李鴻茹 陳愉生 邵 慧 韓莉莉 張祥娥
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福建漢族人胰島素樣生長因子受體基因多態(tài)性與非小細(xì)胞肺癌易感性的研究*
李鴻茹1陳愉生1邵 慧1韓莉莉2張祥娥1
1.福建醫(yī)科大學(xué)省立臨床醫(yī)學(xué)院呼吸內(nèi)科;2.福建省心血管重點實驗室
:探討胰島素樣生長因子受體(IGF-1R)基因多態(tài)性與福建漢族人非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)易感性的關(guān)系。:應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)和DNA測序方法檢測福建籍漢族NSCLC患者260例和健康人258例的IGF-1R+1013和IGF-2R+1619兩個位點的等位基因分布,探討不同基因型與NSCLC發(fā)病的關(guān)系。:IGF-1R+1013(G/A)基因型和各等位基因的頻率在兩組中分布有顯著性差異(< 0.05),與GG基因型者相比,GA、AA基因型者NSCLC患病風(fēng)險均顯著增加(< 0.05),未發(fā)現(xiàn)IGF-2R+1619(G/A)位點各基因型和等位基因的頻率分布在兩組中的差異有統(tǒng)計學(xué)意義(> 0.05)。根據(jù)病理類型分層分析發(fā)現(xiàn),IGF-1R+1013(G/A)變異等位基因A攜帶者(GA+AA)患肺鱗癌、腺癌、其他類型肺癌的風(fēng)險增加2.20倍、0.55倍、0.96倍(< 0.05)。未發(fā)現(xiàn)IGF-1R+1013、IGF-2R+1619兩基因多態(tài)性與臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移有關(guān)(>0.05)。兩基因多態(tài)性的聯(lián)合分析顯示,同時攜帶IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)A等位基因者NSCLC的患病風(fēng)險增加(= 0.003)。:IGF-1R+1013(G/A)中,變異等位基因A是肺癌發(fā)生的危險因素,IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)基因多態(tài)性對肺癌的易感性有協(xié)同作用。
IGF-1R IGF-2R 基因多態(tài)性 非小細(xì)胞肺癌
目前,肺癌已成為發(fā)病率、死亡率最高的惡性腫瘤之一[1]。IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)是目前研究最多的且與腫瘤發(fā)生密切相關(guān)的兩個單核苷酸多態(tài)性(SNP)位點[2],但迄今在中國人群中,該兩位點基因多態(tài)性未見報道。本文分析了福建地區(qū)漢族人群這兩個位點的單核苷酸多態(tài)性,以探討其與NSCLC發(fā)病的相關(guān)性。
1.1.1 研究對象。肺癌血清標(biāo)本來自于2010年10月~2011年6月經(jīng)病理確診的260例NSCLC患者,其中男性173例,女性87例,男女比例約2 : 1,年齡范圍35~93歲,平均年齡61.1歲;258例自愿參加的健康人群血清作為對照組,其中男性171例,女性87例,年齡范圍為39~90歲,平均年齡58.24歲,兩組性別、年齡無統(tǒng)計學(xué)差異。納入標(biāo)準(zhǔn): ①每份樣品均為3代以內(nèi)無異族通婚史且無親緣關(guān)系的血液標(biāo)本,并與受檢者簽署知情同意書。②對照組均無其他部位原發(fā)腫瘤。③所有病例與對照均為居住在當(dāng)?shù)?0年以上的漢族常住人口。收集病例組研究對象的組織類型、TNM分期等臨床特征,TNM分期采用UICC第七版腫瘤分期,組織類型根據(jù)2004年WHO公布的“肺及胸膜腫瘤組織學(xué)分類修訂方案”進(jìn)行分型,將大細(xì)胞肺癌和未分化及未定性肺癌統(tǒng)稱為其他型肺癌。
1.1.2 試劑。人血液基因組DNA提取試劑盒購自廈門泰京生物技術(shù)有限公司,PCR反應(yīng)試劑購自大連寶生物工程有限公司,MnlI、NciI限制性內(nèi)切酶購自Fermentas公司,PCR擴(kuò)增引物由上海生工生物有限公司設(shè)計合成。
