金艷麗 蘭曉君 姚拓 丁小琴
摘要:為獲取對當(dāng)歸和羌活生長具有促生作用的促生菌(plant growth promoting rhizobacteria,PGPR),以當(dāng)歸、羌活的根系為研究對象,利用選擇性培養(yǎng)基分離具有固氮、溶磷和分泌3-吲哚乙酸(IAA)能力的菌株。通過對菌株的固氮酶活性、溶磷能力及分泌IAA的能力進(jìn)行測定,篩選出促生性能優(yōu)良的菌株;進(jìn)一步通過生理生化指標(biāo)和16S rDNA序列分析相結(jié)合的方法分析優(yōu)良菌株的分類地位。結(jié)果表明,共篩選到12株具有固氮酶活性的菌株,其固氮酶活性為0.30~4.04 nmol C2H4·mL-1·h-1;6株溶解無機磷的菌株,溶磷量為290.98~420.33 μg·mL-1;3株產(chǎn)IAA的菌株, IAA分泌量為10.38~18.63 μg·mL-1。經(jīng)鑒定,溶磷特性優(yōu)良的菌株屬于假單胞菌屬(Pseudomonas)和錯玫桿菌屬(Falsirhodobacter),假單胞菌屬為優(yōu)勢菌屬。綜合各菌株的促生特性,篩選出2株促生性能優(yōu)良的菌株:WQP-5(Pseudomonas grimontii)和MDP-8(Pseudomonas thivervalensis),為開發(fā)適用于甘肅道地藥材當(dāng)歸與羌活專用生物菌肥提供了優(yōu)良菌種。
關(guān)鍵詞:當(dāng)歸;羌活;促生菌;固氮;溶磷;3-吲哚乙酸doi:10.13304/j.nykjdb.2021.0534
中圖分類號:S154.3 文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A 文章編號:10080864(2023)01018710
當(dāng)歸(Angelica sinensis)具有廣泛的藥理活性,藥用價值較高,能夠抗癌、抗衰老并增強免疫功能[1];傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)認(rèn)為,當(dāng)歸具有補氣活血、調(diào)理經(jīng)絡(luò)和潤腸通便的功效[2]。羌活(Notopterygiumincisum)也是一種藥用植物,現(xiàn)代醫(yī)學(xué)認(rèn)為其具有消炎、鎮(zhèn)痛、解熱、抗心律失常、抗心肌缺血、促進(jìn)腦部血液循環(huán)、預(yù)防血栓形成等作用[3-5],傳統(tǒng)醫(yī)學(xué)認(rèn)為其具有解表散寒、祛風(fēng)勝濕、止痛等功效[6]。當(dāng)歸與羌活均為甘肅道地藥材,是道地藥材中的“西北藥”。道地藥材是在一定的生產(chǎn)區(qū)域內(nèi)生產(chǎn),能夠長期、穩(wěn)定地滿足市場需求,并經(jīng)臨床或現(xiàn)代科學(xué)技術(shù)驗證的優(yōu)質(zhì)中藥材,在中醫(yī)藥市場上具有一定地位[7]。為了提高當(dāng)歸與羌活的藥材產(chǎn)量,藥農(nóng)大量施用化肥和農(nóng)藥,肖婉君等[8]調(diào)查發(fā)現(xiàn),在當(dāng)歸成藥期一般田地磷酸二銨的施用量為400~450 kg·hm-2。大量施用化肥不僅會造成土壤退化板結(jié)、農(nóng)殘超標(biāo),還會降低藥材品質(zhì)[9-11]。生物菌肥是生物肥料的一種,具有環(huán)境友好、作用時間長、改善土壤結(jié)構(gòu)的優(yōu)良特性[12],應(yīng)用前景廣闊。生物菌肥研發(fā)的基礎(chǔ)是獲取促生特性優(yōu)良的植物根際促生菌(plant growth-promotingrhizobacteria,PGPR),Kloepper 等[13]將PGPR 定義為定殖于植物根際區(qū)域可促進(jìn)宿主生長的有益細(xì)菌。