摘要：目的 利用鏈霉菌Streptomyces sp. TRM76323的基因組序列信息，分析其次級(jí)代謝產(chǎn)物生物合成基因簇并預(yù)測(cè)其代謝產(chǎn)物，為發(fā)現(xiàn)潛在新抗生素奠定基礎(chǔ)。方法 采用Illumina Novaseq對(duì)TRM76323菌株進(jìn)行全基因組測(cè)序，結(jié)合antiSMASH、CARD、OrthoFinder、Peppan軟件進(jìn)行基因組分析，進(jìn)行代謝潛力、抗性基因和基因組差異預(yù)測(cè)，為指導(dǎo)新的微生物來(lái)源的天然產(chǎn)物的發(fā)現(xiàn)提供重要的理論指導(dǎo)，并利用現(xiàn)代分離技術(shù)獲得代謝產(chǎn)物。結(jié)果 TRM76323菌株的基因組序列由7，338，911 bp組成，G+C含量為72.1%，共31個(gè)生物合成基因簇，有糖肽類耐藥等抗性基因、分離獲得化合物β-羰基-1H-吲哚-3-丙醛、環(huán)二肽和鄰苯二甲酸二丁酯。結(jié)論 檉柳根際土壤鏈霉菌Streptomyces sp. TRM76323有豐富的次級(jí)代謝產(chǎn)物生物合成基因簇，能產(chǎn)生多種次級(jí)代謝產(chǎn)物，具有進(jìn)一步發(fā)掘新抗生素的價(jià)值。

關(guān)鍵詞：檉柳根際；鏈霉菌；全基因組測(cè)序；次級(jí)代謝產(chǎn)物

中圖分類號(hào)：R978.1，Q939.1 文獻(xiàn)標(biāo)志碼：A

Gene cluster analysis and metabolic product isolation of Streptomyces sp. TRM76323 in the rhizosphere soil of Tamarix

Abstract Objective This study analyzed the secondary metabolite biosynthesis gene clusters of Streptomyces sp. TRM76323 on the basis of its genomic sequence information， laying the foundation for the discovery of potential new antibiotics. Method The whole genome sequencing of the strain TRM76323. was performed by Illumina Novaseq. Additionally， antiSMASH， CARD， OrthoFinder and Pepperan softwares were used for genome analysis to predict metabolic potential， resistance genes， and genomic differences. These findings provided important theoretical guidance for the discovery of new natural products from microbial sources. Furthermore， modern isolation techniques were utilized to obtain metabolites. Results The genome sequence of the TRM76323 strain consisted of 7，338， 911-base pairs， with a G+C content of 72.1%. A total of 31 biosynthetic gene clusters were identified， including resistance genes such as glycopeptide resistance. β-Carbonyl-1H-indole-3-propanal， cyclic dipeptide， and dibutyl phthalate were isolated from this strain. Conclusion Streptomyces sp. TRM76323， found in the rhizosphere soil of Tamarix， possessed a diverse clusters of secondary metabolite biosynthesis genes. This strain had the potential to produce various secondary metabolites and was worth further exploration for the discovery of new antibiotics.

Key words Rhizosphere of Tamarix chinensis; Streptomyces; Whole genome sequencing; Secondary metabolites

臨床68.3%抗感染和79.8%抗腫瘤的小分子化學(xué)藥來(lái)源于天然產(chǎn)物或者其衍生物，而放線菌作為抗生素的寶庫(kù)[1-4]，從中已分離出鏈霉素、新霉素等結(jié)構(gòu)多樣的抗生素[5]。放線菌抗生素種類多、活性廣、應(yīng)用十分廣泛，除發(fā)揮常規(guī)的殺菌、抑菌和抗感染等作用，還可用于抗蟲劑、抗腫瘤劑、除草及免疫抑制。而隨著放線菌物種和代謝產(chǎn)物研究的長(zhǎng)期積累，新物種和新活性物質(zhì)的發(fā)現(xiàn)越來(lái)越難，科學(xué)家們將目光轉(zhuǎn)向極端環(huán)境[6-7]。相較于普通生境，極端環(huán)境微生物在長(zhǎng)期適應(yīng)生存中，產(chǎn)生了有別于普通生境微生物的代謝產(chǎn)物，如一些特殊功能的酶類或一些結(jié)構(gòu)特異的代謝產(chǎn)物，以應(yīng)對(duì)環(huán)境中生長(zhǎng)制約因素對(duì)其自身生長(zhǎng)的影響，因此更有可能從中發(fā)現(xiàn)對(duì)人類有用的次級(jí)代謝產(chǎn)物。

