彭 琳 陳建良 方裕森 吳庫生 霍 霞
1.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院附屬腫瘤醫(yī)院檢驗(yàn)科,廣東 汕頭 515031;2.汕頭大學(xué)醫(yī)學(xué)院,廣東 汕頭 515041
乳腺癌作為女性最常見的惡性腫瘤之一,發(fā)病率正呈逐年上升趨勢,在大城市的發(fā)病率甚至超過宮頸癌,躍居女性惡性腫瘤首位。1996~2003年,在我院惡性腫瘤住院病例前五位中,乳腺癌是唯一女性惡性腫瘤[1],汕頭地區(qū)2005年的統(tǒng)計(jì)資料顯示,本地區(qū)已婚婦女乳腺癌檢出率是47.40/10萬[2]。乳腺癌的發(fā)病機(jī)制復(fù)雜,其中遺傳因素約占發(fā)病病因的1/4,基因遺傳變異和多態(tài)性被認(rèn)為是腫瘤易感性的重要分子基礎(chǔ)。
Prohibitin(PHB/PHB1)被認(rèn)為是一個候選腫瘤抑制基因,1992年日本Sato等首先提出該基因變異可能與散發(fā)性乳腺癌有關(guān)[3]。2001年一份北美人群的調(diào)查顯示,PHB基因rs6917 C>T單核苷酸多態(tài)性 (single nucleotide polymophism,SNP)與乳腺癌遺傳易感性存在關(guān)聯(lián)[4];然而隨后其他源自不同國家、不同種族的研究報(bào)道結(jié)論不盡一致。迄今為止,尚無中國漢族女性的相關(guān)報(bào)道[5]。本研究將采用高分辨率熔解曲線(HRM)技術(shù)進(jìn)行病例-對照研究,探討PHB rs6917位點(diǎn)SNP與潮汕女性乳腺癌發(fā)生風(fēng)險(xiǎn)的相關(guān)性。
231例乳腺癌病例為2009年7~12月在我院住院診治的患者,均有病理確診報(bào)告,且排除同時合并宮頸癌、卵巢癌及其他惡性腫瘤。對照組169例為同期征集的健康體檢正常人群。所有對象要求均為潮汕籍漢族女性,無吸煙史。231例乳腺癌患者平均年齡(49.60±10.71)歲,169例正常對照組平均年齡為(49.06±14.19)歲,經(jīng)統(tǒng)計(jì)學(xué)檢驗(yàn),差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.088)。
在獲得知情同意后,采集乳腺癌患者及對照組人員2 mL外周血,以EDTA抗凝。采用TIANamp血液基因組DNA提取試劑盒 (天根生化科技有限公司)提取DNA。將提取好的DNA終濃度調(diào)節(jié)至10 ng/μL。PCR引物使用Lightscanner Primer Design Software設(shè)計(jì),序列為5’-CCAGGAACGTAGGTCGGACAC-3’(上游)和 5’-GCTGAACATGCCTGCCAAAGA-3’(下游),由蘇州為真生物醫(yī)藥科技有限公司合成。Taq酶、dNTP購自Roche公司,熒光染料購自Biotium,96孔板、384孔板、封膜等購自漢爵克斯,使用LightCycler480實(shí)時熒光定量PCR儀(德國羅氏公司)。PCR反應(yīng)體系10 μL,含10×PCR Buffer(15 mmol/L MgCl2)1 μL,MgCl2(25 mmol/L)1 μL,dNTP(10 mmol/L)0.25 μL,20×Eva-green 飽和染料 0.5 μL,10 μm Primers各 0.25 μL,PCR 產(chǎn)物(10 ng/μL)1.0 μL、Taq 酶(5 U/μL)0.1 μL,ddH2O 5.65 μL。 反應(yīng)條件:95℃預(yù)變性 5 min,95℃變性 10 s,60℃退火 15 s,72℃延伸 25 s,循環(huán)數(shù) 50。 擴(kuò)增結(jié)束后直接進(jìn)行 HRM,反應(yīng)條件:95℃ 1 min,40℃ 1 min,溶解曲線從65~95℃,溫度上升速率為0.02℃/s,每秒檢測熒光40次,最后40℃冷卻10 s。運(yùn)行Gene scanning程序,得到分型圖譜。對于多態(tài)性的基因分型結(jié)果,選取10%樣本進(jìn)一步測序驗(yàn)證。PCR擴(kuò)增曲線及基因型分型圖見圖1、2。
圖1 PCR擴(kuò)增曲線
圖2 HRM分型圖