Vessey 等[14]和 Weller 等[15]認(rèn)為,滿足定殖、促進(jìn)植物生長和生防作用三個功能中的兩個就可被定義為PGPR。近年來,對PGPR的研究多針對糧食作物和經(jīng)濟(jì)作物,從蔬菜[16]、萵筍[17]、珠芽蓼[18]、紅三葉[19]、黑果枸杞[20]等植物根際均分離出具有良好特性的促生菌。藥用植物與其根際促生菌間存在著一定的互作關(guān)系[21],然而,目前對藥材植物根際微生物的研究較少。因此,本研究以甘肅岷縣的當(dāng)歸和渭源縣的羌活根系為研究對象,分離篩選具有促生特性(固氮、溶磷、分泌IAA等)的促生菌,并對優(yōu)良菌株進(jìn)行鑒定,為后續(xù)開發(fā)適用于甘肅道地藥材當(dāng)歸與羌活專用生物菌劑提供優(yōu)良菌種和研究基礎(chǔ),對生產(chǎn)綠色中藥材及保護(hù)生態(tài)環(huán)境具有重要意義。
1 材料與方法
1.1 材料
當(dāng)歸樣品采集于甘肅岷縣西寨鎮(zhèn)(34°48′33.6″N、103°80′47.9″E,海拔2 651 m);羌活樣品采集于甘肅渭源縣會川鎮(zhèn)(N 35°09′70.7″、E 103°98′85.9″,海拔2 149 m)。采用五點取樣法選擇長勢良好的植株,去除植株地上部分,將根連同根系土壤混合后裝入無菌自封袋中,低溫運輸至實驗室,48 h內(nèi)進(jìn)行樣品處理。
1.2 培養(yǎng)基
試驗所用培養(yǎng)基包括: LB培養(yǎng)基、NFM培養(yǎng)基[22]、NBRIP(National Botanical Research InstitutesPhosphate medium)培養(yǎng)基[23]、蒙金娜有機磷培養(yǎng)基[24]和KingB培養(yǎng)基[25]。
1.3 植物根際促生菌的分離純化及其測定
1.3.1 涂布液制備 抖落根系附著的土壤,將抖落虛土后的根系稱取10 g置于盛有90 mL無菌生理鹽水的三角瓶中,搖床震蕩30 min(180 r·min-1),靜置10 min后用移液器吸取1 mL懸液加入盛有9 mL滅過菌生理鹽水的試管中,制得10-1土壤梯度稀釋液,依次配制10-2、10-3、10-4、10-5梯度稀釋液,充分混勻備用。
1.3.2 固氮菌分離純化 分別吸取不同樣本10-3、10-4、10-5的梯度稀釋液100 μL,分別接種于滅菌的NFM固體培養(yǎng)基上。將接種好的培養(yǎng)皿置于28 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)3~5 d后,用接種環(huán)挑取NFM 培養(yǎng)基上不同的單菌落,用四區(qū)劃線法反復(fù)純化至菌落均一,經(jīng)結(jié)晶紫或美蘭簡單染色后在顯微鏡(1 000×,油鏡)下觀察細(xì)胞形態(tài),確定為純化合格的菌株后,將菌株轉(zhuǎn)接至LB固體斜面置于4 ℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.3 固氮特性測定 菌株的固氮酶活性采用乙炔還原法進(jìn)行測定[26]。將待測菌株活化后與無菌水配制成108 cfu·mL-1的菌懸液,吸取10 μL菌懸液接入盛有NFM半固體培養(yǎng)基的血清小瓶中(血清瓶體積15 mL,NFM半固體培養(yǎng)基5 mL),每個菌株3 個重復(fù),對照為等量不接菌。接種后28 ℃培養(yǎng)48 h,用一次性注射器從每個小瓶中抽出1 mL 氣體,然后再注入1 mL 乙炔氣體,28 ℃培養(yǎng)48 h,最后吸取50 μL的氣體注入氣相色譜儀(GC7890B),色譜條件同標(biāo)準(zhǔn)曲線,記錄C2H4出峰時間及峰面積百分比,計算菌株的固氮酶活性。
