王澤華,王 梓,方香玲
(草種創(chuàng)新與草地農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)全國(guó)重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室 / 蘭州大學(xué)草地微生物中心 /蘭州大學(xué)草地農(nóng)業(yè)科技學(xué)院, 甘肅 蘭州 730020)
苜蓿(Medicagosativa)是一種多年生豆科牧草,其營(yíng)養(yǎng)價(jià)值高、適口性好、耐受性強(qiáng),是我國(guó)畜牧業(yè)生產(chǎn)的優(yōu)質(zhì)牧草[1-3]。尖孢鐮刀菌(Fusarium oxysporum)引起的苜蓿枯萎病是苜蓿上的重要病害之一,會(huì)嚴(yán)重影響苜蓿的產(chǎn)量和品質(zhì),在我國(guó)東北、西北和華北等苜蓿種植區(qū)普遍發(fā)生,嚴(yán)重制約著苜蓿產(chǎn)業(yè)的發(fā)展[2]。尖孢鐮刀菌是一種在全世界各種土壤中廣泛分布的土傳病原真菌[4],寄主范圍廣,能夠引起100 多種作物發(fā)生枯萎病或根腐病[5-6]。在沒有合適寄主植物的情況下,尖孢鐮刀菌分生孢子可以在植物表面存活較長(zhǎng)時(shí)間,或者以厚垣孢子在土壤種存活數(shù)年[6-7]。土壤中微生物區(qū)系復(fù)雜,普通培養(yǎng)基難以直接分離出尖孢鐮刀菌。為了從土壤中快速高效地分離尖孢鐮刀菌,本研究對(duì)特異性培養(yǎng)基進(jìn)行了探索,從而為該菌的快速檢測(cè)定量以及病害的發(fā)生機(jī)制和監(jiān)測(cè)預(yù)警等研究提供基礎(chǔ)。
供試土壤采集自蘭州大學(xué)榆中半干旱區(qū)生態(tài)農(nóng)業(yè)實(shí)踐基地,采樣前去除土壤表面的植物殘?bào)w等之后,取0-10 cm 深的土壤,過2 mm 孔徑土篩后備用。
尖孢鐮刀菌選擇性分離培養(yǎng)基(selective isolation media forFusarium oxysporum, SIMF)的配置方法:取馬鈴薯葡萄糖肉湯培養(yǎng)基(potato dextrose broth,PDB)干粉4.8 g,用蒸餾水將其溶解,加CuSO4·5H2O 0.5 g、MgSO4·7H2O 0.5 g、KH2PO40.3 g、瓊脂15.0 g,后加蒸餾水補(bǔ)足至1 L,利用1.0 mol·L-1NaOH 溶液調(diào)節(jié)pH 至6.5,121 ℃高壓滅菌20 min。冷卻至45 ℃左右時(shí)加入95%酒精10 mL、敵磺鈉飽和溶液10 mL、20%硫酸鏈霉素4 mL、5%氯霉素溶液1 mL,攪拌均勻,倒制平板[8-10]。馬鈴薯葡萄糖瓊脂(potato dextrose agar,PDA)培養(yǎng)基的配制方法:取PDB 粉末4.8 g 和瓊脂15.0 g,用1 L 蒸餾水溶解,121 ℃高壓滅菌20 min,倒制平板。PDB 液體培養(yǎng)基的配制方法:稱取PDB 干粉4.8 g,用1 L 蒸餾水溶解,分裝于100 mL錐形瓶,121 ℃高壓滅菌20 min 備用。
采用稀釋平板法,取發(fā)病植株根圍土壤1.0 g,用9 mL 無菌蒸餾水稀釋;吸取稀釋液1 mL,用9 mL無菌蒸餾水稀釋后將稀釋液0.1 mL 于選擇性培養(yǎng)基上涂布,以涂布等量無菌水的PDA 培養(yǎng)基為對(duì)照。室溫靜置10 min,將涂布的平板和對(duì)照倒置放在培養(yǎng)箱內(nèi),25 ℃恒溫黑暗培養(yǎng)5~7 d。挑取分離得到的菌落于PDA 培養(yǎng)基和SIMF 培養(yǎng)基,25 ℃培養(yǎng)4~5 d,采用十字交叉法,每天測(cè)量菌株直徑,并依據(jù)Booth 的鐮刀菌分類標(biāo)準(zhǔn)[11],進(jìn)行形態(tài)學(xué)鑒定。
