董嘉文,孫敏華,李林林,袁建豐,鄺瑞歡,胡奇林
(廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動物衛(wèi)生研究所 廣東省獸醫(yī)公共衛(wèi)生公共實驗室,廣州 510640)
番鴨細(xì)小病毒病多發(fā)生于1~3周齡的雛番鴨,又稱為“三周病”,它是由番鴨細(xì)小病毒(Muscovy duck parvovirus,MPV)引起的以呼吸困難、腹瀉、腳軟以及進(jìn)行性消瘦為主要癥狀的番鴨疫病[1,2]。番鴨細(xì)小病毒(MPV)屬于細(xì)小病毒科細(xì)小病毒屬,其基因組為單鏈線性 DNA,基因組全長為5132 bp,包含兩個主要開放閱讀框架(open reading frame, ORF),兩個 ORF 位于同一讀碼框內(nèi)[3]。左側(cè)ORF編碼非結(jié)構(gòu)蛋白NS(NS1、NS2),編碼二者基因的起始密碼子的位置不同,但共用同一終止密碼子。NS1基因含有1884個核苷酸,編碼628個氨基酸,NS1蛋白參與病毒對細(xì)胞的毒性作用、病毒復(fù)制及基因表達(dá)[4]。NS2 蛋白能促進(jìn)NS1蛋白對細(xì)胞的毒性作用[5]?,F(xiàn)已證明NS1蛋白具有與ATP結(jié)合、ATPase活性、解旋酶活性等功能[6]。右側(cè) ORF 編碼病毒3種結(jié)構(gòu)蛋白分別是VP1、VP2 和VP3。目前關(guān)于番鴨細(xì)小病毒的研究主要集中在病毒的結(jié)構(gòu)蛋白上,而對非結(jié)構(gòu)蛋白的研究較少[7-9]。因此,本研究擴增了MPV NS1基因,進(jìn)行了克隆和序列分析,并成功表達(dá)和純化了具有生物學(xué)活性的NS1蛋白,為MPV診斷試劑盒、基因工程疫苗與NS1蛋白的結(jié)構(gòu)、功能研究奠定了基礎(chǔ)。
1.1 病毒 菌株 質(zhì)粒和試劑MPV 佛山分離株(MPV FS)、MPV 多克隆抗體、大腸埃希菌工程菌株 DH5α、Rosseta 感受態(tài)細(xì)胞、pET32a ( + )質(zhì)粒,均為廣東省農(nóng)業(yè)科學(xué)院動物衛(wèi)生研究所保存。BamH Ⅰ、XhoI 、T4 DNA 連接酶和 MiniBest病毒RNA/DNA抽提試劑盒購于寶生物工程有限公司;DNA凝膠回收試劑盒購和小量質(zhì)粒提取試劑盒購于天根生物科技有限公司;預(yù)染蛋白質(zhì)Marker為Fmentas公司產(chǎn)品,兔抗鴨IgG為Nordic公司產(chǎn)品。
1.2 引物設(shè)計根據(jù) MPV FM 株 NS1基因序列(GenBank:U22967), 利用 primer 5.0軟 件 設(shè)計一對NS1基因的特異性引物,預(yù)擴增片段長大約1900 bp,由上海英濰捷基生物技術(shù)公司合成,NS1-P1:5'-GCGGGATCCATGGCATTTTCTAGGC-3' (BamH I),NS1-P2: 5'-GCGCTCGAG TTGTTCATTCTCCATATCA -3'(XhoI)。
1.3 MPV NS1基因的PCR擴增以提取的 MPV FS株DNA為模板進(jìn)行 PCR,25 μL PCR反應(yīng)體系:10×ExTaqbuffer 2.5 μL,dNTPs(2.5 mM)2.0 μL,P1(10 pmol/μL)1.0 μL ,P2(10 pmol/μL) 1.0 μL,ExTaqDNA 聚合酶(5 U/μL)0.125 μL,DNA 2 μL,加 ddH2O 至 25 μL。反應(yīng)條件:94℃ 預(yù)變性 5 min;94℃變性 30 s,53℃退火30 s,72℃延伸 2 min,循環(huán) 30次;最后 72℃延伸10 min,10 g/L 瓊脂糖凝膠電泳分析擴增產(chǎn)物,回收目的片段。
1.4 目的基因的克隆與鑒定將回收的PCR產(chǎn)物克隆入pMD18-T-Simple 載體上,連接反應(yīng)體系:pMD18-T-Simple 1 μL、NS1 基因回收片段 4 μL和 Solution I 5 μL; 16℃連接過夜后轉(zhuǎn)化 DH5α 感受態(tài)細(xì)胞,將培養(yǎng)液涂布于含 Amp(100 mg/ L)的平板上,37℃培養(yǎng)過夜,挑選單個菌落進(jìn)行菌落PCR,提取質(zhì)粒經(jīng)過雙酶切鑒定正確后,將陽性克隆送上海英濰捷基生物技術(shù)公司測序。運用DNAStar 軟件對測序所得的序列與MPV FM株進(jìn)行相似性比較。
