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OGG1 Ser326Cys多態(tài)性與結直腸癌發(fā)病風險的meta分析

2012-09-20 03:38高天翼李瑞許曄瓊聶珍琳顧玲陳麗萍宋國齊王書奎
中國醫(yī)療設備 2012年11期
關鍵詞:多態(tài)性異質(zhì)性直腸癌

高天翼,李瑞,許曄瓊,聶珍琳,顧玲,陳麗萍,宋國齊,王書奎

南京醫(yī)科大學附屬南京第一醫(yī)院中心實驗室,江蘇 南京 210006

0 前言

結直腸癌是西方國家最常見的死亡原因之一,常常受到環(huán)境因素和遺傳特性的影響。許多癌癥的發(fā)生,特別是結直腸癌,常由DNA的損傷引起,而這些影響因素有化學物質(zhì)、吸煙、高脂飲食、飲酒等[1];但是人類已經(jīng)建立起一套復雜的基因修復系統(tǒng)來避免DNA損傷引起的染色體異常[2-3]。目前在基因修復系統(tǒng)的各條路徑上已發(fā)現(xiàn)100多種蛋白[4-5],包含堿基切除修復蛋白(BER)、核苷酸切除修復蛋白、雙鏈斷裂修復蛋白以及錯配修復蛋白(MMR)等。流行病學調(diào)查表明,除了MMR基因在結直腸癌的發(fā)病中有重要作用外,參與活性氧簇(ROS)造成的基因氧化損傷初始修復的BER路徑上的基因同樣在腫瘤的發(fā)生過程中起到重要作用。ROS引起的基因損傷方式包括造成G:C 到T:A 的轉化,引起致癌基因的活化以及引起腫瘤抑制基因失活導致的致癌作用等,而BER通路在抵抗DNA氧化損壞的影響中起著重要的作用。

8-羥基鳥嘌呤DNA糖苷酶1(OGG1)[6]是BER通路中一個關鍵蛋白,能夠識別和切除那些單個DNA損傷引起的寡核苷酸病變,包括8-羥基鳥嘌呤(8-oxoGua)、2,6-二氨基-4-羥基-5-甲酰胺基嘧啶(FapyGua)、2,6-二氨基-4-羥基-5N-甲基甲酰胺嘧啶(Fapy-7-MeGua)、8-羥基腺嘌呤等[7-8]。許多研究發(fā)現(xiàn)腫瘤患者在基因修復效率上呈現(xiàn)下降趨勢[9-10],而DNA修復基因多態(tài)性的表現(xiàn)形式或許是導致這些酶活性下降最為可能的原因[11]。目前已發(fā)現(xiàn)的OGG1基因多態(tài)性有多種[12-14],但越來越多的研究側重于常見的Ser326Cys單核苷酸多態(tài)性的研究。OGG1外顯子7在1245 bp(C1245G)處C/G多態(tài)性造成了密碼子326的單個氨基酸置換,即絲氨酸(Ser)被半胱氨酸(Cys)取代(Ser326Cys,rs 1052133 )[15]。更重要的是,在8-oxoGua被刪除的寡核苷酸[16]及經(jīng)過純Cys326或Ser326 OGG1酶處理的8-oxoGua和FapyGua釋放的γ-輻照DNA中[7,17],OGG1-Cys326被發(fā)現(xiàn)呈現(xiàn)出更低的酶活性。自從OGG1在腫瘤發(fā)病的潛在功能被研究者發(fā)表以來[18],許多研究探討了OGG1的遺傳變異與結直腸癌易感性的聯(lián)系以及基因與環(huán)境的相互作用[19-24]。盡管OGG1 Ser326Cys多態(tài)性與CRC發(fā)病風險的關聯(lián)在很多研究中得到呈現(xiàn)[25-26],但這些結果研究仍沒有定論??紤]到OGG1在結直腸癌中的作用,我們對有符合條件的病例對照研究進行meta分析,全面評估OGG1 Ser326Cys多態(tài)性在結直腸癌發(fā)病風險中的作用。