1.1.3 儀器。PCR儀(德國EPPENDORF),VDS-CL凝膠成像系統(tǒng)(瑞典PHARMACZA,JS-680D),紫外分光分度計(BECKMAN,DU-640),瓊脂糖電泳儀(北京儀器廠),低溫度高速離心機(jī)(力新儀器上海有限公司),恒溫水浴箱(新康器械)。
1.2.1 基因組DNA的提取。抽取每個研究對象外周肘靜脈血5mL,乙二胺四乙酸(EDTA)抗凝,用DNA提取試劑盒提取基因組DNA,紫外分光分度計對DNA的濃度和純度進(jìn)行檢測,純度保證( 260 nm/280 nm) OD 值在1. 8~ 2. 0 之間。DNA置-20℃低溫冰箱保存?zhèn)溆谩?/p>
1.2.2聚合酶鏈反應(yīng)-限制性片段長度多態(tài)性(PCR-RFLP)分析。設(shè)計引物如下: G→A(Glu 1013 Glu)(SNP No:rs2229765),sense primer:5’-CAGGGGTCGTTTGGGATGGTC-3’,anti sense primer 5’-CCTGTGCTGCATTTTGGCTTTTC-3,以MnlI酶切可得到不同的基因多態(tài)性片段分別為:GG: 103、84 bp;GA: 103、84、123bp;AA: 84、123bp。G→A(Gly 1619 Arg) (SNP No:rs629849),sense primer:5’-AACAATGGTTAA- AGCCGGATTG-3’,anti sense primer :5’-GGCCCGGGTGC- AGCCAGGCACTG-3’,以NciI酶切可得到不同的基因多態(tài)性片段分別為:GG: 307、149 bp;GA: 456、307、149 bp;AA: 456bp。PCR擴(kuò)增體系(25uL)含0.4umol/L上下游引物,0.02mmol/L dNTPs,1.25U TaKaRaTaq酶,1×PCR buffer, 100ngDNA模板,加蒸餾水至25ul。IGF-1R反應(yīng)條件為:94℃變性20 s,54℃退火20 s,72℃延伸30s;共36個循環(huán),末次循環(huán)后,72℃再延伸10 min,產(chǎn)物為207bp。IGF-2R反應(yīng)條件為:94℃變性30 s,67℃退火60 s,72℃延伸30 s;共30個循環(huán),末次循環(huán)后,72℃再延伸15 min,產(chǎn)物為456bp,以蒸餾水替代模板DNA 作為陰性對照。取10uL PCR反應(yīng)產(chǎn)物、1U限制性內(nèi)切酶,2uL 10×buffer tango,18uL無菌去離子水,37 ℃水浴過夜。取5uL酶切產(chǎn)物經(jīng)3 g/L瓊脂糖凝膠電泳, 100 V 20 min,凝膠成像系統(tǒng)顯影,隨機(jī)抽取10%的DNA 標(biāo)本進(jìn)行重復(fù)實驗。
1.2.3 DNA測序。取50μL PCR產(chǎn)物連同其上游引物由英濰捷基貿(mào)易有限公司,采用雙脫氧法在ABI_3730XL 測序儀上進(jìn)行單向測序。DNA測序圖譜中,SNP位點只有一個峰G或A,表明是純合子GG或AA型,SNP位點出現(xiàn)兩個峰,表明是雜合子GA型。隨機(jī)選擇5% 樣本進(jìn)行DNA 測序, 測序得到的基因型與采用PCR-RFLP 方法得到的基因型完全相同(圖1、圖2)。
①: IGF-1R PCR產(chǎn)物經(jīng)限制性內(nèi)切酶MnlI消化后的電泳圖. M: marker;1泳道:GG型;3泳道:AA型;2,4泳道:GA型; 5泳道:陰性對照;②: IGF-1R+1013多態(tài)性位點測序圖。
圖1 IGF-1R+1013(G/A)瓊脂糖電泳及測序結(jié)果
①: IGF-1R PCR產(chǎn)物經(jīng)限制性內(nèi)切酶NciI消化后的電泳圖. M: marker;3泳道:GG型;2泳道:AA型;1,4泳道:GA型; 5泳道:陰性對照; ②: IGF-1R+1619多態(tài)性位點測序圖。
圖2 IGF-1R+1619(G/A)瓊脂糖電泳及測序結(jié)果
