馬翠,楊凡,張君泰,何凱
(1 中國(guó)科學(xué)院深圳先進(jìn)技術(shù)研究院,廣東 深圳 518055; 2 深圳市精密工程重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,廣東 深圳 518055)
目前生物分析技術(shù)正向高靈敏度、小劑量、高通量、多功能等趨勢(shì)發(fā)展,以微孔板為載體的多功能微孔板檢測(cè)儀是合成生物實(shí)驗(yàn)中的必備儀器。微孔板是一種高通量反應(yīng)容器,常用的96孔板每孔的容量大概是365 μL,單次檢測(cè)所需的溶液體積小且可多孔批量檢測(cè),利用它可以提高檢測(cè)速度并降低檢測(cè)成本。微孔板讀板機(jī)、酶標(biāo)儀是針對(duì)微孔板的檢測(cè)儀器,廣泛應(yīng)用于生物醫(yī)藥檢測(cè)[1-4]。該類(lèi)儀器最早是由BioTek公司(現(xiàn)已歸入Agilent公司)生產(chǎn)研制,極大地提高了生化分析的工作效率。后來(lái)Molecular Devices、Tecan、PerkinElmer、Thermo Scientific等公司也逐漸推出了具有動(dòng)力學(xué)檢測(cè)功能、溫控功能、振板功能的酶標(biāo)儀和微孔板檢測(cè)儀,這些儀器可進(jìn)行吸光度檢測(cè)、熒光強(qiáng)度檢測(cè)、熒光偏振檢測(cè)、化學(xué)發(fā)光檢測(cè)等,性能逐漸完善,功能也不斷擴(kuò)充。多功能微孔板檢測(cè)儀幾乎被這些國(guó)外知名儀器廠商所壟斷,典型的有Agilent Biotek的Synergy系列[5]、Molecular Devices公司的SpectraMax系列[6]、Tecan公司的Infinite系列[7]等。在儀器研制方面,國(guó)內(nèi)很多高校和研究機(jī)構(gòu)也開(kāi)展了相關(guān)方面的研究。如山東藥學(xué)科學(xué)院于學(xué)龍等[8]研制了多通道的吸光度檢測(cè)酶標(biāo)儀,12通道同時(shí)檢測(cè),帶溫控功能;蘇州大學(xué)林學(xué)源等[9]增加參比光路,研制高分辨率酶標(biāo)儀;上海交通大學(xué)的朱家亮等[10]研制基于嵌入式系統(tǒng)的小型酶標(biāo)儀;浙江大學(xué)王宇等[11]研制熒光/發(fā)光檢測(cè)的多功能分析儀;華南理工大學(xué)的李強(qiáng)等[12]研制多功能熒光分析儀;杭州電子科技大學(xué)的周鵬飛等[13]研制了一套多功能微孔板分析儀樣機(jī),包括吸光度、熒光、化學(xué)/生物發(fā)光檢測(cè);中國(guó)科學(xué)院大連化學(xué)物理研究所的耿旭輝團(tuán)隊(duì)[14-15]研發(fā)了小型高精度的熒光檢測(cè)模塊,達(dá)到同等儀器國(guó)際先進(jìn)水平。國(guó)內(nèi)的研究雖然取得了不少成績(jī),但產(chǎn)業(yè)化的產(chǎn)品還不多。國(guó)內(nèi)公司生產(chǎn)的酶標(biāo)儀基本都只包含吸光度檢測(cè)功能,雖然也有相關(guān)的熒光PCR儀、發(fā)光分析儀等,但單機(jī)功能相對(duì)單一,自動(dòng)化水平不高。
合成生物學(xué)自動(dòng)化鑄造平臺(tái)將工業(yè)4.0的理念引入實(shí)驗(yàn)室,用自動(dòng)化機(jī)器代替人。通過(guò)集成軟硬件技術(shù)實(shí)現(xiàn)生物材料的自動(dòng)化合成,代替研究人員進(jìn)行海量的工程化試錯(cuò)實(shí)驗(yàn),提升實(shí)驗(yàn)效率和操作精度[16]。微孔板檢測(cè)儀作為自動(dòng)化平臺(tái)中廣泛使用的一種檢測(cè)設(shè)備,需要能夠集成在自動(dòng)化控制系統(tǒng)中。進(jìn)口產(chǎn)品價(jià)格昂貴,操作復(fù)雜,且其控制指令自成體系,接口通常不開(kāi)放,不易集成;國(guó)內(nèi)已有設(shè)備儀器功能相對(duì)單一,同時(shí)也需要進(jìn)行改造才能集成應(yīng)用于自動(dòng)化鑄造平臺(tái)。
本研究面向合成生物學(xué)研究中對(duì)微孔板檢測(cè)儀的廣泛需求,研究高精度吸光度檢測(cè)和高靈敏度熒光檢測(cè)等關(guān)鍵技術(shù),開(kāi)發(fā)具有吸光度檢測(cè)和熒光檢測(cè)功能的緊湊、經(jīng)濟(jì)型微孔板檢測(cè)儀,并自主開(kāi)發(fā)控制系統(tǒng)及采集分析軟件,使其易于接入合成生物自動(dòng)化鑄造平臺(tái)。
