摘""要:火龍果的生長發(fā)育與根際微生物密切相關(guān),但對火龍果生產(chǎn)周期中根際微生物的季節(jié)性特征缺乏了解。本研究以海南紅心火龍果為研究對象,采用高通量測序技術(shù)探討火龍果根際微生物群落在不同季節(jié)的動態(tài)變化,以及微生物群落與土壤理化因子的相關(guān)性。結(jié)果表明:火龍果根際微生物群落豐富度和多樣性受季節(jié)驅(qū)動,各季節(jié)微生物群落的Ace指數(shù)、Chao1指數(shù)、Shannon指數(shù)和Simpson指數(shù)存在一定差異,特別是在秋季呈上升趨勢。從火龍果四季采集的12個根際樣品中共獲得6132個細(xì)菌OTUs和1850個真菌OTUs。其中,細(xì)菌分別隸屬于43門、135綱、319目、502科和963屬;真菌分別隸屬于15門、42綱、103目、214科和423屬。厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)和變形菌門(Proteobacteria)的相對豐度在四季中穩(wěn)定且占據(jù)前三,為優(yōu)勢細(xì)菌門。芽孢桿菌屬(Bacillus)相對豐度在整個細(xì)菌群落中一直保持最高,為優(yōu)勢細(xì)菌屬,但春、冬季的相對豐度明顯高于夏、秋季。子囊菌門(Ascomycota)為火龍果根際的優(yōu)勢真菌門,毛殼菌屬(Chaetomium)為優(yōu)勢菌屬,且春季的相對豐度遠(yuǎn)高于其他季節(jié)。差異物種分析顯示,四季中細(xì)菌共產(chǎn)生了15個差異物種,真菌產(chǎn)生了3個差異物種?;瘕埞H土壤理化因子季節(jié)變化明顯,且與根際微生物群落密切相關(guān)。FAPROTAX預(yù)測顯示火龍果根際細(xì)菌主要表現(xiàn)為化能異養(yǎng)、好氧化能異養(yǎng)、尿素水解、硝酸鹽還原、纖維素水解、固氮作用、芳香族有機(jī)物降解以及人畜致病性等功能;FUNGuild預(yù)測顯示火龍果根際真菌主要表現(xiàn)為腐生生存和某些未知功能等。本研究結(jié)果顯示海南紅心火龍果根際微生物群落結(jié)構(gòu)在四季發(fā)生顯著變化,秋季具有最高的多樣性和豐富度,芽孢桿菌屬和毛殼菌屬分別是根際的優(yōu)勢細(xì)菌屬和優(yōu)勢真菌屬。研究結(jié)果可為基于根際微生物的火龍果栽培改良措施的設(shè)計提供理論依據(jù)。
關(guān)鍵詞:火龍果;根際微生物;多樣性;季節(jié)變化中圖分類號:S154.3;S667.9""""""文獻(xiàn)標(biāo)志碼:A
Seasonal"Characteristics"of"Rhizosphere"Microbial"Communities"in"Red"Pitaya"in"Hainan
YANG"Yuxin1,"ZHU"Ji1,"HUANG"Shengnan2,"TANG"Yingzhi3,"CONG"Xinli1*,"HUANG"Xiaolong1*
1."College"of"Life"and"Health"Sciences,"Hainan"University,"Haikou,"Hainan"570228,"China;"2."Haikou"Customs"Technical"Center,"Haikou,"Hainan"570311,"China;"3."Hainan"Shangling"Agricultural"Technology"Co.,"Ltd.,"Changjiang,"Hainan"572700,"China
Abstract:"The"growth"and"development"of"pitaya"are"closely"associated"with"the"rhizosphere"microbiome,"yet"there"is"a"lack"of"understanding"regarding"the"seasonal"characteristics"of"the"microorganisms"during"the"fruit’s"production"cycle."This"study"focused"on"the"red-fleshed"pitaya"in"Hainan,"utilizing"high-throughput"sequencing"technology"to"investigate"the"dynamics"of"the"rhizosphere"microbial"community"across"different"seasons"and"its"correlation"with"soil"physicochemical"factors."The"results"indicated"that"the"richness"and"diversity"of"the"pitaya"rhizosphere"microbial"community"were"seasonally"driven."There"were"significant"differences"in"the"Ace"index,"Chao1"index,"Shannon"index,"and"Simpson"