采用SPSS 18. 0 軟件,以χ檢驗比較各基因型及等位基因在病例組與對照組分布的差異,多因素Logistic regression方法統(tǒng)計比值比(odds ratio,OR)和95%可信區(qū)間(confidence interval,CI),且經(jīng)性別、年齡等混雜因素校正。Spearman 等級相關(guān)分析基因型與肺癌分化程度、原發(fā)腫瘤TNM分期、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移、臨床分期的線性關(guān)系,雙側(cè)<0.05有統(tǒng)計學(xué)意義。
兩個位點的基因型分布均符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律(>0.05)。病例組中IGF-1R+1013(G/A)位點的GG、GA、AA基因型和等位基因A攜帶者(GA+AA)的頻率分別為34.6%、53.1%、12.3%和65.4%,對照組的頻率分別為51.2%、43.8%、5.0%和48.8%,兩組中各個頻率的差異均有統(tǒng)計學(xué)意義(<0.05)。與IGF-1R+1013(G/A) GG基因型攜帶者相比,GA型攜帶者的患病風(fēng)險增加0.80倍(95%CI:1.24~2.59,=0.002), AA型攜帶者的患病風(fēng)險增加2.59倍(95%CI:1.78~7.26,=0.000),而等位基因A(GA+AA)攜帶者的患病風(fēng)險增加0.98倍(95%CI:1.39~2.83,=0.000)。IGF-2R+1619(G/A)各基因型和等位基因的頻率分布在兩組中的差異無統(tǒng)計學(xué)意義(>0.05)。詳見表1。
表1 IGF-1R+1013(G/A)、IGF-2R+1619(G/A)基因型及等位基因頻率分布與肺癌的患病風(fēng)險的相關(guān)性
根據(jù)肺癌病理類型進(jìn)行的分層分析發(fā)現(xiàn),與IGF-1R+ 1013(G/A) GG基因型攜帶者相比,IGF-1R+1013(G/A)的變異等位基因A攜帶者(GA+AA)患肺鱗癌的風(fēng)險增加2.20倍(95% CI: 1.75~5.84,=0.000),患肺腺癌的風(fēng)險增加0.55倍(95% CI: 1.00~2.41,=0.049),患大細(xì)胞肺癌、未定性肺癌等其他型肺癌的風(fēng)險增加0.96倍(95% CI: 1.10~3.49,=0.023)。IGF-2R+1619(G/A)基因多態(tài)性與病理類型無關(guān)(>0.05)(見表2);Spearman 等級相關(guān)分析基因突變與肺癌患者臨床特征之間的線性關(guān)系未發(fā)現(xiàn)IGF-2R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G / A)基因多態(tài)性與臨床分期、淋巴結(jié)轉(zhuǎn)移、遠(yuǎn)處轉(zhuǎn)移有關(guān)(>0.05),IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)基因的突變率并未隨著腫瘤的T N M分期等的增加而增加(>0.05)(見表3)。
表2 IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)基因多態(tài)性與肺癌癌病理類型的關(guān)系
注: 其他類型包括大細(xì)胞癌、未分化及未定性肺癌。
表3 IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)基因型與肺癌患者臨床特征之間的關(guān)系
表4進(jìn)一步分析了IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+ 1619(G/A)各種基因型組合與肺癌的關(guān)系。結(jié)果顯示,與同時攜帶這兩個基因的GG基因型的個體相比,攜帶IGF-1R +1013(G/A)的GA基因型和IGF-2R+1619(G/A)的GA基因型的個體患肺癌的危險性增加1.05倍(95% CI: 1.18~3.57,=0.011),攜帶IGF-1R+1013(G/A)的AA基因型和IGF-2R+ 1619(G/A)的GG基因型的個體患肺癌的危險性增加1.86倍(95% CI: 1.17~7.03,=0.022),攜帶IGF-1R+1013(G/A)的AA基因型和IGF-2R+1619(G/A)的GA基因型的個體患肺癌的危險性增加3.54倍(95% CI: 1.41~14.60,=0.011),肺癌組中未檢測到同時攜帶IGF-1R+1013(G/A)的AA基因型和IGF-2R+1619(G/A)的AA基因型的患者,兩基因聯(lián)合多態(tài)性與NSCLC的易感性有關(guān)(=0.004)。
