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蜱傳人獸共患無形體和立克次體的分子生物學(xué)鑒定

2023-06-12 06:35:34李美辰張家銘杜孌英郭文平謝廣成
關(guān)鍵詞:承德地區(qū)立克次體形體

任 晴,李美辰,張家銘,杜孌英,郭文平*,謝廣成*

(1.承德醫(yī)學(xué)院基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,河北承德 067000;2.秦皇島市第一醫(yī)院)

立克次氏體目(Rickettsiales)在分類上屬于α變形桿菌綱細(xì)菌,是嚴(yán)格寄生在真核細(xì)胞內(nèi)的原核細(xì)胞型微生物。立克次氏體目細(xì)菌主要通過蜱、跳蚤和螨類等節(jié)肢動(dòng)物傳播媒介將病原體傳播給人類,引起人獸共患性傳染病[1]。蜱是專性寄生在哺乳動(dòng)物體表的吸血節(jié)肢動(dòng)物,所傳染的疾病多為自然疫源性疾病,易在自然界流行。在過去幾十年里,蜱傳疾病的發(fā)病率在全球范圍內(nèi)不斷增加,在中國內(nèi)陸已發(fā)現(xiàn)了33種蜱相關(guān)病原體,據(jù)報(bào)道[2]有15種可引起人類感染。作為立克次氏體目細(xì)菌重要的傳播媒介,由蜱傳播且可引起疾病的立克次氏體目細(xì)菌主要包括無形體科中的無形體(Anaplasma)、埃立克體(Ehrlichia)、新埃立克體(CandidatusNeoehrlichia)以及立克次體科立克次體屬(Rickettsia)??梢鹑祟惛腥镜尿鐐鳠o形體包括羊無形體(A. ovis)、山羊無形體(A. capra)、扁平無形體(A. platys)和嗜吞噬細(xì)胞無形體(A. phagocytophilum)等[3];埃立克體主要為查菲埃立克體(E. chaffeensis)和新埃立克體中的米庫爾新埃立克體(CandidatusN. mikurensis)。引起人類感染的蜱傳立克次體主要包括斑點(diǎn)熱群(spotted fever group rickettsia, SFGR)中的黑龍江立克次體(R. heilongjiangiensis)、西伯利亞立克次氏體(R. sibirica)、饒氏立克次體(R. raoultii)以及近年來新發(fā)現(xiàn)的新塔拉塞維奇立克次體等[4]。我國是受立克次體目細(xì)菌相關(guān)疾病嚴(yán)重影響的國家,上述病原體在蜱、儲(chǔ)存宿主以及患者中均有發(fā)現(xiàn),嚴(yán)重威脅著我國的公共衛(wèi)生安全[5]。

承德市近年來旅游業(yè)發(fā)展迅速,人們的生活和工作環(huán)境經(jīng)常侵入到蜱的生活地,加大了蜱媒病原體的傳播風(fēng)險(xiǎn)。然而,承德地區(qū)蜱源立克次體疾病與無形體疾病的報(bào)道甚少。本研究采用分子流行病學(xué)研究的方法對(duì)承德地區(qū)蜱攜帶的立克次體、無形體的情況進(jìn)行調(diào)查,分析承德地區(qū)人獸共患無形體和立克次體種類及其遺傳特征,為蜱源立克次氏體目細(xì)菌引起相關(guān)疾病的防控提供理論依據(jù)。

1 材料與方法

1.1 主要試劑與設(shè)備

DNA提取試劑盒(美國OMEGA生物技術(shù)公司),凝膠純化回收試劑盒(北京全式金生物技術(shù)有限公司),2×PCR Taq Mix(北京全式金生物技術(shù)有限公司),DL2000 DNA Marker(北京擎科新業(yè)生物技術(shù)有限公司)。

超凈工作臺(tái)(上海智城分析儀器制造公司),PCR基因擴(kuò)增儀(美國Bio-Rad公司),核酸電泳儀(美國Bio-Rad公司),Gel Doc凝膠成像系統(tǒng)(美國Bio-Rad公司),4℃離心機(jī)(美國Thermo公司)。

