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多模態(tài)X 線影像組學(xué)列線圖預(yù)測(cè)乳腺腫塊良惡性的價(jià)值

2023-05-31 03:49牛煥東朱衛(wèi)峰袁宏濤王錫明
關(guān)鍵詞:勾畫(huà)組學(xué)惡性

牛煥東,徐 菡,朱衛(wèi)峰,袁宏濤,黃 程,王錫明

1.濱州醫(yī)學(xué)院醫(yī)學(xué)影像學(xué)院,山東 煙臺(tái) 264003;2.山東第一醫(yī)科大學(xué)附屬省立醫(yī)院影像科,山東 濟(jì)南 250001;3.山東省煙臺(tái)芝罘醫(yī)院放射科,山東 煙臺(tái)264000

乳腺癌是女性癌癥中發(fā)病率和死亡率最高的腫瘤[1],嚴(yán)重威脅患者的身心健康,早期診斷并及時(shí)治療能有效改善預(yù)后[2-3]。目前,全數(shù)字化乳腺X 線攝影(full-field digital mammography,F(xiàn)FDM)因其處理快、成本低、易于操作等優(yōu)點(diǎn)已廣泛應(yīng)用于乳腺癌的篩查及診斷中[4],但致密型乳腺因腺體遮擋,F(xiàn)FDM對(duì)其檢出率較低;數(shù)字乳腺體層合成攝影(digital breast tomosynthesis,DBT)技術(shù)可在很大程度上解決這個(gè)難題,提高乳腺疾病的檢出率和診斷準(zhǔn)確率,具有重要的臨床意義[5-6]。DBT 與FFDM 聯(lián)合應(yīng)用已被臨床廣泛認(rèn)可[7-8]。在近幾年開(kāi)展的大量關(guān)于FFDM、DBT 應(yīng)用價(jià)值的研究中,傳統(tǒng)影像學(xué)表現(xiàn)及形態(tài)特征方面的研究占較大比例[9-11]。影像組學(xué)基于更深層次的數(shù)據(jù)挖掘分析,為影像診斷提供全新的視野,在乳腺方面也有大量相關(guān)研究[12-13]。而對(duì)多模態(tài)X 線影像組學(xué)結(jié)合臨床危險(xiǎn)因素建立聯(lián)合預(yù)測(cè)模型的診斷價(jià)值卻鮮有報(bào)道[14-15]。本研究旨在探討FFDM+DBT 影像組學(xué)特征+臨床危險(xiǎn)因素建立的聯(lián)合預(yù)測(cè)模型評(píng)估乳腺腫塊良惡性的價(jià)值,以期為臨床醫(yī)師術(shù)前提供一種無(wú)創(chuàng)且有效評(píng)價(jià)乳腺腫塊良惡性的方法。

1 資料與方法

1.1 一般資料

回顧性分析2018 年6 月至2020 年6 月于山東第一醫(yī)科大學(xué)附屬省立醫(yī)院就診的女性乳腺腫塊患者391 例,其中選擇2018 年6 月至2019 年12 月就診的313 例患者作為訓(xùn)練集,選擇2020 年1—6 月就診的78 例患者作為驗(yàn)證集。訓(xùn)練集中良性91 例,惡性222 例;驗(yàn)證集中良性30 例,惡性48 例。為解決訓(xùn)練集中良惡性樣本分類不平衡的問(wèn)題,用隨機(jī)欠采樣方法刪除惡性樣本131 例,最終訓(xùn)練集中惡性與良性患者各91 例。最終260 例患者納入模型,年齡27~77 歲;惡性139 例,其中浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌108 例、導(dǎo)管原位癌9 例、浸潤(rùn)性導(dǎo)管癌伴導(dǎo)管原位癌6 例、浸潤(rùn)性小葉癌7 例、乳頭狀癌5 例、黏液癌2 例和髓樣癌2 例;良性121 例,其中乳腺纖維腺瘤49 例、乳腺導(dǎo)管內(nèi)乳頭狀瘤23 例、乳腺病17 例、乳腺炎性病變11 例、良性分葉狀腫瘤10 例、硬化性腺病6 例和乳腺囊腫5 例。納入標(biāo)準(zhǔn):①術(shù)前完善的FFDM 及DBT 檢查資料,臨床資料完善;②病理良惡性診斷明確。排除標(biāo)準(zhǔn):①影像資料質(zhì)量不理想;②FFDM 及DBT 檢查前有乳腺手術(shù)、化療、放療、激素治療、靶向治療既往史。