index"among"the"microbial"communities"across"seasons,"particularly"showing"an"increasing"trend"in"autumn."A"total"of"6132"bacterial"OTUs"and"1850"fungal"OTUs"were"obtained"from"12"rhizosphere"samples"collected"throughout"the"four"seasons."Bacterial"OTUs"were"classified"into"43"phyla,"135"classes,"319"orders,"502"families,"and"963"genera,"while"fungal"OTUs"were"classified"into"15"phyla,"42"classes,"103"orders,"214"families,"and"423"genera."The"phyla"Firmicutes,"Actinobacteria,"and"Proteobacteria"showed"stable"and"dominant"relative"abundances"across"the"four"seasons,"making"them"the"predominant"bacterial"phyla."The"genus"Bacillus"maintained"the"highest"relative"abundance"within"the"bacterial"community,"making"it"the"dominant"bacterial"genus;"however,"its"relative"abundance"was"significantly"higher"in"spring"and"winter"compared"to"summer"and"autumn."The"phylum"Ascomycota"was"the"dominant"fungal"phylum"in"the"pitaya"rhizosphere."The"genus"Chaetomium"was"the"dominant"fungal"genus,"with"a"notably"higher"relative"abundance"in"spring"compared"to"other"seasons."Differential"species"analysis"revealed"15"bacterial"differential"species"and"3"fungal"differential"species"across"the"four"seasons."The"physicochemical"properties"of"the"pitaya"rhizosphere"soil"showed"significant"seasonal"variation"and"were"closely"related"to"the"rhizosphere"microbial"community."FAPROTAX"predictions"indicated"that"the"pitaya"rhizosphere"bacteria"primarily"exhibited"functions"such"as"chemoheterotrophy,"aerobic"chemoheterotrophy,"ureolysis,"nitrate"reduction,"cellulolysis,"nitrogen"fixation,"aromatic"compound"degradation"and"animal"parasites"or"symbionts."FUNguild"predictions"showed"that"the"pitaya"rhizosphere"fungi"mainly"displayed"saprotrophic"lifestyles"and"some"unknown"functions."In"summary,"this"study"demonstrated"that"the"structure"of"the"rhizosphere"microbial"community"associated"with"red-fleshed"pitaya"in"Hainan"undergoes"significant"changes"across"the"four"seasons,"with"the"highest"diversity"and"richness"observed"in"the"fall."Bacillus"and"Chaetomium"were"identified"as"the"dominant"bacterial"and"fungal"genera"in"the"rhizosphere,"respectively."The"findings"could"provide"a"theoretical"basis"for"designing"cultivation"improvement"measures"based"on"rhizosphere"microbiota"for"pitaya.
