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原發(fā)灶不明癌溯源定位方法的研究進(jìn)展*

2023-03-21 20:21:27趙凌昆李葳駱驚濤
中國(guó)腫瘤臨床 2023年3期
關(guān)鍵詞:甲基化癌癥部位

趙凌昆 李葳 駱驚濤

原發(fā)灶不明癌(cancer of unknown primary,CUP)是一種侵襲性疾病,占所有惡性上皮性腫瘤的3%~5%。其中位生存時(shí)間為8~11 個(gè)月,僅25%患者超過(guò)1年,20%~50%的患者無(wú)法找到原發(fā)病灶。這導(dǎo)致在CUP 的診斷中,通常要依靠經(jīng)驗(yàn)性化療,患者預(yù)后差,5年生存率較低。故急需確定腫瘤的來(lái)源并進(jìn)行針對(duì)性治療。近年來(lái),已有多種方法可以用于CUP 的原發(fā)病灶定位,這些技術(shù)將有助于臨床上對(duì)CUP 進(jìn)行評(píng)估及診療,并較好的改善患者的預(yù)后。本文對(duì)原發(fā)灶不明癌的定位方法、研究進(jìn)展,以及溯源定位技術(shù)的應(yīng)用給予綜述,為臨床治療提供新的方法及理論依據(jù)。

1 CUP 的概述

流行病學(xué)調(diào)查數(shù)據(jù)表明,CUP 占總癌癥的3%~5%,是發(fā)達(dá)國(guó)家最常見(jiàn)的10 種惡性腫瘤之一,也是癌癥相關(guān)的第四大死亡原因[1]。通常CUP 發(fā)病時(shí)的中位年齡約為60 歲,且男性的發(fā)病率略高于女性。在兒童中,CUP 在確診的實(shí)體瘤中所占比例不到1%[2]。荷蘭的一項(xiàng)研究報(bào)告中表明,患CUP 的風(fēng)險(xiǎn)可能與吸煙和飲酒有關(guān)[3],但有癌癥家族史并不是CUP 的獨(dú)立危險(xiǎn)因素[4]。

1.1 CUP 的發(fā)生

CUP 不是一個(gè)單一的生物實(shí)體,而是由不相關(guān)的特定部位腫瘤組成的,且所有這些轉(zhuǎn)移腫瘤都具有逃避檢測(cè)的微小原發(fā)腫瘤的特性[5]。在CUP 患者中未發(fā)現(xiàn)原發(fā)腫瘤的原因可能是成像技術(shù)檢測(cè)微小腫瘤的靈敏度有限、原發(fā)腫瘤退化或保持休眠,以及干細(xì)胞源性[6]。目前的假說(shuō)普遍認(rèn)為其是一種獨(dú)特的,但尚未被識(shí)別的病理實(shí)體,起源于特殊的、具有共同特性的干細(xì)胞。這種細(xì)胞可以在體外分離,并通過(guò)連續(xù)的移植在體內(nèi)繁殖,顯示出高致瘤性[7]。在對(duì)同一個(gè)CUP 患者的多個(gè)轉(zhuǎn)移瘤進(jìn)行基因和轉(zhuǎn)錄組分析后顯示出高度相似性,進(jìn)一步證明了其來(lái)自同一來(lái)源[8]。

1.2 CUP 的病理生理學(xué)

CUP 在臨床上表現(xiàn)多樣,淋巴結(jié)、肝、骨最常受累[3,9],大多數(shù)CUP 起源于癌癥,85%~90 %起源于腺癌和低分化癌、5%~10%起源于鱗癌,5%起源于神經(jīng)內(nèi)分泌癌[9]。肺臟是CUP 病變的最常見(jiàn)的原發(fā)部位,其次是各種胃腸道腫瘤,而乳腺和前列腺則很少被確定為病變的主要部位[3]。CUP 患者往往死于肺部或肝部等其他器官的轉(zhuǎn)移[10]。研究顯示,CUP 患者存在著獨(dú)立于原發(fā)腫瘤的導(dǎo)致轉(zhuǎn)移的遺傳特征,在對(duì)22例CUP 患者進(jìn)行下一代測(cè)序(next-generation sequencing,NGS)后,檢測(cè)到268 個(gè)基因的共600 個(gè)突變,且所有患者都有至少一個(gè)或多個(gè)基因的改變,如TP53、CDKN2A、SMAD4、BRAF 等[9]。Haratani 等[11]研究表明,CUP 中TP53 的突變率與在其他實(shí)體瘤中的突變率相當(dāng),這證明TP53 的突變可能在CUP 的發(fā)生發(fā)展中不起主要作用。