作為合成生物自動(dòng)化鑄造平臺(tái)的組成部分,微孔板檢測(cè)系統(tǒng)必須實(shí)現(xiàn)全自動(dòng)操作,包括進(jìn)樣的自動(dòng)化以及檢測(cè)的自動(dòng)化。系統(tǒng)發(fā)送指令,機(jī)械臂將待檢測(cè)微孔板放置在檢測(cè)平臺(tái)上,放置完成后機(jī)械臂收回,儀器蓋自動(dòng)關(guān)閉,系統(tǒng)自動(dòng)執(zhí)行檢測(cè)功能;當(dāng)檢測(cè)完成后儀器蓋自動(dòng)打開(kāi),機(jī)械臂取出檢測(cè)完成的微孔板,進(jìn)行下一步操作。
按功能模塊設(shè)計(jì),多功能微孔板檢測(cè)系統(tǒng)的硬件部分可以分為吸光度檢測(cè)模塊、熒光檢測(cè)模塊、控制模塊、光源模塊、電源模塊、儀器蓋自動(dòng)開(kāi)閉及微孔板進(jìn)給模塊,如圖1所示。其中,吸光度和熒光檢測(cè)模塊主要包括吸光度和熒光檢測(cè)的光路系統(tǒng),包含光源、探測(cè)器、濾光片、準(zhǔn)直鏡、聚焦鏡等光學(xué)器件??刂颇K需要完成微孔板機(jī)構(gòu)的運(yùn)動(dòng)控制、儀器蓋的自動(dòng)開(kāi)閉機(jī)構(gòu)運(yùn)動(dòng)、數(shù)據(jù)的采集與處理、信號(hào)的傳輸通信等。
圖1 微孔板檢測(cè)儀主要模塊Fig. 1 Main modules of microplate reader
微孔板檢測(cè)系統(tǒng)具有吸光度檢測(cè)、熒光檢測(cè)兩種模式,分別對(duì)應(yīng)不同的波長(zhǎng)種類(lèi)和不同的光學(xué)結(jié)構(gòu),可獨(dú)立運(yùn)行。
2.1.1 吸光檢測(cè)模塊
微孔板吸光度的檢測(cè)與分光光度計(jì)類(lèi)似[17],均是基于朗伯-比爾定律,當(dāng)一束單色光照射于介質(zhì)表面,通過(guò)一定厚度的介質(zhì)后,光會(huì)被吸收一部分,透射光會(huì)減弱。介質(zhì)的厚度和濃度越大,光強(qiáng)減弱就越明顯。吸光度或光密度OD(optical density)可以用公式表示如下:
式中,OD為光密度或吸光度;I0為入射光強(qiáng);It為透射光強(qiáng);T為透過(guò)率;K為摩爾系數(shù)或吸收系數(shù);l為吸收介質(zhì)的厚度;c為物質(zhì)濃度。
光源模塊輸出的光經(jīng)過(guò)微孔板樣品后,進(jìn)入吸光度檢測(cè)光路。物質(zhì)對(duì)不同波長(zhǎng)的光具有不同的吸收能力,檢測(cè)吸收能力需要用單色光。單色光通常有兩種實(shí)現(xiàn)方法:一是單色儀分光,可以任意選擇波長(zhǎng),波長(zhǎng)范圍寬準(zhǔn)確性高,但光能損失會(huì)較大;二是采用濾光片方式得到單色光,波段數(shù)量有限,但濾光片相對(duì)更便宜,光能損失小。不同的光學(xué)系統(tǒng)都有各自的優(yōu)點(diǎn)和局限,目前市面上的微孔板檢測(cè)儀均采用光柵單色儀或?yàn)V光片來(lái)實(shí)現(xiàn)。具有代表性的是Agilent BioTek公司提出了Hybrid混合技術(shù)[18],將兩種光學(xué)系統(tǒng)結(jié)合,可以實(shí)現(xiàn)兩種方式的吸光度檢測(cè),具有較高的靈活度。光路系統(tǒng)如圖2(a)所示,圖中黃色部分是濾光片光路系統(tǒng),白色標(biāo)注部分是雙光柵的分光系統(tǒng)。該系統(tǒng)靈敏度高,不同光路系統(tǒng)對(duì)應(yīng)不同的應(yīng)用場(chǎng)景,應(yīng)用范圍廣,但結(jié)構(gòu)相對(duì)復(fù)雜。
圖2 吸光度檢測(cè)原理Fig. 2 Principle of absorbance detection
這里我們研究緊湊、經(jīng)濟(jì)型微孔板檢測(cè)儀,僅采用濾光片方式,光路結(jié)構(gòu)簡(jiǎn)單,要得到相同的靈敏度不需要很強(qiáng)的光源。結(jié)合濾光片輪得到多個(gè)單色光,目前包含4個(gè)濾光片(405 nm、450 nm、492 nm、630 nm),后續(xù)可擴(kuò)展。采用8路光路并行檢測(cè)來(lái)提高檢測(cè)速度,光源發(fā)出的光經(jīng)8條光纖束同時(shí)入射到8個(gè)樣品,經(jīng)樣品吸收后進(jìn)入檢測(cè)光路,被8個(gè)光電二極管同時(shí)接收。檢測(cè)前經(jīng)一組透鏡組進(jìn)行聚焦,避免多路信號(hào)的相互干擾,檢測(cè)光路示意圖如圖(2b)所示。圖2(c)是吸光度檢測(cè)的實(shí)物圖,光源選用Philips的12 V/24 W鹵鎢燈,光纖芯徑400 μm,8路探測(cè)器均采用濱松的S1133-01,光譜有效范圍320~1100 nm,感光面積2.8 mm×2.4 mm。透鏡組之間的間隔與探測(cè)器的排列尺寸對(duì)應(yīng)。