新疆地處我國(guó)西北邊陲，獨(dú)特的地理環(huán)境造就了干旱、鹽堿化程度高的極端環(huán)境。檉柳作為一種廣布的鹽生植物，具有很強(qiáng)的耐鹽、抗旱、耐淹的生物學(xué)特性，廣泛分布在新疆內(nèi)陸鹽堿地，有能量轉(zhuǎn)換、氣候與水分調(diào)節(jié)、水質(zhì)凈化等環(huán)境功能[8-9]。本研究開展新疆檉柳根際鹽堿土微生物的分離和多樣性研究[10]，根據(jù)菌株形態(tài)和16S rRNA鑒定，獲得了一株與Streptomyces luozhongensis TRM49605相似性較高的鏈霉菌，命名為Streptomyces sp. TRM76323。兩者的DNA-DNA雜交的dDDH值為30.60%，ANI值為86.09%，為一潛在新物種。本研究以挖掘新疆檉柳根際鏈霉菌的次級(jí)代謝產(chǎn)物為目標(biāo)，結(jié)合全基因組測(cè)序技術(shù)與現(xiàn)代分離純化技術(shù)，開展了TRM76323菌種次級(jí)代謝產(chǎn)物的預(yù)測(cè)和挖掘。

1 材料與方法

1.1 儀器、材料及試劑

1.2 菌種來(lái)源

Streptomyces sp. TRM76323菌株分離自檉柳根際鹽堿性土壤（東經(jīng)83°205'，北緯38°412'），菌種分別保存于塔里木大學(xué)生命科學(xué)與技術(shù)學(xué)院、塔里木大學(xué)省部共建國(guó)家重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室和中國(guó)典型培養(yǎng)物保藏中心（China Center for Type Culture Collection，CCTCC），編號(hào)為CCTCC No. M2023092。

1.3 培養(yǎng)基

ISP4培養(yǎng)基：淀粉10.0 g，硫酸鎂2.0 g，碳酸鈣2.0 g，硫酸銨4.0 g，磷酸氫二鉀2.0 g，瓊脂16 g，蒸餾水1.0 L，pH 7.0。

高氏培養(yǎng)基：可溶性淀粉20 g，硝酸鉀1 g，硫酸氫二鉀 0.5 g，硫酸鎂0.5 g，氯化鈉0.5 g，硫酸亞鐵0.01 g，瓊脂20 g，pH 7.0。

1.4 方法

1.4.1 基因組測(cè)序

將提取的DNA送到南京派森諾生物信息科技有限公司進(jìn)行全基因組Illumina Novaseq測(cè)序[11]。對(duì)獲得的基因組采用AbySS軟件[12]進(jìn)行拼接。將拼接好的基因組數(shù)據(jù)上傳到NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)（https：//pubmed.ncbi.nlm.nih.gov/），基于Snapgene軟件進(jìn)行分析。

1.4.2 比較基因組分析

基于比較基因組的方法，本研究使用Ezbiocloud （https：//www.ezbiocloud.net/）中相似性最高的19個(gè)菌株基因組進(jìn)行下載，將所得基因組進(jìn)行antiSMASH[13]進(jìn)行預(yù)測(cè)，將預(yù)測(cè)得到的不同基因簇進(jìn)行匯總分類整理，分析TRM76323菌株的次級(jí)代謝潛力，為次級(jí)代謝產(chǎn)物的挖掘提供理論指導(dǎo)。

1.4.3 泛基因組分析

對(duì)TRM76323菌株及相似菌株進(jìn)行核心基因組分析，將掃描獲得的數(shù)據(jù)，同時(shí)將數(shù)據(jù)進(jìn)行ITOL[14]作圖。利用orthoFinder對(duì)所有菌株進(jìn)行直系同源蛋白分析，將文件使用ITOL進(jìn)行作圖?；赑EPPAN算法對(duì)所有菌株進(jìn)行泛基因組掃描，將文件利用 ITOL進(jìn)行作圖。并將通過(guò)Peppan掃描得到的peppan.PEPPAN.gene_content文件利用imgeGP在線軟件構(gòu)建泛基因組曲線圖進(jìn)行泛基因組分析。

