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基于壓縮感知的核磁共振圖像重建的Bregman方法

2012-11-21 01:22:45楊曉蘭朱永貴叢佳劉平
關(guān)鍵詞:范數(shù)正則信噪比

楊曉蘭,朱永貴,叢佳,劉平

(中國(guó)傳媒大學(xué)理學(xué)院,北京 100024)

基于壓縮感知的核磁共振圖像重建的Bregman方法

楊曉蘭,朱永貴,叢佳,劉平

(中國(guó)傳媒大學(xué)理學(xué)院,北京 100024)

由于一些器官的邊界信息在大多數(shù)核磁共振圖像中都是稀疏的,所以利用壓縮感知從數(shù)量非常有限的觀測(cè)數(shù)據(jù)集合中重構(gòu)同樣的核磁共振圖像并且大大減少核磁共振圖像的掃描磨損成為可能。然而,為了能夠做到這一點(diǎn),我們必須要解決定義在大量數(shù)據(jù)集合上的非光滑函數(shù)的最小化這一困難問(wèn)題。為了解決這一問(wèn)題,我們給出了一個(gè)有效算法,它克服以往求解l1問(wèn)題的計(jì)算復(fù)雜性,提出β范數(shù)近似逼近l1范數(shù)的思想,由于β范數(shù)具有光滑性,可采用Bregman迭代正則化方法進(jìn)行求解。數(shù)值實(shí)驗(yàn)證明,核磁共振圖像可以從全部數(shù)據(jù)的40%抽樣中幾乎精確重構(gòu)。

壓縮感知;核磁共振成像;重構(gòu)算法;Bregman方法

1 引言

對(duì)于壓縮感知成像,其目的是盡可能減少探測(cè)單元數(shù)量,更精確的重構(gòu)出圖像。因此在感知信息獲取投影方面,該方面的研究需要沿著以下幾個(gè)方面進(jìn)行:(a)投影方法的選擇,投影方法需要滿(mǎn)足以下三個(gè)條件:1)在信息采集方面,能夠使需要進(jìn)行的測(cè)量盡量少;2)便于投影方法的硬件實(shí)現(xiàn)和優(yōu)化算法的迭代運(yùn)算;3)能夠適用于大多數(shù)的稀疏情況。(b)尋找穩(wěn)定性更高,重建精度更好的重構(gòu)算法,使得獲得的圖像的精度滿(mǎn)足實(shí)際應(yīng)用需要。

如今,成像在醫(yī)療診斷方面起到了著非常重要的作用。事實(shí)表明減少掃描時(shí)間非常重要,即減少核磁共振成像所需要的時(shí)間,那就意味著在保證圖像質(zhì)量的情況下,盡可能少地從頻域中收集觀測(cè)數(shù)據(jù)。然而,這看上去直接違背了長(zhǎng)期以來(lái)建立的奈奎斯特標(biāo)準(zhǔn):即所獲得的觀測(cè)數(shù)據(jù)的數(shù)量必須至少與恢復(fù)圖像所需要的信息數(shù)量相匹配。這就意味著完美的圖像重構(gòu)將是不可能的,但壓縮感知允許我們?cè)跊](méi)有相關(guān)噪聲的情況下重構(gòu)圖像。

我們給出了一個(gè)有效算法,它克服以往求解l1問(wèn)題的計(jì)算復(fù)雜性,提出β范數(shù)近似逼近范數(shù)的思想,由于β范數(shù)具有光滑性,可采用Bregman迭代正則化方法進(jìn)行求解。數(shù)值實(shí)驗(yàn)證明,核磁共振圖像可以從全部數(shù)據(jù)的40%抽樣中幾乎精確重構(gòu)。

2 基于壓縮感知的核磁共振圖像重建的Bregman方法

通過(guò)壓縮感知我們得到b=Ru,其中傳感矩陣R是大小為m×n的矩陣?,F(xiàn)在若想通過(guò)已經(jīng)得到的b恢復(fù)出原信號(hào)u,則通過(guò)直接求解上述方程組是無(wú)法得到,因?yàn)樯鲜龇匠探M的未知數(shù)個(gè)數(shù)n大于方程個(gè)數(shù)m。如果一個(gè)方程組中未知數(shù)個(gè)數(shù)多于方程個(gè)數(shù),則一般有無(wú)窮解,通常的求解方法為[1]:

