郭 明 黃鳳琴 劉咪咪 李銘慧
(浙江農(nóng)林大學(xué)化學(xué)系,臨安 311300)
蛋白質(zhì)組學(xué)以蛋白質(zhì)組(Proteome)為研究對象,從蛋白質(zhì)整體水平研究蛋白質(zhì)功能表達(dá),認(rèn)識生命活動規(guī)律[1-2]。人體蛋白質(zhì)組中,超過30%的蛋白質(zhì)含有單一或多個(gè)金屬離子,金屬離子對蛋白質(zhì)發(fā)揮生物學(xué)功能起著關(guān)鍵的作用[3]。金屬離子絡(luò)合物/復(fù)合物結(jié)構(gòu)、功能的研究是無機(jī)化學(xué)的重要內(nèi)容,而分析金屬離子與生物大分子(蛋白質(zhì)、DNA、酶等)的結(jié)合反應(yīng)性能是無機(jī)化學(xué)發(fā)展的前沿領(lǐng)域之一。
重金屬鉻離子主要以三價(jià)和六價(jià)形式存在,Crバ對人體有益,而Crボ影響生物體葡萄糖、脂肪、蛋白質(zhì)的新陳代謝[4-5],當(dāng)Crボ進(jìn)入血液后,可與血清中的高豐度組分如白蛋白、轉(zhuǎn)鐵蛋白、免疫球蛋白等相結(jié)合,發(fā)揮生物學(xué)效應(yīng)。血清白蛋白是人和動物血漿中含量最豐富的蛋白質(zhì),能夠與多種金屬離子相互作用[6-7],免疫球蛋白是人體和動物體發(fā)揮免疫作用的關(guān)鍵蛋白質(zhì),轉(zhuǎn)鐵蛋白則是人體和動物體內(nèi)運(yùn)送鐵等金屬離子的載體蛋白,故在組學(xué)條件下研究Crボ與血清蛋白質(zhì)組的結(jié)合反應(yīng)性能對于理解Crボ-蛋白質(zhì)分子的結(jié)構(gòu)、性能及生物體內(nèi)分布,闡釋Crボ-蛋白質(zhì)組絡(luò)合/復(fù)合作用機(jī)制,解釋鉻離子在生物體內(nèi)的代謝過程及評價(jià)Crボ的毒性具有一定的理論指導(dǎo)意義。
目前,生物活性小分子/離子與蛋白質(zhì)分子結(jié)合作用機(jī)制的研究是國內(nèi)外的研究熱點(diǎn)之一,核磁共振法[7]、熒光光譜法[8]、紅外光譜法[9]、圓二色譜法[10]等分析手段廣泛應(yīng)用,并取得了諸多成果,促進(jìn)該研究領(lǐng)域的發(fā)展,而利用色譜方法研究陸續(xù)也有報(bào)道。色譜方法中親和毛細(xì)管電泳(ACE)法具有樣品用量少、高靈敏度、高分辨率等特點(diǎn),通過ACE法研究重金屬離子與單一蛋白質(zhì)結(jié)合反應(yīng)的報(bào)道已有相應(yīng)文獻(xiàn)[11-18],而組學(xué)條件下通過ACE方法研究金屬離子與蛋白質(zhì)組結(jié)合反應(yīng)性能未見報(bào)道。重金屬離子與蛋白質(zhì)組的結(jié)合過程中,重金屬離子與所有蛋白質(zhì)相互結(jié)合,互相影響,故理想化的金屬離子與單一蛋白質(zhì)結(jié)合反應(yīng)模型不能全面反映金屬離子與蛋白質(zhì)的結(jié)合反應(yīng)機(jī)制,而在組學(xué)條件下研究更具有實(shí)際意義。牛血清具有與人血清結(jié)構(gòu)和氨基酸序列高度相似,且低廉易得等特點(diǎn),本文充分利用ACE對蛋白質(zhì)組的高效分離功能結(jié)合其對絡(luò)合物/復(fù)合物平衡性質(zhì)的檢測,研究Crボ與牛血清蛋白質(zhì)組結(jié)合反應(yīng)性能。通過分析Crボ與FBS高豐度組分結(jié)合反應(yīng)的有效淌度數(shù)據(jù),進(jìn)行非線性擬合,獲得Crボ與血清蛋白質(zhì)組中高豐度組分相互作用的表觀結(jié)合常數(shù),推斷Crボ與FBS結(jié)合反應(yīng)的動力學(xué)機(jī)制。
P/ACETMMDQ毛細(xì)管電泳儀(美國Beckman-Coulter公司);未涂層熔融石英毛細(xì)管柱(60.2 cm×50 μm I.D.,有效長度50 cm);KQ-250DB型數(shù)控超聲清洗器 (昆山市超聲儀器有限公司);Eppendorf移液槍(上??蠌?qiáng)儀器有限公司);ZD-2型精密酸度計(jì)(上海雷磁儀器廠);電子分析天平(十萬分之一,德國Sartorius公司);1810D自動雙重純水蒸餾器 (美國Millipore 公司)。