1.5 重組原核表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定將測序正確的pMD18-T-NS1陽性質(zhì)粒和原核表達(dá)載體 pET32a(+)分別用BamH Ⅰ和XhoI 雙酶切,分別回收酶切后的NS1片段與線性化后的pET32a (+),加入T4-DNA連接酶于16℃連接過夜,并將連接產(chǎn)物轉(zhuǎn)化DH5α 感受態(tài)細(xì)胞,將培養(yǎng)液涂布于含 Amp (100 mg/ L) 的平板上,37℃培養(yǎng)過夜,挑選單個菌落進(jìn)行菌落 PCR 和酶切鑒定。
1.6 重組菌在 Rosetta中的初步表達(dá)鑒定將pET32a-NS1陽性菌液按1:100比例加入5 mL含Amp 的LB液體培養(yǎng)基,37℃ 180 rpm振蕩培養(yǎng),等OD600值到0.5~0.8 時,取 1 mL 菌液于 1.5 mL 離心管中作為誘導(dǎo)前對照,加入 IPTG 至終濃度為 1.0 mmol/ L,誘導(dǎo)5 h 停止培養(yǎng)。將pET32a-NS1誘導(dǎo)菌、未誘導(dǎo)pET32a- NS1 菌液以及誘導(dǎo)的 pET32a (+)空載體 10 800×g離心 1 min,加入 50 μL PBS 重懸菌體,然后加入2×SDS 凝膠上樣緩沖液50 μL,沸水中煮10 min,10 800×g離心 1 min,取 10 μL 上清上樣進(jìn)行SDS-PAGE,凝膠經(jīng)考馬斯亮藍(lán)染色,脫色后分析。
1.7 重組蛋白的可溶性分析按照確定的最佳誘導(dǎo)表達(dá)條件對100 mL pET32a-NS1 陽性菌進(jìn)行誘導(dǎo)表達(dá)。首先將菌液 9000×g、4℃離心 10 min 收集菌體,加入20 mL PBS 重懸菌體,置冰浴中超聲破裂解菌。超聲完畢后 10 800×g、4℃離心 10 min,分別收集上清和沉淀,經(jīng)SDS-PAGE電泳檢測和凝膠經(jīng)考馬斯亮藍(lán)染色,脫色后分析蛋白的可溶性。
1.8 重組蛋白的提取及純化參照Novagen 公司的Ni-NTA His.Bind 操作說明進(jìn)行,離心收集 200 mL誘導(dǎo)宿主菌,加入20 mL PBS 重懸菌體,置冰浴超聲使菌體裂解至溶液清亮,離心棄上清,用 10 mL Binding Buffer(含 8 M 尿素)重懸菌體,冰浴 1 h后,4℃、 10 000 ×g離心 20 min,收集上清,即為溶解的包涵體。將1 mL 50%的Ni-NTA 樹脂懸浮液加到10 mL細(xì)胞裂解液中,輕柔混勻,室溫結(jié)合30 min,將混合液裝柱;然后分別用pH值為8.0、6.3、4.5的含8 M 尿素緩沖液洗脫柱子上的蛋白,并且每次都要收集流出液,用于SDS-PAGE電泳分析。
1.9 重組蛋白的Western blot檢測按照上述處理重組蛋白樣品并做SDS-PAGE,隨后將電泳蛋白轉(zhuǎn)移至NC膜上,5V 轉(zhuǎn)印1 h后,NC 膜用5%脫脂奶粉4℃封閉過夜;PBST 洗膜 3次,每次 5 min;1:50 稀釋MPV 多克隆抗體,37℃孵育1 h;PBST洗膜3次,每次 5 min;加入 1:2000 稀釋的 HRP 標(biāo)記的兔抗鴨IgG ,37℃孵育 1 h后洗膜 3次,每次 5 min;然后用DAB顯色進(jìn)行分析。
2.1 PCR 擴增MPV NS1 基因的 PCR 擴增產(chǎn)物電泳后,可見一條約 1900 bp 特異性的條帶,與預(yù)期片段大小相一致(見圖1)。運用 DNAStar 軟件對測序所得的序列與MPV FM 株進(jìn)行相似性比較發(fā)現(xiàn):MPV FS 株 NS1 基因核苷酸序列與 MPV FM 株(登錄號:U22967)相似性為99.3%,僅有13個堿基的差異;NS1 基因推導(dǎo)所得的氨基酸序列與以上毒株的相似性為98.4%,有10個氨基酸差異。
圖 1 MPV-NS1 基因 PCR 擴增Fig.1 PCR-amplifi ed NS1 gene from MPV