1.2 蜱的采集

2020年4月~2020年8月,在承德市周邊的三溝鎮(zhèn)和六溝鎮(zhèn)采集蜱標(biāo)本。隨機(jī)選擇自然放養(yǎng)的家畜,如牛、山羊和綿羊等,在其體表用鑷子采集蜱,每個(gè)動(dòng)物體表只采集1只蜱。采集的蜱經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定后,用分子生物學(xué)的方法進(jìn)行病原體的檢測。

1.3 蜱DNA的提取

將采集到的蜱放置于75%乙醇溶液中,浸泡10 min后再用PBS緩沖液沖洗3次,待自然干燥后以單只蜱為一組置于1.5 mL離心管中。DNA的提取按照試劑盒提供的步驟進(jìn)行提取,提取后的總DNA 50μL,放置于-20 ℃冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>

1.4 無形體與立克次體的分子生物學(xué)檢測與鑒定

為了增強(qiáng)擴(kuò)增產(chǎn)物的特異性,提高檢測的靈敏度,使擴(kuò)增結(jié)果更準(zhǔn)確,本實(shí)驗(yàn)采用巢式PCR擴(kuò)增無形體科和立克次體屬的16S rRNA基因進(jìn)行病原體的檢測,檢測的引物序列見表1。PCR的反應(yīng)體系如下:第1輪PCR反應(yīng)采用20 μL的反應(yīng)體系,包括2×Taq DNA聚合酶10 μL,上下游引物各0.8 μL(10 μmol/L),DNA模板1 μL,加ddH2O補(bǔ)足至20 μL。PCR的反應(yīng)條件為94 ℃預(yù)變性5 min;94 ℃變性40s,50℃退火40s,72 ℃延伸50s,共35個(gè)循環(huán);72 ℃終延伸7 min。待第1輪反應(yīng)結(jié)束后,以第1輪的PCR產(chǎn)物為模板進(jìn)行第2輪PCR反應(yīng),反應(yīng)條件同第一輪。反應(yīng)體系為40 μL:2×Taq DNA聚合酶20 μL,上下游引物各1.6 μL(10 μmol/L),DNA模板2.5 μL,加ddH2O補(bǔ)足至40 μL。

表1 本研究中用到的引物

擴(kuò)增groEL進(jìn)行無形體屬物種的鑒定,擴(kuò)增外膜蛋白A(ompA)基因進(jìn)行立克次體的鑒定(表1)。PCR擴(kuò)增同上述擴(kuò)增16S rRNA基因的體系與程序。

1.5 序列測定與同源性比對(duì)分析

PCR反應(yīng)結(jié)束后,取5μL PCR產(chǎn)物在1.2%瓊脂糖凝膠上電泳,然后使用凝膠成像儀觀察電泳結(jié)果,將符合目的條帶大小的PCR產(chǎn)物用DNA純化試劑盒進(jìn)行回收,回收產(chǎn)物送至上海生工生物工程有限公司進(jìn)行基因測序。將測序獲得的序列在美國國立生物技術(shù)信息中心(NCBI)進(jìn)行BLASTn比對(duì)。采用DNAstar軟件進(jìn)行同源性分析,采用MEGA7.0軟件進(jìn)行最佳核酸替代模型計(jì)算與系統(tǒng)發(fā)育分析。使用最大似然法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)生樹,并進(jìn)行Bootstrap驗(yàn)證,分析采用1000次。

1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析

計(jì)數(shù)資料以(n,%)表示,使用SPSS 22.0統(tǒng)計(jì)軟件進(jìn)行χ2檢驗(yàn)和統(tǒng)計(jì)學(xué)顯著性差異分析,以P<0.05為具有顯著統(tǒng)計(jì)學(xué)差異。

