劉 彥,吳移謀
副衣原體科(Parachlamydiaceae)是1997年首次從2例女性阿米巴感染者鼻黏膜中分離出來的細胞內(nèi)共生體,可觀察到原體、網(wǎng)狀體及新月體3種不同的發(fā)育期,大量證據(jù)表明它與人類呼吸道感染密切相關(guān),還可能與動物的泌尿生殖道、眼部感染及全身性疾病有關(guān),1999年被正式命名。副衣原體科主要包括棘阿米巴副衣原體(Parachlamydiaacanthamoeba,Pa)和哈氏變形蟲新衣原體(Neochlamydiaartmanellae,Nh)兩個屬。副衣原體屬目前僅有棘阿米巴副衣原體(P.a(chǎn)canthamoebae,Pa)一個單獨的種類,本文就棘阿米巴副衣原體分類、病原學(xué)特征及分離培養(yǎng)方法研究進展作一綜述。
一個新的物種的鑒定,一般應(yīng)該分析5種不同的種系進化。由于棘阿米巴副衣原體的基因序列尚未完全明確,目前主要是根據(jù)16SrRNA基因、23S rRNA基因、RNase P RNA基因及全基因的種系進化進行分類。Everett等通過對肺炎嗜衣原體(Chlamydophilapneumoniae)16SrRNA 基 因(GenBank登錄號為U68426)和/或23SrRNA基因(GenBank登錄號為U73784)的種系進化分析認為,與16SrRNA或23SrRNA基因同源性大于95% 的屬于衣原體科,反之則屬于副衣原體科。副衣原體科分為兩個屬,其典型菌株分別是棘阿米巴副衣原體和哈氏變形蟲新衣原體,目前已發(fā)現(xiàn)8個種的棘阿米巴副衣原體,分別為BN9、Bergl7、Hall’s球菌、UWE1、UWE25、UWC22、TUME1和 CorvenA4株。理論上認為,16SrRNA基因序列在同一屬的細菌中差別很小,同源性至少應(yīng)該在97%以上;但經(jīng)過比較,發(fā)現(xiàn) UWE1、UWE25、UWC22、TUME1及CorvenA4等5株棘阿米巴副衣原體的16SrRNA基因與BN9株的同源性介于91% ~93%之間,說明棘阿米巴副衣原體在種系進化中具有呈多樣性。
2.1 形態(tài)與結(jié)構(gòu) 棘阿米巴副衣原體可自然感染棘阿米巴的滋養(yǎng)體階段,是其細胞內(nèi)共生體,復(fù)制周期與衣原體相似。電鏡下可觀察到原體(elementary body,EB)和網(wǎng)狀體(reticulate body,RB)兩種基本結(jié)構(gòu),有時可見新月體(crescent body,CB)(圖1)。原體和網(wǎng)狀體均可存在于棘阿米巴滋養(yǎng)體的空泡內(nèi),但革蘭染色結(jié)果不一致。
原體呈球形或橢球形,直徑為0.3~0.5μm,主要定位于棘阿米巴滋養(yǎng)體的空泡內(nèi),隨著培養(yǎng)時間的增加而增多,是副衣原體成熟階段,革蘭氏染色呈陽性。電鏡下可見原體細胞壁厚,有致密的類核結(jié)構(gòu)和少量的核糖體(圖1A)。原體EB在外界環(huán)境較穩(wěn)定,無繁殖能力,但具有高度的感染性;當(dāng)進入棘阿米巴滋養(yǎng)體后,在其棘偽足包繞形成的空泡即吞噬空泡中逐漸發(fā)育,體積增大進入增殖狀態(tài),形成始體。
網(wǎng)狀體呈球形,直徑稍大于原體,約為0.5~0.7μm,不同的菌株原體和始體直徑相差比較大,Hall’s coccus株始體直徑約0.6μm,BN9株直徑可達到1.0μm,CorvenA4株直徑為0.9μm。始體是副衣原體在棘阿米巴細胞質(zhì)內(nèi)的一個主要階段,但是在棘阿米巴的吞噬空泡中也數(shù)量眾多。始體呈二分裂相增殖,細胞壁薄,革蘭染色呈陰性。電鏡下可見始體電子密度低,無致密核質(zhì),內(nèi)有纖細的網(wǎng)狀結(jié)構(gòu),又叫始體(initial body,IB)(圖1B)。
