摘""要:木薯(Manihot"esclenta"Crantz)具有抗旱、耐貧瘠、適應性強等優(yōu)良的種植特點,是全世界10億多人口的主要糧食作物。CMLs(calmodulin-like"proteins)是一種植物類鈣調(diào)蛋白,是存在于細胞內(nèi)的鈣感受器,與其他鈣調(diào)素結合蛋白相互作用調(diào)控細胞生理過程,參與植物逆境脅迫響應。木薯MeCML42基因受干旱脅迫誘導,為了研究該基因參與的干旱脅迫響應通路,本研究利用酵母雙雜交篩選MeCML42的互作蛋白。首先利用同源重組技術構建pGBKT7-MeCML42誘餌載體,通過自激活檢測證明MeCML42蛋白無自激活活性。毒性檢測實驗證明,MeCML42蛋白對酵母菌沒有毒性,不影響酵母正常生長。通過酵母雙雜交進行cDNA文庫篩選,獲得7個候選互作蛋白。通過酵母雙雜回轉(zhuǎn)實驗驗證了MeCML42與硫氧還蛋白MeCDSP32存在互作關系。甘露醇模擬干旱脅迫發(fā)現(xiàn),MeCML42與MeCDSP32均受干旱誘導表達,且在脅迫48"h的表達量最高,此結果說明MeCML42蛋白與MeCDSP32蛋白協(xié)同參與了木薯對干旱脅迫的響應。本研究結果為MeCML42參與木薯響應干旱脅迫通路提供新的依據(jù)。
關鍵詞:木薯;MeCML42;酵母雙雜交;MeCDSP32中圖分類號:S533""""""文獻標志碼:A
Screening"of"MeCML42"Interacting"Proteins"in"Cassava
ZHANG"Huimin1,2,3,"GE"Yujian1,2,3,"HOU"Jingyi1,2,"LIANG"Baojuan1,2,3,"REN"Zhixin1,2,3,"GUO"Jianchun2,3,"YAO"Yuan2,3,"WANG"Yajie2,3*,"GENG"Mengting1*
1."College"of"Tropical"Agriculture"and"Forestry,"Hainan"University,"Haikou,"Hainan"570228,"China;"2."Institute"of"Tropical"Bioscience"and"Biotechnology,"Chinese"Academy"of"Tropical"Agricultural"Sciences"/"Key"Laboratory"of"Biology"and"Genetic"Resources"of"Tropical"Crops,"Ministry"of"Agriculture"and"Rural"Affairs"/"Hainan"Institute"for"Tropical"Agricultural"Resources"/"Key"Laboratory"for"Biology"and"Genetic"Resources"of"Tropical"Crops"of"Hainan"Province,"Haikou,"Hainan"571101,"China;"3."Sanya"Research"Institute,"Chinese"Academy"of"Tropical"Agricultural"Sciences,"Sanya,"Hainan"572000,"China
Abstract:"Cassava"(Manihot"esclenta"Crantz)"has"excellent"planting"characteristics"such"as"drought"resistance,"barren"tolerance"and"strong"adaptability,"and"is"the"main"food"crop"for"more"than"1"billion"people"in"the"world."CMLs"(calmodulin-like"proteins)"are"plant"calmodulin-like"receptors"in"cells."They"interact"with"other"calmodulin-binding"proteins"to"regulate"cellular"physiological"processes"and"participate"in"plant"stress"response."MeCML42"gene"in"cassava"is"induced"by"drought"stress."In"order"to"study"the"drought"stress"response"pathway"involved"in"this"gene,"yeast"two-hybridization"was"used"to"screen"the"interacting"proteins"of"MeCML42."Firstly,"the"decoy"vector"pGBKT7-"MeCML42"was"constructed"by"homologous"recombination"technique,"and"the"self-activation"experiment"showed"that"MeCML42"protein"had"no"self-activation"activity."The"toxicity"test"showed"that"MeCML42"protein"was"not"toxic"to"yeast"and"did"not"affect"the"normal"growth"of"yeast."The"cDNA"library"was"screened"by"yeast"two-hybridization"and"7"candidate"interacting"proteins"were"obtained."The"interaction"between"MeCML42"and"thioredoxin"MeCDSP32"was"verified"by"yeast"double"heterogyclic"experiment."Mannitol"simulation"of"drought"stress"showed"that"the"expressions"of"MeCML42"and"MeCDSP32"were"both"induced"by"drought,"and"the"expression"levels"were"the"highest"at"48"h"under"stress."These"results"indicated"that"MeCML42"and"MeCDSP32"were"synergistically"involved"in"cassava's"response"to"drought"stress."The"results"of"this"study"provide"a"new"basis"for"MeCML42"to"participate"in"cassava"response"to"drought"stress.