1.2 儀器與方法

應(yīng)用Siemens Mammomat Inspiration 數(shù)字化乳腺X 線攝影機(jī)行影像檢查,采用頭尾位(CC 位)及內(nèi)外斜位(MLO 位)。患者先獲取單一體位FFDM 圖像,在相同條件下自動(dòng)完成DBT 檢查。X 線球管于乳腺上方按順序旋轉(zhuǎn)攝影,在-25°~25°夾角內(nèi)每旋轉(zhuǎn)2°自動(dòng)曝光掃描一次,經(jīng)后處理重建最終獲取多幅不同角度的低劑量DBT 圖像,層厚1 mm,被檢乳腺的腺體厚度決定層數(shù)。

1.3 ROI 勾畫(huà)

由1 名主治醫(yī)師(醫(yī)師1)和1 名高年資住院醫(yī)師(醫(yī)師2)使用Deepwise 科研平臺(tái)(深睿醫(yī)療)分別在CC 位、MLO 位圖像上手動(dòng)勾畫(huà)腫塊邊界(圖1),其中每一體位FFDM 圖像僅需勾畫(huà)單幅圖像,而DBT 圖像需逐層完整勾畫(huà)腫塊邊界。

圖1 ROI 手動(dòng)勾畫(huà)方法示意圖 注:患者,女,49 歲,術(shù)后病理為良性乳腺纖維腺瘤。圖1a 為全數(shù)字化乳腺X 線攝影(FFDM)頭尾位勾畫(huà)示意圖(箭頭);圖1b 為數(shù)字乳腺體層合成攝影(DBT)頭尾位勾畫(huà)示意圖(箭頭)

1.4 影像組學(xué)特征提取

在Deepwise 科研平臺(tái)上進(jìn)行影像組學(xué)特征的提取。隨機(jī)選出的90 例患者圖像先由2 名醫(yī)師同時(shí)勾畫(huà)ROI,然后分別提取2 名醫(yī)師勾畫(huà)ROI 的影像組學(xué)特征并行一致性評(píng)估;1 個(gè)月后由醫(yī)師2 再次勾畫(huà)ROI,并提取ROI 內(nèi)影像組學(xué)特征,對(duì)該醫(yī)師前后2 個(gè)時(shí)間段所勾畫(huà)的影像組學(xué)特征進(jìn)行一致性評(píng)估;篩選一致性較高的影像組學(xué)特征進(jìn)入下一步數(shù)據(jù)分析。剩余170 例患者ROI 的勾畫(huà)由醫(yī)師2 完成。

1.5 影像組學(xué)特征篩選與模型構(gòu)建

對(duì)訓(xùn)練集中影像組學(xué)特征行單因素ANOVA、Mann-Whitney U 檢驗(yàn),運(yùn)用最小絕對(duì)收縮與選擇算子(least absolute shrinkage and selection operator,LASSO)算法進(jìn)一步篩選出主要的影像組學(xué)特征作為預(yù)測(cè)良惡性乳腺疾病的診斷價(jià)值標(biāo)簽。共建立3 類預(yù)測(cè)模型:第1 類模型,通過(guò)篩選相關(guān)影像組學(xué)特征建立FFDM、DBT 及FFDM+DBT 的邏輯回歸預(yù)測(cè)模型,分別為模型1、模型2 及模型3。第2 類模型,用logistic 回歸篩選臨床危險(xiǎn)因素,利用篩選的臨床危險(xiǎn)因素構(gòu)建臨床預(yù)測(cè)模型(模型4)。第3 類模型,用影像組學(xué)特征結(jié)合臨床危險(xiǎn)因素建立聯(lián)合預(yù)測(cè)模型(模型5)。