牛血清(Fetal bovine serum,FBS;Purity≥98%,杭州四季青生物工程材料有限公司);牛血清白蛋白(Bovine serum albumin,BSA;Purity≥96%,Sigma公司); 牛 轉(zhuǎn) 鐵 蛋 白(Bovine apo transferrin,bATF;Purity≥98%)、牛免疫球蛋白(Bovine IgG,IgG;Purity≥98%)購置于上海浩然生物技術(shù)有限公司;N,N-二甲基甲酰胺(N,N-dimethylformamide,DMF,上海華美生物工程公司);其它試劑均為分析純;實(shí)驗(yàn)用水為亞沸蒸餾去離子水。
1.2.1 ACE方法運(yùn)行緩沖液及樣品溶液的配制
稱取適量CrO3固體,以25 mmol·L-1Na2B4O7-NaOH空白緩沖液 (pH 9.27)溶解并配制成0.1 mmol·L-1Crボ儲備液 (CrO3在該 pH 下以 CrO42-存在,即鉻以六價(jià)形式存在[19-20],以Crボ,表示鉻與血清蛋白質(zhì)作用時(shí)的初始價(jià)態(tài),其并不代表鉻與血清蛋白質(zhì)作用時(shí)的最終化學(xué)式,后續(xù)Crボ表示相同含義)。移取系列不同體積Crボ儲備液,以Na2B4O7-NaOH緩沖液依次稀釋至所需濃度??瞻拙彌_液和各Crボ緩沖液均用0.45μm混合纖維素酯微孔過濾并脫氣5 min,待用。
解凍后的胎牛血清用過濾脫氣后的Na2B4O7-NaOH空白緩沖液以10∶1稀釋,加入適量過濾脫氣后的0.5%DMF(用于檢測電滲流和遷移時(shí)間的重現(xiàn)性)混勻,待用。
1.2.2 FBS中高豐度組分的分析
FBS溶液進(jìn)行ACE分析的測定條件:壓力進(jìn)樣:2.068 5 kPa,進(jìn)樣時(shí)間:3 s;檢測波長:214 nm;分離電壓:25 kV;柱溫:25℃。實(shí)驗(yàn)操作程序:將樣品瓶置于樣品槽中,用0.1 mol·L-1NaOH、去離子水及空白緩沖液分別沖洗3 min,壓力進(jìn)樣,分離獲得FBS電泳譜圖。
內(nèi)標(biāo)添加法進(jìn)行ACE分析確認(rèn)FBS高豐度組分:適量BSA,bATF及牛IgG用Na2B4O7-NaOH緩沖液配成 1×10-5mol·L-1標(biāo)準(zhǔn)樣品溶液,0.45 μm 混合纖維素酯微孔過濾。逐一適量添加BSA,bATF及牛IgG標(biāo)準(zhǔn)樣品溶液于FBS溶液中,渦旋搖勻,分別置于樣品瓶中,逐一通過ACE分析,檢測條件和程序同F(xiàn)BS溶液,獲得相應(yīng)的電泳譜圖。通過分析比較內(nèi)標(biāo)添加FBS溶液和FBS溶液電泳譜圖上遷移時(shí)間、峰高、峰面積變化情況,確定FBS中高豐度組分信息。
1.2.3 Crボ-FBS 相 互作 用體 系中 FBS 高豐 度組分有效淌度的測定
不含Crボ運(yùn)行緩沖液條件下,測定程序同1.2.2; 含 Crボ運(yùn)行緩沖液條件下,F(xiàn)BS 高豐度組分有效淌度的測定程序:實(shí)驗(yàn)前用0.1 mol·L-1NaOH、去離子水及空白緩沖液分別沖洗3 min,隨后用含相應(yīng)Crボ濃度運(yùn)行緩沖液沖洗5 min;其他測試程序同1.2.2,分別測定6次,求不同緩沖液條件下FBS中高豐度組分有效淌度的平均值。
針對非共價(jià)鍵配體M(金屬離子)-受體P(蛋白質(zhì)分子)之間的相互作用體系(n M+P→MnP),所形成的結(jié)合物MnP的表觀結(jié)合常數(shù)表達(dá)式如下:
受體P的平均電泳淌度(μ)變化值介于游離受體P(沒有配體M存在)的電泳淌度(μP)與結(jié)合物MnP的電泳淌度(μMnP)之間,其可以表示為[21-23]:
μMnP可用配體M濃度較高時(shí)測得受體P的電泳淌度(μMnP,∞)代替。將方程式(1)代入方程式(2),得到受體P的平均電泳淌度μ。
在ACE方法中,一般不能準(zhǔn)確獲得遷移區(qū)帶中游離態(tài)M的濃度cMf,在配體M的合理范圍內(nèi)(通常配體M的濃度高于受體P濃度的10~100倍[24])可設(shè)定cMf等于運(yùn)行緩沖液中配體M的濃度cM,進(jìn)而由受體P的μ值和cM估算結(jié)合常數(shù)KB。前人研究金屬離子與HSA(人血清白蛋白),BSA等單一蛋白質(zhì)分子結(jié)合反應(yīng)時(shí),多采用簡化模型方法而考慮1∶1的配合物情況,本文也采用類似的簡化方法。n=1時(shí),方程式(3)轉(zhuǎn)化為:
方程式(4)經(jīng)過處理可轉(zhuǎn)化為如下形式:
方程式(5)為以電泳淌度表示的位點(diǎn)結(jié)合模型,以1/(μ-μP)對1/cM進(jìn)行線性擬合,將所得直線的截距與斜率值相比即可得KB。但在實(shí)際的擬合過程中,μ與cM不存在線性關(guān)系,Bowser等[23]強(qiáng)調(diào)通過對ACE方法測得的數(shù)據(jù)進(jìn)行非線性擬合,特別在cM濃度合理范圍內(nèi),計(jì)算結(jié)合常數(shù)能夠降低誤差。
從式(4)可知,不同的cM對應(yīng)不同的μ值。從電泳譜圖上,得到遷移時(shí)間,有效淌度計(jì)算公式如下:
方程式(6)中,μeff是受體 P 的有效淌度,μapp是其表觀淌度,μeof是電滲流淌度,t是從電泳譜圖中直接測得的受體P的遷移時(shí)間,teof是DMF的遷移時(shí)間,V是毛細(xì)管兩端的外加電壓,Lt是毛細(xì)管總長,Ld是從進(jìn)樣端到檢測窗口的有效長度。由式(6)計(jì)算出μeff,并把其作為式(5)中的μ(游離受體P的有效淌度或受體P的平均有效淌度),然后對cM進(jìn)行非線性擬合更符合實(shí)際情況,所得的結(jié)果更為精確。因此本研究后續(xù)工作利用非線性擬合求KB。針對FBS蛋白質(zhì)組體系,根據(jù)式(4)進(jìn)行非線性擬合求表觀結(jié)合常數(shù)。
按1.2.2實(shí)驗(yàn),測得FBS蛋白質(zhì)組電泳譜圖。分析比較FBS溶液ACE譜圖與添加適量BSA,bATF及牛IgG標(biāo)準(zhǔn)樣品溶液的FBS溶液ACE譜圖,結(jié)果如圖1所示。
FBS譜圖表明,F(xiàn)BS蛋白質(zhì)組中明顯存在3個(gè)高豐度組分峰,依次為峰1,峰2與峰3。添加BSA標(biāo)準(zhǔn)樣品后,F(xiàn)BS中3個(gè)高豐度組分峰遷移時(shí)間基本不變,但峰3明顯增高,且峰面積增大,認(rèn)定峰3為BSA峰;添加bATF標(biāo)準(zhǔn)樣品后,F(xiàn)BS中3個(gè)高豐度組分峰遷移時(shí)間基本不變,但峰1明顯增高,且峰面積增大,認(rèn)定峰1為bATF峰;添加IgG標(biāo)準(zhǔn)樣品后,F(xiàn)BS中3個(gè)高豐度組分峰遷移時(shí)間基本不變,但峰2明顯增高,且峰面積增大,認(rèn)定峰2為IgG峰,由此確定FBS中高豐度組分為BSA,bATF和IgG。BSA、bATF、IgG在血清中占90﹪左右,其他蛋白含量較少,本工作采用的ACE方法也難以分離并檢測低豐度組分,故本文以下內(nèi)容均考慮以該3個(gè)高豐度組分為基礎(chǔ)開展相應(yīng)工作,低豐度FBS組分的影響可近似忽略。FBS中3個(gè)高豐度組分的蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品等電點(diǎn)值及其相關(guān)數(shù)據(jù)見表1[25-26]。
表1 蛋白質(zhì)標(biāo)準(zhǔn)品基本物理量Table 1 Basic physical quantities of protein standards