2.1.2 熒光檢測(cè)模塊
分子受到激發(fā),吸收光子能量,從激發(fā)態(tài)的最低振動(dòng)能級(jí)返回基態(tài)時(shí)發(fā)射特定波長(zhǎng)光譜的現(xiàn)象稱(chēng)為熒光。熒光輻射比激發(fā)光能量低,發(fā)射的波長(zhǎng)比激發(fā)光的波長(zhǎng)要長(zhǎng)。熒光檢測(cè)技術(shù)具有靈敏度高、動(dòng)態(tài)范圍寬等優(yōu)點(diǎn),但也容易受環(huán)境的影響,如:熒光猝滅、光漂白等會(huì)對(duì)檢測(cè)產(chǎn)生較大的影響。不同的熒光物質(zhì)有不同的激發(fā)光譜和發(fā)射光譜,可用熒光對(duì)物質(zhì)進(jìn)行鑒別;同時(shí)在較低濃度下,熒光強(qiáng)度與樣品濃度存在線性變化關(guān)系,熒光檢測(cè)也可用于物質(zhì)的定量測(cè)定[19-20]。
熒光檢測(cè)系統(tǒng)中,由光源輸出光入射到微孔板樣品,激發(fā)的熒光信號(hào)進(jìn)入熒光檢測(cè)光路。光路主要包括激發(fā)光路和發(fā)射光路,激發(fā)光路是從光源輸出光照射到樣品,實(shí)現(xiàn)高效激發(fā);發(fā)射光路用于檢測(cè)激發(fā)的熒光。熒光信號(hào)通常較弱,常用熒光檢測(cè)系統(tǒng)中,光源多采用大功率的氙燈,探測(cè)器采用高靈敏的光電倍增管PMT(photomultiplier),發(fā)射及激發(fā)光路均采用單色儀,可以實(shí)現(xiàn)光譜掃描。光路結(jié)構(gòu)如圖3(a)所示[21],該系統(tǒng)波段范圍廣,可得到熒光光譜,但系統(tǒng)功率高且體積也較大。后來(lái)有研究人員研制出小型熒光檢測(cè)模塊,采用LED光源和光電二極管PD(photodiode)實(shí)現(xiàn)[22-25],同樣具有較高的檢測(cè)靈敏度。特別是中科院大連化物所研制的高靈敏度小型熒光模塊[14],結(jié)構(gòu)緊湊,精度高。這里我們采用類(lèi)似的光路結(jié)構(gòu),集成小型熒光模塊,減小系統(tǒng)體積,光路結(jié)構(gòu)如圖3(b)所示。為保證激發(fā)光信號(hào)不會(huì)影響熒光信號(hào),分別采用激發(fā)濾光片和發(fā)射濾光片來(lái)實(shí)現(xiàn)。光源經(jīng)激發(fā)濾光片得到窄波段的激發(fā)光源,經(jīng)二向色鏡反射到微孔板樣品,激發(fā)熒光后,熒光經(jīng)二向色鏡和發(fā)射濾光片到達(dá)探測(cè)器上,即可檢測(cè)熒光強(qiáng)度。光源采用300 mW的藍(lán)光LED,濾光片選擇480 nm和520 nm范圍的窄帶濾光片,探測(cè)器選用LSSPD-1.2。光路末端連接一個(gè)5 mm孔徑的光纖準(zhǔn)直鏡,避免光線發(fā)散造成較大的孔間干擾。同時(shí),小型熒光模塊安裝在一維移動(dòng)機(jī)構(gòu)上,與微孔板的一維運(yùn)動(dòng)機(jī)構(gòu)組合實(shí)現(xiàn)二維空間掃描檢測(cè)。此外,鏡頭相對(duì)被測(cè)物的距離對(duì)檢測(cè)光強(qiáng)也有較大影響,結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)時(shí)增加距離可調(diào)部件用于實(shí)驗(yàn)時(shí)調(diào)節(jié)測(cè)試。熒光檢測(cè)部分的實(shí)物圖如圖3(c)所示,熒光光路封裝集成在一小盒子里,由于微孔板里的裝載樣品可能會(huì)有不同容量,所需的聚焦位置會(huì)不同,這里在底部增加一個(gè)準(zhǔn)直鏡使光線平行。后續(xù)也可考慮自動(dòng)聚焦系統(tǒng),根據(jù)樣品溶液的高度調(diào)節(jié)聚焦位置。
圖3 熒光檢測(cè)原理Fig. 3 Principle of fluorescence detection
控制系統(tǒng)基于ARM Cortex-M4內(nèi)核的主控器STM32F407芯片,包括電源轉(zhuǎn)換模塊、步進(jìn)電機(jī)驅(qū)動(dòng)模塊、數(shù)據(jù)采集模塊、串口通信等(圖4)。
圖4 控制系統(tǒng)主要功能Fig. 4 Functions of control module
2.2.1 電機(jī)驅(qū)動(dòng)控制模塊