新月體與原體和網(wǎng)狀體共存,是原體和網(wǎng)狀體發(fā)育的中間階段,具有感染性,大量存在于外界環(huán)境中,還可寄生于棘阿米巴的吞噬空泡中,但在棘阿米巴胞漿內(nèi)沒有發(fā)現(xiàn);其主要功能可能是延長潛伏期。電鏡下可見新月體呈新月狀,大小約為0.3×0.6μm,細胞壁厚(圖1C),革蘭氏染色呈陽性。新月體發(fā)生機制尚不清楚,與共培養(yǎng)時間有關(guān),隨著培養(yǎng)時間的延長,新月體出現(xiàn)頻率增加。新月體已見于副衣原體Berg17株、BN9和Hall’s coccus株,而衣原體均未見報道,因此新月體有可能用來作為區(qū)別衣原體分類的一個形態(tài)學(xué)特征。
圖1 棘阿米巴副衣原體(Hall’s coccus株)3個不同階段的形態(tài)結(jié)構(gòu)(電鏡,×45 600)A:原體;B:網(wǎng)狀體;C:新月體(Gilbert Greub and Didier Raoult,2002)Fig.1 Morphology of the three different stages of Parachlamydia acanthamoeba (Hall's coccus strain)(Electron microscopy,×45 600)(Greub G and Raoult D,2002)A:Elementary body;B:Reticulate body;C:Crescent body
2.2 發(fā)育周期 原體和新月體在外界環(huán)境性質(zhì)均較穩(wěn)定,富有感染性,可通過表面受體吸附于棘阿米巴滋養(yǎng)體,棘阿米巴伸出棘狀偽足將其吞入,并由自身胞膜包繞原體和新月體形成吞噬空泡(圖2);原體和新月體在吞噬空泡中逐漸發(fā)育、增大成為網(wǎng)狀體。有時可見散在的原體游離分布棘阿米巴胞漿中,而未見吞噬空泡,其形成來源可能為:①由體外經(jīng)滋養(yǎng)體的胞吞作用進人胞漿中的原體,尚未開始形成吞噬空泡;②在成熟吞噬空泡中,發(fā)育成熟并具有感染能力的原體顆??砂l(fā)生胞內(nèi)胞吐,釋放原體進入胞漿中,成為游離的原體。
網(wǎng)狀體在吞噬空泡內(nèi)進行二分裂增殖,增殖后的網(wǎng)狀體可侵入棘阿米巴胞漿內(nèi),但不能繼續(xù)增殖,而吞噬空泡內(nèi)的網(wǎng)狀體可繼續(xù)指數(shù)增殖,產(chǎn)生大量子代,形成致密的包涵體。網(wǎng)狀體在包涵體內(nèi)逐漸發(fā)育成為原體或新月體,棘阿米巴滋養(yǎng)體的吞噬空泡體積增大,最終通過副衣原體的溶胞作用或者直接以胞吐方式釋放出來。棘阿米巴副衣原體的溶胞作用受溫度影響比較明顯,在低于30℃時表現(xiàn)較低的水平,而在32℃~37℃時達到最大值。
感染的棘阿米巴滋養(yǎng)體體積增加,出現(xiàn)空泡樣變化,可能是由于棘阿米巴副衣原體空泡的形成/或擴張;在培養(yǎng)后期,滋養(yǎng)體裂解,數(shù)量減少,大部分失去成囊活力,少部分輕度感染滋養(yǎng)體可形成包囊。據(jù)報道,Hall’s coccus株8h即可在多嗜棘阿米巴滋養(yǎng)體的吞噬空泡內(nèi)發(fā)育成網(wǎng)狀體;滋養(yǎng)體發(fā)生空泡樣變化,可見分裂現(xiàn)象,胞漿內(nèi)可見副衣原體包涵體,主要靠近細胞膜,呈瘤樣或球狀;滋養(yǎng)體體積增大,后期可見大部分滋養(yǎng)體裂解,數(shù)量減少;滋養(yǎng)體成囊率從99.6%下降至3%,囊內(nèi)未發(fā)現(xiàn)存在副衣原體顆粒。在BN9株的研究中也發(fā)現(xiàn),感染的多噬棘阿米巴滋養(yǎng)體的成囊能力下降,但在部分輕度感染的滋養(yǎng)體成囊后包囊內(nèi)可發(fā)現(xiàn)副衣原體顆粒。