按1.2.3實(shí)驗(yàn)測定Crボ-FBS相互作用中3個(gè)高豐度組分的有效淌度,在不同運(yùn)行緩沖液條件下,DMF與FBS混合進(jìn)樣后得到相應(yīng)ACE譜圖,結(jié)果見圖2。
圖2表明,隨著Crボ濃度增大,F(xiàn)BS中各高豐度組分出峰時(shí)間均延長,區(qū)帶展寬。pH 9.27時(shí),中性內(nèi)標(biāo)物的遷移時(shí)間基本不變,Crボ濃度增大不能顯著影響DMF的遷移行為,即DMF與Crボ之間沒有明顯的相互作用。bATF、IgG、BSA在pH 9.27空白緩沖液中均帶有負(fù)電荷,根據(jù)CE中不同電荷物質(zhì)出峰時(shí)間先后順序知FBS中3個(gè)高豐度組分在DMF之后被檢測到,這與圖1所示FBS中各高豐度組分峰均在DMF之后出峰一致。由圖2還可知:隨著運(yùn)行緩沖液中Crボ濃度的增大,在空白緩沖液中具有固定濃度的3個(gè)高豐度組分的出峰時(shí)間延長,區(qū)帶展寬。Crボ使結(jié)合物 Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA所帶負(fù)電荷量增多,它們的電泳方向與電滲流相反,隨著Crボ濃度的增大,各峰的遷移時(shí)間增大。
試驗(yàn)中改變運(yùn)行緩沖液中Crボ濃度,可獲得不同濃度Crボ條件下FBS中3個(gè)高豐度組分和DMF的遷移時(shí)間,根據(jù)式(6)可計(jì)算不同濃度Crボ運(yùn)行緩沖液中3個(gè)高豐度組分的有效淌度,測定結(jié)果列于表2。由表2可見,bATF、IgG、BSA的有效淌度分別從-1.086 73×10-4cm2·V-1·s-1變化至-0.850 03×10-4cm2·V-1·s-1、 從-1.685 12×10-4cm2·V-1·s-1變化至-1.385 21×10-4cm2·V-1·s-1、從-2.026 13×10-4cm2·V-1·s-1變化至-1.525 13×10-4cm2·V-1·s-1, 這表明 Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 之間確實(shí)發(fā)生了結(jié)合反應(yīng),并且它們之間的相互作用逐漸增強(qiáng)。
表2 牛血清中轉(zhuǎn)鐵蛋白、免疫球蛋白和白蛋白在含不同濃度Crボ運(yùn)行緩沖液中的有效淌度Table 2 Effective mobility of bATF,IgG and BSA in FBSunder the different concentrations of Crボ
以Crボ濃度為橫坐標(biāo),以μeff為縱坐標(biāo)作圖,得到 Crボ-bATF、Crボ-IgG 與 Crボ-BSA 的 親和 曲線(圖 3), 進(jìn)而可求得 Crボ-bATF、Crボ-IgG 與 Crボ-BSA結(jié)合物的平均有效淌度。按公式(4)非線性擬合,擬合結(jié)果列于表3中。
從圖3看出,實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)點(diǎn)基本接近擬合曲線,bATF、IgG與BSA的有效淌度隨著運(yùn)行緩沖液中Crボ濃度的增大而增大,因Crボ使結(jié)合物Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA所帶的負(fù)電荷量增多,則隨著Crボ濃度的增大,bATF、IgG、BSA峰的遷移時(shí)間分別延長,區(qū)帶展寬,相對于bATF、IgG、BSA峰游離有效淌度 (-1.086 73×10-4,-1.685 12×10-4,-2.026 13×10-4cm2·V-1·s-1),結(jié)合物 Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 的平均有效淌度變?yōu)?0.824 97×10-4,-1.348 63×10-4,-1.472 31×10-4cm2·V-1·s-1, 這也證實(shí)了 Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 之間發(fā)生了結(jié)合反應(yīng)。