系統(tǒng)共有4個(gè)電機(jī),包括送板位置二維運(yùn)動(dòng)的兩個(gè)電機(jī)、濾光片輪控制電機(jī)以及自動(dòng)開(kāi)蓋的控制電機(jī)。這里均采用兩相步進(jìn)電機(jī)來(lái)實(shí)現(xiàn),使用微控制器結(jié)合步進(jìn)電機(jī)驅(qū)動(dòng)芯片來(lái)驅(qū)動(dòng)電機(jī)。每個(gè)電機(jī)4個(gè)端子A+A-B+B-對(duì)應(yīng)控制端的4個(gè)端口,通過(guò)微控制器端口的電平高低控制電流的導(dǎo)通,通過(guò)導(dǎo)通順序控制轉(zhuǎn)動(dòng)方向。定時(shí)器的時(shí)鐘頻率控制速度,脈沖數(shù)控制運(yùn)行位置,細(xì)分部分可以提高位置控制精度。
每個(gè)電機(jī)均配有光電限位開(kāi)關(guān),通過(guò)光電開(kāi)關(guān)判斷電機(jī)是否到達(dá)零點(diǎn)及限定位置。當(dāng)發(fā)生限位時(shí)產(chǎn)生外部中斷傳入微控制器,根據(jù)中斷信號(hào)進(jìn)行停止等操作。
2.2.2 數(shù)據(jù)采集模塊
光學(xué)信號(hào)的采集需要I/V轉(zhuǎn)換電路、前置放大、增益放大、信號(hào)調(diào)理、AD轉(zhuǎn)換電路等,還需與數(shù)字電路、功率電路進(jìn)行電氣隔離。吸光度檢測(cè)的是相對(duì)初始光強(qiáng)的比值,因此信號(hào)放大部分要求不是很高。熒光檢測(cè)的是發(fā)射熒光的強(qiáng)度,熒光信號(hào)通常較弱,要得到高的檢測(cè)靈敏度需要更大的放大倍數(shù)。STM芯片內(nèi)部有AD轉(zhuǎn)換功能,為了提高檢測(cè)精度,增加外置AD轉(zhuǎn)換模塊,特別是熒光溶液的檢測(cè)精度需要微伏級(jí)別,這里采用24位的高精度采集卡。
2.2.3 通信模塊
通信模塊負(fù)責(zé)發(fā)送接收指令和數(shù)據(jù),這里采用串口總線接口設(shè)計(jì),利用MAX3232電平轉(zhuǎn)換芯片實(shí)現(xiàn)單片機(jī)與上位機(jī)進(jìn)行通信。波特率采用19 200 bit/s,包含1個(gè)起始位、8個(gè)數(shù)據(jù)位、無(wú)校驗(yàn)位、1個(gè)停止位。指令主要分為三大類(lèi):送板位置控制,吸光度檢測(cè),熒光檢測(cè)。根據(jù)串口功能,可自定義串口指令格式(串口指令功能見(jiàn)表1),如:這里以十六進(jìn)制FA字符作為幀頭,功能碼自定義,ODOA字符結(jié)束。根據(jù)定義的指令格式,可與上位機(jī)PC端進(jìn)行通信控制,也可與自動(dòng)化鑄造平臺(tái)集成控制軟件進(jìn)行通信。
表1 串口指令功能表Table 1 Serial port instructions
2.3.1 下位機(jī)程序
下位機(jī)的控制程序在Keil uVision環(huán)境下編寫(xiě),主要實(shí)現(xiàn)對(duì)電機(jī)驅(qū)動(dòng)控制、數(shù)據(jù)傳輸、串口通信等,涉及系統(tǒng)時(shí)針設(shè)置、定時(shí)器TIM設(shè)置及中斷函數(shù)、I/O配置、外部中斷函數(shù)、AD通道配置及DMA數(shù)據(jù)傳輸設(shè)置、串口指令功能等。
以電機(jī)驅(qū)動(dòng)控制為例,電機(jī)控制主要包括速度、位置、方向,這里我們通過(guò)在嵌入式程序里的定時(shí)器TIM時(shí)鐘頻率控制電機(jī)運(yùn)行速度,通過(guò)寫(xiě)入的脈沖數(shù)控制電機(jī)運(yùn)動(dòng)的位置,通過(guò)改變電機(jī)電磁繞組端子A/B/C/D的導(dǎo)通順序控制電機(jī)轉(zhuǎn)動(dòng)方向。驅(qū)動(dòng)控制的流程及主要函數(shù)如圖5所示。
圖5 電機(jī)的驅(qū)動(dòng)控制程序Fig. 5 Control program for stepping motor
2.3.2 上位機(jī)程序設(shè)計(jì)
上位機(jī)程序采用QT開(kāi)發(fā),包括參數(shù)設(shè)置、吸光度和熒光檢測(cè)功能、數(shù)據(jù)處理分析、系統(tǒng)校準(zhǔn),軟件主要功能如圖6。
圖6 軟件功能圖Fig. 6 Software function diagram
具體的操作界面如圖7。圖7(a)是軟件主界面,可以進(jìn)行參數(shù)設(shè)置、檢測(cè)控制。另外,還可在操作界面進(jìn)行以下操作:
圖7 軟件界面Fig. 7 User interface of software
(1)顯示/隱藏調(diào)試信息
點(diǎn)擊按鈕顯示/隱藏調(diào)試信息交替顯示。顯示調(diào)試信息,便于查看串口的傳輸數(shù)據(jù)。
(2)檢測(cè)數(shù)據(jù)的保存和顯示