(1)尋求更多的方程;

(2)選自由變量,給一組線性無(wú)關(guān)的值后,進(jìn)行求解。

如果未知u的其它信息,則上述逆問(wèn)題很難求得唯一解。但若信號(hào)u是k-稀疏的,設(shè)m≥k·log(n),則上述方程組可以求解,因?yàn)榇藭r(shí)未知數(shù)個(gè)數(shù)事實(shí)上只有k個(gè)。盡管如此,由于我們并不知道u中哪些分量為零,所以不能直接求解,而是通過(guò)下式求最稀疏的向量,從而獲得u:

(2.1)

其中‖·‖0表示u中非零元素的個(gè)數(shù)。然而,盡管從理論上來(lái)講,這種方法可以實(shí)現(xiàn),但是在實(shí)際中不可行,因?yàn)檫@是一個(gè)組合問(wèn)題(NP難問(wèn)題),計(jì)算量非常大。因此我們需要尋求合適的范數(shù)來(lái)近似求解上述問(wèn)題。采用l1范數(shù)最小化求得的解,為稀疏向量,非常接近最小化l0范數(shù)所得的真實(shí)解。因此,我們可以選擇l1范數(shù)最小化來(lái)近似求解上述優(yōu)化問(wèn)題,即

(2.2)

剛才討論的信號(hào)u本身是稀疏的,接下來(lái)討論信號(hào)u本身并不稀疏,但是可以壓縮的情況。我們需要將信號(hào)變換到變換域考慮。設(shè)Ф是壓縮基(如小波基)或緊框架,滿(mǎn)足規(guī)范正交,即Ф*Ф=I,作變換Фu=x,顯然x是稀疏的。于是在這種情況下的求解方法為:

(2.3)

其中A=RФ-1,并且要求m≥μ2(R,Ф-1)·k·logn。

以上考慮的都是等式約束,然而實(shí)際中,測(cè)量過(guò)程可能會(huì)引入噪聲,這時(shí)約束條件式中的Ax=b必須被放松,從而引出問(wèn)題

(2.4)

或者問(wèn)題

(2.5)

其中σ與μ是參數(shù)。從最優(yōu)化理論上來(lái)說(shuō),問(wèn)題(2.4)和(2.5)在某種意義上是等價(jià)的,解決了其中一個(gè)問(wèn)題就能決定另一個(gè)問(wèn)題的參數(shù),使得它倆能夠給出相同的解[2]。

我們將提出β范數(shù)近似逼近l1范數(shù)的思想,他克服了以往求解l1問(wèn)題的計(jì)算復(fù)雜性的問(wèn)題,由于β范數(shù)具有光滑性,使得模型可采用Bregman迭代正則化方法進(jìn)行求解。

(2.6)

令J(u)=μ|u|β,基于凸函數(shù)J(u)的u,v之間的Bregman距離定義為:

p∈?J(v)是J在v點(diǎn)的次微分中的某一個(gè)次梯度。

可通過(guò)求解:

(2.8)

k=0,1,2,3…

u0=0,p0=0(k=0為原始問(wèn)題(2.6))來(lái)替代對(duì)(2.6)問(wèn)題的求解,其證明參見(jiàn)文獻(xiàn)[3]。

因?yàn)镴(u)不是處處可微,故J(u)的次微分可能包含不止一個(gè)元素,從(2.8)中uk+1的最優(yōu)性,對(duì)(2.8)關(guān)于u求偏導(dǎo)再以u(píng)k+1替換可以得到:

0∈?J(uk+1)-pk+A*(Auk+1-b)

因此令:

pk+1=pk+A*b-A*Auk+1。

(2.8)與(2.6)的區(qū)別在于正則化的應(yīng)用,(2.6)通過(guò)直接最小化u的β-范數(shù)將其正則化,而(2.8)是通過(guò)最小化u的基于β-范數(shù)的Bregman距離將其正則化。