Keywords:"cassava;"MeCML42;"yeast"two-hybrid;"MeCDSP32
DOI:"10.3969/j.issn.1000-2561.2024.11.002
木薯(Manihot"esculenta"Crantz)為大戟科木本植物,是重要的根莖類熱帶作物[1]。木薯塊根具有豐富的淀粉,被認為是生物能源、變性淀粉以及動物飼料的理想原料作物[2-3]。木薯具有一定的干旱耐受性,但苗期的生長嚴重受干旱制約,種植后3~4個月是灌溉木薯的關鍵時期[4]。在這個時期的水分脅迫會導致植物死亡或者儲藏根產(chǎn)量減少高達60%[5]。在干旱條件下,木薯通過快速閉合氣孔和葉片脫落以限制水分的進一步丟失,這是保護植物免受脫水的一種機制[6]。盡管木薯對干旱具有一定的耐受性,但這種耐受性是以犧牲塊根產(chǎn)量為代價的。一些參與木薯的干旱脅迫響應的基因已經(jīng)被挖掘。TURYAGYENDA等[7]通過全基因組關聯(lián)研究(GWAS)挖掘了23個與干旱耐受性相關的顯著單核苷酸多態(tài)性(SNPs),這些SNPs分布在木薯的不同染色體上,與干旱條件下的干物質(zhì)含量、根產(chǎn)量和淀粉產(chǎn)量等性狀相關。MeALDH和MeMSD通過清除ROS來保護細胞免受氧化應激的損害,而MeZFP和MeRD28則可能參與調(diào)節(jié)滲透物質(zhì),幫助木薯在干旱條件下維持細胞的水分和穩(wěn)定性,這些基因均在抗旱木薯品種中上調(diào)表達。
鈣離子作為重要的次信使,在植物的生長發(fā)育和逆境響應中發(fā)揮著重要作用[8]。CMLs(calmodulin-like"proteins)是一種植物類鈣調(diào)蛋白,起源于真核生物,參與植物的生長發(fā)育并且發(fā)揮重要作用[9]。植物類鈣調(diào)蛋白是存在于細胞內(nèi)的鈣感受器,與其他鈣調(diào)素結合蛋白相互作用調(diào)控細胞生理過程[10]。擬南芥的類鈣調(diào)蛋白CML37正調(diào)控ABA介導干旱脅迫[11]。水稻OsERF48轉(zhuǎn)錄因子通過調(diào)控OsCML16基因表達,增強根部生長和干旱耐受性[12]。過表達甜瓜的CmCML13基因,提高擬南芥的抗旱性[13]。研究表明ABA、MeJA、IAA正調(diào)控MeCML42啟動子活性,而SA對MeCML42啟動子活性則為負調(diào)控[14]。本研究通過酵母雙雜交篩選MeCML42的候選互作蛋白,點對點驗證實驗證明MeCML42與MeCDSP32存在互作關系,并利用qPCR分析MeCML42和MeCDSP32在干旱脅迫下的表達特征。本研究結果有助于進一步解析MeCML42在木薯響應干旱脅迫過程的作用。
1.1""材料
植物材料為華南8號木薯(SC8),在24"℃培養(yǎng)室中生長。