2 結(jié)果

2.1 蜱感染無形體和立克次體的流行情況

本研究在承德六溝鎮(zhèn)和三溝鎮(zhèn)共采集到336只蜱樣本,其中六溝鎮(zhèn)192只,三溝鎮(zhèn)144只。經(jīng)形態(tài)學(xué)鑒定,所有蜱樣本均為長角血蜱。經(jīng)巢式PCR擴(kuò)增16S rRNA、測序以及BLASTn搜索比對(duì),在承德六溝鎮(zhèn)和三溝鎮(zhèn)檢測出無形體屬樣本共85份。其中,六溝鎮(zhèn)蜱感染無形體的陽性率為31.3%(60/192),三溝鎮(zhèn)的陽性率為17.4%(25/144),六溝鎮(zhèn)蜱感染無形體的陽性率顯著高于三溝鎮(zhèn)(P=0.004)。另外,共檢測到立克次體陽性樣本58份,其中六溝鎮(zhèn)蜱感染立克次體的陽性率為15.1%(29/192),三溝鎮(zhèn)的陽性率為20.1%(29/144),三溝鎮(zhèn)蜱感染立克次體的陽性率顯著高于六溝鎮(zhèn)(P=0.02)。總的來看,兩個(gè)鎮(zhèn)蜱感染無形體的陽性率為25.3%(85/336),立克次體的陽性率為17.3%(58/336),蜱感染無形體的陽性率顯著高于立克次體(P=0.01)。

2.2 蜱感染無形體和立克次體的物種鑒定及進(jìn)化分析

為了進(jìn)一步確定無形體和立克次體的物種,分別擴(kuò)增了groEL基因與ompA基因進(jìn)行鑒定。在groEL基因構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹上,本研究中擴(kuò)增到的所有序列分成兩個(gè)進(jìn)化分支。第一個(gè)進(jìn)化分支包括來自28個(gè)陽性標(biāo)本的序列,與山羊無形(A. capra)之間的親緣關(guān)系最近(圖1)。這28條序列之間的同源性為99.5%~100%,與山羊無形體已知groEL基因序列之間的同源性為99.67%~100%。第二個(gè)進(jìn)化分支包括來自57個(gè)陽性標(biāo)本的序列,與羊無形體之間的親緣關(guān)系最近(圖1),這57條序列之間的同源性是99.50%~100%,與羊無形體已知groEL基因序列之間的同源性為99.31%~100%。根據(jù)groEL基因序列的同源性與系統(tǒng)發(fā)生分析,本研究中檢測到的無形體分別是山羊無形體和羊無形體,陽性率分別為8.3%和17.0%,具有顯著的差異性(P=0.0001)。

圖1 根據(jù)groEL基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹

在立克次體ompA基因部分核苷酸序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹上,發(fā)現(xiàn)本研究中擴(kuò)增到的58條序列分成3個(gè)進(jìn)化分支(圖2)。第一個(gè)進(jìn)化分支包括12條序列,與西伯利亞立克次體(R. sibirica)的親緣關(guān)系最近。這12條序列之間的同源性為99.1%~100%,與西伯利亞立克次體之間的同源性為99.63%~100%。第二個(gè)進(jìn)化分支包括25條序列,與Ca. R. jingxinensis 暫定種和河北立克次體(Ca.R.hebeiii)的親緣關(guān)系最近。這25條序列之間的同源性是99.90~100%,與Ca. R. jingxinensis暫定種和河北立克次體的ompA基因序列之間的同源性為99.30%~100%。第三個(gè)進(jìn)化分支包括21個(gè)陽性標(biāo)本,與饒氏立克次體的親緣關(guān)系最近。這21條序列之間的同源性為99.6%~100%,與饒氏立克次體之間的同源性為99.93%~100%。根據(jù)ompA基因序列的同源性與系統(tǒng)發(fā)生分析,本研究中檢測到的立克次體包括3種,分別是西伯利亞立克次體、Ca. R.jingxinensis和饒氏立克次體,陽性率分別為3.6%、7.4%和6.3%。Ca. R. jingxinensis和饒氏立克次體顯著高西伯利亞立克次體(P<0.05)。