1 資料與方法

1.1 搜索策略

Pubmed的搜索項目為“OGG”“OGG1”“hOGG1”“ polymorphism”“colorectal cancer”,搜索截止日期為2010年9月22日。搜索結果限制為英文表達的文獻,并且Pudmed中“Related Articles”選項也被用來尋找潛在的相關文獻。另外,文獻中引用文獻也在我們的搜索范圍內(nèi),最后12篇文獻被確定能夠用于本次meta分析,并且這些文獻都遵循以下標準:① 評估了OGG1 Ser326Cys多態(tài)性在結直腸癌發(fā)病風險中的作用;② 符合病例-對照研究;③ 包含可用基因型頻率。

1.2 數(shù)據(jù)提取

兩名研究者分別將所需信息從這些被選的文章中仔細篩選出來,所摘錄的信息包括:作者、出版年限、癌癥病例與對照的選擇和特點、質(zhì)控來源(隨機抽取或醫(yī)院來源為基礎)、人口、民族、基因分型資料和族群等,根據(jù)族群信息將提取數(shù)據(jù)歸類為歐洲人和亞洲人,本次研究不包含非洲人。

1.3 統(tǒng)計方法

通過χ2檢驗對文獻中的質(zhì)控人群基因型分布進行檢測,檢驗在人口分布上是否符合哈溫平衡(HWE;P<0.05,具有顯著差異)。OGG1 Ser326Cys多態(tài)性與結直腸癌發(fā)病風險的關聯(lián)強度采用OR及其95%可信區(qū)間(CI)表示。研究采用Z檢驗匯總的OR值統(tǒng)計學差異。以野生型Ser/Ser純合子為對照,首先評估Ser/Cys和Cys/Cys基因與結直腸癌的關系,來評價Ser/Cys + Cys/Cys 與 Ser/Ser 及 Cys/Cys與Ser/Cys +Ser/Ser在結直腸癌發(fā)病風險中的顯性和隱性作用。并且本次研究對人種以及標本來源進行了分層分析。采用Q統(tǒng)計[27](P<0.1,具有顯著差異)和I2統(tǒng)計進行異質(zhì)性檢驗,以量化異質(zhì)性在總變異中的比例。作為標準,I2值<25%為低,<50%為中,>50%為高[28]。固定效應模型和隨機效應模型在數(shù)據(jù)合并中都被采用,但當存在異質(zhì)性時,隨機效應模型更為適合[29-31]。通過漏斗圖和Egger’s線性回歸來檢驗文獻數(shù)據(jù)的偏倚情況。本次meta分析中所有統(tǒng)計學檢驗采用的都是STATA 10.0(Stata Corporation College Station,TX,USA)。

1.4 主要方法

本文納入的文獻主要運用了以下3種測序方法:

(1)聚合酶鏈反應和限制性片段長度多態(tài)性(PCRRFLP):是用PCR儀擴增目的DNA片段,擴增產(chǎn)物用特異性內(nèi)切酶消化切割成不同大小片段,經(jīng)過凝膠電泳,在凝膠成像與分析系統(tǒng)上分辨。不同等位基因的限制性酶切位點分布不同,產(chǎn)生不同長度的DNA片段條帶。

(2)直接測序法:利用一種DNA聚合酶來延伸結合在待定序列模板上的引物。直到摻入一種鏈終止核苷酸為止。每次序列測定由一套4個單獨的反應構成,每個反應含有所有4種脫氧核苷三磷酸 (dNTP),并混入限量的一種不同雙脫氧核苷三磷酸(ddNTP)。由于ddNTP缺乏延伸所需要的3-OH基團,使延長的寡聚核苷酸選擇性地在G、A、T或C處終止。終止點由反應中相應的雙脫氧而定。每一種dNTPs和ddNTPs的相對濃度可以調(diào)整,使反應得到一組長幾百至幾千個堿基的鏈終止產(chǎn)物。它們具有共同的起始點,但終止在不同的核苷酸上,可通過高分辨率變性凝膠電泳分離大小不同的片段,凝膠處理后可用X-光膠片放射自顯影或非同位素標記進行檢測。

(3)Taqman:Taqman熒光探針是一寡核苷酸,兩端分別標記一個熒光發(fā)射基團和一個熒光淬滅基團。探針完整時,發(fā)射基團發(fā)射的熒光信號被淬滅基團吸收;PCR擴增時,Taq酶的5’-3’外切酶活性將探針酶切降解,使熒光發(fā)射基團和熒光淬滅基團分離,從而熒光監(jiān)測系統(tǒng)可接收到熒光信號,即每擴增一條DNA鏈,就有一個熒光分子形成,實現(xiàn)了熒光信號的累積與PCR產(chǎn)物形成完全同步,從而實現(xiàn)定量。