Keywords:"pitaya;"rhizospheric"microorganism;"diversity;"seasonal"change
DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2024.12.018
火龍果(Hylocereus"undulatus)屬仙人掌科(Cactaceae)量天尺屬(Hylocereus)的多年生常綠藤本漿果類果樹,是一種典型的熱帶水果[1]。目前,我國火龍果的種植面積已經(jīng)超過百萬畝,已成為全球火龍果第一大生產(chǎn)國[2]。海南屬典型的熱帶海洋性季風(fēng)氣候,具備周年生產(chǎn)火龍果的天然優(yōu)勢,是火龍果生產(chǎn)的最佳種植區(qū)。當(dāng)前海南火龍果種植面積超過104"hm2,年產(chǎn)量達(dá)60萬t,是國內(nèi)火龍果的主要生產(chǎn)地之一[3]。
植物根際指根系周圍并受根系生長影響的土壤微環(huán)境,存在大量的微生物類群,并與植物建立互惠共生的關(guān)系[4]。一方面根系沉積物和分泌物影響根際微生物群落的組成,另一方面根際微生物的生命活動也影響植物的生長和健康[5]。根際微生物與宿主植物的相互影響因素已有廣泛研究,但根際微生物對氣候季節(jié)變化的響應(yīng)機(jī)制卻報道甚少。在自然生態(tài)系統(tǒng)中,植物根際微生物群落的結(jié)構(gòu)和功能經(jīng)常受季節(jié)變化的影響,這種影響主要通過土壤溫度、濕度和養(yǎng)分等環(huán)境因子的變化來實現(xiàn),進(jìn)而影響微生物的生命活動和代謝過程[6]。在不同季節(jié)間,根際微生物的多樣性和豐度存在顯著差異,冬季由于溫度較低,微生物的代謝活動減緩,相對豐度降低;而夏季由于溫度升高和降水增加,微生物的代謝活動增強(qiáng),微生物多樣性有所提高,尤其是那些與水分、溫度密切相關(guān)的微生物類群[7]。季節(jié)變化也會導(dǎo)致根際微生物群落結(jié)構(gòu)的變化,一些對特定環(huán)境條件敏感的微生物類群可能在某些季節(jié)中占據(jù)優(yōu)勢,而其他類群則可能減少,這與不同季節(jié)土壤環(huán)境因子的變化有關(guān)[8]。根際微生物的功能也隨季節(jié)變化而變化,冬季可能更有利于發(fā)酵過程的發(fā)生,而夏季則可能更有利于固氮過程,此外,根際微生物參與的生化過程,如化能異養(yǎng)、硝化和氨氧化作用,在不同季節(jié)間可能存在差異[9]。在農(nóng)業(yè)生態(tài)系統(tǒng)中,作物生產(chǎn)周期內(nèi)的根際微生物的群落結(jié)構(gòu)和組成以及功能除受季節(jié)變化的影響外,還受生產(chǎn)管理措施,如施肥、施藥、灌溉和除草等多種綜合因素的影響[10]。因此,了解作物生產(chǎn)周期內(nèi)不同時期的根際微生物群落結(jié)構(gòu)和功能的動態(tài)變化規(guī)律,將為不同生產(chǎn)時期管理措施的設(shè)計提供一定的參考依據(jù)。
火龍果的生長和發(fā)育與根際微生物息息相關(guān),火龍果根際微生物的群落結(jié)構(gòu)和組成受火龍果栽培品種的影響[11]。但火龍果根際微生物群落在生產(chǎn)周期內(nèi)的季節(jié)性動態(tài)變化卻很少報道。為此,本研究采用高通量測序技術(shù)和生物信息學(xué)探討海南紅心火龍果根際微生物群落在周年內(nèi)的季節(jié)變化規(guī)律,為火龍果栽培管理措施的設(shè)計提供理論依據(jù)。
1.1""材料