1.4.4 抗性基因分析

使用綜合抗菌研究數(shù)據(jù)庫(kù)（CARD）[15]預(yù)測(cè)TRM76323的耐藥基因[16]，預(yù)測(cè)其抗性潛力。

1.4.5 代謝產(chǎn)物發(fā)酵、分離及鑒定

發(fā)酵：選擇ISP4作為種子培養(yǎng)基，配制3 L，接種培養(yǎng)3 d，30 ℃，150 r/min。選擇小米作為發(fā)酵培養(yǎng)基，將50 L小米培養(yǎng)基（每升15 g小米，5 g葡萄糖，4 g蛋白胨和3 g氯化鈉，pH7）的置于100 L發(fā)酵罐中。同時(shí)配3 mol/L NaOH溶液以及HCl溶液調(diào)節(jié)pH值，將發(fā)酵罐進(jìn)行121 ℃高溫滅菌30 min，滅菌后待溫度冷卻至30 ℃，將種子液接種培養(yǎng)7 d。使用80%甲醇對(duì)樣品進(jìn)行萃取，獲得發(fā)酵粗提取物。

分離：將干燥完的樣品進(jìn)行分段萃取，通過(guò)TLC檢測(cè)確定洗脫劑，選擇二氯甲烷-甲醇（10：1， V/V）對(duì)甲醇萃取后的樣品進(jìn)行展層，確定濃度后選擇樣品-硅膠（1：8， W/W）進(jìn)行柱層析分離，柱層析的上樣量為212 g，洗脫劑為二氯甲烷-甲醇（10：1， V/V），洗脫4個(gè)柱體積，每200 mL收集為一瓶，將其旋干，點(diǎn)板，確定樣品真空濃縮至干燥，通過(guò)TLC薄層色譜分析，確定樣品純度，得到純品化合物。

鑒定：將純品化合物溶解于適宜的氘代溶劑，置于潔凈干燥的核磁管中進(jìn)行核磁共振分析，得到碳?xì)渥V數(shù)據(jù)，將碳譜信號(hào)輸入上海微譜化合物數(shù)據(jù)庫(kù)（http：//www.nmrdata.com/）查詢，將結(jié)果與已發(fā)表文獻(xiàn)中的碳?xì)渥V數(shù)據(jù)進(jìn)行對(duì)比，確定化合物結(jié)構(gòu)。

2" " 結(jié)果

2.1 菌株基因組特征

TRM76323菌株的基因組序列由7，338，911 bp組成，包含127個(gè)重疊群、5個(gè)rRNA、103個(gè)tRNA和6330個(gè)編碼序列，G+C含量為72.1%。全基因組登入號(hào)：JAWCTQ000000000，數(shù)據(jù)庫(kù)為NCBI數(shù)據(jù)庫(kù)（https：//www.ncbi.nlm.nih.gov/）。

2.2 生物合成相關(guān)基因簇分析及比較基因組學(xué)分析

本研究通過(guò)對(duì)菌株TRM 76323及相似菌株進(jìn)行antiSMASH分析，將結(jié)果匯總進(jìn)行比較基因組學(xué)分析（圖1）?；诒容^基因組學(xué)分析可知所有菌株都有Terpene和NRPS-independent-siderophore（非核糖體肽合成酶-獨(dú)立鐵載體合成酶）基因簇和促植物生長(zhǎng)因子。所有菌株的主要次級(jí)代謝產(chǎn)物還有T1PKS、T2PKS、T3PKS、melanin、RiPP-like和butyrolactone等。相似菌株S. cellostaticus DSM 40189有55個(gè)基因簇，代謝潛力最豐富，S. yokosukanensis DSM 40224次之，有54個(gè)基因簇，S. luozhongensis TRM 49605只有22個(gè)基因簇。其中該菌株TRM 76323中Cluster 8為膦酸生物合成基因簇，基因簇全長(zhǎng)96，815 kb，該基因簇在其相似菌株中較為獨(dú)特，其可能產(chǎn)生相應(yīng)的抗生素，草甘膦是該類化合物的主要代表之一。