圖2 根據(jù)ompA基因序列構(gòu)建的系統(tǒng)進(jìn)化樹

3 討論

我國流行的蜱傳立克次氏體目細(xì)菌種類眾多,其中多數(shù)是人獸共患病的病原體。此外,傳播這些病原體的蜱種包括硬蜱屬、血蜱屬、扇頭蜱屬、革蜱屬中的五十余種蜱[9]。河北省幅員遼闊,地形地貌多種,適合蜱的生存,目前至少發(fā)現(xiàn)了17種蜱[10]。雖然蜱的種類眾多,但河北省關(guān)于蜱傳立克次體目細(xì)菌的研究較少,目前只報(bào)道了河北立克次體的流行[11]。本研究中從承德市周邊三溝鎮(zhèn)和六溝鎮(zhèn)的農(nóng)村地區(qū)采集的蜱種均為長角血蜱,是通過吸血將立克次氏體目細(xì)菌傳播給人類和脊椎動(dòng)物的主要媒介[9]。在本研究中,我們通過分子生物學(xué)的方法對(duì)立克次氏體目細(xì)菌進(jìn)行檢測,共檢測到羊無形體、山羊無形體、西伯利亞立克次體、Ca. R. jingxinensis和饒氏立克次體在內(nèi)的5種立克次氏體目細(xì)菌。更為重要的是,這5種立克次氏體目細(xì)菌均是能感染人的人獸共患病原體。

2015年我國學(xué)者首次報(bào)道了我國黑龍江省人感染山羊無形體的病例[12],此后,分子流行病學(xué)調(diào)查顯示其在我國廣泛分布[2]。2010年,羊無形體被首次報(bào)道可以感染人,是人獸共患病的病原體,但迄今為止有關(guān)羊無形體感染人的報(bào)道較少[13]。羊無形體在我國分布更廣,幾乎大部分的省份均有報(bào)道[2]。山羊無形體和羊無形體的傳播媒介比較類似,包括硬蜱屬、血蜱屬、扇頭蜱屬和革蜱屬中的多個(gè)蜱種[2]。在本研究中,經(jīng)過groEL基因序列的同源性與系統(tǒng)進(jìn)化分析,承德地區(qū)周邊農(nóng)村流行的無形體主要為山羊無形體和羊無形體,并且攜帶率較高。雖然我國尚無人感染羊無形體的報(bào)道,但其在蜱中的感染率較高,應(yīng)加強(qiáng)對(duì)羊無形體的流行監(jiān)測。長角血蜱是羊無形體和羊無形體的傳播媒介,并且其為三宿主蜱,居住在農(nóng)村地區(qū)的人與蜱接觸的可能性更大,更容易被感染,因此需要進(jìn)一步開展人感染無形體的監(jiān)測來評(píng)估這些無形體對(duì)人的健康所造成的威脅。

研究[2,11]顯示,河北省張家口市、唐山市和秦皇島市的長角血蜱中發(fā)現(xiàn)了一個(gè)立克次體新種,后被命名為河北立克次體,陽性率為6.7%~7.9%,但在承德采集的長角血蜱中沒有檢測該立克次體。本研究發(fā)現(xiàn)承德地區(qū)立克次體的陽性率為17.3%,明顯高于周邊城市,表明立克次體在承德地區(qū)可能是一個(gè)日益嚴(yán)重的公共衛(wèi)生問題。Ca.R.jingxinensis和Ca. R. longicornii是立克次體中的兩個(gè)暫定種,課題組前期研究顯示二者實(shí)為一個(gè)物種[14]。在本研究中,我們經(jīng)過同源性與系統(tǒng)進(jìn)化分析發(fā)現(xiàn)河北立克次體與上述兩個(gè)物種也應(yīng)為同一個(gè)物種。因此,本次研究共發(fā)現(xiàn)3種蜱傳立克次體,分別為西伯利亞立克次體、Ca.R. jingxinensis和饒氏立克次體。尤為重要的是,這3種立克次體均可感染人,并且在我國都有感染人的報(bào)道[2,15],是對(duì)我國影響比較大的立克次體種類。本研究結(jié)果提示,承德地區(qū)應(yīng)加強(qiáng)不明原因發(fā)熱的病人中立克次體的監(jiān)測,以期更好地預(yù)防和控制該地區(qū)蜱與蜱媒疾病。

本研究明確了承德農(nóng)村地區(qū)媒介蜱種與立克次氏體的種類,確定流行的立克次氏體目細(xì)菌的遺傳多樣性,所得到的研究結(jié)果為承德地區(qū)蜱傳立克次體的預(yù)警和防控提供科學(xué)依據(jù)。

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