1.3.4 溶磷菌的分離純化 用移液器分別吸取不同樣本10-3、10-4、10-5梯度稀釋液100 μL,分別接種于滅菌的NBRIP和Menkina固體培養(yǎng)基上。將接種好的培養(yǎng)皿置于28 ℃的培養(yǎng)箱中培養(yǎng)5 d后,用接種環(huán)挑取NBRIP和Menkina培養(yǎng)基上出現(xiàn)溶磷圈的菌株,用四區(qū)劃線法反復(fù)純化至菌落均一,經(jīng)結(jié)晶紫或美蘭簡單染色后顯微鏡(1 000×,油鏡)下觀察,細(xì)胞形態(tài)均一為純化合格的菌株,將菌株轉(zhuǎn)接LB斜面培養(yǎng)基置于4 ℃冰箱中保存?zhèn)溆谩?/p>
1.3.5 溶解無機磷能力的測定 參考張英[27]的方法,在150 mL三角瓶中裝入50 mL NBRIP液體培養(yǎng)基,每個待測菌株3個重復(fù);121 ℃滅菌25 min,冷卻后,生物安全柜內(nèi)吸取各待測菌株的菌懸液(108 cfu·mL-1)500 μL 接種至三角瓶中。對照為不接種菌株的NBRIP培養(yǎng)基。將上述三角瓶固定于搖床,28 ℃、180 r·min-1培養(yǎng)10 d后,用酸度計測定培養(yǎng)液pH。取8 mL上述培養(yǎng)液在10 000 r·min-1離心20 min后,吸取5 mL上清液轉(zhuǎn)150 mL三角瓶中,加入0.5 mol·L-1碳酸氫鈉浸提劑45 mL,再加入適量無磷活性炭粉,振蕩機上振蕩30 min,無磷濾紙過濾,吸取濾液5 mL于50 mL容量瓶中,加入鉬銻抗試劑5 mL,用蒸餾水定容,然后搖勻,放置30 min 后,用分光光度計700 nm 波長進(jìn)行比色。讀出待測液的吸光值,計算顯色液的磷含量(μg·mL-1)??鄢龑φ蘸蟮闹禐橛行Я自隽浚é蘥·mL-1)。
培養(yǎng)液磷含量=ρ × V × Ts/V0?(1)
式中,ρ 為從標(biāo)準(zhǔn)曲線上查得P 的質(zhì)量濃度(μg·mL-1);V為顯色時定容體積(mL);Ts為分取倍數(shù);V0為測定發(fā)酵液的體積(mL)。
1.3.6 有機磷溶解菌的半定量測定 參考Shenoy等[28]的方法,將保存于LB斜面培養(yǎng)基上的溶解有機磷菌株活化后點接種于蒙金娜有機磷平板上,恒溫培養(yǎng)7 d(28 ℃)后測量各菌株形成的溶磷圈。根據(jù)測量的溶磷圈直徑(D,mm)和菌落直徑(d,mm)計算溶磷指數(shù),計算公式如下。
溶磷指數(shù)=D + d/d×100%?(2)
1.3.7 分泌IAA菌株初篩 于生物安全柜內(nèi)用接種環(huán)將上述分離純化后的固氮菌與溶磷菌全部接入制備好的培養(yǎng)基中,同時做空白對照處理,接種后在28 ℃、180 r·min-1搖床振蕩培養(yǎng)12 d。培養(yǎng)結(jié)束后,10 000 r·min-1離心菌液,吸取50 μL上清液,將50 μL 上清液與50 μL Spot 比色液混合滴于白瓷板凹陷處,同時做陰性(50 μL 未接菌的KingB培養(yǎng)基上清與Spot比色液混合)和陽性對照(50 μL·mL-1吲哚-3-乙酸10 μL與Spot比色液混合),黑暗處靜置30 min,觀察混合液的顯色反應(yīng),粉紅色為陽性,根據(jù)顯色反應(yīng)的結(jié)果初步判定菌株產(chǎn)IAA 能力大小,記錄分泌IAA 菌株編號。
1.3.8 IAA的定量測定 參考Glickmann等[29]的方法,制備50 mL KingB 液體培養(yǎng)基于150 mL三角瓶中,121 ℃,0.1 MPa 條件下滅菌25 min。