1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

運(yùn)用SPSS 22.0 軟件和R3.6.1 完成統(tǒng)計(jì)分析。正態(tài)性檢驗(yàn)采用科爾莫戈羅夫-斯米爾諾夫(Kolmogorov-Smirnov,K-S)檢驗(yàn)進(jìn)行,符合正態(tài)分布的計(jì)量資料以表示,偏態(tài)分布的計(jì)量資料用M(QL,QU)表示;用χ2檢驗(yàn)或Fisher 確切概率法對(duì)計(jì)數(shù)資料進(jìn)行比較。通過(guò)組內(nèi)相關(guān)系數(shù)(intraclass correlation efficient,ICC)評(píng)價(jià)觀察者一致性,比較不同醫(yī)師之間及不同時(shí)間段之間影像組學(xué)特征的一致性,當(dāng)ICC>0.75 時(shí)為一致性較高。采用單因素方差分析及Mann-Whitney U 檢驗(yàn)行單因素分析。用ROC 曲線評(píng)價(jià)各預(yù)測(cè)模型的性能,DeLong 檢驗(yàn)評(píng)價(jià)不同預(yù)測(cè)模型AUC 的顯著性差異。用R 軟件生成列線圖、決策曲線(DCA)及校準(zhǔn)曲線,用校準(zhǔn)曲線評(píng)價(jià)模型的實(shí)用性,用DCA 分析評(píng)估模型的臨床凈收益。以P<0.05 為差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義。

2 結(jié)果

2.1 2 組一般資料比較

訓(xùn)練集與驗(yàn)證集腫塊大小、位置比較差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05);2 組年齡、腺體密度、有無(wú)鈣化、僅DBT 清晰顯影、觸診是否質(zhì)硬不規(guī)則、觸診是否單發(fā)等特征差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05,表1)。單因素logistic 回歸分析顯示,訓(xùn)練集中,良惡性患者年齡、觸診是否質(zhì)硬不規(guī)則及觸診是否單發(fā)差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05,表2);采用多因素logistic 回歸對(duì)上述臨床危險(xiǎn)因素進(jìn)行分析,年齡、觸診是否質(zhì)硬不規(guī)則及觸診是否單發(fā)差異均有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P<0.05,表3)。

表1 訓(xùn)練集與驗(yàn)證集患者臨床資料比較

表2 訓(xùn)練集良惡性患者臨床資料的單因素邏輯回歸分析

表3 訓(xùn)練集良惡性患者臨床資料的多因素邏輯回歸分析

2.2 特征篩選與模型評(píng)估

訓(xùn)練集與驗(yàn)證集中的FFDM、DBT 及FFDM+DBT影像組學(xué)特征一致性較高(ICC>0.8)。FFDM 2 個(gè)體位組合數(shù)據(jù)集共3 124 個(gè)特征,其中2 562 個(gè)特征具有較高的一致性;DBT 2 個(gè)體位組合數(shù)據(jù)集共3 984 個(gè)特征,其中3 274 個(gè)特征具有較高的一致性;FFDM+DBT 2 個(gè)體位組合數(shù)據(jù)集共7 108 個(gè)特征,其中5 836 個(gè)特征具有較高的一致性。最終篩選出19、15、20 個(gè)影像組學(xué)特征分別納入模型1、模型2、模型3。多模態(tài)的模型3 篩選的影像組學(xué)特征與其對(duì)應(yīng)的特征系數(shù)見(jiàn)表4。

表4 模型3(多模態(tài)影像組學(xué)模型)中包含的特征及參數(shù)

模型1 在訓(xùn)練集與驗(yàn)證集的AUC 分別為0.90、0.80,準(zhǔn)確率分別為83.52%、75.64%;在驗(yàn)證集中,模型1 的特異度及敏感度分別為83.30%、70.80%。模型2 在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集的AUC 為0.90、0.88,準(zhǔn)確率分別為81.32%、75.64%;在驗(yàn)證集中,模型2 的特異度及敏感度分別為96.70%、68.80%。模型3 在訓(xùn)練集與驗(yàn)證集的AUC 分別為0.91、0.90,準(zhǔn)確率分別為84.07%、79.49%;在驗(yàn)證集中,模型3 的特異度及敏感度分別為80.00%、91.70%。模型4 在訓(xùn)練集和驗(yàn)證集的AUC 分別為0.82、0.85,準(zhǔn)確率分別為76.92%、78.21%;在驗(yàn)證集中,模型4 的特異度及敏感度分別為70.00%、91.70%。模型5 在訓(xùn)練集與驗(yàn)證集AUC分別為0.96、0.93,準(zhǔn)確率分別為87.91%、84.62%;在驗(yàn)證集中,模型5 的特異度和敏感度分別為96.70%、75.00%。