檢測(cè)完成后數(shù)據(jù)自動(dòng)保存并顯示在界面的表格里。數(shù)據(jù)保存采用兩種方式:一種是CSV文件,方便用Excel隨時(shí)查看,文件名以當(dāng)前時(shí)間命名;另一種是數(shù)據(jù)庫(kù)文件,可以進(jìn)行查詢、修改等操作,數(shù)據(jù)庫(kù)這里選用SQLite小型數(shù)據(jù)庫(kù),無(wú)需額外的安裝與配置。
(3)校準(zhǔn)菜單
校準(zhǔn)包括位置校準(zhǔn)、檢測(cè)值的校準(zhǔn)。圖7(b)顯示了位置校準(zhǔn)界面,位置校準(zhǔn)主要是送板位置的偏差校準(zhǔn)和濾光輪不同波長(zhǎng)位置的校準(zhǔn),若存在位置誤差可根據(jù)偏差值補(bǔ)償在實(shí)際的運(yùn)動(dòng)中。檢測(cè)值校準(zhǔn)針對(duì)一些系統(tǒng)固定誤差進(jìn)行補(bǔ)償,不同波長(zhǎng)對(duì)應(yīng)的檢測(cè)值誤差可能不同,具體的校準(zhǔn)方法將根據(jù)實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)分析。
(4)質(zhì)控圖
對(duì)檢測(cè)數(shù)據(jù)進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析,計(jì)算均值M和均方差S,確定圖形中心線、上下控制限、上下輔助線等。如圖7(c),根據(jù)檢測(cè)值的變化分布可以查看檢測(cè)值的準(zhǔn)確性、穩(wěn)定性等。按照統(tǒng)計(jì)學(xué)規(guī)律,檢測(cè)數(shù)值一般要遵循一些規(guī)律,如:95%的結(jié)果應(yīng)落在M±2S范圍內(nèi);均值兩側(cè)的數(shù)據(jù)分布幾乎相同,不能有連續(xù)多次結(jié)果在均值的同一側(cè),或連續(xù)多次數(shù)值漸升或漸降。如果準(zhǔn)確性變化,數(shù)值會(huì)出現(xiàn)向上或向下的總體趨勢(shì)性變化;如果精密度變化,會(huì)出現(xiàn)數(shù)值差異性增大的現(xiàn)象。
2.3.3 自動(dòng)化鑄造平臺(tái)的連接通信
微孔板檢測(cè)儀作為合成生物實(shí)驗(yàn)中常用的一種檢測(cè)儀器,需要集成在合成生物自動(dòng)化鑄造平臺(tái)中,并與集成控制軟件通信控制。該系統(tǒng)可以通過(guò)兩種方式通信:一種是通過(guò)串口進(jìn)行物理連接,直接使用表1中的串口指令進(jìn)行通信,這種方式不需要運(yùn)行微孔板檢測(cè)的上位機(jī)程序,但需要串口線連接,使用范圍有限制:另一種是通過(guò)TCP/IP協(xié)議進(jìn)行通信,可以遠(yuǎn)程控制,TCP(transmission control protocol)傳輸控制協(xié)議是一個(gè)用于數(shù)據(jù)傳輸?shù)膫鬏攲泳W(wǎng)絡(luò)協(xié)議,一般分為客戶端和服務(wù)端,即C/S(client/server)模型。這里微孔板檢測(cè)系統(tǒng)作為服務(wù)端,集成控制平臺(tái)作為客戶端,通過(guò)QT的QTcpSocket來(lái)讀取和寫(xiě)入數(shù)據(jù)。程序運(yùn)行時(shí),客戶端需已知服務(wù)端的IP地址和端口號(hào),先打開(kāi)服務(wù)端程序,服務(wù)端監(jiān)聽(tīng)客戶端發(fā)來(lái)的連接請(qǐng)求,等連接后可以讀取客戶端發(fā)來(lái)的數(shù)據(jù)報(bào),也可發(fā)送數(shù)據(jù)報(bào)。表2是自定義的TCP通信指令,客戶端連接后可通過(guò)該指令進(jìn)行遠(yuǎn)程控制。圖8是編寫(xiě)的服務(wù)端和客戶端測(cè)試程序,圖8(a)是微孔板檢測(cè)儀程序上對(duì)應(yīng)的服務(wù)端,圖8(c)對(duì)應(yīng)自動(dòng)化平臺(tái)上的客戶端程序,經(jīng)測(cè)試兩部分程序可以進(jìn)行遠(yuǎn)程連接通信。
表2 TCP通信指令Table 2 Instructions of TCP communication
圖8 TCP通信測(cè)試Fig.8 TCP communication test program