供試火龍果品種為大紅,采樣地點為海南省昌江黎族自治縣海南尚嶺農(nóng)業(yè)科技有限公司火龍果種植基地(108°52′8.2416″E,"19°23′18.762″N),屬于熱帶季風(fēng)氣候,日照充足。采樣地為生長1年以上的火龍果栽培大田,按照常規(guī)方式進(jìn)行田間生產(chǎn)管理,每年的9—10月施用有機(jī)肥(2"t/"666.67"m2),并在其催花期增施高磷肥(每666.67"m2施加5"kg高磷水溶肥和50"kg有機(jī)水溶肥,均分2次灌根),幼果期增施高氮加鉀肥(每666.67"m2施加6"kg高氮水溶肥和70"kg有機(jī)水溶肥,均分2次灌根),中果后期增施高鉀肥(每666.67"m2施加5"kg硫酸鉀)。分別于2022年春季、夏季、秋季、冬季以五點取樣法隨機(jī)采集土壤樣本(表1),均選取健康火龍果植株的根際土壤,采集深度為15~30"cm,每次取樣3個重復(fù),于–20"℃儲存。
1.2""方法
1.2.1""土壤理化指標(biāo)測定""參照常規(guī)測定方法[12-13]共測定10個土壤理化性質(zhì):土壤pH、有機(jī)質(zhì)、全氮、全磷、堿解氮、有效磷、速效鉀、有效硫、交換性鈣、交換性鎂。
1.2.2""根際微生物測序鑒定""采用E.Z.N.A.?"Soil
DNA"Kit"(Omega"Bio-tek)"DNA抽提試劑盒,抽提土壤樣本DNA。采用NEXTflexTM"Rapid"DNA-"Seq"Kit"(Bioo"Scientific)構(gòu)建DNA測序庫。使用引物338"F和806"R擴(kuò)增細(xì)菌16S"rRNA基因,利用引物ITS1"F和ITS2"R擴(kuò)增真菌ITS基因,并通過MiSeq"PE300測序平臺獲得原始數(shù)據(jù)。
1.3""數(shù)據(jù)處理
通過對原始數(shù)據(jù)進(jìn)行質(zhì)控等操作,獲得有效序列以供測序分析,使用UPARSE軟件將原始數(shù)據(jù)拼接并聚類,以大于97%的有效序列劃分為一個操作性分類單元(OTU),并進(jìn)行后續(xù)統(tǒng)計分析。使用WPS"Excel軟件對多樣性數(shù)據(jù)進(jìn)行預(yù)處理,并用SPSS"26軟件進(jìn)行顯著性差異分析。使用Kruskal-Wallis秩和檢驗檢測組間多樣性差異。使用R語言(3.3.1)繪制維恩圖、物種群落組成Bar圖、RDA分析圖以及相關(guān)性Heatmap圖。分別使用FAPROTAX(1.2.1)和FUNGuild"1.0軟件對細(xì)菌和真菌群落進(jìn)行功能預(yù)測。
2.1""不同季節(jié)火龍果根際土壤理化特征
火龍果的生長發(fā)育與其根際土壤理化性質(zhì)密切相關(guān),不同季節(jié)火龍果根際土壤的各項理化指標(biāo)見表2。不同季節(jié)土壤pH變化明顯,夏、秋季高于春、冬季;有機(jī)質(zhì)、全氮、速效磷含量同樣在夏、秋季更高;有效磷、全磷、交換性鈣和交換性鎂含量在夏季顯著高于其他季節(jié);秋季的堿解氮含量明顯較低。
2.2""不同季節(jié)火龍果根際微生物多樣性分析
2.2.1""α多樣性分析""不同季節(jié)火龍果根際微生物的α多樣性指數(shù)見表3。Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)反映微生物群落的豐富度,火龍果根際細(xì)菌和真菌的Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)均在秋季最高,春、夏、冬季3組樣品無顯著性差異。Shannon指數(shù)
和Simpson指數(shù)反映微生物群落的多樣性,秋季火龍果根際細(xì)菌和真菌的Shannon指數(shù)以及真菌的Simpson指數(shù)均高于其他季節(jié),細(xì)菌的Simpson指數(shù)無顯著差異。Coverage指數(shù)反映群落測序覆蓋度,所有樣品的Coverage值均大于98%,說明所有序列基本被檢測出,數(shù)據(jù)可靠。