2.2 重組表達(dá)載體的構(gòu)建與鑒定將測序正確的NS1片段與表達(dá)載pET32a(+)連接,并轉(zhuǎn)化至大腸桿菌Rosetta,挑取單菌落培養(yǎng)并提取質(zhì)粒,經(jīng)過BamHⅠ和XhoI 雙酶切鑒定,電泳可見兩條大小分別為 1900 bp 和5900 bp 清晰條帶,前者為 NS1基因,后者為pET32a (+) 載體片段,說明NS1基因正確插入到表達(dá)載體中(見圖2),將該重組質(zhì)粒命名為pET32a-NS1。
圖2 pET32a-NS1 質(zhì)粒酶切鑒定Fig.2 Identifi cation of recombinant plasmid pET32a-NS1 by restriction enzymes digestion
2.3 重組表達(dá)質(zhì)粒的SDS-PAGE分析重組表達(dá)質(zhì)粒pET32a-NS1轉(zhuǎn)化大腸桿菌Rosetta,經(jīng) IPTG誘導(dǎo)獲得高效表達(dá)。SDS-PAGE分析結(jié)果表明,大約在92 kDa處出現(xiàn)一條特異性蛋白條帶,與預(yù)期的蛋白分子量大小一致,而對照泳道無該條帶(見圖3)。融合蛋白主要以包涵體形式存在于沉淀中,但上清中也有少量的融合蛋白(見圖4)。
2.4 Western blot檢測結(jié)果對pET32a-NS1重組蛋白進(jìn)行Western blot分析,結(jié)果顯示在92 kDa處出現(xiàn)一條特異條帶,說明純化重組蛋白在大腸桿菌中獲得正確表達(dá),并且能被 MPV多克隆抗體所識別,表明該蛋白具有良好的反應(yīng)原性(見圖5)。
圖4 pET32a-NS1表達(dá)產(chǎn)物的可溶性分析Fig.4 The analysis of solubility of pET32a-NS1 expression products
圖5 pET32a-NS1表達(dá)產(chǎn)物的Western blot 分析Fig.5 Western blot analysis of pET32a-NS1
番鴨細(xì)小病毒病由林世堂等[10]學(xué)者首次報道,隨后國內(nèi)外學(xué)者對番鴨細(xì)小病毒的生物學(xué)特性及番鴨細(xì)小病毒病的診斷與防制進(jìn)行了研究[3,11,12]。Zadori等[13]首次報道了 MPV的全基因組序列,比較分析發(fā)現(xiàn)MPV和GPV的基因組有81.9%同源性。張云等[14]對1株鵝細(xì)小病毒EP22和2株番鴨細(xì)小病毒DV2、J3D6株的全長基因進(jìn)行測序分析,根據(jù)NS和VP1系統(tǒng)進(jìn)化樹分析表明:番鴨和鵝細(xì)小病毒來自共同的祖先,但隨著宿主的不同而演化為不同的分支。MPV NS1基因編碼MPV的非結(jié)構(gòu)蛋白NS1蛋白,NS1蛋白是MPV基因組本身編碼的一種反式激活蛋白,對于其基因組的早期和晚期的轉(zhuǎn)錄都具有重要作用[15]。另外,NS1蛋白參與病毒DNA的復(fù)制及調(diào)節(jié)基因表達(dá)[4]。
本研究利用PCR擴增了MPV的NS1基因片段,經(jīng)過克隆和測序分析發(fā)現(xiàn),MPV FS株 NS1基因核苷酸和氨基酸序列與國外的FM株的相似性高達(dá)99.3%和98.4%,表明NS1基因是高度保守的。為了分析原核表達(dá)的NS1蛋白的生物學(xué)特性,本實驗構(gòu)建了pET32a-NS1表達(dá)載體,并在大腸桿菌Rosetta中成功表達(dá)。本試驗選擇的Rosetta菌株,是攜帶氯霉素抗性質(zhì)粒 BL21的衍生菌,能補充大腸桿菌缺乏的6種稀有密碼子(AUA、AGG、AGA、CUA、CCC、GGA)對應(yīng)的tRNA,從而提高了NS1基因在pET32a (+)中的表達(dá)水平。對原核表達(dá)產(chǎn)物的可溶性分析結(jié)果表明,表達(dá)的NS1蛋白主要以包涵體的形式存在于菌體裂解后的沉淀中。本研究中NS1蛋白在大量表達(dá)后用Ni柱進(jìn)行純化,獲得的蛋白含有雜蛋白,經(jīng)過改變純化所用緩沖液的PH值,雜蛋白有所減少。今后仍需要對純化條件進(jìn)行優(yōu)化,來獲得高純度的蛋白,這為MPV的診斷、抗原性分析以及蛋白的功能研究提供了基礎(chǔ)。
[1]魯國苗, 黃紹棠, 梁啟平, 等.雛番鴨細(xì)小病毒的初步分離[J].浙江畜牧獸醫(yī), 1998, 23(3): 36-37.