2.3 抗原結(jié)構(gòu) 與衣原體相比,目前認為副衣原體的細胞壁中可能不具備脂多糖或N-末端截斷型脂多糖(truncated LPS);但副衣原體細胞壁上也含有一層蛋白質(zhì)外膜,主要由幾種多肽組成,稱為主要外膜蛋白(major outer membrane protein,MOMP),它是決定其抗原性的主要物質(zhì)基礎(chǔ)。
在衣原體的研究中發(fā)現(xiàn),MOMP的二級結(jié)構(gòu)與穿孔蛋白(porin)一致,具有穿孔蛋白特性。外膜蛋白A(outer membrane proteinA,OmcA)、外膜蛋白B(outer membrane protein B,OmcB)同 MOMP一起構(gòu)成外膜復(fù)合物(outer membrane complex,OMC)。這些蛋白質(zhì)的多態(tài)性非常明顯,從而決定了衣原體的多樣性。
經(jīng)二維電泳及質(zhì)譜分析,棘阿米巴副衣原體UWE25株已經(jīng)發(fā)現(xiàn)38個外膜蛋白,蛋白pc0978、pc0616和pc0617富含半胱氨酸,可能與副衣原體細胞外膜的穩(wěn)定性相關(guān);其中pc0616和pc0617分別與衣原體OmcB、OmcA具備較高的同源性。pc1489和pc1077蛋白在副衣原體外膜中含量極高,研究已經(jīng)證明,pc1489作為特異性抗體,定位于棘阿米巴副衣原體外膜[23],預(yù)測pc1489和pc1077的二級結(jié)構(gòu)具備β-桶狀(β-barrel)結(jié)構(gòu),類似穿孔蛋白,被認為是副衣原體的MOMP;這兩種蛋白質(zhì)與pc0978、pc0616和pc0617一起,構(gòu)成了副衣原體的外膜復(fù)合物(圖3)。
圖2 棘阿米巴副衣原體發(fā)育周期1、副衣原體(原體及新月體階段,紫色顆粒)與棘阿米巴(滋養(yǎng)體階段);2、棘阿米巴滋養(yǎng)體吞噬棘副衣原體;3、原體及新月體在棘阿米巴的吞噬空泡內(nèi)體積增大形成網(wǎng)狀體(黃色顆粒),進行二分裂增殖,形成致密的包涵體;4、網(wǎng)狀體在包涵體內(nèi)逐漸成熟為原體及新月體,棘阿米巴滋養(yǎng)體腫脹(4A),難以成囊(4B);5、棘阿米巴副衣原體以原體、新月體(5A)及小囊泡(5B)的形式釋放出來Fig.2 Developmental cycle of Parachlamydia acanthamoeba1:Parachlamydia (the elementary body and the crescent body,the purple particles)and Acanthamoeba(trophozoite);2:Acanthamoebatrophozoites swallowed the Parachlamydia;3:The elementary and crescent body turned to reticulate body(the yellow particles);4:The reticulate body turned to the elementary and crescent body,and the acanthamoebatrophozoites were difficult to turn to cysts;5:The Acanthamoebatrophozoites were split and the elementary and crescent body were released