圖9(a)是樣機(jī)的外部實(shí)物圖,圖9(b)是打開(kāi)上面蓋子后的內(nèi)部結(jié)構(gòu)圖。吸光度檢測(cè)時(shí),96孔板的一排8孔同時(shí)檢測(cè),送板機(jī)構(gòu)只需要一維來(lái)回運(yùn)動(dòng)。熒光檢測(cè)是單點(diǎn)檢測(cè),需要增加另一軸的掃描運(yùn)動(dòng)。為了減小儀器尺寸,設(shè)計(jì)熒光檢測(cè)模塊在另一方向來(lái)回運(yùn)動(dòng),結(jié)合送板機(jī)構(gòu)的一維運(yùn)動(dòng)實(shí)現(xiàn)二維掃描。開(kāi)蓋部分設(shè)計(jì)為向上的推拉方式,方便機(jī)械臂從側(cè)面進(jìn)行微孔板的拿取和放下。
圖9 研制樣機(jī)Fig. 9 Prototype built
根據(jù)計(jì)量檢定規(guī)程JJG 861—2007的規(guī)定要求,采用中性密度濾光片對(duì)微孔板吸光度性能進(jìn)行重復(fù)性檢測(cè)[26-28]。實(shí)驗(yàn)中采用大恒光電的GCC系列中性濾光片。
由于環(huán)境、暗電流等影響,在沒(méi)有光照的情況下,探測(cè)器的檢測(cè)值通常不為0,故吸光度的計(jì)算[式(1)]表示為:
式中,Imin是沒(méi)有光照的情況下的檢測(cè)值;Imax是沒(méi)有檢測(cè)物的情況下測(cè)的光源強(qiáng)度。光源的穩(wěn)定性隨著時(shí)間可能會(huì)有變化,可以每次測(cè)量時(shí)先測(cè)量光源強(qiáng)度再進(jìn)行檢測(cè),也可以事先測(cè)量光源強(qiáng)度保存相關(guān)值,定期對(duì)光源值進(jìn)行校準(zhǔn)。經(jīng)檢測(cè),不同波長(zhǎng)光源的光強(qiáng)值差異較大,每個(gè)波段需要單獨(dú)保存用于計(jì)算。為了提高檢測(cè)速度,這里選用保存光源測(cè)量值、定期校準(zhǔn)光源的方式,吸光度整板檢測(cè)一次測(cè)量時(shí)間小于10 s。
3.1.1 重復(fù)性及準(zhǔn)確性測(cè)試
選擇不同波長(zhǎng)的光源,將標(biāo)稱(chēng)值OD=1.0的中性濾光片放在96孔架上,如圖10所示,在濾光片所在的中心孔位重復(fù)測(cè)量10次,計(jì)算多次測(cè)量OD值的平均值A(chǔ)VE和標(biāo)準(zhǔn)偏差RSD(表3)。
表3 不同波長(zhǎng)吸光度測(cè)量值Table 3 OD values at different wavelength
圖10 檢測(cè)中性密度濾光片的OD值Fig. 10 Neutral filter used for OD test
從上表可以看到,4個(gè)波長(zhǎng)的測(cè)量值標(biāo)準(zhǔn)偏差均小于0.3%。測(cè)量準(zhǔn)確性方面,不同波長(zhǎng)的光源強(qiáng)度有些差異,測(cè)量誤差也有些不同,405 nm的示值誤差稍大,平均值與標(biāo)稱(chēng)值的差異為0.035,其他幾個(gè)波長(zhǎng)分別為0.008、0.006、-0.004。由于測(cè)量值的重復(fù)性較好,考慮補(bǔ)償方式校正示值誤差。測(cè)量誤差隨波長(zhǎng)不同有些變化,需對(duì)不同波長(zhǎng)測(cè)量結(jié)果分別校正。
除了同一孔位的重復(fù)性,不同孔位之間的差異也需要考慮。這里選取同一波長(zhǎng)同一濾光片,隨機(jī)移動(dòng)濾光片在96孔板上的位置,測(cè)量幾個(gè)不同孔位的重復(fù)性,不同孔位用微孔板兩個(gè)方向的序號(hào)代表,測(cè)量結(jié)果如表4,測(cè)量標(biāo)準(zhǔn)偏差同樣小于0.3%。后續(xù)還需進(jìn)一步增加測(cè)量孔位,并在測(cè)量值的校準(zhǔn)中綜合考慮不同孔位的誤差。
表4 不同孔位吸光度測(cè)量值Table 4 OD values at different position
3.1.2 線性度測(cè)試
為更準(zhǔn)確地測(cè)量線性度,在中國(guó)計(jì)量科學(xué)研究院購(gòu)買(mǎi)橙黃G吸光度標(biāo)準(zhǔn)溶液[生化分析儀線性誤差校準(zhǔn)用溶液GBW(E)130767-130774]進(jìn)行線性度測(cè)試。不同濃度的溶液分別取100 μL加入透明微孔板的不同孔位,光源采用492 nm波段,吸光度測(cè)量值的平均值A(chǔ)VE及標(biāo)準(zhǔn)差RSD如表5。線性擬合曲線如圖11所示,擬合方程y=0.2739x+0.0434,擬合系數(shù)R2=0.9963。由于測(cè)量條件不一樣,使用的波長(zhǎng)及檢測(cè)工具不同,測(cè)量值與標(biāo)準(zhǔn)值數(shù)值差異較大,但擬合系數(shù)接近1,線性度較好。
表5 不同標(biāo)準(zhǔn)溶液的吸光度測(cè)量值Table 5 OD values for different standard solutions