本研究利用antiSMASH對(duì)菌株Streptomyces sp. TRM76323基因組的次級(jí)代謝產(chǎn)物合成基因簇進(jìn)行預(yù)測(cè)及分析，檢測(cè)到31個(gè)與次級(jí)代謝產(chǎn)物合成相關(guān)的基因簇，主要包含6個(gè)terpene、6個(gè)NRPS、5個(gè)lanthipeptide、2個(gè)siderophore、3個(gè)butyrolactone和1個(gè)phosphonate。從次級(jí)代謝產(chǎn)物類型看，其代謝能力較為豐富，其中可能包含抗真菌的大環(huán)類IPC合酶抑制劑rustmicin、抗腫瘤neocarzinostatin、胰腺癌干細(xì)胞抑制劑BE-43547A1、抗結(jié)核ecumicin、酶抑制劑RP-1776、抗病毒soraphen A、抗細(xì)菌ficellomycin和抗腫瘤zorbamycin等。該菌株具有比較獨(dú)特的膦酸生物合成基因簇，與已發(fā)表的代謝產(chǎn)物的基因簇相似性較低，表明其很大的合成新型抗生素潛力。

TRM 76323 中Cluster 1共有基因65個(gè)基因構(gòu)成，與已知S. hiroshimensis中的hiroshidine的生物合成基因簇（MIBiGaccession： BGC0001960）具有同源性，相似度為89%，說(shuō)明菌株TRM 76323的Region1基因簇極有可能具有合成這類化合物的潛力，且可能為新抗生素。

2.3 菌株的泛基因組分析

菌株TRM 76323與其相似菌株建立系統(tǒng)發(fā)育樹，基于核心基因組，同源蛋白，泛基因組建樹（圖1）可知，TRM 76323與其最相似的兩株菌株都聚類到一起，說(shuō)明了菌株的同源性。菌株TRM 49605和菌株S. roseoliacinus NBRC 12851都具有明顯分支，說(shuō)明菌株的物種特異性。通過(guò)同源蛋白建樹的同源性揭示這些蛋白質(zhì)控制的基因表達(dá)之間的相互關(guān)系，也可以預(yù)測(cè)在特定基因組織中蛋白質(zhì)的表達(dá)和調(diào)控水平，說(shuō)明菌株TRM 76323與相似菌株具有較好的同源性。泛基因組代表該物種所有的基因庫(kù)，菌株TRM 76323與相似菌株聚類到一起，其生物合成代謝具有相似性，通過(guò)圖2發(fā)現(xiàn)大多數(shù)菌株具有共同的基因簇，它們分別是terpene、ectoine、NRPS、NRPS-like、NRPS-independent-siderophore和lanthipeptide-class-iii等，泛基因組的分析結(jié)果與比較基因組一致。

TRM 76323中Cluster 1共有基因65個(gè)基因構(gòu)成，與已知Streptomyces hiroshimensis中的hiroshidine生物合成基因簇（MIBiGaccession：BGC0001960）具有同源性，相似度為89%，說(shuō)明菌株TRM 76323的Cluster 1基因簇極有可能具有合成這類化合物的潛力（圖3）。

泛基因組關(guān)聯(lián)研究（PanGWAS）是通過(guò)使用Peppan算法來(lái)定義鏈霉菌中的生物基因組。只有敏感性和特異性≥95%的基因，存在于≤25%的對(duì)照組中，才被認(rèn)為是有意義的結(jié)果。通過(guò)泛基因組基因和核心基因擬合性分析，顯示了添加最后一個(gè)基因組后的明顯增加趨勢(shì)，支持鏈霉菌的泛基因組是開放的（α=0.534±0.015，γ=0.049±0.004）。核心基因組大小估計(jì)表明，核心基因的數(shù)量接近恒定值。泛基因組基因家族的數(shù)量隨著鏈霉菌基因組數(shù)量的增加而增加，最終有34，550個(gè)基因。核心基因組中的基因家族數(shù)量隨著鏈霉菌基因組數(shù)量的增加而減少。共有2，225個(gè)核心基因，占6.4%，軟核心基因共有446個(gè)，占比1.3%，共有9，906個(gè)外殼基因，占28.7%，共有21953個(gè)云基因，占63.6%（圖4）。泛基因組結(jié)果模型是開放的，更多的非核心基因促進(jìn)了物種的多樣性，使它們能夠適應(yīng)各種環(huán)境條件。

2.4 菌株抗性基因預(yù)測(cè)

基于耐藥基因數(shù)據(jù)庫(kù)CARD對(duì)菌株TRM 76323進(jìn)行抗性分析，分析可知菌株抗性包含利福平單加氧酶、糖肽類耐藥基因簇和解旋酶樣RNA聚合酶保護(hù)蛋白基因家族，序列相似性分別為75.52%、35.38%和81.24%，說(shuō)明菌株可能具有此類抗性，已另文發(fā)表[16]。