將分離的菌株接種于PDB 培養(yǎng)基120 r·min-1、25 ℃搖床培養(yǎng)3 d。參考Fang 等[12]的方法提取菌株DNA。利用引物ITS1 (5′-TCCGTAGGTGAACC TGCGG-3′) / ITS4 (5′-TCCTCCGCTTATTGATATG C-3′)[13],和EF1 (5′-ATGGGTAAGGARGACAAGA C-3′) / EF2 (5′-GGARGTACCAGTSATCATG-3′)[14]分別擴(kuò)增供試菌株ITS 和TEF 序列。PCR 產(chǎn)物經(jīng)1.2%瓊脂糖凝膠電泳檢測(cè)后,送上海生工測(cè)序。測(cè)序結(jié)果在NCBI 網(wǎng)站進(jìn)行BLAST 比對(duì),根據(jù)比對(duì)結(jié)果獲得同源性最高鐮刀菌的ITS 和TEF 序列[13,15-17]。
將分離得到的菌株進(jìn)行PDB 搖瓶培養(yǎng)并收集孢子懸浮液106個(gè)·mL-1,然后按照梯度稀釋法稀釋為不同的濃度,與滅菌土壤按比例混勻,制作成每克 土 含 量 為50 000個(gè)、5 000 個(gè) 和500 個(gè) 的 土 壤 樣品,利用選擇性培養(yǎng)基進(jìn)行分離和計(jì)數(shù),每隔24 h統(tǒng)計(jì)菌落數(shù),并計(jì)算分離率。分離率 = (樣品涂布定量結(jié)果/樣品中孢子實(shí)際數(shù)量) × 100%。
數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)和圖表利用Excel 2010 進(jìn)行。測(cè)序結(jié)果通過BLAST 比對(duì)分析,從GenBank 下載鐮刀菌屬代表種序列,利用MEGA (6.0)通過鄰接法(Neighbor-Joining)構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,同時(shí)利用Bootstrap(1 000 次重復(fù))檢驗(yàn)各分支的置信度。
通過涂布發(fā)病土壤稀釋液于不同的培養(yǎng)基上驗(yàn)證了尖孢鐮刀菌選擇性分離培養(yǎng)基的特異性。發(fā)病土壤稀釋液涂布于PDA 培養(yǎng)基上,培養(yǎng)5 d 后培養(yǎng)基上滋生了多種菌,菌落形態(tài)各異(圖1A),而發(fā)病土壤稀釋液涂布于SIMF 培養(yǎng)基上,長(zhǎng)出形態(tài)一致的菌落(圖1B)。將在SIMF 培養(yǎng)基上的單菌落接種于PDA 培養(yǎng)基上培養(yǎng)4~5 d,分離到的菌株菌落淡紫色,菌絲呈條紋狀、絨毛狀至叢卷毛狀(圖1C、D)。小型分生孢子大量產(chǎn)生,橢圓形無隔或僅有一個(gè)分隔;大型分生孢子兩端尖,呈梭形或鐮刀形,通常有3 個(gè)分隔(圖1E)。
圖1 SIMF 培養(yǎng)基的特異性驗(yàn)證Figure 1 Specificity of SIMF medium
對(duì)分離菌株進(jìn)行ITS 和TEF 的PCR 擴(kuò)增及測(cè)序,并將序列測(cè)定結(jié)果在NCBI 進(jìn)行比對(duì)。該菌株的序列與已知尖孢鐮刀菌苜蓿專化型如LZ22 (GenBank ITS序列號(hào)MW036290,TEF 序列號(hào)MW560899)[17]的序列同源性為100%。根據(jù)ITS和TEF 序列,采用鄰近連接法構(gòu)建系統(tǒng)發(fā)育樹,分離得到的菌株與尖孢鐮刀菌聚為一支(圖2、圖3)。