DeLong 檢驗(yàn)示:在驗(yàn)證集中,模型3 與模型1 的AUC 差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.043);模型1 與模型2、模型2 與模型3 的AUC 差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05 圖2,表5)。在驗(yàn)證集中,模型5 與模型4 的AUC 差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.047),模型3 與模型4、模型3 與模型5 的AUC 差異均無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(均P>0.05,圖2,表5)。繪制模型5 的列線圖(圖3)。DCA 示當(dāng)驗(yàn)證集閾值概率在0.12~0.93,模型5 具有較高的診斷價(jià)值及臨床凈收益(圖4)。校準(zhǔn)曲線顯示模型5 具有良好的臨床實(shí)用性(圖4)。

表5 驗(yàn)證集5 種預(yù)測(cè)模型AUC 兩兩差異DeLong 檢驗(yàn)P 值

圖4 模型評(píng)價(jià) 注:圖4a 為驗(yàn)證集聯(lián)合模型決策曲線(DCA)。圖4b 為驗(yàn)證集聯(lián)合模型校準(zhǔn)曲線,圖中45°斜虛線表示診斷的理想預(yù)測(cè)性能,另一條虛線表示列線圖的預(yù)測(cè)性能,實(shí)線則表示列線圖預(yù)測(cè)偏差的修正,2 條虛線越接近表示預(yù)測(cè)準(zhǔn)確率越高

3 討論

FFDM 因價(jià)格低廉、檢查便捷,是乳腺癌篩查及術(shù)前診斷的常規(guī)檢查方法,也是鈣化類病變的最佳檢查方法,但其對(duì)致密型腺體背景下腫塊類病變的檢出率及準(zhǔn)確率不理想。DBT 通過(guò)機(jī)架的旋轉(zhuǎn)獲得斷層圖像,重建出類三維圖像,突破FFDM 二維圖像組織重疊的局限性,明顯提高了病變的檢出率及準(zhǔn)確率。影像組學(xué)可高通量地提取病變圖像的內(nèi)部特征,對(duì)病變特征進(jìn)行深層次分析,旨在為疾病的診斷提供更多規(guī)范化的客觀依據(jù),進(jìn)一步提高疾病診斷的準(zhǔn)確性[16-19]。本研究構(gòu)建了乳腺腫塊的多模態(tài)X 線影像組學(xué)特征聯(lián)合臨床特征的列線圖,最終結(jié)果顯示影像組學(xué)、臨床特征聯(lián)合預(yù)測(cè)模型的診斷效能最優(yōu),AUC=0.93。DCA 顯示聯(lián)合模型具有良好的臨床應(yīng)用價(jià)值。

3.1 影像組學(xué)模型效能比較

本研究比較了FFDM、DBT 及FFDM+DBT 3 種模態(tài)的影像組學(xué)模型的效能,結(jié)果顯示,F(xiàn)FDM+DBT的診斷效能(AUC=0.93)優(yōu)于單一FFDM 模型(AUC=0.80)及單一DBT 模型(AUC=0.88),且DBT 模型優(yōu)于FFDM 模型,DeLong 檢驗(yàn)進(jìn)行3 組模型的AUC 兩兩比較,僅FFDM+DBT 模型與FFDM 模型間差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.043)。與FFDM 比較,DBT 圖像可避免病變與正常組織的重疊,清晰顯示病變邊緣,提供更多的形態(tài)學(xué)特征,生成類三維圖像,可獲取更多病變內(nèi)部的紋理特征。從FFDM+DBT 建模的20 個(gè)最優(yōu)特征權(quán)重看,部分FFDM 特征也占較高權(quán)重,表明盡管FFDM 提供的特征信息數(shù)量與細(xì)節(jié)不及DBT,但部分權(quán)重較高的特征對(duì)最終結(jié)果也有重要影響,2 種模態(tài)聯(lián)合呈現(xiàn)出最佳的診斷能效,與之前研究[20]結(jié)果一致。本研究比較了各模型的特異度及敏感度,在驗(yàn)證集中,多模態(tài)影像組學(xué)模型預(yù)測(cè)惡性腫瘤的效能有所提高,說(shuō)明FFDM 結(jié)合DBT 組學(xué)紋理特征不但減少了腺體重疊的干擾,且能提供更豐富的診斷信息,提高診斷效能,尤其是惡性腫瘤的檢出率。