1.5 主要儀器設備

普通離心機 盧湘儀集團

2 結果

2.1 數(shù)據(jù)特征

通過關鍵詞和手動搜索,總共有182篇相關文獻,見圖1。首先,瀏覽這些文獻,可排除128篇文獻(122篇文獻不是有關結直腸癌的研究,6篇文獻不屬于腫瘤研究);其次,回顧文獻摘要,將具有完整文獻發(fā)表的留下。對這些文獻進一步瀏覽,再排除36篇(6篇文獻是綜述,2篇文獻沒有可用數(shù)據(jù),9篇文獻非英文書寫,19篇文獻為基礎研究);然后,對剩下的文獻全文進行篩選后,排除6篇文獻(3篇沒有報道可用的數(shù)據(jù),1篇是綜述,2篇是對以前文獻的重復);將剩下的納入標準,共有12個條件符合研究,涉及4233例和6494組對照被納入最后的數(shù)據(jù)分析,見表1。其中4篇為有關亞洲人的研究,8篇為有關歐洲人的研究。其中10篇文獻應用Tapman探針和PCR-RFLP。共有8篇研究歐洲后裔,4篇研究亞洲后裔。結直腸癌在大多數(shù)的研究都經(jīng)過病理組織確認。此外,對照組在年齡上相匹配,且其中8組以隨機人群抽取為基礎,4組以醫(yī)院來源為基礎。

圖1 文獻納入和排除流程圖

2.2 定量分析

如表2所示,OGG1 Ser326Cys的全部基因型與結直腸癌的發(fā)病無明顯聯(lián)系??傊?,在Cys/Cys vs Ser/Ser(OR=1.19,95%CI=0.92~1.53)、Ser/Cys vs Ser/Ser(OR=1.04,95%CI=0.95~1.13)、Ser/Cys + Cys/Cys vs Ser/Ser(OR=1.06,95%CI=0.98~1.16)(圖2)和Cys/Cys vs Ser/Cys + Ser/Ser(OR=1.11,95%CI=0.90~1.38)無明顯聯(lián)系;此外,在種族及對照組來源的分層分析中,OGG1 Ser326Cys的各基因型無明顯的風險增長。

表1 hOGG1 Ser326Cys多態(tài)性和結直腸癌發(fā)病風險病例-對照研究概要

表2 hOGG1 Ser326Cys多態(tài)性和結直腸癌發(fā)病風險的分層分析

圖2 OGG1 Ser/Cys多態(tài)性與結直腸癌發(fā)病風險聯(lián)系隨機效應森林圖(Cys/Cys + Ser/Cys vs Ser/Ser)

2.3 敏感性分析和發(fā)表偏倚

敏感性分析時,通過依次移除單個研究評估研究個體對合并OR值的影響。結果顯示無研究個體對整體OR值具有顯著影響。森林圖和Egger’s 檢測被用來檢驗發(fā)表偏倚。漏斗圖的形狀未顯示任何對稱的跡象,同時Egger’s 檢測顯示發(fā)表偏倚缺失(t=0.87,P=0.404,Cys/Cys + Ser/Cys vs Ser/Ser),見圖3。

圖3 hOGG1 Ser326Cys多態(tài)性發(fā)表偏倚95%可信區(qū)間漏斗圖(Cys/Cys +Ser/Cys versus Ser/Ser)

3 討論

過去可能受樣本量或者基因背景的影響,有關OGG1 326Cys 等位基因和結直腸癌發(fā)病風險的研究呈現(xiàn)出相互矛盾的結果。meta分析是一個有效解決大量研究結果不一致的分析方法。在本次研究中,通過對12篇文獻嚴格的meta分析,提供了有關OGG1 Ser326Cys與結直腸癌發(fā)病風險關系最為詳盡的評估。同時,本次研究對人種和對照來源進行了亞組分析。異質(zhì)性和敏感性研究都被嚴格執(zhí)行,確保本次meta分析的可靠性。本次研究通過meta分析表明OGG1 Ser326Cys多態(tài)性與結直腸癌總發(fā)病率無聯(lián)系。