用SPSS 17.0進(jìn)行統(tǒng)計(jì)學(xué)處理,計(jì)量資料采用均數(shù)±標(biāo)準(zhǔn)差()表示,組間年齡比較采用 t檢驗(yàn),Logistic回歸分析計(jì)算優(yōu)勢比(odds ratio,OR)及其 95%可信區(qū)間(confidence interval,CI)。
對照組的rs6917 C>T位點(diǎn)基因型經(jīng)過Hardy-Weinberg遺傳平衡檢驗(yàn),P值符合Hardy-Weinberg遺傳平衡定律(P=0.880),說明該人群基因型頻率處于平衡狀態(tài),具有群體代表性。
所有受檢對象均未發(fā)現(xiàn)TT基因型攜帶者。乳腺癌組C和T等位基因頻率分別為0.872和0.128,正常對照組C和T等位基因頻率分別為0.864和0.136。經(jīng)Logistic回歸分析,C/C基因型與T/C基因型攜帶者在乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)上差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(P=0.706);在調(diào)整了年齡因素后,同樣未發(fā)現(xiàn)基因型與乳腺癌易感性有關(guān)聯(lián)(P=0.906),見表1。
PHB基因定位于人染色體17q21,與已知的乳腺癌易感基因BRCA1相鄰。PHB具有增殖抑制作用,但與蛋白編碼區(qū)無關(guān),而受控于該基因的3'-UTR。PHB基因的3’UTR存在一個功能性SNP——1630C/T(rs6917),當(dāng)該位點(diǎn)上的胞嘧啶(C)轉(zhuǎn)變?yōu)樾叵汆奏ぃ═)時,PHB失去增殖抑制作用,細(xì)胞永生化生長。進(jìn)一步研究發(fā)現(xiàn),UTR/C基因型能編碼功能性RNA,而UTR/T基因型編碼的RNA沒有活性,前者對腫瘤細(xì)胞增殖及移植瘤生長發(fā)揮顯著的抑制作用,可將細(xì)胞周期阻斷在G1/S[6]。
2001年,Jupe等[4]發(fā)表在LANCET的一篇報(bào)道首次關(guān)注PHB基因3'-UTR多態(tài)性與家族性、早發(fā)性乳腺癌的相關(guān)性。該研究通過對北美人群rs6917位點(diǎn)SNP分子流行病學(xué)調(diào)查發(fā)現(xiàn),T等位基因型與具有一級親屬家族史的乳腺癌患者顯著相關(guān)(OR=2.5),同時,這種相關(guān)性在50歲前被診斷為乳腺癌人群中尤為明顯(OR=4.8)。然而隨后針對澳大利亞、英國及土耳其等人群的研究卻未能得出相同結(jié)論[7-9]。來自波蘭多中心研究的新近報(bào)道則指出,T等位基因型能增加BRCA1基因突變攜帶者罹患乳腺癌的風(fēng)險(xiǎn)[10-11]。
中國漢族女性PHB基因rs6917位點(diǎn)的基因多態(tài)性是否也是乳腺癌的易感因素之一,目前并無相關(guān)文獻(xiàn)報(bào)道。因此,本研究首次利用高通量HRM-SNP技術(shù)對潮汕漢族女性PHB基因rs6917位點(diǎn)進(jìn)行基因多態(tài)性檢測,結(jié)果發(fā)現(xiàn)本地區(qū)女性僅存在T/C和C/C兩種基因型,缺乏T/T基因型,T等位基因頻率低于可檢索到的其他種族人群T等位基因頻率為0.2的平均水平。由于病例組中僅發(fā)現(xiàn)4例有一級親屬罹患乳腺癌,故在本研究中未將該因素列入考慮。本次研究的數(shù)據(jù)表明,T/C和C/C兩種基因型在乳腺癌發(fā)病風(fēng)險(xiǎn)度上差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義,可見,PHB基因rs6917 C>T多態(tài)性并非潮汕人群乳腺癌的易感因素之一。
事實(shí)上,PHB基因3'-UTR上還有若干SNP位點(diǎn),包括rs1049620、rs4987083、rs9893420等,但目前針對乳腺癌易感性的研究多集中在rs6917這一位點(diǎn)上。筆者下一步的工作將對其他位點(diǎn)的基因多態(tài)性與乳腺癌相關(guān)性進(jìn)行篩選,翼以尋找可用于篩選乳腺癌易感個體的遺傳標(biāo)志物。
表1 PHB rs6917 T>C多態(tài)性和乳腺癌發(fā)病危險(xiǎn)關(guān)系的Logistic回歸分析
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