2.2.2""β多樣性分析""不同季節(jié)火龍果根際微生物的β多樣性如圖1所示,對不同季節(jié)根際微生物進(jìn)行PCoA分析,結(jié)果表明,根際細(xì)菌的夏季和秋季樣品距離相近,而與冬季和春季的樣品距離較遠(yuǎn)且在不同象限,說明在夏、秋季細(xì)菌群落組成相似,而與春、冬季的細(xì)菌群落存在一定差異(圖1A)。不同季節(jié)樣品內(nèi)真菌PCoA分析表明,所有樣品相距較近,真菌群落無太大差異(圖1B)。
2.3""不同季節(jié)火龍果根際微生物群落結(jié)構(gòu)分析
2.3.1nbsp;"微生物群落Venn分析""根據(jù)根際樣品的所有OTUs,對不同季節(jié)火龍果根際微生物群落進(jìn)行Venn分析(圖2)。4個季節(jié)樣品中共有的細(xì)菌OTUs為2469個,春、夏、秋、冬各季所獨有的OTUs分別為198、269、401和191個;共有
的真菌OTUs數(shù)為346個,春、夏、秋、冬各季所獨有的OTUs分別為138、250、274和159個。其中,秋季火龍果根際細(xì)菌和真菌獨有的OTUs數(shù)量均最多,表明秋季具有豐富的微生物群落組成。
2.3.2""細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)分析""從4個季節(jié)12個根際樣品中共獲得6132個細(xì)菌OTUs,分別隸屬于43門、135綱、319目、502科和963屬。細(xì)菌群落在門水平主要有厚壁菌門(Firmicutes)、放線菌門(Actinobacteria)、變形菌門(Proteobacteria)、綠灣菌門(Chloroflexi)、酸桿菌門(Acidobacteria)、芽單胞菌門(Gemmatimonadota)、擬桿菌門(Bacteroidota)、黏球菌門(Myxococcota)、Patescibacteria、WPS-2等(圖3A)。不同季節(jié)門水平的群落結(jié)構(gòu)總體上差異不大,主要以厚壁菌門、放線菌門、變形菌門為主,其相對豐度穩(wěn)居前三,均為優(yōu)勢門類。在屬水平主要有芽孢桿菌屬(Bacillus)、蓋亞女神菌目未定義屬(norank_f__norank_"o__Gaiellales)、鞘氨醇單胞菌屬(Sphingomonas)、嗜鄰聚桿菌目未定義屬(norank_f__norank_o__"Vicinamibacterales)、馬賽菌屬(Massilia)、鏈霉菌屬(Streptomyces)、酸桿菌目未定義屬(norank_f__norank_o__Aci dobacteriales)、北里孢菌屬(Kitasatospora)、黃色桿菌科未定義屬(norank_f__Xanthobacter aceae)等(圖3B)。不同季節(jié)屬水平的細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)組成存在一定差異,特別是芽孢桿菌屬的相對豐度在春、冬季明顯高于夏、秋季,但總體而言,不同季節(jié)所有細(xì)菌群落中芽孢桿菌屬的相對豐度均最大,在火龍果根際內(nèi)占據(jù)核心地位,為優(yōu)勢屬類。在各季節(jié)中蓋亞女神菌目未定義屬的相對豐度以夏季最高,馬賽菌屬的相對豐度在春季時顯著增高。此外,還存在部分未知細(xì)菌屬,具有著較高的相對豐度,值得進(jìn)一步發(fā)掘。