表4 IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)聯(lián)合作用與肺癌易感性的關(guān)系
基因定位于15q25-26,全長約100 kb,有21個外顯子。IGF-1R蛋白是一種酪氨酸激酶跨膜蛋白受體,由兩個a-亞基(130-135KDa)和兩個β亞基(90-95KDa)通過二硫鍵結(jié)合而形成四聚體(α2β2), 與細(xì)胞外配體結(jié)合后,通過Ras/Raf/MEK/ERK 和PI3K/AKT兩條信號傳導(dǎo)通路促進(jìn)細(xì)胞存活及抗細(xì)胞凋亡的作用[3]。IGF-1R主要與IGF-1、IGF-2和胰島素相結(jié)合,研究表明,IGF-1R在包括肺癌在內(nèi)的多種腫瘤中高表達(dá)[4],并與腫瘤的分化程度相關(guān)[5-6],16外顯子上第1013編碼谷氨酸的密碼子出現(xiàn)G→A的突變(突變率0.49)與血清中IGF-1水平及人類壽命有關(guān)[7]。本研究發(fā)現(xiàn),IGF-1R +1013(G/A)攜帶A變異等位基因的基因型(GA+AA) 在NSCLC組的頻率顯著高于對照組的,提示該位點A變異等位基因是肺癌發(fā)生的危險因素,這與MacDonald K等在食管癌的研究結(jié)果一致[8]。但G-A等位基因突變?nèi)绾螌?dǎo)致氨基酸合成改變進(jìn)而影響蛋白質(zhì)功能,使肺癌發(fā)生風(fēng)險增加的具體作用機(jī)制有待進(jìn)一步深入研究。
基因定位于6q26,約136kb,含有48個外顯子,其編碼的蛋白質(zhì)是一個無內(nèi)在催化活性的跨膜糖蛋白,與IGF-2配體結(jié)合后不能傳導(dǎo)信號反而加速IGF-2的降解,目前認(rèn)為IGF-2R對IGF信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路所起的作用很可能是負(fù)向調(diào)節(jié)性的。IGF-2R基因座位有高頻率的雜合性缺失(LOH),并且在相當(dāng)比例的等位基因中存在點突變[9]。Savag1[10]等報道,IGF2R基因內(nèi)多個SNP與骨肉瘤的發(fā)病風(fēng)險有關(guān)。IGF-2R的轉(zhuǎn)錄區(qū)1619位點G→A的突變造成IGF-2R結(jié)合域中甘氨酸被精氨酸替代進(jìn)而影響了IGF-2對IGF-2R結(jié)合的親和力,IGF-2基因+3580位點AA純合突變和IGF - 2R的野生純合型GG的組合對肝癌發(fā)生有保護(hù)作用[2]。Pavel檢測到肺鱗癌IGF-2R基因發(fā)生了突變,認(rèn)為IGF-2R 3’非翻譯區(qū)短串聯(lián)重復(fù)序列的基因突變可降低轉(zhuǎn)錄的穩(wěn)定性[11],與非小細(xì)胞肺癌的進(jìn)展有關(guān)。本研究未發(fā)現(xiàn)IGF-2R+1619(G/A)基因多態(tài)性與肺癌易感性有關(guān)(>0.05),但分析兩基因多態(tài)性聯(lián)合作用發(fā)現(xiàn)IGF-1R+1013(G/A)和IGF-2R+1619(G/A)基因多態(tài)性對肺癌的易感性有協(xié)同作用。由于IGF-1R+1013 (G/A)變異等位基因A可能掩蓋IGF-2R+1619(G/A)基因多態(tài)性在肺癌發(fā)生中的作用,尚不能認(rèn)為IGF-2R+1619(G/A)基因多態(tài)性與肺癌易感性有關(guān)。
綜上所述,IGF-1R基因1013密碼子的突變與肺癌易感性相關(guān),提示胰島素樣生長因子軸(IGFs)在肺癌分子發(fā)病機(jī)制中可能起重要作用,但具體作用機(jī)制有待進(jìn)一步深入研究。
致謝:感謝福州市肺科醫(yī)院在標(biāo)本收集方面給予的幫助!
