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影響電穿孔法轉(zhuǎn)化效率的因素

2011-12-10 01:00張小娟綜述張榮光審校
醫(yī)學(xué)綜述 2011年5期
關(guān)鍵詞:埃希菌質(zhì)粒細(xì)菌

張小娟(綜述),張榮光(審校)

(1.河南科技大學(xué)醫(yī)學(xué)院病原生物學(xué)教研室,河南洛陽471003;2.鄭州大學(xué)河南省分子醫(yī)學(xué)重點學(xué)科開放實驗室,鄭州450001)

電穿孔轉(zhuǎn)化細(xì)胞的方法是分子生物學(xué)中常用的技術(shù),廣泛應(yīng)用于基因克隆、外源基因的表達(dá)、基因定位、基因圖譜的繪制等研究[1-3]。雖然基因轉(zhuǎn)移可以通過化學(xué)的方法實現(xiàn),但是操作復(fù)雜且效率低。經(jīng)典的氯化鈣轉(zhuǎn)化法轉(zhuǎn)化效率較低;病毒轉(zhuǎn)染的方法雖然效率很高,但是對健康的威脅不可忽視;電穿孔基因轉(zhuǎn)移法適用范圍廣,轉(zhuǎn)化效率高,殘余毒性小[4],是最有發(fā)展?jié)摿Φ囊环N轉(zhuǎn)化方法。然而,由于影響電穿孔方法的因素較為復(fù)雜,其中一些技術(shù)環(huán)節(jié)的機制并不十分清楚,轉(zhuǎn)化效果的穩(wěn)定性難以保證,這在一定程度上制約了該方法的推廣應(yīng)用。近年來,隨著國內(nèi)外對該方法應(yīng)用實踐的增加,人類對影響電穿孔法轉(zhuǎn)化效率的因素有了更深入的認(rèn)識?,F(xiàn)對影響電穿孔法轉(zhuǎn)化效率的因素進(jìn)行綜述。

1 感受態(tài)細(xì)胞

1.1 細(xì)菌濃度 李南等[5]在優(yōu)化大腸埃希菌TG1電轉(zhuǎn)化條件時,將細(xì)菌懸液按1∶10梯度稀釋,取等體積不同濃度的菌液進(jìn)行電穿孔。結(jié)果發(fā)現(xiàn),在一定規(guī)范內(nèi),細(xì)菌濃度越高,轉(zhuǎn)化效率就越高,兩者呈正相關(guān),菌濃度為1010個/mL時,轉(zhuǎn)化效率最高。韋曉明等[6]在探索大腸埃希菌XL1-Blue菌株電轉(zhuǎn)化條件時,分別用2.5×1013、2.5×1014、2.5×1015個/L三個感受態(tài)濃度進(jìn)行電轉(zhuǎn)化,結(jié)果表明菌濃度為2.5× 1015個/L時的轉(zhuǎn)化效率較菌濃度為2.5×1014個/L時高10倍,較2.5×1013個/L高16倍。

1.2 細(xì)菌生長周期 細(xì)菌培養(yǎng)到不同密度都能用于電轉(zhuǎn)化,但最好的轉(zhuǎn)化效率是在對數(shù)生長期。電轉(zhuǎn)化效率和細(xì)胞存活數(shù)均與轉(zhuǎn)化前的細(xì)胞所處生長階段有關(guān)。在對數(shù)生長期,每個細(xì)胞對電擊都非常敏感,死亡率較高。但在存活的細(xì)胞中,轉(zhuǎn)化子的比例較高(約80%)。