1.3 CUP 的診治

20世紀(jì)70年代初,在尸檢未發(fā)現(xiàn)原發(fā)腫瘤的情況下才能診斷為CUP[12]。目前,關(guān)于原發(fā)灶不明癌的診斷方法主要包括具有特定標(biāo)志物的免疫組織化學(xué)檢測(cè)、胸部X 光成像技術(shù)、胸部、腹部和骨盆的計(jì)算機(jī)體層攝影(CT)以及磁共振成像(MRI)和正電子發(fā)射斷層掃描(PET)等,但是均未能較好的明確原發(fā)病灶的位置。在CUP 的治療中,通常采取經(jīng)驗(yàn)性基于鉑的聯(lián)合化療方案,如紫杉醇+鉑,或吉西他濱+鉑等治療[12],但患者的中位生存期僅為6~15 個(gè)月[13]。目前,迫切需要從分子層面上對(duì)原發(fā)灶不明癌進(jìn)行溯源,以提高治療的有效性和患者的生存率。一項(xiàng)回顧性研究表明,CUP 具有適合免疫檢查點(diǎn)抑制劑(immune checkpoint inhibitors,ICIs)治療的免疫特性,類似于對(duì)ICI 敏感的實(shí)體癌癥,因此ICIs 是CUP 治療的一個(gè)潛在選擇[11]。

2 CUP 的定位方法

近10年來(lái),不同國(guó)家的CUP 的發(fā)病率呈總體下降的趨勢(shì)[14],在一項(xiàng)研究報(bào)告中表明,接受癌癥特異性藥物治療的患者的生存時(shí)間比標(biāo)準(zhǔn)化療更長(zhǎng)[9]。已有一些傳統(tǒng)的方法來(lái)預(yù)測(cè)原發(fā)病灶位置,如免疫組織化學(xué)法、胸部X 光等,其準(zhǔn)確度只有20%~30%[15]。有助于活檢和確定疾病程度的PET-CT 在CUP 的定位中也有一定的幫助,在原發(fā)病灶不明的宮頸癌患者中,44%患者通過(guò)PET-CT 發(fā)現(xiàn)了原發(fā)病灶[16]。目前,分子分類工具已逐漸成熟,如組織蛋白陣列、microRNA 微陣列、寡核苷酸微陣列等方法可以描述腫瘤中的基因或蛋白的表達(dá)?;谶@些檢測(cè)方法,可以將CUP 的分子特征與已知腫瘤的分子特征進(jìn)行匹配,并完成原發(fā)病灶的定位。

2.1 光學(xué)顯微鏡和免疫組織化學(xué)法檢測(cè)

免疫組織化學(xué)法(immunohistochemistry,IHC)是確定腫瘤類型、亞型以及起源部位的重要的檢測(cè)工具,并可用于評(píng)估組織樣本中特定的蛋白表達(dá)以確認(rèn)癌組織的類型并進(jìn)行診斷[17]。目前,病理學(xué)和IHC 檢測(cè)仍是CUP 診斷的“金標(biāo)準(zhǔn)”[18]。在原發(fā)癌和轉(zhuǎn)移癌中,腫瘤通常表達(dá)一些組織特有的基因,而這種組織特異性是由調(diào)控基因或蛋白質(zhì)產(chǎn)物所決定的。在原發(fā)癌與轉(zhuǎn)移癌的表達(dá)譜有一致性的前提下,可應(yīng)用IHC 檢測(cè)腫瘤的譜系。雖然其準(zhǔn)確度僅有30%左右,但普遍認(rèn)為通過(guò)IHC 來(lái)尋找原發(fā)癌癥是可行的,并可以幫助患者制定更好的治療方案[18]。

2.2 DNA 微陣列

DNA 微陣列(DNA microarrays)可同時(shí)監(jiān)測(cè)數(shù)千個(gè)基因的表達(dá),可作為癌癥分類的一種工具[19]。DNA微陣列有助于高通量地發(fā)現(xiàn)腫瘤特異性標(biāo)記基因,臨床上最常使用仍是常規(guī)IHC 或其他傳統(tǒng)的方法。雖然大多數(shù)的實(shí)體瘤的分子marker 還未被最終確定[20],但基于DNA 微陣列/基因芯片(genechip)的腫瘤基因表達(dá)譜已廣泛被用于癌癥的診斷[21]。在一項(xiàng)對(duì)14 種腫瘤類型的218 例腫瘤標(biāo)本和90 例正常組織標(biāo)本進(jìn)行寡核苷酸微陣列基因表達(dá)分析發(fā)現(xiàn),該方法的總體分類準(zhǔn)確率達(dá)78%[22]。證明了對(duì)原發(fā)灶不明癌進(jìn)行分子分類的可能性,并為CUP 的診斷和臨床實(shí)施提供了一種新的思路。