[2]程由銓, 林天龍, 胡奇林, 等.雛番鴨細(xì)小病毒病的病毒分離和鑒定[J].病毒學(xué)報, 1993, 9 (3): 228-235.
[3]Le Gall-Recule G, Jestin V.Biochemical and genomic characterization of Muscovy duck parvovirus[J].Arch Virol, 1994, 139(1-2):121-131.
[4]Cotmore S F, Christensen J, Nuesch J P,et al.The NS1 Polypeptide of Murine Parvovirus Minute Virus of Mice binds to DNA Sequences Containing the Motif (ACCA)223[J].J Virol, 1995, 69(3): 1652-1660.
[5]Smith D H,Wand P, Linden R M.Comparative Characterization of REP Proteins from the Helper Dependent Adeno-Associated Virus Type 2 and the Artonomous Goose Parvovirusr[J].J Virol, 1999, 73(4):2930-2937.
[6]Pujol A, Deleu L, Nuesch J P,et al.Inhibitionof Parvovirus Minute Virus of Mice Replication by a Peptide Involved in the Oligomerzation of Nonstructural Protein NS1[J ].J Virol, 1997, 71(10): 7393-7403.
[7]婁華, 白挨泉, 顧萬軍, 等.番鴨細(xì)小病毒強、弱毒株VP2 基因的序列測定比較[J].病毒學(xué)報, 2001, 17(2):175-177.
[8]李雪梅, 章金剛, 向華, 等.鵝細(xì)小病毒和番鴨細(xì)小病毒核酸疫苗重組質(zhì)粒的構(gòu)建及表達(dá)[J].生物技術(shù)通訊,2002, 13(6): 433-435.
[9]季芳, 張毓金, 楊增岐, 等.番鴨細(xì)小病毒和鵝細(xì)小病毒廣東株 VP1 基因的克隆與序列分析[J].中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報, 2004, 26(4): 245-247.
[10]林世棠, 郁曉嵐, 陳炳鈿, 等.一種新的雛番鴨病毒性傳染病的診斷[J].中國畜禽傳染病, 1991, (2): 26-27.
[11]吳國棟, 任祖伊, 王耐娟, 等.雛番鴨兩種細(xì)小病毒病初探[J].養(yǎng)禽與禽病防治, 1994, (6): 910.
[12]程由銓, 胡奇林, 陳少鶯, 等.番鴨細(xì)小病毒和鵝細(xì)小病毒生化及基因組特性的比較[J].中國獸醫(yī)學(xué)報, 2001,21(5): 429-433
[13]Zadori Z , Stefaancsik R , Rauch T ,et al.Analysis of complete nucleotide sequence of goose and Muscovy duck parvovirus indicates common ancestral origin with adeno-associated virus [J].Virology, 1995, 212 (2): 562-573.
[14]張云, 耿宏偉, 郭東春, 等.鵝和番鴨細(xì)小病毒全基因克隆與序列分析[J].中國預(yù)防獸醫(yī)學(xué)報, 2008, 30(6): 415-419.
[15]張彥鵬, 李靜, 寇錚, 等.鴨細(xì)小病毒04 Nb 株的分離鑒定與rep 基因測序與分析[J].中國病毒學(xué), 2006, 21(2):173-177.