當(dāng)細(xì)胞進(jìn)入對數(shù)后期,細(xì)胞存活率上升,轉(zhuǎn)化效率也逐漸下降,因此電轉(zhuǎn)化的細(xì)菌以培養(yǎng)到對數(shù)中期較為合適[7,8]。在制備感受態(tài)時,常通過測定菌液光密度(optical density,OD)值方法判斷細(xì)菌生長階段。韋曉明等[6]發(fā)現(xiàn)在大腸埃希菌XL1-Blue處于對數(shù)生長早期、OD600為0.3~0.4時轉(zhuǎn)化效率達(dá)到最高,隨著細(xì)菌的老化,OD600值每增加0.1,轉(zhuǎn)化效率都會下降一個數(shù)量級以上。所以制備電轉(zhuǎn)化用感受態(tài)時,應(yīng)嚴(yán)格掌握菌液的OD值,以保持較高的轉(zhuǎn)化效率。

1.3 細(xì)胞培養(yǎng)溫度 韓峰等[9]采用大腸埃希菌DH5α菌株研究了細(xì)菌培養(yǎng)溫度對電轉(zhuǎn)化效率的影響。研究結(jié)果顯示,在18℃下培養(yǎng)的細(xì)菌,當(dāng)菌液OD600為0.5~1.0時,轉(zhuǎn)化效率都維持在高水平;而在37℃培養(yǎng)的細(xì)菌,僅當(dāng)OD600為0.6~0.7時轉(zhuǎn)化效率出現(xiàn)一個銳利的峰值,菌液OD值偏高或偏低都會使轉(zhuǎn)化效率顯著下降。

2 電轉(zhuǎn)化過程

2.1 電場強度 電場強度是影響電轉(zhuǎn)化效率的主要因素。在一定范圍內(nèi),隨著電場強度的增加,外源DNA越容易進(jìn)入細(xì)胞,但細(xì)胞的死亡率也會隨著電場強度的增加而增加。所以要得到最高的電轉(zhuǎn)化效率,一方面要提高電場強度到一個合適數(shù)值,另一方面又要盡量降低死亡率。戴建新等[10]研究了電場強度對電轉(zhuǎn)化效率的影響。結(jié)果表明在低電場強度(1~10 kV/cm)作用下,轉(zhuǎn)化效率<109CFU/μg DNA;而當(dāng)電場強度>10 kV/cm時,轉(zhuǎn)化效率顯著上升,并在12.5~15 kV/cm時,轉(zhuǎn)化效率達(dá)到峰值(約2× 109CFU/μg);當(dāng)電場強度繼續(xù)升高時,轉(zhuǎn)化效率則迅速下降。

2.2 脈沖時間 研究表明,電脈沖時間對電轉(zhuǎn)化效率有較大影響,時間太短或太長均會使轉(zhuǎn)化效率降低。目前,脈沖時程閾值現(xiàn)象還不能作出理論計算,但其合理的解釋為:一方面,因為膜電容的充電需要一定的時程,才能使膜電位達(dá)到穩(wěn)定值,這一時程正好是電穿孔導(dǎo)入小分子的閾值;另一方面,只有外電場持續(xù)提供能量,保持胞膜穿孔部位局部的無序狀態(tài),才能使孔道擴大至細(xì)胞骨架網(wǎng)孔的大小。如果脈沖時程過短,則孔道很快自發(fā)地復(fù)原為有序結(jié)構(gòu)。這可能是采用電穿孔方法導(dǎo)入大分子DNA時,脈沖時程存在閾值的原因。戴建新等[10]在探索大腸埃希菌DH5α電轉(zhuǎn)化影響因素時發(fā)現(xiàn),當(dāng)電場強度為15 kV/cm時,脈沖持續(xù)時間取4~5 ms,其轉(zhuǎn)化效率即達(dá)峰值;若脈沖持續(xù)時間延長,則轉(zhuǎn)化效率迅速下降。