文獻(xiàn)[3]中的數(shù)值結(jié)果表明,當(dāng)u足夠大,這一簡(jiǎn)單迭代過(guò)程明顯改進(jìn)了原始模型(2.6)的去噪能力。

除了對(duì)于迭代過(guò)程k=0,對(duì)于所有的k,(2.8)可以演繹為問(wèn)題(2.6)只要滿(mǎn)足:

bk+1:=b+(bk-Auk)
b0=u0=0

其初始條件為:b0=u0=0,因此迭代過(guò)程(2.8)可以等價(jià)于

(2.9)

(2.9)可以通過(guò)任意一種已存在的求解(2.6)的方法求解。

方法一:

u0←0,p0←0

(2.81)

Fork=0,1,…do

(2.82)

pk+1←pk-A*(Auk+1-b)

(2.83)

方法二:

b0←0,u0←0

(2.91)

Fork=0,1,…,N,do

bk+1=b+(bk-Auk)

(2.92)

(2.93)

在方法一中,給出uk,pk,uk+1滿(mǎn)足一階最優(yōu)條件:

0∈?J(uk+1)-pk+▽H(uk+1)
=?J(uk+1)-pk+A*(Auk+1-b)

因此:

pk+1=pk-A*(Auk+1-b)∈?J(uk+1)

定理二表示Bregman迭代過(guò)程的方法一(2.81)-(2.83),方法二(2.91)-(2.93)在(2.82)及(2.93)有相同的目標(biāo)函數(shù)(達(dá)到同一個(gè)常量)的情況下是等價(jià)的。

由(2.91)可以得出:b1=b因此當(dāng)k=0時(shí),(2.82)(2.93)求解相同的最優(yōu)化問(wèn)題:

A*(b-Au)
=wF*P*(b-PFw-1u)

故:

根據(jù)(2.83)p0=0,b=b1可以得到:

試證明:

(i) (2.82)(2.93)最優(yōu)化問(wèn)題的第k次迭代是等價(jià)的

關(guān)于(i)的證明:由假設(shè)可知:

其中C1,C2,C3為常數(shù),因此(2.82)(2.93)有相同的目標(biāo)函數(shù);

由(i)及[4]的結(jié)論可以得到;

關(guān)于(iii)的證明:根據(jù)假設(shè)以及(2.83)(2.92),及(ii)可以得到:

pk+1=pk-A*(Auk+1-b)

=pk-wF*P*(PFw-1uk+1-b)

注:如果J不是嚴(yán)格凸函數(shù),方法一、二也許會(huì)求的不止一個(gè)解,上面的證明過(guò)程告訴我們,即使方法一及方法二的某一步迭代產(chǎn)生了不同的中間值,他們之后還是會(huì)產(chǎn)生相同的結(jié)果。

(2.93)的每次迭代都是(2.6)的一個(gè)實(shí)例,都可以通過(guò)FPC(Fixed-point continuation Methed)[5]來(lái)求解,盡管對(duì)任何嚴(yán)格正的μ都能得到收斂的結(jié)果,我們還是要選取能使得(2.6)可以用FPC有效求解的μ,并且使得Bregman迭代的總時(shí)間是最優(yōu)的。

下面我們將求解模型:

(2.9)

bk+1=b+(bk-Auk)

此時(shí)u是近似稀疏信號(hào),且A=PF指的是部分傅利葉變換,如果令x代表原始信號(hào),w代表小波變換,那么可以得到u=wx,同樣的x=w-1u,因?yàn)樵趯?shí)際計(jì)算時(shí),能直接得到并且可以做初值的是原始信號(hào),所以需要對(duì)模型中的u做一個(gè)替換,用wx替換u,那么我們可以得到:

由于A=PF而w代表小波變換,對(duì)原始圖進(jìn)行完小波變換后,不能直接對(duì)稀疏信號(hào)進(jìn)行福利葉變換,故要對(duì)稀疏信號(hào)再進(jìn)行一次逆小波變換再進(jìn)行傅利葉變換,此時(shí)為使模型簡(jiǎn)單,繼續(xù)用u=wx替換wx但同時(shí)要加入逆小波變換那么得到:

但是此時(shí)使A=PFw-1,下面我們就對(duì)上述模型進(jìn)行計(jì)算推導(dǎo)。

令導(dǎo)數(shù)為0,那么式子變?yōu)椋?/p>

需要求解上式中的u,我們使用逐步遞歸的方法,用u(k+1)代替u得到:

在分母部分用u(k)代替u(k+1),并且去分母,得到:

利用

b(k+1)←b+(b(k)-Au(k))

得到:

μu(k+1)+A*(Au(k+1)-b-(b(k)-Au(k)))

合并同類(lèi)項(xiàng)得到:

A=PFw-1

A*A=(PFw-1)*(PFw-1)=wF*P*PFw-1

A*Au(k)=wF*P*PFw-1u(k)

A*=wF*P*

A*b=wF*P*b

那么就得到:

對(duì)兩邊同時(shí)進(jìn)行逆小波變換、傅里葉變換。得到:

具體算法如下:

b0←0,u0←0
For:k=0,1,…,N,do
bk+1=b+(bk-Auk)

(3.0)

bk=bk+1
kk=uk+1

3 數(shù)值實(shí)驗(yàn)

在壓縮的核磁共振成像中,采樣矩陣A是由A=RФ-1給出的,其中Ф是一個(gè)小波變換,R是一個(gè)部分二維離散傅里葉變換。假設(shè)一個(gè)核磁共振圖像有n個(gè)像素。在我們的算法中,R是從相應(yīng)于一個(gè)完整的二維離散傅里葉變換的n×n階矩陣中隨機(jī)抽取m行組成的,即R=PF,其中P是從n×n階單位矩陣中隨機(jī)抽取m行組成的矩陣,F(xiàn)是二維離散傅里葉變換矩陣,m?n。所選的m行指出所選擇的頻率,在這些頻率中,b中的觀測(cè)數(shù)據(jù)被收集。m值越小,通過(guò)一個(gè)核磁共振掃描器來(lái)獲取b所需要的時(shí)間就越少。在核磁共振成像中,我們有一定的自由來(lái)選擇行(然而,實(shí)際的限制可能會(huì)影響我們的選擇,但是這已經(jīng)超出了這篇論文的討論范圍)。在我們的實(shí)驗(yàn)中,由R估量得出的傅里葉系數(shù)并不是在隨機(jī)的頻率中選取的。我們是通過(guò)以下方式來(lái)選擇的:在k-space中,我們分別采取了兩種不同采樣方法進(jìn)行試驗(yàn):一種采樣是沿著一定數(shù)量的從中心散開(kāi)的呈輻射狀的直線來(lái)選取,即半徑抽樣。例如圖4.1顯示了在一個(gè)k-space中的22*5條輻射狀直線,即這是22*5 views抽樣頻域圖;另一種則是矩形采樣,例如圖4.2顯示了在一個(gè)中采樣的區(qū)域(白色部分為采樣區(qū)域)。我們發(fā)現(xiàn)這種選擇允許我們從數(shù)量較少的采樣數(shù)據(jù)中,而不是整體隨機(jī)采樣選擇來(lái)恢復(fù)方形的核磁共振圖像。實(shí)際上,在一個(gè)核磁共振成像掃描中,頻率的集合以及采樣的速度都是受物理和心理極限限制的,所以我們的采樣方法是理想化的。

白色顯示的是采樣位置,這時(shí)的采樣率是圖1:42.38%,圖2:42.95%。

圖1 圖2

(3.1)

我們?cè)?56×256的心臟原始圖像核磁共振圖像上檢測(cè)我們的編碼。在所有的檢測(cè)問(wèn)題中,采用的噪聲是均值為0方差為0.01的高斯白噪聲。對(duì)256×256的心臟原始圖像進(jìn)行110 views、66views、22 views頻域抽樣,重構(gòu)的圖像如圖3每組圖中圖(a)為原始圖像圖(b)、(c)、(d)為恢復(fù)后圖像。然后,我們?cè)賹?duì)256×256的心臟原始圖像進(jìn)行矩形區(qū)域抽樣,重構(gòu)的圖像如圖4示,每組圖中圖(a)為原始圖像,圖(b)、(c)、(d)為恢復(fù)后圖像。