圖11 不同濃度溶液吸光度測(cè)量值的線性擬合Fig. 11 Linear fitting of different solutions OD test
熒光素鈉安全無(wú)毒,這里我們采用熒光素鈉粉末(分子量376.27)配制熒光素溶液(圖12)測(cè)試熒光檢測(cè)精度,10 mmol/L的NaOH標(biāo)準(zhǔn)溶液作為稀釋溶液。主要的儀器工具包括高精度電子秤、移液槍、容量瓶、燒杯、滴定管等。為降低背景干擾,熒光檢測(cè)選用黑色的96孔板。
圖12 配制熒光素鈉溶液Fig. 12 Fluorescein solution
①配制0.5 mmol/L熒光素鈉溶液:用電子秤量取0.301 g熒光素鈉,與1600 mL的NaOH溶液融合。選擇該溶液作為母液,用NaOH溶液稀釋可得到所需濃度的溶液。
②配制pmol/L的熒光素鈉梯度溶液:首先將10 μL的0.5 mmol/L的熒光素鈉溶液與4990 μL的NaOH溶液混合得到1 μmol/L的溶液;再將10 μL 1 μmol/L的溶液與10 mL NaOH溶液稀釋得到1 nmol/L的溶液,此后再對(duì)半稀釋得到500 pmol/L、250 pmol/L、125 pmol/L、 62.5 pmol/L、 31.25 pmol/L、15.625 pmol/L、7.8125 pmol/L、3.9063 pmol/L的溶液。
③用移液槍量取100 μL的不同濃度的溶液分別滴入96孔板,連續(xù)測(cè)量5次計(jì)算平均值A(chǔ)VE和標(biāo)準(zhǔn)偏差RSD,測(cè)量結(jié)果如表6。根據(jù)測(cè)量的平均值進(jìn)行線性擬合,這里將稀釋所用的NaOH溶液作為對(duì)照樣本,其他濃度的溶液減去對(duì)照樣本的數(shù)值后再進(jìn)行擬合,如圖13,擬合系數(shù)R2=0.9967。當(dāng)濃度稀釋至3.9063 pmol/L時(shí),檢測(cè)值與稀釋溶液NaOH的值接近,基本到達(dá)檢測(cè)限。
表6 熒光素鈉溶液檢測(cè)值Table 6 Detected values of fluorescein sodium
圖13 熒光檢測(cè)值線性擬合Fig. 13 Linear fitting of fluorescence detection
此外,為比較不同孔位的檢測(cè)重復(fù)性,用移液槍選取100 μL的相同濃度溶液分別加入96孔板的不同孔位。檢測(cè)結(jié)果如表7,可以看到檢測(cè)值的標(biāo)準(zhǔn)差相對(duì)表6明顯增加,機(jī)構(gòu)移動(dòng)時(shí)的定位誤差會(huì)影響光照位置,不同孔位的加樣過(guò)程也可能會(huì)引入部分誤差,均會(huì)影響檢測(cè)值。后續(xù)還需提高位置控制精度,另外,不同的檢測(cè)距離、溶液加樣量[29]等對(duì)測(cè)量結(jié)果都會(huì)有影響,還需要進(jìn)一步實(shí)驗(yàn)驗(yàn)證選取最佳參數(shù)。
表7 不同孔位的熒光檢測(cè)值Table 7 Fluorescence values at different position
實(shí)驗(yàn)中采用自動(dòng)化鑄造平臺(tái)的集成控制軟件控制機(jī)械臂與微孔板檢測(cè)系統(tǒng),可以實(shí)現(xiàn)對(duì)微孔板檢測(cè)系統(tǒng)的控制。首先,集成控制軟件根據(jù)IP地址和端口號(hào)連接設(shè)備;然后,機(jī)械臂運(yùn)動(dòng)到微孔板檢測(cè)儀所在的位置,如圖14(a);接著,機(jī)械臂將96孔板送到檢測(cè)系統(tǒng),如圖14(b);最后,發(fā)送命令進(jìn)行操作并顯示當(dāng)前狀態(tài)。圖14(c)顯示集成控制軟件發(fā)送#Abs001#進(jìn)行吸光度檢測(cè),目前狀態(tài)是吸光度檢測(cè)完成。
圖14 自動(dòng)化平臺(tái)遠(yuǎn)程控制Fig. 14 Remote controlled by automated integration platform
本系統(tǒng)研制一種經(jīng)濟(jì)、緊湊型多功能微孔板檢測(cè)儀,根據(jù)實(shí)驗(yàn)結(jié)果與部分國(guó)內(nèi)外儀器進(jìn)行性能比較。國(guó)外的多功能微孔板檢測(cè)儀種類(lèi)較多,功能也從單功能、雙功能到多功能。這里僅列舉兩種:SectralMax Mini作為一種經(jīng)濟(jì)型的多功能酶標(biāo)儀,主要用于檢測(cè)光吸收、熒光;BioTek Synergy H1多功能檢測(cè)儀,采用光柵和濾光片的獨(dú)特組合光路,可以檢測(cè)光吸收、熒光強(qiáng)度、熒光偏振、時(shí)間分辨率熒光、生物發(fā)光、熒光共振BRET等,功能強(qiáng)大。