2.5 菌株代謝產(chǎn)物鑒定

將獲得的單體化合物利用核磁共振分析。首先為樣品選擇適宜的氘代試劑，旋蒸干后使用相應(yīng)的試劑進(jìn)行核磁共振分析，并結(jié)合相關(guān)文獻(xiàn)確定化合物的單體結(jié)構(gòu)，解析如下。

化合物1：淡黃色無(wú)定形粉末，5 mg，溶于DMSO，化合物結(jié)構(gòu)鑒定為β-羰基-1H-吲哚-3-丙醛。1H NMR（500 MHz， DMSO-d6）： 8.34（1H， s， H-10）， 8.18（1H， d， J=7.5 Hz， H-4）， 7.22～7.25（2H， m， H-5， H-6）， 4.54（1H， d， J=5.0 Hz， C-9）， 13C NMR（125 MHz， DMSO-d6）： 134.1（d， C-2）， 114.4（s， C-3）， 125.8（s， C-3a）， 121.6（d， C-4）， 122.3（d， C-5）， 123.4（d， C-6）， 112.6（d， C-7）， 136.9（s， C-7a）， 190.0（s， C-8）， 44.8（t， C-9）， 161.8（s， C-10）。經(jīng)文獻(xiàn)查閱，該化合物與文獻(xiàn)報(bào)道[17]基本對(duì)應(yīng)，鑒定該化合物為β-羰基-1H-吲哚-3-丙醛（圖5）。

化合物2：白色粉末，5 mg，溶于DMSO，化合物結(jié)構(gòu)鑒定為甘氨酸-L-脯氨酸。1H NMR（500 MHz， DMSO-d6）： 4.01（1H， dd， J =16.8， 1.6 Hz， H-3a）， 3.98（1H， d， J =16.8 Hz， H-3b）， 4.12（1H， ddd， J=7.2， 6.6， 1.8 Hz， H-6）， 2.55/2.13（each1H， m， H-7）， 1.86（2H， m， H-8）， 3.54（2H， m， H-9），13C NMR（125 MHz， DMSO-d6）： 163.9（C-2）， 58.1（C-6）， 169.3（C-5）， 58.1（C-6）， 45.9（C-3）， 22.1（C-8）， 27.9（C-7）.經(jīng)過(guò)微譜數(shù)據(jù)庫(kù)比對(duì)，文獻(xiàn)查閱，該化合物與文獻(xiàn)報(bào)道基本對(duì)應(yīng)[18]，鑒定該化合物為環(huán)二肽（甘氨酸-L-脯氨酸）即cyclo-（Gly-L-Pro）（圖6）。

化合物3：無(wú)色透明液體，4 mg，溶于MeOD?；衔锝Y(jié)構(gòu)鑒定為鄰苯二甲酸二丁酯。1H NMR（500 MHz， DMSO-d6）： 1H NMR（500 MHz， Methanol-d4）： 0.99（6H， t， J =5， CH3 5'， 5\"）， 1.47（4H， m， CH2-4'， 4\"）， 1.77（4H， m， CH2-3' ，3\"）， 4.32（4H， t， J =5， CH2-2'， 2\"）， 7.75（2H， dd， J =10， 5， H-2， 5）; 7.65（2H， dd， J=10， 5， H-3， 4）.13C NMR（125 MHz， Methanol-d4）：12.2（q， C-5'， 5\"）， 18.4（t， C-4'， 4\"）， 39.9（t， C-3'， 3\"）， 64.9（t， C-2'， 2''）， 128.1（d， C-2， 5）， 130.5（d， C-3， 4）， 131.8（s， C-1， 6）， 167.5（s， C-1'， 1\"），與文獻(xiàn)相符合[19]，見圖7。

