弓 強 黃浩楹 陳樂樂 柴 智 樊慧杰
(山西中醫(yī)藥大學(xué)基礎(chǔ)醫(yī)學(xué)院,山西 晉中 030619)
百合科植物知母(Anemarrhena asphodeloidesBge.)主要分布于山西、河北及山東等地,是多年生草本植物,春、秋二季采挖,以干燥根莖入藥。中藥材知母的藥用歷史有2000年之久,歷代本草古籍均有記載。知母味甘、苦,性寒,有清熱瀉火、滋陰潤燥之功效,是常用的清熱瀉火類中藥[1]。現(xiàn)代藥理研究認(rèn)為知母具有解熱[2,3]、降血糖[4]、改善認(rèn)知缺陷[5]、抗炎和免疫調(diào)節(jié)[6]等方面的作用。
石竹科植物石竹(Dianthus chinensisL.)主要分布于河北、河南、遼寧及江蘇等地,是多年生草本植物,夏、秋二季花果期采割,以干燥地上部分入藥稱為瞿麥(Dianthus superbusLinn.)。瞿麥最早記載于《神農(nóng)本草經(jīng)》,被列為中品,藥用歷史悠久。瞿麥味苦,性寒,歸心、小腸經(jīng),屬于利水滲濕類中藥,有利尿通淋、活血通經(jīng)之功效,臨床用于熱淋、血淋、石淋和小便不通等方面的治療[7]。現(xiàn)代藥理研究認(rèn)為,瞿麥具有抗腫瘤[8,9]和潛在治療吉蘭-巴雷綜合征[10]的作用。
目前,知母和石竹均未有深入到基因組學(xué)的研究,而基因組學(xué)研究的首要前提是測定基因組大小?;蚪M大小是指生物單倍體細(xì)胞的DNA含量(又稱C值)。本實驗欲采用流式細(xì)胞術(shù)(Flow cytometry,F(xiàn)CM)測定知母和石竹的基因組大小,為基因組學(xué)研究提供重要數(shù)據(jù)。
1.1 實驗材料知母和石竹是待測植物,采自山西中醫(yī)藥大學(xué)校園中草藥種植基地;蒙古黃芪是測定的內(nèi)標(biāo)植物,采自山西中醫(yī)藥大學(xué)校園中草藥種植基地。將三種植株的幼嫩葉片作為細(xì)胞核的提取材料。
1.2 實驗儀器、試劑和耗材流式細(xì)胞儀BD Accuri C6 PLUS 購自美國BD 公司。試劑Triton X-100(批號D220BA0041)、 四 鹽 酸 精 胺( 批 號512BA0029)、Na2EDTA(批號D328BA0007)購自BBI生命科學(xué)有限公司。試 劑NaCl (批 號D710BA0034)、KCl (批 號D316BA0025)購自生工生物工程上海股份有限公司。β-巰基乙醇(批號D124BA0001)購自美國Sigma-Aldrich 股份有限公司。碘化丙啶(PI)(批號326C042 8)、核糖核酸酶A(RNase)(批號20170607)、三羥甲基氨基甲烷(Tris)(批號0922S0714)、400 目尼龍篩網(wǎng)(批號20161111)購自北京索萊寶生物科技有限公司。
1.3 FCM測定知母和石竹基因組大小的方法
1.3.1 制備裂解液LB01裂解液LB01:15 mmol/L Tris,2 mmol/L Na2EDTA,0.5 mmol/L 四鹽酸精胺,80 mmol/L KCl,20 mmol/L NaCl,0.1%Triton X-100,15 mmol/L β-巰基乙醇;調(diào)pH至7.5。
1.3.2 制備細(xì)胞核濾液分別采集知母、石竹、蒙古黃芪、知母和蒙古黃芪等質(zhì)量混合、石竹和蒙古黃芪等質(zhì)量混合的幼嫩葉片,每份20 mg。蒸餾水清洗葉片,濾紙吸凈表面水分。置葉片于玻璃培養(yǎng)皿中,加入預(yù)冷LB01解離液1 mL。鋒利刀片迅速垂直切碎葉片,混勻,冰上靜置培養(yǎng)皿5 min。尼龍篩網(wǎng)過濾,收獲細(xì)胞核濾液[11],依次加入1 mg/L 的RNase 20 μL、1 mg/L 的PI 20 μL,置于4 ℃冰箱染色5 min。
1.3.3 FCM 檢測輕搖流式管分散細(xì)胞核,上流式細(xì)胞儀檢測,低速抽取5000 個PI 染色的細(xì)胞核。選用波長488 nm 的藍(lán)光激發(fā)熒光PI,藻紅蛋白(PE)通道收集熒光強度的數(shù)據(jù)和圖像。變異系數(shù)(Coefficient of variation,CV)<5%,表明數(shù)據(jù)可信[12]。數(shù)據(jù)和圖像用流式細(xì)胞儀軟件分析,將數(shù)據(jù)代入基因組大小的計算公式,待測植物基因組大小=待測植物熒光強度的均值/內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪熒光強度的均值×內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪基因組大小(蒙古黃芪基因組大小為1.46 Gb)[13,14]。