由實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù)非線性擬合得到Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 的表觀結(jié)合常數(shù) KB分別為 1.27×104、4.91×104、8.98×104L·mol-1。 為了比較分析組學(xué)條件及單一蛋白質(zhì)組分條件下,高豐度蛋白質(zhì)組分與Crボ結(jié)合反應(yīng)性能的差異,本工作選定BSA(費(fèi)用低)開展其與Crボ結(jié)合反應(yīng)的毛細(xì)管電泳實(shí)驗(yàn),求得KCrボ-BSA=4.69×104L·mol-1,組學(xué)條件及單一蛋白質(zhì)組分條件下高豐度蛋白質(zhì)與Crボ結(jié)合反應(yīng)性能存在一定差異,推測其它高豐度蛋白質(zhì)組分與Crボ結(jié)合反應(yīng)具有類似結(jié)果。由此推斷,本文在組學(xué)條件下的獲得的BSA、bATF、IgG與Crボ結(jié)合反應(yīng)的毛細(xì)管電泳行為,即包括蛋白質(zhì)-蛋白質(zhì)相互作用的影響(含BSA、bATF、IgG等之間的相互作用)、低豐度蛋白-Crボ結(jié)合反應(yīng)的影響及室溫、溶液等環(huán)境因素的影響,應(yīng)該比單獨(dú)考慮BSA、bATF、IgG與Crボ結(jié)合反應(yīng)的毛細(xì)管電泳行為更接近生理狀態(tài),所獲得的結(jié)果為組學(xué)條件下BSA、bATF、IgG與Crボ結(jié)合反應(yīng)的綜合結(jié)果。依據(jù)結(jié)合反應(yīng)發(fā)生的快慢,可將結(jié)合體系分為快平衡(KB數(shù)量級為 104~106L·mol-1)和慢平衡(KB數(shù)量級為103L·mol-1)體系[27-29]。其中快平衡的一個(gè)特點(diǎn)是游離蛋白質(zhì)分子和結(jié)合物將難以分開,它們混合成一個(gè)條帶遷移,在電泳譜圖上表現(xiàn)為一個(gè)寬峰。根據(jù)表觀結(jié)合常數(shù)KB,我們發(fā)現(xiàn)Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 之間發(fā)生的結(jié)合反應(yīng)均為快平衡反應(yīng),且Crボ-BSA之間的結(jié)合作用最強(qiáng),其次是 Crボ-IgG、Crボ-bATF。本試驗(yàn)中,發(fā)生結(jié)合后的電泳譜圖峰數(shù)未增加,蛋白質(zhì)分子峰無變形,表明Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 之間的結(jié)合體系為快平衡體系。
表3 Crボ-FBS相互作用的非線性擬合結(jié)果Table 3 Results of non-linear curve fitting about the interactions between Crボand FBS
當(dāng)分析物分子在高壓電場作用下通過毛細(xì)管發(fā)生電泳遷移時(shí),它的電泳淌度μ由兩個(gè)主要因素決定[30-33]:(1)分析物分子的荷/質(zhì)比;(2)分析物分子所處環(huán)境中其它化學(xué)物質(zhì)的影響。當(dāng)?shù)鞍踪|(zhì)分子與質(zhì)量相對小的帶電配體發(fā)生相互作用時(shí),結(jié)合物的電泳淌度發(fā)生變化主要是因?yàn)槠潆姾砂l(fā)生了變化,而因?yàn)槠滟|(zhì)量發(fā)生變化導(dǎo)致電泳淌度的改變可以忽略。在運(yùn)行緩沖液 pH條件下,Crボ使結(jié)合物 Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 所帶負(fù)電荷的量增大,則隨著Crボ離子濃度的增大,bATF、IgG、BSA峰的遷移時(shí)間延長,且BSA峰遷移時(shí)間延長的最多,其次是IgG和bATF,這也進(jìn)一步證實(shí)了BSA峰的表觀結(jié)合常數(shù)KB最大,其次是IgG和bATF。