由于其相較于Ser326較弱的防止8-oxoG相關突變的能力,以往研究表明OGG1-Cys326能增加癌癥易感性[7,32]。在本次meta分析中,我們未發(fā)現(xiàn)OGG1 Ser326Cys多態(tài)性與結直腸癌之間的聯(lián)系,此外,人種的分層分析表明亞洲人與歐洲人無差異。有研究表明遺傳基因異質(zhì)性在結直腸癌病理中具有重要作用,此外,結直腸癌的致癌作用受遺傳背景與環(huán)境因素間相互作用的影響。另有研究推斷不同種族和環(huán)境暴露會影響結直腸癌的易感性[33],是因為歐洲人和亞洲人飲食文化不同,前者更多的紅肉攝食可能是結直腸癌發(fā)病的高危因素[34];但是本次研究未能證實該發(fā)現(xiàn),需要更多的研究積累來證實這一差異。

本次meta分析仍存在一些限制。首先,文章中對照組來源不夠一致,大部分來自于健康人群外,還有一部分來自于醫(yī)院病人。其次,本次研究的病例和對照組數(shù)量仍然較少,未能具備完全詮釋真正內(nèi)在關系的能力。另外,本次研究采用的12篇文獻間存在異質(zhì)性,除了Ser/Cys 與Ser/Ser 和Ser/Cys + Cys/Cys 與 Ser/Ser間的比較,其他總OR值的計算采用了隨機效應模型。最后,由于研究對象詳細的信息無法獲得(如年齡、性別、吸煙史、飲酒史和生活情況等),我們未經(jīng)調(diào)整的評估結果需要今后的研究來證實。

總之,本次研究通過meta分析表明OGG1 Ser326Cys多態(tài)性與結直腸癌發(fā)病率無聯(lián)系,并且OGG1 Ser326Cys多態(tài)性在結直腸癌發(fā)病中不是一個孤立的風險因素。

[1]Levi F,Pasche C,La Vecchia C,et al.Food groups and colorectal cancer risk[J].Br J Cancer,1999,79(7-8):1283-1287.

[2]Hoeijmakers JH.Genome maintenance mechanisms for preventing cancer[J].Nature,2001,411(6835):366-374.

[3]Wood RD,Mitchell M,Sgouros J,et al.Human DNA repair genes[J].Science,2001,291(5507):1284-1289.

[4]Umar A,Boland CR,Terdiman JP,et al.Revised bethesda guidelines for hereditary nonpolyposis colorectal cancer(Lynchsyndrome)and microsatellite instability[J].J Natl Cancer Inst,2004,96(4):261-268.

[5]Farrington SM,Tenesa A,Barnetson R,et al.Germlinesusceptibility to colorectal cancer due to base-excision repairgene defects[J].Am J Hum Genet,2005,77(1):112-119.

[6]Cheng KC,Cahill DS,Kasai H,et al.8-Hydroxyguanine, an abundant form of oxidative DNA damage,causes G→T and A→C substitutions[J].J Biol Chem,1992,267(1):166-172.

[7]Dherin C,Radicella JP,Dizdaroglu M,et al.Excision of oxidatively damaged DNA bases by the human alpha-hOgg1 protein and the polymorphic alpha-hOgg1(Ser326Cys)protein which is frequently found in human populations[J].Nucleic Acids Res,1999,27(20):4001-4007.

[8]Audebert M,Radicella JP,Dizdaroglu M.Effect of single mutations in the OGG1 gene found in human tumors on the substrate specificity of the Ogg1 protein[J].Nucleic Acids Res,2000,28(14):2672-2678.

[9]Gackowski D,Speina E,Zielinska M,et al.Products of oxidative DNA damage and repair as possible biomarkers of susceptibility to lung cancer[J].Cancer Res,2003,63(16):4899-4902.

[10]Paz-Elizur T,Ben-Yosef R,Elinger D,et al.Reduced repair of the oxidative 8-oxoguanine DNA damage and risk of head and neck cancer[J].Cancer Res,2006,66(24):11683-11689.

[11]Tudek B.Base excision repair modulation as a risk factor for human cancers[J].Mol Aspects Med,2006,28(3-4):258-275.

[12]Kim JI,Park YJ,Kim KH,et al.hOGG1 Ser326Cys polymorphism modifies the significance of the environmental risk factor for colon cancer[J].World J Gastr oenterol,2003,9(5):956-960.

[13]Fearon ER.Human cancer syndromes: clues to the origin and nature of cancer[J].Science,1997,278(5340):1043-1050.