2.3.3""真菌群落結(jié)構(gòu)分析""從4個季節(jié)12個根際樣品中總共獲得真菌1850個OTUs,分別隸屬于15門、42綱、103目、214科和423屬。真菌群落結(jié)構(gòu)組成如圖4所示,在門水平下主要為子囊菌門(Ascomycota)、擔(dān)子菌門(Basidiomycota)、真菌界未定義門(unclassified_k__Fungi)、壺菌門(Chytridiomycota)、羅茲菌門(Rozellomycota)、被孢菌門(Mortierellomycota)等。4個季節(jié)中,子囊菌門的相對豐度在火龍果根際內(nèi)占據(jù)絕對數(shù)量優(yōu)勢,夏季時雖有所降低,但仍處于核心地位,為優(yōu)勢門類;擔(dān)子菌門在夏季的相對豐度有明顯上升趨勢(圖4A)。在屬水平主要有毛殼菌屬(Chaetomium)、毛殼菌科未定義屬(unclassified_"f__Chaetomiaceae)、曲霉屬(Aspergillus)、梭孢殼屬(Thielavia)、青霉屬(Penicillium)、小裸囊殼菌屬(Gymnascella)、小囊菌屬(Microascus)、糞殼菌科未定義屬(unclassified_f__Sordariaceae)、unclassified_k__Fungi、Dichotomopilus、小鬼傘屬(Coprinellus)、瓶毛殼屬(Lophotrichus)等。屬水平下火龍果根際真菌群落組成結(jié)構(gòu)差異較大,說明季節(jié)變化對真菌群落的影響程度較大,尤其是毛殼菌屬在春季的相對豐度顯著高于其他季節(jié),占據(jù)核心地位,而在其他季節(jié)相對豐度明顯降低;毛殼菌科未定義屬在冬季時的相對豐度明顯增加(圖4B)。
2.4""不同季節(jié)火龍果根際微生物物種差異分析
不同季節(jié)火龍果根際微生物群落的物種差異如圖5所示。4個季節(jié)中,細(xì)菌共產(chǎn)生15個顯著差異物種,其中主要包括:黃色桿菌科未定義的屬(norank_f__Xanthobacteraceae)、KD4-96綱未定義屬(norank_f__norank_o__norank_c__KD4-"96)、Candidatus_Solibacter、JG30-KF-CM66綱未定義屬(norank_f__norank_o__norank_c__JG30-"KF-CM66)、RB41等屬類成員,大部分存在顯著差異的物種屬于未分類的細(xì)菌。火龍果根際土壤內(nèi)相對豐度占比大的物種在不同季節(jié)幾乎無顯著差異,在根際內(nèi)穩(wěn)定存在。真菌共產(chǎn)生3個顯著差異物種,其中,梨孢假殼屬(Apiospora)和短梗蠕孢屬(Trichocladium)在夏、秋季的群落豐度顯著高于春、冬季,而酵母菌目未定義科(un classified_o__Saccharomycetales)只在冬季存在。
2.5""不同季節(jié)土壤理化因子與微生物相關(guān)性
土壤微生物群落的冗余分析(RDA)如圖6
所示。細(xì)菌群落RDA的第1軸(RDA1)的特征值為72.41%,第2軸(RDA2)的特征值為12.18%,二者共解釋了土壤細(xì)菌群落總變異的84.59%。土壤pH、有機(jī)質(zhì)、堿解氮、有效磷、全氮、全磷、交換性鈣以及交換性鎂是影響細(xì)菌群落結(jié)構(gòu)的8個顯著因素(Plt;0.05)。對于土壤真菌群落,RDA1的特征值為27.91%,RDA2的特征值為14.09%,二者共解釋了約42.00%的真菌群落變異。土壤中的有機(jī)質(zhì)、堿解氮、有效磷、交換性鈣以及交換性鎂是影響真菌群落結(jié)構(gòu)的5個主要因素(Plt;0.05)。
土壤細(xì)菌和真菌群落的門水平與土壤性質(zhì)之間的相關(guān)性熱圖為冗余分析的結(jié)果提供了進(jìn)一步的證據(jù)。相關(guān)性分析表明,在細(xì)菌群落中,擬桿菌門(Bacteroidota)與SOM、AP、Mg呈顯著正相關(guān);粘菌門(Myxococcota)與PH、SOM、TN、AP、Mg呈顯著正相關(guān);芽單胞菌門(Gemma timonadota)與SOM、TN、AP呈顯著正相關(guān);放線菌門(Actinobacteriota)與TN、AP、Mg呈顯著正相關(guān);厚壁菌門(Firmicutes)與AN呈顯著正相關(guān),與AP、Mg呈顯著負(fù)相關(guān);WPS-2與SOM、TN呈顯著負(fù)相關(guān);酸桿菌門(Acido bacteriota)和綠灣菌門(Chlorolexi)均與AN呈顯著負(fù)相關(guān)(圖7A)。