3.2 影像組學(xué)模型、臨床模型及聯(lián)合預(yù)測(cè)模型的比較

本研究采用logistic 回歸分析對(duì)患者病史及相應(yīng)的體格檢查行臨床危險(xiǎn)因素分析,最終證實(shí)觸診是否質(zhì)硬不規(guī)則及觸診是否單發(fā)可作為臨床預(yù)測(cè)因子對(duì)模型進(jìn)一步優(yōu)化,構(gòu)建了臨床模型、影像組學(xué)與臨床預(yù)測(cè)因子結(jié)合的聯(lián)合模型,而之前的研究多局限于影像組學(xué)聯(lián)合模型性能的比較,或是對(duì)乳腺M(fèi)RI 聯(lián)合臨床模型的分析,乳腺X 線多模態(tài)影像組學(xué)聯(lián)合臨床模型的研究則鮮有報(bào)道[21-23]。相對(duì)于乳腺M(fèi)RI 費(fèi)用高、檢查時(shí)間長(zhǎng)、存在對(duì)比劑風(fēng)險(xiǎn)等因素,基于乳腺X 線基礎(chǔ)的診斷模型具有廣泛的臨床適用性。另外,本研究聯(lián)合模型的AUC 顯著高于臨床模型及影像組學(xué),這表明聯(lián)合模型中年齡、是否觸診質(zhì)硬不規(guī)則及觸診是否單發(fā)這些臨床危險(xiǎn)因素能進(jìn)一步提高對(duì)病變良惡性的預(yù)測(cè)效能。本研究中臨床預(yù)測(cè)因素對(duì)聯(lián)合預(yù)測(cè)模型列線圖的貢獻(xiàn)權(quán)重較小,后續(xù)研究可進(jìn)一步挖掘更具權(quán)重的臨床危險(xiǎn)因素。

3.3 訓(xùn)練集中自變量分類不平衡解決方法

自變量分類不平衡導(dǎo)致模型偏頗預(yù)測(cè)是在機(jī)器學(xué)習(xí)的分類模型訓(xùn)練過(guò)程中的常見(jiàn)問(wèn)題。為解決該問(wèn)題,研究者多采用系統(tǒng)性過(guò)采樣算法處理數(shù)據(jù)不平衡問(wèn)題[24],此算法存在的缺點(diǎn)是訓(xùn)練集中部分?jǐn)?shù)據(jù)為合成數(shù)據(jù),非患者的真實(shí)數(shù)據(jù),因此預(yù)測(cè)模型的準(zhǔn)確性會(huì)受到一定影響。本研究訓(xùn)練集中惡性患者多于良性患者,樣本分類不平衡,筆者用隨機(jī)欠采樣方法刪除訓(xùn)練集中部分惡性樣本,使訓(xùn)練集樣本分類變量數(shù)據(jù)平衡;同時(shí)驗(yàn)證集中樣本分類變量保持不變,保證模型在驗(yàn)證集中不存在過(guò)擬合現(xiàn)象,從而客觀反映患者的真實(shí)病理分布情況。

本研究的局限性:①為單中心回顧性研究,需加入多中心數(shù)據(jù)進(jìn)一步研究驗(yàn)證;②人工勾畫(huà)ROI 存在一定主觀性及不穩(wěn)定性,且效率低;今后將采用自動(dòng)勾畫(huà)方式提高性能及效率;③有監(jiān)督機(jī)器學(xué)習(xí)算法較為單一,以后可運(yùn)用深度學(xué)習(xí)進(jìn)一步探索。

綜上所述,F(xiàn)FDM+DBT 影像組學(xué)特征結(jié)合臨床危險(xiǎn)因素建立的聯(lián)合預(yù)測(cè)模型可高效預(yù)測(cè)術(shù)前預(yù)測(cè)乳腺腫塊的良惡性,為臨床醫(yī)師提供了一種術(shù)前無(wú)創(chuàng)評(píng)價(jià)乳腺腫塊良惡性的方法。

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