2.3.1 緩沖溶液中影響因素
在該實(shí)驗(yàn)中,影響結(jié)合常數(shù)的因素包括荷/質(zhì)比、運(yùn)行緩沖液中所含有的化學(xué)物質(zhì)、運(yùn)行緩沖液的pH、溶液的粘度、離子強(qiáng)度等。本實(shí)驗(yàn)首先使Crボ和血清在同一緩沖液條件下運(yùn)行;其次使Crボ濃度低于空白緩沖液的濃度,并使Crボ濃度在0~10 KB范圍左右[34-36]。根據(jù)實(shí)驗(yàn)求得的KB值,計(jì)算最佳Crボ濃度范圍為 0~7.87 mmol·L-1,而實(shí)驗(yàn)中 Crボ濃度范圍大致在該濃度范圍內(nèi),添加Crボ濃度對運(yùn)行緩沖液的粘度、離子強(qiáng)度基本無變化,引起bATF、IgG、BSA 的有效淌度變化是 Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA之間結(jié)合反應(yīng)的結(jié)果。
2.3.2 蛋白質(zhì)結(jié)構(gòu)差異對結(jié)合作用影響
天然產(chǎn)物等有機(jī)活性分子與蛋白質(zhì)等生物大分子之間的結(jié)合主要有疏水作用力、氫鍵作用力、范德華力和靜電引力等,而金屬離子與蛋白質(zhì)大分子之間的結(jié)合作用主要靠靜電引力[35]等。BSA分子是由585個(gè)氨基酸殘基組成的多肽鏈,其中約67﹪的氨基酸以α-螺旋形成BSA二級結(jié)構(gòu),BSA三級結(jié)構(gòu)由3個(gè)結(jié)構(gòu)域Ⅰ、Ⅱ和Ⅲ組成,進(jìn)而以槽口相對的方式形成圓筒狀結(jié)構(gòu),活性分子/離子可通過包埋在圓筒結(jié)構(gòu)內(nèi)部進(jìn)而與白蛋白分子發(fā)生結(jié)合反應(yīng),結(jié)構(gòu)域Ⅱ與結(jié)構(gòu)域Ⅲ為主要的結(jié)合反應(yīng)位域;另一方面BSA分子中含有大量-OH、-NH2和-SH等極性官能團(tuán),極性官能團(tuán)也是形成MnP絡(luò)合物的極好配位官能團(tuán)[36];IgG分子為四肽鏈組成的基本結(jié)構(gòu),兩條較長的肽鏈稱為重鏈(分子量較大),兩條較短的肽鏈稱為輕鏈(分子量較小),輕鏈與重鏈通過鏈間二硫鍵構(gòu)成IgG分子。IgG分子由3個(gè)結(jié)構(gòu)域形成Y形或T形三級結(jié)構(gòu),每一輕鏈和重鏈在其N-末端有一可變區(qū),在其C-末端有一不變區(qū)。每個(gè)可變區(qū)中均有一個(gè)由鏈內(nèi)二硫鍵連接形成的肽環(huán),每個(gè)可變區(qū)域氨基酸的組成和排列具有可變性,故可結(jié)合多種具有不同結(jié)合抗原特異性的抗體,也是Crボ與IgG的活性結(jié)合位域[37];bATF是由兩個(gè)結(jié)構(gòu)和功能上類似的結(jié)構(gòu)域組成的單一肽鏈糖蛋白,其立體結(jié)構(gòu)是在二級結(jié)構(gòu)的基礎(chǔ)上折疊成2個(gè)相等的葉 (N-葉和C-葉),每個(gè)葉狀結(jié)構(gòu)中含有一個(gè)Fe3+的結(jié)合部位,但此部位存在于一個(gè)很深的裂隙中。分析蛋白質(zhì)分子結(jié)構(gòu),BSA含較多的分子/離子結(jié)合部位,其圓筒狀三級結(jié)構(gòu)使Crボ較易進(jìn)入其結(jié)構(gòu)域空腔與親和基團(tuán)接觸形成絡(luò)合物,同時(shí)疏水氨基酸殘基形成的外圍空腔能將進(jìn)入的Crボ牢牢裹住,充分結(jié)合,所以結(jié)合作用力較強(qiáng),結(jié)合常數(shù)較大;其次,bATF的結(jié)合部位深陷在裂隙中[38],使Crボ較難進(jìn)入裂隙與親和基團(tuán)鍵合,所以結(jié)合力較弱,結(jié)合常數(shù)較??;IgG分子中含有少量親和基團(tuán),Crボ可以進(jìn)入可變區(qū)與IgG發(fā)生結(jié)合反應(yīng)。