對于真菌群落,被孢菌門(Mortierellomycota)與土壤pH、有機(jī)質(zhì)、全氮、全磷、有效磷、交換性鈣以及交換性鎂都呈顯著正相關(guān);Calcarisporiellomycota與AN呈顯著負(fù)相關(guān)(圖7B)。
2.6""不同季節(jié)火龍果根際微生物功能預(yù)測分析
對不同季節(jié)火龍果根際細(xì)菌功能預(yù)測分類結(jié)果如圖8所示(僅展示前20個功能)。根際細(xì)菌功能主要有:化能異養(yǎng)(chemoheterotrophy)、需氧化能異養(yǎng)(aerobic"chemoheterotrophy)、尿素水解(ureolysis)、硝酸鹽還原(nitrate"reduction)、纖維素水解(cellulolysis)、固氮作用(nitrogen"fixation)、芳香族化合物降解(aromatic"compound"degradation)以及人畜致病性(animal"parasites"or"symbionts)。其中化能異養(yǎng)和需氧化能異養(yǎng)功能在不同季節(jié)的土壤生態(tài)功能中均占主導(dǎo)地位,這表明火龍果根際細(xì)菌具有良好的碳水化合物轉(zhuǎn)化能力;在春季,尿素水解能力、人畜致病性菌明顯高于其他季節(jié);在夏季,纖維素水解作用菌更為顯著,有助于纖維素分解為單糖,便于吸收利用;在冬季,硝酸鹽還原作用、固氮作用和芳香族化合物降解作用菌較強(qiáng)于其他季節(jié)。而不同季節(jié)火龍果根際真菌的預(yù)測功能存在一定差異,但是其根際真菌基本均以腐生菌為主,如植物腐生、動物腐生、木材腐生和糞腐生等,同時還存在某些未知的功能菌(圖9)。
土壤理化因子體現(xiàn)了土壤的肥力水平和植物生長條件,不同季節(jié)的火龍果根際土壤理化因子表現(xiàn)出一定的差異。本研究中,夏、秋季的土壤pH普遍高于春、冬季,這與孟彤彤等[14]的研究結(jié)果一致,可能與微生物代謝旺盛有關(guān),并且夏、秋季降雨量大,雨水沖刷帶走土壤中酸性物質(zhì)。土壤中的一系列養(yǎng)分(有機(jī)質(zhì)、全氮、速效鉀、速效磷、全磷、有效硫、交換鈣、交換鉀)在夏季時均處于較高水平,這可能是由于大量的植物殘骸和微生物的代謝提供了豐富的養(yǎng)分[15]。土壤中堿解氮含量在夏、秋季偏低,這與趙滿興等[16]"的研究結(jié)果一致,由于植物在夏、秋季時生長旺盛并對氮吸收量大,堿解氮的消耗量急劇增加,導(dǎo)致其含量偏低。
根際微生物是植物土壤根際生態(tài)系統(tǒng)中極其重要的組成部分[17]。根際土壤中富含豐富的微生物,微生物群落的數(shù)量和種類與根際土壤的健康程度密切相關(guān),維持土壤內(nèi)部環(huán)境的動態(tài)平衡[18-19]。
季節(jié)是影響根際微生物類群豐度的重要因素[20]。與其他季節(jié)相比,秋季火龍果根際細(xì)菌的Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)最高,具有最高的相對豐度,與譚雪等[21]在三峽草本植物根際細(xì)菌的研究結(jié)論一致;火龍果根際真菌的Ace指數(shù)和Chao1指數(shù)同樣為秋季最高,與黃雨軒等[22]在江西油茶根際真菌的研究結(jié)論相符。這可能是由于秋季的氣候條件更適合某些微生物的生長和繁殖,導(dǎo)致微生物豐富度增加。