圖2 基于rDNA-ITS 序列構(gòu)建的鐮刀菌系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 2 Fusariumphylogenetic tree constructed based on the rDNA-ITS sequence
圖3 基于TEF 序列構(gòu)建的鐮刀菌系統(tǒng)發(fā)育樹Figure 3 Fusariumphylogenetic tree based on the TEF sequence
尖孢鐮刀菌在SIMF 培養(yǎng)基上生長(zhǎng)初期,菌落呈白色圓形且菌絲質(zhì)密;培養(yǎng)5 d 后菌絲呈松散絨毛狀,中間密邊緣稀疏;菌落邊緣有缺口呈鋸齒狀,中心呈淡黃色,菌落直徑為22 mm,生長(zhǎng)速度為4.4 mm·d-1(圖4A)。在PDA 培 養(yǎng) 基 上 培 養(yǎng)5 d 后 直 徑為66 mm,SIMF 培養(yǎng)基上菌落生長(zhǎng)速度小于PDA上的生長(zhǎng)速度。平板中有多個(gè)菌落時(shí),菌落生長(zhǎng)慢,培養(yǎng)5 d 時(shí)菌絲呈輻射狀生長(zhǎng),菌落形態(tài)為白色不規(guī)則狀,在平板上容易辨認(rèn) (圖4B)。
圖4 尖孢鐮刀菌在SIMF 培養(yǎng)基上的菌落形態(tài)Figure 4 Colony morphology of Fusarium oxysporumon SIMF medium
利用孢子含量為5 000 個(gè)每克帶菌土壤驗(yàn)證培養(yǎng)基的分離率,統(tǒng)計(jì)不同培養(yǎng)天數(shù)的菌落數(shù)發(fā)現(xiàn),隨著培養(yǎng)天數(shù)的增加,分離率逐漸增加,初期生長(zhǎng)較快,期間有一個(gè)生長(zhǎng)緩慢的階段(圖5)。培養(yǎng)7 d時(shí),菌落數(shù)趨于穩(wěn)定,分離率達(dá)86.4%,培養(yǎng)7 d 后菌落有交叉重疊的現(xiàn)象,不利于計(jì)數(shù)。
圖5 不同培養(yǎng)天數(shù)分離率Figure 5 Changes in isolation rate at different culture days
將孢子含量分別為每克土500、5 000、50 000 個(gè)的土壤涂布于選擇性培養(yǎng)基上,測(cè)定土壤攜菌分離率,發(fā)現(xiàn)分離率在50%~94%,平均分離率為79.3%,表明該選擇性培養(yǎng)基檢測(cè)效果較好。不同含菌量土壤的分離率不同,這與稀釋濃度和平板菌落數(shù)相關(guān)。本研究中,孢子含量為每克土500 個(gè)~5 000 個(gè)時(shí),平板菌落數(shù)介于30~50 個(gè)時(shí)計(jì)數(shù)最準(zhǔn)確。孢子濃度為每克土50 000 個(gè)時(shí),菌落數(shù)過多,有菌落重疊的現(xiàn)象不利于計(jì)數(shù)。