但I(xiàn)gG可變區(qū)域的Y或T形結(jié)構(gòu)為疏水區(qū)域結(jié)構(gòu),Crボ不容易包裹在其中,較易流出,所以IgG結(jié)合作用適度。通過實(shí)驗(yàn)發(fā)現(xiàn)KCrボ-BSA>KCrボ-IgG>KCrボ-bATF, 結(jié)果表明 Crボ-BSA 之間的結(jié)合作用最強(qiáng),其次是Crボ-IgG、Crボ-bATF,此實(shí)驗(yàn)結(jié)果與蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)相一致。
(1)在現(xiàn)有實(shí)驗(yàn)條件下,依據(jù)毛細(xì)管電泳譜圖,確定FBS中bATF、IgG、BSA高豐度組分峰,并基于確認(rèn)的高豐度組分開展Crボ與蛋白質(zhì)組的結(jié)合反應(yīng)性能研究,F(xiàn)BS中存在其他低豐度及極低豐度組分,這些低豐度及極低豐度組分也可能與Crボ發(fā)生結(jié)合作用,這些結(jié)合反應(yīng)對組學(xué)條件下Crボ-蛋白質(zhì)絡(luò)合物/復(fù)合物的形成起著一定作用,但鑒于目前蛋白質(zhì)組分離技術(shù)的限制,尚不能完全清晰FBS全組分組成及含量,故只能基于目前現(xiàn)有的ACE技術(shù)手段開展Crボ與高豐度蛋白質(zhì)組的結(jié)合反應(yīng)性能研究。
(2)在蛋白質(zhì)組學(xué)條件下,以DMF為內(nèi)標(biāo)物,構(gòu)建配體Crボ-受體(FBS)相互作用模型,計(jì)算有效淌度的變化, 發(fā)現(xiàn) Crボ-bATF、Crボ-IgG、Crボ-BSA 相互作用后的有效淌度均較游離bATF、IgG、BSA的有效淌度有所增加,表明Crボ確與FBS中bATF、IgG、BSA發(fā)生了結(jié)合反應(yīng);其次基于位點(diǎn)結(jié)合方程,通過非線性擬合方程計(jì)算Crボ-FBS中3個(gè)高豐度組分結(jié)合反應(yīng)的表觀結(jié)合常數(shù) KCrボ-bATF、KCrボ-IgG、KCrボ-BSA;定量表征了Crボ與 FBS中 bATF、IgG、BSA結(jié)合作用強(qiáng)度及絡(luò)合物穩(wěn)定性,并解析電泳譜圖獲得了Crボ-FBS中高豐度組分的結(jié)合反應(yīng)為一快平衡體系的結(jié)論。
(3)依據(jù)親和曲線變化表明,得到結(jié)合反應(yīng)作用強(qiáng)度即絡(luò)合物穩(wěn)定性與運(yùn)行緩沖液中Crボ濃度存在量效關(guān)系,隨溶液中Crボ濃度的提高,結(jié)合作用也隨之增強(qiáng),當(dāng)Crボ濃度提高到一定濃度時(shí),結(jié)合作用不再改變;同時(shí)通過文獻(xiàn)查閱BSA、IgG、bATF分子結(jié)構(gòu)進(jìn)行比較分析,表明蛋白質(zhì)的分子結(jié)構(gòu)與實(shí)驗(yàn)所得表觀結(jié)合常數(shù) KCrボ-BSA>KCrボ-IgG>KCrボ-bATF結(jié)果相吻合。表明在蛋白質(zhì)組學(xué)條件下,以ACE方法研究Crボ與血清蛋白質(zhì)組的結(jié)合反應(yīng)性能有效、可行。
本研究初步探索了組學(xué)條件下金屬離子與蛋白質(zhì)組的結(jié)合反應(yīng)性能,相應(yīng)結(jié)果可為生物無機(jī)化學(xué)類似工作提供前期工作基礎(chǔ),有關(guān)工作可為重金屬離子-蛋白質(zhì)絡(luò)合物結(jié)合性能等研究提供一定參考。
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