對(duì)于數(shù)學(xué)愛(ài)好者來(lái)說(shuō),分形是一種令人著迷的模式,它具有重復(fù)的、人造的外觀結(jié)構(gòu)?,F(xiàn)在,科學(xué)家發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)已知的分形蛋白質(zhì)。
即使對(duì)數(shù)學(xué)家來(lái)說(shuō),分形的定義也很棘手,但一般來(lái)說(shuō),它們是由更小的結(jié)構(gòu)組成的幾何圖形,而這些結(jié)構(gòu)本身又與整體相似。在實(shí)踐中,這意味著如果放大分形的一部分,就會(huì)看到類似的結(jié)構(gòu),如此類推,直至無(wú)窮。
在自然界中,分形特征出現(xiàn)在雪花、閃電和河網(wǎng)等事物中。分子似乎是發(fā)現(xiàn)分形的最佳場(chǎng)所,因?yàn)樗鼈兛梢耘帕谐筛鞣N有趣的形狀,但在現(xiàn)有的所有分子目錄中,還從未出現(xiàn)過(guò)規(guī)則分形。
據(jù)報(bào)道,德國(guó)馬克斯·普朗克研究所和美國(guó)菲利普斯大學(xué)的科學(xué)家們發(fā)現(xiàn)了第一個(gè)規(guī)則分子分形。這是一種藍(lán)藻用來(lái)生產(chǎn)檸檬酸鹽的酶,這種酶被發(fā)現(xiàn)可以自然地組合成一種特殊的分形圖案,這種圖案被稱為“謝爾賓斯基三角形”。
從一個(gè)等邊三角形開(kāi)始。然后從中間打出一個(gè)倒三角形,這樣就有三個(gè)小三角形組成一個(gè)大三角形,中間有一個(gè)三角形空洞。然后從每個(gè)較小的實(shí)心三角形中打出一個(gè)倒三角形,這樣就有三個(gè)第二個(gè)形狀或九個(gè)原始形狀的三角形組成了一個(gè)較大的三角形。你可以一直這樣做下去,每個(gè)三角形都變小,這就是謝爾賓斯基三角形分形圖案。
這項(xiàng)研究的第一作者弗蘭茲斯卡·森德克說(shuō):“我們是偶然發(fā)現(xiàn)這種結(jié)構(gòu)的,當(dāng)我們第一次用電子顯微鏡拍攝它的圖像時(shí),幾乎不敢相信我們看到的一切。蛋白質(zhì)構(gòu)成了這些美麗的三角形,隨著分形的增長(zhǎng),我們?cè)谒鼈冎虚g看到了這些越來(lái)越大的三角形空隙,這完全不同于我們以前見(jiàn)過(guò)的任何蛋白質(zhì)組裝?!?p>
為了弄清這種蛋白質(zhì)是如何形成如此有趣的結(jié)構(gòu)的,研究人員使用電子顯微鏡對(duì)其進(jìn)行了更詳細(xì)的分析,發(fā)現(xiàn)它的自組裝并不對(duì)稱。研究人員發(fā)現(xiàn),不同的蛋白質(zhì)鏈在分形的不同位置產(chǎn)生了略微不同的相互作用,從而形成了引人注目的結(jié)構(gòu)。
那么,這個(gè)數(shù)學(xué)奇跡在細(xì)菌生物學(xué)中是否有特定的作用呢?為了弄清這個(gè)問(wèn)題,研究小組對(duì)這種微生物進(jìn)行了基因改造,使這種蛋白質(zhì)不能形成分形結(jié)構(gòu),但這種細(xì)菌仍能正常生產(chǎn)檸檬酸鹽。
這啟發(fā)了研究人員對(duì)另一種可能性進(jìn)行研究: 這種結(jié)構(gòu)相對(duì)容易進(jìn)化,因此它只是偶然發(fā)生的,不需要有特定的目的。他們利用祖先序列重建技術(shù)追溯了數(shù)百萬(wàn)年來(lái)可能的進(jìn)化過(guò)程,然后用生物化學(xué)方法制造出了這些古老的蛋白質(zhì)。
令人驚訝的是,他們發(fā)現(xiàn)這種分形結(jié)構(gòu)出現(xiàn)得相當(dāng)快,只經(jīng)過(guò)了幾次突變。但這種結(jié)構(gòu)很快就在其他藍(lán)藻品系中消失了,直到最近在一個(gè)物種中才被發(fā)現(xiàn)。
該研究的資深作者格奧爾格·霍赫伯格說(shuō):“雖然我們永遠(yuǎn)無(wú)法完全確定過(guò)去發(fā)生的事情的原因,但這一特殊案例確實(shí)具有看似復(fù)雜的生物結(jié)構(gòu)的所有特征,這種結(jié)構(gòu)只是突然出現(xiàn)的,沒(méi)有任何好的理由,因?yàn)樗浅H菀走M(jìn)化?!?/p>
對(duì)于那些在幾乎感覺(jué)是人造的東西中尋找意義的人們來(lái)說(shuō),這可能不是一個(gè)特別令人滿意的解釋,但從好的方面來(lái)說(shuō),這確實(shí)表明可能還有更多的分子分形等待著人們?nèi)グl(fā)現(xiàn)。
這項(xiàng)研究發(fā)表在《自然》雜志上。