圖3 衣原體、副衣原體外膜基本結(jié)構(gòu)模式圖左圖為衣原體外膜基本結(jié)構(gòu)模式圖,右圖為副衣原體外膜基本結(jié)構(gòu)預(yù)測圖。Fig.3 The diagram about structure of outer membrane of Chlamydiaand ParachlamydiaLeft:The structure of outer membrane of Chlamydia;Right:The predicted structure of Parachlamydia
目前已知的副衣原體UWE25株細胞壁外膜上的MOMP與已知衣原體沒有明顯同源性;這也進一步說明副衣原體UWE25和衣原體在細胞壁成分之間存在明顯的差異。
2.4 基因組結(jié)構(gòu)與功能 目前只完成了副衣原體UWE25株全基因組測序(NC_005861)。UWE25基因組全長2 414 465bp,是衣原體基因數(shù)的2倍;其中存在3kb的gap,G+C含量為34.72%,比衣原體低得多;含有2 031個編碼區(qū)(Coding Sequence,CDS),938個CDS與其他衣原體具有同源性,其中711個CDS為副衣原體與其他衣原體所共有,而1 093個CDS只存在于UWE25中;副衣原體擁有3個rRNA操縱子,其數(shù)量多于其他衣原體的rRNA操縱子。
棘阿米巴副衣原體含有豐富的亮氨酸重復(fù)序列,采集了大量的植物類基因,并含有一個變形桿菌起源的大型基因組島Pam100G,包含有6個大型G+C 富 集 基 因 (large GC-rich genes,IgrA,IgrB,IgrC,IgrD,IgrE,IgrF),它們很可能起源于一個獨特的重復(fù)基因序列,與其他細菌未見任何同源性,在UWE25的生物學(xué)活性中發(fā)揮著重要的作用。由此可見,副衣原體的基因組遠遠大于其他衣原體的基因組,主要原因是其他衣原體生活在相對恒定的環(huán)境中(如真核細胞內(nèi)),它們在進化過程中丟失了很多非必需的基因。
在 UWE25株基因島(genomic islands,GIS)研究中發(fā)現(xiàn)另一個G+C含量豐富的19kb的區(qū)域。這段序列是一個100kb的染色體的一部分,它包含100個高度保守的開放閱讀框(open reading frame,ORF),兩側(cè)有兩個17bp的重復(fù)序列,在這段遺傳密碼近段有兩個相同的GLY-tRNA串聯(lián)在一起;位于該染色體區(qū)域內(nèi)有數(shù)個水平轉(zhuǎn)移獲得的基因,編碼轉(zhuǎn)座酶(transposases)及噬菌體相關(guān)蛋白,基本滿足GIS的標(biāo)準(zhǔn)。G+C含量分析表明,若干個序列組成這個基因組島(genomic island,GI),其中一組基因編碼了具有F-樣結(jié)構(gòu)的DNA結(jié)合轉(zhuǎn)移系統(tǒng),對F質(zhì)粒的 DNA 接合傳遞 (traF,traG,traH,traN,traU,traW 及trbC)至關(guān)重要,說明副衣原體tra單位同樣參與了DNA的接合傳遞。這種F質(zhì)粒的接合傳遞最有可能發(fā)生在感染了副衣原體的棘阿米巴內(nèi),涉及到副衣原體之間的DNA傳遞;這可能是副衣原體與衣原體遺傳學(xué)上的一個鑒別點;這些異源DNA很有可能是副衣原體從棘阿米巴的其他不同種的寄生物中獲取的,該基因島可能還是副衣原體一個重要致病物質(zhì)。
同衣原體一樣,UWE25的合成能力有限,不能合成核苷酸和電子載體NAD+,只能通過一些特殊的渠道依靠宿主獲取,但能合成一些有限的氨基酸(甘氨酸,丙氨酸,絲氨酸,天門冬酸,谷氨酰胺,谷氨酸和脯氨酸)和輔助因子(血紅素,核黃素,葉酸和甲基萘醌類)等;這些特點證明了副衣原體專營寄生生活。