主要試劑:質(zhì)粒提取試劑盒(Plasmid"Mini"Kit)和純化試劑盒(Cycle"Pure"Kit)購自OMEGA公司;酵母雙雜交載體pGBKT7、pGADT7、pGBKT7-lam、pGBKT7-p53、pGADT7-T均由本實驗室提供;AH109酵母感受態(tài)和大腸桿菌感受態(tài)DH5α均購自上海唯地生物技術有限公司;X-α-gal酵母顯色底物購自北京索萊寶科技有限公司;限制性核酸內(nèi)切酶(EcoRⅠ、BamHⅠ)購自賽默飛世爾科技(中國)有限公司;PrimeSTAR"HS(Premix)DNA"PolyMerase酶購自TaKaRa公司、酵母缺陷平板購自Clontech公司;2×Rapid"Taq"Master"Mix酶購自南京諾唯贊生物科技股份有限公司;RNA提取試劑盒(M5"HiPer"Plant"RNeasy"Complex"Mini"Kit“繁可簡”)購自北京聚合美生物科技有限公司;逆轉(zhuǎn)錄試劑盒(MonScript?"RTIII"All-in-One"Mix"with"dsDNase)和qPCR試劑盒(ChemoHS"qPCR"Mix)購自莫納(武漢)生物科技有限公司。
1.2""方法
1.2.1""誘餌載體pGBKT7-MeCML42的構建""按照聚合美“繁可簡”RNA提取試劑盒說明書提取SC8木薯全株RNA,1%瓊脂糖凝膠電泳和分光光度計檢測RNA質(zhì)量,逆轉(zhuǎn)錄成cDNA。采用PrimeSTAR高保真酶,以攜帶重組接頭的引物擴增MeCML42的編碼區(qū)(引物序列見表1)。擴增獲得并回收與預期片段大小一致的目的基因,然后通過聚合美試劑盒說明書將MeCML42回收片段與線性化載體pGBKT7(EcoR"I和BamH"I)連接。將同源重組產(chǎn)物轉(zhuǎn)入DH5α大腸桿菌感受態(tài)中,篩選獲得單菌落。利用2×Rapid"Taq"Master"Mix進行菌液PCR反應,通過凝膠電泳鑒定篩選陽性菌落,并進行Sanger測序,獲得測序正確的陽性克隆。
1.2.2""MeCML42蛋白的毒性檢測和自激活""(1)毒性檢測。將pGBKT7空載載體和pGBKT7-"MeCML42誘餌載體分別轉(zhuǎn)入AH109酵母感受態(tài)進行毒性檢測。將轉(zhuǎn)化后酵母菌液涂板在SD/-Trp培養(yǎng)基上,倒置在28"℃的酵母培養(yǎng)箱中生長約3"d,得到酵母單菌落。挑取單菌落,使用2×Rapid"Taq"Master"Mix酶體系進行菌斑PCR驗證,驗證引物為5-BD-F、3-BD-R。選取陽性酵母菌株進行擴大培養(yǎng),將pGBKT7空載酵母菌液和pGBKT7-MeCML42酵母菌液分別接種至SD/-Trp液體培養(yǎng)基中,搖菌至OD600為0.6。將菌液稀釋為1∶1、1∶10、1∶100、1∶1000、1∶10000等不同濃度,涂布于一缺(SD/-Trp)培養(yǎng)基上,在28"℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~3"d,觀察菌落的生長狀況。
(2)自激活檢測。將pGBKT7-MeCML42誘餌載體與pGADT7空載載體共轉(zhuǎn)至AH109酵母感受態(tài),涂布于二缺(SD/-Trp-Leu)培養(yǎng)基上,稀釋從平板上挑取的陽性菌落,接種于二缺平板(SD/-Trp-Leu)、四缺平板(SD/-Trp-Leu-His-Ade)和SD/-Trp-Leu-His-Ade+X-α-gal平板上。分別以pGBKT7-p53+pGADT7-T和pGBKT7-lam+pGA DT7-T共轉(zhuǎn)化酵母為陽性對照和陰性對照。在28"℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~3"d,觀察菌落的生長狀況。