在數(shù)值試驗(yàn)中,相對(duì)誤差(Relative Error)和信噪比(Signal to Noise Rations,簡(jiǎn)稱(chēng)SNR)用來(lái)評(píng)估重構(gòu)圖像的質(zhì)量。相對(duì)誤差和信噪比的定義如下:

(3.2)

(3.3)

(a) (b)

(c) (d)

圖3(a)是原始心臟圖像;(b)、(c)和(d)分別是恢復(fù)后的圖像,它們的采樣率分別是42.18%、26.85%和9.36%。

(a) (b)

(c) (d)

圖4 (a)是原始心臟動(dòng)脈圖像;(b)、(c)和(d)是恢復(fù)后的圖像,它們的采樣率分別是42.95%、24.29%和14.44%.

圖5 半徑采樣下相對(duì)誤差、信噪比CPU時(shí)間與采樣率之間的關(guān)系

圖6 矩形采樣下相對(duì)誤差、信噪比、CPU時(shí)間與采樣率之間的關(guān)系

表1半徑采樣下核磁共振圖像重建實(shí)驗(yàn)結(jié)果:

表1

表2矩形采樣下核磁共振圖像重建實(shí)驗(yàn)結(jié)果

表2

4 結(jié)論

在這篇論文中,基于壓縮感知理論,我們通過(guò)較少數(shù)量的觀測(cè)數(shù)據(jù)來(lái)恢復(fù)核磁共振圖像,對(duì)此,我們研發(fā)了一個(gè)有效算法,它克服以往求解問(wèn)題的計(jì)算復(fù)雜性,提出β范數(shù)近似逼近l1范數(shù)的思想,由于β范數(shù)具有光滑性,可采用Bregman迭代正則化方法進(jìn)行求解,這在l1問(wèn)題的求解方面是一種新穎的方法。在真實(shí)的核磁共振圖像上進(jìn)行的數(shù)值實(shí)驗(yàn)表明,這種算法可以在采樣率相對(duì)較小的情況下,使用不到一分鐘的時(shí)間來(lái)恢復(fù)忠實(shí)于原圖的正方形圖像。通過(guò)對(duì)相對(duì)誤差、信噪比和CPU時(shí)間的對(duì)比,我們知道通過(guò)使用最優(yōu)化技巧,例如光滑以及更有效的線性搜索等,我們的算法速度仍然可以加快。然而,本論文未能就Bregman法的收斂速度進(jìn)行系統(tǒng)分析,對(duì)這種方法的理論分析也缺乏詳細(xì)的研究,這些問(wèn)題要留待以后再解決。另外,我們認(rèn)為,這篇論文中所闡述的壓縮感知的算法可以被延拓到其他相關(guān)的圖像以及可視化的應(yīng)用中。

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(責(zé)任編輯:王 謙)

TheBregmanMethedResearchonImageReconstructionBasedonCompressiveSensing

YANG Xiao-lan,ZHU Yong-gui,CONG Jia,LIU Ping

(School of Sciences,Communication University of China,Beijing 100024,China)

Because information such as boundaries of organs is very sparse in most MR images,compressed sensing makes it possible to reconstruct the same MR images from a very limited set of measurements significantly reducing the MRI scan duration.In order to do that,however,one has to solve the difficult problem of minimizing nonsmooth functions on large data sets.To handle this,we propose an efficient algorithm that It has overcome the computational complexity of solving thel1problem,this paper puts forwardβnorm approximationl1norm thought,becauseβnorm with slickness,one can use Bregman iterative regularization method to solve this problem.The numerical experiments demonstrate that original MR images can be reconstructed exactly from the mere 40 percent of the complete set of measurements by our approach.

compressed sensing;magnetic resonance imaging;reconstruction algorithm;The Bregman methed

2012-06-06

中國(guó)傳媒大學(xué)理科規(guī)劃項(xiàng)目(XNL1105)

楊曉蘭(1985-),女(滿(mǎn)族),新疆昌吉人,中國(guó)傳媒大學(xué)理學(xué)院碩士研究生.E-mail:yxlan_2010@163.com

TP391

A

1673-4793(2012)04-0018-09

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