3.1 棘阿米巴中的副衣原體分離培養(yǎng) 副衣原體比較合適的自然宿主是棘阿米巴,極易與棘阿米巴共生,將其作為復(fù)制的載體,在棘阿米巴中復(fù)制增殖。迄今為止發(fā)現(xiàn)的8種副衣原體都寄生在人體或環(huán)境中的棘阿米巴中,因此副衣原體的培養(yǎng)主要依賴于棘阿米巴。目前可以從環(huán)境樣本和臨床標(biāo)本檢測和分離獲得副衣原體,分離的樣品包括鼻拭子、支氣管肺泡灌洗液、感染的角膜組織、腦組織和皮膚病灶、粥樣硬化斑塊和外周血單個核細胞等,以及污水、土壤等;分離棘阿米巴中的副衣原體主要有兩種方法。
3.1.1 PYG分離培養(yǎng):將環(huán)境樣本或臨床標(biāo)本直接在蛋白胨酵母膏葡糖培養(yǎng)基(peptone yeast-extract glucose,PYG)中培養(yǎng),PYG含有胰蛋白胨、酵母提取物及葡萄糖,營養(yǎng)豐富,必須添加雙抗(β-內(nèi)酰胺類和喹諾酮類抗生素)和兩性霉素來去除污染。最佳生長溫度為28℃,需培養(yǎng)數(shù)天或幾周,培養(yǎng)過程中需要定期檢查有無棘阿米巴分解或Gimenez陽性球菌的出現(xiàn)[8]。
3.1.2 PAS分離培養(yǎng):將環(huán)境樣本或臨床標(biāo)本直接接種在PAS(Page’s modified Neff’s amoeba saline)培養(yǎng)基中培養(yǎng),再覆蓋一層60℃熱滅活1hr的大腸桿菌(棘阿米巴以滅活的大腸桿菌為食)。PAS是一種專門用于阿米巴培養(yǎng)的培養(yǎng)基,其特點是培養(yǎng)基中無營養(yǎng)成分,能抑制臨床標(biāo)本中污染物的過度生長,無須添加抗生素;于25~30℃培養(yǎng),此法室溫下可保種3個月,4℃可保種6~12個月。A-strid等對工業(yè)廢水治理工廠中的活性淤泥(activated sludge)與未感染副衣原體的棘阿米巴標(biāo)準(zhǔn)株UWE1進行共同培養(yǎng),成功獲得一株新的副衣原體命名為UV-7。經(jīng)鑒定UV-7的16SrRNA序列與UWE1的同源性為98.7%。
3.1.3 研究證實抗生素、溫度和棘阿米巴狀態(tài)對副衣原體的分離培養(yǎng)有影響。
(1)抗生素:副衣原體對β-內(nèi)酰胺類抗生素和喹諾酮類是耐藥的,而對慶大霉素較為敏感,使用此氨基甙類抗生素可阻礙副衣原體感染棘阿米巴;大環(huán)內(nèi)酯類、四環(huán)素類抗生素、利福平及磺胺類藥物等也會抑制副衣原體的生長,故不能在PYG培養(yǎng)基中添加上述抗生素。
(2)溫度:棘阿米巴對生長條件的耐受性遠大于其它營自生生活阿米巴(如納氏蟲屬阿米巴),對干燥有較高抗性,對溫度要求也不嚴(yán)格,可在20~37℃ 左右很好的存活,但是在培養(yǎng)含有副衣原體的棘阿米巴時,孵育期間的溫度一般低于32℃,28℃是其最佳培養(yǎng)溫度。高溫下棘阿米巴非常容易形成包囊,而且在大于32℃的時候副衣原體易誘導(dǎo)阿米巴發(fā)生溶胞。冷凍可造成副衣原體的活力喪失,用液氮超低溫保存的方法,細胞的復(fù)蘇率極低,但添加2%~10% 胎牛血清可以減少失活率。
(3)宿主:副衣原體對外界的抵抗力主要源自于其寄生的棘阿米巴。一方面,它們的寄生宿主對溫度、pH值、滲透壓、消毒液以及抗生素等具有很強的耐受力,因此副衣原體對外界的抵抗力相對較強;另一方面,副衣原體與阿米巴的共生使它們互惠互利,副衣原體經(jīng)過在阿米巴內(nèi)的繁殖增強了傳播能力、耐藥性和致病性,同時也增強了自生生活阿米巴的抵抗力和致病性。