1.2.3""MeCML42的酵母雙雜交文庫篩選""制備攜帶pGBKT7-MeCML42誘餌質(zhì)粒的AH109酵母感受態(tài)細胞。取本實驗室的SC8木薯品種cDNA文庫質(zhì)粒30"μg,加入至1.2"mL酵母感受態(tài)細胞中進行轉(zhuǎn)化。將轉(zhuǎn)化后的酵母菌液涂布于三缺平板(SD/-Trp-Leu-His)上,在28"℃培養(yǎng)箱中培養(yǎng)2~3"d,觀察酵母生長狀態(tài)。將三缺(SD/-Trp-Leu-"His)平板上生長的菌落(大于2"mm)挑到20"μL"0.9%"NaCl溶液中,混合均勻后點板至SD/-Trp-"Leu-His-Ade+X-α-gal平板上,平板倒置在28"℃培養(yǎng)箱培養(yǎng)3"d左右,觀察酵母的生長狀態(tài)。挑取藍色單菌落進行菌落PCR,將獲得的片段進行測序分析,獲得候選互作蛋白。
1.2.4""MeCML42的酵母雙雜交回轉(zhuǎn)驗證""根據(jù)候選互作蛋白測序信息,在木薯基因組數(shù)據(jù)庫搜索CDS區(qū),設計攜帶重組接頭的引物(表1),克隆候選互作蛋白基因。通過同源重組試劑盒說明書將候選互作蛋白回收片段與線性化載體pGADT7連接,轉(zhuǎn)化至DH5α大腸桿菌感受態(tài)中,轉(zhuǎn)化方法詳見說明書。挑取單菌落,利用2×"Rapid"Taq"Master"Mix進行菌液PCR反應,通過凝膠電泳鑒定獲得陽性克隆,Sanger測序獲得序列正確的載體并提取質(zhì)粒。將含有候選互作蛋白基因的pGADT7載體與pGBKT7-MeCML42質(zhì)粒共轉(zhuǎn)化AH109感受態(tài)細胞獲得轉(zhuǎn)基因酵母。將陽性酵母菌液點樣于SD/-Trp-Leu、SD/-Trp-Leu-"His-Ade和SD/-Trp-Leu-His-Ade+X-α-gal培養(yǎng)基平板上,將平板倒置在28"℃培養(yǎng)箱培養(yǎng),觀察酵母其生長狀態(tài),驗證候選互作蛋白是否與MeCML42存在互作關系。
1.2.5""MeCML42與互作基因MeCDSP32在干旱脅迫下的表達分析""選取同一生長時期同一表型的SC8木薯植株,使用300"mmol/L甘露醇溶液澆灌至木薯根部,處理0、12、24、48"h后取樣。參照聚合美RNA提取試劑盒說明書提取植株全株總RNA,使用莫納逆轉(zhuǎn)錄試劑盒將總RNA反轉(zhuǎn)錄成cDNA。根據(jù)MeCML42和MeCDSP32基因CDS序列,使用NCBI網(wǎng)站設計qPCR引物(表1),分析SC8木薯的MeCML42和MeCDSP32基因在干旱脅迫下的表達量變化。
2.1""pGBKT7-MeCML42誘餌載體構建
提取質(zhì)量良好的SC8木薯總RNA,并逆轉(zhuǎn)錄為cDNA,使用攜帶重組接頭的特異性引物擴增MeCML42基因的編碼區(qū)。PCR產(chǎn)物經(jīng)電泳檢測顯示得到約400"bp的片段(圖1),條帶單一且明亮,符合片段預期大小(420"bp)。將回收的MeCML42基因片段與線性化pGBKT7載體連接涂板,挑取8個單菌落進行菌落PCR鑒定,將得到陽性菌落測序,獲得序列正確的pGBKT7-MeCML42誘餌載體。