在一項(xiàng)前瞻性隨機(jī)研究中,應(yīng)用基于微陣列的分類器已在約75%的患者中實(shí)現(xiàn)了對(duì)原發(fā)部位的準(zhǔn)確預(yù)測(cè)[23],但目前基于微陣列的檢測(cè)是否具有臨床應(yīng)用所需的靈敏度、特異性尚不清楚,且這種檢測(cè)方式仍然受制于腫瘤的類型、數(shù)量、成本等。

2.3 DNA 甲基化

DNA 甲基化是一種穩(wěn)定的DNA 的標(biāo)記物,在不同的腫瘤類型中具有不同的特征[24]。DNA 甲基化的變化可以被用作癌癥檢測(cè)的一個(gè)可行的生物標(biāo)記物。在一項(xiàng)研究中用甲基化EPIC 芯片(Illumina Infinium MethylationEPIC 850k BeadChip)和測(cè)序技術(shù)分析檢測(cè)了甲狀腺癌組織樣本中的全基因組DNA 甲基化模式和基因表達(dá)譜,得出其差異甲基化的CpG 位置與區(qū)域幾乎覆蓋整個(gè)基因組,這為甲狀腺癌的腫瘤發(fā)生提供了新的線索[25]。同時(shí),在使用該芯片對(duì)正常組織及宮頸癌組織的分析中表明,與正常組織相比,宮頸癌組織中的SEPT9 高度甲基化,為后續(xù)的臨床治療提供了可靠的支持與指導(dǎo)意義[26]。

研究顯示,基于微陣列DNA 甲基化特征(microarray DNA methylation signatures)建立了一個(gè)包含38 種腫瘤類型的分類器來(lái)確定原發(fā)病灶的位置,在通過(guò)光學(xué)顯微鏡以及IHC 等驗(yàn)證后,其準(zhǔn)確度高達(dá)87%[27]。進(jìn)一步表明基于DNA 甲基化特征來(lái)判斷原發(fā)不明癌的原發(fā)病灶的位置是可行的。同時(shí),探索更靈敏、更特異的DNA 甲基化檢測(cè)方法,對(duì)進(jìn)一步提高疾病的早期診斷水平具有重要意義,將DNA 甲基化作為診斷CUP 的工具,可作為一種預(yù)測(cè)最初未確定原發(fā)部位的一種方法。雖然仍需進(jìn)一步的前瞻性臨床研究來(lái)證明其提高患者的總體生存率,但分子治療將對(duì)腫瘤的特異性治療的發(fā)展至關(guān)重要,在確定原始腫瘤類型后進(jìn)行特定部位的治療可以改善患者的預(yù)后[27]。

2.4 MicroRNA

MicroRNA 是一種小的調(diào)節(jié)性RNA(約22nt),在癌癥中的表達(dá)紊亂,其差異表達(dá)與腫瘤的形成有關(guān),其參與組織形態(tài)的發(fā)生、細(xì)胞凋亡等細(xì)胞過(guò)程,是癌癥分類和預(yù)后的組織標(biāo)記物[28]。MicroRNA 可以調(diào)節(jié)特定的mRNA 靶點(diǎn)的活性,并在廣泛的生理病理過(guò)程中發(fā)揮著重要的作用[29]。理想的MicroRNA 標(biāo)記物是在癌細(xì)胞上中高表達(dá)而在健康人的血漿中幾乎檢測(cè)不到[30]。MicroRNA 無(wú)論是在受損的樣本中,還是在生物體液中都具有高度的穩(wěn)定性和對(duì)RNase 酶的抵抗力,且無(wú)論組織樣本質(zhì)量如何,MicroRNA 均能被檢測(cè)到[31]。MicroRNA 的特點(diǎn)支持從FFPE 樣本中獲得其圖譜,進(jìn)而確定腫瘤的分子特征,并進(jìn)行快速的CUP溯源[32]。研究證明,在前列腺癌患者中,腫瘤表達(dá)的miRNA-141 的血清水平與健康人相比,有顯著的特異性和敏感性[32]。且高度穩(wěn)定的MicroRNAs 是癌癥診斷的理想的標(biāo)志物,有研究測(cè)量了64 個(gè)MicroRNA 來(lái)識(shí)別腫瘤的起源,并成功地區(qū)分了42 種腫瘤的類型[33]。Laprovitera 等[32]在分析了150 例患者的159份FFPE 樣本的89 個(gè)MicroRNA 后,推斷共53 例包括17 個(gè)腫瘤類型的原發(fā)病灶未確定的轉(zhuǎn)移性癌,并成功獲得了良好的預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率?;贛icroRNA 分析雖有助于選擇治療方案,但仍缺乏大量的Ⅲ期臨床試驗(yàn),有必要進(jìn)行進(jìn)一步的前瞻性臨床研究,以評(píng)估基于MicroRNA 的分類器在臨床上的使用情況,并證明其對(duì)CUP 患者生存的可能影響。

