1],居城市地區(qū)女性惡性腫瘤發(fā)生率第4位,預(yù)測將以年均20%的速率持續(xù)增長[2]。甲狀腺乳頭狀癌(papillary thyroid carcinoma,PTC)是TC中最常見的病理類型,10年生存率高達90%[3]。隨著檢出率增高,高侵襲性、分化程度差、臨床分期晚的PTC數(shù)量逐年增加,它們的復(fù)發(fā)及死亡風(fēng)險較大[4]。長鏈非編碼RNA(Long Noncoding RNA,lncRNA)具有相對較高的組織器官特異性[5],研究發(fā)現(xiàn)在發(fā)生側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的PTC中l(wèi)ncRNA出現(xiàn)差異表達基因,擬為阻斷淋巴管形成、降低側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率、提高患者生存率提供靶點。
收集3例2020年在吉林大學(xué)第二醫(yī)院病理證實為發(fā)生側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的PTC患者的癌組織、癌旁組織、無瘤甲狀腺組織。
第1例:男性,48歲,(甲狀腺左葉)微小乳頭狀癌(直徑分別為0.3 cm、0.5 cm),(甲狀腺右葉)微小乳頭狀癌(直徑分別為0.2 cm、0.5 cm),右頸Ⅲ、Ⅵ區(qū)淋巴結(jié)(1/6)。
第2例:女性,27歲,(甲狀腺左葉)微小乳頭狀癌(多灶,最大直徑0.8 cm),(甲狀腺右葉)乳頭狀癌,左側(cè)II-V區(qū)淋巴結(jié)(6/10),左側(cè)VI區(qū)淋巴(7/12),右側(cè)Ⅵ區(qū)淋巴結(jié)(2/2)。
第3例:女性,26歲,(甲狀腺左葉)乳頭狀癌,(甲狀腺右葉)微小乳頭狀癌,左側(cè)Ⅱ-Ⅴ區(qū)淋巴結(jié)(2/6),左側(cè)Ⅵ區(qū)淋巴結(jié)(7/12)。
1.2.1去核糖體RNA(rRNA)鏈特異性文庫測序,操作流程圖及儀器試劑如圖1所示。
圖1 rRNA鏈特異性文庫測序?qū)嶒灹鞒?/p>
1.2.2生信分析 見圖2。
圖2 生信分析流程圖
差異表達基因篩選標準:FDR<0.05&|log2FC|≥1。繪制出散點圖(圖3)、火山圖(圖4)。
見表1,圖3、圖4。
回顧性分析發(fā)現(xiàn)PTC發(fā)生側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移率為20%-90%[6]。癌灶侵犯腺葉上段1/3、原發(fā)灶分期達到T3或T4、多中心病灶均為獨立的危險因素[7]??傮w而言,這樣的患者預(yù)后較差[8],死亡率高,尤其是老年患者[9]。若無影像學(xué)及穿刺病理學(xué)證實為發(fā)生側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的PTC,否認手術(shù)不會常規(guī)清掃側(cè)頸部淋巴結(jié)。據(jù)統(tǒng)計,隱匿性發(fā)生側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的PTC高達55%[10]。
圖3 差異基因可視化圖
圖4 差異基因可視化圖
淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移與淋巴管形成密不可分,腫瘤會直接或間接刺激淋巴管生成和產(chǎn)生促進淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的生長因子[11]。淋巴管生成是惡性腫瘤細胞發(fā)生淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的限速步驟[12]。lncRNA被證實為多種腫瘤的驅(qū)動或抑制因子,與惡性腫瘤的發(fā)生發(fā)展、細胞凋亡過程相關(guān)[13],影響癌癥細胞內(nèi)穩(wěn)態(tài)的各個方面[14]。
實驗得出lncRNA H19明顯高表達、lncRNA CHI3L1明顯低表達,以此展開討論。H19位于染色體11p15,該位點還包含胰島素樣生長因子2[15],在胚胎發(fā)生中高表達,但出生后大多組織中幾乎檢測不到[16]。H19具有促癌和抑癌的雙向功能,證實與人類遺傳疾病和癌癥有關(guān)[16],參與多種腫瘤的侵襲轉(zhuǎn)移過程,在肺癌[17]、乳腺癌[18]、胃癌[19]高表達,而在視網(wǎng)膜母細胞瘤[20]、膀胱癌[21]中低表達。Lan[22]發(fā)現(xiàn)H19在PTC癌組織中表達下調(diào)。Liu等發(fā)現(xiàn)H19表達水平明顯高于癌旁或正常組織[23-24],H19過表達時抑制細胞周期進展,細胞增殖、遷移和侵襲性增加[23]。本實驗得出H19在癌組織、癌旁組織中均高表達,推測與腫瘤細胞增殖和侵襲相關(guān),與發(fā)生側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),擬通過構(gòu)建lncRNA-H19敲除慢病毒,轉(zhuǎn)染高表達癌細胞,qPCR驗證敲減水平,進而檢測各組細胞的增殖、遷移及侵襲能力。殼多糖酶3樣蛋白1(chitinase 3-like 1,CHI3L1),也稱為YKL-40,位于染色體1q32.1,與多種惡性腫瘤相關(guān):在結(jié)腸癌[25]、食管癌[26]、宮頸癌[27]高表達,提示侵襲性增強、預(yù)后不良,在口腔癌中高表達,提示與淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān)[28]。Cheng等[29]發(fā)現(xiàn)CHI3L1在甲狀腺良性腫瘤中呈現(xiàn)低表達或不表達,在甲狀腺惡性腫瘤中高表達。本實驗CHI3L1低表達考慮與側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移有關(guān),可能也因為樣本量較少且未包含PTC亞型有關(guān)。
表1 差異表達基因
隨著全基因組和轉(zhuǎn)錄組測序技術(shù)推進和精準醫(yī)學(xué)的發(fā)展,lncRNA在多種腫瘤中出現(xiàn)基因表達差異,有望作為腫瘤標志物用于疾病的診斷和治療。
綜上所述,H19、CHI3L1在發(fā)生側(cè)頸淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移的PTC中出現(xiàn)差異表達,推測與惡性病理特征有關(guān),是預(yù)后不良的分子標志物,可作為靶點阻斷淋巴管形成,降低側(cè)頸部淋巴結(jié)的轉(zhuǎn)移率。