2.2""pGBKT7-MeCML42誘餌載體的毒性和自激活檢測
將pGBKT7空載質(zhì)粒與pGBKT7-MeCML42誘餌質(zhì)粒分別轉(zhuǎn)化AH109酵母,梯度稀釋后接種于SD/-Trp平板,觀察菌斑生長狀態(tài)。結果顯示,pGBKT7空載與pGBKT7-MeCML42誘餌載體轉(zhuǎn)基因酵母生長狀態(tài)大致相同(圖2),說明pGBKT7-MeCML42誘餌載體對酵母細胞無毒性。
將pGBKT7-MeCML42誘餌質(zhì)粒與pGADT7共轉(zhuǎn)至AH109酵母,菌株可在SD/-Trp-Leu培養(yǎng)基上正常生長(圖3)。進一步觀察發(fā)現(xiàn)實驗組(pGBKT7-"MeCML42+pGADT7)和陰性對照(pGBKT7-lam+"pGADT7-T)在四缺培養(yǎng)基中均無生長,只有陽性對照(pGBKT7-p53"+"pGADT7-T)生長出酵母菌斑。結果表明,MeCML42蛋白無法獨自激活下游報告基因,即無自激活能力,可以進行酵母雙雜交實驗。
2.3""酵母雙雜交篩選MeCML42的候選互作蛋白
使用SC8木薯的cDNA文庫篩選MeCML42候選互作蛋白,最終在SD/-Trp-Leu-His-Ade+"X-α-gal平板上共生長出21個藍色菌落(圖4)。說明這21個藍色菌落攜帶的蛋白與MeCML42可能存在互作關系。經(jīng)菌落PCR獲得擴增產(chǎn)物后,進行Sanger測序分析,最終獲得了7個候選互作蛋白基因(表2)。
2.4""MeCML42候選互作蛋白的酵母雙雜交回轉(zhuǎn)驗證
克隆候選互作蛋白MeCDSP32、MeRBCSP、MeUPF0415、MeIF-3-4和MeNADP的編碼區(qū),分別連接至pGADT7載體,構建回轉(zhuǎn)驗證載體:pGADT7-MeCDSP32"(AD-CDSP32)、pGADT7-"MeRBCSP"(AD-RBCSP)、pGADT7-MeUPF0415"(AD-UPF0415)、pGADT7-MeIF-3-4"(AD-IF-3-4)、pGADT7-MeNADP"(AD-NDAP)。將pGBKT7-"MeCML42(BD-MeCML42)誘餌蛋白分別與AD-MeCDSP32、AD-MeRBCSP、AD-MeUPF0415、AD-MeIF-3-4、AD-MeNADP共轉(zhuǎn)至AH109感受態(tài)細胞中,涂布于二缺(SD/-Trp-Leu)培養(yǎng)基平板上,菌斑經(jīng)PCR鑒定后,將共轉(zhuǎn)化成功的酵母菌液接種于含有SD/-Trp-Leu、SD/-Trp-Leu-His-"Ade和SD/-Trp-Leu-His-Ade+X-"α-gal等缺陷培養(yǎng)基平板上。結果發(fā)現(xiàn),轉(zhuǎn)AD-"MeCDSP32載體的酵母在SD/-Trp-Leu、SD/-Trp-"Leu-His-Ade、SD/-Trp-Leu-His-Ade+X-α-gal平板上均長出菌斑,且在SD/-Trp-Leu-His-Ade+X-"α-gal培養(yǎng)基平板上的菌斑變藍(圖5),說明MeCDSP32與MeCML42蛋白存在互作關系。
2.5""MeCML42與MeCDSP32在干旱脅迫下表達分析