生物安全柜內(nèi),每個三角瓶中分別接入500 μL待測菌株配制成的菌懸液(108 cfu·mL-1),同時用未接菌的King'B 液體培養(yǎng)基做空白對照處理,每個待測菌株3 個重復(fù);接種后在28 ℃、180 r·min-1 搖床振蕩培養(yǎng)12 d。培養(yǎng)結(jié)束后,10 000 r·min-1 離心菌液,取上清液5 mL 加5 mLS2 比色液,在黑暗下靜置30 min 后,迅速用分光光度計在波長530 nm 下測定各待測液的吸光值,用標(biāo)準(zhǔn)曲線公式計算待測液的IAA 含量(μg·mL-1)。扣除對照后的值記為該菌株分泌到培養(yǎng)液中IAA的含量。
1.4 PGPR 菌株鑒定
1.4.1 PGPR 表型特征 將菌株從斜面接出后,四區(qū)劃線接到LB 平板上,28 ℃培養(yǎng)3 d,觀察菌落大小、色澤、邊緣和質(zhì)地等。選擇生長在指數(shù)期的細(xì)菌,結(jié)晶紫簡單染色,顯微鏡(BX60;Olympus)放大倍數(shù)1 000 倍下觀察細(xì)胞形態(tài),測定細(xì)胞大小。并進(jìn)行部分生理和生化特性的檢測[30]。
1.4.2 16S rDNA分析 用細(xì)菌基因組DNA提取試劑盒提細(xì)菌總DNA,采用16S rDNA 通用引物27F/1492r(生工生物工程股份有限公司合成)進(jìn)行PCR。 擴增產(chǎn)物進(jìn)行瓊脂糖電泳,合格后送北京奧科生物有限公司測序。將測得合格的序列用ChromasPro V2.1.8 軟件進(jìn)行拼接,在EZBiocloud網(wǎng)站(www.ezbiocloud.net) 用16S-based ID進(jìn)行比對分析,選擇序列相近模式菌株的16S rDNA序列下載,用MEGA 7.0.17軟件采用鄰近法構(gòu)建系統(tǒng)進(jìn)化樹,Pairwise Deletion,Kimura 2計算核苷酸差異值, 自展數(shù)為10 000。所有待鑒定菌株序列拼接后提交NCBI 的GenBank 數(shù)據(jù)庫并獲得檢索號。
1.5 數(shù)據(jù)處理
采用Excel 2007進(jìn)行數(shù)據(jù)整理及制圖,采用SPSS 24.0對菌株促生特性進(jìn)行單因素方差分析。
2 結(jié)果與分析
2.1 當(dāng)歸、羌活根際PGPR 菌株的分離純化
通過選擇性培養(yǎng)基分離篩選出具有固氮、溶磷特性的菌株共28株。其中,聯(lián)合固氮菌12株;溶解無機磷的菌株6株;溶解有機磷的菌株10株。從溶磷菌株和固氮菌株中分離出3株可分泌IAA的菌株,分別是MDM-6、MDP-4和WQP-5(表1)。
2.2 固氮酶活性
以乙烯濃度為橫坐標(biāo),對應(yīng)乙烯峰面積為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,制作的乙烯標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程為y=13 441x-2 124;R2=0.999 1。采用ARA 法測定21株初篩為固氮菌的固氮酶活性,結(jié)果(圖1)表明,12株菌株檢測到固氮酶活性,其固氮酶活性為0.30~4.04 nmol (C2H4)·h-1·mL-1。其中,分離自羌活根際的菌株WQN-10 固氮酶活性最高;分離自當(dāng)歸根際的菌株MDN-5 固氮酶活性最低。
2.3 無機磷溶解菌溶磷能力