[1] Pandini G, Frasca F, Mineo R, et al. Insulin/insulin-like growth factor I hybrid receptors have different biological characteristics depending on the insulin receptor isoform involved[J]. J Biol Chem,2002(277):39684-39695.
[2]Weng CJ, Hsieh YH, Tsai CM, et al. Relationship of Insulin-Like Growth Factors System Gene Polymorphisms with the Susceptibility and Pathological Development of Hepatocellular Carcinoma[J]. Ann Surg Oncol, 2010(17): 1808-1815
[3]Paveli? J, Matijevi? T, Knezevi? J. Biological & physiological aspects of action of insulin-like growth factor peptide family[J]. Indian J M ed Res, 2007 (125):511-522
[4] Tao Y, Pinzi V, Bourhis J, et al. Mechanisms of disease: signaling of the insulin-like growth factor 1 receptor pathway—therapeutic perspectives in cancer[J]. Nat Clin Pract Oncol, 2007(4):591–602.
[5]Pavelic J, Krizanac S, Kapitanovic S,et a1. The consequences of insulin-1ike growth factors/receptors dysfunction in lung cancer[J].Am J Respir Cell Mol Biol, 2005(32): 65-71.
[6]余宗陽, 歐陽學(xué)農(nóng), 杜建, 等. 非小細(xì)胞肺癌胰島素樣生長因子受體的表達(dá)及其臨床意義[J].中國癌癥雜志, 2006, 16(8):638- 640.
[7] Bonafe M, Barbieri M, Marchegiani F, et al. Polymorphic variants of insulinlike growth factor I (IGF-I) receptor and phosphoinositide 3-kinase genes affect IGF-I plasma levels and human longevity: cues for an evolutionarily conserved mechanism of life span control[J]. J Clin Endocrinol Metab, 2003(88): 3299–3304.
[8]MacDonald K, Porter GA, Guernsey DL, et al. A polymorphic variant of the insulin-like growth factor type I receptor gene modifies risk of obesity for esophageal adenocarcinoma[J]. Cancer Epidemiol, 2009(33): 37-40.
[9]Jang HS, Kang KM, Choi BO, et a1. Clinical significance of loss of heterozygosity for M6P/IGF2R in patients with primary hepatocellular carcinoma[J]. World J Gastroenterol., 2008(14):1394-1398.
[10] Savage S A, Woodson K, Walk E, et a1. Analysis of genes critical for growth regulation identifies Insulin-like Growth Factor 2 Receptor variations with possible functional significance as risk factors for osteosarcoma[J]. Cancer Epidemiol Biomarkers Prev, 2007(16): 1667-1674.
[11]Kotsinas A, Evangelou K, Sideridou M, et al. The 3' UTR IGF2R-A2/B2 variant is associated with increased tumor growth and advanced stages in non-small cell lung cancer[J]. Cancer Lett, 2008(259): 177-185.
福建省自然科學(xué)基金(NO:2011J01130 ),福建省衛(wèi)生廳青年科研基金(NO.2010-2-7)。
李鴻茹,Email:muzi131122@163.com