2.3 電擊前后冰浴時間 在進(jìn)行電轉(zhuǎn)化前,通常不需要把DNA提前加到細(xì)胞懸液中。據(jù)報道,DNA在進(jìn)入細(xì)胞之前并不需要結(jié)合到細(xì)胞表面[7,8],而且在菌液中預(yù)先加入的DNA還有可能被感受態(tài)細(xì)胞分泌的核酸酶的降解。張洋等[11]采用大腸埃希菌DH10B研究了轉(zhuǎn)化前的冰浴時間對轉(zhuǎn)化效率的影響。結(jié)果發(fā)現(xiàn),冰浴時間0~30 min對轉(zhuǎn)化效率無顯著影響,即DNA分子與細(xì)胞表面的結(jié)合(或充分靠近)并不是必需的,也可能混合完全后的質(zhì)粒DNA和感受態(tài)細(xì)胞已經(jīng)完成了結(jié)合過程(或距離已經(jīng)充分接近)。韓峰等[9]也證實電擊前將感受態(tài)細(xì)胞在冰上靜置0~30 min對轉(zhuǎn)化效率影響不大,在最初的5 min內(nèi)轉(zhuǎn)化效率稍有提高,但隨后的25 min內(nèi)則呈下降趨勢。電擊后在加入培養(yǎng)基前的冰浴時間不同(0~30 min),對轉(zhuǎn)化效率影響顯著,在冰浴1 min內(nèi)轉(zhuǎn)化效率就呈現(xiàn)大幅度下降,10 min后幾乎降至最低點,只有不冰浴的20%。

2.4 脈沖信號持續(xù)時間 電脈沖信號音響后持續(xù)不同時間對轉(zhuǎn)化效率有較大影響。張建瓊等[12]的實驗結(jié)果表明,電脈沖音響后持續(xù)2 s較信號音響后即停和信號音響后持續(xù)3 s轉(zhuǎn)化效率明顯增加。

2.5 樣品鹽離子成分 如果樣品中鹽離子濃度過高時,導(dǎo)電能力增強,放電兩極之間形成低電阻通路,瞬間電流急劇增加,產(chǎn)生無效放電或旁路放電,不能使菌體胞膜產(chǎn)生孔洞,同時,瞬間強電流導(dǎo)致電擊體系溫度驟然升高,大量細(xì)菌死亡,引起轉(zhuǎn)化效率顯著下降,甚至引起電擊穿現(xiàn)象,造成實驗失敗。方勤等[13]研究發(fā)現(xiàn),采用乙醇沉淀法可有效去除連接產(chǎn)物中的鹽分,有利于提高轉(zhuǎn)化效率。然而,包其郁等[14]對1 μL各含0.01 ng或0.001 ng pUC18 DNA的1×連接反應(yīng)混合物進(jìn)行乙醇沉淀處理后,轉(zhuǎn)化效率反而降低至1/10~1/100,因此認(rèn)為乙醇沉淀法不能有效地提高轉(zhuǎn)化效率。在微量DNA狀態(tài)時,由于處理過程中造成DNA的丟失反而使轉(zhuǎn)化效率降低。此外,稀釋法、透析法也能有效降低樣品鹽離子濃度,但稀釋法不利于小體積轉(zhuǎn)化的要求;透析法回收率較低。因此,急需研究開發(fā)一種純化回收微量質(zhì)粒DNA的簡便而有效的方法。

2.6 抗生素濃度 李南等[5]在用質(zhì)粒pFab74X電轉(zhuǎn)化大腸埃希菌TG1時發(fā)現(xiàn),將選擇培養(yǎng)基中氨芐青霉素的濃度從100 mg/L降至20 mg/L,可使轉(zhuǎn)化效率上升約5倍。其可能原因是電穿孔后的細(xì)胞雖然經(jīng)過短時間的恢復(fù)培養(yǎng),但仍然比較脆弱,適當(dāng)降低選擇性培養(yǎng)基中抗生素濃度,有利于轉(zhuǎn)化菌的抗性基因的充分表達(dá),可以進(jìn)一步提高轉(zhuǎn)化效率。韋曉明等[6]在探索大腸埃希菌XL1-Blue電轉(zhuǎn)化條件時,分別用含氨芐青霉素100、50、20 mg/L的培養(yǎng)板篩選轉(zhuǎn)化菌,結(jié)果表明,氨芐青霉素濃度為100 mg/L時的轉(zhuǎn)化率是50 mg/L時的1/2,是20 mg/L時的1/3。