尖孢鐮刀菌是土壤習(xí)居菌,可以在土壤中存活多年,一旦條件適宜,能夠從根部入侵植物,危害植物健康[18]。常用的分離純化土壤真菌的方法需要將土壤懸浮液涂布于培養(yǎng)基平板上,根據(jù)菌落形態(tài)特征初步鑒定,然后挑單菌落進(jìn)行分離純化3~4 次,從而獲得目標(biāo)菌株。但是這種操作過程復(fù)雜且費(fèi)時(shí),而使用選擇性培養(yǎng)基能夠從土壤中快速分離出尖孢鐮刀菌,通過1 次純化即可獲得單一的純菌株。已有關(guān)于尖孢鐮刀菌選擇性培養(yǎng)基的報(bào)道,篩選出特異性分離尖孢鐮刀菌古巴?;?F.oxysporumf.sp.cubense)和棉花專化型(F.oxysporumf.sp.vesinfectum)的選擇性培養(yǎng)基[8,19-20],但是關(guān)于苜蓿?;偷倪x擇性培養(yǎng)基未見報(bào)道。本研究在這些報(bào)道的基礎(chǔ)上[8],對(duì)培養(yǎng)基配方進(jìn)行了優(yōu)化。碳源是微生物生長(zhǎng)發(fā)育、孢子萌發(fā)的重要影響因素[21]。景曉輝等[8]以土豆(Solanum tuberosum)提取物為碳源,但土豆品種和個(gè)體之間差異會(huì)造成培養(yǎng)基碳源含量的差異,本研究利用成品PDB 干粉為碳源,為分離菌株提供了穩(wěn)定一致的碳源,從而提高了培養(yǎng)基的穩(wěn)定性。培養(yǎng)基中添加的敵磺鈉對(duì)多種土壤真菌如絲囊菌(Aphanomyces)等具有抑制作用;鏈霉素對(duì)多種細(xì)菌如變形桿菌屬(Proteus)和沙門菌屬(Salmonella)具有抑制作用,但對(duì)多種革蘭氏陽性細(xì)菌的抑制作用較差;而氯霉素是抑菌性廣譜抗生素,對(duì)革蘭氏陽性細(xì)菌和革蘭氏陰性細(xì)菌均具有抑制作用,能夠有效防止細(xì)菌的污染[22]。
本研究研制的尖孢鐮刀菌選擇性培養(yǎng)基能夠快速分離出土壤中的尖孢鐮刀菌。該培養(yǎng)基平均分離率為79.3%,平板菌落數(shù)在30~50 個(gè)時(shí)計(jì)數(shù)最為準(zhǔn)確。培養(yǎng)7 d 后菌落數(shù)趨于穩(wěn)定。結(jié)合稀釋平板涂布法,可以將選擇性培養(yǎng)基用于土壤中尖孢鐮刀菌數(shù)量的定量研究。平板涂布法測(cè)定的菌為具有活性的菌數(shù)量,常與熒光定量方法一起用于土壤中尖孢鐮刀菌的定量研究[23]。利用選擇性培養(yǎng)基發(fā)現(xiàn)了香蕉(Musa nana)枯萎病發(fā)生率及嚴(yán)重程度與初始接種濃度有關(guān),病害發(fā)生初期,土壤中病原菌的含量與病害嚴(yán)重程度正相關(guān)。同時(shí)還發(fā)現(xiàn),發(fā)病香蕉根際土壤中病原菌的含量高于根圍土[24-25]。通過利用Komada 選擇性培養(yǎng)基對(duì)尖孢鐮刀菌進(jìn)行計(jì)數(shù)發(fā)現(xiàn),間作模式有利于降低西瓜(Citrullus lanatus)根際尖孢鐮刀菌數(shù)量,從而降低西瓜枯萎病的嚴(yán)重程度[26]。本研究的選擇性培養(yǎng)基將為研究尖孢鐮刀菌在苜蓿種植地土壤中的富集和定殖及病害發(fā)生規(guī)律等提供基礎(chǔ)。
本研究研制了一種快速分離和定量土壤中尖孢鐮刀菌的特異性培養(yǎng)基。該培養(yǎng)基的成分及配置方法:馬鈴薯葡萄糖肉湯培養(yǎng)基(PDB)干粉4.8 g,用蒸餾水溶解后加CuSO4·5H2O 0.5 g、MgSO4·7H2O 0.5 g、KH2PO40.3 g、瓊脂15.0 g,加蒸餾水補(bǔ)足至1 L,利用1 mol·L-1NaOH 溶液調(diào)節(jié)pH 至6.5,121 ℃高壓滅菌20 min。冷卻至45 ℃左右時(shí)加入95%酒精10 mL、敵磺鈉飽和溶液10 mL、20%硫酸鏈霉素4 mL 和5%氯霉素溶液1 mL,攪拌均勻后倒制平板備用。