3.2 哺乳類細胞中的副衣原體分離培養(yǎng) 早期的研究認為副衣原體的宿主范圍受棘阿米巴屬限制,一般不用哺乳動物細胞培養(yǎng)副衣原體,但近來越來越多的實驗證明副衣原體菌株能在多種細胞中存活;1994年Michel等首次利用等猴Vero細胞成功培養(yǎng)了副衣原體Berg17株,從而開拓了在實驗室使用細胞培養(yǎng)副衣原體的新領(lǐng)域;Greub等發(fā)現(xiàn)副衣原體可以進入人體巨噬細胞,通過細胞內(nèi)的大量復(fù)制,最后導(dǎo)致巨噬細胞凋亡[36]。體外細胞實驗證實,副衣原體感染肺泡細胞(A549)和肺成纖維細胞(HEL),并在細胞內(nèi)進行復(fù)制;副衣原體BN9株在HEp-2和Vero細胞中也能很好地存活;副衣原體UV-7株不受宿主棘阿米巴UWE1的限制,可入侵哺乳動物細胞,如Vero,Hela和NCI-H292細胞。同其他衣原體一樣,棘阿米巴副衣原體利用ATP/ADP易位酶進行能量的轉(zhuǎn)換。棘阿米巴副衣原體通過細胞內(nèi)吞的途徑進入人體巨噬細胞,并在其形成的吞噬空泡內(nèi)進行大量復(fù)制,最后導(dǎo)致巨噬細胞的凋亡;副衣原體在巨噬細胞內(nèi)的特征類似貝氏考克斯體(Coxiella burnetii)在內(nèi)溶酶體內(nèi)的特點,如呈酸性、溶酶體相關(guān)膜蛋白-1(Lamp-1)陽性及組織蛋白酶陰性;這些特點在本質(zhì)上均不同于衣原體。
操作步驟包括棘阿米巴副衣原體樣本分離、感染宿主細胞及共同培養(yǎng)3部分。
(1)梯度離心-反復(fù)凍融法從棘阿米巴中分離副衣原體網(wǎng)狀體:感染副衣原體的棘阿米巴在PYG中32℃培養(yǎng)6d后,180×g離心10min去除棘阿米巴,取上清6 600×g離心30min后,PBS懸浮沉淀,加入含有10%蔗糖的PBS,4℃,5 800×g離心30min;不同濃度的泛影葡胺梯度超速離心后(140 000×g)收集棘阿米巴副衣原體,懸浮于PBS,在-80℃反復(fù)凍融兩次備用。
(2)感染宿主細胞:副衣原體網(wǎng)狀體經(jīng)過DAPI(4,6-二脒基-2-苯基吲哚二鹽酸鹽,4′,6-diamidino-2-phenyl-indole,DAPI,DNA 熒光染料,可用于活細胞染色)染色后通過孔徑0.25μm的硝酸纖維素膜過濾并計數(shù),或用倍比稀釋法計數(shù)。按1:1的比例,將宿主細胞與純化的棘阿米巴副衣原體(可100℃滅活1h)在RPMI培養(yǎng)基中37℃培養(yǎng)8h后,用RPMI-肝素鈉洗滌,繼續(xù)培養(yǎng),無須添加抗生素。
(3)共同培養(yǎng):感染的細胞在35℃,5%CO2條件下,培養(yǎng)3~5d,每天用PBS洗滌后,取部分細胞用1%甲醛固定10min,Diff-Quik法染色后觀察;也可培養(yǎng)3d后再進行DAPI染色觀察。
作為一個新發(fā)現(xiàn)的病原體,棘阿米巴副衣原體的致病作用需要得到進一步證實;因副衣原體的遺傳呈多樣性,不同的菌種其致病性也各不相同,因此它們的種系發(fā)生關(guān)系也需要進一步闡明;由于副衣原體難以培養(yǎng),目前迫切需要從臨床標(biāo)本和環(huán)境樣本中成功分離出棘阿米巴副衣原體菌株和/或發(fā)現(xiàn)未知的且同源性較高的新種類。分離培養(yǎng)出棘阿米巴副衣原體菌株,并對其進行分子生物學(xué)及血清學(xué)等相關(guān)研究,對進一步闡明其種系發(fā)生關(guān)系、證實其致病性、明確其致病機制并進行快速診斷均具有十分重大的意義。
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