以磷濃度為橫坐標(biāo),對應(yīng)比色濁度為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,所得磷標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程為y=0.529 3x+0.000 25;R2=0.999 9。采用鉬銻抗比色法定量測定19 株無機磷溶解菌株的溶磷能力,結(jié)果(圖2)表明,19 株的溶磷量為317.19~420.33 μg·mL-1,有6 株菌都具有較高的溶磷量。其中,菌株WQP-6 溶磷量最高,達(dá)420.33μg·mL-1;其次為菌株WQP-5,溶磷量也大于400 μg·mL-1;菌株WQP-1 溶磷量最低,為317.19 μg·mL-1。
2.4 菌株溶解有機磷能力
根據(jù)溶磷指數(shù)篩選到10 株溶磷指數(shù)大于200%的菌株(表2),其溶磷指數(shù)為214%~434%。其中,菌株WQM-13溶磷指數(shù)最高,為434%,溶磷能力顯著高于其它菌株;菌株WQM-1溶磷指數(shù)最低,為214%,各菌株之間溶磷能力差異顯著。
2.5 溶磷菌分泌IAA
以IAA含量為橫坐標(biāo),比色濁度為縱坐標(biāo),繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線,制作的IAA標(biāo)準(zhǔn)曲線回歸方程為y=0.013 2x+0.001 5;R2=0.999 5。利用Spot比色法和高效液相色譜法測定其分泌IAA的能力,結(jié)果表明,有5株菌株出現(xiàn)顯色反應(yīng),有3株菌株具有分泌IAA能力(圖3)。分離自當(dāng)歸的MDM-6菌株分泌的IAA量最高,為18.63 μg·mL-1,顯著高于其他株菌。
2.6 菌株鑒定結(jié)果
對篩選出促生效果較好的12株優(yōu)良菌株進(jìn)行鑒定,綜合表型特征(表3)、16S rDNA相似性(表4)和系統(tǒng)發(fā)育分析(圖4),結(jié)果(表5)表明,菌株MDP-4為醋酸鈣不動桿菌(Acinetobacter calcoaceticus);MDP-8 為Pseudomonas thivervalensis;MDM-4 為猴假單胞菌(Pseudomonas simiae);MDM-6和WQP-6為地中海假單胞菌(Pseudomonas mediterranea);WQP-1 為Pseudomonas laurylsul-fatiphila;WQP-5為格式假單胞菌(Pseudomonas grimontii);WQP-7為Pseudomonas frederiks-bergensis;WQM-11 和WQM-13 為沙漠錯玫桿菌(Falsirhodobacterdeserti)。
3 討論
本研究從當(dāng)歸根際分離到27株菌,從羌活根際分離到47株菌。其中,有固氮酶活性的菌株12株,固氮酶活性為0.30~4.04 nmol C2H4·h-1·mL-1;具有溶解無機磷能力的菌株6 株,溶磷量為317.19~420.33 μg·mL-1;溶解有機磷的優(yōu)良菌株10株,有4菌溶磷指數(shù)高達(dá)400%;從溶磷菌和固氮菌中分離出3株菌具有分泌IAA的性能,其中2株綜合性能優(yōu)良。從當(dāng)歸根系分離的MDP-8溶磷量超過400 μg·mL-1,具有良好的溶磷潛力;從羌活根系分離的WQP-5同時具有溶磷和分泌IAA的能力,且溶磷量也超過400 μg·mL-1。由此表明,MDP-8和WQP-5具有良好的開發(fā)潛力,有望發(fā)展為微生物肥料用于當(dāng)歸與羌活專用菌肥。