在本研究中,四季的火龍果根際細(xì)菌主要由厚壁菌門、放線菌門、變形菌門組成,形成了穩(wěn)定的根際細(xì)菌群落結(jié)構(gòu),這與陳第等[23]的研究結(jié)果一致。已有研究認(rèn)為,這3種門類微生物同樣廣泛分布于植物根際土壤中,是最常見的土壤微生物,在植物的生命活動中起著舉足輕重的作用[24]。在屬水平,火龍果根際細(xì)菌群落受季節(jié)更替的影響,不同季節(jié)的結(jié)構(gòu)組成存在差異。這種季節(jié)性差異,可能是因為不同細(xì)菌對生存環(huán)境具有不同的適應(yīng)性,同時也受溫度、濕度等的影響,導(dǎo)致不同季節(jié)可能出現(xiàn)不同的優(yōu)勢菌屬,從而改變了根際群落結(jié)構(gòu)[25]。本研究中,芽孢桿菌屬在每個季節(jié)的相對豐度均占最大比例,說明其在火龍果根際細(xì)菌群落中占據(jù)核心地位并發(fā)揮關(guān)鍵作用。芽孢桿菌屬成員作為有益微生物,對火龍果致病菌具有拮抗作用,保護(hù)植株根際健康[26]。另外,還存在許多未分類鑒定的細(xì)菌,這些細(xì)菌很有可能是火龍果根際微生物中的關(guān)鍵菌群,表現(xiàn)出某些未知的功能。本研究中,子囊菌門是火龍果根際土壤中絕對的優(yōu)勢真菌門類,不同季節(jié)中其相對豐度占比均遠(yuǎn)高于其他門類真菌。子囊菌門真菌通常具有很強(qiáng)的適應(yīng)性,能夠在不同的環(huán)境條件下生存和繁衍,這可能是它們在火龍果根際土壤中成為優(yōu)勢門類的原因之一。在屬水平,毛殼菌屬作為優(yōu)勢菌屬,春季的相對豐度占比遠(yuǎn)高于其他季節(jié),可能與環(huán)境相關(guān)。有研究發(fā)現(xiàn),毛殼菌屬具有抗菌和促生能力,在植物的整個生長階段起到關(guān)鍵作用[27]。因此,推測毛殼菌屬在維持火龍果根際健康、促進(jìn)植株生長中扮演著至關(guān)重要的角色。此外,本研究還發(fā)現(xiàn),在不同季節(jié)中火龍果根際微生物均具有共同的OTUs,也存在獨有的OTUs,表明各季節(jié)的火龍果根際土壤不僅存在普遍共有的根際微生物群落,也存在各季節(jié)獨有的微生物種類,共有的微生物很有可能是火龍果根際生態(tài)系統(tǒng)中的核心微生物群,而獨有的微生物種類可能是各季節(jié)的標(biāo)志性微生物。
植物根際微生物是根際功能的關(guān)鍵驅(qū)動因素[28]。本研究發(fā)現(xiàn)火龍果根際細(xì)菌的功能預(yù)測主要表現(xiàn)為化能異養(yǎng)、需氧化能異養(yǎng)、尿素水解等功能,這與火龍果的生長有密切關(guān)系,有助于火龍果根際的能量轉(zhuǎn)化,從而汲取更多難以吸收的養(yǎng)分。火龍果根際真菌功能預(yù)測主要為腐生微生物組成和某些未知功能,說明在火龍果根際存在大量可以利用動植物殘骸的腐生真菌,有助于促進(jìn)火龍果根際土壤物質(zhì)和能量的生態(tài)循環(huán)。
利用高通量測序技術(shù)探討了海南紅心火龍果根際微生物群落生產(chǎn)周期內(nèi)的季節(jié)性特征和變化規(guī)律。結(jié)果顯示,火龍果根際土壤理化因子季節(jié)變化明顯,反映了土壤理化因子與根際微生物群落的密切聯(lián)系。不同季節(jié)火龍果根際微生物群落均有較高的豐富度和多樣性,其中,秋季明顯高于其他季節(jié);群落結(jié)構(gòu)組成也隨季節(jié)波動,優(yōu)勢菌群的比例有一定變化,但均在火龍果根際占據(jù)核心地位。這些季節(jié)性變化反映了根際微生物的相關(guān)功能和土壤肥力,進(jìn)而影響火龍果的生長和發(fā)育。研究結(jié)果可為火龍果栽培管理措施的設(shè)計提供科學(xué)依據(jù)。
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