為了探究MeCML42與MeCDSP32在干旱脅迫下的表達水平,使用300"mmol/L甘露醇溶液處理SC8植株,使用qPCR技術分析MeCML42與MeCDSP32在干旱脅迫不同時間后的表達量變化。結果表明(圖6),MeCML42在干旱脅迫48"h時的表達量顯著高于0"h,提高了17.3倍。MeCDSP32隨著干旱脅迫處理時間越久,表達量越高,干旱脅迫48"h的表達量比0"h提高了12.75倍。MeCML42與MeCDSP32在干旱脅迫48"h的表達量均顯著上調(diào),說明MeCML42與MeCDSP32參與了對干旱脅迫的響應。
類鈣調(diào)蛋白CMLs(calmodulin-like"proteins)是一類類似于鈣調(diào)素(calmodulin,"CaM)的蛋白,二者之間具有高度同源性[15]。CMLs(calmodulin-"like"proteins)是存在于細胞內(nèi)的Ca2+感受器,胞內(nèi)Ca2+水平通量在介導應激反應通路中發(fā)揮關鍵作用[16]。鈣調(diào)素或類鈣調(diào)蛋白是含有不同數(shù)量的“EF-hand”基序的酸性小蛋白。這些蛋白質(zhì)通過其EF-hand結構域與Ca2+的高親和力結合來感知和解碼細胞鈣離子信號,從而誘導蛋白質(zhì)的構象變化并暴露其疏水表面[17]。CMLs與激酶、磷酸酶、轉(zhuǎn)錄因子以及其他信號蛋白發(fā)生相互作用,參與植物的生長發(fā)育、應答環(huán)境刺激等多種生理過程。當植物經(jīng)歷干旱脅迫時,細胞內(nèi)的鈣離子水平會發(fā)生變化,觸發(fā)信號傳導過程,激活鈣感受器,如鈣調(diào)蛋白和類鈣調(diào)蛋白(CMLs)[18]。木薯MeCML42的表達受到干旱脅迫誘導,但是MeCML42蛋白在木薯中參與的干旱脅迫信號通路尚未明確。
本研究通過酵母雙雜交篩選獲得了MeCML42的互作蛋白硫氧還蛋白MeCDSP32,該蛋白屬于葉綠體干旱脅迫誘導蛋白編碼基因(chloroplast"drought-induced"stress"protein"of"32"kD)。CDSP32由2個硫氧還蛋白模塊組成,這2個模塊在質(zhì)體防御氧化損傷方面起著關鍵作用[19]。植物類硫氧還蛋白通過改變蛋白質(zhì)的氧化還原狀態(tài),在植物生長發(fā)育、非生物脅迫響應過程中具有重要作用。過表達棉花的CDSP32基因可提高擬南芥的耐旱、耐鹽及抗氧化脅迫的能力。過表達煙草CDSP32基因可增強SOD、POD和CAT等抗氧化酶的功能,提高AsA-GSH循環(huán)和Trx-Prx途徑去除H2O2的能力,提高煙草對鎘脅迫的抗性[20]。在干旱條件下,馬鈴薯CDSP32的mRNA和蛋白質(zhì)含量顯著上升,這有助于保護葉綠體免受干旱引起的氧化損傷[21]。本研究分析了MeCML42和MeCDSP32在干旱脅迫下的表達量變化,發(fā)現(xiàn)在48"h時二者的表達量顯著上調(diào),相比0"h,分別上調(diào)了17.3倍和12.75倍。因此推測,MeCML42與MeCDSP32互作,共同參與了木薯對干旱脅迫的響應。后續(xù)將通過BiFC雙分子熒光互補實驗進一步驗證它們的相互作用,通過轉(zhuǎn)基因分析MeCML42和MeCDSP32的功能,明確在木薯響應干旱脅迫的功能。
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