2.5 基因表達(dá)譜

與IHC 相比,基因表達(dá)譜(gene expression profile,GEP)在確定CUP 的原發(fā)部位方面有更高的準(zhǔn)確率,尤其是在中、低分化的病例中。依據(jù)2022年NCCN 指南,可以通過(guò)基因表達(dá)譜的分析來(lái)輔助CUP 的診斷與制定下一步診療計(jì)劃。

92 基因分子腫瘤譜(molecular tumor profiling,MTP)是一種基于GEP 的檢測(cè)方法,是一種由92 個(gè)基因組成的逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈?zhǔn)椒磻?yīng)監(jiān)測(cè)方法,即通過(guò)RT-qPCR 的方法評(píng)估92 種基因特征的表達(dá),需在活檢組織上進(jìn)行[34]。有報(bào)道[35]利用MTP 分析預(yù)測(cè)CUP 的原發(fā)組織,其準(zhǔn)確性為75%。但由于從甲醛固定-石蠟包埋(formalin-fixed paraffin-embedding,F(xiàn)FPE)中提取到的RNA 質(zhì)量不佳,導(dǎo)致GEP 分析受到限制。在其驗(yàn)證性研究中,該方法可以預(yù)測(cè)85%的已知原發(fā)腫瘤患者的起源組織、可以確定多達(dá)30 種腫瘤類型的主要來(lái)源[32]。同時(shí),在一項(xiàng)應(yīng)用該方法的前瞻性研究中,其可識(shí)別84%的原發(fā)腫瘤部位[16],這表明與標(biāo)準(zhǔn)的臨床評(píng)估相比,該方法可以識(shí)別更明確的原發(fā)腫瘤部位,且在確定CUP 患者起源組織方面是標(biāo)準(zhǔn)病理評(píng)估的補(bǔ)充,特別是當(dāng)IHC 無(wú)法確定時(shí),MTP 可以作為一種較好的手段來(lái)確定原發(fā)病灶位置,但由于可能會(huì)存在幾種腫瘤出現(xiàn)基因表達(dá)重疊、統(tǒng)計(jì)偏差、后續(xù)治療路線的選擇,以及原發(fā)癌癥的一致性等情況的出現(xiàn),會(huì)導(dǎo)致對(duì)起源組織出現(xiàn)錯(cuò)誤的判斷,從而無(wú)法得出確切的結(jié)論。該技術(shù)的臨床應(yīng)用已經(jīng)在一些前瞻性研究中進(jìn)行了評(píng)估,在一項(xiàng)多中心前瞻性Ⅱ期臨床試驗(yàn)中,招募了CUP 患者并用該方法進(jìn)行檢測(cè),在成功檢測(cè)的患者中有67%預(yù)測(cè)到了起源組織并接受定向治療,其中位總生存期為13 個(gè)月。這與經(jīng)驗(yàn)性治療的中位生存期相比,結(jié)果有所改善[36]。

2.6 NGS 技術(shù)

原發(fā)灶不明癌通常具有潛在的靶向性基因組的改變與突變。尤其是對(duì)于一些非小細(xì)胞肺癌、結(jié)直腸癌和黑色素瘤等實(shí)體腫瘤的患者,識(shí)別有特定治療方法的基因組的異??稍谂R床上輔助患者的治療,并對(duì)患者的預(yù)后有所改善[16]。