知母、石竹、蒙古黃芪分別用FCM 檢測,單獨檢測結(jié)果見圖1。據(jù)此可見知母和石竹的出峰位置均與蒙古黃芪的出峰位置不同,可以保證蒙古黃芪作為測定內(nèi)標(biāo)時,實驗的可行性與結(jié)果的準(zhǔn)確性。
圖1 單獨樣品的FCM檢測結(jié)果
知母和內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪混合樣品的FCM 檢測結(jié)果見圖2 和表1。據(jù)此可見散點圖中有兩團(tuán)集中的粒子團(tuán),峰圖中兩峰獨立、峰形佳,知母和蒙古黃芪的CV 均小于5%,各數(shù)據(jù)可信,進(jìn)而可知知母的熒光強度均值為287 888.33,蒙古黃芪的熒光強度均值為167 845.33,將各均值代入計算公式中,得到知母的基因組大小為2.50 Gb。
表1 知母基因組大小的測定結(jié)果
圖2 知母和內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪混合樣品的FCM檢測結(jié)果
石竹和內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪混合樣品的FCM檢測結(jié)果見圖3和表2。據(jù)此可見散點圖中有兩團(tuán)界限清晰的粒子團(tuán),峰圖中兩峰不重疊、峰形佳,石竹和蒙古黃芪的CV都小于5%,各數(shù)據(jù)可信,進(jìn)而可知石竹的熒光強度均值為101 071.33,蒙古黃芪的熒光強度均值為159 980.67,將各均值代入計算公式中,得到石竹的基因組大小為0.92 Gb。
表2 石竹基因組大小的測定結(jié)果
圖3 石竹和內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪混合樣品的FCM檢測結(jié)果
FCM 是測定植物基因組大小的首選方法,在測定時需要選用一個已知基因組大小的植物作為標(biāo)準(zhǔn)品。具體應(yīng)用標(biāo)準(zhǔn)品測定基因組大小的方法有兩種:一種為外標(biāo)法;另一種為內(nèi)標(biāo)法。外標(biāo)法是分別單獨上機測定待測物和標(biāo)準(zhǔn)品的熒光強度,內(nèi)標(biāo)法是待測物中加入標(biāo)準(zhǔn)品以混合樣品上機檢測熒光強度。雖然外標(biāo)法較為簡便,但是一般采用內(nèi)標(biāo)法測定待測物的基因組大小,因為內(nèi)標(biāo)法可以保證混合之后的操作過程和環(huán)境一樣,能在相同的條件下測定待測物,減少了實驗誤差,結(jié)果更為準(zhǔn)確[15]。但是內(nèi)標(biāo)法需要注意篩選合適的內(nèi)標(biāo),以避免待測物的峰位和內(nèi)標(biāo)的峰位出現(xiàn)重疊現(xiàn)象。
前期預(yù)實驗中,選用大豆Williams 82 為知母和石竹基因組大小測定的共同內(nèi)標(biāo),研究發(fā)現(xiàn)石竹的峰位與大豆Williams 82 的熒光峰位出現(xiàn)重疊,區(qū)分度不佳,初步推測石竹的基因組大小與大豆Williams 82的1.11 Gb的數(shù)值接近。蒙古黃芪已在前期的實驗中測定出其基因組大小為1.46 Gb[14],并且由于本實驗室蒙古黃芪的數(shù)量充足、細(xì)胞核提取方便,所以選定蒙古黃芪作為知母和石竹基因組大小測定的共同內(nèi)標(biāo)。本研究發(fā)現(xiàn)內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪有效避免了與待測物知母和石竹熒光信號的重疊,知母 的CV 值 為4.82%~4.98%,石 竹 的CV 值 為3.96%~4.49%,蒙古黃芪的CV值亦未超過5%,故蒙古黃芪適合作為知母和石竹的內(nèi)標(biāo)植物,保證基因組大小測定的可行性和準(zhǔn)確性。進(jìn)而測定出知母的基因組大小為2.50 Gb;石竹的基因組大小為0.92 Gb。知母、石竹與內(nèi)標(biāo)蒙古黃芪,三者基因組大小的關(guān)系是:石竹<蒙古黃芪<知母?;蚪M大小在很大程度上是恒定不變的,是生物的一個基本特征?;蚪M大小是物種基因組測序中的一項重要的研究內(nèi)容。本研究不僅可以為其他植物基因組大小的測定提供借鑒;而且可以促進(jìn)知母和石竹的基因組資源開發(fā),有助于深入認(rèn)識知母和石竹。