3 結(jié)論與討論

眾多關(guān)于植物根際鏈霉菌分離次級(jí)代謝產(chǎn)物的報(bào)道說(shuō)明了植物根際來(lái)源的微生物具有豐富的次級(jí)代謝產(chǎn)物，如張小霞等[20]從檉柳根際土壤獲得一株鹽單胞菌Bachu 26，具有植物促生的作用。周冬月等[21]對(duì)長(zhǎng)白山特殊生境藥用植物根際拮抗菌的次級(jí)代謝產(chǎn)物進(jìn)行分離，獲取拮抗金黃色葡萄球菌的化合物，張一等[22]對(duì)紅樹林植物木欖根際土壤真菌Penicillium sp. MA-37的化學(xué)成分進(jìn)行研究鑒定了8個(gè)天然產(chǎn)物，包括氮-（2-甲氧基-4-羥基苯）-丙酰胺酸（1）等。對(duì)于新疆檉柳根際鏈霉菌的次級(jí)代謝產(chǎn)物的挖掘的研究報(bào)道不多，因此對(duì)于檉柳根際來(lái)源的微生物代謝產(chǎn)物挖掘具有重要意義。本研究采用第二代測(cè)序技術(shù)，獲得了新疆檉柳根際鏈霉菌TRM 76323的全基因組序列，并利用antiSMASH（v6.0.1）在線工具預(yù)測(cè)了該菌株的潛在生物合成基因簇，發(fā)現(xiàn)其具有31條生物合成基因簇，相比較其相似菌株，說(shuō)明其具有較為豐富的代謝潛能。通過(guò)對(duì)菌株TRM 76323比較基因組學(xué)和泛基因組學(xué)分析，發(fā)現(xiàn)了菌株共同代謝能力和獨(dú)特的生物合成基因，如基因組揭示了其含有膦酸合成基因簇的相似菌株，值得進(jìn)一步挖掘。抗性基因是導(dǎo)致抗生素抗性菌株出現(xiàn)的原因之一，它是由基因突變導(dǎo)致的。因此，通過(guò)基因檢測(cè)來(lái)篩選抗性基因，可以幫助人們更好地了解菌株的抗性，以便更好地利用微生物資源，為此通過(guò)預(yù)測(cè)菌株TRM 76323抗性基因分析可發(fā)現(xiàn)其可能具有利福平單加氧酶、糖肽類耐藥的耐藥性，該實(shí)驗(yàn)結(jié)果為后續(xù)天然產(chǎn)物挖掘提供理論支持，而獲得的β-羰基-1H-吲哚-3-丙醛，環(huán)二肽，鄰苯二甲酸二丁酯等化合物豐富了小分子化合物資源庫(kù)，對(duì)于以上化合物李云鵬等[23]報(bào)道了鄰苯二甲酸二丁酯對(duì)于4種鐮刀菌[尖孢鐮刀菌（Fusarium oxysporum）、茄病鐮刀菌（F. solani）、三線鐮刀菌（F. tricinctum）、燕麥鐮刀菌（F. avenaceum）]具有較好的拮抗活性；劉睿等[24]發(fā)現(xiàn)環(huán)二肽類化合物對(duì)慢性髓原白血病細(xì)胞K562具有細(xì)胞毒活性。

本研究對(duì)菌株TRM 76323的基因組分析幫助我們準(zhǔn)確、快速地識(shí)別菌株中的基因和功能，發(fā)現(xiàn)菌株獨(dú)特的代謝潛力，以及代謝潛力的同一性。針對(duì)世界抗生素瀕臨枯竭，大多數(shù)菌株具有耐藥性的問題，大多研究根據(jù)生物合成基因簇和抗生素抗性基因這兩方面，試著對(duì)抗生素展開篩選，用來(lái)篩選的這兩類基因中，抗性基因可以通過(guò)靶向修飾起作用，易于識(shí)別。相關(guān)研究通過(guò)對(duì)基因信息的分析，確定了新抗生素的存在，其中之一是一個(gè)已知的化合物complestatin，而另一種則來(lái)自采于加拿大亞伯達(dá)省的一株鏈霉菌，被命名為corbomycin[25]，本研究嘗試通過(guò)菌株抗性基因的預(yù)測(cè)表明了菌株抗性基因包括了糖肽類抗生素抗性基因等，為后續(xù)天然產(chǎn)物的挖掘提供理論指導(dǎo)。本研究利用現(xiàn)代分離技術(shù)獲得了相關(guān)的活性化合物，但未充分獲得該菌株的代謝產(chǎn)物，根據(jù)基因組分析發(fā)現(xiàn)菌株中存在和已知化合物生物合成基因簇相似度低的基因簇，說(shuō)明菌株可能具有產(chǎn)生新化合物的潛力，該菌株還值得后續(xù)進(jìn)行挖掘。

參 考 文 獻(xiàn)

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