從來自于岷縣和渭源的當(dāng)歸、羌活根系篩選到固氮菌的固氮酶活性均不高,可能與采樣地的環(huán)境條件有關(guān)。研究表明,植物生長狀況和外界環(huán)境條件均會影響固氮菌的固氮酶活性[31]。而分離到菌株的溶磷特性較好,可能是由于該地域土壤中可利用的磷素含量較低,對于溶磷菌的需求較大。因此,相較于固氮菌,當(dāng)歸和羌活根系溶磷菌的挖掘及溶磷特性值得進(jìn)一步重點關(guān)注。當(dāng)歸根際分離的3株溶解無機磷特性優(yōu)良的菌株經(jīng)鑒定分別為醋酸鈣不動桿菌(A. calcoaceticus)、P.thivervalensis 和未定種假單胞菌(Pseudomonassp.);2株溶解有機磷特性優(yōu)良的菌株經(jīng)鑒定為猴假單胞菌(P. simiae)和地中海假單胞菌(P.mediterranea)。羌活根際分離的4株溶解無機磷特性優(yōu)良的菌株經(jīng)鑒定分別屬于格式假單胞菌(P. grimontii) 、P. laurylsulfatiphila、P.frederiksbergensis 和地中海假單胞菌(P.mediterranea);3株溶解有機磷特性優(yōu)良的菌株經(jīng)鑒定后1 株屬于未定種假單胞菌(Pseudomonassp.),2 株屬于沙漠錯玫桿菌(Falsirhodobacterdeserti)。目前,沙漠錯玫桿菌(F. deserti)的溶磷特性還未見報道,這為生物菌肥的研發(fā)提供了新的微生物資源。本研究篩選的溶磷特性優(yōu)良的菌株中,假單胞菌屬占比較大,是主要的溶磷優(yōu)勢菌屬,與早先報道的假單胞菌屬細(xì)菌廣泛存在于植物根際土壤,且該屬中多個菌種被發(fā)現(xiàn)有較強的溶磷能力[32]相印證。Elliott等[33]研究表明,小麥根際溶磷菌主要為芽孢桿菌屬(Bacillus)、假單胞菌屬(Pseudomonas)和鏈霉菌屬(Streptomyces),與本研究結(jié)果一致。假單胞菌屬(Pseudomonas)是常見的PGPR菌屬,作為重要的微生物資源,具有較強的環(huán)境適應(yīng)能力和優(yōu)良的促生特性。目前,國內(nèi)對于假單胞菌的研究主要集中在促生和生物防治兩個方面,寧爽[34]從植物內(nèi)生菌中篩選出兩株假單胞菌,既可以分泌植物生長激素促進(jìn)植物生長,還可以分泌溶菌酶抑制病原菌的生長。李海碧[35]從甘蔗根際土壤分離到30株假單胞菌均具有多種促生特性,除具有良好的溶磷作用外,還具有分泌嗜鐵素的能力,說明假單胞菌的促生作用可能不是通過單一的溶磷作用實現(xiàn),而是不同促生機制相互協(xié)同的結(jié)果。研究表明,礦質(zhì)元素含量的增加可能與菌株的溶磷能力相關(guān)[36]。假單胞菌可分泌甲酸、乙酸和丙酸等物質(zhì),降低土壤pH,絡(luò)合土壤中的鐵、鋁、鈣等離子,溶解難溶性磷酸鹽,將其轉(zhuǎn)化為植物可以利用的可溶性磷[37]。本研究僅對篩選到的假單胞菌的溶磷特性進(jìn)行了初步研究,后續(xù)可以進(jìn)一步對菌株的促生機理進(jìn)行深入研究,通過基因工程等手段對菌株進(jìn)行改造,從而提高溶磷效果和促生效果[38]。
篩選出高效的PGPR株對于調(diào)節(jié)土壤中營養(yǎng)元素的供需矛盾、促進(jìn)植物生長和改善土壤條件具有重要意義[39],研究表明,微生物肥料具有增產(chǎn)效果的同時還能改善土壤結(jié)構(gòu)和質(zhì)量[40],藥用植物根際促生菌對藥用植物的生長發(fā)育及其代謝活動有著重要影響,不僅可以促進(jìn)藥用植物對土壤養(yǎng)分的吸收,而且還可以提高藥用植物的產(chǎn)量及品質(zhì)[41]。此外,植物根際促生菌還能夠增強植物對外界環(huán)境脅迫的適應(yīng)能力,有利于藥用植物有效成分的積累。
參 考 文 獻(xiàn)
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(責(zé)任編輯:張冬玲)