在一項(xiàng)對(duì)150 例原發(fā)灶不明癌進(jìn)行NGS 的回顧性研究中,有137 例(91%)出現(xiàn)了至少一種基因的改變,且45 例(30%)具有潛在的靶向性改變,如BRAF基因突變、ERBB2 基因擴(kuò)增,F(xiàn)EFR 基因融合等[37],說(shuō)明靶向治療是可行的。該研究還發(fā)現(xiàn),在接受靶向治療的患者中,其治療效果依舊不佳,最長(zhǎng)的生存期僅為14 個(gè)月左右。近年來(lái),隨著液體活檢技術(shù)的興起與成熟,通過(guò)檢測(cè)循環(huán)腫瘤DNA(circulating tumor DNA,ctDNA)來(lái)評(píng)估CUP 患者的基因組的變化逐漸所熟知,且對(duì)CUP 患者的ctDNA 分析顯示,其檢測(cè)出的基因突變率與從腫瘤組織中得出的結(jié)果相近。對(duì)442 例CUP 患者進(jìn)行ctDNA 的檢測(cè)發(fā)現(xiàn),有290例(66%)至少有一種可能是致病性的基因組改變,如RET 基因融合等[38],其可能會(huì)成為一種潛在的新型的檢測(cè)方法。

通過(guò)NGS 檢測(cè)的基因組異?;蚱渫蛔兡J脚c原發(fā)腫瘤的部位密切相關(guān),有助于識(shí)別原發(fā)腫瘤的部位。基于NGS 技術(shù)開(kāi)發(fā)的共含22 種癌癥類型的7 791個(gè)樣本的基因組學(xué)分類器可在其測(cè)試集中識(shí)別74.1%的腫瘤類型,并可在臨床上識(shí)別大于50%的可能起源組織,為患者的臨床治療帶來(lái)了改善[39]。隨著NGS 在轉(zhuǎn)移性癌癥中的日漸廣泛的應(yīng)用,基于NGS所建立的分類器可能會(huì)提供更多的機(jī)會(huì)來(lái)識(shí)別CUP中的腫瘤類型。

3 結(jié)語(yǔ)

CUP 是一種經(jīng)組織學(xué)證實(shí)的轉(zhuǎn)移性惡性腫瘤,其原發(fā)腫瘤部位在標(biāo)準(zhǔn)評(píng)估和影像研究的基礎(chǔ)上無(wú)法識(shí)別。CUP 因無(wú)針對(duì)性診療措施、患者預(yù)后不良而被廣泛研究,并代表一組不同的惡性腫瘤,具有獨(dú)特的臨床行為和獨(dú)特的生物學(xué)特征,以侵襲性、早期轉(zhuǎn)移,以及不可預(yù)測(cè)的擴(kuò)散模式為主要特點(diǎn)。大多數(shù)CUP 患者最初表現(xiàn)為轉(zhuǎn)移性疾病,常累及淋巴結(jié)、肝臟、骨和肺臟。經(jīng)驗(yàn)性化療如紫杉醇+鉑,或吉西他濱+鉑等是最常見(jiàn)的治療策略,手術(shù)和放療在化療中通常起到輔助治療效果的作用。目前,針對(duì)CUP 的化療方案尚未顯著改善患者的預(yù)后。由于無(wú)標(biāo)準(zhǔn)的CUP 化療方案,且經(jīng)驗(yàn)性治療的獲益低,對(duì)起源組織的準(zhǔn)確識(shí)別和對(duì)特定部位的治療將有可能改善CUP 患者的狀況。尸檢結(jié)果表明,CUP 的原發(fā)部位主要集中于肺臟、胰腺、肝膽等部位,但現(xiàn)有的治療或檢測(cè)手段如IHC、PETCT、X 光等都無(wú)法較好的準(zhǔn)確定位原發(fā)病灶位置[27]。近年來(lái),越來(lái)越多的更精準(zhǔn)的方法如NGS 技術(shù)、MicroRNA 檢測(cè)、DNA 甲基化芯片、基因表達(dá)譜等可在很大程度上確定原發(fā)病灶位置并可以指導(dǎo)臨床的下一步治療。隨著新的預(yù)測(cè)生物標(biāo)記物和靶向治療的確定,現(xiàn)代腫瘤學(xué)的治療越來(lái)越強(qiáng)調(diào)個(gè)性化,未來(lái)CUP 的原發(fā)病灶定位將更加精準(zhǔn),將更好地輔助臨床治療并進(jìn)一步改善患者的預(yù)后與生存。

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