[14]Marnett LJ.Oxyradicals and DNA damage[J].Carcinogenesis,2000,21(3):361-370.

[15]Xing DY,Tan W,Song N,et al.Ser326Cys polymorphism in hOGG1 gene and risk of esophageal cancer in a Chinese population[J].Int J Cancer,2001,95(3):140-143.

[16]Hill JW,Evans MK.Dimerization and opposite basedependent catalytic impairment of polymorphic S326C OGG1 glycosylase[J].Nucleic Acids Res,2006,34(5):1620-1632.

[17]Sidorenko VS,Grollman AP,Jaruga P,et al.Substrate specificity and excision kinetics of natural polymorphic variants and phosphomimetic mutants of human 8-oxoguanine-DNA glycosylase[J].FEBS J,2009,276(18):5149-5162.

[18]Shinmura K,Yokota J.The OGG1 gene encodes a repair enzyme for oxidatively damaged DNA and is involved in human carcin ogenesis[J].An tioxid Red ox Signal,2001,3(4):597-609.

[19]Elahi A,Zheng Z,Park J,et al.The human OGG1 DNA repair enzyme and its association with orolaryngeal cancer risk[J].Carcinogenes,2002,23(7):1229-1234.

[20]Takezaki T,Gao CM,Wu JZ,et al.hOGG1 Ser(326)Cys polymor phism and modification by environmental factors of stomach cancer risk in Chinese[J].Int J Cancer,2002,99(4):624-627.

[21]Kohno T,Kunitoh H,Toyama K,et al.Association of the OGG1-Ser326Cys polymorphism with lung adenocarcinoma risk[J].Cancer Sci,2006,97(8):724-728.

[22]Le Marchand L,Donlon T,Lum-Jones A,et al.Association of the hOGG1 Ser326Cys polymorphism with lung cancer risk[J].Cancer Epidemiol Biomarkers Prev,2002,11(4):409-412.

[23]Hansen R,Saebo M,Skjelbred CF,et al.GPX Pro198Leu and OGG1 Ser326Cys polymorphisms and risk of development of colorectal adenomas and colorectal cancer[J].Cancer Lett,2005,229(1):85-91.

[24]Moreno V,Gemignani F,Landi S,et al.Polymorphisms in genes of nucleotide and base excision repair: risk and prognosis of colorectal cancer[J].Clin Cancer Res,2006,12(7Pt1):2101-2108.

[25]Pardini B,Naccarati A,Novotny J,et al.DNA repair genetic polymorphisms and risk of colorectal cancer in the Czech Republic[J].Mutat Res,2008,638(1-2):146-153.

[26]Sliwinski T,Krupa R,Wisniewska-Jarosinska M,et al.Common polymorphisms in the XPD and hOGG1 genes are not associated with the risk of colorectal cancer in a Polish population[J].Tohoku J Exp Med,2009,218(3):185-191.

[27]Handoll HH.Systematic reviews on rehabilitation interventions[J].Arch Phys Med Rehabil,2006,87(6):875.

[28]Higgins JP,T hompson SG,Deek s JJ,et al.Measuring inconsistency in meta-analyses[J].BMJ,2003,327(7414):557-560.

[29]DerSimonian R,Kacker R.Random-effects model for metaanalysis of clinical trials: an update[J].Contemp Clin Trials,2007,28(2):105-114.

[30]Mantel N,Haenszel W.Statistical aspects of the analysis of data from retrospective studies of disease[J].J Natl Cancer Inst,1959,22(4):719-748.

[31]Egger M,Davey Smith G,Schnei der M,et al.Bias in metaanalysis detected by a simple, graphical test[J].BMJ,1997,315(7109):629-634.

[32]Yamane A,Kohno T,Ito K,et al.Differential ability of polymorphic OGG1 proteins to suppress mutagenesis induced by 8-hydroxygua nine in human cell in vivo[J].Carcinogenes,2004,25(9):1689-1694.

[33]Li H,Hao X,Zhang W,et al.The hOGG1 Ser326Cys polymorphism and lung cancer risk: a meta-analysis[J].Cancer Epidemiol Biomarkers Prev,2008,17(7):1739-1745.

[34]Willett WC,Stampfer MJ,Colditz GA,et al.Relation of meat, fat,and fiber intake to the risk of colon cancer in a prospective study among women[J].N Engl J Med,1990,323(24):1664-1672.

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