國(guó)內(nèi)的酶標(biāo)儀基本都只包含吸光度檢測(cè),選取博科公司最新的BK-EL10D型號(hào)進(jìn)行對(duì)比。光吸收和熒光檢測(cè)性能比較如表8,可以看到國(guó)內(nèi)酶標(biāo)儀在吸光度檢測(cè)方面已經(jīng)接近國(guó)外水平,但功能相對(duì)單一,沒(méi)有集成熒光、發(fā)光檢測(cè)等功能。本系統(tǒng)研發(fā)的微孔板檢測(cè)儀,是一種緊湊、經(jīng)濟(jì)型檢測(cè)儀器,吸光度檢測(cè)精度在0~2.0范圍內(nèi)較好,熒光檢測(cè)靈敏度可以達(dá)到pmol/L級(jí)別,與國(guó)外的經(jīng)濟(jì)型儀器指標(biāo)已比較接近,但在檢測(cè)范圍方面還有待提高。在自動(dòng)化兼容方面,僅BioTek Synergy系列提到可以與第三方兼容,其他型號(hào)無(wú)相關(guān)介紹;本系統(tǒng)研發(fā)設(shè)備的接口開(kāi)放,已實(shí)驗(yàn)測(cè)試可以實(shí)現(xiàn)自動(dòng)化平臺(tái)的遠(yuǎn)程控制。因此,該系統(tǒng)研發(fā)儀器可以替代國(guó)外的經(jīng)濟(jì)型多功能酶標(biāo)儀用于合成生物自動(dòng)化平臺(tái)。
表8 微孔板檢測(cè)儀性能比較Table 8 Performance comparison of microplate readers
本課題組研制了一套經(jīng)濟(jì)、緊湊型的多功能微孔板檢測(cè)系統(tǒng),包含吸光度檢測(cè)和熒光檢測(cè)功能,自主設(shè)計(jì)了控制系統(tǒng)和數(shù)據(jù)采集處理軟件,可以通過(guò)串口和TCP方式與自動(dòng)化平臺(tái)的集成控制系統(tǒng)進(jìn)行通信。實(shí)驗(yàn)測(cè)試驗(yàn)證了系統(tǒng)的可行性及檢測(cè)的準(zhǔn)確性。系統(tǒng)的主要優(yōu)點(diǎn)有:
①模塊化設(shè)計(jì),吸光度模塊和熒光模塊均可獨(dú)立控制和運(yùn)行。吸光度同時(shí)檢測(cè)多路透射光,一維掃描實(shí)現(xiàn)96孔板的檢測(cè),整板檢測(cè)只需10 s;熒光檢測(cè)激發(fā)光,單點(diǎn)高精度檢測(cè),二維掃描實(shí)現(xiàn)整板檢測(cè)。
②系統(tǒng)結(jié)構(gòu)緊湊。熒光檢測(cè)時(shí),通過(guò)微孔板的一維運(yùn)動(dòng)結(jié)合小型熒光檢測(cè)模塊的一維運(yùn)動(dòng)實(shí)現(xiàn)二維掃描,掃描機(jī)構(gòu)緊湊;另外,電機(jī)控制采用嵌入式微控制器和電機(jī)驅(qū)動(dòng)芯片,不需要外接驅(qū)動(dòng)器,節(jié)約成本及空間。
③多種接口通信方式,可串口連接調(diào)試控制,也可遠(yuǎn)程操作檢測(cè)。
該微孔板檢測(cè)系統(tǒng)可以實(shí)現(xiàn)吸光度和熒光的檢測(cè),功能基本實(shí)現(xiàn),但目前還有待改進(jìn)的地方,也是后續(xù)工作的重點(diǎn):
①完善軟件的數(shù)據(jù)處理和分析。目前只包含了基本的質(zhì)控分析,還需增加測(cè)量數(shù)據(jù)的曲線顯示、回歸計(jì)算、具體生化數(shù)據(jù)分析等。
②進(jìn)一步提高檢測(cè)精度。吸光度檢測(cè)中,當(dāng)透射率較小時(shí)測(cè)量誤差會(huì)有所增加,正在改進(jìn)數(shù)據(jù)采集模塊,提高數(shù)據(jù)的采集精度并提高吸光度的測(cè)量范圍。熒光檢測(cè)中,將進(jìn)一步進(jìn)行影響因素分析,如溶液量、檢測(cè)距離、放大倍數(shù)等,實(shí)驗(yàn)選取最佳參數(shù)。此外,機(jī)械運(yùn)動(dòng)誤差會(huì)增加不同孔位之間的檢測(cè)誤差,還要進(jìn)一步提高定位精度,減小整體系統(tǒng)誤差。
③便攜性設(shè)計(jì)。小型化、便攜性是檢測(cè)儀器發(fā)展的趨勢(shì),本系統(tǒng)結(jié)構(gòu)緊湊但還有提升空間。如:a.減小儀器體積,開(kāi)蓋機(jī)構(gòu)目前采用向上推拉設(shè)計(jì),增加了儀器高度和重量,后續(xù)考慮改進(jìn)孔板的進(jìn)樣機(jī)構(gòu),讓孔板自動(dòng)向外伸縮,減小體積;b.輕量化設(shè)計(jì),目前樣機(jī)外殼稍重,后續(xù)擬采用輕質(zhì)材料減小重量,并進(jìn)一步優(yōu)化結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì),使其更便攜美觀。