2.7 電擊溫度 電擊時產(chǎn)熱可直接影響感受態(tài)細(xì)胞的存活率,因此需要特別注意保持菌液的溫度。電轉(zhuǎn)化時樣品的開始溫度對轉(zhuǎn)化效率影響很大,如大腸埃希菌在0~4℃進(jìn)行電擊的轉(zhuǎn)化效率比在室溫下至少提高100倍[8]。

3 質(zhì)粒大小、用量及構(gòu)象

3.1 質(zhì)粒大小 質(zhì)粒的大小直接影響轉(zhuǎn)化效率。由于需要導(dǎo)入細(xì)菌的質(zhì)粒長度遠(yuǎn)大于電穿孔所導(dǎo)致的細(xì)胞空洞,因此質(zhì)粒只能沿長軸方向通過擴散導(dǎo)入細(xì)胞。短質(zhì)粒較之長質(zhì)粒轉(zhuǎn)化率高的原因為:電擊后,在細(xì)胞孔道重新閉合前的數(shù)秒內(nèi),短質(zhì)粒完全進(jìn)入細(xì)胞的數(shù)目較長質(zhì)粒多,進(jìn)而形成較多的轉(zhuǎn)化菌落;而長質(zhì)粒來不及完全進(jìn)入菌體細(xì)胞內(nèi),致使獲得的轉(zhuǎn)化菌落較少[15]。

3.2 質(zhì)粒用量 電轉(zhuǎn)化時的質(zhì)粒DNA用量在很大范圍內(nèi)和轉(zhuǎn)化子數(shù)呈線形關(guān)系。研究表明,電轉(zhuǎn)化大腸埃希菌時,質(zhì)粒DNA用量在10~7.5 mg/L范圍內(nèi),轉(zhuǎn)化子數(shù)和DNA用量呈線型關(guān)系,轉(zhuǎn)化效率可達(dá)109個/μg DNA以上[8]。但在相同的轉(zhuǎn)化體積中(細(xì)胞數(shù)相同)DNA用量愈多,轉(zhuǎn)化子數(shù)也愈多,即轉(zhuǎn)化效率(轉(zhuǎn)化子數(shù)/存活細(xì)胞數(shù))和DNA濃度呈正相關(guān)。

3.3 質(zhì)粒構(gòu)象 質(zhì)粒DNA的構(gòu)象對轉(zhuǎn)化效率的影響非常明顯,超螺旋質(zhì)粒的轉(zhuǎn)化效率遠(yuǎn)高于線型和開環(huán)質(zhì)粒,因此用于轉(zhuǎn)化的質(zhì)粒中超螺旋狀態(tài)DNA分子的比例至少應(yīng)達(dá)到2/3[16]。

文獻(xiàn)報道的不同菌株電轉(zhuǎn)化條件不統(tǒng)一,由于菌株細(xì)胞壁厚薄、細(xì)胞大小及形狀等因素影響造成菌株對電轉(zhuǎn)化的耐受性及敏感程度不同,其在電轉(zhuǎn)化時所采用的條件也各不相同。因此,在對新菌株進(jìn)行電穿孔轉(zhuǎn)化時,有必要探索其最佳轉(zhuǎn)化條件。

4 小結(jié)

目前電穿孔技術(shù)的應(yīng)用范圍得到不斷拓展,例如,將該技術(shù)用于核酸疫苗的轉(zhuǎn)遞[17,18];通過質(zhì)?;蛲鈦砘蜣D(zhuǎn)染原生動物[19];非熱效應(yīng)殺滅腫瘤細(xì)胞[20];向正常組織或腫瘤組織中轉(zhuǎn)入治療性蛋白基因[21,22];向組織中轉(zhuǎn)入生長因子基因,促進(jìn)組織再生[23];基因剔除[24]等。隨著國內(nèi)外對電穿孔技術(shù)的研究日益深入,其在生物和醫(yī)學(xué)領(lǐng)域?qū)⒂兄浅V闊的應(yīng)用前景。

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